Mammals Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of mammals only.

See also: hub access, assembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 aardvark (SDZICR_OR568_19922 2012 Broad)
GCF_000298275.1		 25,607
(1.08 %)		 18,351
(1.06 %)		 20,358
(0.98 %)		 n/a 40.07
(76.89 %)		 411,144
(23.15 %)		 433,653
(76.85 %)		 n/a 536,700
(0.74 %)		 18,176,790
(39.08 %)		 26,235
(0.40 %)
2 African grass rat (maternal 2020)
GCA_011750645.1		 n/a 20,916
(2.01 %)		 19,513
(1.43 %)		 n/a 41.37
(98.89 %)		 1,526
(1.11 %)		 1,610
(100.00 %)		 4,928,847
(37.45 %)		 1,652,295
(5.20 %)		 13,507,965
(32.27 %)		 17,712
(0.51 %)
3 African grass rat (paternal 2020)
GCA_011762545.1		 n/a 20,796
(2.00 %)		 19,611
(1.43 %)		 n/a 41.42
(97.70 %)		 1,563
(2.30 %)		 1,740
(100.00 %)		 4,904,243
(37.25 %)		 1,672,608
(5.37 %)		 13,465,246
(32.19 %)		 17,677
(0.50 %)
4 African grass rat (paternal X 2020)
GCF_011762505.1		 45,963
(2.46 %)		 20,878
(1.99 %)		 19,613
(1.43 %)		 37,929
(2.32 %)		 41.39
(99.19 %)		 1,624
(0.81 %)		 1,595
(100.00 %)		 4,939,557
(37.33 %)		 1,674,970
(5.40 %)		 13,613,429
(32.71 %)		 17,767
(0.51 %)
5 African hunting dog
GCA_001887905.1		 n/a 18,956
(1.75 %)		 17,562
(1.41 %)		 n/a 40.98
(92.89 %)		 1,415,298
(7.28 %)		 803
(100.00 %)		 4,458,183
(39.99 %)		 658,637
(1.13 %)		 13,671,493
(28.24 %)		 47,644
(1.64 %)
6 African savanna elephant (2009 refseq)
GCF_000001905.1		 46,043
(2.30 %)		 19,169
(1.26 %)		 19,664
(1.10 %)		 n/a 40.76
(97.57 %)		 93,514
(2.45 %)		 95,866
(97.55 %)		 6,363,315
(57.54 %)		 365,797
(0.88 %)		 16,073,053
(44.89 %)		 33,513
(0.68 %)
7 African savanna elephant (hap1 mLoxAfr1 2023)
GCA_030020305.1		 n/a 18,845
(1.07 %)		 22,426
(1.10 %)		 n/a 41.34
(99.85 %)		 169
(0.15 %)		 1,253
(99.85 %)		 4,406,744
(29.55 %)		 925,868
(4.71 %)		 15,966,881
(50.49 %)		 68,531
(1.61 %)
8 African savanna elephant (hap2 2023)
GCF_030014295.1		 64,034
(3.35 %)		 18,980
(1.10 %)		 21,593
(1.06 %)		 n/a 41.25
(99.90 %)		 231
(0.10 %)		 879
(100.00 %)		 4,426,749
(29.95 %)		 832,904
(4.08 %)		 16,118,888
(49.47 %)		 62,314
(1.49 %)
9 African savanna elephant (hap2 mLoxAfr1 2023)
GCA_030014295.1		 n/a 18,981
(1.10 %)		 22,759
(1.12 %)		 n/a 41.25
(99.90 %)		 231
(0.10 %)		 880
(100.00 %)		 4,426,756
(29.95 %)		 832,908
(4.08 %)		 16,118,910
(49.47 %)		 62,315
(1.49 %)
10 agile gracile mouse opossum
GCF_016433145.1		 30,697
(1.32 %)		 17,361
(0.78 %)		 17,596
(0.81 %)		 n/a 37.86
(91.75 %)		 85,142
(8.25 %)		 60,714
(100.00 %)		 7,917,577
(49.04 %)		 1,054,566
(1.57 %)		 22,701,659
(37.69 %)		 27,301
(0.49 %)
11 alpaca (v3.2 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U)
GCF_000164845.4		 54,987
(3.56 %)		 18,439
(1.93 %)		 18,426
(1.63 %)		 n/a 41.40
(95.85 %)		 166,272
(4.17 %)		 77,389
(100.00 %)		 3,004,413
(33.17 %)		 315,092
(1.36 %)		 12,458,272
(24.89 %)		 54,502
(1.38 %)
12 Alpine marmot (2019)
GCF_001458135.2		 69,587
(3.43 %)		 19,047
(1.54 %)		 17,768
(1.39 %)		 n/a 39.80
(96.13 %)		 88,858
(3.88 %)		 14,031
(100.00 %)		 3,726,252
(26.48 %)		 746,953
(1.83 %)		 14,066,368
(30.30 %)		 30,191
(0.63 %)
13 Alvarez's mastiff bat (A012 2023)
GCA_031001765.1		 n/a 19,086
(1.55 %)		 22,040
(1.52 %)		 n/a 42.18
(99.99 %)		 1,182
(0.01 %)		 1,369
(99.99 %)		 3,846,728
(31.78 %)		 639,852
(2.90 %)		 11,937,936
(38.98 %)		 75,377
(2.21 %)
14 Alvarez's mastiff bat (hap1 2024)
GCA_037157525.1		 n/a 18,980
(1.50 %)		 22,394
(1.50 %)		 n/a 42.30
(100.00 %)		 80
(0.00 %)		 326
(100.00 %)		 3,896,863
(31.56 %)		 659,711
(4.74 %)		 11,945,162
(40.81 %)		 76,769
(2.57 %)
15 Alvarez's mastiff bat (hap2 2024)
GCA_037176705.1		 n/a 19,066
(1.48 %)		 22,356
(1.48 %)		 n/a 42.25
(100.00 %)		 75
(0.00 %)		 287
(100.00 %)		 3,908,607
(31.48 %)		 664,931
(5.23 %)		 11,892,191
(41.08 %)		 76,453
(2.43 %)
16 American beaver (Ward 2017 refseq)
GCF_001984765.1		 40,013
(2.15 %)		 20,867
(1.53 %)		 24,201
(1.33 %)		 n/a 39.72
(99.99 %)		 3,321
(0.01 %)		 21,157
(100.00 %)		 4,526,430
(33.75 %)		 486,353
(1.30 %)		 14,347,145
(31.96 %)		 23,046
(0.72 %)
17 American bison (2014 refseq)
GCF_000754665.1		 38,686
(2.34 %)		 19,782
(1.47 %)		 20,444
(1.25 %)		 n/a 41.82
(93.12 %)		 341,984
(6.92 %)		 470,415
(93.08 %)		 n/a 419,596
(0.95 %)		 13,519,877
(37.66 %)		 60,388
(1.03 %)
18 American black bear (L20-20 alternate hap 2022)
GCA_024610745.1		 n/a 22,502
(1.17 %)		 43,431
(1.28 %)		 n/a 43.14
(99.99 %)		 n/a 77,311
(100.00 %)		 4,587,986
(32.30 %)		 773,829
(6.39 %)		 14,594,034
(35.67 %)		 78,849
(3.32 %)
19 American black bear (L20-20 primary hap 2022)
GCA_024610735.1		 n/a 18,458
(1.52 %)		 21,049
(1.43 %)		 n/a 42.93
(100.00 %)		 22
(0.00 %)		 317
(100.00 %)		 4,000,508
(32.69 %)		 641,903
(5.91 %)		 13,210,530
(35.54 %)		 68,981
(3.00 %)
20 American black bear (UA15103 2021)
GCF_020975775.1		 53,916
(3.11 %)		 18,840
(1.73 %)		 20,969
(1.50 %)		 n/a 42.09
(100.00 %)		 n/a 2,213
(100.00 %)		 3,936,528
(34.53 %)		 594,864
(2.90 %)		 13,725,005
(32.35 %)		 62,580
(1.91 %)
21 American mink (2018)
GCA_900108605.1		 n/a 18,686
(1.70 %)		 20,016
(1.50 %)		 36,997
(1.74 %)		 41.60
(92.95 %)		 154,172
(7.07 %)		 161,347
(92.93 %)		 4,350,343
(38.70 %)		 606,128
(1.17 %)		 13,605,797
(28.74 %)		 54,199
(1.98 %)
22 American mink (M4711 2021 Dalhousie U)
GCF_020171115.1		 50,253
(2.26 %)		 18,949
(1.49 %)		 20,914
(1.29 %)		 n/a 42.26
(100.00 %)		 n/a 183
(100.00 %)		 4,705,680
(39.15 %)		 795,684
(5.50 %)		 14,085,357
(37.99 %)		 63,307
(2.38 %)
23 American pika (hap1 2023)
GCF_030435755.1		 45,008
(1.93 %)		 17,997
(1.35 %)		 23,185
(1.49 %)		 n/a 44.16
(100.00 %)		 432
(0.00 %)		 5,864
(100.00 %)		 4,126,248
(43.60 %)		 628,344
(15.71 %)		 11,100,962
(42.69 %)		 60,350
(1.67 %)
24 American pika (hap2 2023)
GCA_030435715.1		 n/a 16,911
(1.23 %)		 21,107
(1.43 %)		 n/a 44.43
(100.00 %)		 375
(0.00 %)		 6,123
(100.00 %)		 1,808,768
(10.42 %)		 561,106
(21.05 %)		 10,283,513
(45.97 %)		 54,919
(1.33 %)
25 American pika 3.0 (2012 Broad refseq)
GCF_000292845.1		 26,253
(1.93 %)		 17,576
(1.61 %)		 20,076
(1.70 %)		 n/a 43.35
(87.20 %)		 122,542
(12.82 %)		 132,962
(87.18 %)		 2,761,257
(29.47 %)		 414,896
(1.07 %)		 10,968,698
(26.71 %)		 44,652
(1.14 %)
26 American pika 4.0 (UAM:Mamm:113957 2020)
GCF_014633375.1		 31,887
(1.92 %)		 17,532
(1.60 %)		 19,609
(1.65 %)		 n/a 43.35
(87.14 %)		 124,941
(12.88 %)		 9,351
(100.00 %)		 2,827,662
(29.77 %)		 414,980
(1.07 %)		 10,969,165
(26.69 %)		 44,743
(1.13 %)
27 Amur tiger (TaeGuk 2013 refseq)
GCF_000464555.1		 33,681
(2.23 %)		 17,929
(1.49 %)		 15,090
(1.29 %)		 n/a 41.40
(97.59 %)		 155,553
(2.44 %)		 157,032
(97.56 %)		 n/a 831,136
(1.67 %)		 13,654,437
(31.78 %)		 65,229
(1.60 %)
28 Antarctic minke whale
GCA_000978805.1		 n/a 23,312
(1.49 %)		 45,535
(1.26 %)		 n/a 40.73
(99.37 %)		 299,456
(0.64 %)		 720,900
(99.36 %)		 4,011,313
(41.13 %)		 504,837
(1.04 %)		 13,553,641
(30.96 %)		 56,223
(1.31 %)
29 Antillean ghost-faced bat
GCA_004026545.1		 n/a 20,088
(1.74 %)		 31,558
(1.63 %)		 n/a 41.74
(99.97 %)		 1,835
(0.01 %)		 207,094
(99.99 %)		 3,025,044
(30.67 %)		 332,606
(0.70 %)		 12,504,556
(28.79 %)		 65,503
(2.30 %)
30 aoudad
GCA_002201775.1		 n/a 19,905
(1.62 %)		 27,488
(1.60 %)		 n/a 42.01
(95.96 %)		 186,672
(4.05 %)		 263,992
(95.95 %)		 5,418,013
(45.05 %)		 471,426
(1.19 %)		 13,396,252
(36.94 %)		 48,844
(1.32 %)
31 Arabian camel (Drom800 2019 refseq)
GCF_000803125.2		 64,519
(3.85 %)		 18,483
(1.89 %)		 20,554
(1.62 %)		 n/a 41.51
(99.22 %)		 47,342
(0.79 %)		 21,070
(100.00 %)		 3,233,022
(34.07 %)		 345,049
(1.55 %)		 13,383,050
(26.19 %)		 58,872
(1.79 %)
32 Arabian camel (hap2 2024)
GCA_036321565.1		 n/a 17,085
(1.73 %)		 19,317
(1.59 %)		 n/a 41.75
(100.00 %)		 210
(0.00 %)		 173
(100.00 %)		 2,818,446
(29.44 %)		 316,646
(8.90 %)		 11,192,133
(31.47 %)		 52,135
(1.67 %)
33 Arabian camel (mCamDro1 2024)
GCF_036321535.1		 62,940
(3.46 %)		 18,078
(1.66 %)		 21,071
(1.56 %)		 n/a 41.64
(100.00 %)		 195
(0.00 %)		 171
(100.00 %)		 3,040,467
(29.22 %)		 343,480
(10.93 %)		 11,796,955
(33.50 %)		 55,427
(1.61 %)
34 Arabian camel (paternal 2024)
GCA_036321535.1		 n/a 18,080
(1.66 %)		 20,345
(1.52 %)		 n/a 41.64
(100.00 %)		 195
(0.00 %)		 172
(100.00 %)		 3,040,473
(29.22 %)		 343,482
(10.93 %)		 11,797,012
(33.50 %)		 55,428
(1.61 %)
35 Arctic fox (Blue_001 2021 refseq)
GCF_018345385.1		 60,759
(3.11 %)		 19,942
(1.72 %)		 19,529
(1.38 %)		 n/a 41.27
(100.00 %)		 529
(0.00 %)		 929
(100.00 %)		 4,821,229
(41.22 %)		 1,006,124
(2.31 %)		 13,556,149
(32.92 %)		 49,997
(2.23 %)
36 Arctic ground squirrel
GCF_003426925.1		 39,569
(2.25 %)		 18,954
(1.74 %)		 19,372
(1.45 %)		 n/a 39.95
(89.51 %)		 2,429,461
(10.59 %)		 15,883
(100.00 %)		 4,400,304
(32.67 %)		 672,831
(1.50 %)		 13,913,477
(26.41 %)		 27,575
(0.72 %)
37 Asian palm civet
GCA_004024585.1		 n/a 22,124
(1.43 %)		 43,710
(1.39 %)		 n/a 42.52
(99.95 %)		 4,533
(0.02 %)		 442,658
(99.98 %)		 4,877,367
(40.32 %)		 754,440
(1.35 %)		 14,557,779
(32.29 %)		 148,246
(5.67 %)
38 Asiatic elephant (mEleMax1 alternate hap 2022)
GCA_024166345.1		 n/a 17,906
(1.18 %)		 21,966
(1.14 %)		 n/a 41.14
(100.00 %)		 n/a 6,361
(100.00 %)		 3,818,524
(29.72 %)		 533,426
(3.22 %)		 14,381,781
(47.30 %)		 50,264
(1.15 %)
39 Asiatic elephant (mEleMax1 primary hap 2022)
GCF_024166365.1		 61,202
(2.60 %)		 18,887
(1.13 %)		 21,194
(1.06 %)		 n/a 41.14
(99.90 %)		 126
(0.10 %)		 64
(100.00 %)		 4,358,470
(31.27 %)		 663,094
(4.56 %)		 16,261,778
(48.66 %)		 69,120
(1.32 %)
40 Asiatic mouflon (Amuf_v1 2020)
GCA_014523465.1		 n/a 19,569
(1.59 %)		 21,293
(1.35 %)		 n/a 41.97
(99.68 %)		 257
(0.32 %)		 128
(100.00 %)		 5,390,761
(47.15 %)		 451,837
(1.15 %)		 13,157,608
(40.67 %)		 44,158
(1.19 %)
41 Asiatic tapir (hap1 2023)
GCA_031878655.1		 n/a 18,969
(1.75 %)		 20,207
(1.36 %)		 n/a 41.25
(100.00 %)		 79
(0.00 %)		 262
(100.00 %)		 3,650,963
(38.06 %)		 355,322
(2.63 %)		 14,837,952
(31.37 %)		 37,174
(1.87 %)
42 Asiatic tapir (hap2 2023)
GCA_031878705.1		 n/a 18,931
(1.76 %)		 19,988
(1.37 %)		 n/a 41.16
(100.00 %)		 92
(0.00 %)		 193
(100.00 %)		 3,632,286
(38.21 %)		 350,074
(2.22 %)		 14,785,531
(30.90 %)		 36,699
(1.70 %)
43 ass (Dezhou 2021)
GCF_016077325.2		 84,046
(4.01 %)		 18,838
(1.75 %)		 20,239
(1.42 %)		 69,689
(3.29 %)		 41.42
(99.86 %)		 1,922
(0.15 %)		 50
(100.00 %)		 3,840,509
(41.57 %)		 319,943
(0.81 %)		 14,889,114
(29.46 %)		 41,082
(1.37 %)
44 ass (Maral har 2015 refseq)
GCF_001305755.1		 48,989
(3.12 %)		 18,838
(1.78 %)		 19,295
(1.44 %)		 n/a 41.28
(98.63 %)		 69,593
(1.38 %)		 2,167
(100.00 %)		 3,731,432
(40.84 %)		 289,737
(0.96 %)		 14,695,308
(28.58 %)		 40,025
(1.06 %)
45 Australian echidna (mTacAcu1 alternate hap 2020)
GCA_015852515.1		 n/a 13,505
(1.03 %)		 18,978
(1.47 %)		 n/a 45.32
(99.98 %)		 26
(0.02 %)		 3,482
(100.00 %)		 6,880,857
(41.88 %)		 1,099,932
(7.47 %)		 8,156,735
(56.68 %)		 70,515
(2.88 %)
46 Australian echidna (mTacAcu1 primary hap 2020)
GCF_015852505.1		 42,938
(2.28 %)		 14,891
(1.01 %)		 19,714
(1.45 %)		 n/a 45.30
(98.61 %)		 524
(1.39 %)		 310
(100.00 %)		 7,814,876
(42.89 %)		 1,219,764
(6.93 %)		 9,488,325
(55.68 %)		 78,364
(2.73 %)
47 Bactrian camel (Alxa 2014 refseq)
GCF_000767855.1		 52,178
(3.64 %)		 18,303
(1.98 %)		 17,097
(1.64 %)		 n/a 41.32
(99.32 %)		 31,980
(0.69 %)		 67,435
(99.31 %)		 2,966,704
(34.06 %)		 306,997
(0.95 %)		 12,209,949
(25.43 %)		 49,790
(1.25 %)
48 banded mongoose
GCA_004023785.1		 n/a 21,568
(1.57 %)		 30,427
(1.43 %)		 n/a 42.00
(99.96 %)		 4,510
(0.02 %)		 316,874
(99.98 %)		 4,768,524
(40.51 %)		 684,187
(1.30 %)		 13,713,756
(33.42 %)		 78,648
(2.80 %)
49 bank vole
GCF_902806735.1		 56,410
(2.99 %)		 18,977
(1.71 %)		 18,408
(1.50 %)		 n/a 41.86
(98.62 %)		 53,506
(1.39 %)		 54,142
(98.61 %)		 3,222,366
(21.59 %)		 933,697
(2.20 %)		 12,831,232
(31.50 %)		 18,784
(0.42 %)
50 banner-tailed kangaroo rat
GCF_019054845.1		 43,753
(1.82 %)		 18,397
(1.18 %)		 24,180
(1.39 %)		 n/a 40.83
(100.00 %)		 n/a 2,026
(100.00 %)		 5,587,719
(30.97 %)		 1,363,513
(3.95 %)		 12,128,920
(48.74 %)		 36,371
(1.27 %)
51 banteng 2023
GCF_032452875.1		 71,974
(3.56 %)		 19,305
(1.36 %)		 21,174
(1.20 %)		 n/a 42.79
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 1,518
(100.00 %)		 3,344,481
(20.63 %)		 1,039,571
(11.74 %)		 13,031,356
(47.36 %)		 73,031
(1.72 %)
52 bats A.intermedius (hap1 2024)
GCA_038363145.1		 n/a 18,022
(1.56 %)		 19,824
(1.51 %)		 n/a 42.28
(100.00 %)		 81
(0.00 %)		 419
(100.00 %)		 2,827,417
(26.82 %)		 371,479
(4.97 %)		 11,603,093
(34.64 %)		 71,574
(2.28 %)
53 bats A.intermedius (hap2 2024)
GCA_038363225.1		 n/a 17,124
(1.63 %)		 18,342
(1.54 %)		 n/a 42.25
(100.00 %)		 56
(0.00 %)		 187
(100.00 %)		 2,597,378
(26.81 %)		 332,733
(4.43 %)		 10,957,327
(33.52 %)		 63,688
(2.22 %)
54 beluga whale (Cook Inlet, Alaska, USA DL-CIB17-05 2020)
GCA_009917745.1		 n/a 19,239
(1.79 %)		 22,513
(1.43 %)		 35,878
(1.82 %)		 41.25
(97.57 %)		 27,070
(2.43 %)		 52,780
(97.57 %)		 4,021,599
(43.53 %)		 544,323
(1.08 %)		 12,738,162
(33.47 %)		 59,710
(1.51 %)
55 beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v3 2019)
GCF_002288925.2		 59,400
(3.08 %)		 18,667
(1.79 %)		 20,314
(1.43 %)		 n/a 41.24
(98.49 %)		 24,414
(1.52 %)		 29,444
(98.48 %)		 4,001,248
(43.73 %)		 543,276
(1.11 %)		 12,802,735
(34.18 %)		 59,307
(1.53 %)
56 big brown bat (BU_THK_EF1 2012)
GCF_000308155.1		 59,162
(3.17 %)		 18,334
(1.94 %)		 20,121
(1.78 %)		 n/a 42.93
(89.41 %)		 160,269
(10.62 %)		 167,057
(89.38 %)		 2,842,065
(25.82 %)		 614,712
(1.89 %)		 10,407,733
(28.90 %)		 66,720
(2.99 %)
57 big brown bat (TK198812 2023)
GCF_027574615.1		 46,266
(2.61 %)		 18,620
(1.80 %)		 21,271
(1.72 %)		 n/a 43.51
(100.00 %)		 75
(0.00 %)		 48
(100.00 %)		 3,041,145
(25.08 %)		 904,075
(3.80 %)		 10,530,666
(37.05 %)		 77,605
(3.68 %)
58 bighorn sheep
GCA_004026945.1		 n/a 23,059
(1.34 %)		 36,486
(1.19 %)		 n/a 43.20
(99.90 %)		 9,412
(0.03 %)		 1,057,548
(99.97 %)		 6,321,577
(50.75 %)		 716,846
(1.66 %)		 13,904,326
(44.98 %)		 95,564
(1.72 %)
59 black flying fox
GCF_000325575.1		 46,978
(3.15 %)		 18,089
(2.00 %)		 20,668
(1.75 %)		 n/a 39.74
(97.93 %)		 104,566
(2.08 %)		 170,164
(97.92 %)		 2,975,186
(34.05 %)		 481,859
(1.45 %)		 12,582,349
(26.52 %)		 62,483
(3.88 %)
60 black rat
GCF_011064425.1		 39,601
(2.37 %)		 20,793
(1.98 %)		 17,944
(1.37 %)		 n/a 42.14
(99.98 %)		 6,158
(0.02 %)		 2,173
(100.00 %)		 4,715,157
(41.57 %)		 1,432,294
(3.45 %)		 13,275,550
(32.36 %)		 18,055
(0.48 %)
61 black rhinoceros (BS38 2019 Broad)
GCA_004027315.1		 n/a 21,713
(1.32 %)		 32,731
(1.18 %)		 n/a 41.22
(99.85 %)		 7,256
(0.02 %)		 2,029,914
(99.98 %)		 4,618,655
(36.76 %)		 618,834
(2.21 %)		 16,248,532
(40.32 %)		 44,113
(0.97 %)
62 black rhinoceros (mBicDic1 alternate hap 2021)
GCA_020826835.1		 n/a 19,000
(1.37 %)		 22,547
(1.26 %)		 n/a 41.56
(99.97 %)		 178
(0.03 %)		 1,199
(100.00 %)		 4,340,245
(37.22 %)		 564,468
(8.07 %)		 14,384,523
(40.40 %)		 44,971
(1.16 %)
63 black rhinoceros (mBicDic1 primary hap 2021)
GCF_020826845.1		 56,255
(2.28 %)		 18,774
(1.38 %)		 22,348
(1.26 %)		 n/a 41.59
(99.95 %)		 215
(0.05 %)		 1,076
(100.00 %)		 4,200,390
(36.22 %)		 548,030
(8.34 %)		 14,347,693
(40.14 %)		 43,525
(1.14 %)
64 black-footed cat
GCA_004023925.1		 n/a 22,895
(1.14 %)		 51,789
(1.13 %)		 n/a 41.92
(99.90 %)		 13,476
(0.06 %)		 603,600
(99.94 %)		 5,261,265
(44.11 %)		 943,514
(1.77 %)		 13,681,435
(34.77 %)		 86,892
(2.23 %)
65 black-footed ferret (SB6536 2022)
GCF_022355385.1		 56,402
(2.78 %)		 18,681
(1.55 %)		 20,685
(1.40 %)		 n/a 41.55
(96.71 %)		 33,042
(3.30 %)		 20,575
(100.00 %)		 4,087,717
(30.94 %)		 695,805
(1.18 %)		 13,880,116
(32.08 %)		 54,060
(2.11 %)
66 black-lipped pika
GCF_017591425.1		 46,297
(2.64 %)		 18,529
(1.63 %)		 23,458
(1.83 %)		 n/a 43.71
(100.00 %)		 54
(0.00 %)		 2,214
(100.00 %)		 1,843,705
(12.62 %)		 471,798
(2.76 %)		 11,394,992
(31.27 %)		 63,124
(1.85 %)
67 Blainville's beaked whale (alternate hap 2022)
GCA_025094165.1		 n/a 17,838
(1.54 %)		 21,389
(1.35 %)		 n/a 41.71
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 5,198
