Viral Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of viral only.

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiGene gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 adeno-associated virus 2 (1993)
GCF_000838645.1
14
(89.01 %)
53.80
(99.91 %)
n/a 1
(100.00 %)
8
(3.18 %)
n/a 0
(0.00 %)
1
(54.43 %)
2 Adult diarrheal rotavirus strain J19 (J19 2005)
GCF_000864245.1
11
(95.04 %)
33.42
(99.83 %)
n/a 11
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(0.20 %)
37
(2.83 %)
0
(0.00 %)
3 Aichi virus 1 (A846/88 1998)
GCF_000861885.1
1
(88.50 %)
58.90
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.09 %)
n/a 8
(2.47 %)
1
(81.27 %)
4 Alphapapillomavirus 4 (1991)
GCF_000864945.1
7
(86.62 %)
48.40
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.34 %)
1
(0.50 %)
7
(2.05 %)
0
(0.00 %)
5 Anatid alphaherpesvirus 1 (2085 2023)
GCA_008791745.1
78
(79.40 %)
44.93
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
11
(0.18 %)
13
(1.23 %)
226
(2.34 %)
5
(4.61 %)
6 Argentinian mammarenavirus (XJ13 2003)
GCF_000856545.1
4
(95.69 %)
41.57
(99.95 %)
n/a 2
(100.00 %)
4
(0.24 %)
1
(0.48 %)
2
(0.58 %)
0
(0.00 %)
7 Astrovirus MLB2 (MLB2/human/Stl/WD0559/2008 2012)
GCF_000895575.1
3
(99.13 %)
40.52
(99.93 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(2.01 %)
0
(0.00 %)
8 Astrovirus MLB3 (MLB3/human/Vellore/26564/2004 2012)
GCF_000899535.1
3
(99.15 %)
40.00
(99.93 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 4
(2.19 %)
0
(0.00 %)
9 Astrovirus VA3 (VA3/human/Vellore/28054/2005 2012)
GCF_000901475.1
3
(98.01 %)
41.78
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(0.29 %)
0
(0.00 %)
10 Astrovirus VA4 (VA4/human/Nepal/S5363/2008 2012)
GCF_000897955.1
3
(97.62 %)
42.99
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.11 %)
0
(0.00 %)
11 Australian bat lyssavirus (insectivorous isolate 1999)
GCF_000850325.1
5
(91.79 %)
44.15
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 8
(0.61 %)
0
(0.00 %)
12 Bacillus phage PfNC7401 (2016)
GCA_002611025.1
79
(85.50 %)
36.55
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.12 %)
4
(0.31 %)
121
(3.62 %)
0
(0.00 %)
13 Banna virus strain JKT-6423 (JKT-6423 JKT-6423 2000)
GCF_000858185.1
12
(86.10 %)
39.33
(99.89 %)
n/a 12
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 11
(0.64 %)
0
(0.00 %)
14 Barmah Forest virus (BH2193 1997)
GCF_000847585.1
5
(95.39 %)
48.55
(99.97 %)
2
(0.02 %)
3
(99.98 %)
4
(0.59 %)
n/a 7
(2.47 %)
5
(15.26 %)
15 Bovine herpesvirus type 1.1 (NVSL challenge 97-11 2022)
GCF_008777455.1
75
(84.84 %)
72.42
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
n/a 116
(4.31 %)
1,304
(33.41 %)
1
(99.99 %)
16 Bunyamwera virus (1991)
GCF_000849925.1
4
(95.34 %)
35.16
(99.97 %)
n/a 3
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 30
(3.12 %)
0
(0.00 %)
17 Cercopithecine alphaherpesvirus 2 (B264 2004)
GCF_000846965.1
80
(78.07 %)
75.97
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
169
(6.25 %)
180
(5.92 %)
1,059
(33.71 %)
1
(100.00 %)
18 Chandipura virus (CIN 0451 2013)
GCF_000906815.1
5
(96.34 %)
42.53
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.29 %)
n/a 19
(1.75 %)
0
(0.00 %)
19 Chikungunya virus (S27-African prototype 2002)
GCF_000854045.1
2
(94.47 %)
50.04
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.87 %)
n/a 3
(1.76 %)
7
(34.06 %)
20 Cosavirus A (HCoSV-A1 0553 2009)
GCF_000885595.1
1
(83.53 %)
43.75
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.63 %)
n/a 5
(1.90 %)
0
(0.00 %)
21 Cowpox virus (Brighton Red 2002)
GCF_000839185.1
233
(91.92 %)
33.40
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
41
(0.80 %)
64
(2.52 %)
1,041
(9.40 %)
0
(0.00 %)
22 Crimean-Congo hemorrhagic fever orthonairovirus (IbAr10200 2003)
GCF_000854165.1
3
(95.80 %)
42.23
(99.97 %)
n/a 3
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(0.22 %)
26
(1.53 %)
0
(0.00 %)
23 Dengue virus 1 (clone 45AZ5 Nauru Island 1997)
GCF_000862125.1
1
(94.82 %)
46.67
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.68 %)
0
(0.00 %)
24 Dengue virus 2 (16681/84 Thailand 1993)
GCF_000871845.1
5
(98.86 %)
45.82
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.27 %)
n/a 2
(0.16 %)
0
(0.00 %)
25 Dengue virus 3 (D3/H/IMTSSA-SRI/2000/1266 Sri Lanka 2007)
GCF_000866625.1
5
(98.92 %)
46.71
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.60 %)
0
(0.00 %)
26 Dengue virus 4 (clone rDEN4 2001)
GCF_000865065.1
4
(98.81 %)
47.13
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.27 %)
0
(0.00 %)
27 Dhori thogotovirus (Dhori/1313/61 2017)
GCF_002116195.1
6
(95.15 %)
45.84
(99.90 %)
n/a 6
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 12
(1.33 %)
0
(0.00 %)
28 Dugbe orthonairovirus (ArD44313 1995)
GCF_000850985.1
3
(96.61 %)
40.19
(99.98 %)
n/a 3
(100.00 %)
4
(0.27 %)
n/a 41
(3.15 %)
0
(0.00 %)
29 Duvenhage lyssavirus (86132SA 2013)
GCF_000905375.1
5
(90.59 %)
44.22
(99.99 %)
1
(0.01 %)
2
(99.99 %)
3
(0.00 %)
n/a 7
(0.72 %)
0
(0.00 %)
30 Eastern chimpanzee simian foamy virus (2018)
GCF_003032765.1
5
(93.39 %)
37.99
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.77 %)
n/a 8
(0.77 %)
0
(0.00 %)
31 Eastern equine encephalitis virus (ssp. North American variant 1991)
GCF_000862705.1
5
(96.00 %)
48.71
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
7
(0.91 %)
n/a 3
(0.64 %)
5
(23.55 %)
32 Ectromelia virus (Moscow 2002)
GCF_000841905.1
173
(80.43 %)
33.18
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
45
(0.96 %)
22
(1.55 %)
1,122
(9.40 %)
0
(0.00 %)
33 Encephalomyocarditis virus (Ruckert 1993)
GCF_000862985.1
3
(87.80 %)
49.47
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(1.68 %)
1
(1.68 %)
2
(1.83 %)
0
(0.00 %)
34 Enterovirus A (1994)
GCF_000861905.1
1
(88.79 %)
47.94
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.09 %)
1
(3.32 %)
35 Enterovirus C (human poliovirus 1 Mahoney 1982)
GCF_000861165.1
5
(98.35 %)
46.34
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.40 %)
1
(6.95 %)
36 Enterovirus D (Enterovirus 70 1993)
GCF_000861205.1
1
(89.14 %)
42.80
(100.00 %)
3
(0.04 %)
4
(99.96 %)
3
(0.00 %)
n/a 0
(0.00 %)
0
(0.00 %)
37 Epstein-Barr virus (Raji 2005)
GCF_002402265.1
98
(77.44 %)
59.50
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
30
(0.66 %)
34
(5.62 %)
577
(10.56 %)
27
(45.97 %)
38 Epstein-Barr virus type 2 (AG876 2007)
GCF_000872045.1
114
(68.90 %)
59.54
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
34
(0.79 %)
29
(5.78 %)
498
(10.10 %)
24
(45.98 %)
39 Equine herpesvirus 1 (Ab4 1993)
GCA_000844025.1
81
(83.51 %)
56.66
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
23
(0.73 %)
28
(3.15 %)
306
(5.68 %)
2
(99.10 %)
40 Escherichia phage Lambda (2000)
GCF_000840245.1
92
(95.32 %)
49.86
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.20 %)
n/a 36
(0.81 %)
4
(51.36 %)
41 European bat 1 lyssavirus (RV9; 9395GER 2007)
GCF_000870765.1
5
(90.43 %)
44.65
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 13
(1.08 %)
0
(0.00 %)
42 Gallid alphaherpesvirus 1 (SA-2 1999)
GCA_000847005.2
90
(80.77 %)
47.74
(99.98 %)
n/a 14
(100.00 %)
11
(0.22 %)
9
(0.61 %)
221
(1.97 %)
23
(30.48 %)
43 Gallid alphaherpesvirus 3 (HPRS24 2000)
GCF_000838845.1
78
(74.47 %)
53.61
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
47
(1.57 %)
60
(2.83 %)
387
(6.28 %)
1
(99.49 %)
44 GB virus C (1996)
GCF_000862005.1
1
(91.81 %)
59.09
(99.98 %)
1
(0.01 %)
2
(99.99 %)
3
(0.00 %)
n/a 15
(1.67 %)
2
(82.30 %)
45 Goatpox virus (Pellor 2002)
GCF_000840165.1
150
(93.15 %)
25.31
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
51
(1.59 %)
8
(0.24 %)
1,548
(24.38 %)
0
(0.00 %)
46 Hantaan orthohantavirus (76-118 2003)
GCF_000856085.1
3
(94.17 %)
38.56
(99.96 %)
n/a 3
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 9
(0.78 %)
0
(0.00 %)
47 Hendra henipavirus (1998)
GCF_000852685.1
9
(82.12 %)
39.43
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.38 %)
n/a 13
(0.75 %)
0
(0.00 %)
48 Hepatitis B virus (2015)
GCF_000861825.2
4
(55.31 %)
48.46
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 0
(0.00 %)
1
(12.45 %)
49 Hepatitis C virus genotype 1 (H77 1997)
GCF_000861845.1
3
(93.68 %)
58.24
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.33 %)
6
(1.40 %)
13
(2.88 %)
1
(90.43 %)
50 Hepatitis delta virus (1993)
GCF_000856565.1
2
(38.35 %)
58.81
(99.88 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(2.68 %)
1
(3.63 %)
1
(71.11 %)
51 Hepatovirus A (1993)
GCF_000860505.1
3
(100.00 %)
37.87
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.45 %)
1
(0.47 %)
1
(0.53 %)
0
(0.00 %)
52 Herpes simplex virus type 1 (17 1990)
GCF_000859985.2
81
(86.40 %)
68.30
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
81
(2.72 %)
51
(2.90 %)
932
(18.12 %)
1
(100.00 %)
53 human adenovirus 1 (2004)
GCF_000858645.1
44
(91.94 %)
55.26
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
12
(0.98 %)
2
(0.11 %)
103
(4.79 %)
6
(70.17 %)
54 human adenovirus 2 (2004)
GCF_000859465.1
42
(90.84 %)
55.20
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
13
(0.89 %)
1
(0.12 %)
105
(4.66 %)
5
(70.08 %)
55 human adenovirus 35 (2004)
GCF_000857885.1
44
(93.67 %)
48.88
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
8
(0.68 %)
3
(0.30 %)
80
(3.56 %)
6
(39.41 %)
56 human adenovirus 5 (2004)
GCF_000857865.1
42
(90.68 %)
55.20
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
12
(0.95 %)
n/a 99
(4.47 %)
5
(69.88 %)
57 human adenovirus 54 (Kobe-H 2009)
GCF_000885675.1
40
(91.15 %)
54.91
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
9
(0.74 %)
n/a 65
(2.61 %)
3
(66.98 %)
58 human adenovirus 7 (2004)
GCF_000859485.1
45
(92.24 %)
51.27
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
9
(0.56 %)
1
(1.54 %)
61
(2.28 %)
7
(43.72 %)
59 human alphaherpesvirus 2 (HG52 2013)
GCF_000858385.2
86
(83.37 %)
70.38
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
124
(3.80 %)
64
(3.26 %)
1,158
(23.65 %)
1
(99.99 %)
60 human associated cyclovirus 10 (7078A 2014)
GCF_000918035.2
2
(86.20 %)
43.41
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 0
(0.00 %)
0
(0.00 %)
61 human associated gemyvongvirus 1 (DB1 2015)
GCF_001448435.1
4
(89.04 %)
51.81
(99.91 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(1.89 %)
1
(1.89 %)
1
(2.24 %)
1
(97.10 %)
62 human associated huchismacovirus 1 (Oregon/6/2011/GottageGrove/5A1 2018)
GCF_003033475.1
2
(69.15 %)
42.76
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 0
(0.00 %)
0
(0.00 %)
63 human associated huchismacovirus 2 (France/8/2008/2444 2018)
GCF_003033485.1
2
(69.81 %)
43.97
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(1.38 %)
2
(0.57 %)
0
(0.00 %)
64 human associated huchismacovirus 3 (France/1/2009/3664 2018)
GCF_003033495.1
2
(70.27 %)
42.28
(99.84 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 5
(1.79 %)
0
(0.00 %)
65 human associated porprismacovirus 2 (SF2 2015)
GCF_000931315.1
2
(74.85 %)
48.83
(99.84 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(0.55 %)
1
(41.76 %)
66 human astrovirus (1993)
GCF_000861865.1
3
(97.58 %)
44.83
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.88 %)
1
(1.34 %)
9
(2.08 %)
0
(0.00 %)
67 human astrovirus BF34 (BF34 2014)
GCF_000923215.1
4
(97.29 %)
43.77
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.47 %)
0
(0.00 %)
68 human betaherpesvirus 5 (Merlin 2004)
GCF_000845245.1
194
(84.91 %)
57.48
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
74
(1.33 %)
28
(0.67 %)
1,047
(7.96 %)
1
(99.99 %)
69 human betaherpesvirus 6A (U1102 1995 refseq)
GCF_000845685.2
115
(79.56 %)
42.44
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
33
(1.67 %)
36
(4.27 %)
603
(9.83 %)
3
(13.72 %)
70 human betaherpesvirus 6B (Z29 1999)
GCF_000846365.1
128
(82.45 %)
42.77
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
27
(1.57 %)
20
(3.84 %)
652
(8.84 %)
6
(15.35 %)
71 human betaherpesvirus 7 (RK 1995)
GCF_000848125.1
111
(79.51 %)
36.22
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
16
(1.65 %)
34
(8.04 %)
791
(15.85 %)
3
(5.14 %)
72 human bocavirus 2c PK (PK-5510 2009)
GCF_000882675.1
4
(87.74 %)
41.59
(99.98 %)
1
(0.02 %)
2
(99.98 %)
5
(1.23 %)
n/a 5
(0.98 %)
0
(0.00 %)
73 human bocavirus 3 (W471 2009)
GCF_000882855.1
4
(88.44 %)
42.16
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 5
(1.95 %)
1
(4.96 %)
74 human bocavirus 4 NI (HBoV4-NI-385 2009)
GCF_000886375.1
6
(92.83 %)
40.41
(99.92 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 5
(1.06 %)
0
(0.00 %)
75 human circovirus VS6600022 (VS6600022 2014)
GCF_000924015.1
4
(85.08 %)
47.13
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.85 %)
n/a 1
(0.25 %)
2
(49.61 %)
76 human coronavirus 229E (2001)
GCF_000853505.1
9
(97.14 %)
38.26
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.31 %)
2
(0.29 %)
57
(2.91 %)
0
(0.00 %)
77 human coronavirus HKU1 (HKU1 2004)
GCF_000858765.1
10
(98.07 %)
32.06
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
8
(0.72 %)
1
(1.60 %)
89
(5.62 %)
0
(0.00 %)
78 human coronavirus NL63 (Amsterdam I 2004)
GCF_000853865.1
8
(97.86 %)
34.46
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
9
(1.09 %)
n/a 84
(5.24 %)
0
(0.00 %)
79 human coronavirus OC43 (ATCC VR-759 2019)
GCF_003972325.1
11
(97.82 %)
36.79
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(0.43 %)
1
(0.09 %)
90
(3.88 %)
0
(0.00 %)
80 human cosavirus (Cosavirus_Amsterdam_1994 2014)
GCF_000920655.1
1
(81.59 %)
43.53
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 12
(1.59 %)
0
(0.00 %)
81 human cosavirus B (HCoSV-B1 2263 2009)
GCF_000884955.1
1
(88.49 %)
43.79
(100.00 %)
1
(0.01 %)
2
(99.99 %)
4
(0.47 %)
n/a 6
(1.35 %)
0
(0.00 %)
82 human cyclovirus VS5700009 (VS5700009 2013)
GCF_000908835.1
3
(84.17 %)
46.45
(99.89 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.38 %)
1
(13.92 %)
83 human DNA virus (IND-KIs-REVA-1990 2019)
GCF_003727435.1
1
(6.26 %)
53.36
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(1.89 %)
n/a 3
(0.59 %)
1
(93.16 %)
84 human endogenous retrovirus K113 (2013)
GCF_000913595.1
1
(22.17 %)
41.86
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(1.60 %)
n/a 14
(2.49 %)
0
(0.00 %)
85 human erythrovirus V9 (V9 2001)
GCF_000841965.1
6
(90.67 %)
42.09
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 9
(1.75 %)
0
(0.00 %)
86 human fecal virus Jorvi2 (Jorvi2 2017)
GCF_002219885.1
5
(72.08 %)
31.11
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
7
(5.43 %)
n/a 20
(11.11 %)
0
(0.00 %)
87 human fecal virus Jorvi3 (Jorvi3 2017)
GCF_002219525.1
2
(84.04 %)
32.53
(99.90 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(1.60 %)
0
(0.00 %)
88 human fecal virus Jorvi4 (Jorvi4 2017)
GCF_002219705.1
2
(81.18 %)
45.77
(99.87 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.34 %)
0
(0.00 %)
89 human feces pecovirus (PeCV-NI 2019)
GCF_003726995.1
2
(72.77 %)
50.00
(99.90 %)
1
(0.03 %)
2
(99.97 %)
5
(2.46 %)
n/a 0
(0.00 %)
1
(55.12 %)
90 human feces smacovirus 2 (SmaCV2 2018)
GCF_003033575.1
2
(74.86 %)
46.00
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(0.54 %)
1
(19.22 %)
91 human feces smacovirus 3 (SmaCV3.21 P21 2017)
GCF_002271185.1
2
(72.89 %)
46.99
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(2.66 %)
1
(1.56 %)
4
(1.25 %)
0
(0.00 %)
92 human gammaherpesvirus 8 (GK18 2007)
GCF_000838265.1
113
(85.53 %)
53.76
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
10
(0.18 %)
29
(2.88 %)
151
(3.93 %)
9
(84.42 %)
93 human gammaherpesvirus 8 (JSC-1 2009)
GCA_027939395.1
102
(83.23 %)
53.77
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
11
(1.00 %)
29
(3.04 %)
198
(4.58 %)
9
(84.78 %)
94 human gemycircularvirus GeTz1 (GeTz1 2018)
GCF_002826025.1
4
(77.38 %)
49.05
(99.91 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(1.23 %)
0
(0.00 %)
95 human genital-associated circular DNA virus-1 (349 2015)
GCF_000973295.1
4
(80.18 %)
54.85
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(1.21 %)
1
(91.86 %)
96 human hepegivirus (AK-790 2018)
GCF_002821385.1
1
(96.18 %)
53.60
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 5
(0.51 %)
2
(88.97 %)
97 human immunodeficiency virus 1 (1998)
GCF_000864765.1
14
(93.78 %)
42.11
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.57 %)
1
(0.34 %)
18
(3.29 %)
1
(2.29 %)
98 human immunodeficiency virus 2 (BEN 1993)
GCF_000856385.1
12
(84.81 %)
45.66
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(0.98 %)
10
(1.44 %)
0
(0.00 %)
99 human lung-associated vientovirus FB (2021)
GCF_013088445.1
3
(86.49 %)
33.94
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(1.15 %)
1
(1.34 %)
3
(6.81 %)
0
(0.00 %)
100 human mastadenovirus A (2004)
GCF_000884295.1
41
(94.00 %)
46.52
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
8
(0.61 %)
n/a 73
(3.33 %)
6
(30.52 %)
101 human mastadenovirus A (Huie 1993)
GCF_000846805.1
43
(94.41 %)
46.52
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
8
(0.61 %)
n/a 73
(3.33 %)
6
(30.52 %)
102 human mastadenovirus B (GB 2008)
GCF_000880515.1
48
(93.42 %)
51.05
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
7
(0.47 %)
1
(0.18 %)
41
(1.61 %)
7
(43.26 %)
103 human mastadenovirus B (Slobitski 2008)
GCF_000857085.1
46
(93.74 %)
48.88
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
10
(0.82 %)
3
(0.30 %)
50
(2.47 %)
6
(39.41 %)
104 human mastadenovirus C (1993)
GCF_000845085.1
63
(97.51 %)
55.20
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
13
(0.89 %)
1
(0.12 %)
105
(4.66 %)
5
(70.08 %)
105 human mastadenovirus D (2004)
GCF_000858625.1
21
(47.83 %)
56.58
(100.00 %)
4
(0.01 %)
5
(99.99 %)
12
(1.24 %)
n/a 61
(3.14 %)
3
(66.84 %)
106 human mastadenovirus D (Hicks; NIAID V-209-003-014 2008)
GCF_000845985.1
47
(93.93 %)
57.10
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
10
(0.92 %)
1
(0.13 %)
59
(2.95 %)
3
(67.41 %)
107 human mastadenovirus E (vaccine (CL 68578) 2001)
GCF_000859665.1
40
(96.48 %)
57.67
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
9
(0.65 %)
n/a 107
(4.08 %)
5
(73.25 %)
108 human mastadenovirus F (Dugan 1993)
GCF_000846685.1
44
(94.91 %)
51.22
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(0.32 %)
n/a 63
(2.23 %)
1
(62.53 %)
109 human metapneumovirus (00-1 2018)
GCF_002815375.1
9
(93.36 %)
36.29
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
7
(1.38 %)
1
(0.34 %)
27
(3.46 %)
0
(0.00 %)
110 human orthopneumovirus (2018)
GCF_002815475.1
12
(97.34 %)
33.24
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.64 %)
1
(0.24 %)
19
(3.32 %)
0
(0.00 %)
111 human orthopneumovirus (B1 1997)
GCF_000855545.1
10
(97.35 %)
33.56
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
11
(1.61 %)
2
(0.52 %)
16
(3.21 %)
0
(0.00 %)
112 human orthorubulavirus 2 (1991)
GCF_000863525.1
8
(98.61 %)
38.41
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.38 %)
n/a 6
(0.27 %)
0
(0.00 %)
113 human papillomavirus (SE379 2015)
GCF_001274345.1
6
(93.54 %)
37.49
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.98 %)
1
(2.70 %)
21
(3.02 %)
0
(0.00 %)
114 human papillomavirus 103 (Qv33725 2006)
GCF_000868225.1
6
(88.01 %)
41.58
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.45 %)
n/a 19
(3.06 %)
0
(0.00 %)
115 human papillomavirus 108 (2009)
GCF_000883655.1
5
(88.56 %)
42.65
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 9
(1.38 %)
0
(0.00 %)
116 human papillomavirus 109 (2009)
GCF_000883695.1
7
(92.87 %)
38.28
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.94 %)
1
(0.48 %)
19
(3.13 %)
1
(3.23 %)
117 human papillomavirus 116 (HPV116 2009)
GCF_000884175.1
7
(93.82 %)
38.50
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.40 %)
1
(4.73 %)
118 human papillomavirus 121 (NJ3301 2010)
GCF_000889075.1
7
(92.45 %)
37.74
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.41 %)
n/a 9
(0.98 %)
0
(0.00 %)
119 human papillomavirus 126 (HPV126 2011)
GCF_000896435.1
7
(91.96 %)
38.05
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 18
(2.68 %)
1
(2.92 %)
120 human papillomavirus 127 (R3a 2010)
GCF_000890115.1
8
(93.50 %)
36.98
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
2
(0.79 %)
18
(2.79 %)
1
(3.20 %)
121 human papillomavirus 132 (27-50 2011)
GCF_000888015.1
7
(93.36 %)
37.94
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 12
(1.89 %)
0
(0.00 %)
122 human papillomavirus 134 (39-65 2011)
GCF_000889695.1
7
(92.69 %)
38.14
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 10
(1.48 %)
0
(0.00 %)
123 human papillomavirus 135 (NJ3500 2012)
GCF_000898235.1
7
(92.24 %)
36.86
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.56 %)
1
(0.67 %)
14
(2.77 %)
0
(0.00 %)
124 human papillomavirus 136 (CL3865 2012)
GCF_000899695.1
7
(91.83 %)
38.51
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.85 %)
n/a 19
(3.31 %)
0
(0.00 %)
125 human papillomavirus 140 (NJ2801C1 2012)
GCF_000898855.1
7
(91.69 %)
39.71
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.79 %)
n/a 4
(1.28 %)
0
(0.00 %)
126 human papillomavirus 154 (PV77 2013)
GCF_000908695.1
7
(92.75 %)
37.93
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 10
(1.37 %)
0
(0.00 %)
127 human papillomavirus 161 (KC1 2018)
GCF_002826985.1
6
(92.39 %)
37.73
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.36 %)
0
(0.00 %)
128 human papillomavirus 163 (KC3 2015)
GCF_001430115.1
6
(93.54 %)
37.69
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 13
(1.80 %)
0
(0.00 %)
129 human papillomavirus 166 (KC9 2012)
GCF_000899515.1
6
(92.72 %)
38.29
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.79 %)
0
(0.00 %)
130 human papillomavirus 167 (KC10 2013)
GCF_000913075.1
6
(92.78 %)
35.83
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 23
(5.24 %)
0
(0.00 %)
131 human papillomavirus 172 (2018)
GCF_002827005.1
7
(95.04 %)
37.77
(99.96 %)
1
(0.01 %)
2
(99.99 %)
5
(1.22 %)
n/a 4
(0.60 %)
0
(0.00 %)
132 human papillomavirus 175 (SE87 2018)
GCF_002827025.1
7
(93.05 %)
38.87
(99.99 %)
1
(0.01 %)
2
(99.99 %)
4
(0.29 %)
n/a 8
(1.00 %)
1
(3.46 %)
133 human papillomavirus 178 (2014)
GCF_000918095.1
7
(92.49 %)
38.15
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.53 %)
2
(0.59 %)
8
(1.35 %)
0
(0.00 %)
134 human papillomavirus 179 (SIBX16 2013)
GCF_000912535.1
6
(92.78 %)
36.76
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.87 %)
n/a 7
(1.67 %)
0
(0.00 %)
135 human papillomavirus 18 (2000)
GCF_000865665.1
8
(87.96 %)
40.43
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.70 %)
n/a 12
(3.67 %)
0
(0.00 %)
136 human papillomavirus 184 (SIBX17 2018)
GCF_002987365.1
6
(92.71 %)
36.89
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.98 %)
1
(0.53 %)
4
(0.40 %)
0
(0.00 %)
137 human papillomavirus 187 (ACS447 2018)
GCF_003055605.1
6
(92.85 %)
38.90
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 10
(1.36 %)
0
(0.00 %)
138 human papillomavirus 201 (HPV201 2015)
GCF_001184845.1
7
(93.33 %)
37.71
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.48 %)
n/a 5
(0.95 %)
0
(0.00 %)
139 human papillomavirus 203 (SE369 2019)
GCF_004133345.1
7
(92.96 %)
37.54
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.43 %)
n/a 10
(1.33 %)
0
(0.00 %)
140 human papillomavirus 204 (A342 2018)
GCF_002827045.1
7
(92.47 %)
37.84
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.50 %)
n/a 6
(1.44 %)
1
(2.92 %)
141 human papillomavirus 30 (2018)
GCF_002987345.1
6
(84.46 %)
40.39
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(2.31 %)
2
(1.03 %)
14
(4.22 %)
0
(0.00 %)
142 human papillomavirus 4 (1993)
GCF_000864845.1
7
(92.18 %)
38.53
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.71 %)
1
(0.35 %)
23
(3.75 %)
0
(0.00 %)
143 human papillomavirus 5 (1993)
GCF_000866505.1
8
(92.64 %)
42.39
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
9
(2.94 %)
1
(0.39 %)
13
(3.01 %)
1
(7.11 %)
144 human papillomavirus 71 (2018)
GCF_002826825.1
1
(24.06 %)
44.38
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
7
(2.47 %)
3
(1.63 %)
11
(3.93 %)
0
(0.00 %)
145 human papillomavirus 9 (1993)
GCF_000863685.1
7
(94.00 %)
41.00
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.14 %)
2
(0.93 %)
13
(2.45 %)
1
(4.63 %)
146 human papillomavirus KC5 (KC5 2015)
GCF_000989155.1
7
(92.99 %)
36.78
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.71 %)
0
(0.00 %)
147 human papillomavirus type 10 (1993)
GCF_000864905.1
7
(84.68 %)
45.89
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.78 %)
n/a 16
(3.86 %)
0
(0.00 %)
148 human papillomavirus type 101 (Qv23954 2006)
GCF_000869845.1
6
(89.06 %)
43.12
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.33 %)
n/a 5
(0.61 %)
0
(0.00 %)
149 human papillomavirus type 112 (2009)
GCF_000882135.1
7
(93.62 %)
37.52
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.73 %)
1
(3.81 %)
150 human papillomavirus type 128 (2011)
GCF_000889675.1
7
(92.33 %)
35.98
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 16
(3.18 %)
0
(0.00 %)
151 human papillomavirus type 129 (2011)
GCF_000891495.1
7
(93.07 %)
37.31
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.82 %)
n/a 3
(0.35 %)
0
(0.00 %)
152 human papillomavirus type 131 (27-49 2011)
GCF_000890535.1
7
(93.15 %)
37.03
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 17
(2.73 %)
0
(0.00 %)
153 human papillomavirus type 137 (NJ2801H 2012)
GCF_000897255.1
7
(93.60 %)
37.57
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.32 %)
n/a 16
(2.39 %)
0
(0.00 %)
154 human papillomavirus type 144 (CL3740 2012)
GCF_000898255.1
7
(92.09 %)
38.23
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 9
(1.32 %)
0
(0.00 %)
155 human papillomavirus type 156 (GC01 2017)
GCF_002006915.1
7
(92.47 %)
36.18
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 13
(1.86 %)
0
(0.00 %)
156 human papillomavirus type 16 (1993)
GCF_000863945.3
11
(87.67 %)
36.53
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(3.26 %)
1
(0.32 %)
12
(4.50 %)
0
(0.00 %)
157 human papillomavirus type 26 (1993)
GCF_000866485.1
6
(84.85 %)
38.60
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
8
(2.74 %)
2
(0.45 %)
14
(5.89 %)
0
(0.00 %)
158 human papillomavirus type 32 (1993)
GCF_000864925.1
6
(84.42 %)
40.98
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.83 %)
n/a 9
(1.96 %)
0
(0.00 %)
159 human papillomavirus type 34 (1993)
GCF_000863965.1
6
(85.10 %)
38.25
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(2.33 %)
3
(1.17 %)
8
(3.52 %)
0
(0.00 %)
160 human papillomavirus type 41 (1991)
GCF_000863845.1
11
(90.82 %)
46.94
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.45 %)
n/a 3
(0.28 %)
1
(3.68 %)
161 human papillomavirus type 48 (1995)
GCF_000839365.1
7
(93.41 %)
36.76
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(0.58 %)
18
(3.61 %)
1
(4.07 %)
162 human papillomavirus type 49 (1993)
GCF_000862825.1
6
(93.19 %)
41.11
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.81 %)
n/a 11
(2.66 %)
0
(0.00 %)
163 human papillomavirus type 50 (1995)
GCF_000841625.1
7
(92.78 %)
36.85
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(0.53 %)
14
(2.00 %)
0
(0.00 %)
164 human papillomavirus type 53 (1993)
GCF_000865685.1
7
(66.96 %)
40.14
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(2.47 %)
n/a 24
(6.16 %)
0
(0.00 %)
165 human papillomavirus type 54 (1995)
GCF_000864725.1
7
(84.57 %)
41.88
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(2.32 %)
n/a 9
(3.05 %)
0
(0.00 %)
166 human papillomavirus type 60 (1995)
GCF_000838505.1
7
(92.85 %)
36.94
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.83 %)
n/a 12
(2.15 %)
1
(3.27 %)
167 human papillomavirus type 63 (1993)
GCF_000865565.1
7
(91.55 %)
40.44
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.20 %)
1
(0.59 %)
5
(0.53 %)
0
(0.00 %)
168 human papillomavirus type 6b (type 6b (HPV6b) 1985)
GCF_000861945.1
9
(89.64 %)
40.87
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(1.39 %)
1
(0.76 %)
15
(3.21 %)
0
(0.00 %)
169 human papillomavirus type 7 (1993)
GCF_000861925.1
6
(82.97 %)
39.53
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(1.73 %)
1
(0.59 %)
13
(3.49 %)
0
(0.00 %)
170 human papillomavirus type 85 (114B 2017)
GCF_002153865.1
8
(90.54 %)
37.76
(98.31 %)
7
(1.95 %)
8
(98.05 %)
3
(0.00 %)
n/a 17
(4.34 %)
0
(0.00 %)
171 human papillomavirus type 88 (2008)
GCF_000874925.1
7
(92.19 %)
40.11
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(0.35 %)
6
(0.71 %)
1
(4.00 %)
172 human papillomavirus type 90 (2002)
GCF_000862685.1
7
(82.73 %)
46.65
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.95 %)
n/a 10
(3.96 %)
1
(2.53 %)
173 human papillomavirus type 92 (2003)
GCF_000846285.1
7
(93.86 %)
39.96
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
7
(2.48 %)
3
(1.50 %)
7
(2.92 %)
1
(4.21 %)
174 human papillomavirus type 96 (2003)
GCF_000864825.1
7
(97.38 %)
40.31
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.81 %)
n/a 21
(3.83 %)
1
(4.33 %)
175 human parainfluenza virus 4a (M-25 2013)
GCF_000910675.1
7
(83.27 %)
36.23
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.23 %)
1
(0.22 %)
13
(1.18 %)
0
(0.00 %)
176 human parechovirus 1 (2018)
GCF_002817305.1
1
(89.15 %)
39.06
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 4
(1.29 %)
0
(0.00 %)
177 human parvovirus 4 G1 (2005)
GCF_000861005.1
2
(89.92 %)
44.94
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.87 %)
2
(1.52 %)
4
(0.70 %)
1
(3.85 %)
178 human parvovirus B19 (J35 1999)
GCF_000839645.1
6
(81.47 %)
43.81
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
4
(2.93 %)
13
(4.72 %)
2
(12.12 %)
179 human pegivirus 2 (UC0125.US 2015)
GCF_001310135.2
1
(92.98 %)
53.96
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.49 %)
2
(90.06 %)
180 human picobirnavirus (Hy005102 2005)
GCF_000859285.1
3
(92.15 %)
46.02
(100.00 %)
n/a 2
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 0
(0.00 %)
0
(0.00 %)
181 human polyomavirus 1 (1993)
GCF_000837865.1
7
(89.15 %)
39.53
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
2
(2.45 %)
13
(4.13 %)
0
(0.00 %)
182 human polyomavirus 12 (hu1403 2013)
GCF_000906235.1
6
(89.41 %)
39.60
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.64 %)
1
(0.91 %)
27
(6.74 %)
0
(0.00 %)
183 human polyomavirus 3 (Stockholm 60 2007)
GCF_000873085.1
6
(88.17 %)
39.37
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(0.85 %)
26
(6.90 %)
0
(0.00 %)
184 human polyomavirus 6 (607a 2010)
GCF_000888495.1
6
(89.67 %)
42.66
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 5
(0.83 %)
0
(0.00 %)
185 human polyomavirus 7 (713a 2010)
GCF_000889175.1
6
(89.14 %)
42.91
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(1.25 %)
0
(0.00 %)
186 human polyomavirus 9 (HPyV9 2011)
GCF_000891615.1
6
(88.18 %)
39.16
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 20
(4.74 %)
0
(0.00 %)
187 human respirovirus 1 (Washington 1964 2002)
GCF_000848705.1
10
(99.19 %)
37.24
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
7
(2.19 %)
1
(0.25 %)
4
(1.69 %)
0
(0.00 %)
188 human respirovirus 3 (1998)
GCF_000850205.1
9
(93.58 %)
34.52
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
6
(1.09 %)
n/a 11
(1.89 %)
0
(0.00 %)
189 human rhinovirus NAT001 (NAT001 2018)
GCF_002816885.1
1
(92.58 %)
43.40
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 0
(0.00 %)
0
(0.00 %)
190 human rotavirus B (Bang373 2013)
GCF_000907835.1
13
(95.17 %)
36.97
(99.88 %)
n/a 11
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 18
(1.22 %)
0
(0.00 %)
191 human smacovirus 1 (France/12/2008/3454 2015)
GCF_000929235.1
2
(69.15 %)
43.94
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 0
(0.00 %)
0
(0.00 %)
192 human stool-associated circular virus NG13 (NG13 2018)
GCF_002819605.1
2
(93.58 %)
43.54
(99.76 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(1.24 %)
0
(0.00 %)
193 Human T-cell leukemia virus type I (1993)
GCA_003102335.1
3
(59.99 %)
53.88
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 15
(2.55 %)
3
(15.21 %)
194 human T-cell leukemia virus type I (1998)
GCF_000863585.1
11
(81.17 %)
53.47
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.33 %)
n/a 19
(2.50 %)
2
(12.06 %)
195 human T-lymphotropic virus 2 (1993)
GCF_000847505.1
9
(94.24 %)
53.82
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.11 %)
n/a 16
(2.41 %)
2
(6.46 %)
196 human T-lymphotropic virus 4 (1863LE 2009)
GCF_000882595.1
8
(77.85 %)
56.28
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.51 %)
n/a 30
(5.68 %)
3
(16.69 %)
197 human TMEV-like cardiovirus (2008)
GCF_000875265.1
3
(86.45 %)
43.58
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.84 %)
0
(0.00 %)
198 Influenza A virus (A/California/07/2009 2015)
GCF_001343785.1
14
(99.84 %)
43.70
(99.90 %)
4
(0.03 %)
12
(99.97 %)
3
(0.00 %)
n/a 11
(0.83 %)
0
(0.00 %)
199 Influenza A virus (A/Goose/Guangdong/1/96H5N1 2005)
GCF_000864105.1
15
(96.68 %)
44.12
(99.93 %)
n/a 8
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.35 %)
0
(0.00 %)
200 Influenza A virus (A/Hong Kong/1073/99 2003)
GCF_000851145.1
12
(97.14 %)
44.07
(99.90 %)
n/a 8
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 10
(0.81 %)
0
(0.00 %)
201 Influenza A virus (A/Korea/426/1968 2005)
GCF_000866645.1
15
(97.49 %)
43.41
(99.89 %)
1
(0.01 %)
9
(99.99 %)
3
(0.00 %)
n/a 4
(0.28 %)
0
(0.00 %)
202 Influenza A virus (A/New York/392/2004 2005)
GCF_000865085.1
15
(96.37 %)
42.94
(99.91 %)
n/a 8
(100.00 %)
4
(0.57 %)
n/a 6
(0.33 %)
0
(0.00 %)
203 Influenza A virus (A/Puerto Rico/8/1934 1982)
GCF_000865725.1
15
(96.32 %)
43.40
(99.90 %)
n/a 8
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 7
(0.68 %)
0
(0.00 %)
204 Influenza A virus (A/Shanghai/02/2013 2015)
GCF_000928555.1
15
(99.34 %)
44.36
(99.92 %)
1
(0.01 %)
9
(99.99 %)
3
(0.00 %)
n/a 4
(0.30 %)
0
(0.00 %)
205 Influenza B virus (B/Lee/1940 1993)
GCF_000820495.2
11
(92.51 %)
40.19
(99.88 %)
n/a 8
(100.00 %)
5
(0.51 %)
n/a 23
(1.85 %)
0
(0.00 %)
206 Influenza C virus (C/Ann Arbor/1/50 2004)
GCF_000856665.10
11
(95.87 %)
37.28
(99.91 %)
n/a 7
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 42
(4.23 %)
0
(0.00 %)
207 Isfahan virus (2013)
GCF_000906835.1
5
(96.29 %)
41.93
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 20
(1.82 %)
0
(0.00 %)
208 Japanese encephalitis virus (1993)
GCF_000862145.1
3
(93.83 %)
51.43
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(0.15 %)
0
(0.00 %)
209 JC polyomavirus (Mad1 1993)
GCF_000863805.1
9
(96.55 %)
40.45
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(3.82 %)
17
(5.52 %)
0
(0.00 %)
210 La Crosse virus (human/78 2002)
GCF_000850965.1
4
(94.68 %)
36.68
(99.95 %)
n/a 3
(100.00 %)
4
(0.32 %)
n/a 26
(2.75 %)
0
(0.00 %)
211 Lagos bat lyssavirus (0406SEN 2013)
GCF_000905975.1
5
(90.15 %)
43.48
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 7
(0.41 %)
0
(0.00 %)
212 Langat virus (TP21 2000)
GCF_000860805.1
1
(93.62 %)
54.31
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 7
(0.56 %)
1
(2.18 %)
213 Lassa mammarenavirus (Josiah 1998)
GCF_000851705.1
4
(94.96 %)
42.06
(99.94 %)
n/a 2
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1
(0.37 %)
9
(1.70 %)
0
(0.00 %)
214 Louping ill virus (369/T2 1997)
GCF_000863165.1
1
(94.24 %)
54.86
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.52 %)
3
(12.29 %)
215 Lumpy skin disease virus NI- (Neethling 2490 2001)
GCF_000839805.1
156
(95.76 %)
25.91
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
55
(1.76 %)
20
(0.65 %)
1,542
(23.51 %)
0
(0.00 %)
216 Lymphocytic choriomeningitis mammarenavirus (Armstrong 53b 1993)
GCF_000851025.1
4
(97.52 %)
42.29
(99.99 %)
n/a 2
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.07 %)
0
(0.00 %)
217 Machupo mammarenavirus (Carvallo 2003)
GCF_000853725.1
4
(94.98 %)
41.77
(99.95 %)
n/a 2
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 4
(0.62 %)
0
(0.00 %)
218 Marburg marburgvirus (Marburg virus/H.sapiens-tc/KEN/1980/Mt. Elgon-Musoke 1994)
GCF_000857325.2
7
(98.72 %)
38.29
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 16
(1.05 %)
0
(0.00 %)
219 Mayaro virus (2002)
GCF_000863385.1
5
(96.78 %)
50.37
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.76 %)
n/a 4
(1.59 %)
5
(42.02 %)
220 Measles morbillivirus (Ichinose-B95a 1998)
GCF_000854845.1
7
(94.55 %)
47.43
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 9
(0.91 %)
1
(3.88 %)
221 Merkel cell polyomavirus (R17b 2008)
GCF_000874865.1
5
(88.06 %)
40.69
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 8
(1.78 %)
0
(0.00 %)
222 Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (HCoV-EMC HCoV-EMC/2012 2012)
GCF_000901155.1
12
(97.48 %)
41.24
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.12 %)
n/a 4
(0.14 %)
0
(0.00 %)
223 Mokola lyssavirus (2004)
GCF_000856485.1
5
(98.49 %)
44.42
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 8
(0.73 %)
0
(0.00 %)
224 Molluscum contagiosum virus subtype 1 (1996)
GCF_000843325.1
163
(85.07 %)
63.36
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
128
(3.25 %)
92
(4.74 %)
1,361
(17.29 %)
1
(99.95 %)
225 Monkeypox virus (MPXV-M5312_HM12_Rivers 2022)
GCF_014621545.1
179
(83.90 %)
33.03
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
38
(0.78 %)
22
(0.54 %)
1,097
(9.44 %)
0
(0.00 %)
226 Monkeypox virus (Zaire-96-I-16 2021)
GCF_000857045.1
191
(87.29 %)
33.09
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
37
(0.96 %)
24
(0.57 %)
1,102
(9.51 %)
0
(0.00 %)
227 Mumps orthorubulavirus (Miyahara 2000)
GCF_000856685.1
8
(92.81 %)
42.49
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.24 %)
n/a 10
(0.59 %)
0
(0.00 %)
228 Mupapillomavirus 1 (1982)
GCF_000866405.1
7
(86.17 %)
40.28
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(1.47 %)
1
(0.40 %)
7
(1.87 %)
1
(2.75 %)
229 Murray Valley encephalitis virus (1999)
GCF_000863565.1
3
(93.56 %)
48.72
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.23 %)
1
(1.84 %)
230 Myxoma virus (Lausanne 2002)
GCF_000843685.1
170
(95.89 %)
43.56
(100.00 %)
7
(0.00 %)
8
(100.00 %)
11
(0.16 %)
15
(0.33 %)
578
(5.25 %)
0
(0.00 %)
231 Nipah henipavirus (2000)
GCF_000863625.1
11
(82.06 %)
38.17
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.17 %)
n/a 8
(0.37 %)
0
(0.00 %)
232 Norovirus GI (1993)
GCF_000864005.1
3
(99.09 %)
48.03
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.52 %)
1
(0.35 %)
3
(0.31 %)
0
(0.00 %)
233 Onyong-nyong virus (1993)
GCF_000863005.1
5
(100.00 %)
48.32
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
2
(1.28 %)
7
(1.39 %)
5
(15.80 %)
234 Orf virus (OV-SA00 ORFD 2004)
GCF_000844845.1
130
(89.67 %)
63.44
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
56
(2.03 %)
37
(1.70 %)
1,076
(16.55 %)
1
(100.00 %)
235 Oropouche virus (2004)
GCF_000853785.1
4
(97.72 %)
35.40
(99.96 %)
n/a 3
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 33
(3.75 %)
0
(0.00 %)
236 Orthohepevirus A (Xinjiang 1993)
GCF_000861105.1
3
(98.65 %)
57.95
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 12
(1.80 %)
1
(89.53 %)
237 Parainfluenza virus 5 (W3A 2004)
GCF_000854805.1
9
(99.06 %)
42.27
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.24 %)
n/a 3
(0.30 %)
0
(0.00 %)
238 Paramecium bursaria Chlorella virus 1 (2011)
GCF_000847045.1
814
(95.11 %)
39.97
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
75
(0.98 %)
146
(4.42 %)
1,227
(8.76 %)
23
(3.04 %)
239 Parechovirus A (Gregory 1998)
GCF_000861505.1
1
(89.00 %)
39.48
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.30 %)
n/a 6
(0.98 %)
0
(0.00 %)
240 Pichinde virus (AN3739 2004)
GCF_000856465.1
4
(96.57 %)
41.84
(99.94 %)
n/a 2
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(0.44 %)
0
(0.00 %)
241 Powassan virus (LB 1993)
GCF_000860485.1
1
(94.55 %)
53.32
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 14
(1.20 %)
1
(3.47 %)
242 Punta Toro virus (Adames 2018)
GCF_002815115.1
4
(92.61 %)
40.36
(99.94 %)
n/a 3
(100.00 %)
5
(1.74 %)
3
(0.77 %)
16
(3.35 %)
0
(0.00 %)
243 Puumala orthohantavirus (Sotkamo 2003)
GCF_000854405.1
3
(39.37 %)
36.97
(99.98 %)
n/a 3
(100.00 %)
5
(0.66 %)
n/a 33
(3.47 %)
0
(0.00 %)
244 Rabies lyssavirus (1993)
GCF_000859625.1
5
(95.29 %)
45.10
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 11
(1.15 %)
0
(0.00 %)
245 Reticuloendotheliosis virus (HA9901 2005)
GCF_000858025.1
3
(81.69 %)
52.71
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.86 %)
2
(1.01 %)
9
(1.35 %)
3
(8.85 %)
246 Rhinovirus A (1993)
GCF_000862245.1
1
(90.81 %)
39.05
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.15 %)
0
(0.00 %)
247 Rift Valley fever virus (ZH-548 2010)
GCF_000847345.1
4
(95.24 %)
45.11
(99.97 %)
n/a 3
(100.00 %)
4
(0.49 %)
n/a 8
(1.04 %)
0
(0.00 %)
248 Rosavirus A2 (GA7403 2014)
GCF_000918175.1
1
(82.95 %)
51.41
(99.99 %)
1
(0.01 %)
2
(99.99 %)
3
(0.00 %)
n/a 5
(0.67 %)
1
(4.60 %)
249 Ross River virus (NB5092 1993)
GCF_000862165.1
5
(96.96 %)
51.41
(99.90 %)
20
(0.47 %)
20
(99.53 %)
4
(0.90 %)
n/a 4
(1.54 %)
8
(48.39 %)
250 Rotavirus A (RVA/Simian-tc/ZAF/SA11-H96/1958/G3P5B[2] 2008)
GCF_000880735.1
12
(94.00 %)
33.67
