Mammals Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of mammals only.

See also: hub access, assembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 aardvark (SDZICR_OR568_19922 2012 Broad)
GCF_000298275.1		 25,607
(1.08 %)		 18,351
(1.06 %)		 20,358
(0.98 %)		 n/a 40.07
(76.89 %)		 411,144
(23.15 %)		 433,653
(76.85 %)		 n/a 536,700
(0.74 %)		 18,176,790
(39.08 %)		 26,235
(0.40 %)
2 African grass rat (maternal 2020)
GCA_011750645.1		 n/a 20,916
(2.01 %)		 19,513
(1.43 %)		 n/a 41.37
(98.89 %)		 1,526
(1.11 %)		 1,610
(100.00 %)		 4,928,847
(37.45 %)		 1,652,295
(5.20 %)		 13,507,965
(32.27 %)		 17,712
(0.51 %)
3 African grass rat (paternal 2020)
GCA_011762545.1		 n/a 20,796
(2.00 %)		 19,611
(1.43 %)		 n/a 41.42
(97.70 %)		 1,563
(2.30 %)		 1,740
(100.00 %)		 4,904,243
(37.25 %)		 1,672,608
(5.37 %)		 13,465,246
(32.19 %)		 17,677
(0.50 %)
4 African grass rat (paternal X 2020)
GCF_011762505.1		 45,963
(2.46 %)		 20,878
(1.99 %)		 19,613
(1.43 %)		 37,929
(2.32 %)		 41.39
(99.19 %)		 1,624
(0.81 %)		 1,595
(100.00 %)		 4,939,557
(37.33 %)		 1,674,970
(5.40 %)		 13,613,429
(32.71 %)		 17,767
(0.51 %)
5 African hunting dog
GCA_001887905.1		 n/a 18,956
(1.75 %)		 17,562
(1.41 %)		 n/a 40.98
(92.89 %)		 1,415,298
(7.28 %)		 803
(100.00 %)		 4,458,183
(39.99 %)		 658,637
(1.13 %)		 13,671,493
(28.24 %)		 47,644
(1.64 %)
6 African savanna elephant (2009 refseq)
GCF_000001905.1		 46,043
(2.30 %)		 19,169
(1.26 %)		 19,664
(1.10 %)		 n/a 40.76
(97.57 %)		 93,514
(2.45 %)		 95,866
(97.55 %)		 6,363,315
(57.54 %)		 365,797
(0.88 %)		 16,073,053
(44.89 %)		 33,513
(0.68 %)
7 African savanna elephant (hap1 mLoxAfr1 2023)
GCA_030020305.1		 n/a 18,845
(1.07 %)		 22,426
(1.10 %)		 n/a 41.34
(99.85 %)		 169
(0.15 %)		 1,253
(99.85 %)		 4,406,744
(29.55 %)		 925,868
(4.71 %)		 15,966,881
(50.49 %)		 68,531
(1.61 %)
8 African savanna elephant (hap2 2023)
GCF_030014295.1		 64,034
(3.35 %)		 18,980
(1.10 %)		 21,593
(1.06 %)		 n/a 41.25
(99.90 %)		 231
(0.10 %)		 879
(100.00 %)		 4,426,749
(29.95 %)		 832,904
(4.08 %)		 16,118,888
(49.47 %)		 62,314
(1.49 %)
9 African savanna elephant (hap2 mLoxAfr1 2023)
GCA_030014295.1		 n/a 18,981
(1.10 %)		 22,759
(1.12 %)		 n/a 41.25
(99.90 %)		 231
(0.10 %)		 880
(100.00 %)		 4,426,756
(29.95 %)		 832,908
(4.08 %)		 16,118,910
(49.47 %)		 62,315
(1.49 %)
10 agile gracile mouse opossum
GCF_016433145.1		 30,697
(1.32 %)		 17,361
(0.78 %)		 17,596
(0.81 %)		 n/a 37.86
(91.75 %)		 85,142
(8.25 %)		 60,714
(100.00 %)		 7,917,577
(49.04 %)		 1,054,566
(1.57 %)		 22,701,659
(37.69 %)		 27,301
(0.49 %)
11 alpaca (v3.2 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U)
GCF_000164845.4		 54,987
(3.56 %)		 18,439
(1.93 %)		 18,426
(1.63 %)		 n/a 41.40
(95.85 %)		 166,272
(4.17 %)		 77,389
(100.00 %)		 3,004,413
(33.17 %)		 315,092
(1.36 %)		 12,458,272
(24.89 %)		 54,502
(1.38 %)
12 Alpine marmot (2019)
GCF_001458135.2		 69,587
(3.43 %)		 19,047
(1.54 %)		 17,768
(1.39 %)		 n/a 39.80
(96.13 %)		 88,858
(3.88 %)		 14,031
(100.00 %)		 3,726,252
(26.48 %)		 746,953
(1.83 %)		 14,066,368
(30.30 %)		 30,191
(0.63 %)
13 Alvarez's mastiff bat (A012 2023)
GCA_031001765.1		 n/a 19,086
(1.55 %)		 22,040
(1.52 %)		 n/a 42.18
(99.99 %)		 1,182
(0.01 %)		 1,369
(99.99 %)		 3,846,728
(31.78 %)		 639,852
(2.90 %)		 11,937,936
(38.98 %)		 75,377
(2.21 %)
14 Alvarez's mastiff bat (hap1 2024)
GCA_037157525.1		 n/a 18,980
(1.50 %)		 22,394
(1.50 %)		 n/a 42.30
(100.00 %)		 80
(0.00 %)		 326
(100.00 %)		 3,896,863
(31.56 %)		 659,711
(4.74 %)		 11,945,162
(40.81 %)		 76,769
(2.57 %)
15 Alvarez's mastiff bat (hap2 2024)
GCA_037176705.1		 n/a 19,066
(1.48 %)		 22,356
(1.48 %)		 n/a 42.25
(100.00 %)		 75
(0.00 %)		 287
(100.00 %)		 3,908,607
(31.48 %)		 664,931
(5.23 %)		 11,892,191
(41.08 %)		 76,453
(2.43 %)
16 American beaver (Ward 2017 refseq)
GCF_001984765.1		 40,013
(2.15 %)		 20,867
(1.53 %)		 24,201
(1.33 %)		 n/a 39.72
(99.99 %)		 3,321
(0.01 %)		 21,157
(100.00 %)		 4,526,430
(33.75 %)		 486,353
(1.30 %)		 14,347,145
(31.96 %)		 23,046
(0.72 %)
17 American bison (2014 refseq)
GCF_000754665.1		 38,686
(2.34 %)		 19,782
(1.47 %)		 20,444
(1.25 %)		 n/a 41.82
(93.12 %)		 341,984
(6.92 %)		 470,415
(93.08 %)		 n/a 419,596
(0.95 %)		 13,519,877
(37.66 %)		 60,388
(1.03 %)
18 American black bear (L20-20 alternate hap 2022)
GCA_024610745.1		 n/a 22,502
(1.17 %)		 43,431
(1.28 %)		 n/a 43.14
(99.99 %)		 n/a 77,311
(100.00 %)		 4,587,986
(32.30 %)		 773,829
(6.39 %)		 14,594,034
(35.67 %)		 78,849
(3.32 %)
19 American black bear (L20-20 primary hap 2022)
GCA_024610735.1		 n/a 18,458
(1.52 %)		 21,049
(1.43 %)		 n/a 42.93
(100.00 %)		 22
(0.00 %)		 317
(100.00 %)		 4,000,508
(32.69 %)		 641,903
(5.91 %)		 13,210,530
(35.54 %)		 68,981
(3.00 %)
20 American black bear (UA15103 2021)
GCF_020975775.1		 53,916
(3.11 %)		 18,840
(1.73 %)		 20,969
(1.50 %)		 n/a 42.09
(100.00 %)		 n/a 2,213
(100.00 %)		 3,936,528
(34.53 %)		 594,864
(2.90 %)		 13,725,005
(32.35 %)		 62,580
(1.91 %)
21 American mink (2018)
GCA_900108605.1		 n/a 18,686
(1.70 %)		 20,016
(1.50 %)		 36,997
(1.74 %)		 41.60
(92.95 %)		 154,172
(7.07 %)		 161,347
(92.93 %)		 4,350,343
(38.70 %)		 606,128
(1.17 %)		 13,605,797
(28.74 %)		 54,199
(1.98 %)
22 American mink (M4711 2021 Dalhousie U)
GCF_020171115.1		 50,253
(2.26 %)		 18,949
(1.49 %)		 20,914
(1.29 %)		 n/a 42.26
(100.00 %)		 n/a 183
(100.00 %)		 4,705,680
(39.15 %)		 795,684
(5.50 %)		 14,085,357
(37.99 %)		 63,307
(2.38 %)
23 American pika (hap1 2023)
GCF_030435755.1		 45,008
(1.93 %)		 17,997
(1.35 %)		 23,185
(1.49 %)		 n/a 44.16
(100.00 %)		 432
(0.00 %)		 5,864
(100.00 %)		 4,126,248
(43.60 %)		 628,344
(15.71 %)		 11,100,962
(42.69 %)		 60,350
(1.67 %)
24 American pika (hap2 2023)
GCA_030435715.1		 n/a 16,911
(1.23 %)		 21,107
(1.43 %)		 n/a 44.43
(100.00 %)		 375
(0.00 %)		 6,123
(100.00 %)		 1,808,768
(10.42 %)		 561,106
(21.05 %)		 10,283,513
(45.97 %)		 54,919
(1.33 %)
25 American pika 3.0 (2012 Broad refseq)
GCF_000292845.1		 26,253
(1.93 %)		 17,576
(1.61 %)		 20,076
(1.70 %)		 n/a 43.35
(87.20 %)		 122,542
(12.82 %)		 132,962
(87.18 %)		 2,761,257
(29.47 %)		 414,896
(1.07 %)		 10,968,698
(26.71 %)		 44,652
(1.14 %)
26 American pika 4.0 (UAM:Mamm:113957 2020)
GCF_014633375.1		 31,887
(1.92 %)		 17,532
(1.60 %)		 19,609
(1.65 %)		 n/a 43.35
(87.14 %)		 124,941
(12.88 %)		 9,351
(100.00 %)		 2,827,662
(29.77 %)		 414,980
(1.07 %)		 10,969,165
(26.69 %)		 44,743
(1.13 %)
27 Amur tiger (TaeGuk 2013 refseq)
GCF_000464555.1		 33,681
(2.23 %)		 17,929
(1.49 %)		 15,090
(1.29 %)		 n/a 41.40
(97.59 %)		 155,553
(2.44 %)		 157,032
(97.56 %)		 n/a 831,136
(1.67 %)		 13,654,437
(31.78 %)		 65,229
(1.60 %)
28 Antarctic minke whale
GCA_000978805.1		 n/a 23,312
(1.49 %)		 45,535
(1.26 %)		 n/a 40.73
(99.37 %)		 299,456
(0.64 %)		 720,900
(99.36 %)		 4,011,313
(41.13 %)		 504,837
(1.04 %)		 13,553,641
(30.96 %)		 56,223
(1.31 %)
29 Antillean ghost-faced bat
GCA_004026545.1		 n/a 20,088
(1.74 %)		 31,558
(1.63 %)		 n/a 41.74
(99.97 %)		 1,835
(0.01 %)		 207,094
(99.99 %)		 3,025,044
(30.67 %)		 332,606
(0.70 %)		 12,504,556
(28.79 %)		 65,503
(2.30 %)
30 aoudad
GCA_002201775.1		 n/a 19,905
(1.62 %)		 27,488
(1.60 %)		 n/a 42.01
(95.96 %)		 186,672
(4.05 %)		 263,992
(95.95 %)		 5,418,013
(45.05 %)		 471,426
(1.19 %)		 13,396,252
(36.94 %)		 48,844
(1.32 %)
31 Arabian camel (Drom800 2019 refseq)
GCF_000803125.2		 64,519
(3.85 %)		 18,483
(1.89 %)		 20,554
(1.62 %)		 n/a 41.51
(99.22 %)		 47,342
(0.79 %)		 21,070
(100.00 %)		 3,233,022
(34.07 %)		 345,049
(1.55 %)		 13,383,050
(26.19 %)		 58,872
(1.79 %)
32 Arabian camel (hap2 2024)
GCA_036321565.1		 n/a 17,085
(1.73 %)		 19,317
(1.59 %)		 n/a 41.75
(100.00 %)		 210
(0.00 %)		 173
(100.00 %)		 2,818,446
(29.44 %)		 316,646
(8.90 %)		 11,192,133
(31.47 %)		 52,135
(1.67 %)
33 Arabian camel (mCamDro1 2024)
GCF_036321535.1		 62,940
(3.46 %)		 18,078
(1.66 %)		 21,071
(1.56 %)		 n/a 41.64
(100.00 %)		 195
(0.00 %)		 171
(100.00 %)		 3,040,467
(29.22 %)		 343,480
(10.93 %)		 11,796,955
(33.50 %)		 55,427
(1.61 %)
34 Arabian camel (paternal 2024)
GCA_036321535.1		 n/a 18,080
(1.66 %)		 20,345
(1.52 %)		 n/a 41.64
(100.00 %)		 195
(0.00 %)		 172
(100.00 %)		 3,040,473
(29.22 %)		 343,482
(10.93 %)		 11,797,012
(33.50 %)		 55,428
(1.61 %)
35 Arctic fox (Blue_001 2021 refseq)
GCF_018345385.1		 60,759
(3.11 %)		 19,942
(1.72 %)		 19,529
(1.38 %)		 n/a 41.27
(100.00 %)		 529
(0.00 %)		 929
(100.00 %)		 4,821,229
(41.22 %)		 1,006,124
(2.31 %)		 13,556,149
(32.92 %)		 49,997
(2.23 %)
36 Arctic ground squirrel
GCF_003426925.1		 39,569
(2.25 %)		 18,954
(1.74 %)		 19,372
(1.45 %)		 n/a 39.95
(89.51 %)		 2,429,461
(10.59 %)		 15,883
(100.00 %)		 4,400,304
(32.67 %)		 672,831
(1.50 %)		 13,913,477
(26.41 %)		 27,575
(0.72 %)
37 Asian palm civet
GCA_004024585.1		 n/a 22,124
(1.43 %)		 43,710
(1.39 %)		 n/a 42.52
(99.95 %)		 4,533
(0.02 %)		 442,658
(99.98 %)		 4,877,367
(40.32 %)		 754,440
(1.35 %)		 14,557,779
(32.29 %)		 148,246
(5.67 %)
38 Asiatic elephant (mEleMax1 alternate hap 2022)
GCA_024166345.1		 n/a 17,906
(1.18 %)		 21,966
(1.14 %)		 n/a 41.14
(100.00 %)		 n/a 6,361
(100.00 %)		 3,818,524
(29.72 %)		 533,426
(3.22 %)		 14,381,781
(47.30 %)		 50,264
(1.15 %)
39 Asiatic elephant (mEleMax1 primary hap 2022)
GCF_024166365.1		 61,202
(2.60 %)		 18,887
(1.13 %)		 21,194
(1.06 %)		 n/a 41.14
(99.90 %)		 126
(0.10 %)		 64
(100.00 %)		 4,358,470
(31.27 %)		 663,094
(4.56 %)		 16,261,778
(48.66 %)		 69,120
(1.32 %)
40 Asiatic mouflon (Amuf_v1 2020)
GCA_014523465.1		 n/a 19,569
(1.59 %)		 21,293
(1.35 %)		 n/a 41.97
(99.68 %)		 257
(0.32 %)		 128
(100.00 %)		 5,390,761