(100.00 %)		 3,542,727
(35.35 %)		 650,369
(8.86 %)		 10,971,320
(41.15 %)		 62,389
(1.68 %)
68 Blainville's beaked whale (primary hap 2022 refseq)
GCF_025265405.1		 47,540
(2.07 %)		 19,041
(1.52 %)		 20,766
(1.27 %)		 n/a 41.70
(99.97 %)		 97
(0.03 %)		 74
(100.00 %)		 3,964,038
(35.29 %)		 765,957
(8.74 %)		 12,128,229
(41.78 %)		 70,851
(1.80 %)
69 blue whale (alternate hap JJ_BM4_2016_0621 2019)
GCA_008658375.1		 n/a 17,285
(1.80 %)		 21,295
(1.43 %)		 n/a 41.22
(100.00 %)		 n/a 12,574
(100.00 %)		 3,196,354
(43.47 %)		 467,194
(1.26 %)		 10,176,588
(33.66 %)		 56,916
(1.85 %)
70 Blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 alternate hap 2020)
GCA_008658375.2		 n/a 16,997
(1.82 %)		 20,609
(1.44 %)		 n/a 41.20
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 10,999
(100.00 %)		 3,126,800
(43.49 %)		 454,452
(1.23 %)		 9,916,868
(33.63 %)		 55,436
(1.85 %)
71 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v3 primary hap 2020)
GCF_009873245.2		 58,750
(2.71 %)		 19,162
(1.80 %)		 20,576
(1.41 %)		 36,291
(1.99 %)		 40.88
(98.91 %)		 886
(1.09 %)		 106
(100.00 %)		 3,986,870
(44.21 %)		 579,629
(1.22 %)		 12,858,384
(34.60 %)		 67,032
(1.73 %)
72 bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 alternate hap 2022)
GCA_022079275.1		 n/a 24,877
(1.23 %)		 48,382
(1.39 %)		 n/a 42.05
(99.98 %)		 4,716
(0.01 %)		 72,827
(99.99 %)		 6,403,412
(33.31 %)		 1,269,531
(1.94 %)		 17,771,689
(33.82 %)		 100,915
(3.00 %)
73 bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 primary hap 2022)
GCF_022079265.1		 45,362
(2.39 %)		 18,576
(1.65 %)		 20,510
(1.41 %)		 n/a 41.80
(100.00 %)		 24
(0.00 %)		 75
(100.00 %)		 4,970,082
(43.28 %)		 894,002
(1.80 %)		 13,648,384
(34.21 %)		 69,211
(2.68 %)
74 boreal woodland reindeer (boreal CA-31 2023)
GCA_019903745.2		 n/a 20,135
(1.60 %)		 22,598
(1.47 %)		 n/a 41.46
(96.98 %)		 34,682
(3.03 %)		 12,266
(100.00 %)		 3,134,107
(24.41 %)		 394,920
(0.92 %)		 13,154,929
(36.43 %)		 48,826
(1.07 %)
75 Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 alternate hap 2022)
GCA_024803775.1		 n/a 18,647
(0.96 %)		 23,998
(1.13 %)		 n/a 41.67
(100.00 %)		 124
(0.00 %)		 3,340
(100.00 %)		 3,775,862
(22.40 %)		 1,257,803
(21.71 %)		 9,347,543
(61.85 %)		 33,757
(1.35 %)
76 Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 primary hap 2022)
GCA_024803745.1		 n/a 17,791
(1.12 %)		 22,667
(1.29 %)		 n/a 41.66
(100.00 %)		 106
(0.00 %)		 2,898
(100.00 %)		 6,293,452
(41.30 %)		 1,076,688
(17.94 %)		 8,553,272
(57.13 %)		 31,102
(1.31 %)
77 Botta's pocket gopher (hap1 2023)
GCA_031878675.1		 n/a 18,247
(1.61 %)		 22,673
(1.83 %)		 n/a 41.12
(99.99 %)		 775
(0.01 %)		 835
(100.00 %)		 2,918,285
(18.64 %)		 868,090
(5.77 %)		 9,427,604
(40.78 %)		 27,049
(1.25 %)
78 Botta's pocket gopher (hap2 2023)
GCA_031878665.1		 n/a 17,612
(1.68 %)		 22,099
(1.91 %)		 n/a 41.23
(99.99 %)		 541
(0.01 %)		 365
(100.00 %)		 2,748,918
(17.16 %)		 827,542
(4.51 %)		 8,832,809
(39.20 %)		 26,416
(1.35 %)
79 boutu (hap1 2024)
GCA_036417435.1		 n/a 18,667
(1.46 %)		 20,817
(1.26 %)		 n/a 42.07
(100.00 %)		 284
(0.00 %)		 903
(100.00 %)		 4,004,895
(35.23 %)		 925,158
(12.15 %)		 11,999,784
(42.65 %)		 63,428
(1.55 %)
80 boutu (hap2 2024)
GCA_036417475.1		 n/a 17,954
(1.51 %)		 19,994
(1.30 %)		 n/a 42.02
(100.00 %)		 240
(0.00 %)		 800
(100.00 %)		 3,723,164
(34.96 %)		 809,880
(11.02 %)		 11,359,211
(41.42 %)		 60,067
(1.55 %)
81 Brandt's bat
GCF_000412655.1		 46,912
(2.84 %)		 19,267
(1.75 %)		 18,495
(1.62 %)		 n/a 42.59
(94.06 %)		 155,664
(5.95 %)		 325,414
(94.05 %)		 2,897,662
(25.08 %)		 634,208
(3.20 %)		 11,323,618
(31.06 %)		 66,749
(1.59 %)
82 Brazilian free-tailed bat (primary hap 2023)
GCA_030848825.1		 n/a 19,039
(1.66 %)		 21,660
(1.59 %)		 n/a 42.29
(100.00 %)		 20
(0.00 %)		 148
(100.00 %)		 3,805,818
(31.80 %)		 640,446
(2.50 %)		 11,793,353
(36.15 %)		 68,896
(2.40 %)
83 Brazilian guinea pig
GCA_000688575.1		 n/a 16,531
(1.49 %)		 11,177
(1.44 %)		 n/a 39.81
(64.76 %)		 2,565,595
(35.61 %)		 3,131
(100.00 %)		 2,529,479
(25.87 %)		 342,907
(0.66 %)		 10,719,517
(21.05 %)		 19,508
(0.31 %)
84 Brazilian tapir
GCA_004025025.1		 n/a 21,581
(1.61 %)		 30,818
(1.32 %)		 n/a 41.12
(99.93 %)		 2,273
(0.01 %)		 805,779
(99.99 %)		 3,877,938
(38.36 %)		 344,032
(0.79 %)		 15,601,710
(32.81 %)		 43,382
(1.17 %)
85 brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v2 2018)
GCF_003584765.2		 50,242
(2.92 %)		 18,811
(1.77 %)		 21,073
(1.52 %)		 n/a 41.84
(99.31 %)		 17,380
(0.70 %)		 21,813
(99.30 %)		 4,201,043
(40.86 %)		 567,586
(1.23 %)		 13,807,211
(30.86 %)		 62,125
(1.80 %)
86 brown bear (v2.0 North America Adak 2023)
GCF_023065955.2		 66,371
(4.20 %)		 18,615
(1.68 %)		 21,434
(1.53 %)		 n/a 42.29
(100.00 %)		 250
(0.00 %)		 362
(100.00 %)		 4,030,019
(33.22 %)		 630,008
(4.17 %)		 13,240,060
(32.92 %)		 64,814
(2.05 %)
87 brown big-eared bat (primary hap 2023)
GCA_963455305.1		 n/a 19,138
(1.72 %)		 20,370
(1.54 %)		 n/a 43.08
(99.99 %)		 1,237
(0.01 %)		 65
(100.00 %)		 3,201,470
(26.24 %)		 957,903
(4.27 %)		 10,687,995
(39.65 %)		 60,671
(2.39 %)
88 brown-throated sloth
GCA_004027775.1		 n/a 17,043
(1.21 %)		 37,090
(1.36 %)		 n/a 42.76
(99.76 %)		 462
(0.00 %)		 1,772,267
(100.00 %)		 2,487,215
(36.18 %)		 316,812
(1.60 %)		 7,948,666
(37.96 %)		 62,325
(2.36 %)
89 cactus mouse (2023)
GCF_949786415.1		 47,524
(2.02 %)		 18,894
(1.46 %)		 20,159
(1.22 %)		 n/a 42.40
(99.98 %)		 2,603
(0.02 %)		 4,297
(100.00 %)		 7,181,232
(52.75 %)		 1,247,378
(18.35 %)		 13,329,318
(43.03 %)		 19,540
(0.49 %)
90 California mouse (IS 2022)
GCF_007827085.1		 62,274
(3.80 %)		 18,959
(1.75 %)		 19,378
(1.41 %)		 n/a 42.21
(100.00 %)		 547
(0.00 %)		 237
(100.00 %)		 5,970,582
(45.08 %)		 1,165,743
(3.67 %)		 13,734,349
(33.67 %)		 19,529
(0.58 %)
91 California sea lion (alternate hap 2019)
GCA_009762295.1		 n/a 18,348
(1.81 %)		 18,692
(1.47 %)		 n/a 41.58
(100.00 %)		 n/a 3,093
(100.00 %)		 3,722,619
(42.89 %)		 488,086
(1.26 %)		 10,893,132
(33.14 %)		 44,449
(1.57 %)
92 California sea lion (LMU 2018 refseq)
GCF_900631625.1		 69,240
(2.99 %)		 20,741
(1.78 %)		 20,298
(1.40 %)		 n/a 41.38
(99.81 %)		 47,716
(0.20 %)		 10,423
(100.00 %)		 4,530,259
(43.28 %)		 573,086
(1.12 %)		 13,442,336
(33.58 %)		 50,583
(1.46 %)
93 California sea lion (mZalCal1 alternate hap 2020)
GCA_009762295.2		 n/a 18,319
(1.81 %)		 18,772
(1.48 %)		 n/a 41.58
(100.00 %)		 n/a 3,096
(100.00 %)		 3,724,021
(42.91 %)		 488,356
(1.26 %)		 10,891,276
(33.15 %)		 44,467
(1.57 %)
94 California sea lion (v2 primary hap 2020)
GCF_009762305.2		 70,801
(3.05 %)		 20,915
(1.77 %)		 20,179
(1.40 %)		 44,926
(2.10 %)		 41.40
(99.23 %)		 185
(0.77 %)		 47
(100.00 %)		 4,525,652
(43.65 %)		 590,246
(1.24 %)		 13,263,648
(33.76 %)		 51,899
(1.50 %)
95 California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 alternate hap 2023)
GCA_028537755.1		 n/a 19,409
(1.86 %)		 20,578
(1.69 %)		 n/a 42.43
(100.00 %)		 43
(0.00 %)		 310
(100.00 %)		 3,161,054
(22.60 %)		 891,453
(5.62 %)		 11,087,206
(33.12 %)		 19,104
(0.65 %)
96 California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 primary hap 2023)
GCA_028537955.1		 n/a 19,681
(1.86 %)		 21,257
(1.62 %)		 n/a 42.24
(100.00 %)		 51
(0.00 %)		 350
(100.00 %)		 4,957,057
(42.33 %)		 943,226
(5.63 %)		 11,695,871
(33.83 %)		 20,062
(0.64 %)
97 Canada lynx (alternate hap LIC74 2019)
GCA_007474575.1		 n/a 12,029
(1.42 %)		 15,171
(1.16 %)		 n/a 41.46
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 15,036
(100.00 %)		 2,937,491
(43.50 %)		 544,410
(1.76 %)		 7,641,565
(32.72 %)		 39,082
(2.44 %)
98 Canada lynx (LIC74 v2 alternate hap 2020)
GCA_007474575.2		 n/a 12,041
(1.42 %)		 15,226
(1.16 %)		 n/a 41.46
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 15,046
(100.00 %)		 2,939,291
(43.50 %)		 544,849
(1.76 %)		 7,650,345
(32.74 %)		 39,099
(2.44 %)
99 Canada lynx (LIC74 v2 primary hap 2020)
GCF_007474595.2		 50,142
(2.69 %)		 18,273
(1.65 %)		 19,264
(1.35 %)		 n/a 41.70
(99.88 %)		 842
(0.12 %)		 54
(100.00 %)		 5,011,165
(43.72 %)		 904,525
(1.75 %)		 13,467,551
(34.19 %)		 66,799
(2.48 %)
100 Cantor's roundleaf bat
GCA_004027415.1		 n/a 23,788
(1.42 %)		 45,328
(1.68 %)		 38,254
(1.57 %)		 41.36
(99.91 %)		 6,366
(0.03 %)		 846,566
(99.97 %)		 3,997,370
(31.48 %)		 775,742
(1.42 %)		 12,770,948
(33.45 %)		 41,527
(1.41 %)
101 Cape elephant shrew
GCF_000299155.1		 25,406
(1.08 %)		 23,258
(1.07 %)		 24,266
(1.16 %)		 n/a 40.30
(86.29 %)		 279,394
(13.74 %)		 288,162
(86.26 %)		 3,765,232
(16.90 %)		 604,351
(0.89 %)		 20,072,078
(42.36 %)		 25,977
(0.42 %)
102 Cape golden mole (2012 Broad)
GCF_000296735.1		 25,323
(1.07 %)		 20,961
(1.07 %)		 21,723
(1.04 %)		 n/a 40.01
(79.93 %)		 370,844
(20.11 %)		 391,344
(79.89 %)		 4,924,640
(21.03 %)		 500,830
(1.95 %)		 18,946,663
(41.18 %)		 21,186
(0.33 %)
103 Cape rock hyrax (US060 2019 Broad)
GCA_004026925.1		 n/a 21,401
(0.85 %)		 45,353
(1.14 %)		 n/a 41.08
(99.93 %)		 4,203
(0.01 %)		 1,048,940
(99.99 %)		 7,222,494
(54.48 %)		 430,286
(0.85 %)		 21,775,991
(44.61 %)		 37,158
(0.70 %)
104 capybara
GCA_004027455.1		 n/a 20,152
(1.22 %)		 28,931
(1.29 %)		 n/a 39.76
(99.93 %)		 5,747
(0.02 %)		 661,089
(99.98 %)		 4,220,878
(29.16 %)		 777,357
(2.04 %)		 15,214,944
(35.16 %)		 34,558
(0.85 %)
105 carabao (swamp buffalo K-KA32 2023)
GCF_029407905.1		 77,279
(2.89 %)		 19,433
(1.40 %)		 21,166
(1.23 %)		 n/a 42.77
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 115
(100.00 %)		 3,479,445
(21.92 %)		 547,054
(6.39 %)		 12,840,677
(45.22 %)		 99,752
(3.73 %)
106 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v2.0 2023 USDA)
GCF_002263795.3		 77,927
(4.11 %)		 19,428
(1.48 %)		 22,236
(1.33 %)		 n/a 42.01
(100.00 %)		 386
(0.00 %)		 1,958
(100.00 %)		 3,449,588
(22.63 %)		 596,092
(3.13 %)		 12,785,607
(42.11 %)		 46,864
(1.37 %)
107 cattle (Hereford UMD_3.1.1 2014)
GCF_000003055.6		 57,977
(2.74 %)		 19,583
(1.56 %)		 20,581
(1.31 %)		 n/a 41.82
(99.23 %)		 74,464
(0.78 %)		 75,598
(99.22 %)		 5,607,556
(49.02 %)		 440,521
(1.25 %)		 13,167,657
(40.78 %)		 42,869
(1.24 %)
108 Chacoan peccary (BS20 v2 2019 Broad)
GCA_004024745.2		 n/a 18,603
(1.52 %)		 22,330
(1.36 %)		 n/a 42.35
(98.12 %)		 57,013
(1.80 %)		 1,240,743
(98.20 %)		 5,255,211
(43.27 %)		 2,502,373
(4.37 %)		 12,968,788
(40.96 %)		 172,178
(3.66 %)
109 cheetah (Ajub_Pintada_27869175 2022)
GCF_027475565.1		 80,997
(4.53 %)		 18,420
(1.70 %)		 19,561
(1.40 %)		 n/a 41.59
(100.00 %)		 22
(0.00 %)		 195
(100.00 %)		 4,611,842
(35.10 %)		 837,685
(1.68 %)		 13,649,125
(33.06 %)		 60,367
(2.22 %)
110 cheetah (Rico 2018)
GCF_003709585.1		 72,154
(3.33 %)		 18,472
(1.70 %)		 20,443
(1.42 %)		 n/a 41.55
(99.55 %)		 24,173
(0.45 %)		 3,220
(100.00 %)		 4,853,945
(42.85 %)		 831,106
(1.53 %)		 13,663,571
(32.84 %)		 60,744
(2.17 %)
111 Chinese forest musk deer (Sichuan 2022)
GCF_022376915.1		 51,612
(2.80 %)		 19,565
(1.43 %)		 22,280
(1.29 %)		 n/a 42.30
(99.97 %)		 1,781
(0.03 %)		 2,446
(100.00 %)		 3,257,347
(21.65 %)		 399,120
(3.81 %)		 12,906,274
(43.79 %)		 46,689
(1.12 %)
112 Chinese hamster (17A/GY CHO 2020)
GCF_003668045.3		 55,440
(2.79 %)		 20,030
(1.84 %)		 18,721
(1.41 %)		 67,900
(3.41 %)		 41.51
(99.90 %)		 4,164
(0.10 %)		 647
(100.00 %)		 8,121,057
(33.74 %)		 1,095,058
(2.91 %)		 12,923,274
(32.25 %)		 19,341
(0.58 %)
113 Chinese hamster (CHO v1 2011 BGI)
GCF_000223135.1		 45,993
(2.59 %)		 20,602
(1.78 %)		 17,467
(1.35 %)		 n/a 41.37
(96.61 %)		 156,635
(3.40 %)		 265,787
(96.60 %)		 4,541,936
(33.03 %)		 1,072,129
(2.66 %)		 13,150,189
(30.04 %)		 12,522
(0.25 %)
114 Chinese hamster (CHO v2 2017 Eagle Genomics Ltd)
GCA_900186095.1		 n/a 19,874
(1.85 %)		 19,298
(1.44 %)		 n/a 41.45
(98.56 %)		 63,334
(1.45 %)		 71,598
(98.55 %)		 4,521,726
(33.66 %)		 1,060,619
(2.55 %)		 12,867,288
(31.26 %)		 17,960
(0.54 %)
115 Chinese hamster (CHO-K1 CHOZN v2.4 2022)
GCA_026545065.1		 n/a 20,293
(1.81 %)		 18,881
(1.42 %)		 n/a 41.62
(71.16 %)		 924,541
(28.93 %)		 1,236,122
(71.07 %)		 4,330,728
(30.92 %)		 987,319
(3.70 %)		 13,374,062
(21.92 %)		 18,838
(0.40 %)
116 Chinese pangolin (2020 Yunnan U)
GCF_014570555.1		 69,694
(3.21 %)		 18,206
(1.70 %)		 20,508
(1.48 %)		 n/a 40.79
(95.54 %)		 34,903
(4.47 %)		 4,694
(100.00 %)		 2,927,176
(35.60 %)		 269,964
(0.67 %)		 12,610,535
(29.10 %)		 35,278
(1.05 %)
117 Chinese pangolin (hap1 mManPen7 2023)
GCF_030020395.1		 71,445
(2.98 %)		 18,379
(1.34 %)		 21,837
(1.29 %)		 n/a 41.07
(99.77 %)		 383
(0.23 %)		 661
(100.00 %)		 3,318,871
(34.65 %)		 618,193
(3.68 %)		 12,009,669
(39.02 %)		 47,708
(1.22 %)
118 Chinese pangolin (hap2 mManPen7 2023)
GCA_030020945.1		 n/a 18,538
(1.34 %)		 21,724
(1.27 %)		 n/a 41.09
(99.48 %)		 190
(0.52 %)		 700
(100.00 %)		 3,362,899
(34.48 %)		 678,384
(4.11 %)		 12,024,241
(39.52 %)		 48,960
(1.19 %)
119 Chinese pangolin (MPE899 2014 WashU)
GCA_000738955.1		 n/a 18,749
(1.63 %)		 22,506
(1.40 %)		 n/a 40.93
(90.69 %)		 257,424
(9.33 %)		 230,927
(90.67 %)		 2,691,116
(34.48 %)		 316,518
(1.96 %)		 11,538,086
(25.40 %)		 30,693
(0.58 %)
120 Chinese rufous horseshoe bat
GCA_001888835.1		 n/a 26,871
(2.34 %)		 25,467
(1.89 %)		 n/a 40.52
(97.22 %)		 212,601
(2.80 %)		 63,439
(100.00 %)		 3,219,611
(33.86 %)		 495,126
(1.20 %)		 12,476,551
(27.16 %)		 32,993
(0.98 %)
121 Chinese tree shrew
GCF_000334495.1		 47,005
(2.07 %)		 21,375
(1.39 %)		 19,231
(1.28 %)		 n/a 41.73
(95.10 %)		 191,695
(4.92 %)		 242,445
(95.08 %)		 5,060,321
(23.05 %)		 1,046,388
(4.15 %)		 14,978,259
(38.04 %)		 88,806
(1.44 %)
122 chiru
GCA_000400835.1		 n/a 20,320
(1.60 %)		 42,654
(2.51 %)		 n/a 42.01
(93.04 %)		 283,069
(7.00 %)		 298,127
(93.00 %)		 5,342,241
(43.54 %)		 425,329
(1.25 %)		 13,714,420
(34.66 %)		 43,135
(1.89 %)
123 clouded leopard (mNeoNeb1 alternate hap 2023)
GCA_028018655.1		 n/a 16,430
(1.52 %)		 21,057
(1.44 %)		 n/a 41.79
(100.00 %)		 n/a 10,377
(100.00 %)		 3,845,437
(33.39 %)		 794,587
(2.14 %)		 10,765,695
(33.40 %)		 56,375
(2.45 %)
124 clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028018385.1		 81,219
(3.62 %)		 18,300
(1.65 %)		 20,361
(1.39 %)		 n/a 41.79
(99.94 %)		 181
(0.06 %)		 33
(100.00 %)		 4,224,269
(34.84 %)		 992,668
(2.08 %)		 13,618,866
(34.42 %)		 67,830
(2.45 %)
125 common bottlenose dolphin (maternal 2020)
GCA_011762535.1		 n/a 18,837
(1.77 %)		 20,857
(1.43 %)		 n/a 41.43
(99.73 %)		 649
(0.27 %)		 985
(100.00 %)		 4,073,893
(46.15 %)		 630,039
(2.15 %)		 12,628,219
(35.41 %)		 65,379
(1.89 %)
126 common bottlenose dolphin (maternal Y refseq 2020)
GCF_011762595.1		 67,207
(3.31 %)		 18,766
(1.77 %)		 20,528
(1.42 %)		 35,852
(1.58 %)		 41.44
(99.74 %)		 674
(0.26 %)		 362
(100.00 %)		 4,069,115
(46.17 %)		 628,982
(2.12 %)		 12,490,891
(35.29 %)		 65,551
(1.90 %)
127 common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 refseq)
GCF_001922835.1		 45,975
(2.99 %)		 17,255
(1.69 %)		 17,058
(1.34 %)		 n/a 40.85
(99.45 %)		 114,003
(0.57 %)		 2,648
(100.00 %)		 3,845,938
(43.89 %)		 514,631
(1.06 %)		 12,317,098
(32.18 %)		 48,030
(1.35 %)
128 common bottlenose dolphin (paternal 2020)
GCA_011762515.1		 n/a 18,537
(1.77 %)		 20,619
(1.44 %)		 n/a 41.42
(98.08 %)		 868
(1.92 %)		 1,166
(100.00 %)		 3,997,801
(45.93 %)		 609,838
(1.85 %)		 12,400,272
(34.53 %)		 64,630
(1.84 %)
129 common brushtail (alternate hap 2020)
GCA_011100645.1		 n/a 14,863
(0.75 %)		 15,426
(0.89 %)		 n/a 39.41
(100.00 %)		 313
(0.00 %)		 12,446
(100.00 %)		 5,846,769
(38.56 %)		 987,917
(1.99 %)		 16,764,356
(40.14 %)		 13,303
(0.35 %)
130 common brushtail (refseq 2020)
GCF_011100635.1		 37,674
(1.80 %)		 18,653
(0.80 %)		 15,375
(0.86 %)		 n/a 39.48
(99.44 %)		 1,796
(0.56 %)		 212
(100.00 %)		 7,598,116
(38.90 %)		 1,259,434
(1.97 %)		 22,071,306
(40.56 %)		 17,762
(0.38 %)
131 common pipistrelle (2020)
GCA_903992545.1		 n/a 17,216
(1.82 %)		 19,202
(1.79 %)		 n/a 42.55
(99.97 %)		 1,546
(0.03 %)		 323
(100.00 %)		 2,953,532
(23.94 %)		 805,142
(2.83 %)		 9,964,846
(34.69 %)		 57,295
(2.83 %)
132 common pipistrelle (alternate hap 2020)
GCA_903992515.1		 n/a 15,974
(1.72 %)		 20,563
(1.66 %)		 n/a 42.41
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 10,459
(100.00 %)		 2,634,333
(23.76 %)		 703,674
(2.65 %)		 8,909,525
(33.95 %)		 50,430
(2.54 %)
133 common pipistrelle (Broad 2019)
GCA_004026625.1		 n/a 21,938
(1.35 %)		 53,915
(1.60 %)		 n/a 42.88
(99.88 %)		 10,870
(0.05 %)		 736,974
(99.95 %)		 3,499,501
(22.91 %)		 1,046,301
(2.96 %)		 11,759,516
(37.96 %)		 92,062
(3.23 %)
134 common vampire bat (HL8 alternate hap 2022)
GCA_022682395.1		 n/a 17,520
(1.75 %)		 18,995
(1.67 %)		 n/a 42.89
(99.99 %)		 580
(0.01 %)		 430
(100.00 %)		 2,597,497
(28.17 %)		 356,620
(2.88 %)		 10,797,225
(31.23 %)		 61,931
(2.30 %)
135 common vampire bat (HL8 primary hap 2022 refseq)
GCF_022682495.1		 58,054
(3.40 %)		 18,280
(1.71 %)		 19,515
(1.59 %)		 n/a 42.98
(99.99 %)		 611
(0.01 %)		 573
(100.00 %)		 2,761,826
(28.38 %)		 427,942
(3.89 %)		 11,250,529
(32.57 %)		 70,701
(2.48 %)
136 common vampire bat (v3 DRU21DN04 2018)
GCF_002940915.2		 51,031
(3.24 %)		 18,503
(1.88 %)		 18,071
(1.68 %)		 n/a 42.15
(97.78 %)		 54,246
(2.23 %)		 83,364
(97.77 %)		 2,799,509
(29.62 %)		 275,242
(1.03 %)		 11,796,826
(28.19 %)		 51,634
(1.37 %)
137 common warthog (WHEZ1 2021)
GCF_016906955.1		 55,088
(2.64 %)		 18,264
(1.56 %)		 19,251
(1.34 %)		 54,816
(2.83 %)		 41.95
(99.61 %)		 523
(0.39 %)		 194
(100.00 %)		 3,898,243
(30.33 %)		 588,742
(1.17 %)		 12,955,929
(36.44 %)		 75,592
(1.86 %)
138 common wombat
GCF_900497805.2		 46,365
(1.78 %)		 19,437
(0.86 %)		 18,947
(0.96 %)		 n/a 38.86
(99.68 %)		 67,461
(0.33 %)		 14,183
(100.00 %)		 8,645,969
(41.99 %)		 1,203,246
(1.61 %)		 23,878,215
(39.11 %)		 18,752
(0.37 %)
139 creeping vole
GCF_018167655.1		 54,941
(2.31 %)		 23,033
(1.55 %)		 25,427
(1.53 %)		 n/a 44.23
(100.00 %)		 n/a 2,147
(100.00 %)		 4,549,519
(25.66 %)		 1,153,429
(13.60 %)		 13,568,297
(40.65 %)		 23,141
(0.54 %)
140 crested porcupine
GCA_004026905.1		 n/a 21,005
(1.32 %)		 35,975
(1.39 %)		 n/a 41.51
(99.89 %)		 4,351
(0.02 %)		 1,140,949
(99.98 %)		 4,303,147
(30.69 %)		 600,488
(1.19 %)		 14,049,490
(33.80 %)		 57,196
(1.33 %)
141 Cuvier's beaked whale
GCA_004364475.1		 n/a 23,700
(0.90 %)		 51,715
(0.86 %)		 n/a 42.01
(99.76 %)		 3,229
(0.01 %)		 3,761,505
(99.99 %)		 6,544,424
(43.61 %)		 1,417,186
(3.11 %)		 16,127,873
(42.25 %)		 68,668
(1.15 %)
142 Damara mole-rat DMR 1.0 (2014 BGI)
GCF_000743615.1		 52,373
(2.57 %)		 17,983
(1.45 %)		 17,063
(1.43 %)		 n/a 40.34
(97.96 %)		 87,815
(2.05 %)		 162,545
(97.95 %)		 4,053,433
(30.86 %)		 545,281
(1.74 %)		 13,406,483
(30.65 %)		 37,008
(0.74 %)
143 Damara mole-rat DMR 1.0 HiC (2020 DNA Zoo)
GCF_012274545.1		 58,091
(2.74 %)		 17,780
(1.44 %)		 16,515
(1.42 %)		 n/a 40.34
(97.94 %)		 88,899
(2.07 %)		 73,970
(100.00 %)		 4,035,140
(30.95 %)		 544,772
(1.73 %)		 13,390,872
(30.61 %)		 37,008
(0.74 %)
144 dassie-rat
GCA_004026965.1		 n/a 20,479
(1.16 %)		 42,937
(1.41 %)		 n/a 41.86
(99.89 %)		 9,645
(0.04 %)		 920,324
(99.96 %)		 4,563,054
(28.83 %)		 660,623
(1.92 %)		 12,899,807
(34.48 %)		 46,569
(1.25 %)
145 Daubenton's bat (alternate hap 2023)
GCA_963242275.1		 n/a 18,895
(1.78 %)		 24,235
(1.81 %)		 n/a 43.39
(100.00 %)		 n/a 4,930
(100.00 %)		 2,813,870
(23.75 %)		 718,406
(5.18 %)		 9,977,320
(37.24 %)		 62,910
(2.66 %)
146 Daubenton's bat (primary hap 2023 refseq)
GCF_963259705.1		 64,558
(3.32 %)		 19,141
(1.72 %)		 22,133
(1.66 %)		 n/a 43.18
(99.99 %)		 1,099
(0.01 %)		 121
(100.00 %)		 3,040,232
(24.03 %)		 796,911
(6.38 %)		 10,478,180
(38.84 %)		 64,920
(2.51 %)
147 Daurian ground squirrel
GCA_002406435.1		 n/a 20,990
(1.31 %)		 17,575
(1.17 %)		 n/a 39.77
(96.15 %)		 141,850
(3.84 %)		 502,654
(96.16 %)		 5,783,538
(34.36 %)		 924,038
(3.73 %)		 17,533,301
(30.85 %)		 27,955
(0.39 %)
148 David's myotis bat
GCF_000327345.1		 37,645
(2.70 %)		 18,744
(1.78 %)		 17,565
(1.62 %)		 n/a 42.69
(91.23 %)		 223,511
(8.80 %)		 325,280
(91.20 %)		 2,680,166
(23.79 %)		 532,273
(1.90 %)		 11,016,028
(29.55 %)		 59,615
(1.59 %)
149 degu (3935 2012 refseq)
GCF_000260255.1		 48,152
(2.13 %)		 22,242
(1.41 %)		 22,101
(1.46 %)		 n/a 41.38
(84.36 %)		 252,772
(15.68 %)		 259,904
(84.32 %)		 4,901,673
(27.74 %)		 898,945
(1.50 %)		 14,282,003
(29.30 %)		 40,135
(0.82 %)
150 desert hamster (2022)
GCF_943737965.1		 37,279
(2.11 %)		 19,744
(1.74 %)		 20,215
(1.50 %)		 n/a 41.31
(100.00 %)		 n/a 2,079
(100.00 %)		 4,038,079
(31.01 %)		 1,132,871
(2.71 %)		 11,946,112
(32.62 %)		 17,053
(0.51 %)
151 Desmarest's hutia
GCA_004027915.1		 n/a 23,535
(0.78 %)		 50,796
(0.95 %)		 n/a 42.03
(99.83 %)		 3,492
(0.01 %)		 2,355,850
(99.99 %)		 5,790,506
(26.72 %)		 1,062,134
(1.71 %)		 16,977,224
(35.29 %)		 54,479
(1.01 %)
152 dingo (2020 Alpine COOINDA U.NSW)
GCF_012295265.1		 102,060
(4.04 %)		 19,777
(1.69 %)		 20,341
(1.41 %)		 n/a 41.29
(99.69 %)		 325
(0.31 %)		 477
(100.00 %)		 4,950,808
(42.83 %)		 1,033,921
(2.36 %)		 13,745,703
(33.32 %)		 51,835
(2.25 %)
153 dingo (Sandy 2020 James Cook U)
GCF_003254725.2		 104,332
(4.50 %)		 19,710
(1.72 %)		 19,857
(1.42 %)		 n/a 41.24
(100.00 %)		 69
(0.00 %)		 159
(100.00 %)		 4,547,906
(33.32 %)		 993,474
(2.19 %)		 13,701,060
(33.18 %)		 51,216
(2.28 %)
154 dog (boxer Tasha 2011)
GCF_000002285.3		 82,549
(3.63 %)		 19,772
(1.66 %)		 19,565
(1.39 %)		 n/a 41.31
(99.25 %)		 23,876
(0.76 %)		 27,106
(99.24 %)		 4,918,098
(43.29 %)		 991,835
(2.81 %)		 13,644,959
(33.60 %)		 53,269
(2.07 %)
155 dog (boxer Tasha 2020)
GCF_000002285.5		 93,774
(3.84 %)		 19,392
(1.71 %)		 19,572
(1.42 %)		 52,141
(3.27 %)		 41.26
(100.00 %)		 1,028
(0.00 %)		 147
(100.00 %)		 23,927,903
(42.42 %)		 972,851
(2.05 %)		 13,611,845
(33.11 %)		 50,679
(2.26 %)
156 dog (German shepard Mischka 2020)
GCF_011100685.1		 96,734
(3.71 %)		 20,135
(1.64 %)		 20,871
(1.38 %)		 56,772
(3.19 %)		 41.50
(100.00 %)		 585
(0.00 %)		 2,782
(100.00 %)		 20,264,827
(43.87 %)		 1,152,879
(3.22 %)		 13,784,690
(34.30 %)		 53,518
(2.23 %)
157 dog (labrador SID07034 2020)
GCF_014441545.1		 99,420
(3.87 %)		 19,870
(1.70 %)		 20,252
(1.41 %)		 54,322
(3.23 %)		 41.19
(99.47 %)		 575
(0.53 %)		 376
(100.00 %)		 4,981,985
(42.28 %)		 1,019,772
(1.97 %)		 13,959,750
(32.77 %)		 52,469
(2.25 %)
158 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2017 WashU)
GCF_000181335.3		 72,089
(3.30 %)		 18,662
(1.64 %)		 20,897
(1.37 %)		 n/a 41.73
(98.20 %)		 436
(1.80 %)		 5,079
(98.20 %)		 5,086,462
(43.51 %)		 964,126
(2.68 %)		 13,947,871
(33.33 %)		 69,701
(2.41 %)
159 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021 WashU)
GCA_000181335.5		 n/a 18,378
(1.53 %)		 21,242
(1.40 %)		 n/a 41.73
(98.21 %)		 422
(1.79 %)		 5,010
(98.31 %)		 4,683,703
(33.33 %)		 964,129
(2.68 %)		 13,948,305
(33.33 %)		 69,725
(2.42 %)
160 domestic cat (Fca126 2021 Texas A&M U)
GCF_018350175.1		 99,222
(4.40 %)		 18,456
(1.66 %)		 19,833
(1.39 %)		 94,133
(5.63 %)		 41.81
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 102
(100.00 %)		 4,965,571
(43.65 %)		 932,424
(1.95 %)		 13,596,808
(33.85 %)		 67,329
(2.48 %)
161 domestic ferret (JIRA1106 JCVI 2020)
GCF_011764305.1		 68,855
(3.09 %)		 19,019
(1.55 %)		 21,812
(1.42 %)		 n/a 41.90
(100.00 %)		 n/a 1,224
(100.00 %)		 4,650,028
(39.49 %)		 745,115
(2.02 %)		 13,758,447
(36.14 %)		 58,684
(2.16 %)
162 domestic ferret (Sable 2011 Broad)
GCA_000239315.1		 n/a 18,778
(1.67 %)		 19,571
(1.47 %)		 n/a 41.48
(96.89 %)		 72,670
(3.12 %)		 76,914
(96.88 %)		 4,491,876
(40.13 %)		 618,556
(1.07 %)		 13,721,938
(31.04 %)		 54,600
(1.94 %)
163 domestic guinea pig (051 PalLab524CR 2023)
GCF_034190915.1		 79,333
(3.55 %)		 17,999
(1.09 %)		 21,509
(1.20 %)		 n/a 40.64
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 672
(100.00 %)		 5,037,431
(41.68 %)		 886,785
(13.97 %)		 14,620,284
(42.71 %)		 39,682
(0.89 %)
164 domestic guinea pig (2N 2008 refseq)
GCF_000151735.1		 44,762
(2.31 %)		 18,301
(1.33 %)		 20,111
(1.34 %)		 n/a 39.95
(97.81 %)		 58,460
(2.20 %)		 61,604
(97.80 %)		 4,257,852
(38.85 %)		 658,533
(1.25 %)		 14,547,726
(34.19 %)		 37,093
(0.85 %)
165 dugong (hap1 mDugDug1 2023)
GCA_030035585.1		 n/a 18,354
(1.22 %)		 20,434
(1.08 %)		 n/a 40.65
(100.00 %)		 96
(0.00 %)		 198
(100.00 %)		 4,458,084
(33.00 %)		 444,499
(1.79 %)		 15,031,940
(47.42 %)		 29,863
(0.83 %)
166 dugong (hap2 mDugDug1 2023)
GCA_030020955.1		 n/a 18,538
(1.23 %)		 20,775
(1.09 %)		 n/a 40.64
(100.00 %)		 89
(0.00 %)		 167
(100.00 %)		 4,455,227
(33.01 %)		 444,021
(1.73 %)		 14,946,847
(47.37 %)		 29,828
(0.79 %)
167 dwarf mongoose
GCA_004023845.1		 n/a 21,478
(1.57 %)		 32,174
(1.43 %)		 n/a 41.83
(99.94 %)		 10,815
(0.05 %)		 200,185
(99.95 %)		 4,574,991
(40.34 %)		 595,520
(1.11 %)		 13,720,585
(32.94 %)		 70,689
(2.42 %)
168 eastern cottontail (primary hap 2023)
GCA_949820135.1		 n/a 18,522
(1.26 %)		 22,314
(1.28 %)		 n/a 43.69
(100.00 %)		 316
(0.00 %)		 99
(100.00 %)		 3,699,683
(20.55 %)		 935,350
(11.22 %)		 13,112,318
(44.07 %)		 99,224
(2.27 %)
169 eastern European house mouse (PWK_PhJ v2 2022)
GCA_921998335.2		 n/a 21,903
(2.13 %)		 19,801
(1.40 %)		 108,675
(4.42 %)		 41.79
(99.89 %)		 207
(0.11 %)		 211
(100.00 %)		 4,630,645
(40.56 %)		 1,531,506
(3.70 %)		 13,011,312
(35.48 %)		 22,270
(0.54 %)
170 eastern mole
GCA_004024925.1		 n/a 19,631
(1.57 %)		 32,414
(1.63 %)		 n/a 42.02
(99.91 %)		 7,239
(0.03 %)		 647,535
(99.97 %)		 3,145,725
(29.42 %)		 554,620
(1.75 %)		 10,663,504
(32.88 %)		 55,063
(3.69 %)
171 eastern quoll
GCA_020854095.1		 n/a 15,715
(0.80 %)		 16,750
(0.93 %)		 n/a 36.19
(100.00 %)		 431
(0.00 %)		 76
(100.00 %)		 5,256,999
(24.81 %)		 1,280,160
(3.39 %)		 21,362,866
(41.74 %)		 24,508
(0.70 %)
172 Egyptian rousette (1219 2016 Boston U)
GCF_001466805.2		 54,791
(4.93 %)		 18,221
(2.05 %)		 24,192
(1.88 %)		 46,601
(2.22 %)		 40.02
(99.97 %)		 638
(0.03 %)		 2,490
(100.00 %)		 2,815,693
(32.23 %)		 440,119
(1.01 %)		 12,346,041
(26.86 %)		 56,244
(6.54 %)
173 Egyptian rousette (v1 2020 refseq)
GCF_014176215.1		 65,163
(4.76 %)		 17,642
(2.07 %)		 22,317
(1.84 %)		 n/a 40.05
(98.59 %)		 242
(1.41 %)		 29
(100.00 %)		 2,821,248
(33.05 %)		 434,414
(1.02 %)		 12,031,597
(26.52 %)		 53,573
(4.84 %)
174 Egyptian spiny mouse
GCA_004027535.1		 n/a 23,498
(1.69 %)		 36,970
(1.40 %)		 30,076
(1.58 %)		 42.71
(99.88 %)		 20,469
(0.09 %)		 391,811
(99.91 %)		 4,983,574
(35.17 %)		 1,342,514
(3.45 %)		 13,029,270
(32.79 %)		 19,944
(0.55 %)
175 elk (wapiti)
GCF_019320065.1		 66,846
(3.00 %)		 20,090
(1.67 %)		 21,999
(1.44 %)		 n/a 41.62
(99.93 %)		 6,643
(0.08 %)		 185
(100.00 %)		 4,884,711
(43.14 %)		 429,925
(1.65 %)		 13,135,255
(37.85 %)		 47,099
(1.31 %)
176 ermine (2020)
GCF_009829155.1		 74,332
(3.19 %)		 18,855
(1.65 %)		 20,667
(1.43 %)		 44,584
(2.07 %)		 41.56
(99.12 %)		 199
(0.88 %)		 94
(100.00 %)		 4,647,934
(41.44 %)		 714,174
(1.30 %)		 13,845,904
(33.42 %)		 56,065
(2.25 %)
177 ermine (alternate hap 2020)
GCA_009829165.1		 n/a 13,583
(1.65 %)		 15,403
(1.46 %)		 n/a 41.72
(100.00 %)		 n/a 3,327
(100.00 %)		 3,139,035
(40.57 %)		 480,111
(1.29 %)		 9,106,061
(31.93 %)		 39,139
(2.25 %)
178 Eurasian badger (2021)
GCA_922990625.1		 n/a 19,332
(1.42 %)		 22,424
(1.40 %)		 n/a 42.47
(100.00 %)		 27
(0.00 %)		 726
(100.00 %)		 4,362,536
(31.74 %)		 801,232
(4.02 %)		 13,893,672
(37.73 %)		 65,806
(4.13 %)
179 Eurasian badger (v3.2 2022)
GCA_922984935.2		 n/a 19,268
(1.40 %)		 22,121
(1.36 %)		 41,043
(1.93 %)		 42.48
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 538
(100.00 %)		 4,417,203
(31.72 %)		 821,664
(4.02 %)		 13,814,720
(38.08 %)		 66,524
(3.95 %)
180 Eurasian field mouse (2024)
GCA_964023405.1		 n/a 20,487
(1.88 %)		 19,707
(1.34 %)		 n/a 42.15
(100.00 %)		 182
(0.00 %)		 61
(100.00 %)		 5,115,510
(39.18 %)		 1,868,284
(4.29 %)		 13,503,826
(37.29 %)		 26,414
(0.61 %)
181 Eurasian red squirrel (alternate hap 2019)
GCA_902685485.1		 n/a 12,437
(1.51 %)		 12,702
(1.22 %)		 n/a 40.06
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 10,657
(100.00 %)		 2,303,176
(35.38 %)		 353,996
(1.49 %)		 7,218,556
(31.67 %)		 24,268
(1.07 %)
182 Eurasian red squirrel (v1.2 2020)
GCA_902686455.2		 n/a 21,309
(1.58 %)		 21,026
(1.36 %)		 33,465
(1.53 %)		 40.08
(94.33 %)		 1,177
(5.67 %)		 639
(100.00 %)		 4,677,412
(35.73 %)		 704,218
(1.42 %)		 14,992,063
(31.49 %)		 48,159
(1.04 %)
183 Eurasian river otter (2020)
GCF_902655055.1		 67,145
(2.95 %)		 18,842
(1.54 %)		 20,178
(1.40 %)		 n/a 41.59
(100.00 %)		 185
(0.00 %)		 44
(100.00 %)		 4,259,294
(33.39 %)		 713,721
(1.36 %)		 13,626,048
(34.37 %)		 57,073
(1.82 %)
184 Eurasian river otter (alternate hap 2019)
GCA_902653095.1		 n/a 9,910
(1.59 %)		 11,315
(1.31 %)		 n/a 41.85
(100.00 %)		 n/a 8,506
(100.00 %)		 2,052,338
(42.25 %)		 316,084
(1.64 %)		 6,222,460
(33.12 %)		 27,057
(1.96 %)
185 Eurasian water vole (alternate hap 2020)
GCA_903992525.1		 n/a 16,761
(1.66 %)		 19,715
(1.37 %)		 n/a 42.13
(100.00 %)		 105
(0.00 %)		 16,473
(100.00 %)		 3,118,266
(26.44 %)		 829,463
(2.82 %)		 9,700,482
(31.37 %)		 14,146
(0.57 %)
186 Eurasian water vole (v2 2021)
GCF_903992535.2		 45,544
(2.51 %)		 19,733
(1.78 %)		 19,053
(1.47 %)		 36,935
(2.27 %)		 42.15
(99.74 %)		 873
(0.26 %)		 215
(100.00 %)		 3,993,912
(25.74 %)		 1,088,163
(2.91 %)		 12,853,770
(32.42 %)		 19,000
(0.58 %)
187 European hare (LE1 primary hap 2023)
GCF_033115175.1		 46,528
(2.09 %)		 19,392
(1.25 %)		 23,070
(1.29 %)		 n/a 44.03
(100.00 %)		 418
(0.00 %)		 651
(100.00 %)		 4,011,592
(19.81 %)		 1,000,204
(8.44 %)		 13,414,251
(44.25 %)		 98,831
(2.33 %)
188 European harvest mouse (primary hap 2024)
GCA_963924665.1		 n/a 20,236
(1.71 %)		 19,368
(1.32 %)		 n/a 40.05
(99.99 %)		 2,020
(0.02 %)		 894
(100.00 %)		 4,892,811
(36.49 %)		 1,223,387
(18.26 %)		 11,907,631
(42.51 %)		 17,423
(0.62 %)
189 European mink (alternate hap 2023)
GCA_030435785.1		 n/a 15,419
(1.50 %)		 21,175
(1.51 %)		 n/a 42.09
(100.00 %)		 n/a 12,043
(100.00 %)		 2,952,218
(30.62 %)		 538,508
(2.18 %)		 9,303,303
(34.20 %)		 47,810
(2.50 %)
190 European mink (primary hap 2023 refseq)
GCF_030435805.1		 69,556
(3.13 %)		 18,706
(1.46 %)		 21,193
(1.37 %)		 n/a 41.85
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 25
(100.00 %)		 4,237,791
(30.90 %)		 792,897
(2.69 %)		 13,417,195
(36.59 %)		 67,132
(2.54 %)
191 European pine marten (primary hap 2023)
GCA_963455335.1		 n/a 18,336
(1.50 %)		 20,807
(1.41 %)		 n/a 42.38
(99.98 %)		 2,250
(0.02 %)		 477
(100.00 %)		 4,096,160
(31.55 %)		 707,337
(3.28 %)		 13,715,382
(34.73 %)		 61,481
(4.29 %)
192 European shrew (alternate hap 2023)
GCA_027595995.1		 n/a 17,506
(1.26 %)		 25,527
(1.52 %)		 n/a 43.20
(100.00 %)		 n/a 5,699
(100.00 %)		 2,400,784
(15.19 %)		 1,062,793
(3.20 %)		 13,284,496
(41.93 %)		 77,009
(2.86 %)
193 European shrew (GB8-d 2012)
GCF_000181275.1		 23,525
(1.54 %)		 17,290
(1.33 %)		 22,005
(1.50 %)		 n/a 42.90
(90.49 %)		 188,953
(9.54 %)		 201,798
(90.46 %)		 4,400,127
(33.22 %)		 946,629
(2.03 %)		 13,377,581
(35.30 %)		 77,851
(2.58 %)
194 European shrew (primary hap 2023)
GCF_027595985.1		 44,643
(2.60 %)		 17,479
(1.26 %)		 21,293
(1.37 %)		 n/a 43.24
(99.46 %)		 1,427
(0.54 %)		 65
(100.00 %)		 2,474,584
(15.18 %)		 1,107,884
(3.28 %)		 13,638,467
(41.72 %)		 79,785
(2.86 %)
195 European snow vole (alternate hap 2023)
GCA_950005115.1		 n/a 18,364
(1.79 %)		 20,379
(1.63 %)		 n/a 42.19
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 4,256
(100.00 %)		 3,049,618
(22.22 %)		 852,708
(4.50 %)		 10,501,392
(33.34 %)		 17,629
(0.60 %)
196 European snow vole (primary hap 2023 refseq)
GCF_950005125.1		 47,025
(2.69 %)		 19,592
(1.78 %)		 21,173
(1.56 %)		 n/a 41.98
(100.00 %)		 197
(0.00 %)		 160
(100.00 %)		 5,048,186
(44.12 %)		 998,537
(5.14 %)		 12,204,053
(34.97 %)		 20,725
(0.63 %)
197 European woodmouse (2022 refseq)
GCF_947179515.1		 54,114
(2.24 %)		 19,959
(1.65 %)		 19,953
(1.25 %)		 n/a 41.23
(99.99 %)		 1,129
(0.01 %)		 497
(100.00 %)		 4,863,650
(37.41 %)		 1,795,997
(8.95 %)		 13,681,732
(40.58 %)		 23,961
(0.53 %)
198 European woodmouse (alternate hap 2022)
GCA_947179525.1		 n/a 18,692
