Viral Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of viral only.

See also: hub access, assembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiGene gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 adeno-associated virus 2 (1993)
GCF_000838645.1		 14
(89.01 %)		 53.80
(99.91 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 8
(3.18 %)		 n/a 0
(0.00 %)		 1
(54.43 %)
2 Adult diarrheal rotavirus strain J19 (J19 2005)
GCF_000864245.1		 11
(95.04 %)		 33.42
(99.83 %)		 n/a 11
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 1
(0.20 %)		 37
(2.83 %)		 0
(0.00 %)
3 Aichi virus 1 (A846/88 1998)
GCF_000861885.1		 1
(88.50 %)		 58.90
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 5
(1.09 %)		 n/a 8
(2.47 %)		 1
(81.27 %)
4 Alkhumra hemorrhagic fever virus (Zaki #2 2012)
GCA_031116565.1		 1
(95.14 %)		 54.00
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.40 %)		 n/a 2
(0.13 %)		 0
(0.00 %)
5 Alphapapillomavirus 4 (1991)
GCF_000864945.1		 7
(86.62 %)		 48.40
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 5
(1.34 %)		 1
(0.50 %)		 7
(2.05 %)		 0
(0.00 %)
6 Anatid alphaherpesvirus 1 (2085 2023)
GCA_008791745.1		 78
(79.40 %)		 44.93
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 11
(0.18 %)		 13
(1.23 %)		 226
(2.34 %)		 5
(4.61 %)
7 Anjozorobe virus (Anjozorobe/Em/MDG/2009/ATD49 2017)
GCF_002145785.1		 3
(93.60 %)		 37.87
(99.96 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 6
(0.78 %)		 1
(0.36 %)		 16
(2.19 %)		 0
(0.00 %)
8 Argentinian mammarenavirus (XJ13 2003)
GCF_000856545.1		 4
(95.69 %)		 41.57
(99.95 %)		 n/a 2
(100.00 %)		 4
(0.24 %)		 1
(0.48 %)		 2
(0.58 %)		 0
(0.00 %)
9 Astrovirus MLB2 (MLB2/human/Stl/WD0559/2008 2012)
GCF_000895575.1		 3
(99.13 %)		 40.52
(99.93 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 6
(2.01 %)		 0
(0.00 %)
10 Astrovirus MLB3 (MLB3/human/Vellore/26564/2004 2012)
GCF_000899535.1		 3
(99.15 %)		 40.00
(99.93 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 4
(2.19 %)		 0
(0.00 %)
11 Astrovirus VA3 (VA3/human/Vellore/28054/2005 2012)
GCF_000901475.1		 3
(98.01 %)		 41.78
(99.98 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 2
(0.29 %)		 0
(0.00 %)
12 Astrovirus VA4 (VA4/human/Nepal/S5363/2008 2012)
GCF_000897955.1		 3
(97.62 %)		 42.99
(99.95 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 1
(0.11 %)		 0
(0.00 %)
13 Atlantic salmon calicivirus (Nordland/2011 2014)
GCF_000919195.1		 2
(97.89 %)		 53.49
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 0
(0.00 %)		 3
(56.39 %)
14 Australian bat lyssavirus (insectivorous isolate 1999)
GCF_000850325.1		 5
(91.79 %)		 44.15
(99.98 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 8
(0.61 %)		 0
(0.00 %)
15 Bacillus phage PfNC7401 (2016)
GCA_002611025.1		 79
(85.50 %)		 36.55
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.12 %)		 4
(0.31 %)		 121
(3.62 %)		 0
(0.00 %)
16 Banna virus strain JKT-6423 (JKT-6423 JKT-6423 2000)
GCF_000858185.1		 12
(86.10 %)		 39.33
(99.89 %)		 n/a 12
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 11
(0.64 %)		 0
(0.00 %)
17 Barmah Forest virus (BH2193 1997)
GCF_000847585.1		 5
(95.39 %)		 48.55
(99.97 %)		 2
(0.02 %)		 3
(99.98 %)		 4
(0.59 %)		 n/a 7
(2.47 %)		 5
(15.26 %)
18 Bat sapovirus (Bat-SaV/Limbe65/CAM/2014 2017)
GCF_002005625.1		 2
(97.81 %)		 46.98
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.24 %)		 n/a 5
(0.75 %)		 1
(5.51 %)
19 Bat sapovirus (TLC58/HK 2012)
GCF_000894635.1		 2
(96.96 %)		 60.16
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.49 %)		 n/a 6
(0.66 %)		 1
(94.41 %)
20 Betapolyomavirus macacae (2000)
GCF_000837645.1		 18
(99.29 %)		 40.76
(99.94 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 3
(4.54 %)		 15
(4.33 %)		 0
(0.00 %)
21 Bovine calicivirus strain (Kirklareli 2016)
GCF_001714355.1		 2
(98.04 %)		 58.37
(99.95 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 1
(0.09 %)		 1
(96.34 %)
22 Bovine herpesvirus type 1.1 (NVSL challenge 97-11 2022)
GCF_008777455.1		 75
(84.84 %)		 72.42
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 n/a 116
(4.31 %)		 1,304
(33.41 %)		 1
(99.99 %)
23 Bowe virus (VN1512 2017)
GCF_002118085.1		 3
(94.38 %)		 36.23
(99.97 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 5
(1.00 %)		 1
(0.29 %)		 12
(2.09 %)		 0
(0.00 %)
24 Bruges virus (BE/Vieux-Genappe/TE/2013/1 2017)
GCF_002117675.1		 3
(93.06 %)		 38.99
(99.93 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 4
(0.47 %)		 n/a 8
(1.00 %)		 0
(0.00 %)
25 Bunyamwera virus (1991)
GCF_000849925.1		 4
(95.34 %)		 35.16
(99.97 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 30
(3.12 %)		 0
(0.00 %)
26 Cache Valley virus (6V633 2019)
GCF_004789995.1		 4
(95.45 %)		 35.43
(99.98 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 10
(0.75 %)		 0
(0.00 %)
27 Calicivirus chicken/V0021/Bayern/2004 (Bavaria04V0021 2023)
GCF_004786895.1		 2
(98.62 %)		 54.02
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 5
(0.64 %)		 1
(4.06 %)
28 Calicivirus isolate (TCG 14 2005)
GCF_000859525.1		 2
(98.09 %)		 56.20
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 5
(1.19 %)		 n/a 2
(1.07 %)		 2
(69.58 %)
29 Calicivirus pig/AB90/CAN (AB90 2009)
GCF_000883855.1		 2
(99.21 %)		 54.31
(99.94 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.39 %)		 1
(0.39 %)		 10
(1.83 %)		 0
(0.00 %)
30 California encephalitis virus (BFS 283 2021)
GCF_003972565.1		 4
(94.87 %)		 36.45
(99.95 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 8
(0.66 %)		 0
(0.00 %)
31 Camel Crimean-Congo hemorrhagic fever orthonairovirus (camel/Abu Dhabi/B84 2020)
GCA_032106395.1		 3
(96.30 %)		 43.00
(99.98 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 5
(0.56 %)		 n/a 16
(0.70 %)		 0
(0.00 %)
32 Canine vesivirus (2003)
GCF_000851085.1		 3
(97.08 %)		 45.89
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 5
(0.63 %)		 0
(0.00 %)
33 Capira virus (VP-366G 2015)
GCA_031322265.1		 4
(95.28 %)		 38.38
(99.97 %)		 2
(0.03 %)		 5
(99.97 %)		 4
(1.01 %)		 6
(0.94 %)		 4
(1.22 %)		 0
(0.00 %)
34 Carnivore chapparvovirus 1 (VRI 849 2020)
GCA_031190585.1		 2
(83.55 %)		 37.38
(99.90 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.90 %)		 n/a 3
(1.98 %)		 0
(0.00 %)
35 Cercopithecine alphaherpesvirus 2 (B264 2004)
GCF_000846965.1		 80
(78.07 %)		 75.97
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 169
(6.25 %)		 180
(5.92 %)		 1,059
(33.71 %)		 1
(100.00 %)
36 Chandipura virus (CIN 0451 2013)
GCF_000906815.1		 5
(96.34 %)		 42.53
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.29 %)		 n/a 19
(1.75 %)		 0
(0.00 %)
37 Chicken calicivirus (RS/BR/2015 2017)
GCF_001963095.1		 2
(95.46 %)		 54.17
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 4
(0.38 %)		 1
(2.63 %)
38 Chikungunya virus (S27-African prototype 2002)
GCF_000854045.1		 2
(94.47 %)		 50.04
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 5
(0.87 %)		 n/a 3
(1.76 %)		 7
(34.06 %)
39 Cosavirus A (HCoSV-A1 0553 2009)
GCF_000885595.1		 1
(83.53 %)		 43.75
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.63 %)		 n/a 5
(1.90 %)		 0
(0.00 %)
40 Cowpox virus (Brighton Red 2002)
GCF_000839185.1		 233
(91.92 %)		 33.40
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 41
(0.80 %)		 64
(2.52 %)		 1,041
(9.40 %)		 0
(0.00 %)
41 Crimean-Congo hemorrhagic fever orthonairovirus (IbAr10200 2003)
GCF_000854165.1		 3
(95.80 %)		 42.23
(99.97 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 1
(0.22 %)		 26
(1.53 %)		 0
(0.00 %)
42 Crosse virus (La Crosse/original 1994)
GCA_002831285.1		 6
(94.68 %)		 36.60
(99.96 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 4
(0.32 %)		 n/a 17
(1.43 %)		 0
(0.00 %)
43 Dandenong virus (0710-2678 2007)
GCA_031580275.1		 4
(95.83 %)		 43.24
(99.99 %)		 n/a 2
(100.00 %)		 4
(0.73 %)		 1
(0.31 %)		 5
(1.88 %)		 0
(0.00 %)
44 Deer tick virus (ctb30 CT95 2001)
GCA_004786555.1		 1
(94.89 %)		 52.70
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 10
(0.86 %)		 1
(2.25 %)
45 Dengue virus 1 (clone 45AZ5 Nauru Island 1997)
GCF_000862125.1		 1
(94.82 %)		 46.67
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 6
(0.68 %)		 0
(0.00 %)
46 Dengue virus 2 (16681/84 Thailand 1993)
GCF_000871845.1		 5
(98.86 %)		 45.82
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.27 %)		 n/a 2
(0.16 %)		 0
(0.00 %)
47 Dengue virus 3 (D3/H/IMTSSA-SRI/2000/1266 Sri Lanka 2007)
GCF_000866625.1		 5
(98.92 %)		 46.71
(99.98 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 6
(0.60 %)		 0
(0.00 %)
48 Dengue virus 4 (clone rDEN4 2001)
GCF_000865065.1		 4
(98.81 %)		 47.13
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 3
(0.27 %)		 0
(0.00 %)
49 Dengue virus type 3 (H87 2023)
GCA_004788295.1		 1
(95.11 %)		 46.65
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 2
(0.19 %)		 0
(0.00 %)
50 Dengue virus type 4 (814669 2023)
GCA_004786575.1		 1
(95.45 %)		 47.05
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 3
(0.27 %)		 0
(0.00 %)
51 Dhori thogotovirus (Dhori/1313/61 2017)
GCF_002116195.1		 6
(95.15 %)		 45.84
(99.90 %)		 n/a 6
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 12
(1.33 %)		 0
(0.00 %)
52 Dugbe orthonairovirus (ArD44313 1995)
GCF_000850985.1		 3
(96.61 %)		 40.19
(99.98 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 4
(0.27 %)		 n/a 41
(3.15 %)		 0
(0.00 %)
53 Duvenhage lyssavirus (86132SA 2013)
GCF_000905375.1		 5
(90.59 %)		 44.22
(99.99 %)		 1
(0.01 %)		 2
(99.99 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 7
(0.72 %)		 0
(0.00 %)
54 Eastern chimpanzee simian foamy virus (2018)
GCF_003032765.1		 5
(93.39 %)		 37.99
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 5
(0.77 %)		 n/a 8
(0.77 %)		 0
(0.00 %)
55 Eastern equine encephalitis virus (ssp. North American variant 1991)
GCF_000862705.1		 5
(96.00 %)		 48.71
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 7
(0.91 %)		 n/a 3
(0.64 %)		 5
(23.55 %)
56 ebolavirus (Reston virus/M.fascicularis-tc/USA/1989/Philippines89-Pennsylvania 2002)
GCF_000854085.1		 11
(98.80 %)		 40.62
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 6
(0.55 %)		 n/a 6
(0.28 %)		 0
(0.00 %)
57 ebolavirus (Sudan virus/H.sapiens-tc/UGA/2000/Gulu-808892 2004)
GCF_000855585.1		 11
(96.95 %)		 41.34
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.38 %)		 n/a 10
(0.49 %)		 0
(0.00 %)
58 ebolavirus (Tai Forest virus/H.sapiens-tc/CIV/1994/Pauleoula-CI 2010)
GCF_000888475.1		 11
(96.41 %)		 42.26
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 5
(0.50 %)		 n/a 24
(1.26 %)		 0
(0.00 %)
59 Ectromelia virus (Moscow 2002)
GCF_000841905.1		 173
(80.43 %)		 33.18
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 45
(0.96 %)		 22
(1.55 %)		 1,122
(9.40 %)		 0
(0.00 %)
60 Encephalomyocarditis virus (Ruckert 1993)
GCF_000862985.1		 3
(87.80 %)		 49.47
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(1.68 %)		 1
(1.68 %)		 2
(1.83 %)		 0
(0.00 %)
61 Enterovirus 5666/sin/002209 (2001)
GCA_031116435.1		 1
(88.81 %)		 48.02
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 7
(1.00 %)		 1
(3.40 %)
62 Enterovirus 5865/sin/000009 (2001)
GCA_031116425.1		 1
(88.81 %)		 48.03
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 8
(1.15 %)		 1
(3.40 %)
63 Enterovirus A (1994)
GCF_000861905.1		 1
(88.79 %)		 47.94
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 1
(0.09 %)		 1
(3.32 %)
64 Enterovirus A71 (BrCr 1996)
GCA_008766895.1		 1
(88.85 %)		 47.66
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 5
(0.63 %)		 1
(5.09 %)
65 Enterovirus A71 (pinf7-54A 2005)
GCA_031109255.1		 1
(88.18 %)		 47.90
(99.95 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.72 %)		 1
(0.72 %)		 1
(0.74 %)		 0
(0.00 %)
66 Enterovirus C (human poliovirus 1 Mahoney 1982)
GCF_000861165.1		 5
(98.35 %)		 46.34
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 3
(0.40 %)		 1
(6.95 %)
67 Enterovirus D (Enterovirus 70 1993)
GCF_000861205.1		 1
(89.14 %)		 42.80
(100.00 %)		 3
(0.04 %)		 4
(99.96 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 0
(0.00 %)		 0
(0.00 %)
68 enterovirus D68 (Fermon 2018)
GCF_002816725.1		 1
(89.14 %)		 41.07
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 2
(0.27 %)		 0
(0.00 %)
69 Eothenomys miletus hantavirus (LX309 2018)
GCF_002827125.1		 3
(91.02 %)		 37.39
(99.94 %)		 1
(0.01 %)		 4
(99.99 %)		 5
(0.87 %)		 n/a 18
(2.75 %)		 0
(0.00 %)
70 Epstein-Barr virus (Raji 2005)
GCF_002402265.1		 98
(77.44 %)		 59.50
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 30
(0.66 %)		 34
(5.62 %)		 577
(10.56 %)		 27
(45.97 %)
71 Epstein-Barr virus type 2 (AG876 2007)
GCF_000872045.1		 114
(68.90 %)		 59.54
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 34
(0.79 %)		 29
(5.78 %)		 498
(10.10 %)		 24
(45.98 %)
72 Equine herpesvirus 1 (Ab4 1993)
GCA_000844025.1		 81
(83.51 %)		 56.66
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 23
(0.73 %)		 28
(3.15 %)		 306
(5.68 %)		 2
(99.10 %)
73 Escherichia phage Lambda (2000)
GCF_000840245.1		 92
(95.32 %)		 49.86
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 5
(0.20 %)		 n/a 36
(0.81 %)		 4
(51.36 %)
74 European bat 1 lyssavirus (RV9; 9395GER 2007)
GCF_000870765.1		 5
(90.43 %)		 44.65
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 13
(1.08 %)		 0
(0.00 %)
75 European brown hare syndrome virus (EBHSV-GD 2000)
GCF_000857785.1		 2
(98.66 %)		 49.34
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 6
(0.79 %)		 1
(3.24 %)
76 Fathead minnow calicivirus (FHMCV/USA/MN/2012 2017)
GCF_002285005.1		 2
(98.66 %)		 50.67
(99.94 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 8
(1.25 %)		 3
(65.78 %)
77 Feline calicivirus (2023)
GCF_008767155.1		 2
(95.03 %)		 46.14
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 9
(1.22 %)		 0
(0.00 %)
78 Feline calicivirus (Urbana 2003)
GCF_000853345.1		 3
(100.00 %)		 45.17
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 3
(0.39 %)		 0
(0.00 %)
79 Fugong virus (FG10 2017)
GCF_002118945.1		 3
(93.43 %)		 36.93
(99.97 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 4
(0.38 %)		 n/a 15
(1.61 %)		 0
(0.00 %)
80 Gallid alphaherpesvirus 1 (SA-2 1999)
GCA_000847005.2		 90
(80.77 %)		 47.74
(99.98 %)		 n/a 14
(100.00 %)		 11
(0.22 %)		 9
(0.61 %)		 221
(1.97 %)		 23
(30.48 %)
81 Gallid alphaherpesvirus 3 (HPRS24 2000)
GCF_000838845.1		 78
(74.47 %)		 53.61
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 47
(1.57 %)		 60
(2.83 %)		 387
(6.28 %)		 1
(99.49 %)
82 GB virus C (1996)
GCF_000862005.1		 1
(91.81 %)		 59.09
(99.98 %)		 1
(0.01 %)		 2
(99.99 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 15
(1.67 %)		 2
(82.30 %)
83 GIII (Norovirus Bo/GIII.2/Adam/2006/No 2016)
GCF_001595675.1		 3
(99.14 %)		 57.11
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 4
(1.01 %)		 6
(36.84 %)
84 Goatpox virus (Pellor 2002)
GCF_000840165.1		 150
(93.15 %)		 25.31
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 51
(1.59 %)		 8
(0.24 %)		 1,548
(24.38 %)		 0
(0.00 %)
85 Goose calicivirus (N 2014)
GCF_000920715.1		 2
(97.15 %)		 54.67
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 2
(0.25 %)		 1
(41.13 %)
86 Hantaan orthohantavirus (76-118 2003)
GCF_000856085.1		 3
(94.17 %)		 38.56
(99.96 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 9
(0.78 %)		 0
(0.00 %)
87 Hantavirus (Z10 2004)
GCF_000855785.1		 3
(94.13 %)		 39.29
(99.96 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 4
(0.38 %)		 1
(0.30 %)		 14
(1.40 %)		 0
(0.00 %)
88 Heartland virus (Patient1 2014)
GCF_000922255.1		 4
(96.17 %)		 46.33
(99.94 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 4
(0.27 %)		 0
(0.00 %)
89 Heartland virus (TN 2023)
GCF_013086545.1		 4
(96.63 %)		 46.52
(99.94 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 3
(0.18 %)		 0
(0.00 %)
90 Hendra henipavirus (1998)
GCF_000852685.1		 9
(82.12 %)		 39.43
(99.98 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 5
(0.38 %)		 n/a 13
(0.75 %)		 0
(0.00 %)
91 Hepatitis B virus (2015)
GCF_000861825.2		 4
(55.31 %)		 48.46
(99.94 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 0
(0.00 %)		 1
(12.45 %)
92 Hepatitis C virus genotype 1 (H77 1997)
GCF_000861845.1		 3
(93.68 %)		 58.24
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 5
(1.33 %)		 6
(1.40 %)		 13
(2.88 %)		 1
(90.43 %)
93 Hepatitis delta virus (1993)
GCF_000856565.1		 2
(38.35 %)		 58.81
(99.88 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 1
(2.68 %)		 1
(3.63 %)		 1
(71.11 %)
94 Hepatovirus A (1993)
GCF_000860505.1		 3
(100.00 %)		 37.87
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.45 %)		 1
(0.47 %)		 1
(0.53 %)		 0
(0.00 %)
95 Hepatovirus A (2ID 2023)
GCA_008776015.1		 1
(89.26 %)		 33.72
(99.95 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.57 %)		 n/a 12
(3.99 %)		 0
(0.00 %)
96 Herpes simplex virus type 1 (17 1990)
GCF_000859985.2		 81
(86.40 %)		 68.30
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 81
(2.72 %)		 51
(2.90 %)		 932
(18.12 %)		 1
(100.00 %)
97 Herpes simplex virus type 1 (HSV-H15119 2019)
GCA_027936425.1		 80
(76.71 %)		 68.05
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2
(100.00 %)		 92
(2.63 %)		 60
(4.91 %)		 1,082
(18.73 %)		 1
(100.00 %)
98 human adenovirus 1 (2004)
GCF_000858645.1		 44
(91.94 %)		 55.26
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 12
(0.98 %)		 2
(0.11 %)		 103
(4.79 %)		 6
(70.17 %)
99 human adenovirus 2 (2004)
GCF_000859465.1		 42
(90.84 %)		 55.20
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 13
(0.89 %)		 1
(0.12 %)		 105
(4.66 %)		 5
(70.08 %)
100 human adenovirus 35 (2004)
GCF_000857885.1		 44
(93.67 %)		 48.88
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 8
(0.68 %)		 3
(0.30 %)		 80
(3.56 %)		 6
(39.41 %)
101 human adenovirus 5 (2004)
GCF_000857865.1		 42
(90.68 %)		 55.20
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 12
(0.95 %)		 n/a 99
(4.47 %)		 5
(69.88 %)
102 human adenovirus 54 (Kobe-H 2009)
GCF_000885675.1		 40
(91.15 %)		 54.91
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 9
(0.74 %)		 n/a 65
(2.61 %)		 3
(66.98 %)
103 human adenovirus 7 (2004)
GCF_000859485.1		 45
(92.24 %)		 51.27
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 9
(0.56 %)		 1
(1.54 %)		 61
(2.28 %)		 7
(43.72 %)
104 human alphaherpesvirus 2 (HG52 2013)
GCF_000858385.2		 86
(83.37 %)		 70.38
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 124
(3.80 %)		 64
(3.26 %)		 1,158
(23.65 %)		 1
(99.99 %)
105 human associated cyclovirus 10 (7078A 2014)
GCF_000918035.2		 2
(86.20 %)		 43.41
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 0
(0.00 %)		 0
(0.00 %)
106 human associated gemyvongvirus 1 (DB1 2015)