(47.15 %)		 451,837
(1.15 %)		 13,157,608
(40.67 %)		 44,158
(1.19 %)
41 Asiatic tapir (hap1 2023)
GCA_031878655.1		 n/a 18,969
(1.75 %)		 20,207
(1.36 %)		 n/a 41.25
(100.00 %)		 79
(0.00 %)		 262
(100.00 %)		 3,650,963
(38.06 %)		 355,322
(2.63 %)		 14,837,952
(31.37 %)		 37,174
(1.87 %)
42 Asiatic tapir (hap2 2023)
GCA_031878705.1		 n/a 18,931
(1.76 %)		 19,988
(1.37 %)		 n/a 41.16
(100.00 %)		 92
(0.00 %)		 193
(100.00 %)		 3,632,286
(38.21 %)		 350,074
(2.22 %)		 14,785,531
(30.90 %)		 36,699
(1.70 %)
43 ass (Dezhou 2021)
GCF_016077325.2		 84,046
(4.01 %)		 18,838
(1.75 %)		 20,239
(1.42 %)		 69,689
(3.29 %)		 41.42
(99.86 %)		 1,922
(0.15 %)		 50
(100.00 %)		 3,840,509
(41.57 %)		 319,943
(0.81 %)		 14,889,114
(29.46 %)		 41,082
(1.37 %)
44 ass (Maral har 2015 refseq)
GCF_001305755.1		 48,989
(3.12 %)		 18,838
(1.78 %)		 19,295
(1.44 %)		 n/a 41.28
(98.63 %)		 69,593
(1.38 %)		 2,167
(100.00 %)		 3,731,432
(40.84 %)		 289,737
(0.96 %)		 14,695,308
(28.58 %)		 40,025
(1.06 %)
45 Australian echidna (mTacAcu1 alternate hap 2020)
GCA_015852515.1		 n/a 13,505
(1.03 %)		 18,978
(1.47 %)		 n/a 45.32
(99.98 %)		 26
(0.02 %)		 3,482
(100.00 %)		 6,880,857
(41.88 %)		 1,099,932
(7.47 %)		 8,156,735
(56.68 %)		 70,515
(2.88 %)
46 Australian echidna (mTacAcu1 primary hap 2020)
GCF_015852505.1		 42,938
(2.28 %)		 14,891
(1.01 %)		 19,714
(1.45 %)		 n/a 45.30
(98.61 %)		 524
(1.39 %)		 310
(100.00 %)		 7,814,876
(42.89 %)		 1,219,764
(6.93 %)		 9,488,325
(55.68 %)		 78,364
(2.73 %)
47 Bactrian camel (Alxa 2014 refseq)
GCF_000767855.1		 52,178
(3.64 %)		 18,303
(1.98 %)		 17,097
(1.64 %)		 n/a 41.32
(99.32 %)		 31,980
(0.69 %)		 67,435
(99.31 %)		 2,966,704
(34.06 %)		 306,997
(0.95 %)		 12,209,949
(25.43 %)		 49,790
(1.25 %)
48 banded mongoose
GCA_004023785.1		 n/a 21,568
(1.57 %)		 30,427
(1.43 %)		 n/a 42.00
(99.96 %)		 4,510
(0.02 %)		 316,874
(99.98 %)		 4,768,524
(40.51 %)		 684,187
(1.30 %)		 13,713,756
(33.42 %)		 78,648
(2.80 %)
49 bank vole
GCF_902806735.1		 56,410
(2.99 %)		 18,977
(1.71 %)		 18,408
(1.50 %)		 n/a 41.86
(98.62 %)		 53,506
(1.39 %)		 54,142
(98.61 %)		 3,222,366
(21.59 %)		 933,697
(2.20 %)		 12,831,232
(31.50 %)		 18,784
(0.42 %)
50 banner-tailed kangaroo rat
GCF_019054845.1		 43,753
(1.82 %)		 18,397
(1.18 %)		 24,180
(1.39 %)		 n/a 40.83
(100.00 %)		 n/a 2,026
(100.00 %)		 5,587,719
(30.97 %)		 1,363,513
(3.95 %)		 12,128,920
(48.74 %)		 36,371
(1.27 %)
51 banteng 2023
GCF_032452875.1		 71,974
(3.56 %)		 19,305
(1.36 %)		 21,174
(1.20 %)		 n/a 42.79
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 1,518
(100.00 %)		 3,344,481
(20.63 %)		 1,039,571
(11.74 %)		 13,031,356
(47.36 %)		 73,031
(1.72 %)
52 bats A.intermedius (hap1 2024)
GCA_038363145.1		 n/a 18,022
(1.56 %)		 19,824
(1.51 %)		 n/a 42.28
(100.00 %)		 81
(0.00 %)		 419
(100.00 %)		 2,827,417
(26.82 %)		 371,479
(4.97 %)		 11,603,093
(34.64 %)		 71,574
(2.28 %)
53 bats A.intermedius (hap2 2024)
GCA_038363225.1		 n/a 17,124
(1.63 %)		 18,342
(1.54 %)		 n/a 42.25
(100.00 %)		 56
(0.00 %)		 187
(100.00 %)		 2,597,378
(26.81 %)		 332,733
(4.43 %)		 10,957,327
(33.52 %)		 63,688
(2.22 %)
54 beluga whale (Cook Inlet, Alaska, USA DL-CIB17-05 2020)
GCA_009917745.1		 n/a 19,239
(1.79 %)		 22,513
(1.43 %)		 35,878
(1.82 %)		 41.25
(97.57 %)		 27,070
(2.43 %)		 52,780
(97.57 %)		 4,021,599
(43.53 %)		 544,323
(1.08 %)		 12,738,162
(33.47 %)		 59,710
(1.51 %)
55 beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v3 2019)
GCF_002288925.2		 59,400
(3.08 %)		 18,667
(1.79 %)		 20,314
(1.43 %)		 n/a 41.24
(98.49 %)		 24,414
(1.52 %)		 29,444
(98.48 %)		 4,001,248
(43.73 %)		 543,276
(1.11 %)		 12,802,735
(34.18 %)		 59,307
(1.53 %)
56 big brown bat (BU_THK_EF1 2012)
GCF_000308155.1		 59,162
(3.17 %)		 18,334
(1.94 %)		 20,121
(1.78 %)		 n/a 42.93
(89.41 %)		 160,269
(10.62 %)		 167,057
(89.38 %)		 2,842,065
(25.82 %)		 614,712
(1.89 %)		 10,407,733
(28.90 %)		 66,720
(2.99 %)
57 big brown bat (TK198812 2023)
GCF_027574615.1		 46,266
(2.61 %)		 18,620
(1.80 %)		 21,271
(1.72 %)		 n/a 43.51
(100.00 %)		 75
(0.00 %)		 48
(100.00 %)		 3,041,145
(25.08 %)		 904,075
(3.80 %)		 10,530,666
(37.05 %)		 77,605
(3.68 %)
58 bighorn sheep
GCA_004026945.1		 n/a 23,059
(1.34 %)		 36,486
(1.19 %)		 n/a 43.20
(99.90 %)		 9,412
(0.03 %)		 1,057,548
(99.97 %)		 6,321,577
(50.75 %)		 716,846
(1.66 %)		 13,904,326
(44.98 %)		 95,564
(1.72 %)
59 black flying fox
GCF_000325575.1		 46,978
(3.15 %)		 18,089
(2.00 %)		 20,668
(1.75 %)		 n/a 39.74
(97.93 %)		 104,566
(2.08 %)		 170,164
(97.92 %)		 2,975,186
(34.05 %)		 481,859
(1.45 %)		 12,582,349
(26.52 %)		 62,483
(3.88 %)
60 black rat
GCF_011064425.1		 39,601
(2.37 %)		 20,793
(1.98 %)		 17,944
(1.37 %)		 n/a 42.14
(99.98 %)		 6,158
(0.02 %)		 2,173
(100.00 %)		 4,715,157
(41.57 %)		 1,432,294
(3.45 %)		 13,275,550
(32.36 %)		 18,055
(0.48 %)
61 black rhinoceros (BS38 2019 Broad)
GCA_004027315.1		 n/a 21,713
(1.32 %)		 32,731
(1.18 %)		 n/a 41.22
(99.85 %)		 7,256
(0.02 %)		 2,029,914
(99.98 %)		 4,618,655
(36.76 %)		 618,834
(2.21 %)		 16,248,532
(40.32 %)		 44,113
(0.97 %)
62 black rhinoceros (mBicDic1 alternate hap 2021)
GCA_020826835.1		 n/a 19,000
(1.37 %)		 22,547
(1.26 %)		 n/a 41.56
(99.97 %)		 178
(0.03 %)		 1,199
(100.00 %)		 4,340,245
(37.22 %)		 564,468
(8.07 %)		 14,384,523
(40.40 %)		 44,971
(1.16 %)
63 black rhinoceros (mBicDic1 primary hap 2021)
GCF_020826845.1		 56,255
(2.28 %)		 18,774
(1.38 %)		 22,348
(1.26 %)		 n/a 41.59
(99.95 %)		 215
(0.05 %)		 1,076
(100.00 %)		 4,200,390
(36.22 %)		 548,030
(8.34 %)		 14,347,693
(40.14 %)		 43,525
(1.14 %)
64 black-footed cat
GCA_004023925.1		 n/a 22,895
(1.14 %)		 51,789
(1.13 %)		 n/a 41.92
(99.90 %)		 13,476
(0.06 %)		 603,600
(99.94 %)		 5,261,265
(44.11 %)		 943,514
(1.77 %)		 13,681,435
(34.77 %)		 86,892
(2.23 %)
65 black-footed ferret (SB6536 2022)
GCF_022355385.1		 56,402
(2.78 %)		 18,681
(1.55 %)		 20,685
(1.40 %)		 n/a 41.55
(96.71 %)		 33,042
(3.30 %)		 20,575
(100.00 %)		 4,087,717
(30.94 %)		 695,805
(1.18 %)		 13,880,116
(32.08 %)		 54,060
(2.11 %)
66 black-lipped pika
GCF_017591425.1		 46,297
(2.64 %)		 18,529
(1.63 %)		 23,458
(1.83 %)		 n/a 43.71
(100.00 %)		 54
(0.00 %)		 2,214
(100.00 %)		 1,843,705
(12.62 %)		 471,798
(2.76 %)		 11,394,992
(31.27 %)		 63,124
(1.85 %)
67 Blainville's beaked whale (alternate hap 2022)
GCA_025094165.1		 n/a 17,838
(1.54 %)		 21,389
(1.35 %)		 n/a 41.71
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 5,198
(100.00 %)		 3,542,727
(35.35 %)		 650,369
(8.86 %)		 10,971,320
(41.15 %)		 62,389
(1.68 %)
68 Blainville's beaked whale (primary hap 2022 refseq)
GCF_025265405.1		 47,540
(2.07 %)		 19,041
(1.52 %)		 20,766
(1.27 %)		 n/a 41.70
(99.97 %)		 97
(0.03 %)		 74
(100.00 %)		 3,964,038
(35.29 %)		 765,957
(8.74 %)		 12,128,229
(41.78 %)		 70,851
(1.80 %)
69 blue whale (alternate hap JJ_BM4_2016_0621 2019)
GCA_008658375.1		 n/a 17,285
(1.80 %)		 21,295
(1.43 %)		 n/a 41.22
(100.00 %)		 n/a 12,574
(100.00 %)		 3,196,354
(43.47 %)		 467,194
(1.26 %)		 10,176,588
(33.66 %)		 56,916
(1.85 %)
70 Blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 alternate hap 2020)
GCA_008658375.2		 n/a 16,997
(1.82 %)		 20,609
(1.44 %)		 n/a 41.20
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 10,999
(100.00 %)		 3,126,800
(43.49 %)		 454,452
(1.23 %)		 9,916,868
(33.63 %)		 55,436
(1.85 %)
71 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v3 primary hap 2020)
GCF_009873245.2		 58,750
(2.71 %)		 19,162
(1.80 %)		 20,576
(1.41 %)		 36,291
(1.99 %)		 40.88
(98.91 %)		 886
(1.09 %)		 106
(100.00 %)		 3,986,870
(44.21 %)		 579,629
(1.22 %)		 12,858,384
(34.60 %)		 67,032
(1.73 %)
72 bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 alternate hap 2022)
GCA_022079275.1		 n/a 24,877
(1.23 %)		 48,382
(1.39 %)		 n/a 42.05
(99.98 %)		 4,716
(0.01 %)		 72,827
(99.99 %)		 6,403,412
(33.31 %)		 1,269,531
(1.94 %)		 17,771,689
(33.82 %)		 100,915
(3.00 %)
73 bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 primary hap 2022)
GCF_022079265.1		 45,362
(2.39 %)		 18,576
(1.65 %)		 20,510
(1.41 %)		 n/a 41.80
(100.00 %)		 24
(0.00 %)		 75
(100.00 %)		 4,970,082
(43.28 %)		 894,002
(1.80 %)		 13,648,384
(34.21 %)		 69,211
(2.68 %)
74 boreal woodland reindeer (boreal CA-31 2023)
GCA_019903745.2		 n/a 20,135
(1.60 %)		 22,598
(1.47 %)		 n/a 41.46
(96.98 %)		 34,682
(3.03 %)		 12,266
(100.00 %)		 3,134,107
(24.41 %)		 394,920
(0.92 %)		 13,154,929
(36.43 %)		 48,826
(1.07 %)
75 Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 alternate hap 2022)
GCA_024803775.1		 n/a 18,647
(0.96 %)		 23,998
(1.13 %)		 n/a 41.67
(100.00 %)		 124
(0.00 %)		 3,340
(100.00 %)		 3,775,862
(22.40 %)		 1,257,803
(21.71 %)		 9,347,543
(61.85 %)		 33,757
(1.35 %)
76 Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 primary hap 2022)
GCA_024803745.1		 n/a 17,791
(1.12 %)		 22,667
(1.29 %)		 n/a 41.66
(100.00 %)		 106
(0.00 %)		 2,898
(100.00 %)		 6,293,452
(41.30 %)		 1,076,688
(17.94 %)		 8,553,272
(57.13 %)		 31,102
(1.31 %)
77 Botta's pocket gopher (hap1 2023)
GCA_031878675.1		 n/a 18,247
(1.61 %)		 22,673
(1.83 %)		 n/a 41.12
(99.99 %)		 775
(0.01 %)		 835
(100.00 %)		 2,918,285
(18.64 %)		 868,090
(5.77 %)		 9,427,604
(40.78 %)		 27,049
(1.25 %)
78 Botta's pocket gopher (hap2 2023)
GCA_031878665.1		 n/a 17,612
(1.68 %)		 22,099
(1.91 %)		 n/a 41.23
(99.99 %)		 541
(0.01 %)		 365
(100.00 %)		 2,748,918
(17.16 %)		 827,542
(4.51 %)		 8,832,809
(39.20 %)		 26,416
(1.35 %)
79 boutu (hap1 2024)
GCA_036417435.1		 n/a 18,667
(1.46 %)		 20,817
(1.26 %)		 n/a 42.07
(100.00 %)		 284
(0.00 %)		 903
(100.00 %)		 4,004,895
(35.23 %)		 925,158