(1.72 %)		 22,021
(1.36 %)		 n/a 41.56
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 10,863
(100.00 %)		 4,055,957
(36.08 %)		 1,513,576
(9.53 %)		 11,306,811
(39.67 %)		 20,865
(0.55 %)
199 fallow deer (Ldn47 2023)
GCF_033118175.1		 57,013
(2.35 %)		 20,187
(1.33 %)		 23,290
(1.33 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 44
(0.00 %)		 284
(100.00 %)		 3,308,241
(20.72 %)		 513,748
(18.20 %)		 12,996,819
(48.19 %)		 214,480
(2.98 %)
200 fat dormouse (US078 2019)
GCA_004027185.1		 n/a 23,122
(1.24 %)		 48,677
(1.27 %)		 n/a 42.33
(99.92 %)		 10,685
(0.04 %)		 444,115
(99.96 %)		 6,783,404
(37.03 %)		 1,642,515
(3.72 %)		 12,706,289
(39.97 %)		 65,521
(1.47 %)
201 fat sand rat (mPsaObe1 2021)
GCF_907164565.1		 43,211
(2.50 %)		 18,543
(1.78 %)		 20,094
(1.42 %)		 n/a 41.95
(99.11 %)		 50,482
(0.90 %)		 11,389
(100.00 %)		 4,686,377
(43.10 %)		 920,563
(1.85 %)		 12,813,848
(35.08 %)		 22,480
(0.71 %)
202 fat sand rat (Psa_ob012049795 2017)
GCA_002215935.1		 n/a 21,644
(1.71 %)		 31,665
(1.41 %)		 n/a 41.99
(99.99 %)		 n/a 96,427
(100.00 %)		 4,646,110
(38.87 %)		 946,664
(2.24 %)		 13,134,526
(33.94 %)		 26,411
(0.73 %)
203 fishing cat (Anna 2022 U Missouri)
GCF_022837055.1		 68,015
(2.86 %)		 18,432
(1.63 %)		 19,912
(1.37 %)		 n/a 41.91
(100.00 %)		 63
(0.00 %)		 192
(100.00 %)		 4,777,906
(34.85 %)		 937,432
(2.30 %)		 13,438,032
(34.55 %)		 70,402
(2.61 %)
204 Florida manatee (CSIC 2023)
GCA_030013775.1		 n/a 19,432
(1.24 %)		 24,035
(1.14 %)		 n/a 40.66
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 15,641
(100.00 %)		 4,400,331
(33.07 %)		 439,615
(1.04 %)		 14,884,753
(46.98 %)		 32,563
(0.80 %)
205 Florida manatee (Lorelei 2012 refseq)
GCF_000243295.1		 39,645
(2.08 %)		 18,308
(1.37 %)		 20,588
(1.23 %)		 32,868
(1.38 %)		 40.73
(89.24 %)		 160,167
(10.78 %)		 166,490
(89.22 %)		 n/a 389,315
(0.74 %)		 14,633,038
(38.46 %)		 27,462
(0.64 %)
206 fossa
GCA_004023885.1		 n/a 21,156
(1.56 %)		 29,809
(1.38 %)		 n/a 41.51
(99.94 %)		 6,335
(0.03 %)		 470,371
(99.97 %)		 4,962,168
(42.36 %)		 814,639
(1.52 %)		 13,708,904
(34.14 %)		 78,033
(2.52 %)
207 Gambian giant pouched rat
GCA_004027575.1		 n/a 21,189
(1.59 %)		 32,806
(1.43 %)		 n/a 42.11
(99.88 %)		 7,473
(0.03 %)		 1,110,425
(99.97 %)		 4,137,605
(24.57 %)		 1,071,627
(2.76 %)		 12,905,250
(32.78 %)		 32,359
(0.80 %)
208 gayal (CVASU_BF_001 2021)
GCA_017311355.1		 n/a 24,549
(1.09 %)		 55,194
(1.15 %)		 n/a 42.05
(99.91 %)		 n/a 1,262,134
(100.00 %)		 3,691,398
(22.78 %)		 677,397
(2.00 %)		 14,380,670
(42.36 %)		 75,114
(1.33 %)
209 gayal (Nagaland 2019)
GCA_007844835.1		 n/a 22,715
(1.55 %)		 23,635
(1.33 %)		 n/a 41.67
(96.51 %)		 301,761
(3.52 %)		 306,776
(96.48 %)		 6,243,468
(45.69 %)		 518,664
(1.99 %)		 15,147,647
(37.64 %)		 45,586
(0.89 %)
210 Geoffroy's cat
GCF_018350155.1		 85,331
(3.53 %)		 18,469
(1.66 %)		 19,516
(1.36 %)		 93,795
(4.83 %)		 41.75
(100.00 %)		 45
(0.00 %)		 82
(100.00 %)		 5,021,854
(43.23 %)		 930,175
(1.84 %)		 13,757,469
(34.29 %)		 65,918
(2.36 %)
211 giant anteater
GCA_004026745.1		 n/a 24,383
(0.91 %)		 44,315
(0.93 %)		 n/a 39.53
(99.88 %)		 8,283
(0.02 %)		 1,629,691
(99.98 %)		 5,333,757
(35.57 %)		 575,140
(0.91 %)		 21,181,213
(39.97 %)		 57,558
(0.94 %)
212 giant otter
GCA_004024605.1		 n/a 21,199
(1.46 %)		 30,565
(1.34 %)		 n/a 41.71
(99.93 %)		 7,431
(0.03 %)		 652,159
(99.97 %)		 5,113,769
(41.55 %)		 788,677
(1.46 %)		 14,385,279
(35.77 %)		 82,376
(2.05 %)
213 giant panda (Jingjing v3 2020)
GCF_002007445.2		 65,468
(3.27 %)		 19,077
(1.67 %)		 20,176
(1.39 %)		 n/a 41.68
(98.09 %)		 189,277
(1.92 %)		 73,514
(100.00 %)		 4,012,144
(34.40 %)		 617,803
(1.99 %)		 14,216,587
(30.41 %)		 59,449
(1.50 %)
214 goat (v2 San Clemente 2016 USDA)
GCF_001704415.2		 47,159
(2.31 %)		 19,342
(1.38 %)		 22,346
(1.24 %)		 n/a 43.16
(100.00 %)		 790
(0.00 %)		 29,886
(100.00 %)		 3,502,527
(22.45 %)		 760,831
(7.07 %)		 13,024,178
(44.85 %)		 125,662
(4.00 %)
215 Gobi jerboa
GCA_004027895.1		 n/a 22,410
(0.91 %)		 45,268
(1.02 %)		 n/a 41.94
(99.88 %)		 10,987
(0.04 %)		 1,295,369
(99.96 %)		 8,828,417
(40.19 %)		 1,979,806
(6.43 %)		 14,759,732
(47.73 %)		 24,314
(0.52 %)
216 golden hamster (Baylor 2021)
GCF_017639785.1		 67,831
(3.37 %)		 19,354
(1.71 %)		 19,863
(1.47 %)		 69,903
(4.39 %)		 42.04
(96.99 %)		 711
(3.01 %)		 7,058
(96.99 %)		 3,981,818
(27.65 %)		 976,456
(3.46 %)		 12,580,903
(32.87 %)		 21,268
(0.61 %)
217 golden hamster (Broad 2013 refseq)
GCF_000349665.1		 42,636
(2.91 %)		 18,976
(1.82 %)		 19,149
(1.51 %)		 29,936
(1.96 %)		 42.01
(82.92 %)		 216,216
(17.12 %)		 237,700
(82.88 %)		 3,599,795
(26.09 %)		 790,256
(1.69 %)		 12,003,956
(24.29 %)		 18,591
(0.51 %)
218 golden spiny mouse (2020)
GCF_903995435.1		 36,997
(1.96 %)		 20,006
(1.91 %)		 19,132
(1.50 %)		 n/a 42.51
(99.65 %)		 880
(0.35 %)		 623
(100.00 %)		 4,785,907
(32.61 %)		 1,305,613
(3.34 %)		 12,958,061
(32.33 %)		 20,760
(0.59 %)
219 gracile shrew mole
GCA_004024945.1		 n/a 19,165
(1.25 %)		 43,816
(1.48 %)		 n/a 41.08
(99.89 %)		 8,248
(0.04 %)		 732,083
(99.96 %)		 2,957,465
(23.76 %)		 783,289
(2.60 %)		 11,503,344
(31.38 %)		 92,729
(3.60 %)
220 gray seal
GCF_012393455.1		 79,009
(3.73 %)		 19,882
(1.73 %)		 22,416
(1.46 %)		 n/a 41.44
(100.00 %)		 117
(0.00 %)		 6,880
(100.00 %)		 4,448,588
(43.28 %)		 557,710
(1.32 %)		 13,340,576
(33.41 %)		 55,637
(1.78 %)
221 gray short-tailed opossum (mMonDom1 alternate hap 2023)
GCA_027917375.1		 n/a 12,662
(0.70 %)		 15,124
(0.89 %)		 n/a 37.74
(100.00 %)		 24
(0.00 %)		 8,086
(100.00 %)		 4,098,004
(25.33 %)		 806,470
(2.98 %)		 16,244,072
(43.39 %)		 24,879
(0.67 %)
222 gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027887165.1		 73,383
(3.04 %)		 16,637
(0.72 %)		 16,036
(0.85 %)		 n/a 37.92
(99.11 %)		 2,255
(0.89 %)		 13
(100.00 %)		 5,562,359
(25.40 %)		 1,096,620
(2.60 %)		 22,322,748
(43.37 %)		 28,894
(0.57 %)
223 gray short-tailed opossum (MonDom5 2007)
GCF_000002295.2		 68,375
(2.34 %)		 16,663
(0.75 %)		 16,162
(0.84 %)		 n/a 37.82
(97.26 %)		 67,660
(2.75 %)		 72,674
(97.25 %)		 7,753,175
(55.85 %)		 1,051,473
(2.34 %)		 22,274,001
(42.23 %)		 30,883
(0.53 %)
224 gray squirrel (2020)
GCF_902686445.1		 58,884
(2.46 %)		 20,752
(1.49 %)		 21,107
(1.31 %)		 32,732
(1.45 %)		 40.06
(99.98 %)		 1,824
(0.02 %)		 752
(100.00 %)		 4,605,578
(34.50 %)		 728,192
(1.65 %)		 15,467,412
(33.91 %)		 51,878
(1.11 %)
225 gray squirrel (alternate hap 2019)
GCA_902685475.1		 n/a 17,156
(1.53 %)		 18,190
(1.33 %)		 n/a 40.25
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 9,510
(100.00 %)		 3,455,580
(34.94 %)		 530,053
(1.56 %)		 10,927,458
(32.64 %)		 38,976
(1.13 %)
226 gray wolf (2021)
GCA_905319855.2		 n/a 19,474
(1.55 %)		 20,394
(1.40 %)		 72,806
(4.12 %)		 41.49
(100.00 %)		 166
(0.00 %)		 82
(100.00 %)		 4,550,524
(31.76 %)		 1,063,944
(3.96 %)		 13,588,117
(34.74 %)		 51,996
(2.15 %)
227 gray wolf (alternate hap 2021)
GCA_905319845.1		 n/a 12,760
(1.57 %)		 14,423
(1.42 %)		 n/a 41.35
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 5,537
(100.00 %)		 2,725,227
(31.66 %)		 616,862
(3.40 %)		 8,041,744
(32.68 %)		 32,293
(2.35 %)
228 great fruit-eating bat (mArtLit1 hap1 2024)
GCA_038363095.1		 n/a 18,022
(1.56 %)		 20,018
(1.52 %)		 n/a 42.28
(100.00 %)		 81
(0.00 %)		 419
(100.00 %)		 2,827,417
(26.82 %)		 371,479
(4.97 %)		 11,603,093
(34.64 %)		 71,574
(2.28 %)
229 great roundleaf bat (v2 ML-2016 2016)
GCF_001890085.2		 50,895
(3.26 %)		 18,993
(2.01 %)		 19,633
(1.65 %)		 41,769
(2.41 %)		 41.11
(87.42 %)		 172,750
(12.60 %)		 7,387
(100.00 %)		 2,946,981
(30.72 %)		 495,272
(1.05 %)		 11,587,728
(25.43 %)		 32,949
(0.96 %)
230 greater bulldog bat
GCA_004026585.1		 n/a 20,774
(1.62 %)		 28,140
(1.63 %)		 n/a 40.92
(99.94 %)		 6,171
(0.03 %)		 304,393
(99.97 %)		 3,288,598
(29.60 %)		 478,424
(1.16 %)		 11,427,553
(35.29 %)		 44,124
(1.99 %)
231 Greater cane rat
GCA_004025085.1		 n/a 20,383
(0.98 %)		 47,456
(1.25 %)		 n/a 42.85
(99.83 %)		 8,825
(0.03 %)		 1,898,466
(99.97 %)		 5,569,185
(30.19 %)		 946,696
(3.12 %)		 13,144,109
(41.83 %)		 97,686
(2.61 %)
232 greater horseshoe bat (MPI-CBG alternate hap 2019)
GCA_004115295.1		 n/a 14,896
(1.85 %)		 18,939
(1.59 %)		 n/a 40.69
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 13,426
(100.00 %)		 2,426,330
(34.43 %)		 418,341
(1.36 %)		 8,763,234
(27.86 %)		 24,370
(1.08 %)
233 greater horseshoe bat (v2 MPI-CBG 2019)
GCF_004115265.2		 53,353
(3.13 %)		 18,641
(1.97 %)		 20,359
(1.68 %)		 n/a 40.54
(99.64 %)		 158
(0.36 %)		 134
(100.00 %)		 3,218,744
(34.52 %)		 564,789
(1.35 %)		 12,217,020
(29.39 %)		 32,445
(1.06 %)
234 greater mouse-eared bat (2020 Bat1K)
GCF_014108235.1		 70,930
(3.43 %)		 19,052
(1.84 %)		 21,498
(1.73 %)		 n/a 43.11
(98.55 %)		 538
(1.45 %)		 93
(100.00 %)		 3,088,083
(26.27 %)		 753,124
(2.84 %)		 10,383,466
(35.84 %)		 61,023
(2.69 %)
235 greater sac-winged bat (mSacBil1 primary hap 2024)
GCA_036850765.1		 n/a 18,322
(1.40 %)		 21,049
(1.35 %)		 n/a 41.71
(98.73 %)		 468
(1.27 %)		 359
(99.59 %)		 4,247,148
(29.53 %)		 1,031,385
(2.50 %)		 12,465,194
(43.30 %)		 101,620
(2.01 %)
236 greater spear-nosed bat (2021 Texas Tech U)
GCF_019186645.2		 50,563
(2.96 %)		 18,224
(1.70 %)		 20,689
(1.67 %)		 n/a 42.27
(100.00 %)		 55
(0.00 %)		 534
(100.00 %)		 2,961,591
(0.00 %)		 387,908
(0.97 %)		 12,179,612
(30.91 %)		 62,189
(5.35 %)
237 grey whale
GCA_004363415.1		 n/a 21,827
(1.52 %)		 32,191
(1.24 %)		 n/a 41.22
(99.88 %)		 10,622
(0.04 %)		 1,046,770
(99.96 %)		 4,841,166
(45.56 %)		 780,015
(1.83 %)		 13,559,563
(39.86 %)		 72,343
(1.59 %)
238 grey whale (mEscRob2 alternate hap 2023)
GCA_028021475.1		 n/a 19,129
(1.37 %)		 24,628
(1.24 %)		 n/a 41.83
(100.00 %)		 n/a 14,442
(100.00 %)		 3,892,130
(35.74 %)		 874,864
(15.70 %)		 11,484,916
(45.69 %)		 73,507
(1.72 %)
239 grey whale (mEscRob2 primary hap 2023)
GCA_028021215.1		 n/a 19,288
(1.38 %)		 21,791
(1.21 %)		 n/a 41.74
(100.00 %)		 279
(0.00 %)		 704
(100.00 %)		 4,116,900
(35.85 %)		 966,065
(16.74 %)		 12,154,173
(46.39 %)		 77,011
(1.59 %)
240 hairy big-eared bat (US037 2019 Broad)
GCA_004026765.1		 n/a 21,360
(1.44 %)		 37,376
(1.52 %)		 n/a 42.38
(99.94 %)		 3,218
(0.01 %)		 553,308
(99.99 %)		 3,519,246
(30.77 %)		 393,318
(0.85 %)		 12,525,258
(34.42 %)		 84,875
(2.37 %)
241 harbor porpoise (primary hap 2024)
GCA_963924675.1		 n/a 18,529
(1.58 %)		 20,583
(1.34 %)		 n/a 41.72
(99.99 %)		 966
(0.01 %)		 442
(100.00 %)		 3,760,716
(36.18 %)		 888,368
(7.18 %)		 12,379,240
(39.04 %)		 71,530
(2.69 %)
242 harbor seal
GCF_004348235.1		 50,670
(2.98 %)		 19,484
(1.76 %)		 20,771
(1.44 %)		 33,296
(1.58 %)		 41.38
(99.09 %)		 16,480
(0.91 %)		 21,161
(99.09 %)		 4,526,182
(43.28 %)		 576,921
(1.11 %)		 13,421,780
(33.06 %)		 54,592
(1.70 %)
243 Hawaiian monk seal (2021 Johns Hopkins U)
GCF_002201575.2		 37,605
(1.99 %)		 19,483
(1.73 %)		 19,767
(1.35 %)		 n/a 41.41
(98.23 %)		 25,763
(1.77 %)		 7,487
(100.00 %)		 4,575,217
(43.59 %)		 583,394
(1.11 %)		 13,374,131
(33.69 %)		 52,067
(1.50 %)
244 hazel dormouse
GCA_004027005.1		 n/a 21,556
(1.24 %)		 40,971
(1.33 %)		 n/a 41.60
(99.91 %)		 15,076
(0.06 %)		 481,881
(99.94 %)		 6,679,641
(33.98 %)		 1,653,419
(3.72 %)		 12,685,676
(43.98 %)		 71,478
(1.57 %)
245 hazel dormouse (alternate hap 2023)
GCA_963383665.1		 n/a 11,130
(1.23 %)		 22,071
(1.36 %)		 n/a 42.15
(99.99 %)		 n/a 31,856
(100.00 %)		 2,958,239
(41.25 %)		 788,242
(4.52 %)		 6,056,268
(41.88 %)		 36,143
(1.96 %)
246 hazel dormouse (primary hap 2023)
GCA_963383645.1		 n/a 18,620
(1.42 %)		 22,403
(1.38 %)		 n/a 41.73
(99.99 %)		 1,805
(0.01 %)		 214
(100.00 %)		 6,063,911
(41.66 %)		 1,593,657
(4.46 %)		 12,229,281
(43.98 %)		 71,058
(1.88 %)
247 hippopotamus (BS01 2019 Broad)
GCA_004027065.1		 n/a 24,267
(1.55 %)		 34,820
(1.30 %)		 n/a 41.43
(99.91 %)		 4,730
(0.02 %)		 972,599
(99.98 %)		 4,579,311
(41.26 %)		 606,731
(1.02 %)		 14,514,493
(36.58 %)		 54,753
(1.59 %)
248 hippopotamus (HIP001 2018)
GCA_002995585.1		 n/a 22,343
(1.70 %)		 31,687
(1.45 %)		 n/a 40.96
(94.63 %)		 153,125
(5.38 %)		 281,897
(94.62 %)		 3,952,905
(38.55 %)		 476,243
(1.97 %)		 14,216,817
(27.43 %)		 48,380
(1.43 %)
249 hippopotamus (mHipAmp2 hap1 2023)
GCA_030028035.1		 n/a 20,391
(1.63 %)		 20,668
(1.37 %)		 n/a 41.62
(100.00 %)		 83
(0.00 %)		 545
(100.00 %)		 3,778,764
(35.17 %)		 563,345
(3.63 %)		 13,524,869
(35.56 %)		 48,164
(1.90 %)
250 hippopotamus (v2 hap2 2023 refseq)
GCF_030028045.1		 64,153
(2.73 %)		 20,331
(1.62 %)		 20,633
(1.37 %)		 n/a 41.60
(100.00 %)		 226
(0.00 %)		 357
(100.00 %)		 3,783,440
(35.17 %)		 567,797
(3.38 %)		 13,462,531
(35.48 %)		 48,365
(1.91 %)
251 hirola (BS46 2019 Broad)
GCA_004027495.1		 n/a 22,264
(1.40 %)		 36,984
(1.26 %)		 n/a 42.31
(99.93 %)		 9,287
(0.03 %)		 545,176
(99.97 %)		 5,809,405
(48.62 %)		 465,001
(1.08 %)		 13,326,245
(42.35 %)		 48,312
(1.15 %)
252 Hispaniolan solenodon
GCA_004363575.1		 n/a 18,805
(1.55 %)		 27,454
(1.64 %)		 n/a 39.98
(99.96 %)		 5,186
(0.02 %)		 181,804
(99.98 %)		 2,669,787
(26.78 %)		 431,610
(1.04 %)		 13,429,711
(27.35 %)		 53,444
(2.30 %)
253 hispid cotton rat
GCA_004025045.1		 n/a 25,324
(1.49 %)		 31,681
(1.31 %)		 39,953
(1.43 %)		 39.77
(99.89 %)		 13,744
(0.05 %)		 897,290
(99.95 %)		 4,384,099
(28.17 %)		 1,132,313
(3.34 %)		 14,729,737
(38.08 %)		 17,558
(0.40 %)
254 Hoffmann's two-fingered sloth
GCA_000164785.2		 n/a 24,546
(1.30 %)		 30,273
(1.15 %)		 n/a 39.80
(98.09 %)		 101,085
(1.91 %)		 370,035
(98.09 %)		 5,145,551
(52.20 %)		 614,819
(1.62 %)		 17,932,269
(39.26 %)		 55,943
(1.04 %)
255 hog-nosed bat
GCA_004027555.1		 n/a 20,591
(1.30 %)		 39,589
(1.39 %)		 n/a 40.99
(99.88 %)		 6,224
(0.03 %)		 1,230,480
(99.97 %)		 4,081,924
(31.12 %)		 1,008,077
(2.20 %)		 12,068,828
(39.98 %)		 55,567
(2.02 %)
256 Honduran yellow-shouldered bat (v2.1 Veracruz 20B 2020)
GCF_014824575.3		 49,071
(2.78 %)		 17,588
(1.64 %)		 19,357
(1.60 %)		 n/a 42.32
(99.79 %)		 38,648
(0.21 %)		 25,848
(100.00 %)		 2,708,400
(27.89 %)		 366,870
(1.48 %)		 11,795,308
(31.27 %)		 59,066
(1.72 %)
257 horse (maternal 2024)
GCA_036418255.1		 n/a 16,789
(1.65 %)		 18,017
(1.36 %)		 n/a 42.07
(100.00 %)		 210
(0.00 %)		 821
(100.00 %)		 3,146,381
(34.68 %)		 430,664
(5.91 %)		 13,246,059
(32.62 %)		 37,293
(2.80 %)
258 horse (paternal 2024)
GCA_036426135.1		 n/a 19,073
(1.67 %)		 20,636
(1.38 %)		 n/a 42.08
(100.00 %)		 114
(0.00 %)		 602
(100.00 %)		 3,521,953
(35.39 %)		 461,571
(5.26 %)		 14,833,688
(32.77 %)		 43,527
(2.54 %)
259 horse (Twilight 2018)
GCF_002863925.1		 76,567
(4.06 %)		 18,997
(1.73 %)		 20,914
(1.42 %)		 113,346
(6.08 %)		 41.50
(99.62 %)		 6,294
(0.38 %)		 4,701
(100.00 %)		 4,080,319
(44.85 %)		 395,037
(1.44 %)		 15,169,517
(29.93 %)		 44,825
(1.77 %)
260 house mouse (129S1_SvImJv1 2016)
GCA_001624185.1		 n/a 21,289
(2.22 %)		 18,626
(1.42 %)		 102,148
(4.16 %)		 41.77
(85.00 %)		 366,945
(15.05 %)		 62,882
(95.15 %)		 5,075,137
(40.38 %)		 1,400,072
(2.80 %)		 13,497,076
(26.20 %)		 16,957
(0.40 %)
261 house mouse (129S1_SvImJ_v3 2022)
GCA_921998555.2		 n/a 21,780
(2.13 %)		 19,436
(1.37 %)		 110,376
(4.47 %)		 41.79
(99.60 %)		 1,557
(0.40 %)		 188
(100.00 %)		 4,653,663
(40.74 %)		 1,550,342
(3.54 %)		 12,930,784
(35.48 %)		 23,211
(0.57 %)
262 house mouse (AKR_J v3 2022)
GCA_922000895.2		 n/a 21,721
(2.13 %)		 19,324
(1.37 %)		 110,654
(4.48 %)		 41.80
(99.85 %)		 2,714
(0.15 %)		 201
(100.00 %)		 4,645,513
(40.70 %)		 1,547,237
(3.56 %)		 13,016,932
(35.69 %)		 23,309
(0.57 %)
263 house mouse (alternate hap 2023)
GCA_949316305.1		 n/a 661
(0.88 %)		 720
(0.54 %)		 n/a 38.59
(100.00 %)		 n/a 1,806
(100.00 %)		 97,279
(72.21 %)		 40,071
(55.89 %)		 208,928
(64.94 %)		 506
(0.31 %)
264 house mouse (A_J v3 2022)
GCA_921998355.2		 n/a 21,869
(2.13 %)		 19,400
(1.37 %)		 110,389
(4.48 %)		 41.80
(99.39 %)		 608
(0.61 %)		 163
(100.00 %)		 4,668,553
(40.80 %)		 1,556,835
(3.58 %)		 12,995,938
(35.53 %)		 23,203
(0.56 %)
265 house mouse (BALB_cJ v3 2022)
GCA_921997145.2		 n/a 21,891
(2.13 %)		 19,499
(1.37 %)		 110,461
(4.47 %)		 41.79
(99.80 %)		 274
(0.20 %)		 217
(100.00 %)		 4,673,990
(40.79 %)		 1,560,327
(3.63 %)		 13,018,071
(35.70 %)		 23,196
(0.56 %)
266 house mouse (C3H_HeJ v3 2022)
GCA_921997125.2		 n/a 21,793
(2.13 %)		 19,516
(1.38 %)		 110,049
(4.46 %)		 41.79
(99.05 %)		 844
(0.95 %)		 174
(100.00 %)		 4,657,005
(40.76 %)		 1,551,107
(3.53 %)		 12,949,100
(35.32 %)		 23,262
(0.56 %)
267 house mouse (CBA_J v3 2022)
GCA_921998905.2		 n/a 21,829
(2.13 %)		 19,841
(1.39 %)		 110,858
(4.48 %)		 41.79
(99.52 %)		 658
(0.48 %)		 145
(100.00 %)		 4,658,032
(40.77 %)		 1,552,298
(3.59 %)		 12,948,038
(35.52 %)		 23,232
(0.56 %)
268 house mouse (DBA_2J v3 2022)
GCA_921998315.2		 n/a 22,302
(2.08 %)		 19,749
(1.35 %)		 113,269
(4.42 %)		 41.72
(100.00 %)		 153
(0.00 %)		 361
(100.00 %)		 4,785,676
(41.69 %)		 1,597,598
(4.56 %)		 13,190,158
(36.58 %)		 24,140
(0.59 %)
269 house mouse (FVB_NJ v3 2022)
GCA_921998635.2		 n/a 21,633
(2.15 %)		 19,565
(1.40 %)		 110,246
(4.50 %)		 41.82
(98.35 %)		 6,244
(1.65 %)		 384
(100.00 %)		 4,621,601
(40.42 %)		 1,537,622
(3.48 %)		 12,818,729
(34.77 %)		 22,696
(0.55 %)
270 house mouse (LP_J v3 2022)
GCA_947599735.1		 n/a 22,452
(1.91 %)		 19,841
(1.23 %)		 110,073
(3.98 %)		 41.29
(99.99 %)		 386
(0.01 %)		 515
(100.00 %)		 4,839,574
(46.33 %)		 1,645,163
(11.88 %)		 12,936,515
(41.49 %)		 24,374
(0.54 %)
271 house mouse (NOD_ShiLtJ v3 2022)
GCA_921998325.2		 n/a 21,797
(2.13 %)		 19,521
(1.38 %)		 109,890
(4.48 %)		 41.80
(99.50 %)		 1,462
(0.50 %)		 170
(100.00 %)		 4,650,016
(40.74 %)		 1,547,220
(3.54 %)		 12,918,125
(35.45 %)		 23,253
(0.56 %)
272 house mouse (NZO_HlLtJ v3 2022)
GCA_947593165.1		 n/a 22,481
(1.93 %)		 19,932
(1.26 %)		 109,670
(4.03 %)		 41.34
(100.00 %)		 234
(0.00 %)		 441
(100.00 %)		 4,822,230
(45.92 %)		 1,637,027
(11.19 %)		 13,082,730
(41.04 %)		 24,187
(0.54 %)
273 house mouse (primary hap 2023)
GCA_949316315.1		 n/a 22,351
(1.96 %)		 19,629
(1.26 %)		 n/a 41.38
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 179
(100.00 %)		 4,774,018
(45.31 %)		 1,620,102
(10.50 %)		 13,181,250
(40.47 %)		 23,955
(0.54 %)
274 house mouse C57BL/6J 2020 GRC
GCF_000001635.27		 130,343
(4.85 %)		 22,409
(2.02 %)		 19,480
(1.31 %)		 140,725
(4.83 %)		 41.67
(97.30 %)		 334
(2.70 %)		 22,273
(97.30 %)		 5,361,085
(45.51 %)		 1,641,063
(3.41 %)		 12,722,791
(36.04 %)		 23,794
(0.53 %)
275 house mouse C57BL_6NJ (2016)
GCA_001632555.1		 n/a 21,177
(2.23 %)		 18,495
(1.42 %)		 103,002
(4.20 %)		 41.76
(82.53 %)		 410,660
(17.53 %)		 49,821
(96.37 %)		 5,081,049
(40.22 %)		 1,392,942
(2.58 %)		 13,476,268
(25.21 %)		 16,877
(0.39 %)
276 house mouse C57BL_6NJ (2022)
GCA_921999865.2		 n/a 21,817
(2.13 %)		 19,349
(1.37 %)		 n/a 41.79
(99.76 %)		 1,127
(0.24 %)		 214
(100.00 %)		 4,661,104
(40.76 %)		 1,552,079
(3.56 %)		 12,953,662
(35.57 %)		 23,204
(0.56 %)
277 house mouse CAST_EiJ
GCA_001624445.1		 n/a 21,103
(2.24 %)		 18,682
(1.45 %)		 102,099
(4.16 %)		 41.83
(86.23 %)		 424,005
(13.83 %)		 52,352
(97.85 %)		 4,990,851
(39.88 %)		 1,356,202
(2.67 %)		 13,469,640
(26.15 %)		 16,724
(0.41 %)
278 hybrid cattle (Angus x Brahman F1 Angus haplotype 2018)
GCA_003369685.2		 n/a 19,096
(1.59 %)		 20,674
(1.34 %)		 n/a 41.99
(99.75 %)		 277
(0.25 %)		 1,435
(100.00 %)		 5,290,422
(47.51 %)		 478,946
(1.94 %)		 12,568,313
(41.15 %)		 45,850
(1.37 %)
279 hybrid cattle (Angus x Brahman F1 Brahman haplotype 2018)
GCF_003369695.1		 63,234
(2.88 %)		 19,601
(1.57 %)		 21,699
(1.34 %)		 n/a 41.83
(99.94 %)		 302
(0.06 %)		 1,250
(100.00 %)		 5,524,454
(47.57 %)		 459,928
(1.40 %)		 13,208,799
(41.21 %)		 41,359
(1.10 %)
280 Iberian mole (v2.1 TD23 2020)
GCF_014898055.3		 56,973
(3.41 %)		 18,431
(1.69 %)		 20,317
(1.59 %)		 n/a 41.89
(99.89 %)		 3,575
(0.11 %)		 3,202
(100.00 %)		 2,635,974
(23.38 %)		 496,514
(1.29 %)		 10,969,546
(32.61 %)		 47,466
(2.89 %)
281 Indian false vampire
GCA_004026885.1		 n/a 20,067
(1.37 %)		 36,544
(1.53 %)		 32,548
(1.37 %)		 40.84
(99.83 %)		 6,266
(0.02 %)		 1,909,067
(99.98 %)		 4,096,409
(31.50 %)		 699,311
(1.81 %)		 12,307,198
(39.96 %)		 92,830
(3.12 %)
282 Indian flying fox
GCF_902729225.1		 64,763
(3.85 %)		 18,222
(2.01 %)		 23,187
(1.82 %)		 45,389
(2.18 %)		 39.83
(99.10 %)		 17,500
(0.90 %)		 16,113
(100.00 %)		 2,972,300
(34.11 %)		 487,157
(1.49 %)		 12,486,528
(27.37 %)		 57,869
(3.73 %)
283 Indochinese shrew (US011 2019 Broad)
GCA_004027635.1		 n/a 18,870
(0.51 %)		 55,636
(0.81 %)		 n/a 39.81
(99.83 %)		 5,267
(0.02 %)		 2,420,679
(99.98 %)		 4,130,068
(16.60 %)		 1,663,335
(3.30 %)		 18,728,711
(46.19 %)		 31,453
(0.55 %)
284 Indus River dolphin
GCA_004363435.1		 n/a 24,321
(1.30 %)		 47,065
(1.14 %)		 n/a 41.72
(99.88 %)		 11,702
(0.04 %)		 1,110,492
(99.96 %)		 5,093,308
(45.60 %)		 845,860
(1.72 %)		 13,162,111
(41.37 %)		 68,257
(1.40 %)
285 intermediate roundleaf bat (primary hap 2023)
GCA_031876335.1		 n/a 19,064
(1.67 %)		 20,800
(1.49 %)		 n/a 41.55
(100.00 %)		 119
(0.00 %)		 69
(100.00 %)		 3,393,548
(30.92 %)		 723,545
(6.58 %)		 12,073,117
(35.40 %)		 43,736
(1.20 %)
286 jaguar (BS21 2019)
GCA_004023805.1		 n/a 21,431
(1.51 %)		 32,835
(1.35 %)		 n/a 41.70
(99.89 %)		 21,329
(0.09 %)		 460,121
(99.91 %)		 5,420,861
(43.75 %)		 1,049,353
(1.93 %)		 13,848,545
(34.90 %)		 71,066
(2.37 %)
287 jaguar (Sample0147 2023)
GCF_028533385.1		 71,565
(4.12 %)		 19,122
(1.67 %)		 21,950
(1.36 %)		 n/a 41.58
(99.31 %)		 56,371
(0.70 %)		 36,243
(100.00 %)		 4,552,854
(33.37 %)		 897,371
(1.63 %)		 13,732,912
(32.89 %)		 63,777
(2.41 %)
288 jaguarundi
GCF_014898765.1		 72,564
(3.15 %)		 18,602
(1.64 %)		 20,510
(1.39 %)		 n/a 41.75
(97.85 %)		 42,499
(2.16 %)		 10,948
(100.00 %)		 5,035,745
(43.29 %)		 907,329
(1.61 %)		 13,590,905
(33.57 %)		 69,090
(2.29 %)
289 Jamaican fruit-eating bat (1a 2020 Wuhan U)
GCF_014825515.1		 48,705
(2.72 %)		 19,921
(1.66 %)		 23,614
(1.68 %)		 39,384
(2.12 %)		 41.95
(98.87 %)		 110,840
(1.13 %)		 56,740
(100.00 %)		 2,972,388
(28.79 %)		 405,474
(2.15 %)		 12,458,880
(30.65 %)		 61,973
(1.87 %)
290 Jamaican fruit-eating bat (2021)
GCF_021234435.1		 55,114
(3.18 %)		 17,875
(1.68 %)		 19,958
(1.66 %)		 n/a 42.00
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 868
(100.00 %)		 2,697,287
(28.17 %)		 318,700
(0.84 %)		 11,750,329
(31.61 %)		 61,951
(1.93 %)
291 Japanese wild mouse (2022)
GCA_921999095.2		 n/a 23,292
(2.05 %)		 20,114
(1.31 %)		 n/a 41.71
(100.00 %)		 397
(0.00 %)		 1,449
(100.00 %)		 4,952,306
(42.53 %)		 1,635,456
(4.60 %)		 12,838,321
(38.56 %)		 24,168
(0.56 %)
292 Java mouse-deer (US108 2019 Broad)
GCA_004024965.1		 n/a 23,081
(1.38 %)		 38,181
(1.41 %)		 n/a 42.73
(99.91 %)		 2,829
(0.01 %)		 1,159,819
(99.99 %)		 4,791,310
(34.97 %)		 448,498
(1.92 %)		 13,175,375
(39.89 %)		 68,778
(2.92 %)
293 killer whale (2022)
GCF_937001465.1		 78,470
(3.76 %)		 18,710
(1.51 %)		 21,101
(1.30 %)		 34,448
(1.49 %)		 41.91
(100.00 %)		 123
(0.00 %)		 448
(100.00 %)		 3,955,401
(36.81 %)		 844,672
(9.94 %)		 12,233,568
(41.63 %)		 77,307
(3.08 %)
294 killer whale (alternate hap 2022)
GCA_937001455.1		 n/a 14,982
(1.50 %)		 19,185
(1.30 %)		 n/a 42.13
(100.00 %)		 n/a 12,410
(100.00 %)		 2,752,892
(35.61 %)		 589,217
(10.15 %)		 8,371,032
(41.11 %)		 57,347
(3.41 %)
295 killer whale (Morgan 2013)
GCF_000331955.2		 70,972
(3.55 %)		 18,736
(1.86 %)		 20,365
(1.48 %)		 n/a 41.35
(94.82 %)		 78,441
(5.20 %)		 80,100
(94.80 %)		 3,978,339
(43.98 %)		 555,737
(1.13 %)		 12,773,973
(31.51 %)		 61,145
(1.59 %)
296 koala (Bilbo 61053 2022)
GCA_003287225.2		 n/a 17,087
(0.81 %)		 14,711
(0.86 %)		 n/a 39.05
(100.00 %)		 669
(0.00 %)		 1,246
(100.00 %)		 6,280,029
(29.77 %)		 1,123,294
(2.02 %)		 21,796,316
(39.24 %)		 15,957
(0.35 %)
297 Kuhl's pipistrelle (2020)
GCF_014108245.1		 63,293
(2.96 %)		 17,918
(1.89 %)		 20,819
(1.86 %)		 n/a 42.57
(99.31 %)		 394
(0.69 %)		 202
(100.00 %)		 2,897,422
(23.58 %)		 797,420
(2.76 %)		 10,057,100
(34.56 %)		 55,965
(2.99 %)
298 large flying fox
GCF_000151845.1		 52,243
(3.10 %)		 18,454
(1.91 %)		 23,631
(1.73 %)		 n/a 39.82
(91.80 %)		 189,340
(8.24 %)		 225,433
(91.76 %)		 3,117,045
(36.49 %)		 504,277
(3.03 %)		 13,025,556
(25.00 %)		 78,404
(3.24 %)
299 large Japanese field mouse (IB14-021 2017)
GCA_002335545.1		 n/a 22,630
(1.74 %)		 33,810
(1.26 %)		 n/a 42.04
(57.78 %)		 4,289,924
(42.35 %)		 4,626,044
(57.65 %)		 3,638,537
(31.76 %)		 1,048,253
(1.87 %)		 12,039,926
(16.61 %)		 19,817
(0.34 %)
300 large tree shrew (BS70 2022)
GCA_026018925.1		 n/a 21,678
(1.34 %)		 22,317
(1.25 %)		 n/a 42.17
(100.00 %)		 1,188
(0.00 %)		 1,198
(100.00 %)		 5,530,547
(22.20 %)		 1,357,640
(10.13 %)		 14,334,312
(46.09 %)		 123,453
(2.17 %)
301 leopard (Hobbes primary hap 2022)
GCF_024362965.1		 70,488
(3.29 %)		 18,472
(1.56 %)		 20,388
(1.41 %)		 n/a 41.75
(99.99 %)		 335
(0.01 %)		 382
(100.00 %)		 4,634,038
(33.80 %)		 932,991
(2.25 %)		 13,686,652
(34.03 %)		 65,793
(2.64 %)
302 leopard (Maewha 2016 refseq)
GCF_001857705.1		 73,266
(3.20 %)		 18,881
(1.63 %)		 21,010
(1.44 %)		 n/a 41.71
(96.17 %)		 214,953
(3.85 %)		 265,330
(96.15 %)		 5,247,029
(42.87 %)		 1,059,446
(5.13 %)		 14,265,573
(32.20 %)		 77,001
(2.45 %)
303 leopard cat
GCF_016509475.1		 59,965
(3.05 %)		 18,472
(1.65 %)		 19,934
(1.38 %)		 n/a 41.80
(100.00 %)		 56
(0.00 %)		 123
(100.00 %)		 4,978,115
(43.28 %)		 901,754
(1.84 %)		 13,596,535
(34.23 %)		 67,390
(2.50 %)
304 lesser Egyptian jerboa (2021)
GCF_020740685.1		 51,730
(1.99 %)		 20,129
(1.24 %)		 22,089
(1.24 %)		 40,414
(1.76 %)		 42.00
(99.52 %)		 561
(0.48 %)		 160
(100.00 %)		 7,346,291
(41.25 %)		 1,187,587
(2.92 %)		 14,222,177
(44.13 %)		 34,688
(0.86 %)
305 lesser Egyptian jerboa (alternate hap 2021)
GCA_020740715.1		 n/a 17,777
(1.27 %)		 19,232
(1.28 %)		 n/a 42.13
(92.75 %)		 2,875
(7.25 %)		 508
(100.00 %)		 6,476,967
(33.93 %)		 999,133
(2.78 %)		 11,809,834
(40.52 %)		 29,872
(0.82 %)
306 lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 refseq)
GCF_000280705.1		 25,991
(1.44 %)		 19,408
(1.38 %)		 20,312
(1.35 %)		 n/a 41.87
(87.17 %)		 326,464
(12.87 %)		 337,360
(87.13 %)		 6,125,934
(38.31 %)		 832,825
(1.53 %)		 13,661,612
(33.98 %)		 26,669
(0.59 %)
307 lesser panda
GCA_002007465.1		 n/a 19,120
(1.69 %)		 20,591
(1.50 %)		 n/a 41.60
(98.56 %)		 137,333
(1.45 %)		 148,922
(98.55 %)		 4,513,888
(40.87 %)		 692,778
(1.62 %)		 13,691,859
(31.36 %)		 64,369
(2.52 %)
308 lesser sac-winged bat (mSacLep1 primary hap 2024)
GCA_036850995.1		 n/a 18,322
(1.42 %)		 21,350
(1.39 %)		 n/a 41.84
(99.24 %)		 573
(0.76 %)		 345
(99.51 %)		 4,224,340
(28.69 %)		 1,030,574
(2.60 %)		 12,591,928
(42.30 %)		 98,189
(2.06 %)
309 lion
GCF_018350215.1		 67,745
(2.86 %)		 17,956
(1.69 %)		 19,033
(1.40 %)		 61,242
(3.04 %)		 41.71
(100.00 %)		 55
(0.00 %)		 99
(100.00 %)		 4,666,951
(42.23 %)		 889,987
(1.87 %)		 13,151,686
(33.40 %)		 62,675
(2.56 %)
310 little brown bat
GCF_000147115.1		 50,660
(2.76 %)		 19,314
(1.86 %)		 22,683
(1.70 %)		 n/a 42.50
(96.66 %)		 61,131
(3.35 %)		 72,785
(96.65 %)		 3,682,263
(37.05 %)		 634,854
(2.15 %)		 10,841,759
(33.45 %)		 57,630
(1.79 %)
311 little pocket mouse (longimembris alternate hap 2022)
GCA_024363435.1		 n/a 19,150
(1.52 %)		 23,435
(1.64 %)		 n/a 42.08
(100.00 %)		 229
(0.00 %)		 718
(100.00 %)		 n/a 1,051,300
(12.43 %)		 9,858,628
(43.20 %)		 48,101
(2.62 %)
312 little pocket mouse (longimembris primary hap 2022)
GCA_024363575.1		 n/a 19,760
(1.50 %)		 24,317
(1.63 %)		 n/a 42.09
(100.00 %)		 215
(0.00 %)		 1,135
(100.00 %)		 3,913,744
(28.43 %)		 1,095,577
(12.70 %)		 10,273,833
(43.74 %)		 49,636
(2.61 %)
313 little tube-nosed bat
GCA_004026665.1		 n/a 22,009
(1.26 %)		 45,725
(1.35 %)		 n/a 43.80
(99.90 %)		 6,795
(0.03 %)		 886,972
(99.97 %)		 3,372,804
(23.57 %)		 1,014,476
(3.00 %)		 11,948,592
(41.18 %)		 71,530
(2.05 %)
314 long-finned pilot whale (primary hap 2023)
GCF_963455315.1		 61,797
(2.84 %)		 18,712
(1.51 %)		 20,920
(1.39 %)		 n/a 42.38
(99.99 %)		 1,084
(0.01 %)		 993
(100.00 %)		 4,125,420
(35.62 %)		 1,577,899
(12.03 %)		 12,347,226
(42.01 %)		 71,821
(5.51 %)
315 long-finned pilot whale (X-22926-18 2019)
GCF_006547405.1		 66,104
(3.28 %)		 18,772
(1.80 %)		 21,031
(1.46 %)		 33,672
(1.78 %)		 41.29
(99.58 %)		 14,859
(0.42 %)		 20,999
(99.58 %)		 3,962,125
(45.58 %)		 557,247
(1.11 %)		 12,616,535
(34.70 %)		 62,905
(1.69 %)
316 long-tailed chinchilla
GCF_000276665.1		 54,841
(2.98 %)		 18,096
(1.59 %)		 19,514
(1.52 %)		 n/a 41.06
(95.56 %)		 78,817
(4.46 %)		 81,656
(95.54 %)		 4,018,866
(30.94 %)		 607,082
(1.15 %)		 13,528,234
(28.15 %)		 46,931
(1.25 %)
317 long-tongued fruit bat (US102 2019 Broad)
GCA_004027375.1		 n/a 19,208
(1.99 %)		 31,180
(1.92 %)		 n/a 39.56
(99.97 %)		 2,056
(0.01 %)		 174,041
(99.99 %)		 2,893,453
(32.61 %)		 597,516
(1.76 %)		 12,093,608
(28.14 %)		 63,015
(4.70 %)
318 Lowland paca
GCA_004365215.1		 n/a 21,953
(0.62 %)		 56,356
(0.80 %)		 n/a 40.83
(99.78 %)		 3,060
(0.01 %)		 3,771,510
(99.99 %)		 5,892,507
(29.20 %)		 802,811
(1.38 %)		 18,630,883
(38.61 %)		 61,715
(0.94 %)
319 Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 refseq)
GCF_001685135.1		 48,591
(2.76 %)		 19,458
(1.57 %)		 24,783
(1.38 %)		 41,272
(1.95 %)		 40.78
(92.27 %)		 984,658
(7.81 %)		 80,670
(100.00 %)		 3,064,599
(35.21 %)		 866,309
(3.08 %)		 13,310,859
(28.76 %)		 35,558
(0.84 %)
320 Malayan pangolin YNU ManJav 2.0
GCF_014570535.1		 68,043
(3.50 %)		 18,167
(1.72 %)		 20,453
(1.54 %)		 n/a 40.83
(91.78 %)		 57,746
(8.23 %)		 17,969
(100.00 %)		 2,864,567
(34.23 %)		 277,996
(1.69 %)		 12,659,207
(25.72 %)		 33,486
(1.00 %)
321 Masai giraffe (MA1 2016 Penn St)
GCA_001651235.1		 n/a 20,950
(1.52 %)		 28,854
(1.33 %)		 n/a 41.39
(96.50 %)		 257,672
(3.48 %)		 770,838
(96.52 %)		 5,502,479
(43.94 %)		 531,418
(2.64 %)		 13,936,018
(36.18 %)		 40,504
(1.02 %)
322 meadow jumping mouse
GCA_004024765.1		 n/a 22,236
(1.08 %)		 44,719
(1.21 %)		 n/a 42.31
(99.88 %)		 7,610
(0.03 %)		 1,165,710
(99.97 %)		 6,135,446
(33.31 %)		 1,525,146
(3.34 %)		 13,854,475
(39.91 %)		 26,633
(0.68 %)
323 meadow vole (hap1 2024)
GCA_037038515.1		 n/a 19,134
(1.78 %)		 20,672
(1.55 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 60
(0.00 %)		 181
(100.00 %)		 4,818,689
(41.90 %)		 962,362
(4.16 %)		 12,161,222
(34.42 %)		 23,781
(0.74 %)
324 meadow vole (hap2 2024)
GCA_037039175.1		 n/a 19,001
(1.82 %)		 20,271
(1.68 %)		 n/a 42.58
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 143
(100.00 %)		 3,141,368
(21.37 %)		 898,900
(4.24 %)		 11,475,531
(32.14 %)		 22,186
(0.75 %)
325 meerkat (VVHF042 2019 DNA Zoo refseq)
GCF_006229205.1		 58,806
(2.67 %)		 19,009
(1.64 %)		 19,088
(1.36 %)		 n/a 41.68
(99.72 %)		 65,245
(0.28 %)		 63,791
(100.00 %)		 4,564,931
(40.13 %)		 634,179
(1.21 %)		 13,631,635
(32.17 %)		 64,858
(2.22 %)
326 Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 alternate hap 2022)
GCA_024711525.1		 n/a 18,555
(1.22 %)		 24,508
(1.35 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 181
(0.00 %)		 3,482
(100.00 %)		 6,419,007
(53.84 %)		 1,384,128
(15.63 %)		 11,486,822
(50.51 %)		 38,521
(1.60 %)
327 Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022)
GCA_024711535.1		 n/a 21,281
(1.16 %)		 28,592
(1.34 %)		 n/a 42.27
(100.00 %)		 182
(0.00 %)		 4,354
(100.00 %)		 4,378,955
(29.66 %)		 1,568,842
(17.75 %)		 12,889,786
(51.96 %)		 46,167
(1.71 %)
328 minke whale (2013 refseq)
GCF_000493695.1		 42,553
(2.38 %)		 19,159
(1.73 %)		 18,656
(1.42 %)		 n/a 40.94
(94.06 %)		 173,296
(5.96 %)		 184,072
(94.04 %)		 n/a 573,951
(1.48 %)		 13,504,347
(30.96 %)		 65,448
(1.38 %)
329 minke whale (alternate hap 2023)
GCA_950005055.1		 n/a 20,412
(1.46 %)		 27,421
(1.34 %)		 n/a 41.50
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 21,272
(100.00 %)		 3,811,435
(36.24 %)		 959,712
(10.27 %)		 12,159,896
(41.30 %)		 69,852
(1.62 %)
330 minke whale (primary hap 2023 refseq)
GCF_949987535.1		 61,711
(2.51 %)		 19,550
(1.49 %)		 21,499
(1.26 %)		 n/a 41.55
(99.99 %)		 1,177
(0.01 %)		 1,374
(100.00 %)		 4,006,927
(35.92 %)		 1,058,105
(12.08 %)		 12,708,103
(42.66 %)		 72,756
(1.59 %)
331 Mongolian gerbil (243 2017 Lucigen Corp.)
GCF_002204375.1		 40,346
(2.29 %)		 21,215
(1.83 %)		 24,305
(1.47 %)		 n/a 42.09
(95.23 %)		 91,601
(4.78 %)		 68,793
(100.00 %)		 4,821,343
(37.74 %)		 940,776
(1.82 %)		 13,848,274
(31.31 %)		 24,154
(0.74 %)
332 Mongolian gerbil (EAM2014 2019 BGI)
GCA_008131255.1		 n/a 19,952
(1.59 %)		 23,462
(1.36 %)		 n/a 41.98
(99.01 %)		 103,843
(0.97 %)		 412,933
(99.03 %)		 5,009,454
(0.00 %)		 1,042,929
(2.52 %)		 14,121,194
(34.63 %)		 26,044
(0.71 %)
333 Mongolian gerbil (TT.TT164.6M 2023)
GCF_030254825.1		 65,502
(2.97 %)		 19,045
(1.53 %)		 20,203
(1.29 %)		 n/a 41.87
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 193
(100.00 %)		 4,477,607
(37.21 %)		 1,124,432
(5.22 %)		 13,244,320
(39.20 %)		 25,300
(0.76 %)
334 monito del monte (mDroGli1 alternate hap 2021)
GCA_019395325.1		 n/a 16,419
(0.77 %)		 17,219
(0.89 %)		 n/a 39.03
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 9,959
(100.00 %)		 6,332,360
(29.69 %)		 1,065,454
(2.09 %)		 17,908,986
(42.25 %)		 13,856
(0.35 %)
335 monito del monte (mDroGli1 primary hap 2021 refseq)
GCF_019393635.1		 47,034
(2.02 %)		 18,399
(0.80 %)		 15,519
(0.85 %)		 n/a 39.11
(99.91 %)		 260
(0.09 %)		 17
(100.00 %)		 9,107,968
(41.08 %)		 1,249,635
(2.12 %)		 21,135,324
(42.80 %)		 16,598
(0.36 %)
336 Montane guinea pig
GCA_004027695.1		 n/a 20,064
(1.06 %)		 31,321
(1.18 %)		 39,905
(1.42 %)		 40.09
(99.88 %)		 11,321
(0.04 %)		 1,379,500
(99.96 %)		 4,730,634
(30.02 %)		 1,583,664
(6.57 %)		 15,806,339
(40.40 %)		 37,371
(0.76 %)
337 mountain beaver
GCA_004027875.1		 n/a 22,428
(1.10 %)		 38,670
(1.12 %)		 n/a 40.58
(99.89 %)		 7,253
(0.02 %)		 1,286,779
(99.98 %)		 5,859,004
(32.29 %)		 914,052
(2.37 %)		 16,249,666
(38.21 %)		 39,133
(0.76 %)
338 muskrat
GCA_004026605.1		 n/a 22,540
(1.52 %)		 32,136
(1.35 %)		 n/a 41.59
(99.93 %)		 6,243
(0.02 %)		 571,599
(99.98 %)		 4,437,736
(28.49 %)		 922,826
(2.38 %)		 13,945,732
(35.23 %)		 19,876
(0.50 %)
339 naked mole-rat (MEF-2018 2020)
GCA_014060925.1		 n/a 22,011
(1.30 %)		 21,392
(1.22 %)		 n/a 40.13
(95.11 %)		 139,535
(4.91 %)		 148,797
(95.09 %)		 4,885,102
(35.91 %)		 654,418
(1.90 %)		 16,401,315
(34.21 %)		 40,717
(0.98 %)
340 naked mole-rat (NMR 29 2012 refseq)
GCF_000247695.1		 74,574
(3.56 %)		 21,332
(1.74 %)		 20,861
(1.51 %)		 n/a 40.21
(88.43 %)		 110,424
(11.59 %)		 114,653
(88.41 %)		 4,179,991
(32.69 %)		 484,933
(0.92 %)		 13,672,561
(27.63 %)		 31,950
(0.88 %)
341 narwhal (Baffin Bay 2019)
GCF_005190385.1		 51,639
(2.71 %)		 18,741
(1.78 %)		 20,365
(1.40 %)		 33,148
(1.79 %)		 41.22
(99.52 %)		 18,323
(0.49 %)		 6,972
(100.00 %)		 4,011,742
(43.97 %)		 565,367
(1.22 %)		 12,720,018
(34.85 %)		 60,492
(1.58 %)
342 Natal long-fingered bat
GCF_001595765.1		 32,050
(3.03 %)		 18,015
(2.17 %)		 18,293
(1.87 %)		 n/a 42.07
(96.24 %)		 204,616
(3.79 %)		 1,269
(100.00 %)		 2,565,457
(28.95 %)		 376,532
(1.91 %)		 10,427,823
(26.35 %)		 63,261
(2.07 %)
343 neotropical fruit bat
GCF_014824575.2		 49,109
(2.78 %)		 17,703
(1.63 %)		 19,389
(1.60 %)		 n/a 42.32
(99.79 %)		 38,675
(0.21 %)		 26,068
(100.00 %)		 2,862,405
(29.31 %)		 366,960
(1.48 %)		 11,796,203
(31.27 %)		 59,091
(1.70 %)
344 Nilgiri tahr
GCA_004026825.1		 n/a 22,735
(1.44 %)		 34,961
(1.27 %)		 n/a 42.37
(99.93 %)		 10,387
(0.04 %)		 479,550
(99.96 %)		 5,793,761
(48.50 %)		 535,297
(1.34 %)		 13,378,352
(42.46 %)		 57,653
(1.29 %)
345 nine-banded armadillo (mDasNov1 hap1 2023)
GCA_030445055.1		 n/a 19,429
(1.06 %)		 22,396
(1.07 %)		 n/a 40.96
(99.27 %)		 845
(0.73 %)		 594
(100.00 %)		 4,369,568
(32.83 %)		 673,707
(1.55 %)		 18,586,102
(42.41 %)		 131,852
(2.78 %)
346 nine-banded armadillo (mDasNov1 hap1 2023)
GCA_030445055.2		 n/a 19,350
(1.07 %)		 22,207
(1.07 %)		 n/a 40.97
(99.27 %)		 823
(0.73 %)		 588
(100.00 %)		 4,330,716
(32.85 %)		 661,966
(1.52 %)		 18,302,021
(42.22 %)		 130,245
(2.79 %)
347 nine-banded armadillo (mDasNov1 hap2 2023)
GCF_030445035.1		 69,043
(2.70 %)		 20,516
(1.05 %)		 n/a n/a 41.00
(99.68 %)		 771
(0.32 %)		 539
(100.00 %)		 4,656,325
(32.86 %)		 726,574
(1.99 %)		 19,585,522
(43.65 %)		 140,990
(2.86 %)
348 nine-banded armadillo (v3.2 3-136 2012 Baylor)
GCF_000208655.3		 46,110
(1.87 %)		 20,820
(1.08 %)		 25,226
(1.08 %)		 n/a 40.77
(90.89 %)		 268,437
(9.13 %)		 314,788
(90.87 %)		 4,552,770
(34.01 %)		 651,225
(1.26 %)		 19,266,969
(38.27 %)		 139,490
(2.47 %)
349 North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 alternate hap 2022)
GCA_026167925.1		 n/a 19,342
(1.57 %)		 20,947
(1.48 %)		 n/a 42.40
(100.00 %)		 229
(0.00 %)		 1,006
(100.00 %)		 4,161,568
(23.13 %)		 1,278,205
(8.22 %)		 13,148,019
(37.60 %)		 23,523
(0.71 %)
350 North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 primary hap 2022)
GCA_026229955.1		 n/a 19,700
(1.54 %)		 22,354
(1.46 %)		 n/a 42.19
(100.00 %)		 244
(0.00 %)		 2,082
(100.00 %)		 6,089,884
(47.99 %)		 1,358,786
(9.39 %)		 13,799,349
(39.08 %)		 24,733
(0.70 %)
351 North American porcupine (mEreDor1 alternate hap 2023)
GCA_028500835.1		 n/a 15,210
(1.55 %)		 18,316
(1.43 %)		 n/a 41.06
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 5,051
(100.00 %)		 3,911,633
(40.55 %)		 565,546
(1.54 %)		 10,853,726
(32.61 %)		 40,925
(1.35 %)
352 North American porcupine (mEreDor1 primary hap 2023)
GCA_028451465.1		 n/a 18,102
(1.58 %)		 20,073
(1.40 %)		 n/a 41.03
(100.00 %)		 277
(0.00 %)		 116
(100.00 %)		 4,958,089
(41.64 %)		 719,163
(1.59 %)		 13,867,662
(33.89 %)		 51,299
(1.36 %)
353 North Atlantic right whale (hap1 2023)
GCA_028571275.1		 n/a 18,699
(1.61 %)		 20,354
(1.28 %)		 n/a 41.64
(99.84 %)		 385
(0.16 %)		 947
(100.00 %)		 3,815,900
(43.46 %)		 718,935
(11.38 %)		 11,928,210
(42.25 %)		 85,881
(1.90 %)
354 North Atlantic right whale (hap2 + XY 2023 refseq)
GCF_028564815.1		 49,646
(1.86 %)		 19,562
(1.46 %)		 21,631
(1.25 %)		 n/a 41.69
(99.83 %)		 367
(0.17 %)		 789
(100.00 %)		 1,368,536
(2.24 %)		 841,303
(13.08 %)		 12,527,582
(43.92 %)		 94,259
(1.92 %)
355 North Pacific right whale
GCA_004363455.1		 n/a 23,145
(1.43 %)		 38,161
(1.21 %)		 n/a 41.15
(99.88 %)		 7,094
(0.03 %)		 1,361,057
(99.97 %)		 5,039,622
(45.69 %)		 694,986
(1.31 %)		 14,063,101
(40.51 %)		 74,800
(1.52 %)
356 northern American river otter
GCF_010015895.1		 53,945
(2.18 %)		 18,974
(1.68 %)		 21,247
(1.45 %)		 n/a 41.41
(99.58 %)		 7,620
(0.42 %)		 13,541
(99.58 %)		 4,538,847
(41.18 %)		 685,281
(1.20 %)		 13,840,953
(32.61 %)		 53,559
(1.88 %)
357 northern bat (alternate hap 2023)
GCA_951640545.1		 n/a 18,343
(1.80 %)		 23,253
(1.77 %)		 n/a 43.55
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 4,899
(100.00 %)		 1,174,241
(2.96 %)		 825,170
(5.11 %)		 9,889,579
(36.12 %)		 76,164
(3.52 %)
358 northern bat (primary hap 2023)
GCA_951640355.1		 n/a 18,636
(1.75 %)		 21,446
(1.68 %)		 n/a 43.32
(99.99 %)		 1,423
(0.01 %)		 207
(100.00 %)		 1,259,729
(2.95 %)		 905,676
(6.25 %)		 10,554,535
(38.21 %)		 77,656
(3.27 %)
359 northern black mastiff bat (mMolNig1 2022)
GCA_026936385.1		 n/a 18,924
(1.53 %)		 22,934
(1.58 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 199
(0.00 %)		 146
(100.00 %)		 3,850,624
(31.21 %)		 648,359
(3.76 %)		 11,788,702
(39.25 %)		 85,908
(2.60 %)
360 northern bottlenose whale (alternate hap 2023)
GCA_949752845.1		 n/a 19,537
(1.44 %)		 27,826
(1.30 %)		 n/a 41.67
(100.00 %)		 n/a 23,401
(100.00 %)		 3,634,923
(35.56 %)		 672,860
(11.00 %)		 11,175,398
(41.72 %)		 62,007
(1.94 %)
361 northern bottlenose whale (primary hap 2023)
GCA_949752795.1		 n/a 19,073
(1.44 %)		 20,821
(1.21 %)		 n/a 41.81
(99.99 %)		 1,098
(0.01 %)		 757
(100.00 %)		 3,997,911
(34.76 %)		 769,275
(14.94 %)		 12,133,820
(44.83 %)		 67,258
(2.00 %)
362 northern elephant seal (BS05 2019 Broad)
GCA_004023865.1		 n/a 22,834
(1.54 %)		 36,083
(1.32 %)		 n/a 41.52
(99.94 %)		 9,483
(0.04 %)		 330,739
(99.96 %)		 4,849,944
(43.83 %)		 600,306
(1.16 %)		 13,420,049
(34.43 %)		 57,236
(1.62 %)
363 northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 genbank)
GCA_029215605.1		 n/a 19,278
(1.60 %)		 19,908
(1.39 %)		 n/a 41.84
(100.00 %)		 98
(0.00 %)		 596
(100.00 %)		 4,348,333
(34.40 %)		 621,985
(2.21 %)		 13,251,768
(35.32 %)		 69,898
(2.38 %)
364 Northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 refseq)
GCF_029215605.1		 74,106
(3.88 %)		 19,277
(1.60 %)		 20,000
(1.36 %)		 n/a 41.84
(100.00 %)		 98
(0.00 %)		 595
(100.00 %)		 4,348,327
(34.40 %)		 621,980
(2.21 %)		 13,251,706
(35.32 %)		 69,897
(2.38 %)
365 northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap2 2023)
GCA_029215635.1		 n/a 19,340
(1.59 %)		 19,732
(1.37 %)		 n/a 41.91
(100.00 %)		 60
(0.00 %)		 482
(100.00 %)		 4,365,070
(34.26 %)		 627,639
(2.43 %)		 13,174,494
(35.47 %)		 74,314
(2.49 %)
366 northern elephant seal (v3 JK_09032017 2022)
GCF_021288785.2		 53,819
(3.32 %)		 20,099
(1.75 %)		 20,957
(1.35 %)		 n/a 41.51
(99.35 %)		 39,936
(0.65 %)		 142,455
(100.00 %)		 4,368,400
(33.93 %)		 588,877
(1.19 %)		 13,745,426
(32.96 %)		 52,064
(1.59 %)
367 northern fur seal
GCF_003265705.1		 54,940
(2.43 %)		 23,408
(1.78 %)		 23,666
(1.43 %)		 52,089
(2.17 %)		 41.48
(98.01 %)		 38,666
(1.99 %)		 52,469
(98.01 %)		 5,047,032
(43.38 %)		 638,130
(1.06 %)		 14,922,442
(33.12 %)		 57,281
(1.44 %)
368 northern gundi
GCA_004027205.1		 n/a 18,035
(1.39 %)		 27,379
(1.57 %)		 n/a 42.68
(99.91 %)		 5,037
(0.02 %)		 865,110
(99.98 %)		 4,149,883
(27.83 %)		 654,063
(1.64 %)		 12,342,565
(33.72 %)		 47,533
(1.43 %)
369 northern mole vole
GCA_001685095.1		 n/a 23,252
(1.39 %)		 44,209
(1.25 %)		 n/a 41.68
(99.04 %)		 371,627
(0.98 %)		 722,087
(99.02 %)		 3,923,814
(25.79 %)		 898,453
(2.47 %)		 13,708,986
(29.04 %)		 16,583
(0.36 %)
370 northern white rhinoceros
GCA_004027795.1		 n/a 25,328
(1.34 %)		 61,003
(1.95 %)		 n/a 41.32
(99.90 %)		 7,054
(0.03 %)		 949,480
(99.97 %)		 4,330,882
(38.89 %)		 484,754
(1.12 %)		 15,544,248
(33.11 %)		 43,689
(2.08 %)
371 Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 genbank)
GCA_036323735.1		 114,725
(42.69 %)		 21,917
(1.75 %)		 19,476
(1.26 %)		 n/a 41.82
(99.86 %)		 220
(0.14 %)		 77
(100.00 %)		 4,700,726
(39.99 %)		 1,603,005
(5.45 %)		 13,451,813
(38.68 %)		 20,118
(0.44 %)
372 Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 refseq)
GCF_036323735.1		 114,725
(5.38 %)		 21,870
(1.74 %)		 19,989
(1.27 %)		 n/a 41.82
(99.86 %)		 220
(0.14 %)		 76
(100.00 %)		 5,294,185
(42.75 %)		 1,603,005
(5.45 %)		 13,451,760
(38.68 %)		 20,118
(0.44 %)
373 Norway rat BN7 haplotype
GCA_015244455.1		 n/a 3,096
(1.64 %)		 2,450
(1.02 %)		 n/a 41.23
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 3,156
(100.00 %)		 517,347
(50.76 %)		 157,701
(3.90 %)		 1,502,752
(34.14 %)		 1,806
(0.40 %)
374 Norway rat BN7.2
GCF_015227675.2		 99,139
(4.10 %)		 21,526
(1.86 %)		 19,266
(1.33 %)		 54,530
(2.79 %)		 41.99
(99.19 %)		 581
(0.81 %)		 757
(99.19 %)		 5,029,005
(45.44 %)		 1,514,974
(3.57 %)		 13,450,428
(35.83 %)		 19,244
(0.46 %)
375 Norway rat celera
GCF_000002265.2		 39,745
(2.91 %)		 21,492
(1.95 %)		 19,112
(1.38 %)		 n/a 41.98
(95.28 %)		 111,391
(4.74 %)		 118,423
(95.26 %)		 9,721,869
(43.57 %)		 1,387,703
(3.05 %)		 13,224,921
(32.45 %)		 18,944
(0.42 %)
376 Norway rat Rnor6.0
GCF_000001895.5		 69,456
(3.34 %)		 22,369
(1.83 %)		 20,269
(1.32 %)		 n/a 41.93
(95.13 %)		 145,731
(4.89 %)		 76,195
(95.16 %)		 5,329,187
(44.14 %)		 1,620,304
(3.72 %)		 14,520,050
(33.09 %)		 22,600
(0.47 %)
377 Norway rat SHR/Utx RGD_8142385 2022
GCA_023515785.1		 n/a 21,116
(1.68 %)		 20,103
(1.27 %)		 57,027
(2.45 %)		 41.85
(99.82 %)		 1,256
(0.18 %)		 2,151
(100.00 %)		 4,704,388
(38.22 %)		 1,611,144
(5.76 %)		 13,524,575
(38.35 %)		 20,720
(0.48 %)
378 Norway rat SHRSP/BppUtx 2022
GCA_021556685.1		 n/a 22,366
(1.71 %)		 20,531
(1.26 %)		 57,580
(2.44 %)		 41.86
(99.94 %)		 1,610
(0.06 %)		 2,734
(100.00 %)		 5,238,574
(46.36 %)		 1,638,412
(5.87 %)		 13,769,141
(38.49 %)		 21,006
(0.49 %)
379 Norway rat WKY/Bbb 2022
GCA_023515805.1		 n/a 21,607
(1.68 %)		 21,244
(1.28 %)		 58,136
(2.47 %)		 41.92
(99.80 %)		 1,456
(0.20 %)		 3,553
(100.00 %)		 4,811,412
(38.21 %)		 1,650,950
(5.41 %)		 13,740,644
(38.24 %)		 21,449
(0.51 %)
380 nutria
GCA_004027025.1		 n/a 24,707
(1.00 %)		 47,533
(1.18 %)		 n/a 41.70
(99.84 %)		 15,249
(0.05 %)		 1,684,916
(99.95 %)		 6,961,690
(30.09 %)		 1,698,977
(3.31 %)		 15,207,563
(42.57 %)		 59,854
(1.00 %)
381 okapi
GCA_001660835.1		 n/a 21,483
(1.43 %)		 31,061
(1.26 %)		 n/a 41.48
(95.11 %)		 376,008
(4.86 %)		 1,213,177
(95.14 %)		 5,808,036
(42.90 %)		 619,044
(4.22 %)		 14,940,153
(35.17 %)		 47,417
(1.12 %)
382 Ord's kangaroo rat
GCF_000151885.1		 30,625
(2.21 %)		 17,959
(1.54 %)		 19,318
(1.54 %)		 n/a 42.06
(92.36 %)		 83,035
(7.65 %)		 148,226
(92.35 %)		 4,337,455
(33.76 %)		 1,140,316
(7.60 %)		 10,422,685
(36.59 %)		 61,921
(3.56 %)
383 pacarana
GCA_004027595.1		 n/a 20,748
(1.20 %)		 33,195
(1.31 %)		 n/a 41.81
(99.90 %)		 6,392
(0.02 %)		 1,164,830
(99.98 %)		 4,374,443
(30.16 %)		 660,811
(1.38 %)		 14,062,133
(35.99 %)		 59,382
(1.23 %)
384 Pacific pocket mouse (BS65 2019 Broad)
GCA_004363475.1		 n/a 21,575
(1.07 %)		 47,478
(1.31 %)		 n/a 41.87
(99.76 %)		 18,801
(0.07 %)		 2,428,619
(99.93 %)		 4,881,232
(20.80 %)		 1,352,971
(4.11 %)		 12,583,960
(48.42 %)		 74,961
(2.33 %)
385 Pacific pocket mouse (PPM17 2022 San Diego Zoo)
GCF_023159225.1		 46,202
(2.48 %)		 18,752
(1.50 %)		 22,526
(1.60 %)		 n/a 41.98
(99.96 %)		 1,807
(0.04 %)		 6,180
(100.00 %)		 3,313,319
(16.79 %)		 1,066,382
(10.88 %)		 9,981,468
(42.63 %)		 49,134
(2.83 %)
386 Pacific walrus
GCF_000321225.1		 27,163
(1.89 %)		 20,293
(1.71 %)		 20,982
(1.48 %)		 n/a 41.36
(95.85 %)		 66,766
(4.16 %)		 70,656
(95.84 %)		 4,372,578
(41.12 %)		 511,500
(1.05 %)		 13,507,582
(30.43 %)		 45,142
(1.29 %)
387 Pacific white-sided dolphin
GCF_003676395.1		 65,947
(3.26 %)		 18,743
(1.79 %)		 20,862
(1.45 %)		 31,917
(1.69 %)		 41.28
(99.56 %)		 16,699
(0.44 %)		 21,350
(99.56 %)		 3,971,820
(45.64 %)		 574,056
(1.14 %)		 12,602,965
(34.83 %)		 62,275
(1.67 %)
388 pale spear-nosed bat (alternate hap MPI-MPIP 2019)
GCA_004115245.1		 n/a 18,118
(1.63 %)		 23,536
(1.65 %)		 n/a 42.48
(100.00 %)		 38
(0.00 %)		 10,873
(100.00 %)		 3,001,130
(29.46 %)		 375,042
(0.79 %)		 11,813,971
(29.64 %)		 67,712
(4.23 %)
389 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 alternate hap 2020)
GCA_004115245.2		 n/a 18,116
(1.63 %)		 23,608
(1.65 %)		 n/a 42.48
(100.00 %)		 38
(0.00 %)		 10,895
(100.00 %)		 3,002,448
(29.46 %)		 375,226
(0.79 %)		 11,824,034
(29.65 %)		 67,718
(4.23 %)
390 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 primary hap 2020)
GCF_004126475.2		 54,932
(3.31 %)		 18,171
(1.69 %)		 20,025
(1.62 %)		 42,786
(3.39 %)		 42.38
(99.28 %)		 884
(0.72 %)		 77
(100.00 %)		 3,069,141
(30.00 %)		 385,664
(0.81 %)		 12,050,232
(30.57 %)		 63,905
(3.75 %)
391 Pallas's mastiff bat
GCF_014108415.1		 48,421
(2.20 %)		 18,667
(1.61 %)		 21,915
(1.59 %)		 n/a 42.35
(97.95 %)		 349
(2.05 %)		 60
(100.00 %)		 3,863,217
(32.76 %)		 624,933
(1.88 %)		 11,572,319
(37.09 %)		 79,984
(2.45 %)
392 pallid bat (TK200870 primary hap 2023)
GCA_027563665.1		 n/a 19,688
(1.69 %)		 21,998
(1.64 %)		 n/a 43.04
(99.72 %)		 234
(0.28 %)		 112
(99.99 %)		 2,794,986
(22.60 %)		 938,016
(3.72 %)		 11,241,518
(39.41 %)		 70,272
(2.89 %)
393 Parnell's mustached bat (2013)
GCA_000465405.1		 n/a 21,436
(1.40 %)		 57,232
(2.18 %)		 n/a 40.82
(99.34 %)		 265,720
(0.70 %)		 443,121
(99.30 %)		 2,780,805
(29.26 %)		 290,520
(0.63 %)		 12,354,814
(27.13 %)		 69,806
(1.89 %)
394 Parnell's mustached bat (Mesoamerican 2021)
GCF_021234165.1		 37,033
(2.48 %)		 18,339
(1.76 %)		 21,630
(1.69 %)		 n/a 41.32
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 333
(100.00 %)		 2,828,339
(30.56 %)		 333,670
(0.75 %)		 12,444,271
(30.90 %)		 53,180
(4.61 %)
395 particolored bat (primary hap 2024)
GCA_963924515.1		 n/a 17,913
(1.72 %)		 20,720
(1.72 %)		 n/a 43.54
(99.99 %)		 980
(0.01 %)		 185
(100.00 %)		 2,932,869
(21.94 %)		 874,665
(4.83 %)		 10,263,103
(37.46 %)		 77,397
(4.55 %)
396 Patagonian cavy
GCA_004027295.1		 n/a 21,143
(0.94 %)		 40,887
(1.10 %)		 n/a 39.86
(99.87 %)		 6,223
(0.02 %)		 1,911,987
(99.98 %)		 5,194,890
(30.95 %)		 892,551
(2.11 %)		 17,052,577
(40.22 %)		 45,730
(0.84 %)
397 Pere David's deer
GCA_002443075.1		 n/a 20,723
(1.65 %)		 23,551
(1.43 %)		 n/a 41.58
(97.49 %)		 144,642
(2.51 %)		 339,454
(97.49 %)		 5,171,293
(43.30 %)		 427,987
(1.20 %)		 13,665,133
(35.97 %)		 48,374
(1.14 %)
398 Philippine flying lemur (mCynVol1 alternate hap 2022)
GCA_027409165.1		 n/a 18,794
(1.72 %)		 21,421
(1.40 %)		 n/a 40.18
(100.00 %)		 n/a 1,750
(100.00 %)		 4,001,442
(39.37 %)		 547,894
(2.75 %)		 13,870,563
(34.33 %)		 40,162
(1.31 %)
399 Philippine flying lemur (mCynVol1 primary hap 2022 genbank)
GCA_027409185.1		 n/a 20,384
(1.64 %)		 22,124
(1.29 %)		 n/a 40.24
(100.00 %)		 116
(0.00 %)		 131
(100.00 %)		 4,492,423
(39.31 %)		 627,842
(4.79 %)		 15,561,515
(36.57 %)		 45,336
(1.27 %)
400 Philippine flying lemur (mCynVol1 primary hap 2022 refseq)
GCF_027409185.1		 44,950
(1.91 %)		 20,385
(1.64 %)		 22,123
(1.29 %)		 n/a 40.24
(100.00 %)		 116
(0.00 %)		 130
(100.00 %)		 4,492,417
(39.31 %)		 627,841
(4.79 %)		 15,561,458
(36.57 %)		 45,336
(1.27 %)
401 pig (Bamei 2023)
GCA_030704935.1		 n/a 18,472
(1.44 %)		 19,911
(1.28 %)		 n/a 42.63
(99.98 %)		 878
(0.02 %)		 379
(100.00 %)		 3,996,827
(27.97 %)		 2,094,728
(7.23 %)		 12,677,118
(40.57 %)		 81,791
(2.82 %)
402 pig (Duroc 2017)
GCF_000003025.6		 77,695
(4.05 %)		 18,980
(1.64 %)		 19,453
(1.32 %)		 59,876
(4.84 %)		 41.87
(98.81 %)		 544
(1.19 %)		 1,313
(98.81 %)		 5,021,184
(45.67 %)		 710,994
(1.32 %)		 13,243,289
(36.33 %)		 79,132
(1.82 %)
403 pig (USMARCv1 2017)
GCA_002844635.1		 n/a 19,458
(1.54 %)		 21,487
(1.27 %)		 58,655
(2.58 %)		 42.49
(95.20 %)		 661
(4.80 %)		 14,157
(100.00 %)		 5,159,244
(47.53 %)		 902,079
(3.63 %)		 13,145,120
(36.86 %)		 82,442
(2.62 %)
404 plains zebra (Etosha38 2022 UCLA)
GCF_021613505.1		 55,779
(2.87 %)		 19,529
(1.76 %)		 21,214
(1.39 %)		 n/a 41.38
(99.04 %)		 14,595
(0.96 %)		 11,098
(100.00 %)		 3,683,862
(38.74 %)		 314,723
(0.68 %)		 15,217,328
(29.38 %)		 41,391
(1.27 %)
405 platypus (alternate hap Pmale09 2020)
GCA_004115175.2		 n/a 13,244
(1.26 %)		 19,241
(1.68 %)		 n/a 46.27
(100.00 %)		 25
(0.00 %)		 5,868
(100.00 %)		 4,420,884
(51.59 %)		 513,006
(3.13 %)		 7,749,797
(49.18 %)		 81,538
(8.24 %)
406 platypus (Pmale09 v4 2020)
GCF_004115215.2		 51,392
(3.07 %)		 14,778
(1.26 %)		 18,888
(1.63 %)		 n/a 46.14
(99.18 %)		 515
(0.82 %)		 322
(100.00 %)		 5,071,089
(51.34 %)		 578,614
(2.89 %)		 9,113,848
(48.93 %)		 87,796
(6.47 %)
407 polar bear (Baiyulong BGI 2014 refseq)
GCF_000687225.1		 35,764
(2.39 %)		 18,466
(1.69 %)		 15,384
(1.38 %)		 n/a 41.65
(98.35 %)		 110,343
(1.67 %)		 134,162
(98.33 %)		 4,123,540
(40.16 %)		 553,196
(1.29 %)		 13,765,581
(29.91 %)		 54,907
(1.17 %)
408 polar bear (UCSC 2021)
GCF_017311325.1		 52,188
(2.92 %)		 18,588
(1.75 %)		 20,731
(1.54 %)		 n/a 41.88
(99.60 %)		 45,532
(0.41 %)		 3,900
(100.00 %)		 4,204,162
(40.75 %)		 572,129
(1.75 %)		 13,926,894
(30.79 %)		 63,315
(1.93 %)
409 prairie deer mouse (Baylor 2013)
GCF_000500345.1		 50,187
(2.51 %)		 20,427
(1.69 %)		 20,874
(1.45 %)		 n/a 42.34
(94.06 %)		 182,263
(5.97 %)		 212,962
(94.03 %)		 n/a 1,229,123
(2.83 %)		 14,447,916
(30.09 %)		 23,246
(0.56 %)
410 prairie deer mouse (Harvard 2020)
GCF_003704035.1		 69,779
(3.28 %)		 19,755
(1.73 %)		 19,194
(1.43 %)		 n/a 42.28
(95.07 %)		 147,442
(4.96 %)		 155,966
(95.04 %)		 4,751,621
(29.04 %)		 1,172,212
(2.66 %)		 13,934,672
(29.87 %)		 22,444
(0.57 %)
411 prairie vole
GCF_000317375.1		 40,484
(2.72 %)		 19,648
(1.91 %)		 19,489
(1.62 %)		 n/a 42.25
(92.03 %)		 180,677
(8.00 %)		 187,012
(92.00 %)		 3,779,126
(25.51 %)		 879,192
(2.11 %)		 12,360,347
(27.34 %)		 18,233
(0.52 %)
412 proboscis bat (hap1 2024)
GCA_037038545.1		 n/a 17,919
(1.46 %)		 19,330
(1.31 %)		 n/a 40.78
(100.00 %)		 68
(0.00 %)		 41
(100.00 %)		 3,707,234
(28.28 %)		 643,817
(2.22 %)		 12,106,384
(41.48 %)		 54,438
(1.38 %)
413 proboscis bat (hap2 2024)
GCA_037038555.1		 n/a 17,253
(1.51 %)		 18,507
(1.35 %)		 n/a 40.91
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 38
(100.00 %)		 3,466,835
(27.96 %)		 585,261
(1.91 %)		 11,364,898
(40.65 %)		 50,527
(1.37 %)
414 pronghorn (PH2016 2021)
GCA_021018645.1		 n/a 21,848
(1.58 %)		 27,614
(1.56 %)		 n/a 41.70
(96.83 %)		 74,027
(3.17 %)		 140,480
(96.83 %)		 3,335,744
(24.40 %)		 405,435
(4.11 %)		 13,855,606
(34.67 %)		 48,670
(1.19 %)
415 Przewalski's horse (Burgud 2014 refseq)
GCF_000696695.1		 45,076
(2.76 %)		 19,546
(1.69 %)		 22,107
(1.36 %)		 n/a 41.27
(99.13 %)		 80,963
(0.88 %)		 134,060
(99.12 %)		 3,787,533
(40.54 %)		 435,607
(1.73 %)		 14,738,418
(28.36 %)		 40,752
(0.94 %)
416 puma (L17-30 alternate hap 2023)
GCA_028749965.1		 n/a 18,380
(1.53 %)		 20,701
(1.40 %)		 n/a 41.91
(100.00 %)		 96
(0.00 %)		 304
(100.00 %)		 4,881,674
(33.96 %)		 978,817
(2.17 %)		 13,422,986
(35.08 %)		 69,437
(2.62 %)
417 puma (L17-30 primary hap 2023)
GCA_028749985.1		 n/a 17,553
(1.53 %)		 19,299
(1.39 %)		 n/a 41.89
(100.00 %)		 134
(0.00 %)		 390
(100.00 %)		 4,629,539
(33.53 %)		 919,008
(2.02 %)		 12,766,157
(34.70 %)		 65,437
(2.53 %)
418 puma (SC36_Marlon 2018 refseq)
GCF_003327715.1		 25,575
(1.43 %)		 17,664
(1.57 %)		 16,565
(1.29 %)		 n/a 41.36
(95.34 %)		 178,992
(4.69 %)		 2,175
(100.00 %)		 4,885,335
(42.70 %)		 833,138
(1.76 %)		 13,705,778
(31.28 %)		 58,912
(1.65 %)
419 punctate agouti
GCA_004363535.1		 n/a 22,612
(1.05 %)		 45,433
(1.19 %)		 n/a 40.79
(99.92 %)		 6,459
(0.02 %)		 993,123
(99.98 %)		 5,671,738
(32.53 %)		 945,722
(1.69 %)		 17,003,309
(36.58 %)		 85,696
(1.65 %)
420 pygmy sperm whale
GCA_004363705.1		 n/a 22,661
(1.30 %)		 42,546
(1.15 %)		 n/a 41.89
(99.89 %)		 6,053
(0.02 %)		 1,258,125
(99.98 %)		 5,185,912
(43.65 %)		 836,752
(1.88 %)		 14,150,125
(39.88 %)		 95,344
(2.15 %)
421 pygmy sperm whale (mKogBre1 2022 refseq)
GCF_026419965.1		 56,261
(2.22 %)		 18,496
(1.55 %)		 20,718
(1.32 %)		 n/a 42.05
(99.81 %)		 143
(0.19 %)		 581
(100.00 %)		 3,817,659
(34.51 %)		 758,297
(7.42 %)		 12,196,998
(39.96 %)		 101,353
(2.90 %)
422 pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 2 2022)
GCA_026419985.1		 n/a 18,550
(1.51 %)		 20,491
(1.29 %)		 n/a 42.18
(99.99 %)		 138
(0.01 %)		 391
(100.00 %)		 3,860,112
(33.83 %)		 820,375
(9.58 %)		 12,159,196
(41.59 %)		 106,168
(2.78 %)
423 rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 refseq)
GCF_009806435.1		 83,045
(4.16 %)		 19,486
(1.31 %)		 23,267
(1.31 %)		 n/a 43.83
(97.68 %)		 18,178
(2.32 %)		 3,160
(100.00 %)		 4,072,524
(21.41 %)		 976,273
(2.33 %)		 13,766,413
(39.76 %)		 113,371
(2.46 %)
424 rabbit (Thorbecke 2009 Broad refseq)
GCF_000003625.3		 43,655
(2.34 %)		 18,665
(1.39 %)		 20,095
(1.24 %)		 n/a 43.75
(95.14 %)		 80,789
(4.88 %)		 84,024
(95.12 %)		 4,890,480
(44.71 %)		 883,939
(1.73 %)		 13,254,520
(38.27 %)		 110,337
(2.33 %)
425 raccoon dog (2021)
GCF_905146905.1		 52,564
(2.89 %)		 19,628
(1.60 %)		 20,274
(1.43 %)		 n/a 41.28
(99.98 %)		 70
(0.02 %)		 811
(100.00 %)		 4,499,368
(31.98 %)		 1,005,212
(2.04 %)		 13,884,201
(32.95 %)		 52,450
(2.27 %)
426 Rambouillet sheep (Baylor 2017)
GCF_002742125.1		 50,096
(2.48 %)		 19,992
(1.47 %)		 22,506
(1.31 %)		 41,290
(1.46 %)		 41.91
(99.99 %)		 4,847
(0.01 %)		 7,486
(99.99 %)		 5,764,757
(47.38 %)		 507,629
(1.55 %)		 14,138,601
(41.27 %)		 51,748
(1.29 %)
427 Rambouillet sheep (U.Idaho 2021)
GCF_016772045.1		 70,474
(3.21 %)		 19,413
(1.59 %)		 21,222
(1.35 %)		 n/a 41.99
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 142
(100.00 %)		 5,300,958
(46.83 %)		 455,553
(1.24 %)		 13,023,443
(40.62 %)		 43,959
(1.30 %)
428 ratel
GCA_004024625.1		 n/a 22,196
(1.21 %)		 35,937
(1.18 %)		 n/a 42.00
(99.85 %)		 6,511
(0.02 %)		 2,074,823
(99.98 %)		 6,171,383
(41.93 %)		 877,669
(1.49 %)		 15,269,908
(41.22 %)		 95,094
(1.91 %)
429 red bat
GCA_004026805.1		 n/a 27,510
(1.22 %)		 65,467
(1.48 %)		 n/a 42.69
(99.94 %)		 6,380
(0.02 %)		 525,280
(99.98 %)		 4,644,227
(28.24 %)		 1,170,868
(2.68 %)		 15,628,238
(39.97 %)		 125,564
(3.55 %)
430 red deer (2021)
GCF_910594005.1		 68,992
(2.68 %)		 20,470
(1.48 %)		 22,563
(1.32 %)		 n/a 42.98
(100.00 %)		 40
(0.00 %)		 144
(100.00 %)		 5,501,063
(44.60 %)		 503,301
(12.23 %)		 13,102,622
(44.55 %)		 88,756
(1.66 %)
431 red deer (alternate hap 2021)
GCA_910593805.1		 n/a 18,817
(1.29 %)		 21,916
(1.20 %)		 n/a 44.23
(100.00 %)		 22
(0.00 %)		 4,021
(100.00 %)		 3,279,005
(20.48 %)		 472,706
(21.87 %)		 11,466,609
(50.26 %)		 128,858
(2.07 %)
432 red fox
GCF_003160815.1		 43,495
(2.67 %)		 19,826
(1.69 %)		 18,893
(1.40 %)		 n/a 41.08
(97.06 %)		 246,167
(2.96 %)		 82,424
(100.00 %)		 4,919,102
(40.79 %)		 954,461
(2.46 %)		 14,190,625
(30.86 %)		 53,204
(1.88 %)
433 reed vole (MF-2015 2020)
GCF_014885135.2		 55,722
(3.60 %)		 19,808
(1.93 %)		 20,787
(1.69 %)		 n/a 42.36
(95.60 %)		 67,118
(4.40 %)		 10,460
(100.00 %)		 3,130,955
(20.09 %)		 831,969
(2.09 %)		 11,985,657
(28.48 %)		 18,764
(0.58 %)
434 Reeves' muntjac (alternate hap 2024)
GCA_963930665.1		 n/a 18,947
(1.29 %)		 24,114
(1.28 %)		 n/a 42.75
(100.00 %)		 n/a 8,892
(100.00 %)		 3,375,476
(23.21 %)		 654,539
(6.64 %)		 11,132,469
(48.29 %)		 79,357
(2.66 %)
435 reindeer (2023)
GCA_963422255.1		 n/a 21,329
(1.58 %)		 25,201
(1.59 %)		 n/a 41.46
(98.35 %)		 131,886
(1.65 %)		 259,765
(98.35 %)		 3,254,173
(23.49 %)		 440,431
(2.00 %)		 14,258,607
(36.17 %)		 48,931
(1.20 %)
436 reindeer (US061 2019)
GCA_004026565.1		 n/a 24,150
(1.39 %)		 39,911
(1.41 %)		 n/a 42.08
(99.89 %)		 4,769
(0.02 %)		 1,365,508
(99.98 %)		 6,083,178
(46.10 %)		 546,470
(1.23 %)		 14,434,855
(43.16 %)		 55,319
(1.23 %)
437 Rice's whale (hap1 2023)
GCA_028017805.1		 n/a 19,396
(1.48 %)		 21,693
(1.26 %)		 n/a 41.62
(97.80 %)		 131
(2.20 %)		 1,039
(100.00 %)		 3,973,936
(35.55 %)		 987,571
(11.66 %)		 12,473,459
(42.11 %)		 74,971
(1.64 %)
438 Rice's whale (hap2 2023 refseq)
GCF_028023285.1		 59,888
(2.34 %)		 19,291
(1.53 %)		 21,195
(1.30 %)		 n/a 41.44
(99.90 %)		 334
(0.10 %)		 774
(100.00 %)		 3,917,923
(36.26 %)		 828,521
(9.28 %)		 12,518,796
(41.08 %)		 73,126
(1.69 %)
439 Rickett's big-footed myotis (AB-2021 2024)
GCA_036010255.1		 n/a 18,982
(1.81 %)		 22,002
(1.76 %)		 n/a 43.12
(100.00 %)		 n/a 105
(100.00 %)		 2,909,847
(24.53 %)		 757,964
(3.03 %)		 10,561,925
(36.25 %)		 57,318
(2.32 %)
440 Ryukyu mouse (v2 2017)
GCF_900094665.2		 53,779
(2.85 %)		 21,351
(2.29 %)		 18,073
(1.39 %)		 n/a 41.70
(89.05 %)		 306,599
(10.98 %)		 30,835
(92.70 %)		 4,479,912
(35.83 %)		 1,351,677
(2.59 %)		 12,964,608
(27.49 %)		 15,963
(0.43 %)
441 Saanen dairy goat
GCA_015443085.1		 n/a 19,257
(1.54 %)		 21,221
(1.32 %)		 n/a 42.30
(100.00 %)		 170
(0.00 %)		 1,362
(100.00 %)		 5,336,862
(47.58 %)		 515,161
(2.87 %)		 13,144,895
(41.67 %)		 58,623
(2.22 %)
442 saddleback dolphin (alternate hap 2023)
GCA_949987525.1		 n/a 18,509
(1.54 %)		 22,514
(1.36 %)		 n/a 41.95
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 7,427
(100.00 %)		 3,675,922
(35.75 %)		 950,374
(10.49 %)		 11,670,399
(40.31 %)		 63,587
(3.15 %)
443 saddleback dolphin (primary hap 2023 refseq)
GCF_949987515.1		 46,746
(2.39 %)		 18,624
(1.49 %)		 20,662
(1.31 %)		 n/a 42.06
(99.99 %)		 968
(0.01 %)		 630
(100.00 %)		 4,020,676
(35.99 %)		 1,259,549
(13.09 %)		 12,359,748
(42.64 %)		 66,179
(3.91 %)
444 saiga antelope
GCA_004024985.1		 n/a 23,736
(0.84 %)		 55,133
(0.88 %)		 n/a 42.52
(99.87 %)		 2,867
(0.01 %)		 1,775,066
(99.99 %)		 6,485,113
(49.43 %)		 447,097
(0.88 %)		 13,972,753
(44.46 %)		 46,883
(0.82 %)
445 Schreibers' long-fingered bat
GCA_004026525.1		 n/a 20,147
(2.06 %)		 31,271
(1.82 %)		 n/a 42.27
(99.94 %)		 6,918
(0.04 %)		 184,538
(99.96 %)		 2,772,932
(29.66 %)		 366,782
(1.13 %)		 10,477,531
(28.60 %)		 62,520
(2.73 %)
446 scimitar-horned oryx
GCF_014754425.2		 51,527
(2.72 %)		 19,713
(1.57 %)		 21,928
(1.32 %)		 n/a 41.74
(99.30 %)		 16,241
(0.70 %)		 9,089
(100.00 %)		 5,435,109
(46.76 %)		 414,279
(0.98 %)		 13,490,956
(40.45 %)		 42,961
(1.10 %)
447 Screaming hairy armadillo
GCA_004027955.1		 n/a 24,532
(0.39 %)		 56,725
(0.46 %)		 n/a 39.68
(99.70 %)		 2,747
(0.01 %)		 7,680,080
(99.99 %)		 8,978,735
(36.02 %)		 1,516,551
(1.58 %)		 32,918,217
(47.67 %)		 234,762
(1.56 %)
448 sea otter (GAN:26980312 2017 refseq)
GCF_002288905.1		 38,127
(2.16 %)		 18,578
(1.64 %)		 20,913
(1.44 %)		 34,179
(1.77 %)		 41.56
(98.79 %)		 23,134
(1.21 %)		 29,589
(98.79 %)		 4,703,044
(41.42 %)		 721,750
(1.39 %)		 14,065,653
(32.89 %)		 55,388
(1.87 %)
449 Seba's short-tailed bat
GCA_004027735.1		 n/a 21,878
(0.94 %)		 55,858
(1.10 %)		 n/a 42.70
(99.84 %)		 3,864
(0.01 %)		 1,929,203
(99.99 %)		 3,802,235
(28.35 %)		 606,320
(1.03 %)		 15,171,250
(31.99 %)		 118,227
(2.28 %)
450 sheep (OAR_USU_Benz2616 2023)
GCF_016772045.2		 89,680
(5.44 %)		 19,308
(1.52 %)		 21,506
(1.35 %)		 n/a 42.01
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 143
(100.00 %)		 3,275,767
(22.85 %)		 464,346
(1.26 %)		 12,987,607
(40.61 %)		 44,477
(1.28 %)
451 sheep (Texel 2015)
GCA_000298735.2		 n/a 19,179
(1.56 %)		 19,001
(1.26 %)		 48,105
(1.85 %)		 41.90
(98.94 %)		 44,566
(1.07 %)		 48,481
(98.93 %)		 5,429,824
(46.13 %)		 540,267
(1.64 %)		 13,509,668
(38.83 %)		 43,911
(1.13 %)
452 shrew mouse
GCF_900095145.1		 46,279
(2.64 %)		 20,549
(2.23 %)		 18,979
(1.49 %)		 94,079
(3.98 %)		 41.89
(90.53 %)		 269,643
(9.50 %)		 17,879
(93.73 %)		 4,788,498
(38.32 %)		 1,499,714
(3.03 %)		 13,021,757
(27.83 %)		 16,787
(0.47 %)
453 Siberian hamster (SSSS 2022)
GCA_023856395.1		 n/a 18,375
(1.83 %)		 17,066
(1.44 %)		 n/a 41.27
(99.64 %)		 88,601
(0.37 %)		 7,756
(100.00 %)		 3,152,242
(21.63 %)		 1,087,009
(2.64 %)		 12,055,167
(29.20 %)		 15,455
(0.48 %)
454 Siberian musk deer (BS20 2019 Broad)
GCA_004024705.1		 n/a 23,440
(1.32 %)		 37,497
(1.19 %)		 n/a 42.32
(99.86 %)		 19,764
(0.07 %)		 1,195,467
(99.93 %)		 6,726,950
(49.79 %)		 437,480
(1.57 %)		 14,155,240
(46.22 %)		 49,177
(1.05 %)
455 small Madagascar hedgehog
GCF_000313985.2		 37,090
(1.93 %)		 18,969
(1.19 %)		 19,298
(1.31 %)		 n/a 43.01
(88.43 %)		 270,406
(11.60 %)		 7,490
(100.00 %)		 3,789,337
(28.89 %)		 429,226
(0.87 %)		 16,951,112
(32.23 %)		 39,993
(0.70 %)
456 smoky shrew (2023)
GCF_029834395.1		 37,165
(1.66 %)		 17,572
(1.06 %)		 24,146
(1.29 %)		 n/a 43.43
(100.00 %)		 n/a 497
(100.00 %)		 2,593,080
(14.11 %)		 1,194,567
(7.25 %)		 14,051,522
(48.20 %)		 107,473
(2.80 %)
457 snow leopard (11264 2022)
GCF_023721935.1		 53,556
(3.37 %)		 18,780
(1.67 %)		 21,038
(1.40 %)		 n/a 41.60
(99.30 %)		 23,786
(0.70 %)		 2,636
(100.00 %)		 4,714,429
(34.93 %)		 919,518
(1.59 %)		 13,711,504
(33.24 %)		 64,690
(2.41 %)
458 snowshoe hare
GCA_004026855.1		 n/a 23,263
(0.88 %)		 55,811
(1.01 %)		 n/a 44.12
(99.87 %)		 10,153
(0.03 %)		 1,602,982
(99.97 %)		 4,767,120
(21.29 %)		 1,040,992
(2.22 %)		 15,680,144
(43.23 %)		 126,152
(2.28 %)
459 social tuco-tuco
GCA_004027165.1		 n/a 25,166
(1.12 %)		 41,316
(1.26 %)		 n/a 40.71
(99.89 %)		 16,191
(0.06 %)		 823,762
(99.94 %)		 5,390,906
(28.28 %)		 1,027,922
(2.15 %)		 15,241,308
(38.39 %)		 31,883
(0.72 %)
460 soprano pipistrelle (alternate hap 2023)
GCA_949987765.1		 n/a 17,590
(1.81 %)		 21,597
(1.85 %)		 n/a 42.88
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,717
(100.00 %)		 2,734,555
(21.46 %)		 795,752
(6.56 %)		 9,601,735
(36.35 %)		 62,524
(3.25 %)
461 soprano pipistrelle (primary hap 2023)
GCA_949987585.1		 n/a 18,056
(1.78 %)		 21,158
(1.79 %)		 n/a 42.67
(100.00 %)		 161
(0.00 %)		 249
(100.00 %)		 2,899,535
(21.64 %)		 853,717
(7.80 %)		 10,162,216
(37.72 %)		 63,256
(3.06 %)
462 South African ground squirrel
GCA_004024805.1		 n/a 22,802
(1.44 %)		 33,892
(1.27 %)		 n/a 39.97
(99.92 %)		 9,745
(0.04 %)		 587,115
(99.96 %)		 5,256,998
(34.93 %)		 594,122
(1.27 %)		 14,462,947
(33.96 %)		 34,141
(0.80 %)
463 Southeastern Asian house mouse (2022)
GCA_921999005.2		 n/a 21,799
(2.13 %)		 19,729
(1.40 %)		 110,356
(4.43 %)		 41.78
(99.19 %)		 278
(0.81 %)		 151
(100.00 %)		 4,663,228
(40.41 %)		 1,549,985
(3.70 %)		 13,012,600
(34.99 %)		 21,349
(0.52 %)
464 southern elephant seal
GCF_011800145.1		 53,210
(2.86 %)		 19,520
(1.73 %)		 20,727
(1.41 %)		 39,634
(1.86 %)		 41.45
(99.36 %)		 22,850
(0.64 %)		 1,115
(100.00 %)		 4,728,105
(43.75 %)		 585,443
(1.13 %)		 13,463,979
(33.65 %)		 53,182
(1.62 %)
465 southern grasshopper mouse (2020)
GCF_903995425.1		 47,152
(2.39 %)		 19,356
(1.68 %)		 18,821
(1.36 %)		 n/a 41.81
(98.94 %)		 2,143
(1.06 %)		 2,949
(100.00 %)		 4,850,460
(28.64 %)		 1,195,836
(2.72 %)		 13,540,762
(32.73 %)		 18,046
(0.54 %)
466 southern multimammate mouse
GCF_008632895.1		 69,045
(3.04 %)		 20,313
(2.11 %)		 17,745
(1.38 %)		 n/a 41.39
(91.90 %)		 146,713
(8.12 %)		 28
(100.00 %)		 4,875,400
(38.43 %)		 1,454,350
(2.93 %)		 13,104,717
(28.82 %)		 16,715
(0.45 %)
467 southern tamandua (mTamTet1 alternate hap 2022)
GCA_023853755.1		 n/a 20,179
(1.21 %)		 24,249
(1.19 %)		 n/a 39.54
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 7,866
(100.00 %)		 3,953,031
(35.88 %)		 531,111
(1.14 %)		 16,354,874
(39.96 %)		 59,907
(1.35 %)
468 southern tamandua (mTamTet1 primary hap 2022)
GCA_023851605.1		 n/a 20,058
(1.26 %)		 22,196
(1.13 %)		 n/a 39.48
(99.44 %)		 961
(0.56 %)		 201
(100.00 %)		 4,037,291
(46.02 %)		 593,019
(1.17 %)		 18,033,833
(40.56 %)		 65,039
(1.33 %)
469 southern three-banded armadillo
GCA_004025125.1		 n/a 29,138
(0.73 %)		 56,522
(0.75 %)		 n/a 39.20
(99.82 %)		 15,801
(0.04 %)		 2,941,308
(99.96 %)		 6,990,740
(38.88 %)		 839,452
(1.23 %)		 24,805,397
(43.95 %)		 71,951
(0.98 %)
470 southern two-toed sloth (mChoDid1 alternate hap 2020)
GCA_015220265.1		 n/a 22,897
(1.23 %)		 27,007
(1.18 %)		 n/a 39.87
(100.00 %)		 70
(0.00 %)		 12,050
(100.00 %)		 4,502,020
(38.27 %)		 576,759
(1.02 %)		 17,143,050
(40.65 %)		 51,339
(1.15 %)
471 southern two-toed sloth (mChoDid1 primary hap 2020)
GCF_015220235.1		 63,054
(2.39 %)		 21,998
(1.29 %)		 23,177
(1.18 %)		 45,345
(1.69 %)		 39.89
(97.48 %)		 1,243
(2.52 %)		 146
(100.00 %)		 4,559,690
(39.66 %)		 577,607
(1.02 %)		 16,594,630
(40.50 %)		 51,430
(1.14 %)
472 southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 refseq)
GCF_000283155.1		 37,037
(2.11 %)		 18,398
(1.71 %)		 19,753
(1.44 %)		 n/a 40.90
(96.05 %)		 54,737
(3.96 %)		 57,824
(96.04 %)		 3,685,898
(38.31 %)		 421,694
(0.97 %)		 14,765,529
(28.93 %)		 36,281
(1.02 %)
473 Sowerby's beaked whale
GCA_004027085.1		 n/a 22,800
(1.32 %)		 38,247
(1.17 %)		 n/a 41.68
(99.84 %)		 8,597
(0.03 %)		 1,810,317
(99.97 %)		 5,520,986
(45.05 %)		 1,081,962
(2.69 %)		 13,480,261
(43.01 %)		 69,001
(1.39 %)
474 sperm whale (SW-GA 2023)
GCF_002837175.3		 62,615
(2.83 %)		 19,485
(1.75 %)		 22,707
(1.41 %)		 n/a 41.33
(95.82 %)		 121,387
(4.20 %)		 133,555
(95.80 %)		 3,906,439
(36.43 %)		 691,647
(2.39 %)		 13,489,368
(32.95 %)		 86,751
(2.23 %)
475 star-nosed mole
GCF_000260355.1		 30,444
(2.86 %)		 16,116
(1.82 %)		 17,403
(1.78 %)		 n/a 41.55
(95.10 %)		 82,557
(4.92 %)		 84,595
(95.08 %)		 1,855,039
(18.90 %)		 308,473
(0.86 %)		 9,571,561
(26.02 %)		 48,079
(2.76 %)
476 Steller sea lion
GCF_004028035.1		 46,044
(2.38 %)		 21,171
(1.78 %)		 21,626
(1.43 %)		 36,701
(1.75 %)		 41.38
(99.41 %)		 18,994
(0.59 %)		 24,485
(99.41 %)		 4,556,415
(43.53 %)		 577,797
(1.09 %)		 13,545,012
(33.71 %)		 51,355
(1.45 %)
477 Stephens's kangaroo rat
GCA_004024685.1		 n/a 20,638
(1.19 %)		 43,541
(1.37 %)		 n/a 41.90
(99.85 %)		 8,882
(0.04 %)		 1,278,525
(99.96 %)		 4,886,095
(30.36 %)		 1,229,832
(5.30 %)		 11,334,494
(44.33 %)		 38,450
(1.17 %)
478 steppe mouse (ZRU 2018)
GCA_003336285.1		 n/a 22,032
(2.17 %)		 20,891
(1.41 %)		 n/a 41.70
(95.78 %)		 123,681
(4.24 %)		 161,217
(95.76 %)		 4,964,415
(42.35 %)		 1,414,584
(2.75 %)		 12,989,925
(31.80 %)		 17,544
(0.44 %)
479 straw-colored fruit bat
GCA_000465285.1		 n/a 20,161
(1.66 %)		 40,283
(1.50 %)		 n/a 39.24
(99.62 %)		 154,908
(0.40 %)		 288,446
(99.60 %)		 2,814,732
(32.92 %)		 372,539
(1.01 %)		 12,351,823
(25.93 %)		 67,245
(2.34 %)
480 stripe-headed round-eared bat
GCA_004024845.1		 n/a 20,248
(1.62 %)		 29,173
(1.61 %)		 n/a 42.04
(99.96 %)		 2,860
(0.01 %)		 252,670
(99.99 %)		 3,018,746
(29.48 %)		 333,243
(0.74 %)		 12,128,116
(30.51 %)		 59,513
(1.87 %)
481 striped dolphin (alternate hap 2023)
GCA_951394445.1		 n/a 18,204
(1.54 %)		 21,036
(1.34 %)		 n/a 42.07
(100.00 %)		 n/a 3,464
(100.00 %)		 3,767,720
(35.65 %)		 1,102,723
(10.92 %)		 11,794,617
(40.96 %)		 67,537
(3.57 %)
482 striped dolphin (primary hap 2023)
GCA_951394435.1		 n/a 18,595
(1.48 %)		 20,637
(1.29 %)		 n/a 42.18
(99.99 %)		 993
(0.01 %)		 639
(100.00 %)		 4,097,623
(35.88 %)		 1,442,973
(13.60 %)		 12,327,244
(43.08 %)		 68,498
(4.29 %)
483 striped hyena (BS54 2019 Broad)
GCA_004023945.1		 n/a 22,373
(1.45 %)		 39,382
(1.45 %)		 n/a 41.66
(99.93 %)		 11,849
(0.05 %)		 362,072
(99.95 %)		 5,048,667
(42.42 %)		 712,073
(1.24 %)		 13,879,012
(34.58 %)		 69,835
(2.20 %)
484 striped hyena (Hyena2069 2018 Potsdam U)
GCF_003009895.1		 48,870
(2.41 %)		 18,793
(1.67 %)		 20,950
(1.44 %)		 n/a 41.56
(99.29 %)		 23,058
(0.71 %)		 5,761
(100.00 %)		 4,782,500
(41.88 %)		 701,157
(1.32 %)		 13,436,624
(33.05 %)		 58,977
(2.20 %)
485 Sumatran rhinoceros (Ipuh 2017)
GCA_002844835.1		 n/a 20,368
(1.53 %)		 24,204
(1.23 %)		 n/a 41.05
(95.54 %)		 50,876
(4.40 %)		 1,112,463
(95.60 %)		 4,516,240
(39.90 %)		 561,540
(1.56 %)		 15,821,451
(34.68 %)		 45,201
(1.03 %)
486 Sunda flying lemur (2014 WashU)
GCF_000696425.1		 34,734
(1.83 %)		 21,356
(1.55 %)		 25,832
(1.21 %)		 n/a 40.21
(87.96 %)		 412,608
(12.07 %)		 511,878
(87.93 %)		 4,961,153
(38.35 %)		 854,441
(3.33 %)		 17,562,576
(28.82 %)		 82,988
(1.05 %)
487 Sunda flying lemur (US047 2019 Broad)
GCA_004027255.1		 n/a 24,882
(1.29 %)		 43,546
(1.12 %)		 n/a 40.46
(99.88 %)		 5,895
(0.02 %)		 1,655,642
(99.98 %)		 5,807,241
(38.62 %)		 953,765
(2.48 %)		 18,836,777
(37.68 %)		 114,955
(1.43 %)
488 tailed tailless bat
GCA_004027475.1		 n/a 19,920
(1.58 %)		 28,017
(1.58 %)		 n/a 41.76
(99.95 %)		 4,640
(0.02 %)		 341,895
(99.98 %)		 3,139,817
(30.43 %)		 381,536
(0.81 %)		 12,069,229
(32.73 %)		 54,528
(2.15 %)
489 takin (Tak-1 2022)
GCF_023091745.1		 31,914
(1.65 %)		 19,290
(1.42 %)		 21,656
(1.27 %)		 n/a 43.32
(100.00 %)		 152
(0.00 %)		 1,363
(100.00 %)		 3,256,033
(21.01 %)		 714,375
(8.32 %)		 13,010,154
(44.58 %)		 49,134
(7.43 %)
490 Talazac's shrew tenrec
GCA_004026705.1		 n/a 22,605
(0.81 %)		 50,725
(1.09 %)		 n/a 43.03
(99.93 %)		 6,619
(0.02 %)		 795,514
(99.98 %)		 3,493,378
(14.58 %)		 705,274
(1.31 %)		 20,975,335
(36.85 %)		 70,793
(1.26 %)
491 tammar wallaby (mMacEug1 alternate hap 2023)
GCA_028389975.1		 n/a 11,133
(0.77 %)		 13,869
(0.98 %)		 n/a 38.63
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 14,285
(100.00 %)		 3,114,522
(26.10 %)		 661,874
(3.02 %)		 11,667,649
(38.41 %)		 12,393
(0.46 %)
492 tammar wallaby (mMacEug1 primary hap 2023)
GCA_028372415.1		 n/a 17,652
(0.77 %)		 15,774
(0.88 %)		 n/a 38.73
(99.81 %)		 515
(0.19 %)		 315
(100.00 %)		 5,836,160
(26.14 %)		 1,193,709
(2.72 %)		 22,682,658
(39.52 %)		 23,629
(0.48 %)
493 Tasmanian devil
GCF_902635505.1		 52,057
(2.36 %)		 15,918
(0.85 %)		 16,111
(0.91 %)		 n/a 36.16
(100.00 %)		 354
(0.00 %)		 106
(100.00 %)		 6,789,158
(44.28 %)		 1,246,027
(2.19 %)		 21,434,803
(41.20 %)		 23,609
(0.65 %)
494 thirteen-lined ground squirrel (2021 HiC)
GCF_016881025.1		 69,352
(3.50 %)		 18,934
(1.68 %)		 16,775
(1.37 %)		 n/a 39.91
(93.25 %)		 146,412
(6.77 %)		 7,132
(100.00 %)		 4,262,890
(35.64 %)		 640,624
(1.64 %)		 14,118,452
(27.90 %)		 28,317
(0.64 %)
495 tiger
GCF_018350195.1		 71,226
(2.84 %)		 18,513
(1.68 %)		 19,919
(1.39 %)		 n/a 41.64
(100.00 %)		 65
(0.00 %)		 131
(100.00 %)		 4,878,003
(42.77 %)		 912,595
(1.82 %)		 13,804,650
(33.76 %)		 64,312
(2.55 %)
496 Townsend's big-eared bat (haplotype 1 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022)
GCA_026230055.1		 n/a 19,370
(1.77 %)		 21,062
(1.61 %)		 n/a 42.81
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 610
(100.00 %)		 2,923,694
(25.49 %)		 772,382
(3.25 %)		 10,654,074
(37.41 %)		 48,226
(2.42 %)
497 Townsend's big-eared bat (haplotype 2 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022)
GCA_026230045.1		 n/a 18,627
(1.82 %)		 20,108
(1.67 %)		 n/a 42.95
(100.00 %)		 217
(0.00 %)		 182
(100.00 %)		 2,733,927
(24.79 %)		 715,258
(3.17 %)		 10,099,456
(36.35 %)		 47,139
(2.58 %)
498 Transcaucasian mole vole
GCA_001685075.1		 n/a 20,173
(1.62 %)		 18,627
(1.30 %)		 n/a 41.51
(96.09 %)		 440,846
(3.96 %)		 499,269
(96.04 %)		 3,827,136
(25.51 %)		 810,597
(2.65 %)		 13,634,524
(27.54 %)		 9,596
(0.16 %)
499 Upper Galilee mountains blind mole rat (2095 2014 refseq)
GCF_000622305.1		 54,667
(2.07 %)		 19,704
(1.26 %)		 21,262
(1.20 %)		 n/a 41.26
(95.18 %)		 201,121
(4.83 %)		 356,097
(95.17 %)		 6,165,645
(34.95 %)		 1,197,750
(2.77 %)		 16,282,383
(36.21 %)		 22,905
(0.49 %)
500 Vancouver Island marmot (RANI-1049 2019)
GCA_005458795.1		 n/a 19,867
(1.62 %)		 15,893
(1.33 %)		 n/a 39.77
(94.43 %)		 296,819
(5.60 %)		 315,631
(94.40 %)		 4,452,628
(33.94 %)		 751,210
(1.84 %)		 13,917,879
(30.08 %)		 26,541
(0.58 %)
501 vaquita (alternate hap mPhoSin1 2019)
GCA_008692045.1		 n/a 9,367
(1.66 %)		 11,297
(1.30 %)		 n/a 41.50
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 9,470
(100.00 %)		 1,708,360
(43.81 %)		 267,584
(1.67 %)		 5,373,410
(33.52 %)		 29,783
(1.94 %)
502 vaquita (mPhoSin1 2019)
GCF_008692025.1		 60,106
(3.00 %)		 18,611
(1.76 %)		 20,103
(1.39 %)		 35,176
(2.22 %)		 41.36
(99.66 %)		 212
(0.34 %)		 64
(100.00 %)		 4,067,454
(44.25 %)		 602,407
(1.34 %)		 12,468,582
(35.55 %)		 66,806
(1.79 %)
503 water buffalo (Mediterranean 2018)
GCF_003121395.1		 69,771
(3.14 %)		 19,465
(1.58 %)		 21,849
(1.37 %)		 46,051
(1.86 %)		 41.81
(99.99 %)		 410
(0.01 %)		 509
(100.00 %)		 5,407,697
(47.11 %)		 473,976
(1.54 %)		 13,015,899
(41.23 %)		 43,120
(1.15 %)
504 water buffalo (Murrah 2021)
GCF_019923935.1		 80,552
(3.26 %)		 19,402
(1.59 %)		 20,375
(1.31 %)		 n/a 41.75
(100.00 %)		 659
(0.00 %)		 26
(100.00 %)		 5,358,548
(47.11 %)		 447,338
(1.14 %)		 13,034,537
(41.28 %)		 40,189
(1.07 %)
505 Weddell seal (WS11-02 2013 refseq)
GCF_000349705.1		 48,251
(2.73 %)		 21,063
(1.73 %)		 22,333
(1.43 %)		 n/a 41.39
(70.44 %)		 152,836
(29.58 %)		 169,547
(70.42 %)		 4,420,479
(41.72 %)		 471,256
(0.66 %)		 13,410,237
(22.09 %)		 48,738
(1.01 %)
506 western European hedgehog (2012 refseq)
GCF_000296755.1		 29,923
(1.67 %)		 18,067
(1.33 %)		 19,777
(1.35 %)		 n/a 41.54
(85.94 %)		 219,764
(14.09 %)		 225,567
(85.91 %)		 6,594,783
(45.66 %)		 1,271,533
(2.29 %)		 12,374,161
(42.02 %)		 28,528
(0.71 %)
507 western European hedgehog (alternate hap 2023)
GCA_950295305.1		 n/a 14,370
(1.06 %)		 24,297
(1.27 %)		 n/a 42.08
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 26,601
(100.00 %)		 3,360,923
(19.59 %)		 1,043,098
(3.92 %)		 8,511,380
(53.68 %)		 23,321
(0.97 %)
508 western European hedgehog (primary hap 2023 refseq)
GCF_950295315.1		 61,103
(2.36 %)		 18,125
(1.16 %)		 20,689
(1.21 %)		 n/a 42.00
(99.97 %)		 3,760
(0.03 %)		 1,174
(100.00 %)		 4,891,329
(19.68 %)		 1,507,929
(3.81 %)		 12,571,105
(54.50 %)		 32,667
(0.90 %)
509 western European house mouse (WSB_EiJ v3 2022)
GCA_921998345.2		 n/a 21,722
(2.14 %)		 19,586
(1.39 %)		 108,856
(4.46 %)		 41.81
(98.87 %)		 1,233
(1.13 %)		 233
(100.00 %)		 4,634,551
(40.61 %)		 1,541,826
(3.49 %)		 13,030,566
(35.21 %)		 22,985
(0.56 %)
510 western spotted skunk
GCA_004023965.1		 n/a 21,665
(1.46 %)		 34,370
(1.32 %)		 n/a 41.61
(99.92 %)		 11,822
(0.05 %)		 433,831
(99.95 %)		 4,889,781
(40.77 %)		 901,906
(2.30 %)		 13,931,764
(34.80 %)		 54,394
(1.54 %)
511 western wild mouse (SPRET_EiJ v3 2022)
GCA_921997135.2		 n/a 21,699
(2.10 %)		 18,837
(1.32 %)		 n/a 41.69
(99.51 %)		 1,576
(0.49 %)		 143
(100.00 %)		 4,507,329
(41.24 %)		 1,517,241
(3.77 %)		 12,832,499
(36.17 %)		 22,568
(0.53 %)
512 white-beaked dolphin (alternate hap 2023)
GCA_949774935.1		 n/a 17,639
(1.50 %)		 25,684
(1.35 %)		 n/a 42.08
(100.00 %)		 n/a 25,619
(100.00 %)		 3,039,324
(36.05 %)		 637,912
(8.02 %)		 9,746,398
(38.98 %)		 56,325
(3.33 %)
513 white-beaked dolphin (primary hap 2023 refseq)
GCF_949774975.1		 59,982
(2.43 %)		 18,737
(1.57 %)		 20,767
(1.34 %)		 n/a 41.91
(99.99 %)		 1,070
(0.01 %)		 410
(100.00 %)		 3,820,566
(36.21 %)		 922,103
(8.43 %)		 12,304,360
(39.74 %)		 68,551
(3.58 %)
514 white-footed mouse
GCF_004664715.2		 54,479
(2.82 %)		 19,971
(1.69 %)		 20,132
(1.42 %)		 n/a 42.23
(99.95 %)		 2,299
(0.05 %)		 1,857
(100.00 %)		 5,060,487
(30.71 %)		 1,258,073
(2.85 %)		 14,007,098
(32.99 %)		 23,456
(0.67 %)
515 white-tailed deer (Pink-7 2017 refseq)
GCF_002102435.1		 57,774
(2.93 %)		 20,661
(1.75 %)		 23,085
(1.50 %)		 40,987
(1.94 %)		 41.55
(99.10 %)		 107,058
(0.91 %)		 48,653
(99.10 %)		 4,800,704
(41.29 %)		 413,129
(2.59 %)		 13,296,779
(34.22 %)		 44,165
(1.19 %)
516 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 alternate hap 2022)
GCA_024140225.1		 n/a 12,198
(1.10 %)		 18,494
(1.29 %)		 n/a 39.87
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 14,841
(100.00 %)		 1,725,021
(17.81 %)		 802,415
(4.26 %)		 8,321,474
(45.72 %)		 15,669
(0.79 %)
517 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 primary hap 2022)
GCF_024139225.1		 40,430
(1.81 %)		 17,575
(1.21 %)		 21,880
(1.35 %)		 47,496
(1.55 %)		 39.81
(99.57 %)		 1,010
(0.43 %)		 147
(100.00 %)		 2,846,063
(18.57 %)		 1,252,362
(3.89 %)		 13,776,063
(46.50 %)		 24,589
(0.78 %)
518 wild Bactrian camel (BCGSAC Cfer 1.0 YT-003-E 2020)
GCF_009834535.1		 70,235
(4.11 %)		 18,202
(1.93 %)		 20,199
(1.66 %)		 42,728
(2.35 %)		 41.66
(99.99 %)		 2,345
(0.01 %)		 2,043
(100.00 %)		 3,091,018
(33.31 %)		 332,720
(5.33 %)		 12,161,286
(28.79 %)		 55,524
(1.75 %)
519 wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 refseq)
GCF_000311805.1		 34,726
(2.40 %)		 18,746
(1.96 %)		 17,104
(1.61 %)		 n/a 41.28
(98.83 %)		 60,971
(1.18 %)		 68,872
(98.82 %)		 2,991,821
(33.93 %)		 353,632
(1.23 %)		 12,349,615
(25.12 %)		 45,437
(1.02 %)
520 wild goat
GCA_000978405.1		 n/a 19,104
(1.48 %)		 16,198
(1.21 %)		 n/a 41.91
(91.72 %)		 279,195
(8.31 %)		 368,693
(91.69 %)		 5,563,294
(45.39 %)		 452,402
(1.99 %)		 13,802,376
(35.47 %)		 41,935
(0.63 %)
521 wild yak
GCF_000298355.1		 29,776
(1.92 %)		 19,936
(1.62 %)		 19,914
(1.32 %)		 n/a 41.71
(95.48 %)		 192,006
(4.54 %)		 233,198
(95.46 %)		 5,348,663
(46.08 %)		 449,880
(1.38 %)		 13,572,902
(36.62 %)		 41,147
(0.82 %)
522 woodchuck (v1.1 L192 2022)
GCF_021218885.2		 68,030
(3.47 %)		 19,116
(1.55 %)		 21,017
(1.38 %)		 n/a 39.92
(100.00 %)		 47
(0.00 %)		 3,380
(100.00 %)		 5,285,788
(43.20 %)		 912,552
(2.73 %)		 14,538,866
(35.15 %)		 36,914
(1.02 %)
523 woodland dormouse
GCA_004027655.1		 n/a 23,556
(1.09 %)		 55,517
(1.33 %)		 n/a 41.52
(99.86 %)		 15,691
(0.06 %)		 1,283,630
(99.94 %)		 7,674,195
(34.99 %)		 1,698,258
(3.76 %)		 13,705,886
(42.23 %)		 68,562
(1.41 %)
524 woodland thicket rat
GCF_004785775.1		 43,129
(2.40 %)		 22,710
(2.13 %)		 21,042
(1.49 %)		 n/a 41.17
(98.57 %)		 76,623
(1.44 %)		 23,656
(100.00 %)		 4,732,544
(38.04 %)		 1,424,025
(3.23 %)		 13,549,399
(30.42 %)		 18,232
(0.48 %)
525 Yangtze finless porpoise (v2 wild 2018 refseq)
GCF_003031525.2		 43,297
(2.49 %)		 18,747
(1.81 %)		 19,638
(1.46 %)		 n/a 41.28
(99.29 %)		 52,647
(0.72 %)		 66,343
(99.28 %)		 3,547,466
(35.83 %)		 540,760
(1.65 %)		 12,691,756
(32.88 %)		 59,050
(1.48 %)
526 Yangtze River dolphin (v1.1 BGI 2013 refseq)
GCF_000442215.2		 26,115
(1.61 %)		 18,978
(1.74 %)		 20,661
(1.39 %)		 n/a 41.24
(98.69 %)		 123,788
(1.33 %)		 148,598
(98.67 %)		 3,788,303
(37.04 %)		 690,288
(1.96 %)		 12,841,906
(35.04 %)		 62,458
(1.54 %)
527 yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.1 2019)
GCF_003676075.3		 42,654
(2.16 %)		 19,547
(1.52 %)		 21,406
(1.40 %)		 n/a 39.89
(97.96 %)		 35,509
(2.04 %)		 66,442
(97.96 %)		 3,814,223
(27.39 %)		 800,865
(1.96 %)		 14,323,977
(32.63 %)		 34,122
(0.91 %)
528 yellow-footed antechinus (v2 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021)
GCF_016432865.1		 47,606
(2.50 %)		 15,703
(0.78 %)		 16,155
(0.90 %)		 n/a 36.21
(99.99 %)		 620
(0.01 %)		 486
(100.00 %)		 5,191,383
(23.81 %)		 1,269,772
(2.59 %)		 21,430,585
(42.69 %)		 28,118
(0.66 %)
529 yellow-spotted hyrax
GCA_004026845.1		 n/a 20,424
(0.86 %)		 43,984
(1.27 %)		 n/a 40.93
(99.94 %)		 3,815
(0.01 %)		 971,748
(99.99 %)		 5,365,974
(31.41 %)		 435,699
(1.22 %)		 21,229,266
(45.17 %)		 38,521
(0.68 %)
530 yellow-spotted hyrax (mHetBru1 2023)
GCA_028571685.1		 n/a 17,610
(1.00 %)		 20,322
(1.04 %)		 n/a 40.80
(100.00 %)		 276
(0.00 %)		 62
(100.00 %)		 3,295,935
(23.58 %)		 389,907
(6.37 %)		 19,525,382
(45.90 %)		 31,831
(0.63 %)
531 yellow-spotted hyrax (mHetBru1 alternate hap 2023)
GCA_028571665.1		 n/a 16,320
(1.03 %)		 20,318
(1.13 %)		 n/a 40.93
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 4,169
(100.00 %)		 2,911,332
(23.50 %)		 347,110
(4.57 %)		 17,256,419
(44.04 %)		 28,674
(0.68 %)
532 Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP alternate hap 2023)
GCA_028536395.1		 n/a 19,188
(1.79 %)		 21,673
(1.72 %)		 n/a 43.03
(100.00 %)		 215
(0.00 %)		 250
(100.00 %)		 3,043,589
(24.76 %)		 773,853
(4.49 %)		 10,648,494
(37.26 %)		 61,910
(2.52 %)
533 Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP primary hap 2023)
GCA_028538775.1		 n/a 18,587
(1.82 %)		 21,049
(1.76 %)		 n/a 43.22
(100.00 %)		 209
(0.00 %)		 685
(100.00 %)		 2,890,086
(24.28 %)		 719,555
(4.26 %)		 10,089,514
(36.35 %)		 60,975
(2.61 %)
534 zebu cattle (Nelore 2014 refseq)
GCF_000247795.1		 39,817
(2.52 %)		 18,603
(1.59 %)		 18,779
(1.29 %)		 n/a 41.75
(92.62 %)		 6,941,272
(7.66 %)		 253,770
(92.59 %)		 5,119,428
(46.84 %)		 358,908
(0.88 %)		 13,431,672
(36.60 %)		 35,241
(0.84 %)
TOTALS:total assembly count 534

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 214 assemblies assembly stats track stats
Mammals 534 assemblies assembly stats track stats
Birds 353 assemblies assembly stats track stats
Fishes 387 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 220 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 700 assemblies assembly stats track stats
Plants 296 assemblies assembly stats track stats
Fungi 648 assemblies assembly stats track stats
Viruses 281 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 96 assemblies assembly stats track stats
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VGP - Vertebrate Genome Project 882 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats