Fish Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of fish only.

See also: hub accessassembly statistics


Data resource links

NOTE: Click on the column headers to sort the table by that column
The link to genome browser will attach only that single assembly to the genome browser.
The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 alligator pipefish (LvHL_M 2021)
GCF_019802595.1
54,226
(11.15 %)
13,427
(2.67 %)
46,903
(5.94 %)
n/a 42.94
(100.00 %)
144
(0.00 %)
143
(100.00 %)
1,200,994
(30.62 %)
143,062
(2.20 %)
3,921,676
(38.03 %)
67,978
(8.92 %)
2 allis shad
GCF_017589495.1
48,507
(8.47 %)
15,371
(2.28 %)
58,686
(5.84 %)
n/a 42.99
(99.91 %)
1,541
(0.09 %)
1,095
(100.00 %)
1,190,406
(9.30 %)
1,205,679
(11.28 %)
3,960,328
(38.81 %)
36,494
(1.83 %)
3 Amazon molly
GCF_000485575.1
56,958
(11.69 %)
15,117
(2.64 %)
30,114
(6.60 %)
n/a 39.16
(95.38 %)
36,429
(4.64 %)
31,058
(95.36 %)
346,461
(2.03 %)
188,557
(1.44 %)
5,139,633
(26.01 %)
35,229
(1.82 %)
4 amberjack S.aureovittata (China HTS-2021-v1 2021)
GCF_021018895.1
47,198
(13.10 %)
15,500
(3.14 %)
41,230
(6.67 %)
n/a 40.79
(99.99 %)
150
(0.01 %)
31
(100.00 %)
1,230,524
(26.57 %)
398,694
(5.41 %)
4,106,609
(25.60 %)
15,656
(0.99 %)
5 American shad (fAloSap1 alternate hap 2021)
GCA_018492705.1
n/a 15,901
(2.25 %)
61,133
(6.37 %)
n/a 43.14
(100.00 %)
1
(0.00 %)
5,411
(100.00 %)
2,043,181
(23.64 %)
1,141,539
(11.35 %)
3,668,314
(38.60 %)
40,218
(2.14 %)
6 American shad (fAloSap1 primary hap 2021)
GCF_018492685.1
70,400
(9.39 %)
16,145
(2.29 %)
60,087
(6.26 %)
76,974
(8.55 %)
43.18
(99.45 %)
1,639
(0.55 %)
74
(100.00 %)
1,297,174
(9.39 %)
1,245,221
(12.59 %)
3,857,267
(39.43 %)
42,699
(2.23 %)
7 Andian cavefish (hap1 2023)
GCF_030014385.1
42,881
(5.97 %)
15,802
(1.97 %)
47,186
(4.62 %)
n/a 40.27
(100.00 %)
198
(0.00 %)
349
(100.00 %)
2,616,870
(40.73 %)
658,784
(9.71 %)
5,197,126
(48.95 %)
48,344
(2.62 %)
8 annual killifish
GCF_001266775.1
38,517
(8.87 %)
14,027
(2.45 %)
27,798
(5.86 %)
n/a 39.29
(80.23 %)
1,025,519
(19.94 %)
168,368
(80.17 %)
349,927
(2.63 %)
296,826
(3.18 %)
5,039,517
(28.69 %)
26,364
(1.18 %)
9 Antarctic jonasfish (primary hap 2024)
GCA_963971535.1
n/a 16,678
(0.56 %)
151,361
(4.03 %)
n/a 44.57
(99.91 %)
15,113
(0.09 %)
5,983
(100.00 %)
12,251,532
(51.73 %)
3,521,157
(17.69 %)
10,051,020
(68.37 %)
494,595
(10.52 %)
10 Antarctic lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_951214905.1
n/a 17,318
(1.49 %)
80,097
(5.79 %)
n/a 43.49
(100.00 %)
n/a 11,436
(100.00 %)
5,482,467
(36.71 %)
1,454,729
(18.84 %)
6,756,226
(47.56 %)
92,057
(3.50 %)
11 Antarctic lanternfish (primary hap 2023)
GCA_951216825.1
n/a 17,342
(1.44 %)
78,914
(5.48 %)
n/a 43.57
(99.96 %)
3,179
(0.04 %)
1,901
(100.00 %)
5,980,457
(37.18 %)
1,633,782
(21.76 %)
6,279,725
(52.83 %)
104,688
(3.57 %)
12 Arctic char
GCF_002910315.2
67,196
(4.99 %)
23,967
(1.55 %)
45,775
(3.69 %)
n/a 43.16
(93.25 %)
1,718,015
(6.84 %)
16,700
(99.99 %)
1,011,348
(4.06 %)
1,666,148
(10.50 %)
10,597,529
(44.77 %)
76,282
(1.94 %)
13 Aristotle's catfish (alternate hap 2022)
GCA_946807865.1
n/a 14,032
(2.44 %)
39,770
(4.92 %)
n/a 38.85
(100.00 %)
n/a 7,617
(100.00 %)
1,808,149
(37.98 %)
583,449
(10.56 %)
4,203,368
(40.67 %)
24,867
(2.06 %)
14 Aristotle's catfish (primary hap 2022)
GCA_946808225.1
n/a 15,455
(2.53 %)
40,077
(4.90 %)
86,346
(8.45 %)
38.90
(99.98 %)
795
(0.02 %)
241
(100.00 %)
2,045,691
(38.70 %)
669,975
(11.72 %)
4,638,765
(42.07 %)
28,277
(1.93 %)
15 Arkansas darter
GCF_013103735.1
51,282
(9.79 %)
14,588
(2.90 %)
42,306
(6.27 %)
n/a 40.52
(99.50 %)
35,052
(0.52 %)
4,664
(100.00 %)
418,294
(3.29 %)
331,380
(3.74 %)
4,153,309
(26.60 %)
15,489
(0.95 %)
16 arroyo chub (AC-1 alternate hap 2022)
GCA_026230005.1
n/a 17,862
(2.29 %)
70,667
(5.50 %)
n/a 40.01
(100.00 %)
327
(0.00 %)
179
(100.00 %)
2,876,989
(50.39 %)
700,511
(9.88 %)
5,977,913
(44.08 %)
104,320
(8.02 %)
17 arroyo chub (AC-1 primary hap 2022)
GCA_026230025.1
n/a 18,025
(2.28 %)
71,255
(5.50 %)
n/a 40.03
(100.00 %)
318
(0.00 %)
341
(100.00 %)
2,884,301
(50.42 %)
702,464
(9.98 %)
5,989,299
(44.18 %)
105,945
(8.03 %)
18 Asian bonytongue (2019)
GCF_900964775.1
50,315
(9.13 %)
16,526
(2.73 %)
38,780
(6.64 %)
72,662
(8.52 %)
44.16
(99.99 %)
145
(0.01 %)
72
(100.00 %)
504,673
(3.06 %)
216,136
(1.69 %)
4,323,242
(26.50 %)
88,517
(10.73 %)
19 Asian bonytongue (alternate hap)
GCA_900964985.2
n/a 16,053
(2.73 %)
74,777
(7.26 %)
n/a 44.15
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,006
(100.00 %)
482,351
(3.03 %)
207,018
(1.68 %)
4,139,370
(26.26 %)
85,546
(10.82 %)
20 Asian redtail catfish (EC202008001 2021)
GCF_019097595.1
51,017
(10.40 %)
15,549
(2.60 %)
42,858
(5.39 %)
n/a 39.70
(100.00 %)
107
(0.00 %)
73
(100.00 %)
1,718,992
(31.80 %)
749,009
(14.09 %)
4,206,758
(37.30 %)
19,230
(1.16 %)
21 Atlantic bluefin tuna (primary hap 2024)
GCA_963924715.1
n/a 15,722
(2.57 %)
43,026
(5.68 %)
n/a 39.77
(99.99 %)
468
(0.01 %)
120
(100.00 %)
1,608,686
(33.02 %)
253,749
(4.14 %)
5,181,115
(27.80 %)
14,488
(0.90 %)
22 Atlantic cod (2019)
GCF_902167405.1
51,642
(11.92 %)
14,055
(2.62 %)
36,761
(8.42 %)
68,438
(9.50 %)
45.64
(96.48 %)
1,216
(3.52 %)
227
(100.00 %)
790,946
(10.54 %)
855,327
(13.06 %)
2,851,161
(33.38 %)
97,133
(7.82 %)
23 Atlantic cod (alternate hap)
GCA_902167395.1
n/a 13,366
(2.68 %)
66,599
(9.29 %)
n/a 45.55
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3,592
(100.00 %)
696,727
(10.13 %)
749,876
(13.00 %)
2,554,769
(33.77 %)
87,167
(8.03 %)
24 Atlantic halibut (2019 refseq)
GCF_009819705.1
52,130
(11.46 %)
14,961
(3.19 %)
45,365
(7.48 %)
69,662
(10.94 %)
42.21
(99.43 %)
290
(0.57 %)
57
(100.00 %)
428,321
(4.16 %)
256,153
(3.73 %)
3,725,981
(24.13 %)
31,325
(2.25 %)
25 Atlantic halibut (alternate hap 2019)
GCA_009819745.1
n/a 16,554
(3.01 %)
54,832
(7.45 %)
n/a 42.29
(100.00 %)
62
(0.00 %)
4,053
(100.00 %)
494,008
(4.23 %)
299,066
(3.87 %)
4,272,649
(24.46 %)
36,868
(2.33 %)
26 Atlantic herring (v2)
GCF_900700415.2
50,946
(10.35 %)
16,394
(2.60 %)
61,637
(7.20 %)
n/a 44.16
(99.89 %)
1,990
(0.11 %)
3,687
(99.89 %)
1,269,688
(11.71 %)
1,318,661
(13.43 %)
3,732,801
(32.49 %)
35,959
(1.97 %)
27 Atlantic horse mackerel (alternate hap 2021)
GCA_905171655.2
n/a 15,331
(2.42 %)
52,370
(6.91 %)
n/a 41.96
(100.00 %)
74
(0.00 %)
1,049
(100.00 %)
1,454,631
(18.29 %)
383,946
(4.34 %)
4,363,016
(32.69 %)
56,416
(3.08 %)
28 Atlantic horse mackerel (primary hap 2021)
GCA_905171665.2
n/a 15,262
(2.42 %)
51,857
(6.86 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
222
(0.00 %)
153
(100.00 %)
1,454,219
(18.25 %)
384,609
(4.72 %)
4,338,083
(32.80 %)
56,553
(3.08 %)
29 Atlantic mackerel (primary hap 2023)
GCA_963691925.1
n/a 15,291
(2.56 %)
43,206
(5.92 %)
n/a 39.78
(99.96 %)
1,489
(0.04 %)
666
(100.00 %)
1,496,244
(26.83 %)
395,543
(8.92 %)
4,523,761
(29.92 %)
13,309
(0.75 %)
30 Atlantic mackerel (primary hap 2023)
GCF_963691925.1
34,357
(8.10 %)
15,289
(2.56 %)
43,205
(5.92 %)
n/a 39.78
(99.96 %)
1,489
(0.04 %)
665
(100.00 %)
1,496,240
(26.83 %)
395,543
(8.92 %)
4,523,726
(29.93 %)
13,308
(0.75 %)
31 Atlantic salmon (refseq 2021)
GCF_905237065.1
112,906
(5.61 %)
28,077
(1.40 %)
115,207
(3.75 %)
183,727
(7.26 %)
43.42
(100.00 %)
211
(0.00 %)
4,222
(100.00 %)
1,300,611
(4.84 %)
2,247,891
(25.01 %)
10,731,814
(59.31 %)
77,089
(1.86 %)
32 Atlantic salmon (Sally 2015)
GCF_000233375.1
109,794
(5.45 %)
26,968
(1.35 %)
202,772
(19.11 %)
n/a 43.10
(88.27 %)
138,207
(11.73 %)
241,570
(99.97 %)
1,628,119
(9.46 %)
2,496,917
(19.18 %)
10,390,780
(51.80 %)
79,791
(1.60 %)
33 Atlantic turbot (AOZZmale01 2020)
GCF_013347765.1
60,214
(14.44 %)
14,860
(3.40 %)
50,921
(8.07 %)
76,242
(9.93 %)
43.38
(100.00 %)
51
(0.00 %)
127
(100.00 %)
449,865
(5.00 %)
299,255
(7.03 %)
3,274,219
(25.77 %)
67,338
(7.00 %)
34 ballan wrasse (2016)
GCF_900080235.1
42,362
(9.30 %)
16,129
(2.44 %)
33,854
(5.87 %)
n/a 40.89
(99.98 %)
257
(0.02 %)
13,466
(100.00 %)
503,078
(3.93 %)
321,407
(5.60 %)
4,329,412
(30.36 %)
21,221
(1.07 %)
35 ballan wrasse (primary hap 2024)
GCA_963930695.1
n/a 15,142
(2.66 %)
43,601
(6.21 %)
n/a 40.59
(99.98 %)
815
(0.02 %)
133
(100.00 %)
1,221,802
(30.10 %)
290,738
(7.79 %)
4,164,845
(30.34 %)
17,126
(0.94 %)
36 banded archerfish (alternate hap 2021)
GCA_017976295.1
n/a 15,211
(3.23 %)
41,620
(7.14 %)
n/a 41.08
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2,393
(100.00 %)
785,178
(17.57 %)
249,148
(8.36 %)
3,391,653
(26.49 %)
13,787
(0.93 %)
37 banded archerfish (primary hap 2021 refseq)
GCF_017976425.1
42,399
(11.11 %)
15,310
(3.17 %)
41,147
(7.01 %)
62,990
(9.37 %)
41.11
(99.82 %)
98
(0.18 %)
96
(100.00 %)
463,524
(3.35 %)
271,913
(9.55 %)
3,355,326
(28.08 %)
15,089
(0.96 %)
38 banded killifish (hap1 2024)
GCA_037039145.1
n/a 15,122
(1.44 %)
65,809
(4.50 %)
n/a 41.23
(99.74 %)
293
(0.26 %)
331
(100.00 %)
2,545,429
(50.53 %)
451,939
(5.50 %)
5,807,705
(42.18 %)
94,695
(3.92 %)
39 banded killifish (hap2 2024)
GCA_037038625.1
n/a 15,024
(1.45 %)
65,141
(4.53 %)
n/a 41.23
(99.52 %)
373
(0.48 %)
196
(100.00 %)
2,509,508
(50.53 %)
441,892
(5.11 %)
6,245,443
(38.22 %)
93,198
(3.82 %)
40 barbel (alternate hap 2022)
GCA_936446605.1
n/a 26,794
(3.15 %)
76,434
(5.64 %)
n/a 37.81
(100.00 %)
1
(0.00 %)
8,035
(100.00 %)
4,084,361
(52.18 %)
538,411
(4.25 %)
7,659,980
(38.94 %)
58,008
(2.90 %)
41 barbel (primary hap 2022)
GCA_936440315.1
n/a 31,876
(3.30 %)
85,063
(5.65 %)
n/a 37.89
(100.00 %)
108
(0.00 %)
92
(100.00 %)
4,839,533
(52.47 %)
646,636
(4.57 %)
8,240,279
(42.13 %)
71,384
(3.04 %)
42 barramundi perch (ASB-BC8 2022)
GCF_001640805.2
53,646
(13.68 %)
16,073
(3.06 %)
44,214
(6.63 %)
n/a 40.76
(98.88 %)
674
(1.12 %)
2,997
(100.00 %)
986,469
(19.78 %)
237,272
(4.32 %)
3,983,840
(23.58 %)
16,237
(1.03 %)
43 bicolor damselfish
GCF_000690725.1
32,951
(8.67 %)
15,181
(2.55 %)
31,420
(5.94 %)
n/a 41.66
(93.68 %)
44,409
(6.34 %)
42,059
(93.66 %)
351,453
(2.61 %)
180,113
(1.20 %)
5,016,154
(23.41 %)
46,423
(2.30 %)
44 black goby (alternate hap 2023)
GCA_951799965.1
n/a 14,534
(2.11 %)
56,906
(6.41 %)
n/a 42.10
(100.00 %)
n/a 3,523
(100.00 %)
2,445,373
(45.07 %)
452,878
(9.46 %)
4,195,077
(39.49 %)
77,592
(4.86 %)
45 black goby (primary hap 2023)
GCA_951799975.1
n/a 14,455
(2.06 %)
56,488
(6.31 %)
n/a 42.10
(99.99 %)
636
(0.01 %)
298
(100.00 %)
3,230,397
(55.09 %)
494,440
(10.43 %)
4,359,169
(40.46 %)
81,684
(4.81 %)
46 black perch (LCO1_2020_lvr alternate hap 2022)
GCA_022578405.1
n/a 31,847
(2.01 %)
153,565
(6.53 %)
n/a 41.78
(99.99 %)
639
(0.00 %)
63,422
(100.00 %)
2,786,840
(18.28 %)
1,016,389
(7.50 %)
8,844,631
(26.90 %)
130,556
(4.42 %)
47 black perch (LCO1_2020_lvr primary hap 2022)
GCA_022577435.1
n/a 14,991
(3.02 %)
47,106
(6.98 %)
n/a 41.61
(100.00 %)
234
(0.00 %)
230
(100.00 %)
1,017,149
(18.99 %)
360,899
(8.75 %)
3,761,526
(28.91 %)
48,360
(4.43 %)
48 black rockcod
GCF_000735185.1
35,176
(8.54 %)
12,601
(2.15 %)
42,589
(6.13 %)
n/a 40.62
(97.93 %)
59,164
(2.09 %)
72,571
(97.92 %)
268,591
(2.71 %)
238,334
(3.18 %)
3,425,479
(29.48 %)
31,009
(2.11 %)
49 black seabass (Rhode Island RG_2023a 2023)
GCF_030273125.1
43,392
(8.45 %)
15,522
(2.13 %)
48,255
(5.50 %)
n/a 38.69
(100.00 %)
341
(0.00 %)
92
(100.00 %)
1,651,919
(22.26 %)
782,601
(7.55 %)
5,398,047
(38.87 %)
24,508
(1.19 %)
50 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 1 2023)
GCA_028021495.1
n/a 15,274
(2.92 %)
51,453
(7.45 %)
n/a 43.07
(99.99 %)
373
(0.01 %)
461
(100.00 %)
1,239,364
(29.69 %)
354,703
(9.63 %)
3,006,556
(30.35 %)
53,503
(4.48 %)
51 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 2 2023)
GCA_028022725.1
n/a 15,043
(2.96 %)
50,860
(7.54 %)
n/a 42.98
(99.99 %)
366
(0.01 %)
109
(100.00 %)
1,210,142
(29.44 %)
340,820
(9.19 %)
2,986,750
(29.89 %)
52,010
(4.20 %)
52 blackstripe livebearer (line A6 2022)
GCF_027474105.1
44,847
(11.30 %)
15,364
(2.86 %)
51,122
(6.88 %)
n/a 39.48
(99.99 %)
89
(0.01 %)
415
(100.00 %)
1,160,519
(28.33 %)
183,082
(4.75 %)
4,354,804
(27.83 %)
40,207
(2.97 %)
53 blacktail shiner (hap1 2024)
GCA_038021265.1
n/a 17,403
(2.99 %)
45,903
(5.38 %)
n/a 38.64
(99.99 %)
709
(0.01 %)
673
(100.00 %)
2,141,901
(35.77 %)
482,931
(17.18 %)
4,297,133
(46.82 %)
41,889
(2.32 %)
54 blacktail shiner (hap2 2024)
GCA_038024135.1
n/a 17,486
(2.97 %)
46,833
(5.41 %)
n/a 38.79
(99.99 %)
720
(0.01 %)
413
(100.00 %)
2,165,269
(36.18 %)
490,692
(17.84 %)
4,251,333
(47.54 %)
42,744
(2.37 %)
55 blue catfish (D&B 2022)
GCF_023375685.1
48,916
(10.27 %)
15,574
(2.62 %)
44,035
(5.21 %)
n/a 39.80
(98.04 %)
171
(1.96 %)
43
(100.00 %)
2,180,806
(45.14 %)
625,260
(6.63 %)
5,137,199
(35.52 %)
31,164
(1.89 %)
56 blue tilapia (BGI-SZ)
GCF_005870065.1
36,881
(7.40 %)
15,408
(2.38 %)
27,235
(5.59 %)
n/a 40.42
(89.87 %)
53,539
(10.15 %)
12,952
(100.00 %)
867,639
(16.39 %)
195,137
(1.62 %)
5,293,484
(23.10 %)
21,238
(1.02 %)
57 blue tilapia (Guangdong)
GCF_013358895.1
57,860
(9.04 %)
15,494
(1.98 %)
57,878
(5.63 %)
56,939
(8.11 %)
40.66
(99.97 %)
723
(0.03 %)
304
(100.00 %)
1,055,724
(20.14 %)
324,841
(3.27 %)
5,000,753
(32.08 %)
32,357
(1.59 %)
58 bluestripe pipefish (RoL2022-K1 2023)
GCF_030265055.1
63,345
(14.83 %)
14,387
(3.54 %)
43,563
(7.96 %)
n/a 41.68
(100.00 %)
12
(0.00 %)
57
(100.00 %)
842,739
(18.67 %)
356,558
(12.86 %)
2,720,911
(41.08 %)
40,187
(4.66 %)
59 blunt-snouted clingfish (alternate hap)
GCA_900650505.1
n/a 12,494
(1.93 %)
44,967
(5.14 %)
n/a 38.20
(100.00 %)
1
(0.00 %)
7,675
(100.00 %)
608,174
(4.23 %)
390,755
(4.71 %)
4,977,071
(42.41 %)
23,532
(1.46 %)
60 blunt-snouted clingfish (v2 2020 genbank)
GCA_900634775.2
n/a 14,499
(1.97 %)
51,213
(5.47 %)
n/a 38.27
(98.47 %)
1,160
(1.53 %)
442
(100.00 %)
731,731
(4.21 %)
471,623
(4.92 %)
5,974,055
(42.88 %)
29,052
(1.48 %)
61 Boeseman's rainbowfish (fMelBoe1 alternate hap 2021)
GCA_017639755.1
n/a 13,882
(2.27 %)
45,919
(5.98 %)
n/a 39.50
(99.99 %)
45
(0.01 %)
3,194
(100.00 %)
803,073
(13.60 %)
258,404
(4.19 %)
4,674,614
(28.36 %)
15,524
(1.02 %)
62 Boeseman's rainbowfish (fMelBoe1 primary hap 2021)
GCF_017639745.1
51,238
(8.77 %)
15,174
(2.24 %)
51,552
(6.21 %)
n/a 39.65
(99.63 %)
440
(0.37 %)
93
(100.00 %)
542,278
(3.15 %)
303,669
(4.77 %)
5,189,645
(29.11 %)
18,525
(1.10 %)
63 Bolin's lanternfish (primary hap 2024)
GCA_963924005.1
n/a 16,964
(1.77 %)
67,673
(5.93 %)
n/a 42.61
(99.97 %)
1,785
(0.03 %)
979
(100.00 %)
4,285,965
(30.73 %)
1,222,431
(20.69 %)
6,105,881
(46.99 %)
73,543
(3.28 %)
64 bonti-bonti (fTelBon1 alternate hap 2022)
GCA_933228925.1
n/a 12,424
(1.95 %)
46,550
(6.00 %)
n/a 41.63
(100.00 %)
n/a 4,619
(100.00 %)
789,207
(14.61 %)
348,482
(20.98 %)
3,447,241
(38.72 %)
27,035
(4.16 %)
65 bonti-bonti (fTelBon1 primary hap 2022)
GCA_933228915.1
n/a 14,929
(1.93 %)
55,343
(5.90 %)
n/a 41.66
(99.97 %)
1,329
(0.03 %)
146
(100.00 %)
998,246
(14.90 %)
443,155
(22.40 %)
4,319,947
(40.01 %)
34,018
(4.16 %)
66 bony fish N.antarctica (primary hap 2024)
GCA_963989245.1
n/a 17,996
(2.00 %)
89,591
(7.93 %)
n/a 45.22
(99.94 %)
3,299
(0.06 %)
1,177
(100.00 %)
2,828,457
(30.93 %)
1,676,413
(19.87 %)
4,137,400
(48.69 %)
78,669
(4.37 %)
67 bony fish P.dabryanus (BB 2023)
GCF_030506205.1
86,420
(8.25 %)
22,100
(2.28 %)
59,296
(4.66 %)
n/a 38.32
(100.00 %)
1
(0.00 %)
610
(100.00 %)
3,555,303
(40.49 %)
538,181
(9.64 %)
6,137,303
(50.16 %)
71,533
(4.06 %)
68 bony fish R.sp. 'chilingali' (2024)
GCA_963969265.1
n/a 15,501
(2.18 %)
54,090
(6.20 %)
n/a 41.17
(99.99 %)
422
(0.01 %)
82
(100.00 %)
1,727,328
(38.16 %)
259,351
(4.71 %)
4,381,278
(33.25 %)
35,281
(1.93 %)
69 bony fish T.vachellii (PV-2020 2023)
GCF_030014155.1
43,278
(10.19 %)
15,613
(2.96 %)
39,340
(5.77 %)
n/a 39.31
(99.98 %)
291
(0.02 %)
78
(100.00 %)
1,563,305
(33.23 %)
689,312
(9.96 %)
3,954,578
(35.31 %)
20,152
(1.50 %)
70 bowfin (hap1 2024)
GCA_036373705.1
n/a 13,851
(1.83 %)
27,058
(4.43 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
97
(0.00 %)
390
(100.00 %)
953,497
(13.69 %)
387,700
(7.91 %)
4,552,410
(37.72 %)
46,301
(2.99 %)
71 Brauer's lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_963281105.1
n/a 17,999
(1.60 %)
76,655
(5.58 %)
n/a 42.04
(100.00 %)
5
(0.00 %)
10,799
(100.00 %)
5,994,257
(39.29 %)
1,126,685
(10.35 %)
6,996,991
(46.02 %)
71,016
(3.36 %)
72 Brauer's lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963280865.1
n/a 17,865
(1.56 %)
76,506
(5.59 %)
n/a 42.15
(99.96 %)
2,704
(0.04 %)
676
(100.00 %)
6,391,921
(39.62 %)
1,227,487
(11.70 %)
6,669,558
(49.73 %)
76,828
(3.96 %)
73 broad-nosed pipefish (Sweden RoL2023-S1 2023)
GCF_033458585.1
49,639
(15.87 %)
13,630
(3.98 %)
43,263
(9.12 %)
n/a 43.65
(100.00 %)
40
(0.00 %)
495
(100.00 %)
727,223
(20.88 %)
290,624
(20.53 %)
1,369,709
(43.82 %)
51,671
(14.43 %)
74 brook trout (EN_2023a 2023)
GCF_029448725.1
92,568
(6.87 %)
26,875
(1.47 %)
114,101
(4.26 %)
n/a 43.70
(99.83 %)
4,299
(0.17 %)
2,721
(100.00 %)
5,005,012
(52.10 %)
2,055,293
(26.66 %)
9,701,968
(57.04 %)
89,897
(2.49 %)
75 brown-marbled grouper (2020)
GCF_011397635.1
49,205
(8.52 %)
15,634
(1.92 %)
53,710
(4.99 %)
n/a 41.33
(100.00 %)
205
(0.00 %)
26
(100.00 %)
632,147
(3.01 %)
371,482
(3.01 %)
6,438,110
(31.32 %)
26,136
(0.96 %)
76 Burton's mouthbrooder (Broad 2011)
GCF_000239415.1
47,805
(10.97 %)
14,997
(2.72 %)
25,504
(5.86 %)
n/a 40.51
(84.10 %)
61,073
(15.93 %)
69,067
(84.07 %)
311,174
(3.20 %)
125,534
(0.72 %)
4,461,288
(20.25 %)
17,722
(0.91 %)
77 Burton's mouthbrooder (NCSU 2021)
GCF_018398535.1
52,584
(12.38 %)
15,229
(2.54 %)
47,264
(5.92 %)
n/a 40.68
(89.05 %)
32,418
(10.97 %)
7,421
(100.00 %)
812,382
(17.52 %)
158,486
(1.12 %)
4,571,794
(23.61 %)
22,763
(1.21 %)
78 butterfish (fScaArg1 alternate hap 2021)
GCA_020382915.1
n/a 15,228
(3.42 %)
41,322
(7.36 %)
n/a 41.47
(100.00 %)
4
(0.00 %)
1,592
(100.00 %)
972,098
(18.43 %)
155,031
(1.41 %)
3,452,400
(21.36 %)
15,255
(1.12 %)
79 butterfish (fScaArg1 primary hap 2021)
GCF_020382885.2
52,828
(14.10 %)
15,261
(3.43 %)
40,580
(7.38 %)
n/a 41.49
(99.70 %)
77
(0.30 %)
48
(100.00 %)
413,775
(3.11 %)
160,299
(1.55 %)
3,420,994
(21.24 %)
15,574
(1.13 %)
80 butterfly blenny (primary hap 2023)
GCA_963422515.1
n/a 14,403
(2.47 %)
61,860
(7.37 %)
n/a 43.15
(99.96 %)
1,625
(0.04 %)
525
(100.00 %)
959,651
(12.16 %)
517,137
(13.14 %)
3,775,081
(32.47 %)
81,881
(6.68 %)
81 California sheephead (SPU_LCO1_2020_fin alternate hap 2022)
GCA_022749735.1
n/a 19,842
(2.16 %)
72,007
(6.04 %)
n/a 41.70
(99.97 %)
2,679
(0.02 %)
15,877
(99.98 %)
1,911,945
(24.70 %)
364,933
(8.56 %)
6,201,042
(32.00 %)
39,114
(1.56 %)
82 California sheephead (SPU_LCO1_2020_fin primary hap 2022)
GCA_022749685.1
n/a 15,277
(2.46 %)
46,371
(5.95 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
8
(0.00 %)
179
(100.00 %)
1,369,186
(24.73 %)
232,889
(8.56 %)
4,426,065
(31.90 %)
27,134
(1.64 %)
83 channel bull blenny (2019 refseq)
GCF_900634415.1
40,788
(11.04 %)
14,472
(3.02 %)
24,012
(6.59 %)
60,720
(10.43 %)
40.96
(99.58 %)
445
(0.42 %)
322
(100.00 %)
420,697
(5.49 %)
320,518
(6.91 %)
3,394,846
(28.67 %)
20,453
(1.39 %)
84 channel bull blenny (alternate hap 2019)
GCA_900634435.1
n/a 15,980
(2.79 %)
53,680
(6.62 %)
n/a 40.96
(100.00 %)
10
(0.00 %)
11,565
(100.00 %)
451,656
(4.76 %)
321,158
(5.51 %)
3,800,099
(26.83 %)
20,338
(1.21 %)
85 channel catfish (USDA103 v2.0 2022)
GCF_001660625.3
59,187
(10.70 %)
15,782
(2.57 %)
45,562
(5.15 %)
n/a 39.82
(99.35 %)
100
(0.65 %)
137
(100.00 %)
2,257,240
(46.82 %)
671,926
(8.67 %)
5,043,664
(36.53 %)
34,284
(2.16 %)
86 cherry salmon (Uvic2021 2024)
GCF_036934945.1
80,307
(5.31 %)
27,171
(1.38 %)
123,048
(4.00 %)
n/a 44.12
(99.94 %)
4,047
(0.06 %)
18,306
(100.00 %)
1,207,353
(5.23 %)
2,779,869
(27.93 %)
11,429,057
(55.56 %)
83,137
(1.99 %)
87 chichlid (S. diagramma)
GCF_900408965.1
61,496
(12.33 %)
15,296
(2.30 %)
50,818
(6.10 %)
n/a 40.92
(100.00 %)
942
(0.00 %)
823
(100.00 %)
920,881
(19.96 %)
193,629
(1.36 %)
4,724,179
(28.98 %)
28,565
(1.65 %)
88 Chinese cavefish (2022)
GCF_024868665.1
48,058
(11.91 %)
16,738
(3.72 %)
46,295
(6.80 %)
n/a 39.61
(98.56 %)
9,510
(1.45 %)
1,039
(100.00 %)
1,469,931
(44.44 %)
188,838
(2.34 %)
3,624,116
(35.94 %)
44,615
(5.01 %)
89 Chinese large-mouth catfish (SWU-2019-XX 2020)
GCF_014805685.1
49,677
(9.64 %)
15,266
(2.70 %)
40,151
(5.21 %)
n/a 38.75
(99.82 %)
597
(0.18 %)
286
(100.00 %)
772,209
(6.45 %)
630,039
(7.45 %)
4,729,261
(37.48 %)
24,310
(1.76 %)
90 Chinese sucker (Aquarium Trade MX2 2022)
GCF_019703515.2
89,005
(6.31 %)
26,613
(1.64 %)
77,184
(3.14 %)
n/a 39.08
(100.00 %)
224
(0.00 %)
353
(100.00 %)
9,298,177
(59.91 %)
977,119
(3.49 %)
13,499,422
(52.38 %)
100,309
(2.90 %)
91 Chinook salmon (v1 2018 female)
GCF_002872995.1
81,340
(5.14 %)
27,462
(1.53 %)
54,538
(3.80 %)
n/a 43.55
(97.26 %)
272,151
(2.76 %)
15,944
(99.99 %)
1,207,194
(4.55 %)
2,524,408
(13.75 %)
12,127,831
(47.56 %)
87,959
(2.02 %)
92 Chinook salmon (v2 Ot180627B 2021 male rfseq)
GCF_018296145.1
92,383
(5.73 %)
26,372
(1.57 %)
107,059
(4.12 %)
157,582
(6.65 %)
43.55
(99.99 %)
2,334
(0.01 %)
9,978
(99.99 %)
1,483,168
(7.79 %)
2,306,695
(23.48 %)
10,038,888
(54.54 %)
62,726
(1.40 %)
93 chub mackerel (fScoJap1 alternate hap 2022)
GCA_027409835.1
n/a 15,165
(2.44 %)
46,105
(6.16 %)
n/a 39.93
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,163
(100.00 %)
1,546,066
(27.08 %)
537,737
(9.87 %)
4,485,153
(30.70 %)
14,774
(0.81 %)
94 chub mackerel (primary hap 2022 refseq)
GCF_027409825.1
34,390
(6.95 %)
15,348
(2.35 %)
46,858
(6.07 %)
n/a 40.01
(99.92 %)
1,572
(0.08 %)
360
(100.00 %)
1,669,322
(28.44 %)
638,340
(11.55 %)
4,613,373
(32.38 %)
16,290
(0.85 %)
95 chum salmon (Oke142-1_Chum_Gynogen 2020)
GCF_012931545.1
76,338
(6.27 %)
23,186
(1.70 %)
90,881
(4.14 %)
n/a 43.06
(95.36 %)
242,238
(4.66 %)
28,109
(99.98 %)
1,143,292
(6.07 %)
1,487,818
(12.14 %)
8,992,314
(46.24 %)
51,797
(1.25 %)
96 chum salmon (PuntledgeMale-10-30-2019 2022)
GCF_023373465.1
205,915
(6.68 %)
26,582
(1.42 %)
119,437
(4.14 %)
120,379
(5.87 %)
43.89
(99.99 %)
3,433
(0.01 %)
17,480
(99.99 %)
1,160,500
(5.63 %)
2,584,312
(31.72 %)
10,621,107
(55.67 %)
68,538
(1.53 %)
97 climbing perch (alternate hap 2019)
GCA_900650485.1
n/a 14,940
(3.51 %)
39,688
(7.41 %)
n/a 40.40
(99.61 %)
36
(0.39 %)
2,641
(100.00 %)
307,993
(2.63 %)
121,935
(1.79 %)
3,190,928
(20.98 %)
10,131
(0.86 %)
98 climbing perch (v1.3 2021)
GCA_900324465.3
n/a 15,241
(3.53 %)
39,067
(7.54 %)
67,055
(11.68 %)
40.40
(99.35 %)
266
(0.65 %)
51
(100.00 %)
633,883
(15.28 %)
130,249
(1.89 %)
3,325,008
(21.31 %)
10,500
(0.87 %)
99 clown anemonefish (DU_AmpOce 2017)
GCF_002776465.1
53,567
(9.24 %)
15,685
(2.23 %)
33,477
(5.63 %)
n/a 39.47
(99.94 %)
1,406
(0.06 %)
6,405
(100.00 %)
431,950
(2.92 %)
381,394
(4.84 %)
4,952,343
(31.95 %)
23,543
(1.15 %)
100 clown anemonefish (Okinawa individual 3 2022)
GCF_022539595.1
53,912
(11.11 %)
15,702
(2.37 %)
47,805
(5.50 %)
n/a 39.59
(99.98 %)
1,454
(0.02 %)
354
(100.00 %)
1,346,903
(35.25 %)
401,782
(5.36 %)
4,891,035
(31.59 %)
23,489
(1.28 %)
101 coho salmon (150728-3 2019)
GCF_002021735.2
100,850
(6.58 %)
27,072
(1.56 %)
50,811
(3.95 %)
125,873
(5.26 %)
43.55
(99.98 %)
5,631
(0.02 %)
4,482
(100.00 %)
1,491,966
(6.88 %)
2,135,217
(25.52 %)
10,152,659
(54.74 %)
65,662
(1.36 %)
102 common bream (primary hap 2024)
GCA_963993115.1
n/a 18,114
(2.63 %)
66,549
(6.11 %)
n/a 38.62
(99.99 %)
685
(0.01 %)
215
(100.00 %)
2,639,968
(48.46 %)
659,243
(7.55 %)
5,950,358
(40.47 %)
62,337
(3.61 %)
103 common carp SPL01 (2021)
GCF_018340385.1
91,210
(7.89 %)
31,041
(2.89 %)
89,244
(5.01 %)
n/a 37.11
(99.53 %)
26,351
(0.48 %)
6,701
(100.00 %)
1,634,612
(6.00 %)
919,239
(3.97 %)
10,192,037
(38.56 %)
52,638
(1.62 %)
104 common dab (primary hap 2023)
GCF_963576545.1
36,211
(8.34 %)
14,995
(2.62 %)
50,844
(6.89 %)
n/a 42.67
(99.99 %)
275
(0.01 %)
338
(100.00 %)
1,186,799
(32.17 %)
307,864
(16.34 %)
3,562,802
(35.00 %)
41,657
(2.72 %)
105 common seadragon (TA_2022b 2022)
GCF_024500385.1
60,947
(12.28 %)
13,706
(2.67 %)
42,956
(5.71 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
196
(0.00 %)
1,259
(100.00 %)
1,417,848
(37.47 %)
173,323
(3.85 %)
3,968,694
(40.23 %)
70,253
(6.29 %)
106 common sole (alternate hap 2023)
GCA_958295035.1
n/a 14,904
(2.99 %)
43,194
(7.09 %)
n/a 40.77
(100.00 %)
n/a 1,318
(100.00 %)
1,128,080
(18.77 %)
328,975
(8.35 %)
3,952,898
(31.64 %)
26,979
(2.08 %)
107 common sole (primary hap 2023 refseq)
GCF_958295425.1
55,359
(12.02 %)
14,844
(2.94 %)
42,832
(6.93 %)
n/a 40.87
(99.99 %)
373
(0.01 %)
242
(100.00 %)
1,149,243
(19.12 %)
342,238
(9.71 %)
3,906,753
(32.84 %)
27,772
(2.71 %)
108 convict blenny (fPhoLeu1 alternate hap 2021)
GCA_020510965.1
n/a 5,231
(0.27 %)
47,644
(1.48 %)
n/a 44.62
(99.99 %)
144
(0.01 %)
21,561
(99.99 %)
2,803,873
(49.20 %)
655,416
(2.69 %)
7,558,550
(67.05 %)
181,626
(10.52 %)
109 convict blenny (fPhoLeu1 primary hap 2021)
GCA_020510985.1
n/a n/a 134,417
(1.50 %)
n/a 44.52
(99.13 %)
2,580
(0.87 %)
512
(100.00 %)
9,062,541
(49.33 %)
2,097,650
(2.66 %)
3,092
(99.13 %)
568,042
(10.14 %)
110 copperband butterflyfish (fCheRos1 alternate hap 2021)
GCA_017976315.1
n/a 13,622
(2.81 %)
43,285
(6.93 %)
n/a 42.59
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,125
(100.00 %)
1,741,373
(32.89 %)
182,926
(2.01 %)
3,659,106
(21.68 %)
27,693
(1.89 %)
111 copperband butterflyfish (fCheRos1 primary hap 2021)
GCF_017976325.1
35,291
(10.46 %)
15,210
(3.03 %)
44,916
(6.99 %)
61,755
(8.99 %)
42.57
(100.00 %)
60
(0.00 %)
29
(100.00 %)
406,118
(2.95 %)
199,450
(2.10 %)
3,861,745
(21.57 %)
29,106
(1.85 %)
112 corkwing wrasse (primary hap 2022)
GCA_947650265.1
n/a 14,740
(2.91 %)
45,483
(7.26 %)
n/a 41.82
(99.96 %)
1,379
(0.04 %)
395
(100.00 %)
936,676
(24.41 %)
306,192
(9.29 %)
3,495,456
(28.75 %)
29,142
(2.35 %)
113 Corydoras catfish unclassified (C115 2021)
GCA_019802505.1
n/a 14,695
(2.68 %)
51,799
(6.37 %)
n/a 42.12
(100.00 %)
n/a 2,080
(100.00 %)
1,969,654
(37.02 %)
663,295
(11.19 %)
3,764,275
(45.19 %)
67,226
(8.43 %)
114 crucian carp (alternate hap 2023)
GCA_963082795.1
n/a 4,509
(3.03 %)
16,936
(7.22 %)
n/a 38.67
(100.00 %)
n/a 3,713
(100.00 %)
430,197
(46.38 %)
101,926
(7.54 %)
1,077,239
(32.21 %)
10,612
(4.11 %)
115 crucian carp (primary hap 2023 refseq)
GCF_963082965.1
90,094
(6.75 %)
29,386
(2.81 %)
88,291
(5.37 %)
n/a 38.31
(99.99 %)
832
(0.01 %)
277
(100.00 %)
3,481,382
(45.81 %)
802,773
(6.54 %)
8,190,783
(44.41 %)
83,696
(3.82 %)
116 cuckoo wrasse (primary hap 2023)
GCF_963584025.1
51,190
(10.37 %)
15,144
(2.59 %)
43,207
(5.98 %)
n/a 40.77
(99.98 %)
570
(0.02 %)
324
(100.00 %)
1,435,625
(29.39 %)
330,276
(12.54 %)
4,196,830
(33.83 %)
19,310
(1.01 %)
117 cunner (fRauAds1 primary hap 2021)
GCA_020745685.1
n/a 15,192
(2.74 %)
43,564
(6.38 %)
n/a 41.31
(99.41 %)
283
(0.59 %)
64
(100.00 %)
1,419,667
(30.50 %)
243,024
(4.81 %)
4,334,690
(27.65 %)
17,974
(1.06 %)
118 cunner (fTauAds1 alternate hap 2021)
GCA_020745675.1
n/a 14,861
(2.74 %)
42,996
(6.34 %)
n/a 41.31
(99.99 %)
31
(0.01 %)
1,476
(100.00 %)
1,373,727
(30.17 %)
220,572
(4.38 %)
4,176,936
(27.32 %)
17,129
(1.04 %)
119 Dalai köbertrulling (WHDGS20190420 2020)
GCF_015846415.1
49,108
(12.72 %)
16,501
(4.06 %)
40,671
(7.11 %)
n/a 38.77
(100.00 %)
116
(0.00 %)
167
(100.00 %)
1,213,719
(40.21 %)
134,299
(3.43 %)
3,676,403
(30.98 %)
29,879
(3.18 %)
120 Danionella translucida (Bolton 2019)
GCA_007224835.1
n/a 16,341
(3.18 %)
41,545
(5.47 %)
n/a 38.57
(98.69 %)
8,366
(1.31 %)
36,005
(98.69 %)
300,659
(2.50 %)
212,357
(6.15 %)
4,267,143
(35.05 %)
23,311
(2.18 %)
121 Danionella translucida (fDanTra1 2020)
GCA_903798025.1
n/a 15,965
(3.73 %)
37,421
(5.87 %)
n/a 38.52
(94.12 %)
18,487
(5.88 %)
29,831
(94.12 %)
251,333
(2.28 %)
132,120
(1.41 %)
4,061,554
(28.83 %)
16,871
(1.57 %)
122 dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 refseq)
GCF_021462225.1
56,220
(7.59 %)
15,422
(1.71 %)
50,084
(4.18 %)
n/a 40.18
(99.46 %)
409
(0.54 %)
72
(100.00 %)
369,606
(1.86 %)
176,954
(1.87 %)
6,142,638
(38.35 %)
32,973
(1.28 %)
123 delta smelt
GCF_021917145.1
41,807
(14.97 %)
14,549
(4.09 %)
44,849
(9.74 %)
n/a 44.99
(99.92 %)
1,474
(0.08 %)
376
(100.00 %)
387,882
(5.57 %)
383,522
(9.22 %)
1,814,696
(32.48 %)
28,299
(3.33 %)
124 denticle herring (alternate hap 2019)
GCA_900700345.2
n/a 14,119
(3.95 %)
47,988
(8.57 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
4
(0.00 %)
1,972
(100.00 %)
312,660
(2.77 %)
160,575
(2.83 %)
2,525,528
(27.70 %)
50,830
(8.72 %)
125 denticle herring (v2 2020)
GCA_900700375.2
n/a 16,559
(3.78 %)
58,823
(8.66 %)
74,128
(10.47 %)
43.69
(99.18 %)
464
(0.82 %)
461
(100.00 %)
403,512
(3.23 %)
224,284
(4.61 %)
2,948,738
(28.79 %)
64,661
(9.49 %)
126 dorado (hap1 2023)
GCA_030448965.1
n/a 16,788
(2.12 %)
50,338
(4.68 %)
n/a 41.27
(98.12 %)
641
(1.88 %)
182
(100.00 %)
2,709,759
(34.74 %)
798,364
(14.84 %)
5,418,190
(36.02 %)
30,055
(1.31 %)
127 dorado (hap2 2023)
GCA_030463535.1
n/a 16,799
(2.11 %)
50,411
(4.67 %)
n/a 41.29
(99.15 %)
726
(0.85 %)
104
(100.00 %)
2,693,928
(34.60 %)
805,807
(14.65 %)
5,615,731
(36.69 %)
30,083
(1.31 %)
128 dwarf seahorse (Florida 2022)
GCF_025434085.1
51,353
(12.50 %)
13,736
(3.19 %)
50,537
(7.64 %)
n/a 44.73
(100.00 %)
79
(0.00 %)
213
(100.00 %)
986,789
(36.30 %)
235,862
(13.25 %)
2,323,084
(41.85 %)
68,121
(17.75 %)
129 eastern happy (v3 2021)
GCA_900246225.5
n/a 15,552
(2.29 %)
52,465
(6.26 %)
86,437
(9.40 %)
41.07
(99.87 %)
490
(0.13 %)
364
(100.00 %)
1,309,350
(35.93 %)
217,916
(1.89 %)
4,547,434
(30.78 %)
33,005
(1.88 %)
130 electric eel (fEleEle1 alternate hap 2020)
GCA_013347915.1
n/a 12,020
(3.63 %)
38,881
(7.31 %)
n/a 42.77
(100.00 %)
n/a 2,629
(100.00 %)
429,509
(7.66 %)
432,260
(11.41 %)
2,049,609
(24.32 %)
35,597
(4.37 %)
131 electric eel (fEleEle1 primary hap 2020)
GCF_013358815.1
48,958
(12.10 %)
15,950
(3.66 %)
48,976
(7.25 %)
54,541
(8.42 %)
42.49
(98.20 %)
227
(1.80 %)
89
(100.00 %)
567,625
(7.41 %)
564,286
(10.86 %)
2,935,360
(24.79 %)
44,501
(3.93 %)
132 electric eel (MRS-EE1 2018 U Wisconsin)
GCF_003665695.1
40,618
(11.48 %)
15,837
(3.85 %)
23,074
(6.63 %)
n/a 42.56
(96.95 %)
119,361
(3.09 %)
8,786
(100.00 %)
519,014
(5.41 %)
516,718
(6.65 %)
3,020,801
(21.49 %)
41,947
(3.71 %)
133 elephant fish B.brachyistius (T26 2022)
GCF_023856365.1
82,153
(9.98 %)
16,513
(2.13 %)
79,047
(6.37 %)
n/a 44.15
(99.99 %)
234
(0.01 %)
1,425
(100.00 %)
923,543
(11.79 %)
425,650
(9.45 %)
3,525,237
(34.97 %)
91,552
(5.39 %)
134 emerald rockcod
GCF_902827165.1
44,179
(8.48 %)
15,275
(2.20 %)
57,830
(6.43 %)
63,731
(6.65 %)
40.94
(99.99 %)
932
(0.01 %)
864
(100.00 %)
460,185
(3.64 %)
399,729
(6.87 %)
3,533,188
(40.09 %)
52,191
(2.51 %)
135 Eurasian minnow (alternate hap 2023)
GCA_949152275.1
n/a 17,920
(3.03 %)
59,697
(6.61 %)
n/a 39.13
(100.00 %)
8
(0.00 %)
4,949
(100.00 %)
2,285,870
(44.17 %)
480,649
(10.13 %)
4,833,803
(39.56 %)
57,737
(4.15 %)
136 Eurasian minnow (primary hap 2023)
GCA_949152265.1
n/a 17,661
(3.01 %)
58,218
(6.54 %)
n/a 39.21
(99.98 %)
881
(0.02 %)
125
(100.00 %)
2,346,939
(44.27 %)
502,415
(11.23 %)
4,890,830
(40.45 %)
60,482
(4.22 %)
137 European anchovy (BLACKSEA-1 2023)
GCF_034702125.1
48,154
(5.87 %)
15,415
(1.33 %)
77,712
(5.08 %)
n/a 44.45
(99.99 %)
9,202
(0.02 %)
1,922
(100.00 %)
4,406,534
(31.73 %)
2,331,293
(15.35 %)
6,863,540
(50.47 %)
80,927
(2.32 %)
138 European chub (alternate hap 2023)
GCA_949319155.1
n/a 17,416
(2.74 %)
60,936
(6.02 %)
n/a 38.65
(100.00 %)
12
(0.00 %)
7,437
(100.00 %)
2,377,147
(47.98 %)
578,235
(8.27 %)
5,267,308
(40.22 %)
50,909
(3.45 %)
139 European chub (primary hap 2023)
GCA_949319135.1
n/a 18,028
(2.64 %)
64,206
(6.04 %)
n/a 38.73
(99.99 %)
588
(0.01 %)
106
(100.00 %)
2,649,943
(48.88 %)
666,129
(9.08 %)
5,751,610
(41.56 %)
58,471
(3.64 %)
140 European flounder (alternate hap 2023)
GCA_949316195.1
n/a 14,690
(3.17 %)
48,422
(7.90 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
n/a 1,915
(100.00 %)
1,138,190
(26.31 %)
249,865
(4.72 %)
3,352,038
(25.55 %)
36,828
(3.13 %)
141 European flounder (primary hap 2023)
GCA_949316205.1
n/a 14,753
(3.17 %)
47,618
(7.81 %)
n/a 42.59
(99.98 %)
482
(0.02 %)
109
(100.00 %)
1,160,784
(27.06 %)
251,985
(5.23 %)
3,353,121
(26.00 %)
37,130
(2.79 %)
142 European flounder (primary hap 2023)
GCF_949316205.1
48,969
(12.45 %)
14,751
(3.17 %)
47,618
(7.81 %)
n/a 42.59
(99.98 %)
482
(0.02 %)
108
(100.00 %)
1,160,781
(27.06 %)
251,983
(5.23 %)
3,353,086
(26.00 %)
37,129
(2.79 %)
143 European perch
GCF_010015445.1
55,605
(8.20 %)
15,430
(2.07 %)
55,499
(5.43 %)
n/a 40.90
(99.97 %)
801
(0.03 %)
303
(100.00 %)
684,094
(5.16 %)
634,788
(7.48 %)
5,182,241
(37.07 %)
44,049
(1.94 %)
144 European plaice (alternate hap 2022)
GCA_947347695.1
n/a 14,619
(2.94 %)
50,389
(7.92 %)
n/a 42.58
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3,222
(100.00 %)
430,112
(3.88 %)
299,581
(6.89 %)
3,182,258
(27.97 %)
40,094
(3.66 %)
145 European plaice (primary hap 2022 refseq)
GCF_947347685.1
46,468
(10.51 %)
14,818
(2.71 %)
51,453
(7.41 %)
n/a 42.51
(99.97 %)
1,072
(0.03 %)
355
(100.00 %)
476,314
(3.63 %)
520,729
(13.27 %)
3,283,360
(33.55 %)
47,050
(4.45 %)
146 European seabass (2021)
GCF_905237075.1
62,457
(13.08 %)
15,582
(2.89 %)
44,472
(6.56 %)
69,435
(12.92 %)
40.38
(99.85 %)
272
(0.15 %)
303
(100.00 %)
1,210,970
(24.30 %)
278,140
(4.02 %)
4,343,442
(26.18 %)
15,975
(0.93 %)
147 European smelt (primary hap 2023)
GCA_963692335.1
n/a 15,640
(3.79 %)
50,248
(9.36 %)
n/a 45.42
(99.90 %)
2,462
(0.10 %)
1,038
(100.00 %)
1,648,435
(31.35 %)
508,368
(13.05 %)
1,992,832
(35.86 %)
33,284
(4.05 %)
148 European smelt (primary hap 2023)
GCF_963692335.1
46,762
(14.07 %)
15,639
(3.79 %)
50,238
(9.36 %)
n/a 45.42
(99.90 %)
2,462
(0.10 %)
1,007
(100.00 %)
1,648,428
(31.34 %)
508,368
(13.05 %)
1,992,793
(35.86 %)
33,284
(4.05 %)
149 European sprat (primary hap 2023)
GCA_963457725.1
n/a 16,181
(2.44 %)
63,544
(7.17 %)
n/a 43.83
(99.96 %)
1,501
(0.04 %)
387
(100.00 %)
2,109,362
(31.42 %)
1,300,159
(14.91 %)
3,634,744
(35.44 %)
35,552
(1.87 %)
150 fathead minnow
GCF_016745375.1
57,312
(8.34 %)
18,039
(3.02 %)
52,431
(6.01 %)
n/a 38.45
(86.78 %)
5,594
(13.23 %)
911
(100.00 %)
657,027
(4.09 %)
444,571
(6.23 %)
4,902,960
(35.69 %)
49,361
(2.78 %)
151 flathead mullet
GCF_022458985.1
48,689
(12.71 %)
14,908
(3.00 %)
45,084
(6.96 %)
75,582
(11.23 %)
41.90
(99.97 %)
445
(0.04 %)
24
(100.00 %)
469,841
(3.23 %)
207,738
(2.31 %)
3,955,233
(24.74 %)
45,885
(3.03 %)
152 flier cichlid (alternate hap MPI-CPG 2019)
GCA_007364235.1
n/a 17,494
(2.06 %)
62,257
(5.73 %)
n/a 41.17
(99.98 %)
13
(0.02 %)
9,305
(99.98 %)
1,140,986
(16.60 %)
316,083
(2.17 %)
6,036,560
(30.48 %)
26,445
(1.22 %)
153 flier cichlid (MPI-CPG 2019 refseq)
GCF_007364275.1
43,842
(8.12 %)
15,434
(2.15 %)
26,448
(5.90 %)
64,657
(6.60 %)
41.23
(98.19 %)
744
(1.81 %)
188
(100.00 %)
1,014,141
(16.95 %)
287,035
(2.21 %)
5,305,890
(30.67 %)
24,130
(1.26 %)
154 freshwater garfish (fXenCan1 alternate hap 2020)
GCA_014839645.1
n/a 13,745
(2.58 %)
50,416
(6.72 %)
n/a 41.33
(100.00 %)
2
(0.00 %)
5,171
(100.00 %)
442,646
(4.09 %)
276,927
(5.42 %)
3,741,267
(26.25 %)
28,827
(2.28 %)
155 freshwater garfish (fXenCan1 primary hap 2020)
GCA_014839995.1
n/a 14,625
(2.57 %)
52,879
(6.72 %)
n/a 41.41
(98.98 %)
1,373
(1.02 %)
410
(100.00 %)
492,828
(4.29 %)
318,631
(5.94 %)
3,977,536
(27.41 %)
32,390
(2.33 %)
156 giant grouper
GCF_005281545.1
45,328
(7.65 %)
15,661
(1.91 %)
53,910
(4.91 %)
n/a 41.26
(96.40 %)
23,415
(3.61 %)
4,201
(100.00 %)
604,763
(2.71 %)
357,944
(2.52 %)
6,501,327
(30.28 %)
26,431
(0.91 %)
157 gilthead seabream (alternate hap 2019)
GCA_900880695.1
n/a 13,090
(2.37 %)
48,927
(6.41 %)
n/a 41.97
(100.00 %)
2
(0.00 %)
7,241
(100.00 %)
422,758
(2.89 %)
231,452
(2.54 %)
3,818,141
(24.36 %)
38,368
(2.40 %)
158 gilthead seabream (v2 2021)
GCA_900880675.2
n/a 15,752
(2.45 %)
56,395
(6.58 %)
n/a 41.94
(99.96 %)
1,050
(0.04 %)
176
(100.00 %)
1,474,134
(29.50 %)
305,809
(3.03 %)
4,701,691
(25.69 %)
47,327
(2.41 %)
159 golden-line barbel
GCF_001515645.1
74,071
(6.71 %)
29,486
(2.77 %)
55,545
(5.32 %)
n/a 37.54
(89.58 %)
136,894
(10.45 %)
168,074
(89.55 %)
1,118,646
(5.04 %)
718,426
(6.54 %)
9,092,306
(37.16 %)
70,606
(1.91 %)
160 goldfish
GCF_003368295.1
116,745
(8.75 %)
35,097
(2.94 %)
68,251
(6.12 %)
n/a 37.48
(99.99 %)
2,247
(0.01 %)
8,463
(99.99 %)
1,693,800
(5.39 %)
916,195
(5.01 %)
9,731,118
(40.19 %)
66,585
(2.06 %)
161 grass carp (HZGC_01 2021)
GCF_019924925.1
67,810
(11.16 %)
18,195
(3.27 %)
48,459
(5.67 %)
n/a 37.48
(99.98 %)
150
(0.02 %)
31
(100.00 %)
654,416
(3.33 %)
429,734
(3.77 %)
5,501,085
(40.21 %)
26,282
(1.58 %)
162 great blue-spotted mudskipper (Guang Dong 2022)
GCF_026225935.1
36,344
(7.09 %)
14,512
(1.92 %)
45,809
(4.61 %)
n/a 39.76
(99.63 %)
3,407
(0.37 %)
600
(100.00 %)
2,662,894
(54.47 %)
803,911
(10.32 %)
5,763,692
(48.31 %)
53,808
(2.65 %)
163 great blue-spotted mudskipper (pooled male+femail 2014 BGI)
GCF_000788275.1
25,822
(5.19 %)
14,212
(1.97 %)
27,894
(4.68 %)
n/a 39.49
(93.15 %)
92,327
(6.89 %)
108,947
(93.11 %)
552,368
(5.00 %)
742,395
(8.07 %)
5,901,720
(42.46 %)
44,972
(1.97 %)
164 greater amberjack
GCF_002260705.1
33,756
(9.11 %)
15,336
(2.93 %)
22,220
(6.07 %)
n/a 40.86
(99.17 %)
9,742
(0.82 %)
34,656
(100.00 %)
573,770
(4.04 %)
368,800
(3.72 %)
4,449,534
(24.71 %)
15,850
(0.98 %)
165 greater argentine (alternate hap 2023)
GCA_951799415.1
n/a 15,483
(3.45 %)
47,484
(7.95 %)
n/a 44.71
(100.00 %)
n/a 4,805
(100.00 %)
1,400,150
(23.78 %)
738,163
(17.35 %)
2,460,977
(35.90 %)
20,794
(2.09 %)
166 greater argentine (primary hap 2023)
GCA_951799395.1
n/a 16,553
(3.15 %)
51,766
(7.37 %)
n/a 44.75
(99.95 %)
1,752
(0.05 %)
1,085
(100.00 %)
1,674,762
(26.07 %)
900,455
(18.62 %)
2,849,256
(39.22 %)
26,022
(2.30 %)
167 greater pipefish (v1 alternate hap 2019)
GCA_901709685.1
n/a 10,795
(5.59 %)
33,380
(12.07 %)
n/a 43.29
(100.00 %)
2
(0.00 %)
1,848
(100.00 %)
140,376
(2.96 %)
81,000
(3.32 %)
1,318,564
(23.30 %)
34,104
(12.82 %)
168 greater pipefish (v1.2 2020 refseq)
GCF_901709675.1
47,335
(18.32 %)
13,477
(5.26 %)
42,380
(12.01 %)
37,563
(15.76 %)
43.46
(100.00 %)
43
(0.00 %)
87
(100.00 %)
193,407
(3.05 %)
125,716
(4.25 %)
1,676,004
(25.93 %)
46,327
(10.97 %)
169 greater pipefish (v2 2023 genbank)
GCA_948146105.1
n/a 13,412
(4.76 %)
45,946
(11.50 %)
n/a 44.34
(99.99 %)
95
(0.01 %)
251
(100.00 %)
494,547
(20.10 %)
204,804
(10.66 %)
1,444,044
(34.08 %)
47,904
(17.47 %)
170 greater pipefish (v2 alternate haplotype 2023)
GCA_948146095.1
n/a 13,681
(4.93 %)
45,034
(11.64 %)
n/a 43.88
(100.00 %)
n/a 4,533
(100.00 %)
460,038
(18.47 %)
163,838
(7.90 %)
1,681,190
(29.08 %)
47,523
(15.60 %)
171 greater sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_949358355.1
n/a 13,432
(2.10 %)
50,930
(6.39 %)
n/a 41.05
(100.00 %)
n/a 4,952
(100.00 %)
2,495,763
(38.80 %)
473,105
(6.27 %)
3,444,123
(38.56 %)
35,298
(1.94 %)
172 greater sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949357725.1
n/a 15,028
(2.35 %)
50,436
(6.30 %)
n/a 41.10
(99.97 %)
1,188
(0.03 %)
1,568
(100.00 %)
2,688,222
(39.74 %)
549,362
(7.60 %)
3,564,661
(40.05 %)
37,043
(1.94 %)
173 green swordtail
GCF_003331165.1
52,602
(11.81 %)
14,955
(2.58 %)
47,115
(6.33 %)
n/a 39.09
(99.71 %)
661
(0.29 %)
272
(100.00 %)
328,469
(2.10 %)
162,178
(2.35 %)
4,801,050
(28.86 %)
37,217
(2.39 %)
174 grey gurnard (primary hap 2023)
GCA_963514095.1
n/a 14,752
(2.74 %)
58,725
(8.49 %)
n/a 43.13
(99.98 %)
553
(0.02 %)
322
(100.00 %)
1,860,845
(35.64 %)
378,045
(9.39 %)
3,208,482
(30.12 %)
66,857
(4.99 %)
175 gudgeon (alternate hap 2023)
GCA_949357705.1
n/a 16,645
(1.92 %)
62,533
(4.55 %)
n/a 39.69
(100.00 %)
8
(0.00 %)
7,253
(100.00 %)
5,166,731
(67.78 %)
750,850
(11.35 %)
5,903,440
(54.20 %)
90,235
(5.58 %)
176 gudgeon (primary hap 2023)
GCA_949357685.1
n/a 17,136
(1.90 %)
63,611
(4.50 %)
n/a 39.74
(99.99 %)
1,046
(0.01 %)
233
(100.00 %)
5,662,029
(68.75 %)
825,757
(11.99 %)
6,236,024
(55.15 %)
99,559
(5.68 %)
177 Gulf pipefish (RoL_Ssco_1.1 Florida 2022 refseq)
GCF_024217435.1
58,587
(18.27 %)
13,442
(4.00 %)
41,565
(8.87 %)
n/a 44.92
(100.00 %)
11
(0.00 %)
496
(100.00 %)
253,033
(3.86 %)
180,311
(16.78 %)
1,339,521
(43.63 %)
51,080
(18.49 %)
178 Gulf pipefish (RoL_Ssco_1.2 Florida 2022 genbank)
GCA_024217435.4
n/a 13,441
(4.00 %)
41,519
(8.87 %)
n/a 44.92
(100.00 %)
11
(0.00 %)
496
(100.00 %)
644,601
(20.82 %)
180,310
(16.78 %)
1,339,461
(43.63 %)
51,080
(18.49 %)
179 guppy
GCF_000633615.1
48,290
(11.24 %)
14,436
(2.72 %)
44,759
(6.24 %)
n/a 39.33
(90.86 %)
458,354
(9.22 %)
40,143
(90.84 %)
340,480
(2.43 %)
167,943
(1.50 %)
4,695,380
(25.63 %)
35,188
(1.91 %)
180 honeycomb rockfish (fSebUmb1 alternate hap 2020)
GCA_015220095.1
n/a 15,058
(2.50 %)
46,340
(5.85 %)
n/a 40.71
(100.00 %)
21
(0.00 %)
2,131
(100.00 %)
1,642,351
(37.42 %)
389,169
(5.43 %)
4,687,710
(35.55 %)
34,408
(1.75 %)
181 honeycomb rockfish (fSebUmb1 primary hap 2020)
GCF_015220745.1
57,752
(9.94 %)
15,244
(2.44 %)
47,034
(5.98 %)
63,546
(8.88 %)
40.77
(99.83 %)
215
(0.17 %)
138
(100.00 %)
524,161
(3.79 %)
422,265
(6.20 %)
4,827,148
(36.22 %)
37,878
(1.84 %)
182 horned golden-line barbel
GCF_001515625.1
74,585
(6.94 %)
30,802
(3.11 %)
57,655
(5.63 %)
n/a 37.18
(91.91 %)
150,790
(8.11 %)
314,962
(91.89 %)
1,147,234
(4.93 %)
708,513
(4.77 %)
9,080,512
(35.95 %)
63,217
(1.71 %)
183 humphead wrasse
GCF_018320785.1
42,229
(6.60 %)
15,287
(1.66 %)
47,025
(4.13 %)
n/a 39.53
(100.00 %)
284
(0.00 %)
46
(100.00 %)
447,458
(2.27 %)
310,170
(4.65 %)
8,002,463
(32.97 %)
12,252
(0.38 %)
184 Indian glassy fish (alternate hap 2019)
GCA_900651595.1
n/a 14,412
(3.70 %)
41,944
(8.58 %)
n/a 42.27
(99.58 %)
230
(0.42 %)
2,242
(100.00 %)
304,774
(2.86 %)
140,555
(2.80 %)
2,689,154
(24.08 %)
15,419
(1.38 %)
185 Indian glassy fish (v2 2020)
GCA_900634625.2
n/a 15,339
(3.60 %)
44,099
(8.47 %)
57,867
(10.10 %)
42.38
(98.08 %)
1,523
(1.92 %)
157
(100.00 %)
346,399
(3.02 %)
163,524
(3.00 %)
2,755,274
(25.07 %)
17,931
(1.47 %)
186 Indian medaka
GCF_002922805.2
49,295
(10.27 %)
14,591
(2.49 %)
52,982
(6.37 %)
n/a 39.04
(94.83 %)
51,550
(5.20 %)
8,493
(100.00 %)
319,151
(2.20 %)
208,690
(2.67 %)
5,412,546
(33.29 %)
40,721
(2.36 %)
187 Indo-Pacific tarpon (2020)
GCF_013368585.1
41,583
(6.91 %)
18,302
(2.47 %)
29,762
(5.45 %)
74,968
(7.01 %)
43.02
(99.97 %)
63
(0.03 %)
207
(100.00 %)
603,558
(3.71 %)
433,446
(4.32 %)
5,341,985
(22.07 %)
78,561
(3.69 %)
188 Japanese flounder
GCF_001970005.1
37,838
(12.25 %)
14,521
(3.39 %)
30,773
(7.34 %)
n/a 41.64
(81.04 %)
40,314
(18.97 %)
9,525
(100.00 %)
332,322
(2.84 %)
164,916
(1.16 %)
3,476,344
(17.36 %)
21,768
(1.42 %)
189 Japanese medaka
GCF_002234675.1
50,526
(10.32 %)
14,325
(2.50 %)
27,912
(6.71 %)
91,652
(11.67 %)
40.84
(99.93 %)
491
(0.07 %)
25
(100.00 %)
384,317
(4.42 %)
163,041
(3.07 %)
4,631,750
(34.91 %)
41,215
(2.89 %)
190 jewelled blenny (2019)
GCF_902148845.1
42,877
(8.61 %)
15,188
(2.40 %)
41,262
(7.86 %)
58,418
(6.97 %)
44.34
(98.69 %)
602
(1.31 %)
203
(100.00 %)
667,122
(4.21 %)
442,004
(5.09 %)
4,388,570
(26.54 %)
121,464
(9.36 %)
191 jewelled blenny (alternate hap 2019)
GCA_902148835.1
n/a 15,945
(2.17 %)
101,825
(8.93 %)
n/a 44.49
(99.63 %)
9
(0.37 %)
4,516
(100.00 %)
744,228
(4.25 %)
519,896
(5.73 %)
4,677,160
(28.52 %)
138,484
(9.55 %)
192 John dory (alternate hap 2023)
GCA_960530785.1
n/a 14,960
(2.23 %)
74,436
(6.65 %)
n/a 43.94
(100.00 %)
n/a 5,370
(100.00 %)
1,620,688
(23.00 %)
902,057
(13.66 %)
4,547,953
(39.90 %)
129,990
(12.07 %)
193 John dory (primary hap 2023)
GCA_960531495.1
n/a 14,906
(2.33 %)
72,029
(6.72 %)
n/a 43.92
(99.98 %)
887
(0.02 %)
191
(100.00 %)
1,609,654
(22.82 %)
897,264
(13.58 %)
4,548,467
(39.80 %)
129,147
(11.75 %)
194 kelp grouper (mb 2019)
GCF_006386435.1
45,779
(8.57 %)
15,561
(1.99 %)
53,188
(5.12 %)
n/a 41.32
(97.02 %)
48,394
(2.99 %)
4,563
(100.00 %)
574,889
(2.73 %)
367,135
(2.64 %)
6,420,280
(29.10 %)
28,979
(1.07 %)
195 lake trout
GCF_016432855.1
65,012
(4.57 %)
26,528
(1.53 %)
112,119
(4.47 %)
76,885
(3.80 %)
43.50
(99.99 %)
3,264
(0.01 %)
4,121
(100.00 %)
1,387,896
(5.81 %)
1,797,785
(19.28 %)
9,643,314
(54.44 %)
85,419
(2.52 %)
196 lake whitefish (EN20210322 male 2021 Laval U)
GCF_018398675.1
78,867
(4.31 %)
27,579
(1.38 %)
113,850
(3.63 %)
n/a 44.18
(100.00 %)
1,716
(0.00 %)
6,355
(100.00 %)
1,729,029
(6.03 %)
1,781,307
(15.24 %)
9,311,548
(61.16 %)
126,142
(4.04 %)
197 lake whitefish (EN_2021a female 2021 Laval U)
GCF_020615455.1
87,246
(4.53 %)
28,366
(1.38 %)
117,266
(3.71 %)
n/a 44.12
(100.00 %)
1,159
(0.00 %)
7,334
(100.00 %)
1,768,537
(6.02 %)
1,793,716
(15.51 %)
9,525,312
(61.13 %)
126,485
(3.95 %)
198 lantern fish (primary hap 2024)
GCA_963921795.1
n/a 17,851
(1.28 %)
83,249
(5.18 %)
n/a 42.69
(99.97 %)
2,397
(0.03 %)
709
(100.00 %)
7,797,173
(37.37 %)
1,593,818
(10.64 %)
7,610,300
(54.05 %)
127,942
(3.84 %)
199 large yellow croaker
GCF_000972845.2
49,914
(11.76 %)
15,365
(3.00 %)
26,101
(6.66 %)
n/a 41.34
(99.67 %)
7,424
(0.33 %)
9,998
(100.00 %)
478,685
(3.50 %)
306,063
(3.37 %)
4,199,578
(24.80 %)
28,138
(2.09 %)
200 large-eye snaggletooth (alternate hap 2023)
GCA_949987545.1
n/a 15,841
(2.36 %)
79,276
(8.51 %)
n/a 46.35
(100.00 %)
n/a 5,761
(100.00 %)
2,935,570
(42.17 %)
1,208,602
(21.28 %)
3,157,730
(42.63 %)
88,759
(6.30 %)
201 large-eye snaggletooth (primary hap 2023)
GCA_949987555.1
n/a 16,376
(2.19 %)
82,947
(7.99 %)
n/a 46.31
(99.94 %)
2,631
(0.06 %)
1,522
(100.00 %)
3,333,323
(43.58 %)
1,553,932
(25.91 %)
3,393,507
(46.78 %)
99,668
(6.39 %)
202 largemouth bass
GCF_014851395.1
55,170
(9.49 %)
16,635
(2.18 %)
56,707
(5.52 %)
n/a 40.86
(99.85 %)
2,909
(0.15 %)
4,753
(100.00 %)
497,281
(2.60 %)
269,495
(3.70 %)
5,496,732
(29.60 %)
28,733
(1.66 %)
203 largescale foureyes (fAnaAna1 alternate hap 2020)
GCA_014839705.1
n/a 8,132
(2.11 %)
25,878
(4.67 %)
n/a 38.55
(100.00 %)
n/a 5,088
(100.00 %)
260,789
(2.73 %)
158,564
(2.12 %)
3,023,128
(27.39 %)
9,678
(1.02 %)
204 largescale foureyes (fAnaAna1 primary hap 2020)
GCA_014839685.1
n/a 14,774
(2.18 %)
42,858
(4.83 %)
58,247
(6.94 %)
38.54
(99.96 %)
107
(0.04 %)
33
(100.00 %)
506,950
(2.73 %)
305,170
(2.13 %)
6,194,879
(29.85 %)
17,881
(0.94 %)
205 leafy seadragon (BA_2022a 2022)
GCF_024500275.1
46,242
(10.23 %)
13,712
(2.62 %)
43,369
(5.56 %)
n/a 42.40
(100.00 %)
76
(0.00 %)
1,537
(100.00 %)
1,406,779
(35.37 %)
202,983
(7.44 %)
3,933,128
(41.19 %)
70,560
(7.78 %)
206 leopard coralgrouper
GCF_008729295.1
38,671
(7.52 %)
15,538
(2.18 %)
57,480
(5.26 %)
n/a 39.54
(98.22 %)
3,611
(1.77 %)
94,260
(100.00 %)
629,451
(3.42 %)
385,539
(3.83 %)
6,343,655
(29.35 %)
27,018
(1.26 %)
207 lesser salmon catfish (fNeoGra1 alternate hap 2023)
GCA_027579805.1
n/a 15,487
(0.88 %)
85,135
(3.39 %)
n/a 42.43
(100.00 %)
3
(0.00 %)
6,593
(100.00 %)
5,572,163
(49.59 %)
1,052,072
(6.02 %)
7,246,646
(62.69 %)
157,768
(4.38 %)
208 lesser salmon catfish (fNeoGra1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027579695.1
53,323
(3.35 %)
15,955
(0.92 %)
85,700
(3.30 %)
n/a 42.44
(99.43 %)
334
(0.57 %)
38
(100.00 %)
6,041,262
(71.88 %)
1,126,468
(6.51 %)
7,609,180
(62.74 %)
166,630
(4.38 %)
209 lesser sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_950004245.1
n/a 13,792
(2.19 %)
51,353
(6.60 %)
n/a 41.16
(100.00 %)
1
(0.00 %)
3,620
(100.00 %)
2,536,362
(38.05 %)
513,115
(7.50 %)
3,542,854
(37.60 %)
31,814
(1.79 %)
210 lesser sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949987685.1
n/a 13,908
(2.19 %)
50,634
(6.50 %)
n/a 41.22
(99.97 %)
1,017
(0.03 %)
701
(100.00 %)
2,698,640
(39.19 %)
577,328
(8.51 %)
3,615,231
(39.17 %)
33,251
(1.82 %)
211 lesser weever (primary hap 2023)
GCA_963691815.1
n/a 15,269
(2.44 %)
52,449
(6.28 %)
n/a 41.81
(99.99 %)
606
(0.02 %)
133
(100.00 %)
1,879,201
(31.40 %)
449,901
(9.89 %)
4,248,556
(33.21 %)
43,864
(3.01 %)
212 limp eelpout (alternate hap 2023)
GCA_949748265.1
n/a 15,033
(2.98 %)
51,296
(7.68 %)
n/a 43.01
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2,700
(100.00 %)
1,099,919
(28.68 %)
314,919
(9.57 %)
2,620,601
(30.23 %)
49,248
(4.19 %)
213 limp eelpout (primary hap 2023)
GCA_949748355.1
n/a 15,060
(2.89 %)
50,064
(7.31 %)
n/a 41.88
(99.98 %)
589
(0.02 %)
534
(100.00 %)
1,116,427
(28.18 %)
315,489
(13.14 %)
2,598,812
(33.21 %)
50,192
(3.82 %)
214 live sharksucker (alternate hap 2019)
GCA_900963505.1
n/a 14,632
(3.51 %)
40,441
(7.51 %)
n/a 41.42
(99.96 %)
19
(0.04 %)
1,405
(100.00 %)
435,742
(3.57 %)
139,003
(1.51 %)
3,161,165
(22.06 %)
16,302
(1.34 %)
215 live sharksucker (v2 2021)
GCA_900963305.2
n/a 14,975
(3.53 %)
40,908
(7.56 %)
n/a 41.43
(99.89 %)
140
(0.11 %)
38
(100.00 %)
772,309
(14.49 %)
146,353
(1.65 %)
3,204,473
(21.79 %)
16,807
(1.33 %)
216 longspined bullhead (fTauBub2.1 alternate hap 2021)
GCA_910589325.1
n/a 15,137
(3.09 %)
52,499
(7.75 %)
n/a 42.22
(100.00 %)
n/a 1,778
(100.00 %)
448,166
(4.67 %)
416,181
(8.95 %)
3,288,388
(27.99 %)
55,747
(4.41 %)
217 longspined bullhead (fTauBub2.1 primary hap 2021)
GCA_910589615.1
n/a 15,027
(3.10 %)
51,137
(7.71 %)
n/a 42.22
(99.99 %)
242
(0.01 %)
27
(100.00 %)
452,844
(4.81 %)
417,308
(9.63 %)
3,262,282
(28.51 %)
55,527
(4.38 %)
218 lumpfish (alternate hap 2019)
GCA_009769515.1
n/a 12,848
(3.32 %)
43,711
(8.09 %)
n/a 42.84
(100.00 %)
n/a 1,866
(100.00 %)
407,698
(6.03 %)
360,501
(11.29 %)
2,456,041
(28.07 %)
45,916
(5.21 %)
219 lumpfish (primary hap v1 2019 refseq)
GCF_009769545.1
41,612
(11.11 %)
14,752
(3.31 %)
49,223
(8.10 %)
52,721
(8.34 %)
42.83
(98.22 %)
347
(1.78 %)
48
(100.00 %)
478,386
(6.02 %)
421,632
(11.07 %)
2,928,619
(27.99 %)
53,321
(5.09 %)
220 lumpfish (primary hap v2.1 2023 genbank)
GCA_963457625.1
n/a 14,944
(3.23 %)
50,328
(8.09 %)
n/a 42.82
(99.97 %)
954
(0.03 %)
232
(100.00 %)
1,034,598
(25.93 %)
434,819
(13.21 %)
2,907,371
(30.18 %)
55,066
(5.20 %)
221 lyretail cichlid
GCF_000239395.1
38,260
(10.03 %)
14,804
(2.69 %)
23,751
(5.79 %)
n/a 40.44
(80.94 %)
109,100
(19.10 %)
118,181
(80.90 %)
695,696
(14.49 %)
119,381
(1.10 %)
4,539,429
(19.49 %)
18,098
(0.91 %)
222 mandarin fish (FFG_IHB_CAS 2021)
GCF_020085105.1
64,831
(12.89 %)
15,283
(2.75 %)
43,349
(6.02 %)
n/a 40.35
(100.00 %)
93
(0.00 %)
65
(100.00 %)
441,324
(3.38 %)
206,420
(2.54 %)
4,582,841
(27.41 %)
15,999
(1.17 %)
223 mandarin fish (RoL2022-P1 2023)
GCF_027744825.2
49,016
(12.41 %)
14,186
(3.08 %)
55,502
(8.05 %)
n/a 43.27
(100.00 %)
19
(0.00 %)
97
(100.00 %)
321,832
(4.91 %)
114,318
(16.04 %)
2,300,636
(32.10 %)
46,312
(5.05 %)
224 mangrove rivulus
GCF_001649575.2
46,200
(11.83 %)
14,522
(2.87 %)
46,641
(6.86 %)
n/a 40.03
(94.31 %)
32,278
(5.70 %)
300
(100.00 %)
345,678
(2.32 %)
146,263
(1.33 %)
4,718,292
(27.30 %)
39,541
(2.69 %)
225 marbled rockcod (alternate hap 2023)
GCA_949606865.1
n/a 14,564
(1.72 %)
71,604
(6.41 %)
n/a 41.49
(100.00 %)
n/a 8,737
(100.00 %)
1,662,251
(42.29 %)
439,119
(12.96 %)
3,776,125
(45.00 %)
56,507
(2.83 %)
226 marbled rockcod (primary hap 2023)
GCA_949606895.1
n/a 15,070
(1.79 %)
71,367
(6.50 %)
n/a 41.46
(99.92 %)
4,157
(0.08 %)
943
(100.00 %)
1,717,591
(42.63 %)
474,348
(12.30 %)
4,011,319
(44.93 %)
59,531
(2.83 %)
227 Mariana snailfish (Mariana Trench HS2019 2023)
GCF_029220125.1
44,363
(10.91 %)
14,032
(2.80 %)
60,400
(8.09 %)
n/a 43.84
(99.86 %)
974
(0.14 %)
200
(100.00 %)
1,157,953
(36.57 %)
569,832
(12.19 %)
2,864,996
(37.65 %)
98,423
(9.53 %)
228 Mexican tetra (2017 WashU)
GCF_000372685.2
47,018
(6.00 %)
16,516
(1.68 %)
33,920
(4.24 %)
n/a 38.00
(96.73 %)
621
(3.27 %)
2,415
(100.00 %)
1,125,511
(6.89 %)
1,113,607
(11.76 %)
8,546,053
(42.44 %)
44,933
(1.77 %)
229 Mexican tetra (ESR-SI-001 2022)
GCF_023375975.1
71,254
(7.50 %)
16,674
(1.63 %)
52,903
(4.12 %)
101,896
(6.64 %)
38.24
(100.00 %)
14
(0.00 %)
109
(100.00 %)
1,155,823
(4.90 %)
1,363,316
(12.23 %)
7,667,721
(47.23 %)
48,358
(1.88 %)
230 Mexican tetra (Pach_M1 Pachon cave 2021)
GCA_019721115.1
n/a 16,698
(1.62 %)
62,818
(5.14 %)
74,339
(6.58 %)
38.41
(99.99 %)
334
(0.01 %)
195
(100.00 %)
1,194,830
(5.04 %)
1,460,981
(11.81 %)
7,590,179
(47.66 %)
50,533
(2.46 %)
231 milkfish (2019)
GCF_902362185.1
30,812
(7.61 %)
16,869
(3.41 %)
21,377
(6.58 %)
n/a 41.53
(99.36 %)
112
(0.64 %)
31
(100.00 %)
958,774
(8.18 %)
731,733
(9.10 %)
3,702,024
(26.31 %)
22,089
(1.27 %)
232 milkfish (alternate hap 2019)
GCA_902362175.1
n/a 16,565
(3.38 %)
42,094
(6.75 %)
n/a 41.51
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1,937
(100.00 %)
930,392
(8.11 %)
708,375
(9.04 %)
3,612,575
(26.46 %)
21,531
(1.27 %)
233 minispotted lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963454915.1
n/a 17,701
(1.62 %)
73,433
(5.69 %)
n/a 42.20
(99.98 %)
1,398
(0.02 %)
388
(100.00 %)
6,438,444
(40.32 %)
1,202,669
(11.51 %)
7,055,665
(47.04 %)
74,954
(3.44 %)
234 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 alternate hap 2022)
GCA_023349535.1
n/a 15,176
(3.17 %)
47,458
(7.48 %)
n/a 42.05
(99.99 %)
927
(0.02 %)
486
(100.00 %)
1,167,409
(26.98 %)
438,114
(8.08 %)
3,351,987
(27.25 %)
45,298
(3.39 %)
235 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 primary hap 2022)
GCA_023349555.1
n/a 14,480
(3.19 %)
44,951
(7.47 %)
n/a 42.05
(99.98 %)
936
(0.02 %)
725
(100.00 %)
1,101,582
(26.86 %)
415,846
(8.16 %)
3,162,480
(27.08 %)
42,657
(3.44 %)
236 Monterrey platyfish
GCF_001444195.1
53,087
(12.11 %)
14,672
(2.71 %)
27,552
(6.74 %)
n/a 39.02
(99.85 %)
229
(0.15 %)
68
(100.00 %)
305,761
(2.11 %)
134,157
(2.14 %)
4,687,726
(28.26 %)
33,082
(2.28 %)
237 mudskipper P.magnuspinnatus (v1 alternate hap 2020 genbank)
GCA_009829135.1
n/a 13,470
(2.34 %)
42,799
(5.73 %)
n/a 40.16
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,799
(100.00 %)
394,414
(4.41 %)
509,973
(7.17 %)
4,581,968
(38.91 %)
34,522
(2.54 %)
238 mudskipper P.magnuspinnatus (v1.2 primary hap 2023)
GCF_009829125.3
33,236
(8.44 %)
14,601
(2.46 %)
44,145
(5.80 %)
n/a 40.22
(99.05 %)
701
(0.95 %)
122
(100.00 %)
1,755,227
(42.93 %)
551,482
(7.22 %)
4,887,087
(38.97 %)
37,287
(2.58 %)
239 mummichog (Maine)
GCF_000826765.1
41,183
(7.38 %)
14,602
(1.92 %)
57,194
(5.03 %)
35,597
(6.40 %)
40.58
(91.29 %)
123,625
(8.75 %)
120,723
(91.25 %)
447,158
(2.19 %)
235,336
(1.39 %)
6,518,990
(26.03 %)
54,589
(2.39 %)
240 mummichog (U. Missouri)
GCF_011125445.2
56,612
(6.89 %)
15,361
(1.60 %)
69,801
(5.20 %)
n/a 40.76
(99.88 %)
2,820
(0.12 %)
1,031
(100.00 %)
636,480
(2.75 %)
392,130
(3.32 %)
7,023,777
(32.98 %)
81,101
(3.45 %)
241 New Zealand spotty (2019)
GCA_009762535.1
n/a 14,609
(2.22 %)
43,262
(5.33 %)
60,241
(8.02 %)
40.86
(98.32 %)
1,135
(1.69 %)
468
(100.00 %)
519,324
(4.65 %)
393,329
(5.54 %)
4,522,265
(33.34 %)
18,302
(0.85 %)
242 New Zealand spotty (alternate hap 2019)
GCA_009762545.1
n/a 13,566
(2.17 %)
40,774
(5.21 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
n/a 3,286
(100.00 %)
472,659
(4.46 %)
348,429
(5.17 %)
4,169,213
(33.57 %)
16,368
(0.83 %)
243 Nile tilapia
GCF_001858045.2
77,384
(10.86 %)
15,599
(1.99 %)
32,839
(6.04 %)
n/a 40.73
(99.99 %)
551
(0.01 %)
2,460
(100.00 %)
600,869
(5.40 %)
291,105
(3.17 %)
4,958,128
(31.15 %)
32,038
(1.81 %)
244 ninespine stickleback (alternate hap 2023)
GCA_949316245.1
n/a 13,050
(3.93 %)
44,650
(10.12 %)
n/a 44.10
(100.00 %)
n/a 1,934
(100.00 %)
512,583
(14.83 %)
156,305
(8.46 %)
2,005,803
(27.09 %)
59,674
(9.19 %)
245 ninespine stickleback (NSP_V7 2020)
GCF_902500615.1
51,166
(15.31 %)
14,765
(3.99 %)
49,191
(9.80 %)
n/a 44.37
(99.99 %)
341
(0.01 %)
1,667
(100.00 %)
380,357
(3.60 %)
188,301
(6.29 %)
2,422,266
(25.70 %)
72,584
(9.69 %)
246 ninespine stickleback (primary hap 2023)
GCA_949316345.1
n/a 14,600
(3.83 %)
49,927
(9.98 %)
n/a 44.12
(99.97 %)
738
(0.03 %)
175
(100.00 %)
599,088
(14.68 %)
186,747
(10.27 %)
2,273,942
(28.36 %)
70,136
(9.39 %)
247 ninespine stickleback (primary hap 2023)
GCF_949316345.1
57,816
(15.11 %)
14,598
(3.83 %)
49,473
(9.87 %)
n/a 44.12
(99.97 %)
738
(0.03 %)
174
(100.00 %)
599,085
(14.68 %)
186,746
(10.27 %)
2,273,889
(28.36 %)
70,136
(9.39 %)
248 North African catfish (Netherlands MV-2021 2022)
GCF_024256425.1
51,073
(7.42 %)
15,809
(2.17 %)
43,728
(4.54 %)
n/a 39.00
(100.00 %)
n/a 48
(100.00 %)
2,472,286
(44.73 %)
560,123
(5.68 %)
6,203,876
(38.64 %)
42,187
(2.72 %)
249 northern pike
GCF_004634155.1
66,389
(9.11 %)
16,778
(2.37 %)
27,040
(5.41 %)
n/a 42.29
(99.99 %)
584
(0.01 %)
908
(100.00 %)
1,065,458
(31.14 %)
531,451
(7.80 %)
4,677,366
(33.26 %)
44,793
(2.82 %)
250 northern pike (2020 refseq)
GCF_011004845.1
63,733
(9.28 %)
16,618
(2.41 %)
55,784
(5.64 %)
82,941
(8.82 %)
42.22
(99.89 %)
112
(0.11 %)
53
(100.00 %)
984,415
(29.15 %)
524,708
(7.32 %)
4,691,096
(32.91 %)
42,910
(2.52 %)
251 northern pike (alternate hap 2020)
GCA_011004835.1
n/a 11,782
(2.41 %)
40,748
(5.68 %)
n/a 42.32
(99.93 %)
11
(0.07 %)
3,813
(100.00 %)
700,818
(30.15 %)
372,729
(7.71 %)
3,058,655
(31.76 %)
29,687
(2.57 %)
252 Old Calabar mormyrid
GCF_002872115.1
61,915
(11.48 %)
15,987
(2.73 %)
33,963
(6.66 %)
n/a 43.93
(92.03 %)
49,579
(7.99 %)
4,666
(100.00 %)
348,463
(2.27 %)
314,129
(2.95 %)
4,259,711
(20.83 %)
76,846
(4.18 %)
253 orangethroat darter
GCF_008692095.1
55,448
(8.29 %)
15,000
(2.25 %)
49,918
(5.41 %)
n/a 40.91
(99.57 %)
101,221
(0.47 %)
3,119
(100.00 %)
566,915
(3.75 %)
509,018
(6.60 %)
5,142,090
(31.18 %)
26,702
(1.46 %)
254 orbiculate cardinalfish (2019)
GCF_902148855.1
46,571
(5.47 %)
15,761
(1.50 %)
31,563
(4.00 %)
59,905
(3.98 %)
37.90
(99.73 %)
1,844
(0.27 %)
340
(100.00 %)
1,257,250
(5.57 %)
979,214
(8.64 %)
6,386,731
(48.59 %)
29,320
(0.87 %)
255 orbiculate cardinalfish (alternate hap 2019)
GCA_902148825.1
n/a 14,018
(1.51 %)
45,251
(3.61 %)
n/a 37.73
(99.94 %)
142
(0.06 %)
7,038
(99.94 %)
1,041,393
(5.09 %)
744,623
(6.94 %)
6,250,631
(45.53 %)
22,522
(0.77 %)
256 oriental weatherfish (BS_2022a 2023)
GCF_027580225.1
68,779
(8.54 %)
17,223
(2.28 %)
49,697
(5.11 %)
n/a 38.10
(99.99 %)
614
(0.01 %)
358
(100.00 %)
2,925,549
(40.35 %)
402,676
(5.35 %)
5,933,365
(45.71 %)
56,843
(3.18 %)
257 P.nyererei 1_Seehausen
GCF_000239375.1
40,001
(9.36 %)
14,904
(2.72 %)
24,732
(5.87 %)
n/a 40.60
(84.20 %)
60,817
(15.83 %)
68,050
(84.17 %)
306,171
(3.27 %)
124,292
(0.75 %)
4,414,831
(20.66 %)
18,455
(0.96 %)
258 Pacific cod (2023)
GCF_031168955.1
49,417
(13.66 %)
13,542
(2.89 %)
64,214
(9.77 %)
n/a 45.55
(99.92 %)
4,826
(0.09 %)
24
(100.00 %)
1,117,561
(38.30 %)
685,851
(13.38 %)
2,330,116
(34.15 %)
87,761
(8.68 %)
259 Pacific halibut (PH-IPHC-18 2020)
GCF_013339905.1
48,776
(12.61 %)
14,747
(3.15 %)
45,075
(7.30 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
219
(0.00 %)
120
(100.00 %)
410,917
(4.22 %)
246,500
(4.66 %)
3,680,698
(25.23 %)
31,508
(2.30 %)
260 Pacific halibut (QCI-W04-F060 2022)
GCF_022539355.2
46,684
(12.50 %)
14,862
(3.15 %)
45,824
(7.30 %)
n/a 42.17
(99.95 %)
1,131
(0.05 %)
53
(100.00 %)
407,699
(3.94 %)
247,330
(3.84 %)
3,838,896
(24.75 %)
31,782
(2.27 %)
261 Pacific saury (AMF1-May2022 2023)
GCF_033807715.1
54,344
(6.52 %)
15,214
(1.67 %)
74,345
(6.13 %)
n/a 41.49
(99.96 %)
900
(0.04 %)
759
(100.00 %)
805,776
(5.16 %)
849,901
(11.48 %)
4,645,552
(43.92 %)
106,026
(5.14 %)
262 panther danio (primary hap 2020)
GCF_903798145.1
40,657
(5.52 %)
17,858
(2.46 %)
42,119
(3.16 %)
n/a 36.32
(98.82 %)
1,821
(1.18 %)
342
(100.00 %)
3,973,354
(56.67 %)
940,639
(7.81 %)
8,701,639
(50.54 %)
29,684
(1.18 %)
263 Patagonian blennie (Puerto Natales JMC-PN-2008 2024)
GCF_036324505.1
42,701
(12.59 %)
14,986
(3.15 %)
46,289
(7.75 %)
n/a 40.99
(99.97 %)
380
(0.03 %)
27
(100.00 %)
1,031,762
(25.30 %)
219,393
(4.63 %)
3,436,780
(25.57 %)
16,570
(1.12 %)
264 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 1 2023)
GCA_027942865.1
n/a 15,242
(2.07 %)
60,994
(6.53 %)
n/a 41.51
(99.99 %)
282
(0.01 %)
189
(100.00 %)
975,354
(15.76 %)
315,625
(10.49 %)
3,601,904
(35.09 %)
49,121
(3.07 %)
265 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 2 2023)
GCA_027942885.1
n/a 15,317
(2.02 %)
61,647
(6.35 %)
n/a 41.37
(99.99 %)
135
(0.01 %)
469
(99.99 %)
981,519
(15.40 %)
319,637
(12.45 %)
3,706,473
(36.77 %)
50,353
(2.98 %)
266 peladilla (fAplTae1 alternate hap 2021)
GCA_017639685.1
n/a 16,729
(3.56 %)
56,451
(8.61 %)
n/a 45.00
(100.00 %)
11
(0.00 %)
5,701
(100.00 %)
1,153,359
(18.94 %)
829,887
(14.54 %)
2,793,018
(28.79 %)
49,469
(4.32 %)
267 peladilla (fAplTae1 primary hap 2021)
GCA_017639675.1
n/a 13,829
(3.83 %)
41,932
(8.64 %)
n/a 45.01
(98.24 %)
1,158
(1.77 %)
41
(100.00 %)
930,246
(18.49 %)
660,569
(13.71 %)
2,316,198
(27.66 %)
41,023
(4.40 %)
268 pike-perch
GCF_008315115.2
65,418
(8.54 %)
15,731
(2.23 %)
52,240
(5.69 %)
n/a 40.87
(99.98 %)
711
(0.02 %)
337
(100.00 %)
629,999
(5.16 %)
567,578
(7.41 %)
4,697,709
(36.49 %)
39,666
(1.93 %)
269 pinecone soldierfish (2019)
GCF_902150065.1
40,770
(8.72 %)
15,738
(2.42 %)
26,691
(5.69 %)
57,069
(6.14 %)
41.83
(99.78 %)
253
(0.22 %)
87
(100.00 %)
1,063,888
(5.90 %)
646,820
(4.30 %)
4,938,857
(28.11 %)
41,636
(2.04 %)
270 pinecone soldierfish (alternate hap 2019)
GCA_902148815.1
n/a 15,563
(2.38 %)
54,264
(6.19 %)
n/a 41.81
(100.00 %)
6
(0.00 %)
2,193
(100.00 %)
1,040,418
(5.81 %)
623,499
(4.08 %)
4,888,400
(27.89 %)
40,331
(2.02 %)
271 pink salmon
GCF_021184085.1
91,127
(4.89 %)
27,187
(1.37 %)
124,120
(3.88 %)
n/a 44.28
(99.96 %)
5,213
(0.04 %)
22,556
(99.99 %)
1,343,135
(0.00 %)
2,906,520
(28.95 %)
10,882,087
(57.26 %)
97,805
(3.04 %)
272 ploughfish
GCF_902827175.1
50,551
(7.66 %)
14,699
(1.83 %)
66,348
(6.06 %)
62,492
(5.74 %)
41.52
(99.98 %)
1,569
(0.02 %)
2,618
(100.00 %)
467,937
(3.05 %)
412,361
(6.64 %)
3,498,382
(45.08 %)
73,879
(3.55 %)
273 pollack (alternate hap 2023)
GCA_949987605.1
n/a 14,050
(2.77 %)
63,249
(8.86 %)
n/a 45.41
(100.00 %)
n/a 4,970
(100.00 %)
708,455
(9.71 %)
797,241
(15.67 %)
2,785,159
(33.18 %)
78,151
(7.95 %)
274 pollack (primary hap 2023)
GCA_949987615.1
n/a 14,126
(2.81 %)
61,907
(8.75 %)
n/a 45.67
(99.94 %)
1,810
(0.06 %)
616
(100.00 %)
753,034
(10.17 %)
850,189
(15.72 %)
2,888,555
(33.70 %)
80,883
(8.43 %)
275 prehistoric monster fish (2019 refseq)
GCF_902500255.1
45,404
(2.55 %)
14,664
(0.76 %)
72,609
(2.41 %)
57,391
(2.04 %)
41.99
(99.49 %)
2,554
(0.51 %)
464
(100.00 %)
1,310,663
(2.79 %)
786,401
(3.65 %)
9,901,286
(59.90 %)
172,199
(5.45 %)
276 prehistoric monster fish (alternate hap 2019)
GCA_902500245.1
n/a 10,944
(0.64 %)
59,123
(2.21 %)
n/a 41.96
(100.00 %)
8
(0.00 %)
19,587
(100.00 %)
947,336
(2.69 %)
554,284
(3.27 %)
7,314,941
(58.56 %)
125,285
(5.42 %)
277 rainbow smelt (fOsmMor3 primary hap 2024)
GCA_038355195.1
n/a 15,639
(3.89 %)
49,368
(9.40 %)
n/a 45.55
(99.93 %)
1,907
(0.07 %)
365
(100.00 %)
1,655,350
(30.53 %)
511,512
(12.09 %)
2,015,264
(35.19 %)
32,410
(4.33 %)
278 rainbow trout (Arlee)
GCF_013265735.2
119,284
(6.51 %)
27,513
(1.62 %)
109,524
(4.38 %)
138,073
(5.21 %)
43.45
(99.74 %)
486
(0.26 %)
939
(100.00 %)
1,537,455
(7.32 %)
2,083,211
(23.10 %)
10,092,840
(53.71 %)
73,586
(2.16 %)
279 rainbow trout (Swanson)
GCF_002163495.1
79,299
(6.41 %)
25,179
(1.70 %)
98,339
(4.18 %)
115,853
(5.33 %)
42.67
(88.52 %)
427,894
(11.54 %)
139,800
(99.96 %)
1,332,141
(5.52 %)
1,604,760
(8.18 %)
9,451,984
(44.00 %)
56,604
(1.05 %)
280 razorback sucker (HMW12.3.18 2022)
GCF_025860055.1
71,991
(5.94 %)
27,195
(1.88 %)
81,269
(3.63 %)
n/a 39.59
(99.96 %)
1,873
(0.04 %)
1,746
(100.00 %)
7,035,382
(51.89 %)
1,021,269
(5.98 %)
12,768,853
(46.85 %)
109,185
(4.70 %)
281 red drum (XU1910 2020)
GCA_014183145.1
n/a 15,655
(3.01 %)
47,717
(6.87 %)
n/a 40.98
(95.57 %)
11,577
(4.42 %)
34,462
(100.00 %)
470,579
(3.16 %)
231,051
(1.91 %)
4,345,700
(23.24 %)
20,149
(1.25 %)
282 red-bellied piranha (fPygNat1 alternate hap 2020)
GCA_015220065.1
n/a 4,539
(2.01 %)
14,061
(4.35 %)
n/a 40.48
(100.00 %)
n/a 1,751
(100.00 %)
759,605
(49.59 %)
161,693
(7.99 %)
1,684,737
(29.93 %)
7,525
(1.31 %)
283 red-bellied piranha (fPygNat1 primary hap 2020)
GCF_015220715.1
54,818
(7.05 %)
16,817
(1.87 %)
52,672
(4.24 %)
76,011
(5.65 %)
40.58
(99.17 %)
303
(0.83 %)
55
(100.00 %)
817,566
(5.40 %)
689,236
(8.30 %)
7,296,459
(35.73 %)
33,087
(1.38 %)
284 red-bellied piranha (Pna-1 2016)
GCF_001682695.1
47,129
(6.06 %)
17,089
(1.80 %)
33,378
(4.02 %)
n/a 40.45
(97.38 %)
62,964
(2.59 %)
325,620
(97.41 %)
898,445
(4.81 %)
863,000
(6.48 %)
7,757,382
(34.74 %)
34,329
(1.24 %)
285 reedfish (2021)
GCF_900747795.2
44,479
(2.01 %)
13,108
(0.46 %)
23,157
(1.29 %)
n/a 39.37
(99.18 %)
1,431
(0.82 %)
169
(100.00 %)
8,636,520
(39.34 %)
1,069,643
(2.91 %)
19,980,572
(47.52 %)
89,023
(1.13 %)
286 reedfish (alternate hap)
GCA_900700845.2
n/a 9,950
(0.37 %)
31,611
(1.22 %)
n/a 39.44
(100.00 %)
5
(0.00 %)
38,598
(100.00 %)
1,300,565
(2.57 %)
685,834
(2.21 %)
14,691,576
(45.66 %)
63,365
(1.11 %)
287 ringed pipefish (RoL2022-P2 2023)
GCF_027744805.1
56,261
(13.18 %)
14,197
(2.71 %)
45,193
(6.30 %)
n/a 41.67
(100.00 %)
14
(0.00 %)
157
(100.00 %)
941,095
(17.66 %)
238,999
(5.27 %)
4,283,692
(41.06 %)
43,014
(4.07 %)
288 Rio pearlfish (Nwh7 v2 2021)
GCF_014905685.2
25,353
(3.88 %)
14,334
(1.56 %)
137,348
(9.74 %)
n/a 41.06
(92.01 %)
100,521
(8.02 %)
18,998
(100.00 %)
635,526
(3.14 %)
444,158
(3.06 %)
6,203,124
(42.81 %)
52,308
(2.11 %)
289 river trout (v2 2021)
GCA_901001165.2
n/a 27,928
(1.66 %)
110,791
(4.44 %)
n/a 43.36
(96.90 %)
3,941
(3.10 %)
1,441
(100.00 %)
4,690,842
(57.30 %)
1,789,507
(15.87 %)
9,819,763
(52.37 %)
70,821
(1.77 %)
290 roach minnow (alternate hap 2023)
GCA_951802655.1
n/a 18,165
(2.73 %)
62,580
(6.00 %)
n/a 38.74
(100.00 %)
6
(0.00 %)
4,612
(100.00 %)
2,483,904
(48.29 %)
584,363
(7.55 %)
5,582,076
(40.38 %)
60,229
(3.53 %)
291 roach minnow (primary hap 2023)
GCA_951802725.1
n/a 18,132
(2.65 %)
63,523
(6.01 %)
n/a 38.80
(99.99 %)
471
(0.01 %)
86
(100.00 %)
2,613,900
(48.90 %)
625,102
(8.21 %)
5,738,444
(41.24 %)
65,328
(3.68 %)
292 rock gunnel (alternate hap 2021)
GCA_910591705.2
n/a 15,291
(3.29 %)
45,865
(7.56 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,165
(100.00 %)
1,131,154
(25.69 %)
269,583
(5.08 %)
3,371,712
(24.64 %)
36,810
(2.68 %)
293 rock gunnel (primary hap 2021)
GCA_910591455.2
n/a 15,181
(3.34 %)
44,153
(7.53 %)
51,135
(7.40 %)
42.31
(99.98 %)
418
(0.02 %)
101
(100.00 %)
1,121,704
(25.48 %)
269,467
(4.88 %)
3,358,709
(24.69 %)
36,987
(3.02 %)
294 rohu (BAU-BD-2019 2022)
GCF_022985175.1
52,554
(8.81 %)
17,664
(3.05 %)
48,403
(5.24 %)
n/a 36.06
(83.93 %)
5,144
(16.07 %)
2,870
(100.00 %)
2,600,095
(49.94 %)
683,499
(4.34 %)
6,000,462
(35.96 %)
33,741
(1.62 %)
295 Rosablanca catfish (hap1 2023)
GCA_030014385.1
n/a 15,802
(1.97 %)
47,186
(4.62 %)
n/a 40.27
(100.00 %)
198
(0.00 %)
349
(100.00 %)
2,616,870
(40.73 %)
658,784
(9.71 %)
5,197,126
(48.95 %)
48,344
(2.62 %)
296 Rosablanca catfish (hap2 2023)
GCA_030015355.1
n/a 15,434
(2.01 %)
44,991
(4.63 %)
n/a 40.24
(100.00 %)
192
(0.00 %)
302
(100.00 %)
2,506,810
(40.54 %)
613,867
(8.67 %)
5,070,851
(48.32 %)
46,071
(2.57 %)
297 sablefish (Golden Eagle Sablefish UVic2021 2023)
GCF_027596085.1
34,548
(9.49 %)
15,280
(3.00 %)
46,259
(6.95 %)
n/a 40.45
(99.99 %)
723
(0.01 %)
8,212
(99.99 %)
1,335,152
(28.19 %)
415,384
(6.53 %)
3,948,379
(27.81 %)
22,854
(1.61 %)
298 sailfin molly
GCF_001443285.1
53,986
(11.41 %)
15,048
(2.71 %)
33,482
(6.71 %)
n/a 39.18
(83.41 %)
41,735
(16.61 %)
54,623
(83.39 %)
357,919
(2.18 %)
189,502
(1.23 %)
4,873,063
(22.51 %)
34,138
(1.62 %)
299 sansaifugu (HTHZ2018 2019)
GCF_003711565.1
56,010
(20.10 %)
13,998
(4.84 %)
48,737
(11.56 %)
n/a 45.63
(99.99 %)
250
(0.01 %)
868
(100.00 %)
304,980
(15.98 %)
171,631
(4.98 %)
1,616,965
(21.60 %)
48,338
(9.79 %)
300 sardine (primary hap 2023)
GCA_963854185.1
n/a 16,071
(2.33 %)
64,180
(7.08 %)
n/a 44.44
(99.96 %)
1,654
(0.04 %)
241
(100.00 %)
1,503,111
(11.74 %)
1,507,024
(15.48 %)
4,027,638
(37.52 %)
68,874
(3.56 %)
301 sardine (primary hap 2023)
GCF_963854185.1
48,146
(9.15 %)
16,069
(2.33 %)
64,178
(7.08 %)
n/a 44.44
(99.96 %)
1,654
(0.04 %)
240
(100.00 %)
1,503,108
(11.74 %)
1,507,022
(15.48 %)
4,027,614
(37.52 %)
68,873
(3.56 %)
302 scribbled pipefish (RoL2023-P3 2023)
GCF_030265065.1
51,270
(7.00 %)
13,854
(1.32 %)
48,980
(3.46 %)
n/a 39.44
(100.00 %)
9
(0.00 %)
109
(100.00 %)
1,805,346
(21.21 %)
512,153
(12.76 %)
6,260,589
(63.96 %)
96,908
(3.65 %)
303 Senegalese sole
GCF_019176455.1
46,446
(12.02 %)
15,155
(3.15 %)
43,828
(7.31 %)
n/a 40.92
(99.99 %)
662
(0.01 %)
1,937
(100.00 %)
522,618
(4.22 %)
317,280
(4.23 %)
4,040,245
(28.25 %)
26,946
(1.79 %)
304 shanny (alternate hap 2023)
GCA_963383635.1
n/a 14,728
(2.46 %)
62,094
(7.09 %)
n/a 42.32
(100.00 %)
1
(0.00 %)
3,847
(100.00 %)
939,151
(11.90 %)
472,983
(7.68 %)
4,326,183
(28.40 %)
64,290
(4.16 %)
305 shanny (primary hap 2023)
GCA_963383615.1
n/a 15,032
(2.44 %)
62,625
(6.97 %)
n/a 42.07
(99.98 %)
598
(0.02 %)
847
(100.00 %)
967,197
(11.85 %)
498,286
(8.15 %)
4,397,828
(28.96 %)
65,744
(4.06 %)
306 sheepshead minnow
GCF_000732505.1
37,879
(7.01 %)
14,749
(2.02 %)
25,480
(4.66 %)
n/a 38.19
(86.93 %)
113,210
(13.10 %)
110,959
(86.90 %)
363,397
(1.88 %)
195,191
(1.43 %)
6,444,762
(27.47 %)
18,269
(0.66 %)
307 shortfin molly
GCF_001443325.1
54,473
(11.42 %)
15,104
(2.72 %)
33,717
(6.74 %)
n/a 39.23
(84.81 %)
37,507
(15.20 %)
50,598
(84.80 %)
328,347
(2.03 %)
172,112
(1.18 %)
4,876,942
(22.80 %)
34,271
(1.66 %)
308 Siamese fighting fish (v4 primary hap 2023)
GCF_900634795.4
59,278
(19.85 %)
14,594
(4.32 %)
55,265
(10.96 %)
n/a 45.31
(99.99 %)
321
(0.01 %)
36
(100.00 %)
384,203
(19.38 %)
175,898
(4.39 %)
1,946,630
(23.16 %)
70,331
(13.13 %)
309 Siamese fighting fish (v5.1 alternate hap 2019)
GCA_900651605.1
n/a 14,510
(4.12 %)
60,058
(10.77 %)
n/a 45.51
(100.00 %)
2
(0.00 %)
3,705
(100.00 %)
249,671
(3.68 %)
182,366
(4.87 %)
1,939,533
(22.55 %)
72,474
(13.55 %)
310 Siamese fighting fish (v5.4 alternate hap 2023)
GCA_900651605.2
n/a 14,737
(4.05 %)
61,568
(10.70 %)
n/a 45.50
(100.00 %)
108
(0.00 %)
3,872
(100.00 %)
392,585
(19.23 %)
190,741
(5.09 %)
1,994,824
(23.20 %)
74,259
(13.49 %)
311 silver crucian carp (wild population from Czech Republic Cgi1373 2022)
GCF_023724105.1
131,166
(9.80 %)
29,612
(2.99 %)
81,338
(5.43 %)
n/a 37.63
(99.92 %)
2,597
(0.08 %)
51
(100.00 %)
3,277,259
(45.05 %)
801,192
(7.96 %)
7,910,205
(42.51 %)
60,236
(2.18 %)
312 smalleye Pacific opah (hap1 2023)
GCA_029633845.1
n/a 13,661
(1.11 %)
75,418
(4.21 %)
n/a 45.01
(99.96 %)
3,120
(0.04 %)
1,059
(100.00 %)
4,634,757
(53.53 %)
1,006,319
(17.13 %)
5,273,732
(51.16 %)
145,115
(7.59 %)
313 smalleye Pacific opah (hap2 2023 refseq)
GCF_029633865.1
34,018
(4.17 %)
13,617
(1.10 %)
74,639
(4.12 %)
n/a 44.94
(99.96 %)
3,115
(0.04 %)
544
(100.00 %)
4,603,649
(53.23 %)
1,009,241
(18.00 %)
5,236,063
(51.65 %)
143,632
(7.43 %)
314 smallmouth bass
GCF_021292245.1
55,919
(9.40 %)
15,509
(2.37 %)
49,387
(5.61 %)
n/a 40.72
(99.65 %)
34,581
(0.36 %)
15,020
(100.00 %)
445,979
(2.50 %)
249,630
(2.49 %)
5,071,015
(28.28 %)
23,875
(1.36 %)
315 snake pipefish (RoL-2023_Sb 2023)
GCF_033978785.1
57,883
(4.39 %)
15,654
(1.03 %)
72,123
(3.58 %)
n/a 38.64
(100.00 %)
2,564
(0.00 %)
424
(100.00 %)
3,149,025
(23.73 %)
1,621,410
(19.58 %)
7,534,195
(67.22 %)
122,765
(3.07 %)
316 sockeye salmon (On170113-E2 v2 2019)
GCF_006149115.2
75,628
(6.10 %)
24,075
(1.71 %)
98,364
(4.30 %)
n/a 43.37
(96.15 %)
25,658
(3.85 %)
36,660
(99.99 %)
949,725
(3.53 %)
1,465,583
(10.82 %)
8,853,884
(48.52 %)
62,850
(1.45 %)
317 sockeye salmon (Pitt River 2024)
GCF_034236695.1
80,798
(5.59 %)
26,218
(1.35 %)
116,746
(3.87 %)
n/a 44.03
(99.93 %)
4,351
(0.07 %)
12,436
(100.00 %)
6,356,046
(54.95 %)
2,840,516
(31.41 %)
10,575,179
(57.52 %)
77,648
(1.61 %)
318 South Georgia icefish
GCF_902827115.1
41,307
(6.47 %)
14,776
(1.79 %)
68,734
(6.16 %)
61,643
(5.52 %)
42.07
(99.94 %)
2,461
(0.06 %)
1,563
(100.00 %)
498,451
(3.42 %)
474,032
(7.20 %)
3,613,731
(45.83 %)
88,984
(4.31 %)
319 southern bluefin tuna (alternate hap 2021)
GCA_910596085.1
n/a 15,727
(2.61 %)
43,177
(5.74 %)
n/a 39.72
(100.00 %)
n/a 895
(100.00 %)
1,590,386
(33.53 %)
246,800
(2.86 %)
5,173,834
(26.85 %)
14,473
(0.87 %)
320 southern bluefin tuna (primary hap 2021 refseq)
GCF_910596095.1
58,429
(11.06 %)
15,626
(2.56 %)
42,730
(5.74 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
184
(0.00 %)
58
(100.00 %)
554,276
(3.42 %)
247,764
(2.94 %)
5,176,851
(26.85 %)
14,097
(0.88 %)
321 southern platyfish
GCF_002775205.1
46,367
(11.15 %)
14,674
(2.66 %)
28,368
(6.82 %)
n/a 38.97
(99.53 %)
156
(0.47 %)
102
(100.00 %)
323,402
(2.76 %)
146,477
(2.33 %)
4,741,552
(28.27 %)
34,667
(2.13 %)
322 Southwestern China cavefish
GCF_001515605.1
74,317
(6.97 %)
30,906
(3.19 %)
55,474
(5.66 %)
n/a 37.28
(92.69 %)
168,741
(7.34 %)
254,423
(92.66 %)
1,129,104
(5.02 %)
730,197
(4.59 %)
8,910,005
(36.97 %)
64,238
(1.79 %)
323 spiny chromis (Palm Island Apoly-LR-REF 2022)
GCF_021347895.1
57,720
(10.03 %)
15,810
(2.14 %)
58,218
(5.77 %)
n/a 40.33
(99.99 %)
871
(0.01 %)
81
(100.00 %)
1,505,948
(35.31 %)
346,542
(4.71 %)
5,210,329
(31.65 %)
36,529
(1.65 %)
324 spiny chromis (Palm Islands 2017)
GCF_002109545.1
38,931
(8.84 %)
15,624
(2.29 %)
35,942
(5.59 %)
n/a 40.01
(85.05 %)
209,115
(15.01 %)
30,414
(100.00 %)
372,901
(2.33 %)
278,854
(1.99 %)
5,622,334
(22.61 %)
25,079
(0.95 %)
325 spotted tilapia (MD_Pm_ZW 2024)
GCF_036321145.1
46,818
(8.35 %)
14,938
(2.04 %)
55,475
(6.12 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
23
(0.00 %)
792
(100.00 %)
505,488
(2.57 %)
269,742
(4.14 %)
4,697,020
(30.74 %)
30,399
(1.90 %)
326 sterlet (maternal 2020)
GCA_902713425.1
n/a 22,306
(1.80 %)
33,366
(4.09 %)
n/a 39.56
(99.99 %)
402
(0.01 %)
245
(100.00 %)
1,126,738
(3.36 %)
889,853
(6.73 %)
8,766,715
(39.22 %)
51,356
(1.84 %)
327 sterlet (paternal 2020)
GCA_902713435.1
n/a 22,718
(1.81 %)
34,093
(4.15 %)
57,768
(4.88 %)
39.60
(100.00 %)
422
(0.01 %)
224
(100.00 %)
1,145,503
(3.39 %)
912,936
(6.84 %)
8,839,174
(39.17 %)
52,560
(1.82 %)
328 stone loach (alternate hap 2022)
GCA_947034905.1
n/a 16,177
(4.18 %)
40,160
(7.35 %)
n/a 39.58
(100.00 %)
n/a 2,237
(100.00 %)
1,208,781
(38.02 %)
121,854
(7.96 %)
2,956,942
(32.61 %)
27,787
(3.58 %)
329 stone loach (primary hap 2022)
GCA_947034865.1
n/a 16,419
(3.98 %)
40,677
(7.21 %)
n/a 39.69
(99.97 %)
825
(0.03 %)
100
(100.00 %)
1,324,513
(39.84 %)
143,170
(9.30 %)
3,000,881
(34.30 %)
30,130
(3.71 %)
330 straightnose pipefish (RoL-2023_Sa 2023)
GCF_033978795.1
56,498
(4.86 %)
14,602
(1.00 %)
64,279
(2.96 %)
n/a 39.74
(100.00 %)
1,172
(0.00 %)
473
(100.00 %)
2,984,285
(27.54 %)
1,402,691
(20.35 %)
7,915,062
(67.02 %)
140,374
(3.90 %)
331 striped catfish (fPanHyp1 alternate hap 2022)
GCA_027382375.1
n/a 15,871
(2.85 %)
42,287
(5.51 %)
n/a 38.96
(100.00 %)
1
(0.00 %)
3,274
(100.00 %)
1,826,752
(37.53 %)
592,022
(6.69 %)
4,899,884
(32.33 %)
17,357
(1.25 %)
332 striped catfish (primary hap 2022 refseq)
GCF_027358585.1
53,860
(11.99 %)
16,033
(2.86 %)
41,619
(5.48 %)
n/a 38.99
(99.49 %)
236
(0.51 %)
58
(100.00 %)
1,870,234
(37.80 %)
605,570
(6.82 %)
5,059,429
(32.43 %)
17,919
(1.29 %)
333 striped catfish Indonesia
GCF_009078355.1
50,044
(9.61 %)
15,665
(2.76 %)
41,398
(5.35 %)
n/a 38.86
(99.98 %)
463
(0.02 %)
150
(100.00 %)
777,186
(5.69 %)
603,962
(6.24 %)
5,141,987
(32.41 %)
17,264
(1.20 %)
334 striped catfish Vietnam
GCF_003671635.1
40,992
(9.44 %)
15,295
(2.91 %)
20,865
(5.31 %)
n/a 38.71
(97.32 %)
23,755
(2.69 %)
567
(100.00 %)
693,498
(4.75 %)
489,286
(3.69 %)
4,849,313
(30.04 %)
15,076
(0.95 %)
335 striped sea-bass
GCF_004916995.1
32,103
(10.78 %)
14,422
(3.07 %)
38,188
(6.41 %)
n/a 40.19
(99.19 %)
73,335
(0.86 %)
630
(100.00 %)
365,581
(2.59 %)
142,967
(0.99 %)
4,151,813
(22.73 %)
13,730
(0.95 %)
336 Sumatra barb
GCF_018831695.1
54,947
(11.16 %)
18,745
(3.98 %)
49,520
(6.36 %)
n/a 38.24
(99.95 %)
5,075
(0.05 %)
1,122
(100.00 %)
638,783
(6.33 %)
357,159
(7.71 %)
4,520,846
(32.46 %)
46,339
(3.96 %)
337 swamp eel
GCF_001952655.1
43,831
(10.64 %)
14,741
(2.98 %)
20,099
(5.80 %)
n/a 40.90
(92.01 %)
51,257
(8.01 %)
71,879
(91.99 %)
266,195
(1.84 %)
95,726
(1.16 %)
3,596,747
(21.95 %)
7,065
(0.42 %)
338 swordfish
GCF_016859285.1
47,986
(9.92 %)
15,208
(2.84 %)
42,556
(5.91 %)
n/a 40.69
(99.97 %)
449
(0.03 %)
1,482
(100.00 %)
484,543
(3.59 %)
230,762
(3.41 %)
4,496,150
(23.94 %)
27,129
(2.10 %)
339 tambaqui
GCF_904425465.1
46,601
(6.55 %)
17,150
(1.88 %)
50,327
(4.03 %)
n/a 39.33
(100.00 %)
420
(0.00 %)
1,269
(100.00 %)
753,112
(4.00 %)
676,948
(5.71 %)
8,317,676
(35.32 %)
25,784
(0.92 %)
340 thickback sole (primary hap 2023)
GCA_963457635.1
n/a 14,720
(2.58 %)
45,918
(6.44 %)
n/a 40.37
(99.99 %)
454
(0.01 %)
188
(100.00 %)
1,242,704
(17.37 %)
518,293
(15.23 %)
3,986,694
(40.18 %)
51,441
(3.53 %)
341 thicklip grey mullet (primary hap 2023)
GCA_963514085.1
n/a 15,347
(2.73 %)
50,294
(7.25 %)
n/a 42.30
(99.98 %)
610
(0.02 %)
393
(100.00 %)
1,157,324
(26.70 %)
229,196
(4.33 %)
3,694,790
(27.54 %)
38,929
(2.20 %)
342 three-spined stickleback
GCF_016920845.1
50,181
(16.09 %)
14,935
(3.99 %)
53,773
(9.96 %)
n/a 44.66
(99.24 %)
3,125
(0.76 %)
2,937
(100.00 %)
368,987
(9.09 %)
160,564
(2.89 %)
2,308,841
(21.91 %)
80,336
(11.49 %)
343 tidewater goby (DKJ021-1_F 2022)
GCA_026437355.1
n/a 13,912
(1.87 %)
62,727
(6.28 %)
n/a 42.90
(99.99 %)
894
(0.01 %)
755
(100.00 %)
1,981,480
(37.86 %)
652,950
(27.50 %)
3,680,829
(47.75 %)
96,414
(8.01 %)
344 tidewater goby (DKJ021-1_F 2022)
GCA_026437365.1
n/a 14,276
(1.78 %)
66,576
(6.32 %)
n/a 42.96
(99.99 %)
794
(0.01 %)
820
(100.00 %)
2,127,818
(38.86 %)
708,255
(30.28 %)
3,809,452
(49.66 %)
101,682
(8.04 %)
345 tiger tail seahorse (QL1 v2 2016)
GCF_001891065.2
47,024
(13.33 %)
13,806
(3.76 %)
52,367
(8.81 %)
n/a 43.30
(93.08 %)
22,977
(6.92 %)
55,891
(93.08 %)
356,857
(3.66 %)
155,338
(3.36 %)
2,806,278
(24.56 %)
61,010
(7.71 %)
346 tongue sole
GCF_000523025.1
45,186
(16.40 %)
14,186
(3.98 %)
20,816
(8.22 %)
n/a 40.82
(94.88 %)
33,269
(5.14 %)
62,912
(94.86 %)
423,833
(4.34 %)
235,739
(3.33 %)
3,085,031
(24.78 %)
17,094
(1.42 %)
347 torafugu (alternate hap 2019)
GCA_901000745.3
n/a 13,635
(4.82 %)
48,723
(11.83 %)
n/a 45.60
(99.82 %)
38
(0.18 %)
2,012
(100.00 %)
249,793
(9.32 %)
151,193
(4.49 %)
1,577,144
(20.25 %)
46,936
(9.72 %)
348 torafugu (fTakRub1.2 2019 refseq)
GCF_901000725.2
53,479
(18.31 %)
14,527
(4.79 %)
28,597
(10.65 %)
55,587
(14.38 %)
45.67
(99.04 %)
402
(0.96 %)
128
(100.00 %)
281,011
(10.36 %)
178,921
(5.32 %)
1,642,756
(20.86 %)
49,975
(9.63 %)
349 torafugu (fTakRub1.3 2021 genbank)
GCA_901000725.3
n/a 14,527
(4.79 %)
51,181
(11.72 %)
n/a 45.67
(99.04 %)
402
(0.96 %)
128
(100.00 %)
325,077
(14.03 %)
178,921
(5.32 %)
1,642,754
(20.86 %)
49,975
(9.63 %)
350 trahira (hap1 2023)
GCA_029633855.1
n/a 16,039
(2.06 %)
44,287
(4.38 %)
n/a 40.99
(92.91 %)
867
(7.09 %)
597
(100.00 %)
2,228,831
(30.95 %)
687,495
(13.85 %)
5,309,097
(36.70 %)
27,070
(2.09 %)
351 trahira (hap2 2023)
GCA_029633875.1
n/a 16,216
(2.00 %)
45,209
(4.32 %)
n/a 41.03
(96.02 %)
907
(3.98 %)
452
(100.00 %)
2,280,303
(30.80 %)
708,327
(15.59 %)
5,394,248
(39.01 %)
28,386
(2.18 %)
352 turbot (primary hap 2023)
GCA_963854745.1
n/a 14,816
(3.44 %)
49,680
(8.16 %)
n/a 43.40
(99.97 %)
805
(0.03 %)
108
(100.00 %)
808,348
(19.20 %)
301,230
(7.15 %)
3,267,772
(25.91 %)
66,132
(6.90 %)
353 turbot (ysfricsl-2021 2022)
GCF_022379125.1
57,285
(14.93 %)
14,887
(3.52 %)
49,403
(8.32 %)
87,351
(14.65 %)
43.54
(100.00 %)
n/a 28
(100.00 %)
455,017
(0.00 %)
297,185
(5.03 %)
3,312,612
(24.33 %)
65,633
(7.08 %)
354 turquoise killifish (GRZ 2015)
GCF_001465895.1
40,373
(7.85 %)
14,339
(2.08 %)
84,906
(20.47 %)
57,218
(6.01 %)
42.51
(68.98 %)
85,562
(31.04 %)
68,911
(68.97 %)
392,114
(2.78 %)
307,607
(2.09 %)
4,777,941
(27.62 %)
61,105
(2.15 %)
355 turquoise killifish (MZM-0403 2023)
GCF_027789165.1
54,488
(6.75 %)
14,227
(1.27 %)
69,161
(4.33 %)
n/a 44.33
(93.22 %)
3,093
(6.78 %)
2,681
(100.00 %)
2,760,581
(47.64 %)
635,213
(25.56 %)
4,136,925
(56.55 %)
110,696
(10.50 %)
356 walking catfish (CIFAMagur01 2020)
GCA_013621035.1
n/a 15,895
(2.18 %)
46,934
(4.73 %)
n/a 39.83
(99.95 %)
605
(0.05 %)
3,484
(100.00 %)
1,061,538
(6.25 %)
611,618
(5.19 %)
5,978,835
(37.11 %)
54,666
(3.50 %)
357 walleye pollock (NIFS_2021 2022)
GCF_026213295.1
49,084
(12.15 %)
14,241
(2.71 %)
70,653
(9.29 %)
n/a 45.59
(99.96 %)
2,816
(0.04 %)
168
(100.00 %)
1,274,742
(38.63 %)
797,757
(14.11 %)
2,725,416
(34.38 %)
95,149
(8.09 %)
358 warty frogfish (fAntMac1 alternate hap 2020)
GCA_013347815.1
n/a 14,197
(3.33 %)
44,782
(7.70 %)
n/a 41.82
(100.00 %)
n/a 2,294
(100.00 %)
396,279
(4.74 %)
275,154
(5.76 %)
2,933,132
(29.41 %)
35,104
(4.08 %)
359 warty frogfish (fAntMac1 primary hap 2020)
GCA_013358685.1
n/a 14,494
(3.34 %)
45,310
(7.77 %)
n/a 41.86
(99.87 %)
219
(0.13 %)
155
(100.00 %)
413,753
(4.95 %)
290,313
(6.11 %)
3,010,996
(29.71 %)
36,840
(4.18 %)
360 western mosquitofish
GCF_019740435.1
54,029
(12.31 %)
14,667
(2.80 %)
44,358
(6.62 %)
n/a 38.94
(97.42 %)
181
(2.58 %)
37
(100.00 %)
348,476
(2.56 %)
158,728
(2.21 %)
4,604,959
(26.85 %)
30,624
(1.94 %)
361 western speckled dace (OS25496 2023)
GCF_029890125.1
46,203
(5.36 %)
16,945
(2.57 %)
65,343
(6.35 %)
n/a 39.74
(100.00 %)
n/a 930
(100.00 %)
2,528,154
(48.24 %)
549,447
(8.24 %)
5,157,802
(41.42 %)
84,874
(6.05 %)
362 White Sands pupfish
GCF_016077235.1
46,084
(6.27 %)
14,817
(1.71 %)
52,055
(4.88 %)
n/a 39.01
(100.00 %)
n/a 2,003
(100.00 %)
489,894
(2.67 %)
304,277
(3.91 %)
6,371,712
(38.05 %)
41,820
(1.75 %)
363 wolf-eel
GCF_004355925.1
43,625
(14.00 %)
14,930
(3.24 %)
31,372
(7.30 %)
n/a 42.10
(92.86 %)
23,891
(7.15 %)
33,400
(92.85 %)
379,343
(3.26 %)
244,853
(2.39 %)
3,432,622
(22.07 %)
30,581
(2.04 %)
364 woolly sculpin (alternate hap CAN_PGR_092001 2022)
GCA_023055415.1
n/a 14,753
(3.49 %)
49,516
(8.47 %)
n/a 43.00
(100.00 %)
222
(0.00 %)
171
(100.00 %)
458,382
(5.18 %)
420,718
(8.01 %)
3,146,054
(25.71 %)
69,817
(7.20 %)
365 woolly sculpin (CAN_PGR_092001 2022)
GCA_023055335.1
n/a 14,847
(3.48 %)
50,136
(8.43 %)
n/a 42.99
(100.00 %)
219
(0.00 %)
443
(100.00 %)
461,903
(5.20 %)
422,251
(8.03 %)
3,180,804
(25.81 %)
70,183
(7.15 %)
366 worm pipefish (RoL_2023-P1 2023)
GCF_033978685.1
73,681
(3.43 %)
25,892
(1.02 %)
114,154
(3.30 %)
n/a 39.45
(100.00 %)
146
(0.00 %)
630
(100.00 %)
4,795,312
(24.37 %)
2,093,730
(16.74 %)
13,132,465
(67.32 %)
248,526
(4.59 %)
367 Wuchang bream
GCF_018812025.1
68,768
(8.86 %)
18,247
(2.62 %)
57,323
(5.24 %)
n/a 37.64
(99.83 %)
1,281
(0.17 %)
243
(100.00 %)
801,110
(0.00 %)
559,399
(5.04 %)
6,340,567
(43.09 %)
45,067
(2.52 %)
368 Yangtze koukloug (SWU-2019 2020)
GCF_012432095.1
63,925
(10.50 %)
17,502
(3.25 %)
52,519
(5.86 %)
n/a 37.23
(99.62 %)
617
(0.38 %)
353
(100.00 %)
2,297,102
(50.34 %)
368,423
(3.28 %)
5,171,389
(38.98 %)
32,824
(2.00 %)
369 yellow catfish (hzauxx_2018 2022)
GCF_022655615.1
64,819
(11.15 %)
15,680
(2.87 %)
41,108
(5.68 %)
n/a 39.49
(99.94 %)
817
(0.06 %)
517
(100.00 %)
839,496
(9.42 %)
756,396
(11.12 %)
4,051,149
(35.45 %)
24,342
(1.72 %)
370 yellow catfish (Tf-2017 2018)
GCF_003724035.1
54,374
(10.66 %)
15,584
(2.85 %)
22,598
(5.58 %)
n/a 39.55
(99.11 %)
1,760
(0.89 %)
663
(100.00 %)
883,218
(10.65 %)
797,020
(11.09 %)
4,092,065
(35.46 %)
24,238
(1.72 %)
371 yellow perch (YP-PL-M2 2019)
GCF_004354835.1
47,108
(7.77 %)
15,458
(2.26 %)
28,572
(5.62 %)
n/a 40.84
(99.95 %)
831
(0.05 %)
268
(100.00 %)
620,402
(4.92 %)
540,302
(7.26 %)
4,770,842
(35.92 %)
35,251
(1.63 %)
372 yellowfin seabream (v.2019 alternate hap 2020)
GCA_904848175.1
n/a 814
(1.87 %)
3,814
(6.84 %)
n/a 42.36
(99.98 %)
80
(0.02 %)
349
(100.00 %)
38,000
(5.03 %)
29,516
(7.35 %)
232,988
(20.37 %)
2,289
(2.07 %)
373 yellowfin seabream (v.2019 primary hap 2020)
GCF_904848185.1
63,974
(13.26 %)
15,178
(2.82 %)
46,332
(6.73 %)
84,160
(11.62 %)
42.09
(100.00 %)
149
(0.00 %)
66
(100.00 %)
499,939
(3.43 %)
254,361
(2.64 %)
4,420,217
(22.81 %)
31,005
(1.79 %)
374 yellowfin tuna (alternate hap 2021)
GCA_914744365.1
n/a 15,959
(2.63 %)
43,025
(5.73 %)
n/a 39.71
(100.00 %)
n/a 640
(100.00 %)
1,427,221
(28.44 %)
257,108
(3.15 %)
5,197,531
(26.91 %)
13,909
(0.83 %)
375 yellowfin tuna (primary hap 2021)
GCF_914725855.1
57,835
(11.36 %)
15,616
(2.53 %)
42,750
(5.72 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
70
(0.00 %)
68
(100.00 %)
569,665
(3.53 %)
259,656
(3.34 %)
5,175,692
(27.05 %)
14,420
(0.88 %)
376 yellowtail amberjack (v2 SW California HSWRI2012SDOR001 2017)
GCF_002814215.2
40,935
(9.94 %)
15,673
(2.75 %)
53,235
(6.33 %)
n/a 40.72
(97.79 %)
33,661
(2.21 %)
98,345
(100.00 %)
1,337,427
(24.48 %)
522,121
(4.83 %)
4,649,096
(25.00 %)
16,819
(0.86 %)
377 Zealand spotty
GCF_009762535.1
45,555
(9.06 %)
14,609
(2.22 %)
43,259
(5.33 %)
60,241
(8.02 %)
40.86
(98.32 %)
1,135
(1.69 %)
467
(100.00 %)
517,755
(4.63 %)
393,328
(5.54 %)
4,522,224
(33.34 %)
18,299
(0.85 %)
378 zebra mbuna
GCF_000238955.4
51,012
(8.37 %)
15,901
(2.10 %)
32,136
(6.12 %)
n/a 41.16
(99.99 %)
641
(0.01 %)
1,690
(100.00 %)
565,771
(6.22 %)
253,037
(2.53 %)
4,679,743
(31.57 %)
36,689
(2.00 %)
379 zebrafish (fDanRer4 alternate hap 2022)
GCA_944039255.1
n/a 6,365
(2.41 %)
16,467
(3.26 %)
n/a 36.72
(100.00 %)
n/a 4,719
(100.00 %)
1,317,027
(59.43 %)
323,062
(10.58 %)
3,014,570
(45.46 %)
14,563
(1.98 %)
380 zebrafish (fDanRer4 primary hap 2022)
GCA_944039275.1
n/a 18,065
(2.46 %)
44,526
(3.30 %)
n/a 37.08
(99.99 %)
381
(0.01 %)
73
(100.00 %)
4,804,769
(44.04 %)
954,645
(10.72 %)
8,694,743
(51.88 %)
44,936
(2.02 %)
381 zebrafish (T5D 2021)
GCA_018400075.1
n/a 17,774
(2.54 %)
44,221
(3.24 %)
n/a 36.52
(99.87 %)
20,876
(0.14 %)
20,901
(99.86 %)
4,138,008
(61.22 %)
894,145
(6.79 %)
9,494,379
(47.68 %)
42,482
(2.03 %)
382 zebrafish (WGS:CAHPTA01 2020)
GCA_903684865.1
n/a 17,535
(2.50 %)
44,169
(3.34 %)
n/a 36.57
(99.99 %)
712
(0.01 %)
1,252
(100.00 %)
3,891,854
(61.07 %)
927,173
(7.78 %)
8,621,517
(50.27 %)
44,554
(2.12 %)
383 zebrafish (WGS:CAHPTB02 2020)
GCA_903684855.2
n/a 17,692
(2.51 %)
43,578
(3.27 %)
n/a 36.56
(99.99 %)
1,352
(0.01 %)
755
(100.00 %)
3,937,397
(60.86 %)
936,258
(7.76 %)
8,732,369
(50.44 %)
44,812
(2.09 %)
384 zebrafish GRCz11
GCF_000002035.6
65,219
(5.63 %)
22,246
(2.54 %)
51,134
(7.13 %)
n/a 36.60
(99.72 %)
20,258
(0.28 %)
34,617
(99.73 %)
4,595,932
(57.92 %)
1,077,677
(6.47 %)
10,772,232
(49.45 %)
53,471
(2.06 %)
385 zig-zag eel (alternate hap)
GCA_900700395.1
n/a 1,204
(2.88 %)
4,065
(7.13 %)
n/a 41.24
(99.99 %)
n/a 1,437
(100.00 %)
26,319
(3.19 %)
14,209
(3.21 %)
211,357
(18.05 %)
1,253
(1.49 %)
386 zig-zag eel (v1.2 2019 refseq)
GCF_900324485.2
44,988
(12.00 %)
15,037
(3.35 %)
40,235
(7.28 %)
60,496
(9.39 %)
40.66
(97.76 %)
238
(2.24 %)
123
(100.00 %)
348,230
(2.87 %)
157,728
(2.01 %)
3,180,025
(23.44 %)
12,807
(1.08 %)
387 zig-zag eel (v1.3 2021 genbank)
GCA_900324485.3
n/a 15,036
(3.35 %)
40,234
(7.28 %)
n/a 40.66
(97.76 %)
238
(2.24 %)
123
(100.00 %)
671,614
(20.98 %)
157,728
(2.01 %)
3,180,040
(23.44 %)
12,807
(1.08 %)
TOTALS:total assembly count 387

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 214 assemblies assembly stats track stats
Mammals 533 assemblies assembly stats track stats
Birds 353 assemblies assembly stats track stats
Fishes 387 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 220 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 698 assemblies assembly stats track stats
Plants 296 assemblies assembly stats track stats
Fungi 648 assemblies assembly stats track stats
Viruses 281 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 96 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 442 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 865 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats