gene: F

previous_residue: L

new_residue: P

type: aa

gene: G

previous_residue: T

new_residue: I

previous_residue: M

new_residue: T

gene: N

previous_residue: N

new_residue: Y

previous_residue: R

new_residue: H

gene: L

previous_residue: I

new_residue: L

new_residue: V

previous_residue: D

new_residue: N

gene: SH

previous_residue: F

new_residue: A

new_residue: M

new_residue: K

previous_residue: S

previous_residue: V

previous_residue: K

new_residue: R

gene: P

new_residue: S

title: RSV-A 2023-07-28 tree with 591 genomes from INSDC


meta_authors: Mink,M.A., Stec,D.S., Collins,P.L., Hill,M.G. III, Olmsted,R.A., Spriggs,M.K., Johnson,P.R., Buckler-White,A.J.

meta_goya_usher: Unassigned

meta_ramaekers_usher: Unassigned


meta_authors: Whitehead,S.S., Juhasz,K., Firestone,C.Y., Collins,P.L., Murphy,B.R.


meta_country: USA

meta_location: Milwaukee, WI

meta_authors: Rebuffo-Scheer,C., Bose,M.E., He,J., Khaja,S., Ulatowski,M., Beck,E.T., Fan,J., Kumar,S., Nelson,M.I., Henrickson,K.J.


meta_location: New York

meta_authors: Das,S.R., Halpin,R.A., Puri,V., Akopov,A., Fedorova,N., Tsitrin,T., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Gupta,N., Hoover,J., Katzel,D., Schobel,S., Shrivastava,S., Wentworth,D.E., Caserta,M.


meta_authors: Das,S.R., Halpin,R.A., Puri,V., Akopov,A., Fedorova,N., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Katzel,D., Schobel,S., Shrivastava,S., Wentworth,D.E., Caserta,M.


meta_authors: Rameix-Welti,M.-A., Sourimant,J., Yu,Q., Ribeiro,C., Galloux,M., Fix,J., Gault,E., Eleouet,J.-F.


meta_ramaekers_nextclade: Unassigned


meta_location: Tennessee

meta_authors: Newman,R.M., Zody,M.C., DeVincenzo,J.P., Grad,Y., Lipsitch,M., Murphy,R., Fitzgerald,M., Young,S., Gargeya,S., Poon,T.W., Charlebois,P., Weiner,B., Yang,X., Piper,M.E., McCowan,C., Ireland,A., Levin,J., Malboeuf,C., Qu,J., Chapman,S.B., Murphy,C., Wortman,J., Nusbaum,C., Birren,B.


meta_gcc_lineage: not-assigned


meta_location: SE Wisconsin

meta_authors: Lorenzi,H., Town,C., Halpin,R., Bera,J., Ransier,A., Fedorova,N., Stockwell,T., Amedeo,P., Appalla,L., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Hoover,J., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Rebuffo-Scheer,C., Fan,J., He,J., Kehl,S.C., Lederboer,N., Jurgens,L.A., Bose,M.E., Beck,E.T., Kumar,S., Wentworth,D.E., Henrickson,K.J.


meta_country: Netherlands

meta_authors: Tan,L., Lemey,P., Houspie,L., C Viveen,M., Jansen,N.J., van Loon,A.M., Wiertz,E., van Bleek,G.M., Martin,D.P., Coenjaerts,F.E., Viveen,M., Coenjaerts,F.


meta_authors: Tan,L., Lemey,P., Houspie,L., C Viveen,M., Jansen,N.J., van Loon,A.M., Wiertz,E., van Bleek,G.M., Martin,D.P., Coenjaerts,F.E., Viveen,M., Coenjaerts,F.E.J.


meta_country: Mexico

meta_authors: Lorenzi,H., Town,C., Halpin,R., Bera,J., Ransier,A., Fedorova,N., Stockwell,T., Amedeo,P., Appalla,L., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Hoover,J., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Rebuffo-Scheer,C., Fan,J., He,J., Kehl,S.C., Lederboer,N., Jurgens,L.A., Bose,M.E., Beck,E.T., Kumar,S., Noyola,D.E., Wentworth,D.E., Henrickson,K.J.


meta_authors: Das,S., Halpin,R.A., Bera,J., Fedorova,N., Tsitrin,T., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Gupta,N., Hoover,J., Katzel,D., Schobel,S., Shrivastava,S., Hartert,T., Moore,M., Chappell,J., Larkin,E., Wentworth,D.E., Anderson,L.J.