GCF_001448435.1		 4
(89.04 %)		 51.81
(99.91 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(1.89 %)		 1
(1.89 %)		 1
(2.24 %)		 1
(97.10 %)
107 human associated huchismacovirus 1 (Oregon/6/2011/GottageGrove/5A1 2018)
GCF_003033475.1		 2
(69.15 %)		 42.76
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 0
(0.00 %)		 0
(0.00 %)
108 human associated huchismacovirus 2 (France/8/2008/2444 2018)
GCF_003033485.1		 2
(69.81 %)		 43.97
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 1
(1.38 %)		 2
(0.57 %)		 0
(0.00 %)
109 human associated huchismacovirus 3 (France/1/2009/3664 2018)
GCF_003033495.1		 2
(70.27 %)		 42.28
(99.84 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 5
(1.79 %)		 0
(0.00 %)
110 human associated porprismacovirus 2 (SF2 2015)
GCF_000931315.1		 2
(74.85 %)		 48.83
(99.84 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 2
(0.55 %)		 1
(41.76 %)
111 human astrovirus (1993)
GCF_000861865.1		 3
(97.58 %)		 44.83
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.88 %)		 1
(1.34 %)		 9
(2.08 %)		 0
(0.00 %)
112 human astrovirus BF34 (BF34 2014)
GCF_000923215.1		 4
(97.29 %)		 43.77
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 3
(0.47 %)		 0
(0.00 %)
113 human betaherpesvirus 5 (Merlin 2004)
GCF_000845245.1		 194
(84.91 %)		 57.48
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 74
(1.33 %)		 28
(0.67 %)		 1,047
(7.96 %)		 1
(99.99 %)
114 human betaherpesvirus 6A (U1102 1995 refseq)
GCF_000845685.2		 115
(79.56 %)		 42.44
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 33
(1.67 %)		 36
(4.27 %)		 603
(9.83 %)		 3
(13.72 %)
115 human betaherpesvirus 6B (Z29 1999)
GCF_000846365.1		 128
(82.45 %)		 42.77
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 27
(1.57 %)		 20
(3.84 %)		 652
(8.84 %)		 6
(15.35 %)
116 human betaherpesvirus 7 (RK 1995)
GCF_000848125.1		 111
(79.51 %)		 36.22
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 16
(1.65 %)		 34
(8.04 %)		 791
(15.85 %)		 3
(5.14 %)
117 human bocavirus 2c PK (PK-5510 2009)
GCF_000882675.1		 4
(87.74 %)		 41.59
(99.98 %)		 1
(0.02 %)		 2
(99.98 %)		 5
(1.23 %)		 n/a 5
(0.98 %)		 0
(0.00 %)
118 human bocavirus 3 (W471 2009)
GCF_000882855.1		 4
(88.44 %)		 42.16
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 5
(1.95 %)		 1
(4.96 %)
119 human bocavirus 4 NI (HBoV4-NI-385 2009)
GCF_000886375.1		 6
(92.83 %)		 40.41
(99.92 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 5
(1.06 %)		 0
(0.00 %)
120 human circovirus VS6600022 (VS6600022 2014)
GCF_000924015.1		 4
(85.08 %)		 47.13
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.85 %)		 n/a 1
(0.25 %)		 2
(49.61 %)
121 human coronavirus 229E (2001)
GCF_000853505.1		 9
(97.14 %)		 38.26
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 5
(0.31 %)		 2
(0.29 %)		 57
(2.91 %)		 0
(0.00 %)
122 human coronavirus HKU1 (HKU1 2004)
GCF_000858765.1		 10
(98.07 %)		 32.06
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 8
(0.72 %)		 1
(1.60 %)		 89
(5.62 %)		 0
(0.00 %)
123 human coronavirus NL63 (Amsterdam I 2004)
GCF_000853865.1		 8
(97.86 %)		 34.46
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 9
(1.09 %)		 n/a 84
(5.24 %)		 0
(0.00 %)
124 human coronavirus OC43 (ATCC VR-759 2019)
GCF_003972325.1		 11
(97.82 %)		 36.79
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 6
(0.43 %)		 1
(0.09 %)		 90
(3.88 %)		 0
(0.00 %)
125 human cosavirus (Cosavirus_Amsterdam_1994 2014)
GCF_000920655.1		 1
(81.59 %)		 43.53
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 12
(1.59 %)		 0
(0.00 %)
126 human cosavirus B (HCoSV-B1 2263 2009)
GCF_000884955.1		 1
(88.49 %)		 43.79
(100.00 %)		 1
(0.01 %)		 2
(99.99 %)		 4
(0.47 %)		 n/a 6
(1.35 %)		 0
(0.00 %)
127 human cyclovirus VS5700009 (VS5700009 2013)
GCF_000908835.1		 3
(84.17 %)		 46.45
(99.89 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 1
(0.38 %)		 1
(13.92 %)
128 human DNA virus (IND-KIs-REVA-1990 2019)
GCF_003727435.1		 1
(6.26 %)		 53.36
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 6
(1.89 %)		 n/a 3
(0.59 %)		 1
(93.16 %)
129 human endogenous retrovirus K113 (2013)
GCF_000913595.1		 1
(22.17 %)		 41.86
(99.98 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 6
(1.60 %)		 n/a 14
(2.49 %)		 0
(0.00 %)
130 human enterovirus 71 HZ08/Hangzhou/2008 (HZ08 2011)
GCA_031128755.1		 1
(88.89 %)		 47.98
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 1
(0.14 %)		 1
(4.77 %)
131 human erythrovirus V9 (V9 2001)
GCF_000841965.1		 6
(90.67 %)		 42.09
(99.94 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 9
(1.75 %)		 0
(0.00 %)
132 human fecal virus Jorvi2 (Jorvi2 2017)
GCF_002219885.1		 5
(72.08 %)		 31.11
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 7
(5.43 %)		 n/a 20
(11.11 %)		 0
(0.00 %)
133 human fecal virus Jorvi3 (Jorvi3 2017)
GCF_002219525.1		 2
(84.04 %)		 32.53
(99.90 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 3
(1.60 %)		 0
(0.00 %)
134 human fecal virus Jorvi4 (Jorvi4 2017)
GCF_002219705.1		 2
(81.18 %)		 45.77
(99.87 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 1
(0.34 %)		 0
(0.00 %)
135 human feces pecovirus (PeCV-NI 2019)
GCF_003726995.1		 2
(72.77 %)		 50.00
(99.90 %)		 1
(0.03 %)		 2
(99.97 %)		 5
(2.46 %)		 n/a 0
(0.00 %)		 1
(55.12 %)
136 human feces smacovirus 2 (SmaCV2 2018)
GCF_003033575.1		 2
(74.86 %)		 46.00
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 2
(0.54 %)		 1
(19.22 %)
137 human feces smacovirus 3 (SmaCV3.21 P21 2017)
GCF_002271185.1		 2
(72.89 %)		 46.99
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(2.66 %)		 1
(1.56 %)		 4
(1.25 %)		 0
(0.00 %)
138 human gammaherpesvirus 8 (BCBL-1 2019)
GCA_027939675.1		 n/a 53.47
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 6
(0.10 %)		 29
(2.97 %)		 135
(3.68 %)		 8
(83.99 %)
139 human gammaherpesvirus 8 (GK18 2007)
GCF_000838265.1		 113
(85.53 %)		 53.76
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 10
(0.18 %)		 29
(2.88 %)		 151
(3.93 %)		 9
(84.42 %)
140 human gammaherpesvirus 8 (JSC-1 2009)
GCA_027939395.1		 102
(83.23 %)		 53.77
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 11
(1.00 %)		 29
(3.04 %)		 198
(4.58 %)		 9
(84.78 %)
141 human gammaherpesvirus 8 (JSC-1 2019)
GCA_027939375.1		 102
(83.23 %)		 53.78
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 11
(1.00 %)		 29
(3.04 %)		 198
(4.58 %)		 9
(84.78 %)
142 human gammaherpesvirus 8 (JSC-1 2021)
GCA_027939385.1		 102
(83.23 %)		 53.77
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 11
(1.00 %)		 29
(3.04 %)		 198
(4.58 %)		 9
(84.78 %)
143 human gammaherpesvirus 8 (UNC_BCBL-1 2022)
GCA_027939455.1		 114
(84.22 %)		 53.75
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 10
(0.18 %)		 29
(2.87 %)		 145
(3.86 %)		 9
(84.42 %)
144 human gemycircularvirus (GeTz1 2018)
GCF_002826025.1		 4
(77.38 %)		 49.05
(99.91 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 3
(1.23 %)		 0
(0.00 %)
145 human genital-associated circular DNA virus-1 (349 2015)
GCF_000973295.1		 4
(80.18 %)		 54.85
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 2
(1.21 %)		 1
(91.86 %)
146 human hepegivirus (AK-790 2018)
GCF_002821385.1		 1
(96.18 %)		 53.60
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 5
(0.51 %)		 2
(88.97 %)
147 human immunodeficiency virus 1 (1998)
GCF_000864765.1		 14
(93.78 %)		 42.11
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.57 %)		 1
(0.34 %)		 18
(3.29 %)		 1
(2.29 %)
148 human immunodeficiency virus 2 (BEN 1993)
GCF_000856385.1		 12
(84.81 %)		 45.66
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 1
(0.98 %)		 10
(1.44 %)		 0
(0.00 %)
149 human lung-associated vientovirus FB (2021)
GCF_013088445.1		 3
(86.49 %)		 33.94
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(1.15 %)		 1
(1.34 %)		 3
(6.81 %)		 0
(0.00 %)
150 human mastadenovirus A (2004)
GCF_000884295.1		 41
(94.00 %)		 46.52
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 8
(0.61 %)		 n/a 73
(3.33 %)		 6
(30.52 %)
151 human mastadenovirus A (Huie 1993)
GCF_000846805.1		 43
(94.41 %)		 46.52
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 8
(0.61 %)		 n/a 73
(3.33 %)		 6
(30.52 %)
152 human mastadenovirus B (GB 2008)
GCF_000880515.1		 48
(93.42 %)		 51.05
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 7
(0.47 %)		 1
(0.18 %)		 41
(1.61 %)		 7
(43.26 %)
153 human mastadenovirus B (Slobitski 2008)
GCF_000857085.1		 46
(93.74 %)		 48.88
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 10
(0.82 %)		 3
(0.30 %)		 50
(2.47 %)		 6
(39.41 %)
154 human mastadenovirus C (1993)
GCF_000845085.1		 63
(97.51 %)		 55.20
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 13
(0.89 %)		 1
(0.12 %)		 105
(4.66 %)		 5
(70.08 %)
155 human mastadenovirus D (2004)
GCF_000858625.1		 21
(47.83 %)		 56.58
(100.00 %)		 4
(0.01 %)		 5
(99.99 %)		 12
(1.24 %)		 n/a 61
(3.14 %)		 3
(66.84 %)
156 human mastadenovirus D (Hicks; NIAID V-209-003-014 2008)
GCF_000845985.1		 47
(93.93 %)		 57.10
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 10
(0.92 %)		 1
(0.13 %)		 59
(2.95 %)		 3
(67.41 %)
157 human mastadenovirus E (vaccine (CL 68578) 2001)
GCF_000859665.1		 40
(96.48 %)		 57.67
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 9
(0.65 %)		 n/a 107
(4.08 %)		 5
(73.25 %)
158 human mastadenovirus F (Dugan 1993)
GCF_000846685.1		 44
(94.91 %)		 51.22
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 6
(0.32 %)		 n/a 63
(2.23 %)		 1
(62.53 %)
159 human metapneumovirus (00-1 2018)
GCF_002815375.1		 9
(93.36 %)		 36.29
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 7
(1.38 %)		 1
(0.34 %)		 27
(3.46 %)		 0
(0.00 %)
160 human orthopneumovirus (2018)
GCF_002815475.1		 12
(97.34 %)		 33.24
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.64 %)		 1
(0.24 %)		 19
(3.32 %)		 0
(0.00 %)
161 human orthopneumovirus (B1 1997)
GCF_000855545.1		 10
(97.35 %)		 33.56
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 11
(1.61 %)		 2
(0.52 %)		 16
(3.21 %)		 0
(0.00 %)
162 human orthorubulavirus 2 (1991)
GCF_000863525.1		 8
(98.61 %)		 38.41
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 5
(0.38 %)		 n/a 6
(0.27 %)		 0
(0.00 %)
163 human papillomavirus (SE379 2015)
GCF_001274345.1		 6
(93.54 %)		 37.49
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 5
(0.98 %)		 1
(2.70 %)		 21
(3.02 %)		 0
(0.00 %)
164 human papillomavirus 103 (Qv33725 2006)
GCF_000868225.1		 6
(88.01 %)		 41.58
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.45 %)		 n/a 19
(3.06 %)		 0
(0.00 %)
165 human papillomavirus 108 (2009)
GCF_000883655.1		 5
(88.56 %)		 42.65
(99.94 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 9
(1.38 %)		 0
(0.00 %)
166 human papillomavirus 109 (2009)
GCF_000883695.1		 7
(92.87 %)		 38.28
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 5
(0.94 %)		 1
(0.48 %)		 19
(3.13 %)		 1
(3.23 %)
167 human papillomavirus 116 (HPV116 2009)
GCF_000884175.1		 7
(93.82 %)		 38.50
(99.94 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 3
(0.40 %)		 1
(4.73 %)
168 human papillomavirus 121 (NJ3301 2010)
GCF_000889075.1		 7
(92.45 %)		 37.74
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.41 %)		 n/a 9
(0.98 %)		 0
(0.00 %)
169 human papillomavirus 126 (HPV126 2011)
GCF_000896435.1		 7
(91.96 %)		 38.05
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 18
(2.68 %)		 1
(2.92 %)
170 human papillomavirus 127 (R3a 2010)
GCF_000890115.1		 8
(93.50 %)		 36.98
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 2
(0.79 %)		 18
(2.79 %)		 1
(3.20 %)
171 human papillomavirus 132 (27-50 2011)
GCF_000888015.1		 7
(93.36 %)		 37.94
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 12
(1.89 %)		 0
(0.00 %)
172 human papillomavirus 134 (39-65 2011)
GCF_000889695.1		 7
(92.69 %)		 38.14
(99.95 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 10
(1.48 %)		 0
(0.00 %)
173 human papillomavirus 135 (NJ3500 2012)
GCF_000898235.1		 7
(92.24 %)		 36.86
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 5
(1.56 %)		 1
(0.67 %)		 14
(2.77 %)		 0
(0.00 %)
174 human papillomavirus 136 (CL3865 2012)
GCF_000899695.1		 7
(91.83 %)		 38.51
(99.95 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.85 %)		 n/a 19
(3.31 %)		 0
(0.00 %)
175 human papillomavirus 140 (NJ2801C1 2012)
GCF_000898855.1		 7
(91.69 %)		 39.71
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.79 %)		 n/a 4
(1.28 %)		 0
(0.00 %)
176 human papillomavirus 154 (PV77 2013)
GCF_000908695.1		 7
(92.75 %)		 37.93
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 10
(1.37 %)		 0
(0.00 %)
177 human papillomavirus 161 (KC1 2018)
GCF_002826985.1		 6
(92.39 %)		 37.73
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 3
(0.36 %)		 0
(0.00 %)
178 human papillomavirus 163 (KC3 2015)
GCF_001430115.1		 6
(93.54 %)		 37.69
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 13
(1.80 %)		 0
(0.00 %)
179 human papillomavirus 166 (KC9 2012)
GCF_000899515.1		 6
(92.72 %)		 38.29
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 6
(0.79 %)		 0
(0.00 %)
180 human papillomavirus 167 (KC10 2013)
GCF_000913075.1		 6
(92.78 %)		 35.83
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 23
(5.24 %)		 0
(0.00 %)
181 human papillomavirus 172 (2018)
GCF_002827005.1		 7
(95.04 %)		 37.77
(99.96 %)		 1
(0.01 %)		 2
(99.99 %)		 5
(1.22 %)		 n/a 4
(0.60 %)		 0
(0.00 %)
182 human papillomavirus 175 (SE87 2018)
GCF_002827025.1		 7
(93.05 %)		 38.87
(99.99 %)		 1
(0.01 %)		 2
(99.99 %)		 4
(0.29 %)		 n/a 8
(1.00 %)		 1
(3.46 %)
183 human papillomavirus 178 (2014)
GCF_000918095.1		 7
(92.49 %)		 38.15
(99.95 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.53 %)		 2
(0.59 %)		 8
(1.35 %)		 0
(0.00 %)
184 human papillomavirus 179 (SIBX16 2013)
GCF_000912535.1		 6
(92.78 %)		 36.76
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.87 %)		 n/a 7
(1.67 %)		 0
(0.00 %)
185 human papillomavirus 18 (2000)
GCF_000865665.1		 8
(87.96 %)		 40.43
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.70 %)		 n/a 12
(3.67 %)		 0
(0.00 %)
186 human papillomavirus 184 (SIBX17 2018)
GCF_002987365.1		 6
(92.71 %)		 36.89
(99.95 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.98 %)		 1
(0.53 %)		 4
(0.40 %)		 0
(0.00 %)
187 human papillomavirus 187 (ACS447 2018)
GCF_003055605.1		 6
(92.85 %)		 38.90
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 10
(1.36 %)		 0
(0.00 %)
188 human papillomavirus 201 (HPV201 2015)
GCF_001184845.1		 7
(93.33 %)		 37.71
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.48 %)		 n/a 5
(0.95 %)		 0
(0.00 %)
189 human papillomavirus 203 (SE369 2019)
GCF_004133345.1		 7
(92.96 %)		 37.54
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.43 %)		 n/a 10
(1.33 %)		 0
(0.00 %)
190 human papillomavirus 204 (A342 2018)
GCF_002827045.1		 7
(92.47 %)		 37.84
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.50 %)		 n/a 6
(1.44 %)		 1
(2.92 %)
191 human papillomavirus 30 (2018)
GCF_002987345.1		 6
(84.46 %)		 40.39
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 5
(2.31 %)		 2
(1.03 %)		 14
(4.22 %)		 0
(0.00 %)
192 human papillomavirus 4 (1993)
GCF_000864845.1		 7
(92.18 %)		 38.53
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 5
(0.71 %)		 1
(0.35 %)		 23
(3.75 %)		 0
(0.00 %)
193 human papillomavirus 5 (1993)
GCF_000866505.1		 8
(92.64 %)		 42.39
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 9
(2.94 %)		 1
(0.39 %)		 13
(3.01 %)		 1
(7.11 %)
194 human papillomavirus 71 (2018)
GCF_002826825.1		 1
(24.06 %)		 44.38
(99.98 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 7
(2.47 %)		 3
(1.63 %)		 11
(3.93 %)		 0
(0.00 %)
195 human papillomavirus 9 (1993)
GCF_000863685.1		 7
(94.00 %)		 41.00
(99.95 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 5
(1.14 %)		 2
(0.93 %)		 13
(2.45 %)		 1
(4.63 %)
196 human papillomavirus KC5 (KC5 2015)
GCF_000989155.1		 7
(92.99 %)		 36.78
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 6
(0.71 %)		 0
(0.00 %)
197 human papillomavirus type 10 (1993)
GCF_000864905.1		 7
(84.68 %)		 45.89
(99.95 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 5
(1.78 %)		 n/a 16
(3.86 %)		 0
(0.00 %)
198 human papillomavirus type 101 (Qv23954 2006)
GCF_000869845.1		 6
(89.06 %)		 43.12
(99.94 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.33 %)		 n/a 5
(0.61 %)		 0
(0.00 %)
199 human papillomavirus type 112 (2009)
GCF_000882135.1		 7
(93.62 %)		 37.52
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 6
(0.73 %)		 1
(3.81 %)
200 human papillomavirus type 128 (2011)
GCF_000889675.1		 7
(92.33 %)		 35.98
(99.94 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 16
(3.18 %)		 0
(0.00 %)
201 human papillomavirus type 129 (2011)
GCF_000891495.1		 7
(93.07 %)		 37.31
(99.94 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.82 %)		 n/a 3
(0.35 %)		 0
(0.00 %)
202 human papillomavirus type 131 (27-49 2011)
GCF_000890535.1		 7
(93.15 %)		 37.03
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 17
(2.73 %)		 0
(0.00 %)
203 human papillomavirus type 137 (NJ2801H 2012)
GCF_000897255.1		 7
(93.60 %)		 37.57
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.32 %)		 n/a 16
(2.39 %)		 0
(0.00 %)
204 human papillomavirus type 144 (CL3740 2012)
GCF_000898255.1		 7
(92.09 %)		 38.23
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 9
(1.32 %)		 0
(0.00 %)
205 human papillomavirus type 156 (GC01 2017)
GCF_002006915.1		 7
(92.47 %)		 36.18
(99.95 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 13
(1.86 %)		 0
(0.00 %)
206 human papillomavirus type 16 (1993)
GCF_000863945.3		 11
(87.67 %)		 36.53
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 6
(3.26 %)		 1
(0.32 %)		 12
(4.50 %)		 0
(0.00 %)
207 human papillomavirus type 26 (1993)
GCF_000866485.1		 6
(84.85 %)		 38.60
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 8
(2.74 %)		 2
(0.45 %)		 14
(5.89 %)		 0
(0.00 %)
208 human papillomavirus type 32 (1993)
GCF_000864925.1		 6
(84.42 %)		 40.98
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.83 %)		 n/a 9
(1.96 %)		 0
(0.00 %)
209 human papillomavirus type 34 (1993)
GCF_000863965.1		 6
(85.10 %)		 38.25
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(2.33 %)		 3
(1.17 %)		 8
(3.52 %)		 0
(0.00 %)
210 human papillomavirus type 41 (1991)
GCF_000863845.1		 11
(90.82 %)		 46.94
(99.95 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.45 %)		 n/a 3
(0.28 %)		 1
(3.68 %)
211 human papillomavirus type 48 (1995)
GCF_000839365.1		 7
(93.41 %)		 36.76
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 1
(0.58 %)		 18
(3.61 %)		 1
(4.07 %)
212 human papillomavirus type 49 (1993)
GCF_000862825.1		 6
(93.19 %)		 41.11
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.81 %)		 n/a 11
(2.66 %)		 0
(0.00 %)
213 human papillomavirus type 50 (1995)
GCF_000841625.1		 7
(92.78 %)		 36.85
(99.94 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 1
(0.53 %)		 14
(2.00 %)		 0
(0.00 %)
214 human papillomavirus type 53 (1993)
GCF_000865685.1		 7
(66.96 %)		 40.14
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 6
(2.47 %)		 n/a 24
(6.16 %)		 0
(0.00 %)
215 human papillomavirus type 54 (1995)
GCF_000864725.1		 7
(84.57 %)		 41.88
(99.95 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 5
(2.32 %)		 n/a 9
(3.05 %)		 0
(0.00 %)
216 human papillomavirus type 60 (1995)
GCF_000838505.1		 7
(92.85 %)		 36.94
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.83 %)		 n/a 12
(2.15 %)		 1
(3.27 %)
217 human papillomavirus type 63 (1993)
GCF_000865565.1		 7
(91.55 %)		 40.44
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 5
(1.20 %)		 1
(0.59 %)		 5
(0.53 %)		 0
(0.00 %)
218 human papillomavirus type 6b (type 6b (HPV6b) 1985)
GCF_000861945.1		 9
(89.64 %)		 40.87
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(1.39 %)		 1
(0.76 %)		 15
(3.21 %)		 0
(0.00 %)
219 human papillomavirus type 7 (1993)
GCF_000861925.1		 6
(82.97 %)		 39.53
(99.98 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 6
(1.73 %)		 1
(0.59 %)		 13
(3.49 %)		 0
(0.00 %)
220 human papillomavirus type 85 (114B 2017)
GCF_002153865.1		 8
(90.54 %)		 37.76
(98.31 %)		 7
(1.95 %)		 8
(98.05 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 17
(4.34 %)		 0
(0.00 %)
221 human papillomavirus type 88 (2008)
GCF_000874925.1		 7
(92.19 %)		 40.11
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 1
(0.35 %)		 6
(0.71 %)		 1
(4.00 %)
222 human papillomavirus type 90 (2002)
GCF_000862685.1		 7
(82.73 %)		 46.65
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.95 %)		 n/a 10
(3.96 %)		 1
(2.53 %)
223 human papillomavirus type 92 (2003)
GCF_000846285.1		 7
(93.86 %)		 39.96
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 7
(2.48 %)		 3
(1.50 %)		 7
(2.92 %)		 1
(4.21 %)
224 human papillomavirus type 96 (2003)
GCF_000864825.1		 7
(97.38 %)		 40.31
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.81 %)		 n/a 21
(3.83 %)		 1
(4.33 %)
225 human parainfluenza virus 4a (M-25 2013)
GCF_000910675.1		 7
(83.27 %)		 36.23
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.23 %)		 1
(0.22 %)		 13
(1.18 %)		 0
(0.00 %)
226 human parechovirus 1 (2018)
GCF_002817305.1		 1
(89.15 %)		 39.06
(99.95 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 4
(1.29 %)		 0
(0.00 %)
227 human parvovirus 4 G1 (2005)
GCF_000861005.1		 2
(89.92 %)		 44.94
(99.94 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.87 %)		 2
(1.52 %)		 4
(0.70 %)		 1
(3.85 %)
228 human parvovirus B19 (J35 1999)
GCF_000839645.1		 6
(81.47 %)		 43.81
(99.98 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 4
(2.93 %)		 13
(4.72 %)		 2
(12.12 %)
229 human pegivirus 2 (UC0125.US 2015)
GCF_001310135.2		 1
(92.98 %)		 53.96
(99.98 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 6
(0.49 %)		 2
(90.06 %)
230 human picobirnavirus (Hy005102 2005)
GCF_000859285.1		 3
(92.15 %)		 46.02
(100.00 %)		 n/a 2
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 0
(0.00 %)		 0
(0.00 %)
231 human poliovirus strain (Sabin 1 2023)
GCA_008766755.1		 1
(89.10 %)		 46.26
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 2
(0.23 %)		 1
(7.15 %)
232 human polyomavirus 1 (1993)
GCF_000837865.1		 7
(89.15 %)		 39.53
(99.94 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 2
(2.45 %)		 13
(4.13 %)		 0
(0.00 %)
233 human polyomavirus 12 (hu1403 2013)
GCF_000906235.1		 6
(89.41 %)		 39.60
(99.94 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.64 %)		 1
(0.91 %)		 27
(6.74 %)		 0
(0.00 %)
234 human polyomavirus 3 (Stockholm 60 2007)
GCF_000873085.1		 6
(88.17 %)		 39.37
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 1
(0.85 %)		 26
(6.90 %)		 0
(0.00 %)
235 human polyomavirus 6 (607a 2010)
GCF_000888495.1		 6
(89.67 %)		 42.66
(99.98 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 5
(0.83 %)		 0
(0.00 %)
236 human polyomavirus 7 (713a 2010)
GCF_000889175.1		 6
(89.14 %)		 42.91
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 6
(1.25 %)		 0
(0.00 %)
237 human polyomavirus 9 (HPyV9 2011)
GCF_000891615.1		 6
(88.18 %)		 39.16
(99.98 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 20
(4.74 %)		 0
(0.00 %)
238 human respirovirus 1 (Washington 1964 2002)
GCF_000848705.1		 10
(99.19 %)		 37.24
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 7
(2.19 %)		 1
(0.25 %)		 4
(1.69 %)		 0
(0.00 %)
239 human respirovirus 3 (1998)
GCF_000850205.1		 9
(93.58 %)		 34.52
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 6
(1.09 %)		 n/a 11
(1.89 %)		 0
(0.00 %)
240 human rhinovirus NAT001 (NAT001 2018)
GCF_002816885.1		 1
(92.58 %)		 43.40
(99.94 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 0
(0.00 %)		 0
(0.00 %)
241 human rotavirus B (Bang373 2013)
GCF_000907835.1		 13
(95.17 %)		 36.97
(99.88 %)		 n/a 11
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 18
(1.22 %)		 0
(0.00 %)
242 human RSV respiratory syncytial virus A (S2 ts1C 2000)
GCF_000856445.1		 13
(98.68 %)		 33.21
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 6
(0.89 %)		 1
(0.26 %)		 23
(3.73 %)		 0
(0.00 %)
243 human smacovirus 1 (France/12/2008/3454 2015)
GCF_000929235.1		 2
(69.15 %)		 43.94
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 0
(0.00 %)		 0
(0.00 %)
244 human stool-associated circular virus NG13 (NG13 2018)
GCF_002819605.1		 2
(93.58 %)		 43.54
(99.76 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 2
(1.24 %)		 0
(0.00 %)
245 human T-cell leukemia virus type I (1993)
GCA_003102335.1		 3
(59.99 %)		 53.88
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 15
(2.55 %)		 3
(15.21 %)
246 human T-cell leukemia virus type I (1998)
GCF_000863585.1		 11
(81.17 %)		 53.47
(99.98 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.33 %)		 n/a 19
(2.50 %)		 2
(12.06 %)
247 human T-lymphotropic virus 2 (1993)
GCF_000847505.1		 9
(94.24 %)		 53.82
(99.98 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 5
(1.11 %)		 n/a 16
(2.41 %)		 2
(6.46 %)
248 human T-lymphotropic virus 4 (1863LE 2009)
GCF_000882595.1		 8
(77.85 %)		 56.28
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.51 %)		 n/a 30
(5.68 %)		 3
(16.69 %)
249 human TMEV-like cardiovirus (2008)
GCF_000875265.1		 3
(86.45 %)		 43.58
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 6
(0.84 %)		 0
(0.00 %)
250 I virus (Cowden 2000)
GCF_000849945.1		 2
(99.13 %)		 53.50
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 4
(0.57 %)		 1
(10.49 %)
251 Igbo Ora virus (IBH10964 1998)
GCA_002888815.1		 2
(95.47 %)		 48.08
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.42 %)		 1
(1.24 %)		 2
(0.48 %)		 5
(13.59 %)
252 Influenza A virus (A/California/07/2009 2015)
GCF_001343785.1		 14
(99.84 %)		 43.70
(99.90 %)		 4
(0.03 %)		 12
(99.97 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 11
(0.83 %)		 0
(0.00 %)
253 Influenza A virus (A/Goose/Guangdong/1/96H5N1 2005)
GCF_000864105.1		 15
(96.68 %)		 44.12
(99.93 %)		 n/a 8
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 3
(0.35 %)		 0
(0.00 %)
254 Influenza A virus (A/Hong Kong/1073/99 2003)
GCF_000851145.1		 12
(97.14 %)		 44.07
(99.90 %)		 n/a 8
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 10
(0.81 %)		 0
(0.00 %)
255 Influenza A virus (A/Korea/426/1968 2005)
GCF_000866645.1		 15
(97.49 %)		 43.41
(99.89 %)		 1
(0.01 %)		 9
(99.99 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 4
(0.28 %)		 0
(0.00 %)
256 Influenza A virus (A/New York/392/2004 2005)
GCF_000865085.1		 15
(96.37 %)		 42.94
(99.91 %)		 n/a 8
(100.00 %)		 4
(0.57 %)		 n/a 6
(0.33 %)		 0
(0.00 %)
257 Influenza A virus (A/Puerto Rico/8/1934 1982)
GCF_000865725.1		 15
(96.32 %)		 43.40
(99.90 %)		 n/a 8
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 7
(0.68 %)		 0
(0.00 %)
258 Influenza A virus (A/Shanghai/02/2013 2015)
GCF_000928555.1		 15
(99.34 %)		 44.36
(99.92 %)		 1
(0.01 %)		 9
(99.99 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 4
(0.30 %)		 0
(0.00 %)
259 Influenza B virus (B/Lee/1940 1993)
GCF_000820495.2		 11
(92.51 %)		 40.19
(99.88 %)		 n/a 8
(100.00 %)		 5
(0.51 %)		 n/a 23
(1.85 %)		 0
(0.00 %)
260 Influenza C virus (C/Ann Arbor/1/50 2004)
GCF_000856665.10		 11
(95.87 %)		 37.28
(99.91 %)		 n/a 7
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 42
(4.23 %)		 0
(0.00 %)
261 Isfahan virus (2013)
GCF_000906835.1		 5
(96.29 %)		 41.93
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 20
(1.82 %)		 0
(0.00 %)
262 Japanese encephalitis virus (1993)
GCF_000862145.1		 3
(93.83 %)		 51.43
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 2
(0.15 %)		 0
(0.00 %)
263 JC polyomavirus (Mad1 1993)
GCF_000863805.1		 9
(96.55 %)		 40.45
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 1
(3.82 %)		 17
(5.52 %)		 0
(0.00 %)
264 Jeju virus (10-11 2017)
GCF_002117615.1		 3
(93.96 %)		 36.20
(99.94 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 6
(1.02 %)		 1
(0.28 %)		 16
(2.20 %)		 0
(0.00 %)
265 Kenkeme virus (Fuyuan-Sr-326 2017)
GCF_002146025.1		 3
(95.18 %)		 37.73
(99.95 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 4
(0.26 %)		 n/a 16
(1.40 %)		 0
(0.00 %)
266 Kunjin virus (MRM61C 2023)
GCA_004786635.1		 1
(96.61 %)		 50.58
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 0
(0.00 %)		 1
(2.43 %)
267 Kyasanur Forest disease virus (2018)
GCF_002820625.1		 1
(98.80 %)		 55.20
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.38 %)		 n/a 1
(0.11 %)		 3
(6.73 %)
268 La Crosse virus (human/78 2002)
GCF_000850965.1		 4
(94.68 %)		 36.68
(99.95 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 4
(0.32 %)		 n/a 26
(2.75 %)		 0
(0.00 %)
269 La Crosse virus (LACV/human/1960 2023)
GCF_004789695.1		 4
(94.68 %)		 36.75
(99.96 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 4
(0.32 %)		 n/a 17
(1.56 %)		 0
(0.00 %)
270 Lagos bat lyssavirus (0406SEN 2013)
GCF_000905975.1		 5
(90.15 %)		 43.48
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 7
(0.41 %)		 0
(0.00 %)
271 Lake Victoria marburgvirus - Angola2005 (Ang1379c 2006)
GCA_031121245.1		 n/a 38.40
(99.98 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 13
(0.91 %)		 0
(0.00 %)
272 Lake Victoria marburgvirus - Ci67 (2007)
GCA_031121995.1		 n/a 38.45
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 5
(0.38 %)		 0
(0.00 %)
273 Lake Victoria marburgvirus - DRC1999 (07DRC99 2006)
GCA_031121255.1		 n/a 38.19
(99.98 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 12
(1.27 %)		 0
(0.00 %)
274 Lake Victoria marburgvirus - (Leiden 2011)
GCA_031129775.1		 7
(76.60 %)		 38.11
(99.98 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 5
(0.25 %)		 0
(0.00 %)
275 Langat virus (TP21 2000)
GCF_000860805.1		 1
(93.62 %)		 54.31
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 7
(0.56 %)		 1
(2.18 %)
276 Langya virus (SDQD_H1801 2022)
GCA_031319335.1		 9
(81.86 %)		 38.30
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.26 %)		 n/a 18
(1.31 %)		 0
(0.00 %)
277 Lassa mammarenavirus (Josiah 1998)
GCF_000851705.1		 4
(94.96 %)		 42.06
(99.94 %)		 n/a 2
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 1
(0.37 %)		 9
(1.70 %)		 0
(0.00 %)
278 Louping ill virus (369/T2 1997)
GCF_000863165.1		 1
(94.24 %)		 54.86
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 6
(0.52 %)		 3
(12.29 %)
279 Lumpy skin disease virus NI- (Neethling 2490 2001)
GCF_000839805.1		 156
(95.76 %)		 25.91
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 55
(1.76 %)		 20
(0.65 %)		 1,542
(23.51 %)		 0
(0.00 %)
280 Lymphocytic choriomeningitis mammarenavirus (Armstrong 53b 1993)
GCF_000851025.1		 4
(97.52 %)		 42.29
(99.99 %)		 n/a 2
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 1
(0.07 %)		 0
(0.00 %)
281 Machupo mammarenavirus (Carvallo 2003)
GCF_000853725.1		 4
(94.98 %)		 41.77
(99.95 %)		 n/a 2
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 4
(0.62 %)		 0
(0.00 %)
282 Mammarenavirus chapareense (810419 2008)
GCF_000879235.1		 4
(96.22 %)		 40.03
(99.96 %)		 n/a 2
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 4
(0.75 %)		 0
(0.00 %)
283 Mammarenavirus choriomeningitidis (Armstrong 53b 2023)
GCF_004789475.1		 4
(95.06 %)		 43.03
(99.96 %)		 n/a 2
(100.00 %)		 4
(1.05 %)		 1
(0.43 %)		 3
(1.37 %)		 1
(2.40 %)
284 Mammarenavirus guanaritoense (INH-95551 2003)
GCF_000853765.1		 4
(96.01 %)		 40.64
(99.96 %)		 n/a 2
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 4
(0.75 %)		 0
(0.00 %)
285 Mammarenavirus lassaense (Alzey 2016)
GCA_900094045.1		 4
(94.91 %)		 42.17
(99.98 %)		 n/a 2
(100.00 %)		 4
(0.33 %)		 2
(0.37 %)		 7
(1.51 %)		 0
(0.00 %)
286 Mammarenavirus lujoense (2009)
GCF_000885555.1		 4
(96.94 %)		 42.40
(99.93 %)		 n/a 2
(100.00 %)		 4
(0.40 %)		 n/a 7
(0.88 %)		 0
(0.00 %)
287 Marburg virus - Musoke, Kenya, 1980 (Musoke 2024)
GCA_000857325.3		 n/a 38.28
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 16
(1.05 %)		 0
(0.00 %)
288 Maporal virus (HV 97021050 2017)
GCF_002145825.3		 3
(92.24 %)		 38.51
(99.91 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 4
(0.25 %)		 1
(0.22 %)		 11
(1.32 %)		 0
(0.00 %)
289 Marburg marburgvirus (Marburg virus/H.sapiens-tc/KEN/1980/Mt. Elgon-Musoke 1994)
GCF_000857325.2		 7
(98.72 %)		 38.29
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 16
(1.05 %)		 0
(0.00 %)
290 Marmot norovirus (HT16 2019)
GCF_004130475.1		 1
(92.61 %)		 55.57
(99.95 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 1
(0.19 %)		 0
(0.00 %)
291 Mayaro virus (2002)
GCF_000863385.1		 5
(96.78 %)		 50.37
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 5
(0.76 %)		 n/a 4
(1.59 %)		 5
(42.02 %)
292 Measles morbillivirus (Ichinose-B95a 1998)
GCF_000854845.1		 7
(94.55 %)		 47.43
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 9
(0.91 %)		 1
(3.88 %)
293 Merkel cell polyomavirus (R17b 2008)
GCF_000874865.1		 5
(88.06 %)		 40.69
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 8
(1.78 %)		 0
(0.00 %)
294 Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (HCoV-EMC HCoV-EMC/2012 2012)
GCF_000901155.1		 12
(97.48 %)		 41.24
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.12 %)		 n/a 4
(0.14 %)		 0
(0.00 %)
295 Mink calicivirus (MCV-DL/2007/CN 2012)
GCF_000901135.1		 3
(95.62 %)		 45.47
(99.98 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.21 %)		 n/a 1
(0.21 %)		 0
(0.00 %)
296 Mokola lyssavirus (2004)
GCF_000856485.1		 5
(98.49 %)		 44.42
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 8
(0.73 %)		 0
(0.00 %)
297 Molluscum contagiosum virus subtype 1 (1996)
GCF_000843325.1		 163
(85.07 %)		 63.36
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 128
(3.25 %)		 92
(4.74 %)		 1,361
(17.29 %)		 1
(99.95 %)
298 Monkeypox virus (MPXV-M5312_HM12_Rivers 2022)
GCF_014621545.1		 179
(83.90 %)		 33.03
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 38
(0.78 %)		 22
(0.54 %)		 1,097
(9.44 %)		 0
(0.00 %)
299 Monkeypox virus (Zaire-96-I-16 2021)
GCF_000857045.1		 180
(84.71 %)		 33.09
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 37
(0.96 %)		 24
(0.57 %)		 1,102
(9.51 %)		 0
(0.00 %)
300 Mopeia Lassa virus reassortant 29 (ML29 IGS-15 2004)
GCF_000855745.1		 4
(95.68 %)		 43.06
(99.97 %)		 n/a 2
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 6
(1.48 %)		 0
(0.00 %)
301 Mumps orthorubulavirus (Miyahara 2000)
GCF_000856685.1		 8
(92.81 %)		 42.49
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.24 %)		 n/a 10
(0.59 %)		 0
(0.00 %)
302 Mupapillomavirus 1 (1982)
GCF_000866405.1		 7
(86.17 %)		 40.28
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 5
(1.47 %)		 1
(0.40 %)		 7
(1.87 %)		 1
(2.75 %)
303 Murine herpesvirus 68 (WUMS 2007)
GCA_000845665.1		 80
(90.74 %)		 47.23
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 7
(0.12 %)		 31
(3.40 %)		 69
(4.25 %)		 4
(4.97 %)
304 Murray Valley encephalitis virus (1999)
GCF_000863565.1		 3
(93.56 %)		 48.72
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 1
(0.23 %)		 1
(1.84 %)
305 Myxoma virus (Lausanne 2002)
GCF_000843685.1		 170
(95.89 %)		 43.56
(100.00 %)		 7
(0.00 %)		 8
(100.00 %)		 11
(0.16 %)		 15
(0.33 %)		 578
(5.25 %)		 0
(0.00 %)
306 Nebraska virus (NB 2002)
GCF_000851625.1		 2
(98.09 %)		 56.55
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.72 %)		 n/a 1
(0.30 %)		 2
(68.70 %)
307 Newbury agent 1 (2006)
GCF_000867125.1		 2
(98.08 %)		 56.20
(99.95 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 5
(1.19 %)		 n/a 3
(1.18 %)		 2
(62.74 %)
308 Nipah henipavirus (2000)
GCF_000863625.1		 11
(82.06 %)		 38.17
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.17 %)		 n/a 8
(0.37 %)		 0
(0.00 %)
309 Norovirus (dog/GVI.1/HKU_Ca026F/2007/HKG 2019)
GCF_007609015.1		 3
(97.97 %)		 56.44
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 8
(1.17 %)		 3
(66.91 %)
310 Norovirus GI (1993)
GCF_000864005.1		 3
(99.09 %)		 48.03
(99.95 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.52 %)		 1
(0.35 %)		 3
(0.31 %)		 0
(0.00 %)
311 Norovirus GI (Hu/BD/2011/GI.7PNA2/Dhaka1882 2019)
GCF_008704025.1		 3
(99.22 %)		 48.46
(99.95 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 3
(0.27 %)		 0
(0.00 %)
312 Norovirus GI (Hu/JP/1998/GI.6PNA4/No20-Saitama-98-17 2019)
GCF_008703965.1		 3
(98.91 %)		 49.94
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.56 %)		 n/a 3
(0.36 %)		 0
(0.00 %)
313 Norovirus GI (Hu/JP/2000/GI.6PNA1/WUG1 2019)
GCF_008703985.1		 3
(98.82 %)		 49.62
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.43 %)		 n/a 12
(1.55 %)		 0
(0.00 %)
314 Norovirus GI/Hu/JP/2007/GI.P3_GI.3/Shimizu/KK2866 (Shimizu/KK2866 2018)
GCF_003813225.1		 3
(99.03 %)		 48.57
(100.00 %)		 2
(0.03 %)		 3
(99.97 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 6
(0.56 %)		 1
(3.89 %)
315 Norovirus GII (Hu/GII.PNA4-GII.NA4/PNV06929/2008/PER 2019)
GCF_008711635.1		 3
(99.19 %)		 47.69
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 2
(0.29 %)		 0
(0.00 %)
316 Norovirus GII (NORO_176-1_17_12_2015 2019)
GCF_004193815.1		 3
(99.64 %)		 50.31
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 1
(0.13 %)		 0
(0.00 %)
317 Norovirus GII (NORO_226_06_01_2016 2018)
GCF_003638685.1		 3
(99.23 %)		 48.61
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 7
(0.86 %)		 0
(0.00 %)
318 Norovirus GII.17 (Hu/GII.P17_GII.17/KR/2015/CAU-267 2018)
GCF_003638645.1		 3
(99.14 %)		 48.14
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 5
(0.71 %)		 0
(0.00 %)
319 Norovirus GII.2 (BJSMQ 2018)
GCF_003638665.1		 3
(99.36 %)		 48.71
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 2
(0.19 %)		 0
(0.00 %)
320 Norovirus GII/Hu/JP/2007/GII.P15_GII.15/Sapporo/HK299 (Sapporo/HK299 2019)
GCF_007608995.1		 3
(99.01 %)		 49.25
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 3
(0.29 %)		 0
(0.00 %)
321 Norovirus GII/Hu/JP/2011/GII/Yuzawa/Gira2HS (Yuzawa/Gira2HS 2019)
GCF_007609035.1		 3
(98.91 %)		 48.63
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 3
(0.30 %)		 0
(0.00 %)
322 Norovirus GIV (CU081210E/USA/2010 2020)
GCF_010478905.1		 3
(98.55 %)		 58.56
(99.95 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 2
(0.28 %)		 1
(98.56 %)
323 Norovirus GIV (Hu/GIV.1/LakeMacquarie/NSW268O/2010/AU 2016)
GCF_001595715.1		 3
(98.88 %)		 50.71
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 3
(0.37 %)		 1
(3.69 %)
324 Norovirus GIV (Hu/US/2016/GIV.NA1PNA1/WI7002 2019)
GCF_008704005.1		 3
(99.96 %)		 51.14
(99.95 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 4
(0.55 %)		 1
(2.78 %)
325 Norovirus GV (Mu/NoV/GV/MNV1/2002/USA 2006)
GCF_000868425.1		 4
(98.92 %)		 56.72
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.42 %)		 n/a 5
(0.60 %)		 4
(18.84 %)
326 Norwalk-like virus (Hu/Norovirus/hiroshima/1999/JP9912-02F 2016)
GCF_001595695.1		 3
(99.32 %)		 50.06
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 2
(0.23 %)		 0
(0.00 %)
327 Omsk hemorrhagic fever virus (Bogoluvovska 2003)
GCF_000855505.1		 1
(94.98 %)		 53.64
(99.98 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 3
(0.20 %)		 0
(0.00 %)
328 Onyong-nyong virus (1993)
GCF_000863005.1		 5
(100.00 %)		 48.32
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 2
(1.28 %)		 7
(1.39 %)		 5
(15.80 %)
329 Onyong-nyong virus (SG650 2023)
GCF_002888795.1		 2
(95.47 %)		 48.09
(99.98 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.42 %)		 1
(1.22 %)		 4
(0.63 %)		 4
(13.44 %)
330 Orf virus (OV-SA00 ORFD 2004)
GCF_000844845.1		 130
(89.67 %)		 63.44
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 56
(2.03 %)		 37
(1.70 %)		 1,076
(16.55 %)		 1
(100.00 %)
331 Oropouche virus (2004)
GCF_000853785.1		 4
(97.72 %)		 35.40
(99.96 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 33
(3.75 %)		 0
(0.00 %)
332 Orthohantavirus asikkalaense (CZ/Beskydy/412/2010/Sm 2019)
GCF_002815935.1		 3
(93.28 %)		 38.58
(99.89 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 3
(0.33 %)		 0
(0.00 %)
333 Orthohantavirus bayoui (HV F0260003 2018)
GCF_002816435.1		 3
(91.68 %)		 39.50
(99.93 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 5
(0.48 %)		 n/a 11
(1.72 %)		 0
(0.00 %)
334 Orthohantavirus caobangense (3 2017)
GCF_002119025.1		 3
(93.00 %)		 36.66
(99.93 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 7
(1.60 %)		 2
(0.38 %)		 10
(1.22 %)		 0
(0.00 %)
335 Orthohantavirus delgaditoense (VHV-574 2017)
GCF_002145545.1		 3
(91.23 %)		 37.63
(99.97 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 4
(0.29 %)		 3
(0.77 %)		 6
(0.87 %)		 0
(0.00 %)
336 Orthohantavirus dobravaense (DOBV/Ano-Poroia/Afl9/1999 2003)
GCF_000863045.1		 3
(94.21 %)		 39.24
(99.96 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 5
(0.68 %)		 2
(0.46 %)		 13
(1.44 %)		 0
(0.00 %)
337 Orthohantavirus khabarovskense (Fuyuan-Mm-217 2017)
GCF_002146125.1		 3
(92.38 %)		 38.20
(99.98 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 5
(0.46 %)		 n/a 17
(1.58 %)		 0
(0.00 %)
338 Orthohantavirus montanoense (104/2006 2017)
GCF_002117715.1		 3
(91.77 %)		 36.28
(99.95 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 5
(1.70 %)		 15
(2.97 %)		 0
(0.00 %)
339 Orthohantavirus prospectense (PH-1 2018)
GCF_002994685.1		 2
(82.88 %)		 39.99
(99.95 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 4
(0.28 %)		 n/a 4
(0.55 %)		 0
(0.00 %)
340 Orthohantavirus robinaense (P17-14855 2021)
GCF_018594985.1		 3
(100.04 %)		 40.35
(99.96 %)		 5
(0.04 %)		 8
(99.96 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 7
(0.54 %)		 0
(0.00 %)
341 Orthohantavirus sangassouense (SA14 2017)
GCF_002145925.1		 3
(93.52 %)		 38.80
(99.97 %)		 1
(0.01 %)		 4
(99.99 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 11
(1.29 %)		 0
(0.00 %)
342 Orthohantavirus sinnombreense (NM H10 2003)
GCF_000854765.1		 4
(90.70 %)		 38.42
(99.94 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 5
(0.95 %)		 5
(1.33 %)		 11
(1.93 %)		 0
(0.00 %)
343 Orthohantavirus sinnombreense (NM R11 2023)
GCF_002830985.1		 3
(90.70 %)		 38.39
(99.98 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 5
(0.95 %)		 5
(1.33 %)		 11
(1.91 %)		 0
(0.00 %)
344 Orthohantavirus tatenalense (Upton_Heath 2021)
GCF_018595015.1		 3
(100.00 %)		 38.26
(99.98 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 14
(1.55 %)		 0
(0.00 %)
345 Orthohantavirus tulaense (Moravia/5302v/95 2003)
GCF_000855225.1		 4
(92.64 %)		 38.04
(99.95 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 5
(0.94 %)		 n/a 9
(0.58 %)		 0
(0.00 %)
346 Orthohepevirus A (Xinjiang 1993)
GCF_000861105.1		 3
(98.65 %)		 57.95
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 12
(1.80 %)		 1
(89.53 %)
347 Orthomarburgvirus marburgense (Ravn virus/H.sapiens-tc/KEN/1987/Kitum Cave-810040 2014)
GCF_000943645.1		 n/a 37.76
(99.98 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.17 %)		 n/a 21
(1.20 %)		 0
(0.00 %)
348 Parainfluenza virus 5 (W3A 2004)
GCF_000854805.1		 9
(99.06 %)		 42.27
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.24 %)		 n/a 3
(0.30 %)		 0
(0.00 %)
349 Paramecium bursaria Chlorella virus 1 (2011)
GCF_000847045.1		 814
(95.11 %)		 39.97
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 75
(0.98 %)		 146
(4.42 %)		 1,227
(8.76 %)		 23
(3.04 %)
350 Parechovirus A (Gregory 1998)
GCF_000861505.1		 1
(89.00 %)		 39.48
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.30 %)		 n/a 6
(0.98 %)		 0
(0.00 %)
351 Pichinde virus (AN3739 2004)
GCF_000856465.1		 4
(96.57 %)		 41.84
(99.94 %)		 n/a 2
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 2
(0.44 %)		 0
(0.00 %)
352 Poliovirus 2 (Lansing 2023)
GCA_003108605.1		 1
(89.03 %)		 46.71
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 1
(0.13 %)		 1
(4.73 %)
353 Poliovirus 3 (2023)
GCA_008766715.1		 1
(89.09 %)		 46.90
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 1
(0.11 %)		 1
(5.49 %)
354 Potato leafroll virus (2000)
GCF_000856725.1		 9
(93.42 %)		 49.46
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 1
(1.30 %)		 0
(0.00 %)		 1
(9.72 %)
355 Potato leafroll virus (Canada 2023)
GCF_021461725.1		 n/a 49.44
(99.95 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 1
(1.33 %)		 1
(0.17 %)		 1
(9.89 %)
356 Powassan virus (LB 1993)
GCF_000860485.1		 1
(94.55 %)		 53.32
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 14
(1.20 %)		 1
(3.47 %)
357 Primate norovirus (SimianNoV-nj 2016)
GCF_001755385.1		 3
(97.68 %)		 48.57
(99.96 %)		 1
(0.01 %)		 2
(99.99 %)		 6
(1.52 %)		 1
(0.43 %)		 7
(1.64 %)		 0
(0.00 %)
358 Pseudomonas phage phi6 (S2 2006)
GCA_002966185.1		 12
(78.79 %)		 55.86
(99.94 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 6
(0.40 %)		 3
(97.30 %)
359 Punta Toro virus (Adames 2018)
GCF_002815115.1		 4
(92.61 %)		 40.36
(99.94 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 5
(1.74 %)		 3
(0.77 %)		 16
(3.35 %)		 0
(0.00 %)
360 Punta Toro virus (PAN472868 2015)
GCA_001021295.1		 4
(92.38 %)		 39.48
(99.92 %)		 1
(0.01 %)		 4
(99.99 %)		 4
(0.98 %)		 8
(1.26 %)		 8
(2.86 %)		 0
(0.00 %)
361 Puumala orthohantavirus (Sotkamo 2003)
GCF_000854405.1		 3
(39.37 %)		 36.97
(99.98 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 5
(0.66 %)		 n/a 33
(3.47 %)		 0
(0.00 %)
362 Rabbit calicivirus Australia 1 (MIC-07 2008)
GCF_000882575.1		 2
(99.12 %)		 47.88
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 0
(0.00 %)		 1
(3.68 %)
363 Rabbit hemorrhagic disease virus (FRG 2000)
GCF_000861285.1		 2
(99.09 %)		 50.20
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.61 %)		 1
(0.56 %)		 8
(1.18 %)		 0
(0.00 %)
364 Rabbit vesivirus (2006)
GCF_000867805.1		 3
(96.54 %)		 47.74
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(1.01 %)		 1
(1.01 %)		 8
(1.87 %)		 2
(7.00 %)
365 Rabies lyssavirus (1993)
GCF_000859625.1		 5
(95.29 %)		 45.10
(99.98 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 11
(1.15 %)		 0
(0.00 %)
366 Reticuloendotheliosis virus (HA9901 2005)
GCF_000858025.1		 3
(81.69 %)		 52.71
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 5
(0.86 %)		 2
(1.01 %)		 9
(1.35 %)		 3
(8.85 %)
367 Rhinovirus A (1993)
GCF_000862245.1		 1
(90.81 %)		 39.05
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 1
(0.15 %)		 0
(0.00 %)
368 Rift Valley fever virus (ZH-548 2010)
GCF_000847345.1		 4
(95.24 %)		 45.11
(99.97 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 4
(0.49 %)		 n/a 8
(1.04 %)		 0
(0.00 %)
369 Rockport virus (MSB57412 2018)
GCF_002830685.1		 3
(92.73 %)		 35.05
(99.96 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 5
(0.71 %)		 n/a 22
(1.83 %)		 0
(0.00 %)
370 Rosavirus A2 (GA7403 2014)
GCF_000918175.1		 1
(82.95 %)		 51.41
(99.99 %)		 1
(0.01 %)		 2
(99.99 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 5
(0.67 %)		 1
(4.60 %)
371 Ross River virus (NB5092 1993)
GCF_000862165.1		 5
(96.96 %)		 51.41
(99.90 %)		 20
(0.47 %)		 20
(99.53 %)		 4
(0.90 %)		 n/a 4
(1.54 %)		 8
(48.39 %)
372 Rotavirus A (RVA/Simian-tc/ZAF/SA11-H96/1958/G3P5B[2] 2008)
GCF_000880735.1		 12
(94.00 %)		 33.67
(99.88 %)		 n/a 11
(100.00 %)		 4
(0.19 %)		 n/a 21
(1.24 %)		 0
(0.00 %)
373 Rotavirus C (Bristol 2005)
GCF_000864225.1		 11
(95.04 %)		 31.63
(99.89 %)		 n/a 11
(100.00 %)		 7
(1.19 %)		 n/a 33
(2.72 %)		 0
(0.00 %)
374 Rubella virus (F-Therien 1993)
GCF_000863025.1		 2
(99.15 %)		 69.60
(99.98 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 5
(0.85 %)		 n/a 54
(9.70 %)		 1
(98.66 %)
375 Saint Louis encephalitis virus (Kern217 2005)
GCF_000866785.1		 1
(94.09 %)		 49.75
(100.00 %)		 1
(0.01 %)		 2
(99.99 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 9
(1.35 %)		 1
(3.05 %)
376 Salivirus NG-J1 (NG-J1 2009)
GCF_000886535.1		 1
(89.26 %)		 56.70
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 17
(2.15 %)		 2
(48.16 %)
377 San Miguel sea lion virus 8 (2014)
GCF_000925155.1		 3
(98.48 %)		 51.28
(99.95 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 1
(0.14 %)		 3
(47.28 %)
378 Sandfly fever Naples virus (Toscana ISS.Phl.3 2004)
GCF_000854285.1		 4
(98.01 %)		 44.60
(99.94 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 4
(0.30 %)		 n/a 13
(2.02 %)		 0
(0.00 %)
379 Sapovirus (Hu/Dresden/pJG-Sap01/DE 2004)
GCF_000854265.1		 3
(98.76 %)		 50.63
(99.95 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 7
(1.06 %)		 1
(3.94 %)
380 Sapovirus (Hu/GI/Sapporo/MT-2010/1982 2023)
GCF_008792745.1		 3
(98.75 %)		 50.70
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 7
(1.09 %)		 1
(5.79 %)
381 Sapovirus (Mc10 2004)
GCF_000853825.1		 2
(98.38 %)		 51.46
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 1
(0.13 %)		 0
(0.00 %)
382 Sapovirus C12 (C12 2004)
GCF_000855765.1		 2
(98.27 %)		 51.73
(99.99 %)		 1
(0.01 %)		 2
(99.99 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 1
(0.13 %)		 2
(7.50 %)
383 Sapovirus Hu/Nagoya/NGY-1/2012/JPN (Hu/SaV/Nagoya/NGY-1/2012/JPN 2015)
GCF_001008475.1		 2
(98.47 %)		 49.71
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.60 %)		 n/a 0
(0.00 %)		 0
(0.00 %)
384 SARS coronavirus Tor2 (Tor2 2003)
GCF_000864885.1		 16
(97.60 %)		 40.76
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.08 %)		 n/a 18
(0.74 %)		 0
(0.00 %)
385 Semliki Forest virus (1987)
GCF_000860285.1		 4
(96.64 %)		 53.22
(99.98 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.66 %)		 n/a 4
(1.46 %)		 1
(92.56 %)
386 Seoul orthohantavirus (80-39 2003)
GCF_000855645.1		 3
(93.29 %)		 39.00
(99.96 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 5
(0.56 %)		 n/a 14
(1.15 %)		 0
(0.00 %)
387 Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus (HNXH 2019)
GCF_003087855.1		 4
(98.45 %)		 48.84
(99.98 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 4
(0.21 %)		 n/a 5
(0.39 %)		 0
(0.00 %)
388 Sheeppox virus (TU-V02127 2002)
GCF_000840205.1		 148
(93.28 %)		 25.01
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 46
(1.32 %)		 13
(0.59 %)		 1,524
(24.28 %)		 0
(0.00 %)
389 Simian foamy virus (1994)
GCF_000848485.1		 6
(78.31 %)		 38.96
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 5
(0.50 %)		 n/a 7
(0.57 %)		 0
(0.00 %)
390 Sindbis virus (1993)
GCF_000860545.1		 5
(100.00 %)		 50.91
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.34 %)		 n/a 3
(0.28 %)		 1
(93.38 %)
391 Singapore grouper iridovirus (2004)
GCF_000846905.1		 162
(89.23 %)		 48.64
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 10
(0.23 %)		 26
(2.80 %)		 285
(4.52 %)		 1
(0.16 %)
392 smallpox virus (India-1967, ssp. major Ind3 1993)
GCF_000859885.1		 197
(87.60 %)		 32.73
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 31
(0.69 %)		 7
(0.57 %)		 1,031
(9.09 %)		 0
(0.00 %)
393 Snowshoe hare virus (2021)
GCF_004789895.1		 4
(96.87 %)		 37.25
(99.93 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 5
(0.83 %)		 n/a 15
(1.23 %)		 0
(0.00 %)
394 Steller sea lion vesivirus (V1415 SSL2004-250F 2008)
GCF_000879655.1		 3
(97.56 %)		 48.57
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 1
(1.29 %)		 10
(1.29 %)		 3
(13.70 %)
395 Suid alphaherpesvirus 1 (PRV-MdBio PRV-MdBio 2017)
GCA_900230325.1		 170
(86.10 %)		 73.56
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2
(100.00 %)		 202
(7.85 %)		 166
(7.32 %)		 1,126
(32.56 %)		 1
(99.40 %)
396 Tick-borne encephalitis virus (2000)
GCF_000863125.1		 1
(91.96 %)		 53.78
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.48 %)		 1
(0.44 %)		 7
(0.87 %)		 2
(7.65 %)
397 Tick-borne encephalitis virus (Vasilchenko 2023)
GCA_004788235.1		 1
(93.76 %)		 54.70
(99.98 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 6
(0.45 %)		 4
(9.01 %)
398 Torque teno virus 1 (VT416 1998)
GCF_000857545.1		 5
(70.74 %)		 49.06
(99.95 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.80 %)		 n/a 17
(6.93 %)		 2
(35.41 %)
399 Tulane virus (2019)
GCF_004786795.1		 3
(98.38 %)		 46.66
(99.94 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 2
(0.21 %)		 0
(0.00 %)
400 Tupaia hepatovirus A (TN1 2016)
GCF_001502175.1		 1
(90.12 %)		 39.41
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.63 %)		 n/a 2
(0.97 %)		 0
(0.00 %)
401 Turkey calicivirus (L11043 2019)
GCF_004786995.1		 2
(98.47 %)		 50.01
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 0
(0.00 %)		 2
(7.99 %)
402 Turkey herpesvirus (FC126 Burmester 2001)
GCF_000839725.1		 84
(78.98 %)		 47.56
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 13
(0.36 %)		 14
(1.60 %)		 256
(2.38 %)		 0
(0.00 %)
403 Uukuniemi virus (2003)
GCF_000851865.1		 4
(96.08 %)		 47.69
(99.94 %)		 n/a 3
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 6
(0.86 %)		 0
(0.00 %)
404 Vaccinia virus (WR (Western Reserve) 2005)
GCF_000860085.1		 223
(88.80 %)		 33.34
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 26
(0.57 %)		 10
(3.43 %)		 744
(9.15 %)		 0
(0.00 %)
405 Varicella-zoster virus (Dumas 1987)
GCF_000858285.1		 74
(89.36 %)		 46.02
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 14
(0.32 %)		 17
(0.92 %)		 421
(5.39 %)		 1
(0.20 %)
406 Venezuelan equine encephalitis virus (1993)
GCF_000862105.1		 6
(100.00 %)		 50.12
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.27 %)		 1
(0.30 %)		 6
(1.47 %)		 4
(15.75 %)
407 Venezuelan equine encephalitis virus (Trinidad donkey donkey/Trinidad/1943 2023)
GCF_002889695.1		 4
(100.00 %)		 49.79
(99.98 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 5
(0.51 %)		 1
(0.30 %)		 6
(1.28 %)		 4
(12.87 %)
408 Vesicular exanthema of swine virus (2000)
GCF_000847705.1		 3
(97.55 %)		 47.83
(99.95 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 7
(0.86 %)		 1
(3.04 %)
409 Vesicular stomatitis Indiana virus (1993)
GCF_000850045.1		 4
(91.34 %)		 41.74
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 8
(0.60 %)		 0
(0.00 %)
410 vesivirus (Hom-1 2017)
GCF_002118765.1		 3
(97.57 %)		 48.33
(99.95 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 1
(0.10 %)		 1
(3.05 %)
411 Vesivirus ferret badger/JX12/China/2012 (FBCV-JX12 2015)
GCF_001019935.1		 3
(98.23 %)		 45.18
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 1
(0.14 %)		 0
(0.00 %)
412 Walrus calicivirus (2003)
GCF_000852525.1		 3
(97.71 %)		 48.23
(99.95 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 4
(0.49 %)		 3
(9.51 %)
413 West Nile virus (956 1993)
GCF_000861085.1		 3
(93.90 %)		 51.06
(99.98 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 2
(0.19 %)		 3
(7.47 %)
414 West Nile virus (NY99 385-99 2007)
GCF_000875385.1		 5
(93.41 %)		 51.17
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 1
(0.07 %)		 1
(2.23 %)
415 Western equine encephalitis virus (71V-1658 2000)
GCF_000850885.1		 4
(96.79 %)		 49.21
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 1
(0.64 %)		 3
(52.96 %)
416 Western equine encephalitis virus (AG80-646 2023)
GCF_002889215.1		 2
(96.04 %)		 48.32
(99.98 %)		 8
(0.07 %)		 9
(99.93 %)		 4
(0.29 %)		 n/a 5
(1.46 %)		 3
(7.08 %)
417 WU Polyomavirus (B0 2007)
GCF_000870785.1		 6
(85.79 %)		 39.18
(99.92 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(1.03 %)		 1
(0.71 %)		 16
(3.46 %)		 0
(0.00 %)
418 Yaba monkey tumor virus (2003)
GCF_000845705.1		 140
(94.29 %)		 29.83
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 24
(0.67 %)		 6
(0.47 %)		 1,223
(18.16 %)		 0
(0.00 %)
419 Yaba-like disease virus (2001)
GCF_000847185.1		 152
(95.76 %)		 27.00
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 39
(1.06 %)		 10
(0.44 %)		 1,396
(21.09 %)		 0
(0.00 %)
420 Yellow fever virus (17D vaccine strain 1986)
GCF_000857725.1		 1
(100.00 %)		 49.72
(99.98 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.27 %)		 n/a 1
(0.28 %)		 0
(0.00 %)
421 Zaire ebolavirus (Ebola virus/H.sapiens-tc/COD/1976/Yambuku-Mayinga 1999)
GCF_000848505.1		 11
(95.31 %)		 41.07
(99.98 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 4
(0.18 %)		 n/a 4
(0.15 %)		 1
(1.12 %)
422 Zika virus (MR 766 2009)
GCF_000882815.3		 1
(95.05 %)		 50.95
(99.96 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 3
(0.26 %)		 0
(0.00 %)
423 Zika virus (Natal RGN 2017)
GCF_002366285.1		 1
(95.04 %)		 51.26
(99.97 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 n/a 2
(0.18 %)		 0
(0.00 %)
TOTALS:total assembly count 423

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