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i canFam3.chr34            C 0 I 1883

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i panTro4.chr5             C 0 C 0
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i ponAbe2.chr5             C 0 C 0
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i nomLeu3.chr6             C 0 C 0
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i rheMac3.chrUn_JH290906   C 0 C 0
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i macFas5.chr6             C 0 C 0
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i papAnu2.chr6             C 0 C 0
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i chlSab2.chr4             C 0 C 0
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i calJac3.chr2             C 0 C 0
s canFam3.chr34              1891463 352 +  42124431 TATTTTTTAGTGACATACTACTTTCTTAACCCAGAATGAGTAAAAGTACCTAATGTTTAAACTACATAGACCCACCAAAGGCTCACATCAGAAAGTCAAATACCTTCCAGATTAACTTCACCTGCTTTAAGGTGACCACTACTCAGGCTGGGAGAGTTCCCATCAGCACCGTAAAGGTGACACTGATTTCCCTACAGAGTGC-GGCTCACTGAGTATCCAGCTTCATTTGCATTTTTTGCTTTGATATTAG------------------AGATTTACCCTCTCAAATTGGGGAGTTTCTTTCATCTTATTCTCCTCTTCCTGGTGTATATTAACCTTGCTTTCTTAAGGCAATG-TTTTGAAGCAATTTTTA
i canFam3.chr34            I 1883 C 0

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i panTro4.chr5             C 0 C 0
s nomLeu3.chr6             109158947 215 - 121039945 ACAGTGGCCTAAGATTTCAAATTCTCAATAATTTGT---CTATTATTGTAACACAGATTCAGATGCACCTTCAAGTACATCTCCCCCTGCACACATATAGAAA-CACACATTCACGCAGAAAC-ATGC------TGAACTCTAGCTCCAACCTCTCCCATGGAAAACTCCCTGCTCTGGTCAACCTGTCCTGGATCATATGTTGTCATTGTAAAGGTAACTTTGTA
i nomLeu3.chr6             C 0 C 0
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i rheMac3.chrUn_JH290906   C 0 C 0
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i macFas5.chr6             C 0 C 0
s papAnu2.chr6             161826267 210 - 174439528 ACAATGGCTTAAGATTTCAAATTCTCAATAATTTGT---CTATTATTGTAACACAGATTCAGATGCACCTTCAAGTACATCTGCCCCTGCACACATATAGAAACCACACATTCACACAGAAAC-ATGC------TGAACTCTAGCTCCAACCTCTCCCGTGGAAAACTCCCTGCTCTGGTCAACCTGTCCTGGAATATATCTTGTCATTGTAAGGGTAAC------
i papAnu2.chr6             C 0 C 0
s chlSab2.chr4              78718492 209 -  91010382 ACAATGGCCTAAGATTTCAAATTCTCAATAATTTGT---CTATTATTGTAACACAGATTCAGATGCACCTTCAAGTACATCTGCCCCTGCACACATATAGAGA-CACACATTCACACAGAAAC-ATGC------TGAACTCTAGCTCCAACCTCTCCCATGGAAAACTCCCTGATCTGGTCAACCTGTCCTGGAATATATCTTGTCATTGTAAGGGTAAC------
i chlSab2.chr4             C 0 C 0
s calJac3.chr2             191029306 201 + 204313951 ACAGTGGCCTAAGATTTCAAATTCTCAATAAACTGT---CTATTATTGTAACACAGATTCG--------TTCAAGTACATCTGCCCCTGCACACATGTAGAAA-CACACATTCACACAGAAAC-ATGC------TCAACTCTAGCTCCAACCTCTCCCATGGAAAACTCCCTCCTCTGGTCAACCTGCCCTGGAACATATGGTGTCATTGTAAAGGTACC------
i calJac3.chr2             C 0 C 0
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i canFam3.chr34            C 0 I 160
e ponAbe2.chr5             170438917   0 - 183952662 C

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s panTro4.chr5             169771638 36 - 182651097 AGGGTAACTTCATTTTCCTGGTGTGAAACTTGCACT
i panTro4.chr5             C 0 C 0
s nomLeu3.chr6             109159162 36 - 121039945 AGGGTAACTTCATTTTCCTGGTGTGAAAACTGCACT
i nomLeu3.chr6             C 0 C 0
s rheMac3.chrUn_JH290906        4755 27 -    153562 ---------TCATTTTCCTGGTGTGAAACCTGCACT
i rheMac3.chrUn_JH290906   C 0 C 0
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i macFas5.chr6             C 0 C 0
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i papAnu2.chr6             C 0 C 0
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i chlSab2.chr4             C 0 C 0
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i calJac3.chr2             C 0 C 0
e canFam3.chr34              1892032 160 +  42124431 I
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i panTro4.chr5             C 0 I 2
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i papAnu2.chr6             C 0 I 2
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i chlSab2.chr4             C 0 I 2
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i calJac3.chr2             C 0 I 2
s canFam3.chr34              1892192 444 +  42124431 agacacaggcagagggagaataaggctccattcaggaagcccgacatgggacttgatcccaggtctccaggatcatgccctgggctgaaggcagcgctaaacagctgagccacccgggttgcccACAAGTGGCTGCTCTTGAGTATAGGCTTGTATTGCTAAGGCTCAAAAGTTCTGGTCCAGGTTAC-TTTTCCCACATTTCCCACATTTGCA--CCTGCTCCGTGTTAG-AGACCTAATGT-AGGAGATAAGAATGTGCTTCTTCTGAGAGAACTAGAAGTTCCTGGTGGA-------ACTGCCTGCAGTGG-------------------------------------ATCTCCATTCTAACAGAATTTCAGA---AGAGACAGATAAAGATAGCACTCACCAGGTAGAAGCCTGAAATTTTAAAAACCT---------GCTGAGAATTCCAATCTCAACCTGGACTCAGGAATGAGGAGTAAGAGTTCCTACAACTCCCTC
i canFam3.chr34            I 160 I 1
e ponAbe2.chr5             170438917   0 - 183952662 C

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i panTro4.chr5             C 0 C 0
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i ponAbe2.chr5             C 0 C 0
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i nomLeu3.chr6             C 0 C 0
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i rheMac3.chrUn_JH290906   C 0 C 0
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i macFas5.chr6             C 0 I 3024
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i papAnu2.chr6             C 0 C 0
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i chlSab2.chr4             C 0 C 0
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i calJac3.chr2             C 0 C 0
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i panTro4.chr5             C 0 C 0
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i ponAbe2.chr5             C 0 C 0
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i nomLeu3.chr6             C 0 I 271
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i rheMac3.chrUn_JH290906   C 0 C 0
s papAnu2.chr6             161829313 126 - 174439528 TACCGAGGAGTGgaacattgctataaaaatatctGATAATGTGGAAGTGGCTTAGGGACTGGGTAACGGGCAAAGCTTGGAAGAGTGTGAAGGGctgagaaaaagacagaaagctgAGAGAAACTT
i papAnu2.chr6             C 0 C 0
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i chlSab2.chr4             C 0 C 0
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i calJac3.chr2             C 0 C 0
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i panTro4.chr5             C 0 C 0
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i ponAbe2.chr5             C 0 C 0
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i rheMac3.chrUn_JH290906   C 0 C 0
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i papAnu2.chr6             C 0 C 0
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s hg38.chr5_GL383532v1_alt     20585 520 +     82728 CAACAAACTTCAGCTGGGAATGTATATTCTAATATAATAAAGGTTACTGTCAGTTTATA---TATCTTCATTTCTATTTTGTATAGCACTTCATATATAGAGATGTG--------------AGTTGCATTTCATCTCAAAAATTCAAGCAATCTCAAACAGAACACTTAA---------------------------------------AAGTAATATTTATATATGCA-ATAAAGCCCTATGTTTCTCCTGTTCTCTTTAGAATCATACATATCTAACCTCATTTGGTGGTTGTTAAAACATTGCAATCACTCTTAGTCATATCACAATATGAAAAAAAGTACTTCATTAAGATTTTTTAAAAACCTTTCATTGTCCGTTTATCTTTACAGATAATTTCTGTGAAGCCCAAAGT--ACTTTTTTCCT-ATTGTTGGTTTTATGGTTTGTATTAAAAT----------------------------GTAATTCAGATTTATTCCCAAATACCATTCAACTTAAAGCAGCCTTCTTCAAATGCTGCTTACACAAATGAAAGTCTAAGGA-CTTTTATGACA-ATGCAGTTTATATAAAAATATCTCATGCA
s panTro4.chr5             169783311 521 - 182651097 CAACAAACTTCAGCTGGGAATGTATATTCTAATATAATAAAGGTTATTGTCAGTTTATA---TATCTTCATTTCTATTTTGTATAGCACTTCATATATAGAGATGTG--------------AGTTGCATTTCATCTCAAAAATTCAAGCAATCTCAAACAGAACACTTAA---------------------------------------AAGTAATATTTATATATGCA-ATAAAGCCCTATGTTTCTCCTGTTCTCTTTAGAATCATACATATCTAACCTCATTTGGTGGTTGTTAAAACATTGCAATCACTCTTAGTCATATCACAATATGAAAAAAAGTACTTCATTAAGATTTTTAAAAAACCTTTCATTGTCCGTTTATCTTTACAGATAATTTCTGTGAAGCCCAAAGT--ACTTATTTCCTAATTGTTGGTTTTATGGTTTGTATTAAAAT----------------------------GTAATTCAGATTTATTCCCAAATACCATTCAACTTAAAGCAGCCTTCTTCAAATGCTGCTTACACAAATGAAAGTCTAAGGA-CTTTTATGACA-ATGCAGTTTATATAAAAATATCTCATGCA
i panTro4.chr5             C 0 C 0
s nomLeu3.chr6             109168185 518 - 121039945 CAACAAACTTCAGCTGGGAAGGTATAGTCTAATATAATAAAGGTTATTGTCAGTTTATA---TATCTTCATTTCTATTTTGTATAGCACTTCATATATAGAGATGTG--------------AGTTGCATTTCATCTCAAAAATTCTAGCAATCTCAAACAGAACACTTAC---------------------------------------AAGTAATATTTATATATGCA-ATAAGGCCCTATGTTTTTCCTGTTCTCTTTAGAATCATACGTATCTAACCTCATTTGGTGGTTGTTAAAACATTGCAATCATTCTTAGTCATATCACAATATG-AAAAAAGTACTTCACTAAGATTTCTTAAAAACCTTTCATTGTCCG-TAATCTTTACAGATAATTTCTGTGAAGCCCAAAGT--ACTTCTTTCTTAATTGTTGGTTTTAT-GCTTGTACTAAAAC----------------------------GTAATTCAGATTTATTCCCAAATACCATTCAACTTAAAGCAGCCTTCTTCAAATGCTGCTTACACAAATGAAAGTCTAAGGA-CTTTTATGACA-ATGCAGTTTATATAAAAATGTCTCATGCA
i nomLeu3.chr6             C 0 C 0
s rheMac3.chrUn_JH290906       17710 523 -    153562 CAACAAACTTCAGCTGGGAATGTATATTCTAATATAATAAA-GTTATTGTCAGTTTATATATTATCTTCATTTCTATTTTGTATAGCACTTCATATATAGAGATGTG--------------AGTTGGATTTCATCTCAAAAATTCAAGCAATCTCAAATAGAACACTCAC---------------------------------------AAGTAATATTTATATATGCA-ATAAGGTCCTACGTTTTTCCCGTTCTCTTTAGAATCATACATATATAACCTCATTTGGTGGTTGTTTAAACATTGCAATCACTCTTAGTCATATCACAATATG-AAAAAAGTACTTCATTCAGATTTTTAGAAAACCTTTCATTGTCCGTTTACCTTTATAGCTAAGTTCTGTGAAGCCCAAAGT--ACTTCTTTCTTAATTGTTGGTTTTACAGTTTGTATTAAAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------------------------TTCAACTTAAAGCAACCTTCTTCAAATGCTTTTTACACAAATGAAAGTCTAAGGA-CTTTTATGACA-ATGCAGTTTATACAAAAATATCTCATGCA
i rheMac3.chrUn_JH290906   C 0 C 0
s macFas5.chr6             168620675 522 - 181584905 CAACAAACTTCAGCTGGGAATGTATATTCTAATATAATAAA-GTTATTGTCAGTTTATATATTATCTTCATTTCTATTTTGTATAGCACTTCATATATAGAGATGTG--------------AGTTGGATTTCATCTCAAAAATTCAAGCAATCTCAAATAGAACACTCAC---------------------------------------AAGTAATATTTATATATGCA-ATAAGGTCCTACGTTTTTCCCGTTCTCTTTAGAATCATACATATATAACCTCATTTGGTGGTTGTTTAAACATTGCAATCACTCTTAGTCATATCACAATATG-AAAAAAGTACTTCATTCAGATTTTTAGAAAACCTTTCATTGTCCGTTTACCTTTATAGCTAAGTTCTGTGAAGCCCAAAGT--ACTTCTTTCTTAATTGTTGGTTTTACGGTTTGTATTAAAAT----------------------------GTAATTCAGATTTATTCCCAAATACCATTCAACTTAAAGCAACCTTCTTCAAATGCTTTTTACACAAATGAAAGTCTAAGGA-CTTTTATGACA-ATGCAGTTTATACAAAAATATCTCATGCA
i macFas5.chr6             C 0 C 0
s papAnu2.chr6             161839696 522 - 174439528 CAGCAAACTTCAGCTGGGAATGTATATTCTAATATAATAAG-GTTATTGTCAGTTTATATAttatcttcttttctattttgtatagCACTTCATATATAGAGATATG--------------AGTTggatttcatctcaaaaattcAAGCAATCTCAAACAGAACATTCAc---------------------------------------aagtaatatttatatatgca-atAAGGTCCTATGTTTTTCCTGTTCTCCTTAGAATCATACATATCTAACCTCATTTGGTGGCTGTTAAAACATTGCAATCACTCTTAGTCATATCACAATATG-AAAAAAGTACTTCATTCAGATTTTTAGAAAATCTTTCATTGTCCGTTTACCTTTATAGCTAATTTCTGTGAAGCCCAAAGT--ACTTCTTTCTTAATTGTTGGTTTTACGGtttgtattaaaat----------------------------gtaattcagaTTTATTCCCAAATACCATTCAACTTAAAGCAACCTTCTTCAAATGCTTTTTACACAAATGAAAGTCTAAGGA-CTTTTATGACA-ATGCAGTTTACACAAAAATATCTCATGCA
i papAnu2.chr6             C 0 C 0
s chlSab2.chr4              78731191 522 -  91010382 CAACAAACTTCAGCTGGGAATGTATATTCTAATATAATAAA-GTTATTGTCAGTTTATATATTATCTTCATTTCTATTTTGTATAGCACTTCATATATAGAGATGTG--------------AGTTGGATTTCATCTCAAAAATTCAAGCAGTCTCAAACAGAACACTCAC---------------------------------------AAGTAATATTTATATATGCA-ATAAGATCCTATGTTTTTCCTGTTCTCCTTAGAATCATATATATCCAACCTCATTTGGTGGTTGTTAAAACATTGCAATCACTCTTAGTCATATCACAATATG-AAGAAAGTACTTCATTCAGATTTTTAGAAAATCTTTCATTGTCTGTTTACCTTTATAGCTAATTTCTGTGAAGCCCAAAGT--ACTTCTTTCTTAATTATTGGTTTTACGGTTTGTATCCAAAT----------------------------GTAATTCAGATTTGTTCCCAAATACCACTCAACTTAAAGCAACCTTCTTCAAATGCTATTTACACAAATGAAAGTCTAAGGA-CTTTTATGACA-ATGCAGTTTATACAAAAATGTCTCGTGTA
i chlSab2.chr4             C 0 C 0
s calJac3.chr2             191042300 556 + 204313951 CAACGAACTTCAGCTGCAAATTTATATTGTAATATAATAAAGGTTATTGTTAGTTTGTA---TATCTTCATTTCTGTTTTGTATAGCACTTCATATTTAAAGATGAG--------------AGTTGCATTTCATCTTAAAAATTCAAGCATTCTCAAAGAGAACACTCACTTATTAAATGTAAGtaatatttatatacttattaaatataagtaatatttatatatGCA-AAAAGCCCCTATGTTTTTTCCATTTTCTTTAGAATCATTTATATCTAACCTCATTCGAT---TGCTAAAACATTTCAATCACTGTTACTCATACTGCAATATG-AAAAAAGTATTTCACTAAGATTTTTAAAAAAACTTTCATTGTCCCTTTATCTTTAGAGCTAAATGCTGTGAAGCCCAGAGT--ACTTCTTTCTTAATTGTTGGTTTTATGGTTTGTATTAAAGT----------------------------ATAATTCTGATTTATTCCCAAATACCATTCAACTTAAAGTAGCCTTCTTTGAATGCTGCTTACACTAAAGAAAGTCTAAGGA-CTTTTATGACA-ATGCAGTTTATATGAAAACATCTCATGCA
i calJac3.chr2             C 0 C 0
s canFam3.chr34              1897724 522 +  42124431 CCACAAACTCTAGCTGGGAATTTATACTATAATATAATAAAGAATATTATCAGCTTATA---TATC--CACTTCTGTTTGGCATAG------------AGAAATGAGAGCGATATAGTAAAAGTTACATTTCATCTCAAAAATTCAATTAATCTTAACCTCCACATATAC---------------------------------------TAGTACAAATTTCATATGCACAGGAACCTATGTGTTTCTCCAGTTTTTGCTAGCATTATGCATCTCTGAGCTCATTTGAGTGTCCTTATAACATTGTGATCACTCTGAGTCATATATCAGTGTG--AGAAAGTACTTCACTGTTTTCTTTTTAAAATGTTTCATTGTCCCTTTGTC-ATATAGCTCATTTCTGTGATGCCCAGAATACACTTTTCTTTTAATTGTTGACTTTATAGTTTGTATTGAAGT----------------------------AAATTTCAGATTGATTCCCAGATGCCATTCCCCTCAAAGCAAGCTTGTTCAAATACT-TATAAACAAATGAAAATCTAATCACCCTTCATGACATATGCAGTTTACATAAAAATACCTCATGCA
i canFam3.chr34            C 0 I 125
e ponAbe2.chr5             170449820 7077 - 183952662 I

a score=45842.000000
s hg38.chr5_GL383532v1_alt     21105 19 +     82728 TATCTTGTCTCCTATCAGG
s panTro4.chr5             169783832 19 - 182651097 TATCTTGTCTCCTATCAGG
i panTro4.chr5             C 0 C 0
s nomLeu3.chr6             109168703 19 - 121039945 CATCTTGTCTCCTATCAGG
i nomLeu3.chr6             C 0 C 0
s rheMac3.chrUn_JH290906       18233 19 -    153562 TGTCTTGTCTCCTATCAGG
i rheMac3.chrUn_JH290906   C 0 C 0
s macFas5.chr6             168621197 19 - 181584905 TGTCTTGTCTCCTATCAGG
i macFas5.chr6             C 0 C 0
s papAnu2.chr6             161840218 19 - 174439528 TGTCTTGTCTCCTATCAGG
i papAnu2.chr6             C 0 C 0
s chlSab2.chr4              78731713 19 -  91010382 TGTCTTGTCTCCTATCAGG
i chlSab2.chr4             C 0 C 0
s calJac3.chr2             191042856 19 + 204313951 TATTTTGTCTCCTATTAGG
i calJac3.chr2             C 0 C 0
e canFam3.chr34              1898246 125 +  42124431 I
e ponAbe2.chr5             170449820 7077 - 183952662 I

a score=383778.000000
s hg38.chr5_GL383532v1_alt     21124 149 +     82728 GATTTCA------------------TGTACTGCTTTTTCAAAACAACCATAAACATTCAGATTGATTTATGCTATAATGGCATTCAGGAGTGTGTGTTAGAAAGAGACTCAATCATGAACTATTTGTTGAGGTTATACAGAGAGTAAAGCAAGTGAGttatgacact
s panTro4.chr5             169783851 145 - 182651097 GATTTCA------------------TGTACTGCTTTTTCAAAACAACTATAAACATTCAGATTGATTTATGCTATAATGGCATTCAGGAGTGTGTGTT----AGAGACTCAATCATAAACTATTTGTTGAGGTTATATGTAGAGTAAAGCAAGTGAGttatgacact
i panTro4.chr5             C 0 C 0
s nomLeu3.chr6             109168722 149 - 121039945 GATTTCA------------------TGTACTGCTTTTTCAAAATAACCATAGACATTCAGATTGATTTATGCTATAATGGCATTCAGGAGTGTGTGTTAGAAAGAGACTCAGTCATGAACTATTTGTTGAGGTTATATAGAGAGTAAAGCAAGAGAATTATGACACT
i nomLeu3.chr6             C 0 C 0
s rheMac3.chrUn_JH290906       18252 149 -    153562 GATTCCA------------------TGTATTGCTTTTTCAAAATAACCATAGACATTCAGATTGATTTATGCTAGAATGGAATTTAGGAGTGTGTGTTAGAAAGAGACTCAACCATTAACTATTTGTTGAGGTTATATAGAGAGTAAAGCAAGCGAGTTATGACACT
i rheMac3.chrUn_JH290906   C 0 I 409
s macFas5.chr6             168621216 149 - 181584905 GATTCCA------------------TGTACTGCTTTTTCAAAATAACCATAGACATTCAGATTGATTTATGCTAGAATGGAATTTAGGAGTGTGTGTTAGAAAGAGACTCAACCATTAACTATTTGTTGAGGTTATATAGAGAGTAAAGCAAGCGAGTTATGACACT
i macFas5.chr6             C 0 C 0
s papAnu2.chr6             161840237 149 - 174439528 GATTCCA------------------TGTACCGCTTTTTCAAAATAACCATAGACATTCAGATTGATTTATGCTATAATGGAATTTAGGAATGTGTGTTAGAAAGAGACTCAACCATTAACTATTTGTTGAGGTTATATAGAGAGTAAAGCAAGAGAGTTATGACACT
i papAnu2.chr6             C 0 C 0
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i chlSab2.chr4             C 0 C 0
s calJac3.chr2             191042875 141 + 204313951 GATTTCA------------------TGTACTGCTTTTGCAAAATAACCATAAATATTCAGATTGATTTAT-----AACAGAATTCAGGAGTGTGTGTTAG---GGGACTCAACCATGAACTGTTTGTTGAGGTTATATGGAGAGTAAAGCAAGAGAGTTATGACACT
i calJac3.chr2             C 0 C 0
s canFam3.chr34              1898371 166 +  42124431 AATCTCATGCAGGTCTCTGCTCCATTGTACTACTTTTTCAAAGTAACTGCAGACTTTCAGATTGCATCATTGCATAATGGAATTTAGCAGTCTATGTTAGAAGGCAAATCAACCATGGACTTCTTATTGAAGTTACCTACAGAGTAAAGCAAGAGA-CAATGGTATT
i canFam3.chr34            I 125 C 0
e ponAbe2.chr5             170449820 7077 - 183952662 I

a score=2548.000000
s hg38.chr5_GL383532v1_alt     21273 1 +     82728 a
s panTro4.chr5             169783996 1 - 182651097 a
i panTro4.chr5             C 0 C 0
s nomLeu3.chr6             109168871 1 - 121039945 A
i nomLeu3.chr6             C 0 I 300
s macFas5.chr6             168621365 1 - 181584905 A
i macFas5.chr6             C 0 C 0
s papAnu2.chr6             161840386 1 - 174439528 A
i papAnu2.chr6             C 0 C 0
s chlSab2.chr4              78731881 1 -  91010382 a
i chlSab2.chr4             C 0 C 0
s calJac3.chr2             191043016 1 + 204313951 A
i calJac3.chr2             C 0 C 0
s canFam3.chr34              1898537 1 +  42124431 A
i canFam3.chr34            C 0 C 0
e rheMac3.chrUn_JH290906       18401 409 -    153562 I
e ponAbe2.chr5             170449820 7077 - 183952662 I

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s hg38.chr5_GL383532v1_alt     21274 20 +     82728 agtaact---tttatattatggt
s panTro4.chr5             169783997 20 - 182651097 agtaact---tttatattatggt
i panTro4.chr5             C 0 C 0
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i nomLeu3.chr6             I 300 C 0
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i macFas5.chr6             C 0 C 0
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i papAnu2.chr6             C 0 C 0
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i chlSab2.chr4             C 0 C 0
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i calJac3.chr2             C 0 C 0
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i canFam3.chr34            C 0 I 2300
e rheMac3.chrUn_JH290906       18401 409 -    153562 I
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i panTro4.chr5             C 0 C 0
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i nomLeu3.chr6             C 0 C 0
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i papAnu2.chr6             C 0 C 0
s chlSab2.chr4              78731902 418 -  91010382 ggctttcagttgtatatctttaattctagactttcgtttgtggtccatacttgtatgttcatggtcacatttatatgtaataaatatcataaagcaaacattagtaaaatttactttttgatccccacctcaaatatatactgccccatttaaggaaaatgcatctattctagaaacctaaaattctttgttgacacttctttaacatctccattcaattaatcactaaatcctaaatcctgttgatttttccccaaatacatataaattcttctcatacttctaaattccttctccttcagtctagttcaaattggcatc--------attattattattattattattattattattattattatattttttggtccaaaatcctactacttgtctcctcacttctgtttttCTTAttatttta
i chlSab2.chr4             C 0 C 0
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i calJac3.chr2             C 0 C 0
e canFam3.chr34              1898561 2300 +  42124431 I
e rheMac3.chrUn_JH290906       18401 409 -    153562 I
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i canFam3.chr34            I 253 I 2650

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i ponAbe2.chr5             C 0 C 0
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i nomLeu3.chr6             C 0 C 0
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i macFas5.chr6             C 0 C 0
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i chlSab2.chr4             I 8 C 0
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i calJac3.chr2             C 0 C 0
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i canFam3.chr34            C 0 I 31

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i rheMac3.chrUn_JH290906   C 0 C 0
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i macFas5.chr6             C 0 C 0
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i calJac3.chr2             C 0 C 0
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i canFam3.chr34            I 31 C 0

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i panTro4.chr5             C 0 C 0
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i papAnu2.chr6             C 0 C 0
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i chlSab2.chr4             C 0 C 0
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i calJac3.chr2             C 0 C 0
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i ponAbe2.chr5             M 183 C 0
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i panTro4.chr5             C 0 C 0
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i chlSab2.chr4             C 0 C 0
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i rheMac3.chrUn_JH290906   C 0 I 461
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i macFas5.chr6             C 0 I 461
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i papAnu2.chr6             C 0 I 461
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i chlSab2.chr4             C 0 C 0
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i calJac3.chr2             C 0 C 0
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i canFam3.chr34            C 0 C 0

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i chlSab2.chr4             I 312 C 0
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i macFas5.chr6             C 0 I 4
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i papAnu2.chr6             C 0 I 4
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i chlSab2.chr4             C 0 I 4
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i calJac3.chr2             C 0 I 4
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i canFam3.chr34            I 263 C 0

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i panTro4.chr5             I 4 C 0
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i nomLeu3.chr6             I 4 C 0
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i rheMac3.chrUn_JH290906   I 4 C 0
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i macFas5.chr6             I 4 C 0
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i papAnu2.chr6             I 4 C 0
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i chlSab2.chr4             I 4 C 0
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i calJac3.chr2             I 4 C 0
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i canFam3.chr34            C 0 C 0
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i ponAbe2.chr5             I 2312 C 0
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i nomLeu3.chr6             C 0 C 0
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i rheMac3.chrUn_JH290906   C 0 I 365
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i papAnu2.chr6             C 0 C 0
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i calJac3.chr2             C 0 C 0
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i canFam3.chr34            C 0 C 0

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i chlSab2.chr4             C 0 C 0
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i calJac3.chr2             C 0 C 0
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i papAnu2.chr6             C 0 C 0
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i calJac3.chr2             C 0 C 0
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e rheMac3.chrUn_JH290906       52442 365 -    153562 I

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s ponAbe2.chr5             170482191 491 - 183952662 TACAAGCCCTATTTTTATAGTAGTGAGAAAACAGATCATAAGGAAATGAAATAAAGAAA----AAATACATAAAGCTGTATGCTATAAATTAGAAGAACTGAATAAA-----TTTATAAGTTAGTCAAGATGAA-AAACAGAAATTCTGGGAC-TTATTTAAGAGATGGGCGTAACTTGGAGATATATTGGATATTCTTAGTGTAAGAGGATGGGGTT-----------TAATTGTAGATATATGTTAAGGCTAATTATAGTGATCTCCAAACCA-CCTCAAATATCTGTCTGTAGTATGATTTTAAGAGATTGGTCTTAAACGTATTTTTTAGGAATCTGTTTACTACACAAAATACAAA-TTAAAATAACATCTATTATCATAGAGAAGTAACAGTGTAAC-TTATGTTAAGAAA-TTTAATTAAGTTTT-CTAGATAATCaaataatatattaacaaaaatgtaatt-aaattttaaGAAGAGACACATAGAA-------------GGGATTTGTCGTTGTGATTTCTC
i ponAbe2.chr5             C 0 C 0
s nomLeu3.chr6             109196486 480 - 121039945 TACAAGCACTATTTTTAGAGTAGTGAGAAAATAGACCATAAGGAAATGAAATAAAGAAA----AAATACATAAAGCTGTGTGCTATAAATTAGAAGAACTGAATAAA-----TTTATGAGTTAGTCAAGATGAA-AAATAGAAATTCTGGGAC-TTATTTAAGAGATGGGCATAACTTGGAGATATACTGGATTTTCATAGTGTAAGAGGATGGGGTT-----------TAATTGTAGATATATGTTAAGGCTAATTAGAGTGATCTCCAAACCATCCTCAAATATCTATCCGTAGTATCATTTTAAGAGATTGGTCTTAAATGTATTTCTTAGGAATCTGTTTACTACATGAAATACAAA-TTAAAATAACATCTATTACCATAGAGAAGTAAGAGTGTAACTTTATATTAAGAAA-TTGAATC--GTTTT-CTAGATAATCA-----------AACAAAAAGGTAATT-AATTTTTAAAAAGAGACACATAGAA-------------GGAATTTGTCACTGTGATTTCTC
i nomLeu3.chr6             C 0 C 0
s macFas5.chr6             168657683 478 - 181584905 TACAAGCACTATTTTTATAGTGGTGAGAAAATAGATCATAAGGAAATGAAATAAAGAAA----AAATACATAAAGCTGTGTGCTATAAATTAGAAGAACCAGATAAA-----TTTATGACTTAGTCAAGATGAA-AAATAGAAATTCTGGGAC-TTATTTAAGAGATGGGCATAACTTGGAGATTTATTGGATTTTCATAGTATAAGAGGATGGGGTT-----------TAATTGTAGATATATGTTAAGGCTAATTATAGTGATCTTAAAACCATCCTCAA----------ATAGCATGATTTTAAGAGATTGGTCTTAAATGCGTTTCTTAGGAATCTGTTTACTACACAAAATACAAA-TTAAAATAACATCTATT---ATAGAGAAGTAAGAGTGTAACTTTATATTAAGAAA-TTTAATCAAGTTTT-CTAGATAATAAAATAATATA--AACAAAAAGGTAATT-AAATTTTAAAAAGAGACACATAGAA-------------GAAATTTGTCATTGTGATTTCTC
i macFas5.chr6             C 0 C 0
s papAnu2.chr6             161877561 489 - 174439528 TACAAGCACTATTTTTATAGTGGTGAGAAAATAGAtcataaggaaatgaaataaagaaa----aaatacataaagctgTGTGCTATAAATTAGAAGAACCAGATAAA-----TTTATGACTTAGTcaagatgaa-aaatagaaattctgggaC-TTATTTAAGAGATGGGCATAACTTGGAGATTTATTGGATTTTCATAGTATAAGAGGATGGAGTT-----------TAATTGTAGATATATGTTAAGGCTAATTATAGTGATCTTCAAACCATCCTCGAATATCTACCTATAGTATGATTTTAAGAGATTGGTCTTAAATGCGTTTCTTAGGAATCTGTTTactacacaaaatacaaa-ttaaaataacatctaTT---ATAGAGAAGTAAGAGTGTAACtttatattaagaaattttaatcaagtttt-ctagataataaaataatata--aacaaaaaggtaatt-aaattttaaaaagagacacatagaa-------------gAAATTTGTCATTGTGATTTCTC
i papAnu2.chr6             C 0 C 0
s chlSab2.chr4              78768893 490 -  91010382 TACAAGCACTATTTTTATAGTGGTGAGAAAATAGATCATAAGGAAATGAAATAAAGAAA----AAATACATAAAGCTCTGTGCTATAAATTAGAAGAACCGGATAAA-----TTTATGACTTAGTTAAGATGAA-AAATAGAAATTCTGGGAC-TTATTTAAGAGATGGGCATAAGTTGGAGATTTATTGGATTTTCATAGTATAAGAAGATGGGGTT-----------TAATTGTAGATATATGTTAAGGCTAATTATAGTGATCTCCAAACCATCCTCAAATATCTACCTGTAGTATGATTTTAAGAGATTGGTCTTAAATGCTTTCCTTAGAAATCTGTTTACTACACAAAATACAAA-GTAAAATAACATCTATT---ATAGAGAAGTAAGAGTGTAACTTTATATTAAGAAA-TTTAATCAAGTTTT-CTGGATAATAAAATAATATATTAACAAAAAGGTAATT-CAATTTTAAAAAGAGACACATAGAA-------------GAAATTTGTCATTGTGATTTCTC
i chlSab2.chr4             C 0 C 0
s calJac3.chr2             191071136 470 + 204313951 TACAAGCACTATATTTATAGTGGTAAGAAAATAGATCATAAGGAAGTGaaataaaaaaa---tatatatataaatttGTGTGCTATAAATTAGAAGAACTGAATAAA-----TTTATAAGTTAGTCAAGACGAA-AAATAGAGATTCGGGGAC-TTATTTAAGAGATGGGCATACCTTGGAGATATATTGGAT-------------------GGGGTT-----------TAATTGTAAATATATGTTAAGGCTAATTATAGTGATCCTCAAACCATCCTGAAATATCTATCTGTGGCATGATTTTAAAAGATTGCTTTTAAATGTATTTTTTAGGAATCAGTTTACTACACAGAATAAAAA-TTGAAATAACATCTATTATCATGAAGAAGTAAGAGTGTAAT-TTATAATAAGAAA-TTTAGTCAAGTTTT-CTAGATAATCACATAATATGTTAACAAAAAGGTAATT-AAATTTT----AGAGTCACATAGAA-------------GGAATTTGTTATTGTGATTTCTC
i calJac3.chr2             C 0 C 0
s canFam3.chr34              1919744 433 +  42124431 TAGAAACATTATTTCAGTAGTAGTGAGAAAA---ATCATAGGAAAACAAGATAAAGGAAAAGAAAATACATAGGAATATACACT----GTTAGAAGAACTGAAAAAAAAACTTATGAGAGTTAACAGTGATGAAGAAATAGAAAAGCTTAAATATCAGTGAGGAAATGGGCATAACTTGGAGATCTATTGGATTTGCATAGTGTAAGAGCATACATCTGCATAATATCATAATTGCAGATGTATGTTTAGGTTAATTAT--------------------------------------------------------TTTTCAATGTATTACTTAGGAGGATGGTCATCACTCAACATGCAAATTTTAAAAAGGGTTTATAAAGGTAGAG------------------------------TTTAATCAAGTTTTACTGAATGAAGAAAGAATTTGTTAACCAAATGGGAACA-AG-----CAGAACAGAAAGAAAGTAAGTGTCAAAAGCTGAAATATGTCATGGTGCTTTCTA
i canFam3.chr34            C 0 C 0
e rheMac3.chrUn_JH290906       54232 338 -    153562 M

a score=1072944.000000
s hg38.chr5_GL383532v1_alt     44706 345 +     82728 CATTACTGAAGGATG-GATGTTTCAAGTAATTTAAATAAACTTTCCAGCCCATTTTTTGAAAGGTGTAAATGTACATGTCAGGGTTTCTTACTGCATGTCCATACATATTTATAAATACAATTATTTTATGTAATTTATTTTTTTTCCATGTGTTCCACTTTACATTGGATTATATTCTACACAGACATAGGC--------------------------------------------------------------------------------------------A-ttgtgtatgagatcataccttttcccataaacttaaagaaatcactcttgaaattgtatccattttcttctgggtcttttgtattttcctGTGCTTATCAGGTTTGCTGCGATAACAAAAATCTC--AATCTCAGTAACTTCTTCAAAAGATTT
s panTro4.chr5             169810624 345 - 182651097 CATTACTGAAGGATG-GATGTTTCAAGTAATTTAAATAAACTTTCCAGCCCATTTTTTGAAAGGTGTAAATGTACATGTCAGGGTTTCTTACTGCATGTCCATACatatttataaatataattattttatgtaatttattttttttCCATGTGTTCAACTTTACATTGGATTATATTCTACACAGACATAGGA--------------------------------------------------------------------------------------------A-TTGTGTATGAGATCATACCTTTTCTCATAAACTTAAAGAAATAACTCTTGAAATTGTATTCATTTTCTTCTGGGTCTTTTGTATTTTCTTGTGCTTATCAGGTTTGCTGCGATAACAAAAATCTC--AATCTCAGTAACTTCTTCAAAAGATTT
i panTro4.chr5             C 0 C 0
s ponAbe2.chr5             170482682 344 - 183952662 CATTACTGAAGGATGAAATGTTTCAAGTAATTTAAATAAACGTTCCAGTCCATTTTTTGAAAGGTGTAAATGTACATGTCAGGGTTTCTTACTGCATGTCCATACATATTTACAAATATAATTATTTTATGT-ATTTATTGCTTTTGCATGTATTCGACTTTTCATTGGATTATATTCTACACAGACATAGGC--------------------------------------------------------------------------------------------A-ttgtatatgagatcataccttttctcataaacttaaagaaatcactcttgaaattgtatccattttcttctgggtcTTTTGTATATTCTTGTGCTTGTCA-GTTTGCTGCCATAAC-AAAATCTCAGAATCTCAGTAACTTCTTC-AAAGATTT
i ponAbe2.chr5             C 0 C 0
s nomLeu3.chr6             109196966 341 - 121039945 CATTACTGAAGGATG-AATGTTTCAAGTAATTTAAATAAACATTCCAGATCATTTTTTGAAAGGTGTAAATGTACATGTCAGGGTTTCTTACTGCCTGTCCGTACATATT------TATAATTATTTTATGTTATTTATTGTTTTTGCATGTATTCAACTTTTCATTGGATTATATTCTACACAGACATAAGC--------------------------------------------------------------------------------------------A-ttgtgtatgagatcataccatttctcacgaacttaaagaaatcactcttgaaattgtatccattttcttctggatcTTTTGTATTTTTTTGTGCTTGTCAGGTTTGCTGTGGTAACAAAAATCTCAGAATCTCAGTAACTTCTTCAAAAAATTT
i nomLeu3.chr6             C 0 C 0
s rheMac3.chrUn_JH290906       54570 347 -    153562 CATTATTGAAGGATG-GATGTTTCAAGTAATTTAAATAAACTTTCCAGCCCATTTTTTGAAAGGTGTAAATGTACATGTCGGGGTTTCTTACTGCCTGTCCATACatatttataaatataattattttatataatttattatttttGCATGTATTCAACTTTTCATTAGATTATATTCTACACAGACATAGGC--------------------------------------------------------------------------------------------A-ttgtgtatgagatcatactttttctcacgagcttaaagaaatcactcttgaaattgtatccattttcttctgggtcttttgtattttcttGTGCTTGTCAGGTTTGCTGCAATAACAAAAATCTCAGAATCTCAGTAACTTCCTCAAGAGATTT
i rheMac3.chrUn_JH290906   M 338 C 0
s macFas5.chr6             168658161 347 - 181584905 CATTATTGAAGGATG-GATGTTTCAAGTAATTTAAATAAACTTTCCAGCCCATTTTTTGAAAGGTGTAAATGTACATGTCGGGGTTTCTTACTGCCTGTCCATACATATTTATAAATATAATTATTTTATATAATTTATTATTTTTGCATGTATTCAACTTTTCATTAGATTATATTCTACACAGACATAGGC--------------------------------------------------------------------------------------------A-TTGTGTATGAGATCATACTTTTTCTCACGAGCTTAAAGAAATCACTCTTGAAATTGTATCCATTTTCTTCTGGGTCTTTTGTATTTTCTTGTGCTTGTCAGGTTTGCTGCAATAACAAAAATCTCAGAATCTCAGTAACTTCCTCAAGAGATTT
i macFas5.chr6             C 0 C 0
s papAnu2.chr6             161878050 346 - 174439528 CATTATTGAAGGATG-GATGTTTCAagtaatttaaataaactttccaGCCCATTTTTTGAAAGGTGTAAATGTACATGTTGGGGTTTCTTACTGCCTGtccatacatatttataaatataattattttatataatttattattttt-catgtattcaacttttcattggattatattcTACACAGACATAGGC--------------------------------------------------------------------------------------------A-TTGTGTATGAGATCATACTTTTTCTCACGAGCTTAAAGAAATCACTCTTGAAATTGTATCCATTTTCTTCTgggtcttttgtattttcttgtgcTTGTCAGGTTTGCTGCAATAACAAAAATCTCAGAATCTCAGTAACTTCCTCAAGAGATTT
i papAnu2.chr6             C 0 C 0
s chlSab2.chr4              78769383 439 -  91010382 CGTTATTGAAGGATG-GATGTTTCAAGTAATTTAAATAAAATTTCCAGCCCATTTTTTGGAAGGTGTAAATGTACATGTCAGGGTTTCTTACTGCCTGTCCATACAtatttataaatataattattttatgtaatttattatttttgcatgtattCAACTTTACATTAGATTATATTCTACACAGGCATAGGCATTATAAAGCGATTGAAAAGTCATAAGACAGTGTTTGCAGTGACCCTCAAGTCTTGTTAGAGCATGGTGGTTTCAGAGACAGACTGCTCTGAA-TTGTGTATGAGCTCATACTTTTTCTCACGAGCTTAAAGAACTCACTCTTGAAATTGTATCCATTTTCTTCTGGGTCTTTTGTATTTTCTTGTGCTTGTCAGGTTTGCTGCAATAACAAAAATCTCAGAATCTCAGTAACTTCCTCAAGAGATTT
i chlSab2.chr4             C 0 C 0
s calJac3.chr2             191071606 325 + 204313951 CATTTCTGAAGGATG-GATGTTTCAAGTAATTTAAATAAACTTTCCAGCCCATTTTTGGAAAGGTCTGAATGTACATGTCAGGGTATCTTGCTGCCTGCTCatttatatttatacatataattattttatGTAACTTACTATTTTTGCATGTATTCAACTTTTCATTGGATTAT---------------------------------------------------------------------------------------------------------------A-ttgtgtatgagattataccttttctcacaaacttaaagaagtcactcttgaaattatatccattttctgctgggtcttttatattttcttGTGCTTGTCAGGTTTGCTGCAATAACAAAAATCCCAGAAACTCAGTAACTTCT---AAATATTT
i calJac3.chr2             C 0 C 0
s canFam3.chr34              1920177 336 +  42124431 CATTTCTAAAGGATCAGGTGTTTTAACTATTTGCTATAAACTTCCCAGCCCATTTTTTTCTGGATGGCAA---ACATGTCACTATATCTTACTATGT----ATGAATATCTATCATAATAA-----ATATGTAATCTATTATTTTTGCATGAGTTCATCCCTTTGTTAGATTAGAGCCTCCACAGAGGCAGGc--------------------------------------------------------------------------------------------atttgtgcactagatcatattctttctcataaactcaaacaaattgttcctaaaaatctatccatttt-tctGGGATATTCTGTGTTTTCTTGTCCTAGTCAGGTTTGCTGTGATAACGAACACCTCAAAATCTTAGTAACTTACACAAAGGATTT
i canFam3.chr34            C 0 I 490

a score=56886.000000
s hg38.chr5_GL383532v1_alt     45051 20 +     82728 GCTTCTTATGCCCCGTCTGC
s panTro4.chr5             169810969 20 - 182651097 GCTTCTTATGCCCCGTCTGC
i panTro4.chr5             C 0 C 0
s ponAbe2.chr5             170483026 19 - 183952662 GCTTCTTATG-CCCGTCTGC
i ponAbe2.chr5             C 0 C 0
s nomLeu3.chr6             109197307 20 - 121039945 GCTTCTTATGCCCCGTCTGC
i nomLeu3.chr6             C 0 C 0
s rheMac3.chrUn_JH290906       54917 20 -    153562 GCTTCTTATGCCCTGTCTGC
i rheMac3.chrUn_JH290906   C 0 C 0
s macFas5.chr6             168658508 20 - 181584905 GCTTCTTATGCCCTGTCTGC
i macFas5.chr6             C 0 C 0
s papAnu2.chr6             161878396 20 - 174439528 GCTTCTTATGCCCTGTCTGC
i papAnu2.chr6             C 0 C 0
s chlSab2.chr4              78769822 20 -  91010382 GCTTCTTTTGCCCCGTCTGC
i chlSab2.chr4             C 0 C 0
s calJac3.chr2             191071931 20 + 204313951 GTTTCTTATGCCCTGTGTGT
i calJac3.chr2             C 0 C 0
e canFam3.chr34              1920513 490 +  42124431 I

a score=69847.000000
s hg38.chr5_GL383532v1_alt     45071 20 +     82728 AGCAGCAGCTGTGCTCTTCC
s panTro4.chr5             169810989 20 - 182651097 AGCGGCAGCTGTGCTCTTCC
i panTro4.chr5             C 0 C 0
s ponAbe2.chr5             170483045 20 - 183952662 AGTGGCAGCTGTGCTCTTCC
i ponAbe2.chr5             C 0 I 445
s nomLeu3.chr6             109197327 20 - 121039945 AGTGGCAGCTGTGCTCTTCC
i nomLeu3.chr6             C 0 C 0
s rheMac3.chrUn_JH290906       54937 20 -    153562 AGTGGCAGCTGTGTTCTTCC
i rheMac3.chrUn_JH290906   C 0 C 0
s macFas5.chr6             168658528 20 - 181584905 AGTGGCAACTGTGTTCTTCC
i macFas5.chr6             C 0 C 0
s papAnu2.chr6             161878416 20 - 174439528 AGTGGCAGCTGTGTTCTTCC
i papAnu2.chr6             C 0 C 0
s chlSab2.chr4              78769842 20 -  91010382 AGTGGCAGCTGTGCTCTTCC
i chlSab2.chr4             C 0 C 0
s calJac3.chr2             191071951 20 + 204313951 GGTGGCAGCTGTGCTCTTCC
i calJac3.chr2             C 0 C 0
s canFam3.chr34              1921003 20 +  42124431 AGGAACATCTGTGCTTTTGC
i canFam3.chr34            I 490 C 0

a score=140838.000000
s hg38.chr5_GL383532v1_alt     45091 54 +     82728 CACTGTGGT--TTAGTCTGCTTAGCTTTGCTTGGATCTCATCCACGTGCCTTCTCA
s panTro4.chr5             169811009 54 - 182651097 CACTGTGGT--TGAATCTGCTTAGCTTTGCTTGGATCTCATCCACGTGCCTTCTCA
i panTro4.chr5             C 0 C 0
s nomLeu3.chr6             109197347 54 - 121039945 CACTGTCGT--TGAGTCTGCTTAGCTTTGCTTGGATCTCATCCACGTGCCTTCTCA
i nomLeu3.chr6             C 0 C 0
s rheMac3.chrUn_JH290906       54957 54 -    153562 CACGGTGGT--TGAGTTGGCTTAGCTTTGCTTGGATCTCATCCACATGCCTTCTCA
i rheMac3.chrUn_JH290906   C 0 C 0
s macFas5.chr6             168658548 54 - 181584905 CACGGTGGT--TGAGTTGGCTTAGCTTTGCTTGGATCTCATCCACGTGCCTTCTCA
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s papAnu2.chr6             161878436 54 - 174439528 CACTGTGGT--TGAGTTGGCTTAGCTTTGCTTGGATCTCATCCATGTGCCTTCTCA
i papAnu2.chr6             C 0 C 0
s chlSab2.chr4              78769862 54 -  91010382 CACTGTGGT--TGAGTTGGCTTAACTTTGCTTGGATCTAATCCACGTGCCTTCTTA
i chlSab2.chr4             C 0 C 0
s calJac3.chr2             191071971 54 + 204313951 CACTGTGGT--TGAGTCTGCTTAGCTTTCCTTGGATCTCCTCCCCATGCCTTCTCA
i calJac3.chr2             C 0 C 0
s canFam3.chr34              1921023 56 +  42124431 TGCTATGGCTATGGGTCTGCTTTGTTTTGCTTGGCTCTGATCCGTATGTTTTCTCA
i canFam3.chr34            C 0 C 0
e ponAbe2.chr5             170483065 445 - 183952662 I

a score=1122350.000000
s hg38.chr5_GL383532v1_alt     45145 359 +     82728 TTTTGAGAT-CAGAGATGAAGGTGAAG-TCTTTCTGTGGGACATATCCGATCTTGTGGT-G-AGGAGGAGTCaaatggagtcacacagcatgcacact-tttgactggcttgtttttgctcaacaaagtgttttgaggt-ggacatatcat-gtgcgtatcaacattttattcatttatatgcatgagaagtattacactttacaaaatatatccaaatttgtttttctatttacctgttaattgacatgtgagctgtttccaaatttttgtatttaggaatacaattactacgaatattcatttgaaacaatttgtataaactaaattttaatttctcttgggcaaatacctggaagtgaaacca
s panTro4.chr5             169811063 356 - 182651097 TTTTGAGAT-CAGAGATGAAGGTGAAG-TCTTTCTGTGGGACATATCAGATCTTGTGAT-G-AGGAGGAGTCaaatggagtcacacagcatgcacact-tttgactggcttgtttttgctcaacaaagtgttttgaggt-ggacatat----gtgcgtatcaacattttattcatttatatgcatgagaagtattacactttacaaaatatatccaaatttgtttttctatttacctgttaattgacatgtgagctgtttccaaatttttatatttaggaatacaattactacgaatattcatttgaaacaatttgtataaactaaattttaatttctcttgggcaaatacctggaagtgaaacca
i panTro4.chr5             C 0 C 0
s ponAbe2.chr5             170483510 357 - 183952662 TTTTGAGAT-CAGAGATGAAGGTGAAGTTCTTTCTGTGGGACCTGTCCGATCTTGTGGT-G-AGGAG--TCAaaatggagtcacacagcatgcatact-tttggctggcttgtttttgctcaacaaagtgctttgaggt-ggacatatcat-gtgcgtatcaacattttattcatttatatggatgagaagtattacactttacaaaatatatccaaatttgtttttttatttacctgttaattgacatgtgagctgtttccaaatttttgtatttaggaatacaattactacgaatattaa-tgaaaacaatttgtataaactaaattctattttctcttgggcaaatacctggaagtgaaacca
i ponAbe2.chr5             I 445 C 0
s nomLeu3.chr6             109197401 359 - 121039945 TTTTGAGAT-CAGAGATGAAGGTGAAG-TCTTTTTGTGGGACATGTCCGATCTTGTGGT-G-AGGAGGAGTCaaatggagtcacacagcatgcacact-tttgtctggcttgtttttgctcaacaaaatgttttgaggt-ggacatatcat-gtgcgtatcaacattttattcatttatatgcatgagaagtattgcactttacaaaatatatccaaatttgtttttctatttacctgttaagtgacatgtgagctgtttccaaatttttgtatttaggaatacaattactaagaatattcatgtgaaacaatttgcataaactaaattttaatttctcttgggcaaatacctggaagtgaaacca
i nomLeu3.chr6             C 0 C 0
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i rheMac3.chrUn_JH290906   C 0 C 0
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i ponAbe2.chr5             C 0 C 0
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i nomLeu3.chr6             C 0 C 0
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i macFas5.chr6             C 0 I 5
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i papAnu2.chr6             C 0 I 5
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i chlSab2.chr4             C 0 I 5
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i rheMac3.chrUn_JH290906   I 312 I 1
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i papAnu2.chr6             I 311 I 104
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i chlSab2.chr4             I 311 I 108
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i ponAbe2.chr5             C 0 C 0
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i nomLeu3.chr6             C 0 C 0
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i macFas5.chr6             I 1 I 78
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i papAnu2.chr6             I 104 C 0
s chlSab2.chr4              78804471  9 -  91010382 atatagat--a
i chlSab2.chr4             I 108 C 0
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i calJac3.chr2             C 0 C 0
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i panTro4.chr5             C 0 C 0
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i ponAbe2.chr5             C 0 C 0
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i nomLeu3.chr6             C 0 C 0
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i macFas5.chr6             I 78 C 0
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i papAnu2.chr6             C 0 C 0
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i chlSab2.chr4             C 0 C 0
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i calJac3.chr2             C 0 C 0
e canFam3.chr34              1929055 2823 +  42124431 I
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i panTro4.chr5             C 0 C 0
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i ponAbe2.chr5             C 0 C 0
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i nomLeu3.chr6             C 0 C 0
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i macFas5.chr6             C 0 I 1
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i papAnu2.chr6             C 0 C 0
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i chlSab2.chr4             C 0 I 2
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i chlSab2.chr4             I 2 C 0
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i panTro4.chr5             C 0 C 0
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i panTro4.chr5             C 0 C 0
s ponAbe2.chr5             170520679 229 - 183952662 CTGTAGCTAAACTATTTCATATATTAATCTCT--ACATTGATTTAAAGATCCATGTTGCCTACAATTTTTAAGTT-TAAAGAATAACATTCACCG--AAGTATCAGCAACACTTTGGTACATAATGTTACAAATTAAGCATCATACGTTTCCTATAAGAGCGTTTCTTTATCACTACATGGGTCCATGGCAAACAATATACTATACCACTGTATATTAGATGTA-CTAAGAGTAA
i ponAbe2.chr5             C 0 C 0
s nomLeu3.chr6             109234196 233 - 121039945 CTGTAGCTAAACTATTTCATATATTAATCTCTCCACATTGATTTAAAGATCCATGTTGCCTACAATTTTTAAGTT-TAAAAAATAACATTCACTGTTAAGTATCAGCAACACTTTGGTACATAATGTTACAAATTAAGCATCATACGTTTCCTATAAGAGCATTTCTTTATCACTACAT-GGTCCATGGCAAACAATATGCTATACCACTATATATTAGATGTATCTAAGGGTAA
i nomLeu3.chr6             C 0 C 0
s rheMac3.chrUn_JH290906       92370 229 -    153562 CTGTAGCTAAACTATTACACATATGAATCTCC--ACATTGATTTAAAG-TCCATGTTGTCTACAATTTTTAAGTT-TAAAGAATAACATTCATCG--AAGTATCAGCAACACTTTGGTACATAATGTTACAAATTAAGCATCATAAGTTTCCTATAAGAGCATTTCTTTATCACCACATGGGTCCATGGCAAACAATATGCTATATCACTATATACTAGATGTATCTAAGAGTTA
i rheMac3.chrUn_JH290906   C 0 C 0
s macFas5.chr6             168696195 229 - 181584905 CTGTAGCTAAACTATTACACATATGAATCTCC--ACATTGATTTAAAG-TCCATGTTGTCTACAATTTTTAAGTT-TAAAGAATAACATTCATCG--AAGTATCAGCAACACTTTGGTACATAATGTTACAAATTAAGCATCATAAGTTTCCTATAAGAGCATTTCTTTATCACCACATGGGTCCATGGCAAACAATATGCTATATCACTATATACTAGATGTATCTAAAAGTTA
i macFas5.chr6             C 0 C 0
s papAnu2.chr6             161915844 229 - 174439528 CTGTAGCTAAACTATTACACATATGAATCTCC--ACATTGATTTAAAG-TCCATGTTGTCtacaatttttaagtt-taaagaaTAACATTCATCG--AAGTATCAGCAACACTTTGGTACATAATGTTACAAATTAAGCATCATAAGTTTCCCATAAGAGCATTTCTTTATCACCACATGGGTCCATGGCAAACAATATGCTATGTCACTATATACTAGATGTATCTAAGAGTTA
i papAnu2.chr6             C 0 C 0
s chlSab2.chr4              78807723 229 -  91010382 CTGTAGCTAAACTATTACACATATGAATCTCC--ACATTGATTTAAAG-TCCATGTTATCTATAATTTTTAAGTT-TAAAGAATAACGTTCATCG--AAGTATCAGCAACACTTTGGTACATAATGTTACAAATTAAGCATCATAGGTCTCCTATAAGAGCATTTCTTTATCACCACATGGGTCCATGGCAAACAATATGCTATATCACTATATACTAGATGTATCTAAGAGTTA
i chlSab2.chr4             C 0 C 0
s calJac3.chr2             191100842 230 + 204313951 CTCTAGCTAAACTCTTTCATATATTAATCTCC--AAATTGATTTAAAGATCCATGTTGACTATAATTTTTAAGTT-TACAAAATAATATTCACCA--AGGTACCAGCAACACTTTGGCACATGATGTTATAAATTAAGCATCATATGTTTCCTATAAGAGTGTTTCTTTATCACCACATGGATCCATGACAAGCAATATACCATACCACTATATATTAGATGTATCCAAGAGGAA
i calJac3.chr2             C 0 C 0
s canFam3.chr34              1934302 223 +  42124431 cTATAGGTGAACTATTGCACACATTAATTCTC--AAACTGATTTAAAGGTCAGTGT-------GATTTTTCGGTTCTAAAGAATGGCATCAACCA--AAGAGTCAGCAATATTTTGATGGA-AACATAACAAATTAAGGCTCATATTTTTCCTATATGAGCATTTCTTTATGACTACATGAATCTACGGCAAACAATGTGCTCTGTAGATATACATCACATGTATTGTAGAGCAG
i canFam3.chr34            I 187 C 0

a score=733940.000000
s hg38.chr5_GL383532v1_alt     72233 253 +     82728 AGTCAgctgtacatggtagctcacgtctctaatcccagcactttaggaggccaaggtgggcagatagcttgagctcaggagtttgagaccagcctgggcaccaaggcaagacctcctctccactaaaaatacaaaaaaattagccaaatgtggtggcacacatctgtagtcccagctactctgggaggttgaggtgggaggatcacttgagcccaggaggcagaggttacagtgagccaagattgtgccactg
s panTro4.chr5             169838216 253 - 182651097 AGTCAgctgtacatggtagctcacgtctctaatcccagcactttaggaggccaaggtgggcagatagcttgagctcaggagtttgagaccagcctgggcaacaaagcaagacctcctctccactaaaaatacaaaaaaattagccaaatgtggtggcacacatctgtagtcccagctactctgggaggttgaggtgggaggatcacttgagcccgggaggcagaggttacagtgagccaagattgtgccactg
i panTro4.chr5             C 0 C 0
s ponAbe2.chr5             170520908 251 - 183952662 AGTCagctgtacatggtagctcacgactctaatcccagcactttaggaggccaaggtgggcaggtagcttgagctcaggagctcgagaccagcctgggcaccaaggcaagacctcctctccactaaaaatacaaaaaaattagccgaatgtggtg--acacatctgtagtcccagctactctgggaggctgaggtgggaggatcacttgagcctgggaggcagaggttacagtgagccaagatcgtgccactg
i ponAbe2.chr5             C 0 C 0
s nomLeu3.chr6             109234429 253 - 121039945 AGTCAgctgtacatggtagctcacgcctctaatcccagcactttaggaggccaaggtgggcagatagcttgagctcaggagttcaagaccagcctgtgtaccaaggcaagaccccttctccactaaatacacaaaaaaattagccgaatgtggtggcacacatctgtagtcccagctactctgggaggctgaggtgggaggatcacttgagcctggggggcagaggttacagtgagccaagatcgtgccactg
i nomLeu3.chr6             C 0 C 0
s rheMac3.chrUn_JH290906       92599 253 -    153562 AGTCAgctgtacgtggtagctcatgcctctaatcccagcactttaggaggccaaggcaggcaaatagcttgagctcaggagttcgagaccaacctgggcaccatggcaagacctcctctccaacaaaaatacaagaaaattagctgagtgtggtggtacacatctgtagtcccagctaccctgggagactgaggtgggaggatcgcttgagcctgggaggcagaggttgaagtgagccaagatcgtgcccccg
i rheMac3.chrUn_JH290906   C 0 I 31
s macFas5.chr6             168696424 253 - 181584905 AGTCAgctgtacgtggtagctcatgcctctaatcccagcactttaggaggccaaggcaggcaaatagcttgagctcaggagttcgagaccaacctgggcaccatggcaagacctcctctccaacaaaaatacaagaaaattagctgagtgtggtggtacacatctgtagtcccagctaccctgggaggctgaggcgggaggatcgcttgagcctgggaggcagaggttgaagtgagccaagatcgtgccactc
i macFas5.chr6             C 0 C 0
s papAnu2.chr6             161916073 253 - 174439528 AGTCAGCTgtacatggtagctcatgcctctaatcccagcactttaggaggccaaggcaggcaaatagcttgagctcaggagttcgagaccaacctgggcaccaTGGCAAGACCTCCTCTCcaacaaaaatacaagaaaattagctgagtgtggtggtacacatctgtagtcccagctaccctgggaggctgaggtgggaggatcgcttgagcctgggaggcagaggttgaagtgagccaagatcgtgccactg
i papAnu2.chr6             C 0 C 0
s chlSab2.chr4              78807952 253 -  91010382 AGTCAgctgtacgtggtagctcatgcctctaatcccagcactttaggaggccaaggcaggtaaatagcttgagctcaggagttcgagaccaacctgggcaccatggcaagacctcctctccaacaaaaatacaagaaaattagctgagtgtggtggtacacatctgtagtcccagctaccctgggaggctgaggtgggaggattgcttgagcctgggaggcagaggttgcagtgagccaagatcgtgccactg
i chlSab2.chr4             C 0 C 0
s calJac3.chr2             191101072 242 + 204313951 AGTCAGCTA-ACTTGATAgct------tctaatcccagcattttgggaggccaaggtgtgtgtataacttgagctcagaagtttgagaccagcctagacacaatggcaagacc---tctccactaaaaatacaaaaaaattagccaagtgtggtggcacatgtctgtactcccagctaccctgggaggctgaggtgggaggattgcctgag-ctgggaggcagaggttacagtgaaccaagatactgccacta
i calJac3.chr2             C 0 C 0
e canFam3.chr34              1934525   0 +  42124431 C

a score=75651.000000
s hg38.chr5_GL383532v1_alt     72486 36 +     82728 cactccagcctaggtgacagagtaagaccctgcctc
s panTro4.chr5             169838469 36 - 182651097 cactccagcctaggtgacagagtaagaccctgcctc
i panTro4.chr5             C 0 C 0
s ponAbe2.chr5             170521159 36 - 183952662 cactccagcctaggtgacagagtaagaccctgcctg
i ponAbe2.chr5             C 0 C 0
s nomLeu3.chr6             109234682 36 - 121039945 cactctagtctaggtgacagagtaagaccctgcctc
i nomLeu3.chr6             C 0 C 0
s macFas5.chr6             168696677 34 - 181584905 tactccagcctgggtgac--agtgagaccctgcctc
i macFas5.chr6             C 0 I 7
s papAnu2.chr6             161916326 34 - 174439528 tactccagcctgggtgac--agtgagaccctgcctc
i papAnu2.chr6             C 0 C 0
s chlSab2.chr4              78808205 34 -  91010382 tactccagcctgggtgac--agtgagactctgcctc
i chlSab2.chr4             C 0 I 6
s calJac3.chr2             191101314 36 + 204313951 cactccagcctgagtgacagagtgagaccctgcctc
i calJac3.chr2             C 0 I 4
e canFam3.chr34              1934525  0 +  42124431 C
e rheMac3.chrUn_JH290906       92852 31 -    153562 I

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s hg38.chr5_GL383532v1_alt     72522 21 +     82728 aa--aaaaaaaaaaaa--aaaaa-------GC-
s panTro4.chr5             169838505 28 - 182651097 aa--aaaaaaaaaaaa--aaaaaaaaaaaaGC-
i panTro4.chr5             C 0 C 0
s ponAbe2.chr5             170521195 18 - 183952662 aa--aaaaaaaaaaaa--aa----------GC-
i ponAbe2.chr5             C 0 C 0
s nomLeu3.chr6             109234718 30 - 121039945 aa--aaaaaaaaaaaaccaaaaaacagaaaaC-
i nomLeu3.chr6             C 0 C 0
s rheMac3.chrUn_JH290906       92883 21 -    153562 aa--aaaaaaaaaaaa--aaaaG-------GC-
i rheMac3.chrUn_JH290906   I 31 C 0
s macFas5.chr6             168696718 21 - 181584905 aa--aaaaaaaaaaaa--aaaaG-------GC-
i macFas5.chr6             I 7 C 0
s papAnu2.chr6             161916360 19 - 174439528 ----aaaaaaaaaaaa--aaaag-------gc-
i papAnu2.chr6             C 0 C 0
s chlSab2.chr4              78808245 23 -  91010382 aattaaaaaaaaaaaa--aaaaa-------GC-
i chlSab2.chr4             I 6 C 0
s calJac3.chr2             191101354 22 + 204313951 aa--aaaaaaaaaaaa--aaaaa-------GCA
i calJac3.chr2             I 4 C 0
e canFam3.chr34              1934525  0 +  42124431 C

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s hg38.chr5_GL383532v1_alt     72543 58 +     82728 AGTCAAACAAGGATAAGAGCAAGAATCTTTGGTATTATGTAAATTAATTACAAACTCT
s panTro4.chr5             169838533 58 - 182651097 AGTCAAATAAGGATAAGAGCAAGAATCTTTGGTATTATGTAAATTAATTACAAACTCT
i panTro4.chr5             C 0 C 0
s ponAbe2.chr5             170521213 58 - 183952662 AGTCAAATAAGGATAAGAGCAAGAATCTTTGGTATTATGTAAATTAATTACAAAGTCT
i ponAbe2.chr5             C 0 C 0
s nomLeu3.chr6             109234748 52 - 121039945 AGTCAA------ATAAGAGCAAGAATCTTTGGTATTATGTAAATTAATTACAAACTCT
i nomLeu3.chr6             C 0 C 0
s rheMac3.chrUn_JH290906       92904 58 -    153562 AGTCAACTGAGGATAAGAGCAAGACTCTTTGGTATTATGTAAATTAATTACAAACTCT
i rheMac3.chrUn_JH290906   C 0 C 0
s macFas5.chr6             168696739 58 - 181584905 AGTCAACTGAGGATAAGAGCAAGACTCTTTGGTATTATGTAAATTAATTACAAACTCT
i macFas5.chr6             C 0 C 0
s papAnu2.chr6             161916379 58 - 174439528 agtcaaCTGAGgataagagcaagactctttgGTATTATGTAAATTAATTACAAACTCT
i papAnu2.chr6             C 0 C 0
s chlSab2.chr4              78808268 58 -  91010382 AGTCAACTGAGGATAAGAGCAAGACTCTTTGGTATTATGTAAATTAATTACAAACTCT
i chlSab2.chr4             C 0 C 0
s calJac3.chr2             191101376 58 + 204313951 AGTCAAATGAAGATAAGAGCAAGTTTCTTTGGTATTATGTAAATTAATTACAAACtct
i calJac3.chr2             C 0 I 1161
s canFam3.chr34              1934525 58 +  42124431 AGTCAAACATGGTGAAGAGCAAGACTGTTCGGTGGTATATAAACTAATTGCAAATTCT
i canFam3.chr34            C 0 C 0

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s hg38.chr5_GL383532v1_alt     72601 225 +     82728 TATTCTATAACTAGACACTTGAGCCACAA-ATGGCCATTTATTTTCCAGGTGGGCCTTTTGCT-----ATAGAGTCAGGGTTGTATTCCG-TTAAACACATTACAACACAGGAGATGGGACTATCAGCAGAATTTTGAGATACTTGGATGTAATAGATCCTATGTCCACTGCATTAAAGGTCAG-TGTTTTGGTTGACTGTTGTACTACACGTTTTTTGAAAACCTCATTCTT
s panTro4.chr5             169838591 225 - 182651097 TATTCTATAACTAGACACTTGAGCCACAA-ATGGCCATTTATTTTCCAGGTGGGCCTTTTGCT-----ATAGAGTCAGGGTTGTATTCCG-TTAAACACATTACAACACAGGAGATGGGACTATCAGCAGAATTTTGAGATACTTGGATGTAATAGATCCTATGTCCACTGCATTAAAGGTCAG-TGTTTTGGTTGACTGTTGTACTACATGTTTTTTGAAAACCTCATTCTT
i panTro4.chr5             C 0 C 0
s ponAbe2.chr5             170521271 229 - 183952662 TATTCTATAACTAGACACTTGAGCCACAA-ATGGCCATTTATTTTCCAGGTGGGCCATTTGCT-ATAGATAGAGTCAGGGTTGTATTCTG-TTAAACATATTACAACACAGGAGATGGGACTATCAGCAGAATTTCCAGACACTTGGATGTAATACATCCTACGTCCACTGCATTAAAGGTCAG-TGTTTTGGTTGACTGTTGTACTACATGTTTGTTGAAAACCTCATTCTT
i ponAbe2.chr5             C 0 C 0
s nomLeu3.chr6             109234800 222 - 121039945 TATTCTGTAACTAGACACCTGAGCCACAA-ATGGCCATTTATTTTCCAGGTGGGCCATTTGCT-----ATAGAGTCAGGGTTGTATTCTG-TTAAACACATTACAACACAGGAGATGGGACTAT---CAGAATTTCCAGACACTTGGACGTAATAGATCCTATGTCCACTGCATTAAAGGTCAG-TGTTTTGGTTGACTGTTGTACTACATGTTTGTTGAAAACCTCATTCTT
i nomLeu3.chr6             C 0 C 0
s rheMac3.chrUn_JH290906       92962 229 -    153562 TATTCTATAGCTAGTCACTTGAGCCACAA-ATGGCCATTTATTTTCCAGGTTGGCCACTTGCT-ATAGACAGAGTCAGGGTTGTATTTTG-TTAAACACATTACAACACAGGAGATGGGACTGTCAGCAGAATTTCCAGACAATTGGACTTAATAGATCCTATGTCCACTGCATTAAAGGTCAG-TGTTTTGGTTGACTATTGTACCACATTTTTGTTGAAAACCTCATTCTT
i rheMac3.chrUn_JH290906   C 0 C 0
s macFas5.chr6             168696797 229 - 181584905 TATTCTATAGCTAGTCACTTGAGCCACAA-ATGGCCATTTATTTTCCAGGTTGGCCACTTGCT-ATAGACAGAGTCAGGGTTGTATTTTG-TTAAACACATTACAACACAGGAGATGGGACTGTCAGCAGAATTTCCAGACAATTGGACTTAATAGATCCTATGTCCACTGCATTAAAGGTCAG-TGTTTTGGTTGACTATTGTACCACATTTTTGTTGAAAACCTCATTCTT
i macFas5.chr6             C 0 C 0
s papAnu2.chr6             161916437 229 - 174439528 TATTCTATAGCTAGTCACTTGAGCCACAA-ATGGCCATTTATTTTCCAGGTTGGCCACTTGCT-ATAGAGAGAGTCAGGGTTGTATTTTG-TTAAACACATTACAACACAGGAGATGGGACTGTCAGCAGAATTTCCAGACAATTGGACTTAATAGATCCTATGTCCACTGCATTAAAGGTCAG-TGTTTTGGTTGACTATTGTACcacatttttgttgaaaacctcattctt
i papAnu2.chr6             C 0 C 0
s chlSab2.chr4              78808326 229 -  91010382 TATTCTATAGCTAGTCACTTGAACCACAA-ATGGCCATTTATTTTCCAGGCTAGCCACTTGCT-ATAGACAGAGTCAGGGTTGTATTTTG-TTAAACACATTACAACACAGGAGATGGGACTGTCAGCAGAATTTCCAGACACTTGGACTTAATAGATCTTATGTCCACTGCATTAAAGGTCAG-TGTTTTGGTTGACTATTGTACTACATTTTTGCTGAAAACCTCATGCTT
i chlSab2.chr4             C 0 C 0
s calJac3.chr2             191102595 218 + 204313951 tATTCTATAGCTAGTCACATGAGCCACAA-CTGGCCGTTTATTTTCTATGTGGGCCATTTGCT-GTAGATAGAGTCAGGGTTGTATTCTG-TTAAACACATTACAACACAGGAGATGTGACTGTGAGCAGAATTTCCAGACACTTGGACATAATAGATCCT-----------ATTAAAAGTCAG-TGTTTTGATTGACTGCTGTACTACATGTTTGTTGAAAACCTCATTCTT
i calJac3.chr2             I 1161 C 0
s canFam3.chr34              1934583 215 +  42124431 TAGTACAGAGCTCCTCACACAAGCCACAGTCTAACCACCTATTGTCCATGTGTGCCATCGGCTGGTGGGAAGAAGCA-GGTTGTAATCTGATTACACAC-------------AGATGTTTAACTCAGCACAATTTCCAGATGG--GAACATGATAGACATTTGGTCCACTGCATGAAAGGGCAGAAATTTTGGTTGACT--TGCAAAACATGTTCCCTTAAAACCTCATTCTT
i canFam3.chr34            C 0 I 323

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s hg38.chr5_GL383532v1_alt     72826 2 +     82728 TT
s panTro4.chr5             169838816 2 - 182651097 TT
i panTro4.chr5             C 0 C 0
s ponAbe2.chr5             170521500 2 - 183952662 TT
i ponAbe2.chr5             C 0 C 0
s nomLeu3.chr6             109235022 2 - 121039945 TT
i nomLeu3.chr6             C 0 I 309
s rheMac3.chrUn_JH290906       93191 2 -    153562 TT
i rheMac3.chrUn_JH290906   C 0 C 0
s macFas5.chr6             168697026 2 - 181584905 TT
i macFas5.chr6             C 0 C 0
s papAnu2.chr6             161916666 2 - 174439528 tt
i papAnu2.chr6             C 0 C 0
s chlSab2.chr4              78808555 2 -  91010382 TT
i chlSab2.chr4             C 0 C 0
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i calJac3.chr2             C 0 C 0
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i ponAbe2.chr5             C 0 C 0
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i rheMac3.chrUn_JH290906   C 0 C 0
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i macFas5.chr6             C 0 C 0
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i papAnu2.chr6             C 0 C 0
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i chlSab2.chr4             C 0 C 0
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i calJac3.chr2             C 0 C 0
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i canFam3.chr34            I 323 C 0

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i panTro4.chr5             C 0 C 0
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i ponAbe2.chr5             C 0 C 0
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i macFas5.chr6             C 0 C 0
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i papAnu2.chr6             C 0 C 0
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i panTro4.chr5             C 0 C 0
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i ponAbe2.chr5             C 0 C 0
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i canFam3.chr34            C 0 C 0

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i ponAbe2.chr5             C 0 I 12
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i papAnu2.chr6             C 0 C 0
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i chlSab2.chr4             C 0 I 30
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i canFam3.chr34            C 0 C 0
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i panTro4.chr5             C 0 C 0
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i ponAbe2.chr5             I 12 C 0
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i canFam3.chr34            C 0 C 0
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i panTro4.chr5             C 0 C 0
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i rheMac3.chrUn_JH290906   I 30 C 0
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i chlSab2.chr4             I 30 C 0
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i ponAbe2.chr5             C 0 C 0
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i rheMac3.chrUn_JH290906   C 0 C 0
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