meta_country: South Africa

meta_authors: Lorenzi,H., Town,C., Halpin,R., Bera,J., Ransier,A., Fedorova,N., Stockwell,T., Amedeo,P., Appalla,L., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Hoover,J., Katzel,D., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Rebuffo-Scheer,C., Fan,J., He,J., Kehl,S.C., Lederboer,N., Jurgens,L.A., Bose,M.E., Beck,E.T., Kumar,S., Venter,M., Wentworth,D.E., Henrickson,K.J.


meta_country: Argentina

meta_authors: Lorenzi,H., Town,C., Halpin,R., Bera,J., Ransier,A., Fedorova,N., Stockwell,T., Amedeo,P., Appalla,L., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Hoover,J., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Rebuffo-Scheer,C., Fan,J., He,J., Kehl,S.C., Lederboer,N., Jurgens,L.A., Bose,M.E., Beck,E.T., Kumar,S., Videla,C., Wentworth,D.E., Henrickson,K.J.


meta_authors: Lorenzi,H., Town,C., Halpin,R., Bera,J., Ransier,A., Fedorova,N., Stockwell,T., Amedeo,P., Appalla,L., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Hoover,J., Katzel,D., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Rebuffo-Scheer,C., Fan,J., He,J., Kehl,S.C., Lederboer,N., Jurgens,L.A., Bose,M.E., Beck,E.T., Kumar,S., Noyola,D.E., Wentworth,D.E., Henrickson,K.J.


meta_authors: Grad,Y.H., Newman,R., Zody,M., Yang,X., Murphy,R., Qu,J., Malboeuf,C.M., Levin,J.Z., Lipsitch,M., DeVincenzo,J., Newman,R.M., Zody,M.C., DeVincenzo,J.P., Grad,Y., Fitzgerald,M., Young,S., Gargeya,S., Poon,T.W., Charlebois,P., Weiner,B., Piper,M.E., McCowan,C., Ireland,A., Levin,J., Malboeuf,C., Chapman,S.B., Murphy,C., Wortman,J., Nusbaum,C., Birren,B.


meta_country: Italy

meta_location: Pavia

meta_authors: Lorenzi,H., Town,C., Halpin,R., Bera,J., Ransier,A., Fedorova,N., Stockwell,T., Amedeo,P., Appalla,L., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Hoover,J., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Rebuffo-Scheer,C., Fan,J., He,J., Kehl,S.C., Lederboer,N., Jurgens,L.A., Bose,M.E., Beck,E.T., Kumar,S., Gerna,G., Wentworth,D.E., Henrickson,K.J.


meta_country: Australia

meta_authors: Lorenzi,H., Town,C., Halpin,R., Bera,J., Ransier,A., Fedorova,N., Stockwell,T., Amedeo,P., Appalla,L., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Hoover,J., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Rebuffo-Scheer,C., Fan,J., He,J., Kehl,S.C., Lederboer,N., Jurgens,L.A., Bose,M.E., Beck,E.T., Kumar,S., Kok,T., Wentworth,D.E., Henrickson,K.J.


meta_country: Viet Nam

meta_authors: Do,L.A., Wilm,A., van Doorn,H.R., Lam,H.M., Sim,S., Sukumaran,R., Tran,A.T., Nguyen,B.H., Tran,T.T., Tran,Q.H., Vo,Q.B., Tran Dac,N.A., Trinh,H.N., Nguyen,T.T., Le Binh,B.T., Le,K., Nguyen,M.T., Thai,Q.T., Vo,T.V., Ngo,N.Q., Dang,T.K., Cao,N.H., Tran,T.V., Ho,L.V., Farrar,J., De Jong,M., Chen,S., Nagarajan,N., Bryant,J.E., Hibberd,M.L., Do,L.A.H., Tran,T.T.L., Nguyen,t.T.H., Ngo,N.Q.M., Dang,t.K.H., de Jong,M.D., Nagaranjan,N.


meta_authors: Lorenzi,H., Town,C., Halpin,R., Bera,J., Ransier,A., Fedorova,N., Stockwell,T., Amedeo,P., Appalla,L., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Hoover,J., Katzel,D., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Rebuffo-Scheer,C., Fan,J., He,J., Kehl,S.C., Lederboer,N., Jurgens,L.A., Bose,M.E., Beck,E.T., Kumar,S., Videla,C., Wentworth,D.E., Henrickson,K.J.


meta_location: Nashville, Tennessee

meta_authors: Lorenzi,H., Halpin,R., Nguyen,A., Fedorova,N., Overton,L., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Chen,H., Edworthy,P., Gupta,N., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Shapiro,C.A., Williams,J., Peebles,S., Chi,M., Wentworth,D.E., Moore,M.L.


meta_authors: Das,S.R., Halpin,R.A., Puri,V., Akopov,A., Fedorova,N., Tsitrin,T., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Gupta,N., Hoover,J., Katzel,D., Schobel,S., Shrivastava,S., Wentworth,D.E., Caserta,M.


meta_authors: Rebuffo-Scheer,C., Bose,M.E., He,J., Khaja,S., Ulatowski,M., Beck,E.T., Fan,J., Kumar,S., Nelson,M.I., Henrickson,K.J.


meta_authors: Das,S.R., Halpin,R.A., Puri,V., Akopov,A., Fedorova,N., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Katzel,D., Schobel,S., Shrivastava,S., Wentworth,D.E., Caserta,M.


meta_authors: Widjojoatmodjo,M.N., Boes,J., van Bers,M., van Remmerden,Y., Roholl,P.J., Luytjes,W., Roholl,P.J.M.


meta_authors: Newman,R.M., Zody,M.C., DeVincenzo,J.P., Grad,Y., Lipsitch,M., Murphy,R., Fitzgerald,M., Young,S., Gargeya,S., Poon,T.W., Charlebois,P., Weiner,B., Yang,X., Piper,M.E., McCowan,C., Ireland,A., Levin,J., Malboeuf,C., Qu,J., Chapman,S.B., Murphy,C., Wortman,J., Nusbaum,C., Birren,B.


meta_country: China

meta_location: Guang Zhou

meta_authors: Zhang,K., He,J., Li,C., Bose,M.E., Henrickson,K.J., Zhou,J., Zheng,B.J., Cheng,Z., Bose,M., Zheng,B.


meta_country: Hong Kong


meta_country: Peru

meta_location: Piura

meta_authors: Wentworth,D.E., Halpin,R.A., Bera,J., Lin,X., Fedorova,N., Tsitrin,T., McLellan,M., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Gupta,N., Hoover,J., Katzel,D., Schobel,S., Shrivastava,S., Garcia,J., Laguna-Torres,V.A., Leguia,M., Benavides,J.G., Halsey,E.


meta_authors: Tan,L., Lemey,P., Houspie,L., C Viveen,M., Jansen,N.J., van Loon,A.M., Wiertz,E., van Bleek,G.M., Martin,D.P., Coenjaerts,F.E., Viveen,M., Coenjaerts,F.


meta_authors: Tan,L., Lemey,P., Houspie,L., C Viveen,M., Jansen,N.J., van Loon,A.M., Wiertz,E., van Bleek,G.M., Martin,D.P., Coenjaerts,F.E., Viveen,M., Coenjaerts,F.E.J.


meta_location: Lima


meta_location: Loreto


meta_authors: Lorenzi,H., Town,C., Halpin,R., Bera,J., Ransier,A., Fedorova,N., Stockwell,T., Amedeo,P., Appalla,L., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Hoover,J., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Rebuffo-Scheer,C., Fan,J., He,J., Kehl,S.C., Lederboer,N., Jurgens,L.A., Bose,M.E., Beck,E.T., Kumar,S., Videla,C., Wentworth,D.E., Henrickson,K.J.


meta_authors: Lorenzi,H., Town,C., Halpin,R., Bera,J., Ransier,A., Fedorova,N., Stockwell,T., Amedeo,P., Appalla,L., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Hoover,J., Katzel,D., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Rebuffo-Scheer,C., Fan,J., He,J., Kehl,S.C., Lederboer,N., Jurgens,L.A., Bose,M.E., Beck,E.T., Kumar,S., Venter,M., Wentworth,D.E., Henrickson,K.J.


meta_country: Belgium


meta_authors: Lorenzi,H., Town,C., Halpin,R., Bera,J., Ransier,A., Fedorova,N., Stockwell,T., Amedeo,P., Appalla,L., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Hoover,J., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Rebuffo-Scheer,C., Fan,J., He,J., Kehl,S.C., Lederboer,N., Jurgens,L.A., Bose,M.E., Beck,E.T., Kumar,S., Noyola,D.E., Wentworth,D.E., Henrickson,K.J.


meta_authors: Lorenzi,H., Town,C., Halpin,R., Bera,J., Ransier,A., Fedorova,N., Stockwell,T., Amedeo,P., Appalla,L., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Hoover,J., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Rebuffo-Scheer,C., Fan,J., He,J., Kehl,S.C., Lederboer,N., Jurgens,L.A., Bose,M.E., Beck,E.T., Kumar,S., Wentworth,D.E., Henrickson,K.J.


meta_country: Germany

meta_location: Freiburg

meta_authors: Lorenzi,H., Town,C., Halpin,R., Bera,J., Ransier,A., Fedorova,N., Stockwell,T., Amedeo,P., Appalla,L., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Hoover,J., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Rebuffo-Scheer,C., Fan,J., He,J., Kehl,S.C., Lederboer,N., Jurgens,L.A., Bose,M.E., Beck,E.T., Kumar,S., Neumann-Haefelin,D., Wentworth,D.E., Henrickson,K.J.


meta_authors: Do,L.A., Wilm,A., van Doorn,H.R., Lam,H.M., Sim,S., Sukumaran,R., Tran,A.T., Nguyen,B.H., Tran,T.T., Tran,Q.H., Vo,Q.B., Tran Dac,N.A., Trinh,H.N., Nguyen,T.T., Le Binh,B.T., Le,K., Nguyen,M.T., Thai,Q.T., Vo,T.V., Ngo,N.Q., Dang,T.K., Cao,N.H., Tran,T.V., Ho,L.V., Farrar,J., De Jong,M., Chen,S., Nagarajan,N., Bryant,J.E., Hibberd,M.L., Do,L.A.H., Tran,T.T.L., Nguyen,t.T.H., Ngo,N.Q.M., Dang,t.K.H., de Jong,M.D., Nagaranjan,N.


meta_location: Guangzhou

meta_authors: Xie,J.H., Zhu,B., Zhong,J.Y., Chen,Y., Zhang,Y.Y.


meta_authors: Lorenzi,H., Town,C., Halpin,R., Bera,J., Ransier,A., Fedorova,N., Stockwell,T., Amedeo,P., Appalla,L., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Hoover,J., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Rebuffo-Scheer,C., Fan,J., He,J., Kehl,S.C., Lederboer,N., Jurgens,L.A., Bose,M.E., Beck,E.T., Kumar,S., Gerna,G., Wentworth,D.E., Henrickson,K.J.


meta_authors: Lorenzi,H., Town,C., Halpin,R., Bera,J., Ransier,A., Fedorova,N., Stockwell,T., Amedeo,P., Appalla,L., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Hoover,J., Katzel,D., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Rebuffo-Scheer,C., Fan,J., He,J., Kehl,S.C., Lederboer,N., Jurgens,L.A., Bose,M.E., Beck,E.T., Kumar,S., Neumann-Haefelin,D., Wentworth,D.E., Henrickson,K.J.


meta_authors: Rebuffo-Scheer,C., Bose,M.E., He,J., Khaja,S., Ulatowski,M., Beck,E.T., Fan,J., Kumar,S., Nelson,M.I., Henrickson,K.J.


meta_location: Chongqing

meta_authors: Gu,H., Xie,Z., Li,T., Zhang,S., Lai,C., Zhu,P., Wang,K., Han,L., Duan,Y., Zhao,Z., Yang,X., Xing,L., Zhang,P., Wang,Z., Li,R., Yu,J.J., Wang,X., Yang,P., Gu,H.J., Sun,S.J., Chen,R., Yang,P.H.


meta_authors: Das,S., Halpin,R.A., Bera,J., Fedorova,N., Tsitrin,T., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Gupta,N., Hoover,J., Katzel,D., Schobel,S., Shrivastava,S., Hartert,T., Moore,M., Chappell,J., Larkin,E., Wentworth,D.E., Anderson,L.J.


meta_country: India

meta_authors: Choudhary,M.L., Wadhwa,B.S., Jadhav,S.M., Chadha,M.S., Wadhwa,B., Mourya,D.T.


meta_authors: Das,S., Halpin,R.A., Bera,J., Puri,V., Fedorova,N., Tsitrin,T., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Katzel,D., Schobel,S., Shrivastava,S., Hartert,T., Moore,M., Chappell,J., Larkin,E., Wentworth,D.E., Anderson,L.J.


meta_authors: Newman,R.M., Zody,M.C., DeVincenzo,J.P., Grad,Y., Lipsitch,M., Murphy,R., Fitzgerald,M., Young,S., Gargeya,S., Poon,T.W., Charlebois,P., Weiner,B., Yang,X., Piper,M.E., McCowan,C., Ireland,A., Levin,J., Malboeuf,C., Qu,J., Chapman,S.B., Murphy,C., Wortman,J., Nusbaum,C., Birren,B.


meta_country: South Korea

meta_authors: Lee,W.J., Kim,Y.J., Kim,D.W., Lee,H.S., Lee,H.Y., Kim,K., Kim,Y.-J.


meta_authors: Wentworth,D.E., Halpin,R.A., Bera,J., Lin,X., Fedorova,N., Tsitrin,T., McLellan,M., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Gupta,N., Hoover,J., Katzel,D., Schobel,S., Shrivastava,S., Garcia,J., Laguna-Torres,V.A., Leguia,M., Benavides,J.G., Halsey,E.