(99.88 %)
n/a 11
(100.00 %)
4
(0.19 %)
n/a 21
(1.24 %)
0
(0.00 %)
251 Rotavirus C (Bristol 2005)
GCF_000864225.1
11
(95.04 %)
31.63
(99.89 %)
n/a 11
(100.00 %)
7
(1.19 %)
n/a 33
(2.72 %)
0
(0.00 %)
252 Rubella virus (F-Therien 1993)
GCF_000863025.1
2
(99.15 %)
69.60
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.85 %)
n/a 54
(9.70 %)
1
(98.66 %)
253 Saint Louis encephalitis virus (Kern217 2005)
GCF_000866785.1
1
(94.09 %)
49.75
(100.00 %)
1
(0.01 %)
2
(99.99 %)
3
(0.00 %)
n/a 9
(1.35 %)
1
(3.05 %)
254 Salivirus NG-J1 (NG-J1 2009)
GCF_000886535.1
1
(89.26 %)
56.70
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 17
(2.15 %)
2
(48.16 %)
255 Sandfly fever Naples virus (Toscana ISS.Phl.3 2004)
GCF_000854285.1
4
(98.01 %)
44.60
(99.94 %)
n/a 3
(100.00 %)
4
(0.30 %)
n/a 13
(2.02 %)
0
(0.00 %)
256 Sapovirus C12 (C12 2004)
GCF_000855765.1
2
(98.27 %)
51.73
(99.99 %)
1
(0.01 %)
2
(99.99 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.13 %)
2
(7.50 %)
257 SARS coronavirus Tor2 (Tor2 2003)
GCF_000864885.1
16
(97.60 %)
40.76
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.08 %)
n/a 18
(0.74 %)
0
(0.00 %)
258 Semliki Forest virus (1987)
GCF_000860285.1
4
(96.64 %)
53.22
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.66 %)
n/a 4
(1.46 %)
1
(92.56 %)
259 Seoul orthohantavirus (80-39 2003)
GCF_000855645.1
3
(93.29 %)
39.00
(99.96 %)
n/a 3
(100.00 %)
5
(0.56 %)
n/a 14
(1.15 %)
0
(0.00 %)
260 Sheeppox virus (TU-V02127 2002)
GCF_000840205.1
148
(93.28 %)
25.01
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
46
(1.32 %)
13
(0.59 %)
1,524
(24.28 %)
0
(0.00 %)
261 Simian foamy virus (1994)
GCF_000848485.1
6
(78.31 %)
38.96
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.50 %)
n/a 7
(0.57 %)
0
(0.00 %)
262 Sindbis virus (1993)
GCF_000860545.1
5
(100.00 %)
50.91
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.34 %)
n/a 3
(0.28 %)
1
(93.38 %)
263 Singapore grouper iridovirus (2004)
GCF_000846905.1
162
(89.23 %)
48.64
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
10
(0.23 %)
26
(2.80 %)
285
(4.52 %)
1
(0.16 %)
264 smallpox virus (India-1967, ssp. major Ind3 1993)
GCF_000859885.1
197
(87.60 %)
32.73
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
31
(0.69 %)
7
(0.57 %)
1,031
(9.09 %)
0
(0.00 %)
265 Snowshoe hare virus (2021)
GCF_004789895.1
4
(96.87 %)
37.25
(99.93 %)
n/a 3
(100.00 %)
5
(0.83 %)
n/a 15
(1.23 %)
0
(0.00 %)
266 Suid alphaherpesvirus 1 (PRV-MdBio PRV-MdBio 2017)
GCA_900230325.1
170
(86.10 %)
73.56
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2
(100.00 %)
202
(7.85 %)
166
(7.32 %)
1,126
(32.56 %)
1
(99.40 %)
267 Torque teno virus 1 (VT416 1998)
GCF_000857545.1
5
(70.74 %)
49.06
(99.95 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.80 %)
n/a 17
(6.93 %)
2
(35.41 %)
268 Turkey herpesvirus (FC126 Burmester 2001)
GCF_000839725.1
84
(78.98 %)
47.56
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
13
(0.36 %)
14
(1.60 %)
256
(2.38 %)
0
(0.00 %)
269 Uukuniemi virus (2003)
GCF_000851865.1
4
(96.08 %)
47.69
(99.94 %)
n/a 3
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 6
(0.86 %)
0
(0.00 %)
270 Vaccinia virus (WR (Western Reserve) 2005)
GCF_000860085.1
223
(88.80 %)
33.34
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
26
(0.57 %)
10
(3.43 %)
744
(9.15 %)
0
(0.00 %)
271 Varicella-zoster virus (Dumas 1987)
GCF_000858285.1
74
(89.36 %)
46.02
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
14
(0.32 %)
17
(0.92 %)
421
(5.39 %)
1
(0.20 %)
272 Venezuelan equine encephalitis virus (1993)
GCF_000862105.1
6
(100.00 %)
50.12
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
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(0.27 %)
1
(0.30 %)
6
(1.47 %)
4
(15.75 %)
273 Vesicular stomatitis Indiana virus (1993)
GCF_000850045.1
4
(91.34 %)
41.74
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 8
(0.60 %)
0
(0.00 %)
274 West Nile virus (956 1993)
GCF_000861085.1
3
(93.90 %)
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(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 2
(0.19 %)
3
(7.47 %)
275 Western equine encephalitis virus (71V-1658 2000)
GCF_000850885.1
4
(96.79 %)
49.21
(99.97 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 1
(0.64 %)
3
(52.96 %)
276 WU Polyomavirus (B0 2007)
GCF_000870785.1
6
(85.79 %)
39.18
(99.92 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(1.03 %)
1
(0.71 %)
16
(3.46 %)
0
(0.00 %)
277 Yaba monkey tumor virus (2003)
GCF_000845705.1
140
(94.29 %)
29.83
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
24
(0.67 %)
6
(0.47 %)
1,223
(18.16 %)
0
(0.00 %)
278 Yaba-like disease virus (2001)
GCF_000847185.1
152
(95.76 %)
27.00
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
39
(1.06 %)
10
(0.44 %)
1,396
(21.09 %)
0
(0.00 %)
279 Yellow fever virus (17D vaccine strain 1986)
GCF_000857725.1
1
(100.00 %)
49.72
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
4
(0.27 %)
n/a 1
(0.28 %)
0
(0.00 %)
280 Zaire ebolavirus (Ebola virus/H.sapiens-tc/COD/1976/Yambuku-Mayinga 1999)
GCF_000848505.1
11
(95.31 %)
41.07
(99.98 %)
n/a 1
(100.00 %)
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(0.18 %)
n/a 4
(0.15 %)
1
(1.12 %)
281 Zika virus (MR 766 2009)
GCF_000882815.3
1
(95.05 %)
50.95
(99.96 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
n/a 3
(0.26 %)
0
(0.00 %)
TOTALS:total assembly count 281

Additional hubs with collections of assemblies
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Primates 214 assemblies assembly stats track stats
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Viruses 281 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 97 assemblies assembly stats track stats
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CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
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