(12.15 %)		 11,999,784
(42.65 %)		 63,428
(1.55 %)
80 boutu (hap2 2024)
GCA_036417475.1		 n/a 17,954
(1.51 %)		 19,994
(1.30 %)		 n/a 42.02
(100.00 %)		 240
(0.00 %)		 800
(100.00 %)		 3,723,164
(34.96 %)		 809,880
(11.02 %)		 11,359,211
(41.42 %)		 60,067
(1.55 %)
81 Brandt's bat
GCF_000412655.1		 46,912
(2.84 %)		 19,267
(1.75 %)		 18,495
(1.62 %)		 n/a 42.59
(94.06 %)		 155,664
(5.95 %)		 325,414
(94.05 %)		 2,897,662
(25.08 %)		 634,208
(3.20 %)		 11,323,618
(31.06 %)		 66,749
(1.59 %)
82 Brazilian free-tailed bat (primary hap 2023)
GCA_030848825.1		 n/a 19,039
(1.66 %)		 21,660
(1.59 %)		 n/a 42.29
(100.00 %)		 20
(0.00 %)		 148
(100.00 %)		 3,805,818
(31.80 %)		 640,446
(2.50 %)		 11,793,353
(36.15 %)		 68,896
(2.40 %)
83 Brazilian guinea pig
GCA_000688575.1		 n/a 16,531
(1.49 %)		 11,177
(1.44 %)		 n/a 39.81
(64.76 %)		 2,565,595
(35.61 %)		 3,131
(100.00 %)		 2,529,479
(25.87 %)		 342,907
(0.66 %)		 10,719,517
(21.05 %)		 19,508
(0.31 %)
84 Brazilian tapir
GCA_004025025.1		 n/a 21,581
(1.61 %)		 30,818
(1.32 %)		 n/a 41.12
(99.93 %)		 2,273
(0.01 %)		 805,779
(99.99 %)		 3,877,938
(38.36 %)		 344,032
(0.79 %)		 15,601,710
(32.81 %)		 43,382
(1.17 %)
85 brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v2 2018)
GCF_003584765.2		 50,242
(2.92 %)		 18,811
(1.77 %)		 21,073
(1.52 %)		 n/a 41.84
(99.31 %)		 17,380
(0.70 %)		 21,813
(99.30 %)		 4,201,043
(40.86 %)		 567,586
(1.23 %)		 13,807,211
(30.86 %)		 62,125
(1.80 %)
86 brown bear (v2.0 North America Adak 2023)
GCF_023065955.2		 66,371
(4.20 %)		 18,615
(1.68 %)		 21,434
(1.53 %)		 n/a 42.29
(100.00 %)		 250
(0.00 %)		 362
(100.00 %)		 4,030,019
(33.22 %)		 630,008
(4.17 %)		 13,240,060
(32.92 %)		 64,814
(2.05 %)
87 brown big-eared bat (primary hap 2023)
GCA_963455305.1		 n/a 19,138
(1.72 %)		 20,370
(1.54 %)		 n/a 43.08
(99.99 %)		 1,237
(0.01 %)		 65
(100.00 %)		 3,201,470
(26.24 %)		 957,903
(4.27 %)		 10,687,995
(39.65 %)		 60,671
(2.39 %)
88 brown-throated sloth
GCA_004027775.1		 n/a 17,043
(1.21 %)		 37,090
(1.36 %)		 n/a 42.76
(99.76 %)		 462
(0.00 %)		 1,772,267
(100.00 %)		 2,487,215
(36.18 %)		 316,812
(1.60 %)		 7,948,666
(37.96 %)		 62,325
(2.36 %)
89 cactus mouse (2023)
GCF_949786415.1		 47,524
(2.02 %)		 18,894
(1.46 %)		 20,159
(1.22 %)		 n/a 42.40
(99.98 %)		 2,603
(0.02 %)		 4,297
(100.00 %)		 7,181,232
(52.75 %)		 1,247,378
(18.35 %)		 13,329,318
(43.03 %)		 19,540
(0.49 %)
90 California mouse (IS 2022)
GCF_007827085.1		 62,274
(3.80 %)		 18,959
(1.75 %)		 19,378
(1.41 %)		 n/a 42.21
(100.00 %)		 547
(0.00 %)		 237
(100.00 %)		 5,970,582
(45.08 %)		 1,165,743
(3.67 %)		 13,734,349
(33.67 %)		 19,529
(0.58 %)
91 California sea lion (alternate hap 2019)
GCA_009762295.1		 n/a 18,348
(1.81 %)		 18,692
(1.47 %)		 n/a 41.58
(100.00 %)		 n/a 3,093
(100.00 %)		 3,722,619
(42.89 %)		 488,086
(1.26 %)		 10,893,132
(33.14 %)		 44,449
(1.57 %)
92 California sea lion (LMU 2018 refseq)
GCF_900631625.1		 69,240
(2.99 %)		 20,741
(1.78 %)		 20,298
(1.40 %)		 n/a 41.38
(99.81 %)		 47,716
(0.20 %)		 10,423
(100.00 %)		 4,530,259
(43.28 %)		 573,086
(1.12 %)		 13,442,336
(33.58 %)		 50,583
(1.46 %)
93 California sea lion (mZalCal1 alternate hap 2020)
GCA_009762295.2		 n/a 18,319
(1.81 %)		 18,772
(1.48 %)		 n/a 41.58
(100.00 %)		 n/a 3,096
(100.00 %)		 3,724,021
(42.91 %)		 488,356
(1.26 %)		 10,891,276
(33.15 %)		 44,467
(1.57 %)
94 California sea lion (v2 primary hap 2020)
GCF_009762305.2		 70,801
(3.05 %)		 20,915
(1.77 %)		 20,179
(1.40 %)		 44,926
(2.10 %)		 41.40
(99.23 %)		 185
(0.77 %)		 47
(100.00 %)		 4,525,652
(43.65 %)		 590,246
(1.24 %)		 13,263,648
(33.76 %)		 51,899
(1.50 %)
95 California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 alternate hap 2023)
GCA_028537755.1		 n/a 19,409
(1.86 %)		 20,578
(1.69 %)		 n/a 42.43
(100.00 %)		 43
(0.00 %)		 310
(100.00 %)		 3,161,054
(22.60 %)		 891,453
(5.62 %)		 11,087,206
(33.12 %)		 19,104
(0.65 %)
96 California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 primary hap 2023)
GCA_028537955.1		 n/a 19,681
(1.86 %)		 21,257
(1.62 %)		 n/a 42.24
(100.00 %)		 51
(0.00 %)		 350
(100.00 %)		 4,957,057
(42.33 %)		 943,226
(5.63 %)		 11,695,871
(33.83 %)		 20,062
(0.64 %)
97 Canada lynx (alternate hap LIC74 2019)
GCA_007474575.1		 n/a 12,029
(1.42 %)		 15,171
(1.16 %)		 n/a 41.46
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 15,036
(100.00 %)		 2,937,491
(43.50 %)		 544,410
(1.76 %)		 7,641,565
(32.72 %)		 39,082
(2.44 %)
98 Canada lynx (LIC74 v2 alternate hap 2020)
GCA_007474575.2		 n/a 12,041
(1.42 %)		 15,226
(1.16 %)		 n/a 41.46
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 15,046
(100.00 %)		 2,939,291
(43.50 %)		 544,849
(1.76 %)		 7,650,345
(32.74 %)		 39,099
(2.44 %)
99 Canada lynx (LIC74 v2 primary hap 2020)
GCF_007474595.2		 50,142
(2.69 %)		 18,273
(1.65 %)		 19,264
(1.35 %)		 n/a 41.70
(99.88 %)		 842
(0.12 %)		 54
(100.00 %)		 5,011,165
(43.72 %)		 904,525
(1.75 %)		 13,467,551
(34.19 %)		 66,799
(2.48 %)
100 Cantor's roundleaf bat
GCA_004027415.1		 n/a 23,788
(1.42 %)		 45,328
(1.68 %)		 38,254
(1.57 %)		 41.36
(99.91 %)		 6,366
(0.03 %)		 846,566
(99.97 %)		 3,997,370
(31.48 %)		 775,742
(1.42 %)		 12,770,948
(33.45 %)		 41,527
(1.41 %)
101 Cape elephant shrew
GCF_000299155.1		 25,406
(1.08 %)		 23,258
(1.07 %)		 24,266
(1.16 %)		 n/a 40.30
(86.29 %)		 279,394
(13.74 %)		 288,162
(86.26 %)		 3,765,232
(16.90 %)		 604,351
(0.89 %)		 20,072,078
(42.36 %)		 25,977
(0.42 %)
102 Cape golden mole (2012 Broad)
GCF_000296735.1		 25,323
(1.07 %)		 20,961
(1.07 %)		 21,723
(1.04 %)		 n/a 40.01
(79.93 %)		 370,844
(20.11 %)		 391,344
(79.89 %)		 4,924,640
(21.03 %)		 500,830
(1.95 %)		 18,946,663
(41.18 %)		 21,186
(0.33 %)
103 Cape rock hyrax (US060 2019 Broad)
GCA_004026925.1		 n/a 21,401
(0.85 %)		 45,353
(1.14 %)		 n/a 41.08
(99.93 %)		 4,203
(0.01 %)		 1,048,940
(99.99 %)		 7,222,494
(54.48 %)		 430,286
(0.85 %)		 21,775,991
(44.61 %)		 37,158
(0.70 %)
104 capybara
GCA_004027455.1		 n/a 20,152
(1.22 %)		 28,931
(1.29 %)		 n/a 39.76
(99.93 %)		 5,747
(0.02 %)		 661,089
(99.98 %)		 4,220,878
(29.16 %)		 777,357
(2.04 %)		 15,214,944
(35.16 %)		 34,558
(0.85 %)
105 carabao (swamp buffalo K-KA32 2023)
GCF_029407905.1		 77,279
(2.89 %)		 19,433
(1.40 %)		 21,166
(1.23 %)		 n/a 42.77
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 115
(100.00 %)		 3,479,445
(21.92 %)		 547,054
(6.39 %)		 12,840,677
(45.22 %)		 99,752
(3.73 %)
106 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v2.0 2023 USDA)
GCF_002263795.3		 77,927
(4.11 %)		 19,428
(1.48 %)		 22,236
(1.33 %)		 n/a 42.01
(100.00 %)		 386
(0.00 %)		 1,958
(100.00 %)		 3,449,588
(22.63 %)		 596,092
(3.13 %)		 12,785,607
(42.11 %)		 46,864
(1.37 %)
107 cattle (Hereford UMD_3.1.1 2014)
GCF_000003055.6		 57,977
(2.74 %)		 19,583
(1.56 %)		 20,581
(1.31 %)		 n/a 41.82
(99.23 %)		 74,464
(0.78 %)		 75,598
(99.22 %)		 5,607,556
(49.02 %)		 440,521
(1.25 %)		 13,167,657
(40.78 %)		 42,869
(1.24 %)
108 Chacoan peccary (BS20 v2 2019 Broad)
GCA_004024745.2		 n/a 18,603
(1.52 %)		 22,330
(1.36 %)		 n/a 42.35
(98.12 %)		 57,013
(1.80 %)		 1,240,743
(98.20 %)		 5,255,211
(43.27 %)		 2,502,373
(4.37 %)		 12,968,788
(40.96 %)		 172,178
(3.66 %)
109 cheetah (Ajub_Pintada_27869175 2022)
GCF_027475565.1		 80,997
(4.53 %)		 18,420
(1.70 %)		 19,561
(1.40 %)		 n/a 41.59
(100.00 %)		 22
(0.00 %)		 195
(100.00 %)		 4,611,842
(35.10 %)		 837,685
(1.68 %)		 13,649,125
(33.06 %)		 60,367
(2.22 %)
110 cheetah (Rico 2018)
GCF_003709585.1		 72,154
(3.33 %)		 18,472
(1.70 %)		 20,443
(1.42 %)		 n/a 41.55
(99.55 %)		 24,173
(0.45 %)		 3,220
(100.00 %)		 4,853,945
(42.85 %)		 831,106
(1.53 %)		 13,663,571
(32.84 %)		 60,744
(2.17 %)
111 Chinese forest musk deer (Sichuan 2022)
GCF_022376915.1		 51,612
(2.80 %)		 19,565
(1.43 %)		 22,280
(1.29 %)		 n/a 42.30
(99.97 %)		 1,781
(0.03 %)		 2,446
(100.00 %)		 3,257,347
(21.65 %)		 399,120
(3.81 %)		 12,906,274
(43.79 %)		 46,689
(1.12 %)
112 Chinese hamster (17A/GY CHO 2020)
GCF_003668045.3		 55,440
(2.79 %)		 20,030
(1.84 %)		 18,721
(1.41 %)		 67,900
(3.41 %)		 41.51
(99.90 %)		 4,164
(0.10 %)		 647
(100.00 %)		 8,121,057
(33.74 %)		 1,095,058
(2.91 %)		 12,923,274
(32.25 %)		 19,341
(0.58 %)
113 Chinese hamster (CHO v1 2011 BGI)
GCF_000223135.1		 45,993
(2.59 %)		 20,602
(1.78 %)		 17,467
(1.35 %)		 n/a 41.37
(96.61 %)		 156,635
(3.40 %)		 265,787
(96.60 %)		 4,541,936
(33.03 %)		 1,072,129
(2.66 %)		 13,150,189
(30.04 %)		 12,522
(0.25 %)
114 Chinese hamster (CHO v2 2017 Eagle Genomics Ltd)
GCA_900186095.1		 n/a 19,874
(1.85 %)		 19,298
(1.44 %)		 n/a 41.45
(98.56 %)		 63,334
(1.45 %)		 71,598
(98.55 %)		 4,521,726
(33.66 %)		 1,060,619
(2.55 %)		 12,867,288
(31.26 %)		 17,960
(0.54 %)
115 Chinese hamster (CHO-K1 CHOZN v2.4 2022)
GCA_026545065.1		 n/a 20,293
(1.81 %)		 18,881
(1.42 %)		 n/a 41.62
(71.16 %)		 924,541
(28.93 %)		 1,236,122
(71.07 %)		 4,330,728
(30.92 %)		 987,319
(3.70 %)		 13,374,062
(21.92 %)		 18,838
(0.40 %)
116 Chinese pangolin (2020 Yunnan U)
GCF_014570555.1		 69,694
(3.21 %)		 18,206
(1.70 %)		 20,508
(1.48 %)		 n/a 40.79
(95.54 %)		 34,903
(4.47 %)		 4,694
(100.00 %)		 2,927,176
(35.60 %)		 269,964
(0.67 %)		 12,610,535
(29.10 %)		 35,278
(1.05 %)
117 Chinese pangolin (hap1 mManPen7 2023)
GCF_030020395.1		 71,445
(2.98 %)		 18,379
(1.34 %)		 21,837
(1.29 %)		 n/a 41.07
(99.77 %)		 383
(0.23 %)		 661
(100.00 %)		 3,318,871
(34.65 %)		 618,193
(3.68 %)		 12,009,669
(39.02 %)		 47,708
(1.22 %)
118 Chinese pangolin (hap2 mManPen7 2023)
GCA_030020945.1		 n/a 18,538
(1.34 %)		 21,724
(1.27 %)		 n/a 41.09
(99.48 %)		 190
(0.52 %)		 700
(100.00 %)		 3,362,899
(34.48 %)		 678,384
(4.11 %)		 12,024,241
(39.52 %)		 48,960
(1.19 %)
119 Chinese pangolin (MPE899 2014 WashU)
GCA_000738955.1		 n/a 18,749
(1.63 %)		 22,506
(1.40 %)		 n/a 40.93
(90.69 %)		 257,424
(9.33 %)		 230,927
(90.67 %)		 2,691,116
(34.48 %)		 316,518
(1.96 %)		 11,538,086
(25.40 %)		 30,693
(0.58 %)
120 Chinese rufous horseshoe bat
GCA_001888835.1		 n/a 26,871
(2.34 %)		 25,467
(1.89 %)		 n/a 40.52
(97.22 %)		 212,601
(2.80 %)		 63,439
(100.00 %)		 3,219,611
(33.86 %)		 495,126
(1.20 %)		 12,476,551
(27.16 %)		 32,993
(0.98 %)
121 Chinese tree shrew
GCF_000334495.1		 47,005
(2.07 %)		 21,375
(1.39 %)		 19,231
(1.28 %)		 n/a 41.73
(95.10 %)		 191,695
(4.92 %)		 242,445
(95.08 %)		 5,060,321
(23.05 %)		 1,046,388
(4.15 %)		 14,978,259
(38.04 %)		 88,806
(1.44 %)
122 chiru
GCA_000400835.1		 n/a 20,320
(1.60 %)		 42,654
(2.51 %)		 n/a 42.01
(93.04 %)		 283,069
(7.00 %)		 298,127
(93.00 %)		 5,342,241
(43.54 %)		 425,329
(1.25 %)		 13,714,420
(34.66 %)		 43,135
(1.89 %)
123 clouded leopard (mNeoNeb1 alternate hap 2023)
GCA_028018655.1		 n/a 16,430
(1.52 %)		 21,057
(1.44 %)		 n/a 41.79
(100.00 %)		 n/a 10,377
(100.00 %)		 3,845,437
(33.39 %)		 794,587
(2.14 %)		 10,765,695
(33.40 %)		 56,375
(2.45 %)
124 clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028018385.1		 81,219
(3.62 %)		 18,300
(1.65 %)		 20,361
(1.39 %)		 n/a 41.79
(99.94 %)		 181
(0.06 %)		 33
(100.00 %)		 4,224,269
(34.84 %)		 992,668
(2.08 %)		 13,618,866
(34.42 %)		 67,830
(2.45 %)
125 common bottlenose dolphin (maternal 2020)
GCA_011762535.1		 n/a 18,837
(1.77 %)		 20,857
(1.43 %)		 n/a 41.43
(99.73 %)		 649
(0.27 %)		 985
(100.00 %)		 4,073,893
(46.15 %)		 630,039
(2.15 %)		 12,628,219
(35.41 %)		 65,379
(1.89 %)
126 common bottlenose dolphin (maternal Y refseq 2020)
GCF_011762595.1		 67,207
(3.31 %)		 18,766
(1.77 %)		 20,528
(1.42 %)		 35,852
(1.58 %)		 41.44
(99.74 %)		 674
(0.26 %)		 362
(100.00 %)		 4,069,115
(46.17 %)		 628,982
(2.12 %)		 12,490,891
(35.29 %)		 65,551
(1.90 %)
127 common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 refseq)
GCF_001922835.1		 45,975
(2.99 %)		 17,255
(1.69 %)		 17,058
(1.34 %)		 n/a 40.85
(99.45 %)		 114,003
(0.57 %)		 2,648
(100.00 %)		 3,845,938
(43.89 %)		 514,631
(1.06 %)		 12,317,098
(32.18 %)		 48,030
(1.35 %)
128 common bottlenose dolphin (paternal 2020)
GCA_011762515.1		 n/a 18,537
(1.77 %)		 20,619
(1.44 %)		 n/a 41.42
(98.08 %)		 868
(1.92 %)		 1,166
(100.00 %)		 3,997,801
(45.93 %)		 609,838
(1.85 %)		 12,400,272
(34.53 %)		 64,630
(1.84 %)
129 common brushtail (alternate hap 2020)
GCA_011100645.1		 n/a 14,863
(0.75 %)		 15,426
(0.89 %)		 n/a 39.41
(100.00 %)		 313
(0.00 %)		 12,446
(100.00 %)		 5,846,769
(38.56 %)		 987,917
(1.99 %)		 16,764,356
(40.14 %)		 13,303
(0.35 %)
130 common brushtail (refseq 2020)
GCF_011100635.1		 37,674
(1.80 %)		 18,653
(0.80 %)		 15,375
(0.86 %)		 n/a 39.48
(99.44 %)		 1,796
(0.56 %)		 212
(100.00 %)		 7,598,116
(38.90 %)		 1,259,434
(1.97 %)		 22,071,306
(40.56 %)		 17,762
(0.38 %)
131 common pipistrelle (2020)
GCA_903992545.1		 n/a 17,216
(1.82 %)		 19,202
(1.79 %)		 n/a 42.55
(99.97 %)		 1,546
(0.03 %)		 323
(100.00 %)		 2,953,532
(23.94 %)		 805,142
(2.83 %)		 9,964,846
(34.69 %)		 57,295
(2.83 %)
132 common pipistrelle (alternate hap 2020)
GCA_903992515.1		 n/a 15,974
(1.72 %)		 20,563
(1.66 %)		 n/a 42.41
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 10,459
(100.00 %)		 2,634,333
(23.76 %)		 703,674
(2.65 %)		 8,909,525
(33.95 %)		 50,430
(2.54 %)
133 common pipistrelle (Broad 2019)
GCA_004026625.1		 n/a 21,938
(1.35 %)		 53,915
(1.60 %)		 n/a 42.88
(99.88 %)		 10,870
(0.05 %)		 736,974
(99.95 %)		 3,499,501
(22.91 %)		 1,046,301
(2.96 %)		 11,759,516
(37.96 %)		 92,062
(3.23 %)
134 common vampire bat (HL8 alternate hap 2022)
GCA_022682395.1		 n/a 17,520
(1.75 %)		 18,995
(1.67 %)		 n/a 42.89
(99.99 %)		 580
(0.01 %)		 430
(100.00 %)		 2,597,497
(28.17 %)		 356,620
(2.88 %)		 10,797,225
(31.23 %)		 61,931
(2.30 %)
135 common vampire bat (HL8 primary hap 2022 refseq)
GCF_022682495.1		 58,054
(3.40 %)		 18,280
(1.71 %)		 19,515
(1.59 %)		 n/a 42.98
(99.99 %)		 611
(0.01 %)		 573
(100.00 %)		 2,761,826
(28.38 %)		 427,942
(3.89 %)		 11,250,529
(32.57 %)		 70,701
(2.48 %)
136 common vampire bat (v3 DRU21DN04 2018)
GCF_002940915.2		 51,031
(3.24 %)		 18,503
(1.88 %)		 18,071
(1.68 %)		 n/a 42.15
(97.78 %)		 54,246
(2.23 %)		 83,364
(97.77 %)		 2,799,509
(29.62 %)		 275,242
(1.03 %)		 11,796,826
(28.19 %)		 51,634
(1.37 %)
137 common warthog (WHEZ1 2021)
GCF_016906955.1		 55,088
(2.64 %)		 18,264
(1.56 %)		 19,251
(1.34 %)		 54,816
(2.83 %)		 41.95
(99.61 %)		 523
(0.39 %)		 194
(100.00 %)		 3,898,243
(30.33 %)		 588,742
(1.17 %)		 12,955,929
(36.44 %)		 75,592
(1.86 %)
138 common wombat
GCF_900497805.2		 46,365
(1.78 %)		 19,437
(0.86 %)		 18,947
(0.96 %)		 n/a 38.86
(99.68 %)		 67,461
(0.33 %)		 14,183
(100.00 %)		 8,645,969
(41.99 %)		 1,203,246
(1.61 %)		 23,878,215
(39.11 %)		 18,752
(0.37 %)
139 creeping vole
GCF_018167655.1		 54,941
(2.31 %)		 23,033
(1.55 %)		 25,427
(1.53 %)		 n/a 44.23
(100.00 %)		 n/a 2,147
(100.00 %)		 4,549,519
(25.66 %)		 1,153,429
(13.60 %)		 13,568,297
(40.65 %)		 23,141
(0.54 %)
140 crested porcupine
GCA_004026905.1		 n/a 21,005
(1.32 %)		 35,975
(1.39 %)		 n/a 41.51
(99.89 %)		 4,351
(0.02 %)		 1,140,949
(99.98 %)		 4,303,147
(30.69 %)		 600,488
(1.19 %)		 14,049,490
(33.80 %)		 57,196
(1.33 %)
141 Cuvier's beaked whale
GCA_004364475.1		 n/a 23,700
(0.90 %)		 51,715
(0.86 %)		 n/a 42.01
(99.76 %)		 3,229
(0.01 %)		 3,761,505
(99.99 %)		 6,544,424
(43.61 %)		 1,417,186
(3.11 %)		 16,127,873
(42.25 %)		 68,668
(1.15 %)
142 Damara mole-rat DMR 1.0 (2014 BGI)
GCF_000743615.1		 52,373
(2.57 %)		 17,983
(1.45 %)		 17,063
(1.43 %)		 n/a 40.34
(97.96 %)		 87,815
(2.05 %)		 162,545
(97.95 %)		 4,053,433
(30.86 %)		 545,281
(1.74 %)		 13,406,483
(30.65 %)		 37,008
(0.74 %)
143 Damara mole-rat DMR 1.0 HiC (2020 DNA Zoo)
GCF_012274545.1		 58,091
(2.74 %)		 17,780
(1.44 %)		 16,515
(1.42 %)		 n/a 40.34
(97.94 %)		 88,899
(2.07 %)		 73,970
(100.00 %)		 4,035,140
(30.95 %)		 544,772
(1.73 %)		 13,390,872
(30.61 %)		 37,008
(0.74 %)
144 dassie-rat
GCA_004026965.1		 n/a 20,479
(1.16 %)		 42,937
(1.41 %)		 n/a 41.86
(99.89 %)		 9,645
(0.04 %)		 920,324
(99.96 %)		 4,563,054
(28.83 %)		 660,623
(1.92 %)		 12,899,807
(34.48 %)		 46,569
(1.25 %)
145 Daubenton's bat (alternate hap 2023)
GCA_963242275.1		 n/a 18,895
(1.78 %)		 24,235
(1.81 %)		 n/a 43.39
(100.00 %)		 n/a 4,930
(100.00 %)		 2,813,870
(23.75 %)		 718,406
(5.18 %)		 9,977,320
(37.24 %)		 62,910
(2.66 %)
146 Daubenton's bat (primary hap 2023 refseq)
GCF_963259705.1		 64,558
(3.32 %)		 19,141
(1.72 %)		 22,133
(1.66 %)		 n/a 43.18
(99.99 %)		 1,099
(0.01 %)		 121
(100.00 %)		 3,040,232
(24.03 %)		 796,911
(6.38 %)		 10,478,180
(38.84 %)		 64,920
(2.51 %)
147 Daurian ground squirrel
GCA_002406435.1		 n/a 20,990
(1.31 %)		 17,575
(1.17 %)		 n/a 39.77
(96.15 %)		 141,850
(3.84 %)		 502,654
(96.16 %)		 5,783,538
(34.36 %)		 924,038
(3.73 %)		 17,533,301
(30.85 %)		 27,955
(0.39 %)
148 David's myotis bat
GCF_000327345.1		 37,645
(2.70 %)		 18,744
(1.78 %)		 17,565
(1.62 %)		 n/a 42.69
(91.23 %)		 223,511
(8.80 %)		 325,280
(91.20 %)		 2,680,166
(23.79 %)		 532,273
(1.90 %)		 11,016,028
(29.55 %)		 59,615
(1.59 %)
149 degu (3935 2012 refseq)
GCF_000260255.1		 48,152
(2.13 %)		 22,242
(1.41 %)		 22,101
(1.46 %)		 n/a 41.38
(84.36 %)		 252,772
(15.68 %)		 259,904
(84.32 %)		 4,901,673
(27.74 %)		 898,945
(1.50 %)		 14,282,003
(29.30 %)		 40,135
(0.82 %)
150 desert hamster (2022)
GCF_943737965.1		 37,279
(2.11 %)		 19,744
(1.74 %)		 20,215
(1.50 %)		 n/a 41.31
(100.00 %)		 n/a 2,079
(100.00 %)		 4,038,079
(31.01 %)		 1,132,871
(2.71 %)		 11,946,112
(32.62 %)		 17,053
(0.51 %)
151 Desmarest's hutia
GCA_004027915.1		 n/a 23,535
(0.78 %)		 50,796
(0.95 %)		 n/a 42.03
(99.83 %)		 3,492
(0.01 %)		 2,355,850
(99.99 %)		 5,790,506
(26.72 %)		 1,062,134
(1.71 %)		 16,977,224
(35.29 %)		 54,479
(1.01 %)
152 dingo (2020 Alpine COOINDA U.NSW)
GCF_012295265.1		 102,060
(4.04 %)		 19,777
(1.69 %)		 20,341
(1.41 %)		 n/a 41.29
(99.69 %)		 325
(0.31 %)		 477
(100.00 %)		 4,950,808
(42.83 %)		 1,033,921
(2.36 %)		 13,745,703
(33.32 %)		 51,835
(2.25 %)
153 dingo (Sandy 2020 James Cook U)
GCF_003254725.2		 104,332
(4.50 %)		 19,710
(1.72 %)		 19,857
(1.42 %)		 n/a 41.24
(100.00 %)		 69
(0.00 %)		 159
(100.00 %)		 4,547,906
(33.32 %)		 993,474
(2.19 %)		 13,701,060
(33.18 %)		 51,216
(2.28 %)
154 dog (boxer Tasha 2011)
GCF_000002285.3		 82,549
(3.63 %)		 19,772
(1.66 %)		 19,565
(1.39 %)		 n/a 41.31
(99.25 %)		 23,876
(0.76 %)		 27,106
(99.24 %)		 4,918,098
(43.29 %)		 991,835
(2.81 %)		 13,644,959
(33.60 %)		 53,269
(2.07 %)
155 dog (boxer Tasha 2020)
GCF_000002285.5		 93,774
(3.84 %)		 19,392
(1.71 %)		 19,572
(1.42 %)		 52,141
(3.27 %)		 41.26
(100.00 %)		 1,028
(0.00 %)		 147
(100.00 %)		 23,927,903
(42.42 %)		 972,851
(2.05 %)		 13,611,845
(33.11 %)		 50,679
(2.26 %)
156 dog (German shepard Mischka 2020)
GCF_011100685.1		 96,734
(3.71 %)		 20,135
(1.64 %)		 20,871
(1.38 %)		 56,772
(3.19 %)		 41.50
(100.00 %)		 585
(0.00 %)		 2,782
(100.00 %)		 20,264,827
(43.87 %)		 1,152,879
(3.22 %)		 13,784,690
(34.30 %)		 53,518
(2.23 %)
157 dog (labrador SID07034 2020)
GCF_014441545.1		 99,420
(3.87 %)		 19,870
(1.70 %)		 20,252
(1.41 %)		 54,322
(3.23 %)		 41.19
(99.47 %)		 575
(0.53 %)		 376
(100.00 %)		 4,981,985
(42.28 %)		 1,019,772
(1.97 %)		 13,959,750
(32.77 %)		 52,469
(2.25 %)
158 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2017 WashU)
GCF_000181335.3		 72,089
(3.30 %)		 18,662
(1.64 %)		 20,897
(1.37 %)		 n/a 41.73
(98.20 %)		 436
(1.80 %)		 5,079
(98.20 %)		 5,086,462
(43.51 %)		 964,126
(2.68 %)		 13,947,871
(33.33 %)		 69,701
(2.41 %)
159 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021 WashU)
GCA_000181335.5		 n/a 18,378
(1.53 %)		 21,242
(1.40 %)		 n/a 41.73
(98.21 %)		 422
(1.79 %)		 5,010
(98.31 %)		 4,683,703
(33.33 %)		 964,129
(2.68 %)		 13,948,305
(33.33 %)		 69,725
(2.42 %)
160 domestic cat (Fca126 2021 Texas A&M U)
GCF_018350175.1		 99,222
(4.40 %)		 18,456
(1.66 %)		 19,833
(1.39 %)		 94,133
(5.63 %)		 41.81
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 102
(100.00 %)		 4,965,571
(43.65 %)		 932,424
(1.95 %)		 13,596,808
(33.85 %)		 67,329
(2.48 %)
161 domestic ferret (JIRA1106 JCVI 2020)
GCF_011764305.1		 68,855
(3.09 %)		 19,019
(1.55 %)		 21,812
(1.42 %)		 n/a 41.90
(100.00 %)		 n/a 1,224
(100.00 %)		 4,650,028
(39.49 %)		 745,115
(2.02 %)		 13,758,447
(36.14 %)		 58,684
(2.16 %)
162 domestic ferret (Sable 2011 Broad)
GCA_000239315.1		 n/a 18,778
(1.67 %)		 19,571
(1.47 %)		 n/a 41.48
(96.89 %)		 72,670
(3.12 %)		 76,914
(96.88 %)		 4,491,876
(40.13 %)		 618,556
(1.07 %)		 13,721,938
(31.04 %)		 54,600
(1.94 %)
163 domestic guinea pig (051 PalLab524CR 2023)
GCF_034190915.1		 79,333
(3.55 %)		 17,999
(1.09 %)		 21,509
(1.20 %)		 n/a 40.64
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 672
(100.00 %)		 5,037,431
(41.68 %)		 886,785
(13.97 %)		 14,620,284
(42.71 %)		 39,682
(0.89 %)
164 domestic guinea pig (2N 2008 refseq)
GCF_000151735.1		 44,762
(2.31 %)		 18,301
(1.33 %)		 20,111
(1.34 %)		 n/a 39.95
(97.81 %)		 58,460
(2.20 %)		 61,604
(97.80 %)		 4,257,852
(38.85 %)		 658,533
(1.25 %)		 14,547,726
(34.19 %)		 37,093
(0.85 %)
165 dugong (hap1 mDugDug1 2023)
GCA_030035585.1		 n/a 18,354
(1.22 %)		 20,434
(1.08 %)		 n/a 40.65
(100.00 %)		 96
(0.00 %)		 198
(100.00 %)		 4,458,084
(33.00 %)		 444,499
(1.79 %)		 15,031,940
(47.42 %)		 29,863
(0.83 %)
166 dugong (hap2 mDugDug1 2023)
GCA_030020955.1		 n/a 18,538
(1.23 %)		 20,775
(1.09 %)		 n/a 40.64
(100.00 %)		 89
(0.00 %)		 167
(100.00 %)		 4,455,227
(33.01 %)		 444,021
(1.73 %)		 14,946,847
(47.37 %)		 29,828
(0.79 %)
167 dwarf mongoose
GCA_004023845.1		 n/a 21,478
(1.57 %)		 32,174
(1.43 %)		 n/a 41.83
(99.94 %)		 10,815
(0.05 %)		 200,185
(99.95 %)		 4,574,991
(40.34 %)		 595,520
(1.11 %)		 13,720,585
(32.94 %)		 70,689
(2.42 %)
168 eastern cottontail (primary hap 2023)
GCA_949820135.1		 n/a 18,522
(1.26 %)		 22,314
(1.28 %)		 n/a 43.69
(100.00 %)		 316
(0.00 %)		 99
(100.00 %)		 3,699,683
(20.55 %)		 935,350
(11.22 %)		 13,112,318
(44.07 %)		 99,224
(2.27 %)
169 eastern European house mouse (PWK_PhJ v2 2022)
GCA_921998335.2		 n/a 21,903
(2.13 %)		 19,801
(1.40 %)		 108,675
(4.42 %)		 41.79
(99.89 %)		 207
(0.11 %)		 211
(100.00 %)		 4,630,645
(40.56 %)		 1,531,506
(3.70 %)		 13,011,312
(35.48 %)		 22,270
(0.54 %)
170 eastern mole
GCA_004024925.1		 n/a 19,631
(1.57 %)		 32,414
(1.63 %)		 n/a 42.02
(99.91 %)		 7,239
(0.03 %)		 647,535
(99.97 %)		 3,145,725
(29.42 %)		 554,620
(1.75 %)		 10,663,504
(32.88 %)		 55,063
(3.69 %)
171 eastern quoll
GCA_020854095.1		 n/a 15,715
(0.80 %)		 16,750
(0.93 %)		 n/a 36.19
(100.00 %)		 431
(0.00 %)		 76
(100.00 %)		 5,256,999
(24.81 %)		 1,280,160
(3.39 %)		 21,362,866
(41.74 %)		 24,508
(0.70 %)
172 Egyptian rousette (1219 2016 Boston U)
GCF_001466805.2		 54,791
(4.93 %)		 18,221
(2.05 %)		 24,192
(1.88 %)		 46,601
(2.22 %)		 40.02
(99.97 %)		 638
(0.03 %)		 2,490
(100.00 %)		 2,815,693
(32.23 %)		 440,119
(1.01 %)		 12,346,041
(26.86 %)		 56,244
(6.54 %)
173 Egyptian rousette (v1 2020 refseq)
GCF_014176215.1		 65,163
(4.76 %)		 17,642
(2.07 %)		 22,317
(1.84 %)		 n/a 40.05
(98.59 %)		 242
(1.41 %)		 29
(100.00 %)		 2,821,248
(33.05 %)		 434,414
(1.02 %)		 12,031,597
(26.52 %)		 53,573
(4.84 %)
174 Egyptian spiny mouse
GCA_004027535.1		 n/a 23,498
(1.69 %)		 36,970
(1.40 %)		 30,076
(1.58 %)		 42.71
(99.88 %)		 20,469
(0.09 %)		 391,811
(99.91 %)		 4,983,574
(35.17 %)		 1,342,514
(3.45 %)		 13,029,270
(32.79 %)		 19,944
(0.55 %)
175 elk (wapiti)
GCF_019320065.1		 66,846
(3.00 %)		 20,090
(1.67 %)		 21,999
(1.44 %)		 n/a 41.62
(99.93 %)		 6,643
(0.08 %)		 185
(100.00 %)		 4,884,711
(43.14 %)		 429,925
(1.65 %)		 13,135,255
(37.85 %)		 47,099
(1.31 %)
176 ermine (2020)
GCF_009829155.1		 74,332
(3.19 %)		 18,855
(1.65 %)		 20,667
(1.43 %)		 44,584
(2.07 %)		 41.56
(99.12 %)		 199
(0.88 %)		 94
(100.00 %)		 4,647,934
(41.44 %)		 714,174
(1.30 %)		 13,845,904
(33.42 %)		 56,065
(2.25 %)
177 ermine (alternate hap 2020)
GCA_009829165.1		 n/a 13,583
(1.65 %)		 15,403
(1.46 %)		 n/a 41.72
(100.00 %)		 n/a 3,327
(100.00 %)		 3,139,035
(40.57 %)		 480,111
(1.29 %)		 9,106,061
(31.93 %)		 39,139
(2.25 %)
178 Eurasian badger (2021)
GCA_922990625.1		 n/a 19,332
(1.42 %)		 22,424
(1.40 %)		 n/a 42.47
(100.00 %)		 27
(0.00 %)		 726
(100.00 %)		 4,362,536
(31.74 %)		 801,232
(4.02 %)		 13,893,672
(37.73 %)		 65,806
(4.13 %)
179 Eurasian badger (v3.2 2022)
GCA_922984935.2		 n/a 19,268
(1.40 %)		 22,121
(1.36 %)		 41,043
(1.93 %)		 42.48
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 538
(100.00 %)		 4,417,203
(31.72 %)		 821,664
(4.02 %)		 13,814,720
(38.08 %)		 66,524
(3.95 %)
180 Eurasian field mouse (2024)
GCA_964023405.1		 n/a 20,487
(1.88 %)		 19,707
(1.34 %)		 n/a 42.15
(100.00 %)		 182
(0.00 %)		 61
(100.00 %)		 5,115,510
(39.18 %)		 1,868,284
(4.29 %)		 13,503,826
(37.29 %)		 26,414
(0.61 %)
181 Eurasian red squirrel (alternate hap 2019)
GCA_902685485.1		 n/a 12,437
(1.51 %)		 12,702
(1.22 %)		 n/a 40.06
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 10,657
(100.00 %)		 2,303,176
(35.38 %)		 353,996
(1.49 %)		 7,218,556
(31.67 %)		 24,268
(1.07 %)
182 Eurasian red squirrel (v1.2 2020)
GCA_902686455.2		 n/a 21,309
(1.58 %)		 21,026
(1.36 %)		 33,465
(1.53 %)		 40.08
(94.33 %)		 1,177
(5.67 %)		 639
(100.00 %)		 4,677,412
(35.73 %)		 704,218
(1.42 %)		 14,992,063
(31.49 %)		 48,159
(1.04 %)
183 Eurasian river otter (2020)
GCF_902655055.1		 67,145
(2.95 %)		 18,842
(1.54 %)		 20,178
(1.40 %)		 n/a 41.59
(100.00 %)		 185
(0.00 %)		 44
(100.00 %)		 4,259,294
(33.39 %)		 713,721
(1.36 %)		 13,626,048
(34.37 %)		 57,073
(1.82 %)
184 Eurasian river otter (alternate hap 2019)
GCA_902653095.1		 n/a 9,910
(1.59 %)		 11,315
(1.31 %)		 n/a 41.85
(100.00 %)		 n/a 8,506
(100.00 %)		 2,052,338
(42.25 %)		 316,084
(1.64 %)		 6,222,460
(33.12 %)		 27,057
(1.96 %)
185 Eurasian water vole (alternate hap 2020)
GCA_903992525.1		 n/a 16,761
(1.66 %)		 19,715
(1.37 %)		 n/a 42.13
(100.00 %)		 105
(0.00 %)		 16,473
(100.00 %)		 3,118,266
(26.44 %)		 829,463
(2.82 %)		 9,700,482
(31.37 %)		 14,146
(0.57 %)
186 Eurasian water vole (v2 2021)
GCF_903992535.2		 45,544
(2.51 %)		 19,733
(1.78 %)		 19,053
(1.47 %)		 36,935
(2.27 %)		 42.15
(99.74 %)		 873
(0.26 %)		 215
(100.00 %)		 3,993,912
(25.74 %)		 1,088,163
(2.91 %)		 12,853,770
(32.42 %)		 19,000
(0.58 %)
187 European hare (LE1 primary hap 2023)
GCF_033115175.1		 46,528
(2.09 %)		 19,392
(1.25 %)		 23,070
(1.29 %)		 n/a 44.03
(100.00 %)		 418
(0.00 %)		 651
(100.00 %)		 4,011,592
(19.81 %)		 1,000,204
(8.44 %)		 13,414,251
(44.25 %)		 98,831
(2.33 %)
188 European harvest mouse (primary hap 2024)
GCA_963924665.1		 n/a 20,236
(1.71 %)		 19,368
(1.32 %)		 n/a 40.05
(99.99 %)		 2,020
(0.02 %)		 894
(100.00 %)		 4,892,811
(36.49 %)		 1,223,387
(18.26 %)		 11,907,631
(42.51 %)		 17,423
(0.62 %)
189 European mink (alternate hap 2023)
GCA_030435785.1		 n/a 15,419
(1.50 %)		 21,175
(1.51 %)		 n/a 42.09
(100.00 %)		 n/a 12,043
(100.00 %)		 2,952,218
(30.62 %)		 538,508
(2.18 %)		 9,303,303
(34.20 %)		 47,810
(2.50 %)
190 European mink (primary hap 2023 refseq)
GCF_030435805.1		 69,556
(3.13 %)		 18,706
(1.46 %)		 21,193
(1.37 %)		 n/a 41.85
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 25
(100.00 %)		 4,237,791
(30.90 %)		 792,897
(2.69 %)		 13,417,195
(36.59 %)		 67,132
(2.54 %)
191 European pine marten (primary hap 2023)
GCA_963455335.1		 n/a 18,336
(1.50 %)		 20,807
(1.41 %)		 n/a 42.38
(99.98 %)		 2,250
(0.02 %)		 477
(100.00 %)		 4,096,160
(31.55 %)		 707,337
(3.28 %)		 13,715,382
(34.73 %)		 61,481
(4.29 %)
192 European shrew (alternate hap 2023)
GCA_027595995.1		 n/a 17,506
(1.26 %)		 25,527
(1.52 %)		 n/a 43.20
(100.00 %)		 n/a 5,699
(100.00 %)		 2,400,784
(15.19 %)		 1,062,793
(3.20 %)		 13,284,496
(41.93 %)		 77,009
(2.86 %)
193 European shrew (GB8-d 2012)
GCF_000181275.1		 23,525
(1.54 %)		 17,290
(1.33 %)		 22,005
(1.50 %)		 n/a 42.90
(90.49 %)		 188,953
(9.54 %)		 201,798
(90.46 %)		 4,400,127
(33.22 %)		 946,629
(2.03 %)		 13,377,581
(35.30 %)		 77,851
(2.58 %)
194 European shrew (primary hap 2023)
GCF_027595985.1		 44,643
(2.60 %)		 17,479
(1.26 %)		 21,293
(1.37 %)		 n/a 43.24
(99.46 %)		 1,427
(0.54 %)		 65
(100.00 %)		 2,474,584
(15.18 %)		 1,107,884
(3.28 %)		 13,638,467
(41.72 %)		 79,785
(2.86 %)
195 European snow vole (alternate hap 2023)
GCA_950005115.1		 n/a 18,364
(1.79 %)		 20,379
(1.63 %)		 n/a 42.19
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 4,256
(100.00 %)		 3,049,618
(22.22 %)		 852,708
(4.50 %)		 10,501,392
(33.34 %)		 17,629
(0.60 %)
196 European snow vole (primary hap 2023 refseq)
GCF_950005125.1		 47,025
(2.69 %)		 19,592
(1.78 %)		 21,173
(1.56 %)		 n/a 41.98
(100.00 %)		 197
(0.00 %)		 160
(100.00 %)		 5,048,186
(44.12 %)		 998,537
(5.14 %)		 12,204,053
(34.97 %)		 20,725
(0.63 %)
197 European woodmouse (2022 refseq)
GCF_947179515.1		 54,114
(2.24 %)		 19,959
(1.65 %)		 19,953
(1.25 %)		 n/a 41.23
(99.99 %)		 1,129
(0.01 %)		 497
(100.00 %)		 4,863,650
(37.41 %)		 1,795,997
(8.95 %)		 13,681,732
(40.58 %)		 23,961
(0.53 %)
198 European woodmouse (alternate hap 2022)
GCA_947179525.1		 n/a 18,692
(1.72 %)		 22,021
(1.36 %)		 n/a 41.56
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 10,863
(100.00 %)		 4,055,957
(36.08 %)		 1,513,576
(9.53 %)		 11,306,811
(39.67 %)		 20,865
(0.55 %)
199 fallow deer (Ldn47 2023)
GCF_033118175.1		 57,013
(2.35 %)		 20,187
(1.33 %)		 23,290
(1.33 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 44
(0.00 %)		 284
(100.00 %)		 3,308,241
(20.72 %)		 513,748
(18.20 %)		 12,996,819
(48.19 %)		 214,480
(2.98 %)
200 fat dormouse (US078 2019)
GCA_004027185.1		 n/a 23,122
(1.24 %)		 48,677
(1.27 %)		 n/a 42.33
(99.92 %)		 10,685
(0.04 %)		 444,115
(99.96 %)		 6,783,404
(37.03 %)		 1,642,515
(3.72 %)		 12,706,289
(39.97 %)		 65,521
(1.47 %)
201 fat sand rat (mPsaObe1 2021)
GCF_907164565.1		 43,211
(2.50 %)		 18,543
(1.78 %)		 20,094
(1.42 %)		 n/a 41.95
(99.11 %)		 50,482
(0.90 %)		 11,389
(100.00 %)		 4,686,377
(43.10 %)		 920,563
(1.85 %)		 12,813,848
(35.08 %)		 22,480
(0.71 %)
202 fat sand rat (Psa_ob012049795 2017)
GCA_002215935.1		 n/a 21,644
(1.71 %)		 31,665
(1.41 %)		 n/a 41.99
(99.99 %)		 n/a 96,427
(100.00 %)		 4,646,110
(38.87 %)		 946,664
(2.24 %)		 13,134,526
(33.94 %)		 26,411
(0.73 %)
203 fishing cat (Anna 2022 U Missouri)
GCF_022837055.1		 68,015
(2.86 %)		 18,432
(1.63 %)		 19,912
(1.37 %)		 n/a 41.91
(100.00 %)		 63
(0.00 %)		 192
(100.00 %)		 4,777,906
(34.85 %)		 937,432
(2.30 %)		 13,438,032
(34.55 %)		 70,402
(2.61 %)
204 Florida manatee (CSIC 2023)
GCA_030013775.1		 n/a 19,432
(1.24 %)		 24,035
(1.14 %)		 n/a 40.66
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 15,641
(100.00 %)		 4,400,331
(33.07 %)		 439,615
(1.04 %)		 14,884,753
(46.98 %)		 32,563
(0.80 %)
205 Florida manatee (Lorelei 2012 refseq)
GCF_000243295.1		 39,645
(2.08 %)		 18,308
(1.37 %)		 20,588
(1.23 %)		 32,868
(1.38 %)		 40.73
(89.24 %)		 160,167
(10.78 %)		 166,490
(89.22 %)		 n/a 389,315
(0.74 %)		 14,633,038
(38.46 %)		 27,462
(0.64 %)
206 fossa
GCA_004023885.1		 n/a 21,156
(1.56 %)		 29,809
(1.38 %)		 n/a 41.51
(99.94 %)		 6,335
(0.03 %)		 470,371
(99.97 %)		 4,962,168
(42.36 %)		 814,639
(1.52 %)		 13,708,904
(34.14 %)		 78,033
(2.52 %)
207 Gambian giant pouched rat
GCA_004027575.1		 n/a 21,189
(1.59 %)		 32,806
(1.43 %)		 n/a 42.11
(99.88 %)		 7,473
(0.03 %)		 1,110,425
(99.97 %)		 4,137,605
(24.57 %)		 1,071,627
(2.76 %)		 12,905,250
(32.78 %)		 32,359
(0.80 %)
208 gayal (CVASU_BF_001 2021)
GCA_017311355.1		 n/a 24,549
(1.09 %)		 55,194
(1.15 %)		 n/a 42.05
(99.91 %)		 n/a 1,262,134
(100.00 %)		 3,691,398
(22.78 %)		 677,397
(2.00 %)		 14,380,670
(42.36 %)		 75,114
(1.33 %)
209 gayal (Nagaland 2019)
GCA_007844835.1		 n/a 22,715
(1.55 %)		 23,635
(1.33 %)		 n/a 41.67
(96.51 %)		 301,761
(3.52 %)		 306,776
(96.48 %)		 6,243,468
(45.69 %)		 518,664
(1.99 %)		 15,147,647
(37.64 %)		 45,586
(0.89 %)
210 Geoffroy's cat
GCF_018350155.1		 85,331
(3.53 %)		 18,469
(1.66 %)		 19,516
(1.36 %)		 93,795
(4.83 %)		 41.75
(100.00 %)		 45
(0.00 %)		 82
(100.00 %)		 5,021,854
(43.23 %)		 930,175
(1.84 %)		 13,757,469
(34.29 %)		 65,918
(2.36 %)
211 giant anteater
GCA_004026745.1		 n/a 24,383
(0.91 %)		 44,315
(0.93 %)		 n/a 39.53
(99.88 %)		 8,283
(0.02 %)		 1,629,691
(99.98 %)		 5,333,757
(35.57 %)		 575,140
(0.91 %)		 21,181,213
(39.97 %)		 57,558
(0.94 %)
212 giant otter
GCA_004024605.1		 n/a 21,199
(1.46 %)		 30,565
(1.34 %)		 n/a 41.71
(99.93 %)		 7,431
(0.03 %)		 652,159
(99.97 %)		 5,113,769
(41.55 %)		 788,677
(1.46 %)		 14,385,279
(35.77 %)		 82,376
(2.05 %)
213 giant panda (Jingjing v3 2020)
GCF_002007445.2		 65,468
(3.27 %)		 19,077
(1.67 %)		 20,176
(1.39 %)		 n/a 41.68
(98.09 %)		 189,277
(1.92 %)		 73,514
(100.00 %)		 4,012,144
(34.40 %)		 617,803
(1.99 %)		 14,216,587
(30.41 %)		 59,449
(1.50 %)
214 goat (v2 San Clemente 2016 USDA)
GCF_001704415.2		 47,159
(2.31 %)		 19,342
(1.38 %)		 22,346
(1.24 %)		 n/a 43.16
(100.00 %)		 790
(0.00 %)		 29,886
(100.00 %)		 3,502,527
(22.45 %)		 760,831
(7.07 %)		 13,024,178
(44.85 %)		 125,662
(4.00 %)
215 Gobi jerboa
GCA_004027895.1		 n/a 22,410
(0.91 %)		 45,268
(1.02 %)		 n/a 41.94
(99.88 %)		 10,987
(0.04 %)		 1,295,369
(99.96 %)		 8,828,417
(40.19 %)		 1,979,806
(6.43 %)		 14,759,732
(47.73 %)		 24,314
(0.52 %)
216 golden hamster (Baylor 2021)
GCF_017639785.1		 67,831
(3.37 %)		 19,354
(1.71 %)		 19,863
(1.47 %)		 69,903
(4.39 %)		 42.04
(96.99 %)		 711
(3.01 %)		 7,058
(96.99 %)		 3,981,818
(27.65 %)		 976,456
(3.46 %)		 12,580,903
(32.87 %)		 21,268
(0.61 %)
217 golden hamster (Broad 2013 refseq)
GCF_000349665.1		 42,636
(2.91 %)		 18,976
(1.82 %)		 19,149
(1.51 %)		 29,936
(1.96 %)		 42.01
(82.92 %)		 216,216
(17.12 %)		 237,700
(82.88 %)		 3,599,795
(26.09 %)		 790,256
(1.69 %)		 12,003,956
(24.29 %)		 18,591
(0.51 %)
218 golden spiny mouse (2020)
GCF_903995435.1		 36,997
(1.96 %)		 20,006
(1.91 %)		 19,132
(1.50 %)		 n/a 42.51
(99.65 %)		 880
(0.35 %)		 623
(100.00 %)		 4,785,907
(32.61 %)		 1,305,613
(3.34 %)		 12,958,061
(32.33 %)		 20,760
(0.59 %)
219 gracile shrew mole
GCA_004024945.1		 n/a 19,165
(1.25 %)		 43,816
(1.48 %)		 n/a 41.08
(99.89 %)		 8,248
(0.04 %)		 732,083
(99.96 %)		 2,957,465
(23.76 %)		 783,289
(2.60 %)		 11,503,344
(31.38 %)		 92,729
(3.60 %)
220 gray seal
GCF_012393455.1		 79,009
(3.73 %)		 19,882
(1.73 %)		 22,416
(1.46 %)		 n/a 41.44
(100.00 %)		 117
(0.00 %)		 6,880
(100.00 %)		 4,448,588
(43.28 %)		 557,710
(1.32 %)		 13,340,576
(33.41 %)		 55,637
(1.78 %)
221 gray short-tailed opossum (mMonDom1 alternate hap 2023)
GCA_027917375.1		 n/a 12,662
(0.70 %)		 15,124
(0.89 %)		 n/a 37.74
(100.00 %)		 24
(0.00 %)		 8,086
(100.00 %)		 4,098,004
(25.33 %)		 806,470
(2.98 %)		 16,244,072
(43.39 %)		 24,879
(0.67 %)
222 gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027887165.1		 73,383
(3.04 %)		 16,637
(0.72 %)		 16,036
(0.85 %)		 n/a 37.92
(99.11 %)		 2,255
(0.89 %)		 13
(100.00 %)		 5,562,359
(25.40 %)		 1,096,620
(2.60 %)		 22,322,748
(43.37 %)		 28,894
(0.57 %)
223 gray short-tailed opossum (MonDom5 2007)
GCF_000002295.2		 68,375
(2.34 %)		 16,663
(0.75 %)		 16,162
(0.84 %)		 n/a 37.82
(97.26 %)		 67,660
(2.75 %)		 72,674
(97.25 %)		 7,753,175
(55.85 %)		 1,051,473
(2.34 %)		 22,274,001
(42.23 %)		 30,883
(0.53 %)
224 gray squirrel (2020)
GCF_902686445.1		 58,884
(2.46 %)		 20,752
(1.49 %)		 21,107
(1.31 %)		 32,732
(1.45 %)		 40.06
(99.98 %)		 1,824
(0.02 %)		 752
(100.00 %)		 4,605,578
(34.50 %)		 728,192
(1.65 %)		 15,467,412
(33.91 %)		 51,878
(1.11 %)
225 gray squirrel (alternate hap 2019)
GCA_902685475.1		 n/a 17,156
(1.53 %)		 18,190
(1.33 %)		 n/a 40.25
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 9,510
(100.00 %)		 3,455,580
(34.94 %)		 530,053
(1.56 %)		 10,927,458
(32.64 %)		 38,976
(1.13 %)
226 gray wolf (2021)
GCA_905319855.2		 n/a 19,474
(1.55 %)		 20,394
(1.40 %)		 72,806
(4.12 %)		 41.49
(100.00 %)		 166
(0.00 %)		 82
(100.00 %)		 4,550,524
(31.76 %)		 1,063,944
(3.96 %)		 13,588,117
(34.74 %)		 51,996
(2.15 %)
227 gray wolf (alternate hap 2021)
GCA_905319845.1		 n/a 12,760
(1.57 %)		 14,423
(1.42 %)		 n/a 41.35
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 5,537
(100.00 %)		 2,725,227
(31.66 %)		 616,862
(3.40 %)		 8,041,744
(32.68 %)		 32,293
(2.35 %)
228 great fruit-eating bat (mArtLit1 hap1 2024)
GCA_038363095.1		 n/a 18,022
(1.56 %)		 20,018
(1.52 %)		 n/a 42.28
(100.00 %)		 81
(0.00 %)		 419
(100.00 %)		 2,827,417
(26.82 %)		 371,479
(4.97 %)		 11,603,093
(34.64 %)		 71,574
(2.28 %)
229 great roundleaf bat (v2 ML-2016 2016)
GCF_001890085.2		 50,895
(3.26 %)		 18,993
(2.01 %)		 19,633
(1.65 %)		 41,769
(2.41 %)		 41.11
(87.42 %)		 172,750
(12.60 %)		 7,387
(100.00 %)		 2,946,981
(30.72 %)		 495,272
(1.05 %)		 11,587,728
(25.43 %)		 32,949
(0.96 %)
230 greater bulldog bat
GCA_004026585.1		 n/a 20,774
(1.62 %)		 28,140
(1.63 %)		 n/a 40.92
(99.94 %)		 6,171
(0.03 %)		 304,393
(99.97 %)		 3,288,598
(29.60 %)		 478,424
(1.16 %)		 11,427,553
(35.29 %)		 44,124
(1.99 %)
231 Greater cane rat
GCA_004025085.1		 n/a 20,383
(0.98 %)		 47,456
(1.25 %)		 n/a 42.85
(99.83 %)		 8,825
(0.03 %)		 1,898,466
(99.97 %)		 5,569,185
(30.19 %)		 946,696
(3.12 %)		 13,144,109
(41.83 %)		 97,686
(2.61 %)
232 greater horseshoe bat (MPI-CBG alternate hap 2019)
GCA_004115295.1		 n/a 14,896
(1.85 %)		 18,939
(1.59 %)		 n/a 40.69
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 13,426
(100.00 %)		 2,426,330
(34.43 %)		 418,341
(1.36 %)		 8,763,234
(27.86 %)		 24,370
(1.08 %)
233 greater horseshoe bat (v2 MPI-CBG 2019)
GCF_004115265.2		 53,353
(3.13 %)		 18,641
(1.97 %)		 20,359
(1.68 %)		 n/a 40.54
(99.64 %)		 158
(0.36 %)		 134
(100.00 %)		 3,218,744
(34.52 %)		 564,789
(1.35 %)		 12,217,020
(29.39 %)		 32,445
(1.06 %)
234 greater mouse-eared bat (2020 Bat1K)
GCF_014108235.1		 70,930
(3.43 %)		 19,052
(1.84 %)		 21,498
(1.73 %)		 n/a 43.11
(98.55 %)		 538
(1.45 %)		 93
(100.00 %)		 3,088,083
(26.27 %)		 753,124
(2.84 %)		 10,383,466
(35.84 %)		 61,023
(2.69 %)
235 greater sac-winged bat (mSacBil1 primary hap 2024)
GCA_036850765.1		 n/a 18,322
(1.40 %)		 21,049
(1.35 %)		 n/a 41.71
(98.73 %)		 468
(1.27 %)		 359
(99.59 %)		 4,247,148
(29.53 %)		 1,031,385
(2.50 %)		 12,465,194
(43.30 %)		 101,620
(2.01 %)
236 greater spear-nosed bat (2021 Texas Tech U)
GCF_019186645.2		 50,563
(2.96 %)		 18,224
(1.70 %)		 20,689
(1.67 %)		 n/a 42.27
(100.00 %)		 55
(0.00 %)		 534
(100.00 %)		 2,961,591
(0.00 %)		 387,908
(0.97 %)		 12,179,612
(30.91 %)		 62,189
(5.35 %)
237 grey whale
GCA_004363415.1		 n/a 21,827
(1.52 %)		 32,191
(1.24 %)		 n/a 41.22
(99.88 %)		 10,622
(0.04 %)		 1,046,770
(99.96 %)		 4,841,166
(45.56 %)		 780,015
(1.83 %)		 13,559,563
(39.86 %)		 72,343
(1.59 %)
238 grey whale (mEscRob2 alternate hap 2023)
GCA_028021475.1		 n/a 19,129
(1.37 %)		 24,628
(1.24 %)		 n/a 41.83
(100.00 %)		 n/a 14,442
(100.00 %)		 3,892,130
(35.74 %)		 874,864
(15.70 %)		 11,484,916
(45.69 %)		 73,507
(1.72 %)
239 grey whale (mEscRob2 primary hap 2023)
GCA_028021215.1		 n/a 19,288
(1.38 %)		 21,791
(1.21 %)		 n/a 41.74
(100.00 %)		 279
(0.00 %)		 704
(100.00 %)		 4,116,900
(35.85 %)		 966,065
(16.74 %)		 12,154,173
(46.39 %)		 77,011
(1.59 %)
240 hairy big-eared bat (US037 2019 Broad)
GCA_004026765.1		 n/a 21,360
(1.44 %)		 37,376
(1.52 %)		 n/a 42.38
(99.94 %)		 3,218
(0.01 %)		 553,308
(99.99 %)		 3,519,246
(30.77 %)		 393,318
(0.85 %)		 12,525,258
(34.42 %)		 84,875
(2.37 %)
241 harbor porpoise (primary hap 2024)
GCA_963924675.1		 n/a 18,529
(1.58 %)		 20,583
(1.34 %)		 n/a 41.72
(99.99 %)		 966
(0.01 %)		 442
(100.00 %)		 3,760,716
(36.18 %)		 888,368
(7.18 %)		 12,379,240
(39.04 %)		 71,530
(2.69 %)
242 harbor seal
GCF_004348235.1		 50,670
(2.98 %)		 19,484
(1.76 %)		 20,771
(1.44 %)		 33,296
(1.58 %)		 41.38
(99.09 %)		 16,480
(0.91 %)		 21,161
(99.09 %)		 4,526,182
(43.28 %)		 576,921
(1.11 %)		 13,421,780
(33.06 %)		 54,592
(1.70 %)
243 Hawaiian monk seal (2021 Johns Hopkins U)
GCF_002201575.2		 37,605
(1.99 %)		 19,483
(1.73 %)		 19,767
(1.35 %)		 n/a 41.41
(98.23 %)		 25,763
(1.77 %)		 7,487
(100.00 %)		 4,575,217
(43.59 %)		 583,394
(1.11 %)		 13,374,131
(33.69 %)		 52,067
(1.50 %)
244 hazel dormouse
GCA_004027005.1		 n/a 21,556
(1.24 %)		 40,971
(1.33 %)		 n/a 41.60
(99.91 %)		 15,076
(0.06 %)		 481,881
(99.94 %)		 6,679,641
(33.98 %)		 1,653,419
(3.72 %)		 12,685,676
(43.98 %)		 71,478
(1.57 %)
245 hazel dormouse (alternate hap 2023)
GCA_963383665.1		 n/a 11,130
(1.23 %)		 22,071
(1.36 %)		 n/a 42.15
(99.99 %)		 n/a 31,856
(100.00 %)		 2,958,239
(41.25 %)		 788,242
(4.52 %)		 6,056,268
(41.88 %)		 36,143
(1.96 %)
246 hazel dormouse (primary hap 2023)
GCA_963383645.1		 n/a 18,620
(1.42 %)		 22,403
(1.38 %)		 n/a 41.73
(99.99 %)		 1,805
(0.01 %)		 214
(100.00 %)		 6,063,911
(41.66 %)		 1,593,657
(4.46 %)		 12,229,281
(43.98 %)		 71,058
(1.88 %)
247 hippopotamus (BS01 2019 Broad)
GCA_004027065.1		 n/a 24,267
(1.55 %)		 34,820
(1.30 %)		 n/a 41.43
(99.91 %)		 4,730
(0.02 %)		 972,599
(99.98 %)		 4,579,311
(41.26 %)		 606,731
(1.02 %)		 14,514,493
(36.58 %)		 54,753
(1.59 %)
248 hippopotamus (HIP001 2018)
GCA_002995585.1		 n/a 22,343
(1.70 %)		 31,687
(1.45 %)		 n/a 40.96
(94.63 %)		 153,125
(5.38 %)		 281,897
(94.62 %)		 3,952,905
(38.55 %)		 476,243
(1.97 %)		 14,216,817
(27.43 %)		 48,380
(1.43 %)
249 hippopotamus (mHipAmp2 hap1 2023)
GCA_030028035.1		 n/a 20,391
(1.63 %)		 20,668
(1.37 %)		 n/a 41.62
(100.00 %)		 83
(0.00 %)		 545
(100.00 %)		 3,778,764
(35.17 %)		 563,345
(3.63 %)		 13,524,869
(35.56 %)		 48,164
(1.90 %)
250 hippopotamus (v2 hap2 2023 refseq)
GCF_030028045.1		 64,153
(2.73 %)		 20,331
(1.62 %)		 20,633
(1.37 %)		 n/a 41.60
(100.00 %)		 226
(0.00 %)		 357
(100.00 %)		 3,783,440
(35.17 %)		 567,797
(3.38 %)		 13,462,531
(35.48 %)		 48,365
(1.91 %)
251 hirola (BS46 2019 Broad)
GCA_004027495.1		 n/a 22,264
(1.40 %)		 36,984
(1.26 %)		 n/a 42.31
(99.93 %)		 9,287
(0.03 %)		 545,176
(99.97 %)		 5,809,405
(48.62 %)		 465,001
(1.08 %)		 13,326,245
(42.35 %)		 48,312
(1.15 %)
252 Hispaniolan solenodon
GCA_004363575.1		 n/a 18,805
(1.55 %)		 27,454
(1.64 %)		 n/a 39.98
(99.96 %)		 5,186
(0.02 %)		 181,804
(99.98 %)		 2,669,787
(26.78 %)		 431,610
(1.04 %)		 13,429,711
(27.35 %)		 53,444
(2.30 %)
253 hispid cotton rat
GCA_004025045.1		 n/a 25,324
(1.49 %)		 31,681
(1.31 %)		 39,953
(1.43 %)		 39.77
(99.89 %)		 13,744
(0.05 %)		 897,290
(99.95 %)		 4,384,099
(28.17 %)		 1,132,313
(3.34 %)		 14,729,737
(38.08 %)		 17,558
(0.40 %)
254 Hoffmann's two-fingered sloth
GCA_000164785.2		 n/a 24,546
(1.30 %)		 30,273
(1.15 %)		 n/a 39.80
(98.09 %)		 101,085
(1.91 %)		 370,035
(98.09 %)		 5,145,551
(52.20 %)		 614,819
(1.62 %)		 17,932,269
(39.26 %)		 55,943
(1.04 %)
255 hog-nosed bat
GCA_004027555.1		 n/a 20,591
(1.30 %)		 39,589
(1.39 %)		 n/a 40.99
(99.88 %)		 6,224
(0.03 %)		 1,230,480
(99.97 %)		 4,081,924
(31.12 %)		 1,008,077
(2.20 %)		 12,068,828
(39.98 %)		 55,567
(2.02 %)
256 Honduran yellow-shouldered bat (v2.1 Veracruz 20B 2020)
GCF_014824575.3		 49,071
(2.78 %)		 17,588
(1.64 %)		 19,357
(1.60 %)		 n/a 42.32
(99.79 %)		 38,648
(0.21 %)		 25,848
(100.00 %)		 2,708,400
(27.89 %)		 366,870
(1.48 %)		 11,795,308
(31.27 %)		 59,066
(1.72 %)
257 horse (maternal 2024)
GCA_036418255.1		 n/a 16,789
(1.65 %)		 18,017
(1.36 %)		 n/a 42.07
(100.00 %)		 210
(0.00 %)		 821
(100.00 %)		 3,146,381
(34.68 %)		 430,664
(5.91 %)		 13,246,059
(32.62 %)		 37,293
(2.80 %)
258 horse (paternal 2024)
GCA_036426135.1		 n/a 19,073
(1.67 %)		 20,636
(1.38 %)		 n/a 42.08
(100.00 %)		 114
(0.00 %)		 602
(100.00 %)		 3,521,953
(35.39 %)		 461,571
(5.26 %)		 14,833,688
(32.77 %)		 43,527
(2.54 %)
259 horse (Twilight 2018)
GCF_002863925.1		 76,567
(4.06 %)		 18,997
(1.73 %)		 20,914
(1.42 %)		 113,346
(6.08 %)		 41.50
(99.62 %)		 6,294
(0.38 %)		 4,701
(100.00 %)		 4,080,319
(44.85 %)		 395,037
(1.44 %)		 15,169,517
(29.93 %)		 44,825
(1.77 %)
260 house mouse (129S1_SvImJv1 2016)
GCA_001624185.1		 n/a 21,289
(2.22 %)		 18,626
(1.42 %)		 102,148
(4.16 %)		 41.77
(85.00 %)		 366,945
(15.05 %)		 62,882
(95.15 %)		 5,075,137
(40.38 %)		 1,400,072
(2.80 %)		 13,497,076
(26.20 %)		 16,957
(0.40 %)
261 house mouse (129S1_SvImJ_v3 2022)
GCA_921998555.2		 n/a 21,780
(2.13 %)		 19,436
(1.37 %)		 110,376
(4.47 %)		 41.79
(99.60 %)		 1,557
(0.40 %)		 188
(100.00 %)		 4,653,663
(40.74 %)		 1,550,342
(3.54 %)		 12,930,784
(35.48 %)		 23,211
(0.57 %)
262 house mouse (AKR_J v3 2022)
GCA_922000895.2		 n/a 21,721
(2.13 %)		 19,324
(1.37 %)		 110,654
(4.48 %)		 41.80
(99.85 %)		 2,714
(0.15 %)		 201
(100.00 %)		 4,645,513
(40.70 %)		 1,547,237
(3.56 %)		 13,016,932
(35.69 %)		 23,309
(0.57 %)
263 house mouse (alternate hap 2023)
GCA_949316305.1		 n/a 661
(0.88 %)		 720
(0.54 %)		 n/a 38.59
(100.00 %)		 n/a 1,806
(100.00 %)		 97,279
(72.21 %)		 40,071
(55.89 %)		 208,928
(64.94 %)		 506
(0.31 %)
264 house mouse (A_J v3 2022)
GCA_921998355.2		 n/a 21,869
(2.13 %)		 19,400
(1.37 %)		 110,389
(4.48 %)		 41.80
(99.39 %)		 608
(0.61 %)		 163
(100.00 %)		 4,668,553
(40.80 %)		 1,556,835
(3.58 %)		 12,995,938
(35.53 %)		 23,203
(0.56 %)
265 house mouse (BALB_cJ v3 2022)
GCA_921997145.2		 n/a 21,891
(2.13 %)		 19,499
(1.37 %)		 110,461
(4.47 %)		 41.79
(99.80 %)		 274
(0.20 %)		 217
(100.00 %)		 4,673,990
(40.79 %)		 1,560,327
(3.63 %)		 13,018,071
(35.70 %)		 23,196
(0.56 %)
266 house mouse (C3H_HeJ v3 2022)
GCA_921997125.2		 n/a 21,793
(2.13 %)		 19,516
(1.38 %)		 110,049
(4.46 %)		 41.79
(99.05 %)		 844
(0.95 %)		 174
(100.00 %)		 4,657,005
(40.76 %)		 1,551,107
(3.53 %)		 12,949,100
(35.32 %)		 23,262
(0.56 %)
267 house mouse (CBA_J v3 2022)
GCA_921998905.2		 n/a 21,829
(2.13 %)		 19,841
(1.39 %)		 110,858
(4.48 %)		 41.79
(99.52 %)		 658
(0.48 %)		 145
(100.00 %)		 4,658,032
(40.77 %)		 1,552,298
(3.59 %)		 12,948,038
(35.52 %)		 23,232
(0.56 %)
268 house mouse (DBA_2J v3 2022)
GCA_921998315.2		 n/a 22,302
(2.08 %)		 19,749
(1.35 %)		 113,269
(4.42 %)		 41.72
(100.00 %)		 153
(0.00 %)		 361
(100.00 %)		 4,785,676
(41.69 %)		 1,597,598
(4.56 %)		 13,190,158
(36.58 %)		 24,140
(0.59 %)
269 house mouse (FVB_NJ v3 2022)
GCA_921998635.2		 n/a 21,633
(2.15 %)		 19,565
(1.40 %)		 110,246
(4.50 %)		 41.82
(98.35 %)		 6,244
(1.65 %)		 384
(100.00 %)		 4,621,601
(40.42 %)		 1,537,622
(3.48 %)		 12,818,729
(34.77 %)		 22,696
(0.55 %)
270 house mouse (LP_J v3 2022)
GCA_947599735.1		 n/a 22,452
(1.91 %)		 19,841
(1.23 %)		 110,073
(3.98 %)		 41.29
(99.99 %)		 386
(0.01 %)		 515
(100.00 %)		 4,839,574
(46.33 %)		 1,645,163
(11.88 %)		 12,936,515
(41.49 %)		 24,374
(0.54 %)
271 house mouse (NOD_ShiLtJ v3 2022)
GCA_921998325.2		 n/a 21,797
(2.13 %)		 19,521
(1.38 %)		 109,890
(4.48 %)		 41.80
(99.50 %)		 1,462
(0.50 %)		 170
(100.00 %)		 4,650,016
(40.74 %)		 1,547,220
(3.54 %)		 12,918,125
(35.45 %)		 23,253
(0.56 %)
272 house mouse (NZO_HlLtJ v3 2022)
GCA_947593165.1		 n/a 22,481
(1.93 %)		 19,932
(1.26 %)		 109,670
(4.03 %)		 41.34
(100.00 %)		 234
(0.00 %)		 441
(100.00 %)		 4,822,230
(45.92 %)		 1,637,027
(11.19 %)		 13,082,730
(41.04 %)		 24,187
(0.54 %)
273 house mouse (primary hap 2023)
GCA_949316315.1		 n/a 22,351
(1.96 %)		 19,629
(1.26 %)		 n/a 41.38
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 179
(100.00 %)		 4,774,018
(45.31 %)		 1,620,102
(10.50 %)		 13,181,250
(40.47 %)		 23,955
(0.54 %)
274 house mouse C57BL/6J 2020 GRC
GCF_000001635.27		 130,343
(4.85 %)		 22,409
(2.02 %)		 19,480
(1.31 %)		 140,725
(4.83 %)		 41.67
(97.30 %)		 334
(2.70 %)		 22,273
(97.30 %)		 5,361,085
(45.51 %)		 1,641,063
(3.41 %)		 12,722,791
(36.04 %)		 23,794
(0.53 %)
275 house mouse C57BL_6NJ
GCA_001632555.1		 n/a 21,177
(2.23 %)		 18,495
(1.42 %)		 103,002
(4.20 %)		 41.76
(82.53 %)		 410,660
(17.53 %)		 49,821
(96.37 %)		 5,081,049
(40.22 %)		 1,392,942
(2.58 %)		 13,476,268
(25.21 %)		 16,877
(0.39 %)
276 house mouse CAST_EiJ
GCA_001624445.1		 n/a 21,103
(2.24 %)		 18,682
(1.45 %)		 102,099
(4.16 %)		 41.83
(86.23 %)		 424,005
(13.83 %)		 52,352
(97.85 %)		 4,990,851
(39.88 %)		 1,356,202
(2.67 %)		 13,469,640
(26.15 %)		 16,724
(0.41 %)
277 hybrid cattle (Angus x Brahman F1 Angus haplotype 2018)
GCA_003369685.2		 n/a 19,096
(1.59 %)		 20,674
(1.34 %)		 n/a 41.99
(99.75 %)		 277
(0.25 %)		 1,435
(100.00 %)		 5,290,422
(47.51 %)		 478,946
(1.94 %)		 12,568,313
(41.15 %)		 45,850
(1.37 %)
278 hybrid cattle (Angus x Brahman F1 Brahman haplotype 2018)
GCF_003369695.1		 63,234
(2.88 %)		 19,601
(1.57 %)		 21,699
(1.34 %)		 n/a 41.83
(99.94 %)		 302
(0.06 %)		 1,250
(100.00 %)		 5,524,454
(47.57 %)		 459,928
(1.40 %)		 13,208,799
(41.21 %)		 41,359
(1.10 %)
279 Iberian mole (v2.1 TD23 2020)
GCF_014898055.3		 56,973
(3.41 %)		 18,431
(1.69 %)		 20,317
(1.59 %)		 n/a 41.89
(99.89 %)		 3,575
(0.11 %)		 3,202
(100.00 %)		 2,635,974
(23.38 %)		 496,514
(1.29 %)		 10,969,546
(32.61 %)		 47,466
(2.89 %)
280 Indian false vampire
GCA_004026885.1		 n/a 20,067
(1.37 %)		 36,544
(1.53 %)		 32,548
(1.37 %)		 40.84
(99.83 %)		 6,266
(0.02 %)		 1,909,067
(99.98 %)		 4,096,409
(31.50 %)		 699,311
(1.81 %)		 12,307,198
(39.96 %)		 92,830
(3.12 %)
281 Indian flying fox
GCF_902729225.1		 64,763
(3.85 %)		 18,222
(2.01 %)		 23,187
(1.82 %)		 45,389
(2.18 %)		 39.83
(99.10 %)		 17,500
(0.90 %)		 16,113
(100.00 %)		 2,972,300
(34.11 %)		 487,157
(1.49 %)		 12,486,528
(27.37 %)		 57,869
(3.73 %)
282 Indochinese shrew (US011 2019 Broad)
GCA_004027635.1		 n/a 18,870
(0.51 %)		 55,636
(0.81 %)		 n/a 39.81
(99.83 %)		 5,267
(0.02 %)		 2,420,679
(99.98 %)		 4,130,068
(16.60 %)		 1,663,335
(3.30 %)		 18,728,711
(46.19 %)		 31,453
(0.55 %)
283 Indus River dolphin
GCA_004363435.1		 n/a 24,321
(1.30 %)		 47,065
(1.14 %)		 n/a 41.72
(99.88 %)		 11,702
(0.04 %)		 1,110,492
(99.96 %)		 5,093,308
(45.60 %)		 845,860
(1.72 %)		 13,162,111
(41.37 %)		 68,257
(1.40 %)
284 intermediate roundleaf bat (primary hap 2023)
GCA_031876335.1		 n/a 19,064
(1.67 %)		 20,800
(1.49 %)		 n/a 41.55
(100.00 %)		 119
(0.00 %)		 69
(100.00 %)		 3,393,548
(30.92 %)		 723,545
(6.58 %)		 12,073,117
(35.40 %)		 43,736
(1.20 %)
285 jaguar (BS21 2019)
GCA_004023805.1		 n/a 21,431
(1.51 %)		 32,835
(1.35 %)		 n/a 41.70
(99.89 %)		 21,329
(0.09 %)		 460,121
(99.91 %)		 5,420,861
(43.75 %)		 1,049,353
(1.93 %)		 13,848,545
(34.90 %)		 71,066
(2.37 %)
286 jaguar (Sample0147 2023)
GCF_028533385.1		 71,565
(4.12 %)		 19,122
(1.67 %)		 21,950
(1.36 %)		 n/a 41.58
(99.31 %)		 56,371
(0.70 %)		 36,243
(100.00 %)		 4,552,854
(33.37 %)		 897,371
(1.63 %)		 13,732,912
(32.89 %)		 63,777
(2.41 %)
287 jaguarundi
GCF_014898765.1		 72,564
(3.15 %)		 18,602
(1.64 %)		 20,510
(1.39 %)		 n/a 41.75
(97.85 %)		 42,499
(2.16 %)		 10,948
(100.00 %)		 5,035,745
(43.29 %)		 907,329
(1.61 %)		 13,590,905
(33.57 %)		 69,090
(2.29 %)
288 Jamaican fruit-eating bat (1a 2020 Wuhan U)
GCF_014825515.1		 48,705
(2.72 %)		 19,921
(1.66 %)		 23,614
(1.68 %)		 39,384
(2.12 %)		 41.95
(98.87 %)		 110,840
(1.13 %)		 56,740
(100.00 %)		 2,972,388
(28.79 %)		 405,474
(2.15 %)		 12,458,880
(30.65 %)		 61,973
(1.87 %)
289 Jamaican fruit-eating bat (2021)
GCF_021234435.1		 55,114
(3.18 %)		 17,875
(1.68 %)		 19,958
(1.66 %)		 n/a 42.00
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 868
(100.00 %)		 2,697,287
(28.17 %)		 318,700
(0.84 %)		 11,750,329
(31.61 %)		 61,951
(1.93 %)
290 Japanese wild mouse (2022)
GCA_921999095.2		 n/a 23,292
(2.05 %)		 20,114
(1.31 %)		 n/a 41.71
(100.00 %)		 397
(0.00 %)		 1,449
(100.00 %)		 4,952,306
(42.53 %)		 1,635,456
(4.60 %)		 12,838,321
(38.56 %)		 24,168
(0.56 %)
291 Java mouse-deer (US108 2019 Broad)
GCA_004024965.1		 n/a 23,081
(1.38 %)		 38,181
(1.41 %)		 n/a 42.73
(99.91 %)		 2,829
(0.01 %)		 1,159,819
(99.99 %)		 4,791,310
(34.97 %)		 448,498
(1.92 %)		 13,175,375
(39.89 %)		 68,778
(2.92 %)
292 killer whale (2022)
GCF_937001465.1		 78,470
(3.76 %)		 18,710
(1.51 %)		 21,101
(1.30 %)		 34,448
(1.49 %)		 41.91
(100.00 %)		 123
(0.00 %)		 448
(100.00 %)		 3,955,401
(36.81 %)		 844,672
(9.94 %)		 12,233,568
(41.63 %)		 77,307
(3.08 %)
293 killer whale (alternate hap 2022)
GCA_937001455.1		 n/a 14,982
(1.50 %)		 19,185
(1.30 %)		 n/a 42.13
(100.00 %)		 n/a 12,410
(100.00 %)		 2,752,892
(35.61 %)		 589,217
(10.15 %)		 8,371,032
(41.11 %)		 57,347
(3.41 %)
294 killer whale (Morgan 2013)
GCF_000331955.2		 70,972
(3.55 %)		 18,736
(1.86 %)		 20,365
(1.48 %)		 n/a 41.35
(94.82 %)		 78,441
(5.20 %)		 80,100
(94.80 %)		 3,978,339
(43.98 %)		 555,737
(1.13 %)		 12,773,973
(31.51 %)		 61,145
(1.59 %)
295 koala (Bilbo 61053 2022)
GCA_003287225.2		 n/a 17,087
(0.81 %)		 14,711
(0.86 %)		 n/a 39.05
(100.00 %)		 669
(0.00 %)		 1,246
(100.00 %)		 6,280,029
(29.77 %)		 1,123,294
(2.02 %)		 21,796,316
(39.24 %)		 15,957
(0.35 %)
296 Kuhl's pipistrelle (2020)
GCF_014108245.1		 63,293
(2.96 %)		 17,918
(1.89 %)		 20,819
(1.86 %)		 n/a 42.57
(99.31 %)		 394
(0.69 %)		 202
(100.00 %)		 2,897,422
(23.58 %)		 797,420
(2.76 %)		 10,057,100
(34.56 %)		 55,965
(2.99 %)
297 large flying fox
GCF_000151845.1		 52,243
(3.10 %)		 18,454
(1.91 %)		 23,631
(1.73 %)		 n/a 39.82
(91.80 %)		 189,340
(8.24 %)		 225,433
(91.76 %)		 3,117,045
(36.49 %)		 504,277
(3.03 %)		 13,025,556
(25.00 %)		 78,404
(3.24 %)
298 large Japanese field mouse (IB14-021 2017)
GCA_002335545.1		 n/a 22,630
(1.74 %)		 33,810
(1.26 %)		 n/a 42.04
(57.78 %)		 4,289,924
(42.35 %)		 4,626,044
(57.65 %)		 3,638,537
(31.76 %)		 1,048,253
(1.87 %)		 12,039,926
(16.61 %)		 19,817
(0.34 %)
299 large tree shrew (BS70 2022)
GCA_026018925.1		 n/a 21,678
(1.34 %)		 22,317
(1.25 %)		 n/a 42.17
(100.00 %)		 1,188
(0.00 %)		 1,198
(100.00 %)		 5,530,547
(22.20 %)		 1,357,640
(10.13 %)		 14,334,312
(46.09 %)		 123,453
(2.17 %)
300 leopard (Hobbes primary hap 2022)
GCF_024362965.1		 70,488
(3.29 %)		 18,472
(1.56 %)		 20,388
(1.41 %)		 n/a 41.75
(99.99 %)		 335
(0.01 %)		 382
(100.00 %)		 4,634,038
(33.80 %)		 932,991
(2.25 %)		 13,686,652
(34.03 %)		 65,793
(2.64 %)
301 leopard (Maewha 2016 refseq)
GCF_001857705.1		 73,266
(3.20 %)		 18,881
(1.63 %)		 21,010
(1.44 %)		 n/a 41.71
(96.17 %)		 214,953
(3.85 %)		 265,330
(96.15 %)		 5,247,029
(42.87 %)		 1,059,446
(5.13 %)		 14,265,573
(32.20 %)		 77,001
(2.45 %)
302 leopard cat
GCF_016509475.1		 59,965
(3.05 %)		 18,472
(1.65 %)		 19,934
(1.38 %)		 n/a 41.80
(100.00 %)		 56
(0.00 %)		 123
(100.00 %)		 4,978,115
(43.28 %)		 901,754
(1.84 %)		 13,596,535
(34.23 %)		 67,390
(2.50 %)
303 lesser Egyptian jerboa (2021)
GCF_020740685.1		 51,730
(1.99 %)		 20,129
(1.24 %)		 22,089
(1.24 %)		 40,414
(1.76 %)		 42.00
(99.52 %)		 561
(0.48 %)		 160
(100.00 %)		 7,346,291
(41.25 %)		 1,187,587
(2.92 %)		 14,222,177
(44.13 %)		 34,688
(0.86 %)
304 lesser Egyptian jerboa (alternate hap 2021)
GCA_020740715.1		 n/a 17,777
(1.27 %)		 19,232
(1.28 %)		 n/a 42.13
(92.75 %)		 2,875
(7.25 %)		 508
(100.00 %)		 6,476,967
(33.93 %)		 999,133
(2.78 %)		 11,809,834
(40.52 %)		 29,872
(0.82 %)
305 lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 refseq)
GCF_000280705.1		 25,991
(1.44 %)		 19,408
(1.38 %)		 20,312
(1.35 %)		 n/a 41.87
(87.17 %)		 326,464
(12.87 %)		 337,360
(87.13 %)		 6,125,934
(38.31 %)		 832,825
(1.53 %)		 13,661,612
(33.98 %)		 26,669
(0.59 %)
306 lesser panda
GCA_002007465.1		 n/a 19,120
(1.69 %)		 20,591
(1.50 %)		 n/a 41.60
(98.56 %)		 137,333
(1.45 %)		 148,922
(98.55 %)		 4,513,888
(40.87 %)		 692,778
(1.62 %)		 13,691,859
(31.36 %)		 64,369
(2.52 %)
307 lesser sac-winged bat (mSacLep1 primary hap 2024)
GCA_036850995.1		 n/a 18,322
(1.42 %)		 21,350
(1.39 %)		 n/a 41.84
(99.24 %)		 573
(0.76 %)		 345
(99.51 %)		 4,224,340
(28.69 %)		 1,030,574
(2.60 %)		 12,591,928
(42.30 %)		 98,189
(2.06 %)
308 lion
GCF_018350215.1		 67,745
(2.86 %)		 17,956
(1.69 %)		 19,033
(1.40 %)		 61,242
(3.04 %)		 41.71
(100.00 %)		 55
(0.00 %)		 99
(100.00 %)		 4,666,951
(42.23 %)		 889,987
(1.87 %)		 13,151,686
(33.40 %)		 62,675
(2.56 %)
309 little brown bat
GCF_000147115.1		 50,660
(2.76 %)		 19,314
(1.86 %)		 22,683
(1.70 %)		 n/a 42.50
(96.66 %)		 61,131
(3.35 %)		 72,785
(96.65 %)		 3,682,263
(37.05 %)		 634,854
(2.15 %)		 10,841,759
(33.45 %)		 57,630
(1.79 %)
310 little pocket mouse (longimembris alternate hap 2022)
GCA_024363435.1		 n/a 19,150
(1.52 %)		 23,435
(1.64 %)		 n/a 42.08
(100.00 %)		 229
(0.00 %)		 718
(100.00 %)		 n/a 1,051,300
(12.43 %)		 9,858,628
(43.20 %)		 48,101
(2.62 %)
311 little pocket mouse (longimembris primary hap 2022)
GCA_024363575.1		 n/a 19,760
(1.50 %)		 24,317
(1.63 %)		 n/a 42.09
(100.00 %)		 215
(0.00 %)		 1,135
(100.00 %)		 3,913,744
(28.43 %)		 1,095,577
(12.70 %)		 10,273,833
(43.74 %)		 49,636
(2.61 %)
312 little tube-nosed bat
GCA_004026665.1		 n/a 22,009
(1.26 %)		 45,725
(1.35 %)		 n/a 43.80
(99.90 %)		 6,795
(0.03 %)		 886,972
(99.97 %)		 3,372,804
(23.57 %)		 1,014,476
(3.00 %)		 11,948,592
(41.18 %)		 71,530
(2.05 %)
313 long-finned pilot whale (primary hap 2023)
GCF_963455315.1		 61,797
(2.84 %)		 18,712
(1.51 %)		 20,920
(1.39 %)		 n/a 42.38
(99.99 %)		 1,084
(0.01 %)		 993
(100.00 %)		 4,125,420
(35.62 %)		 1,577,899
(12.03 %)		 12,347,226
(42.01 %)		 71,821
(5.51 %)
314 long-finned pilot whale (X-22926-18 2019)
GCF_006547405.1		 66,104
(3.28 %)		 18,772
(1.80 %)		 21,031
(1.46 %)		 33,672
(1.78 %)		 41.29
(99.58 %)		 14,859
(0.42 %)		 20,999
(99.58 %)		 3,962,125
(45.58 %)		 557,247
(1.11 %)		 12,616,535
(34.70 %)		 62,905
(1.69 %)
315 long-tailed chinchilla
GCF_000276665.1		 54,841
(2.98 %)		 18,096
(1.59 %)		 19,514
(1.52 %)		 n/a 41.06
(95.56 %)		 78,817
(4.46 %)		 81,656
(95.54 %)		 4,018,866
(30.94 %)		 607,082
(1.15 %)		 13,528,234
(28.15 %)		 46,931
(1.25 %)
316 long-tongued fruit bat (US102 2019 Broad)
GCA_004027375.1		 n/a 19,208
(1.99 %)		 31,180
(1.92 %)		 n/a 39.56
(99.97 %)		 2,056
(0.01 %)		 174,041
(99.99 %)		 2,893,453
(32.61 %)		 597,516
(1.76 %)		 12,093,608
(28.14 %)		 63,015
(4.70 %)
317 Lowland paca
GCA_004365215.1		 n/a 21,953
(0.62 %)		 56,356
(0.80 %)		 n/a 40.83
(99.78 %)		 3,060
(0.01 %)		 3,771,510
(99.99 %)		 5,892,507
(29.20 %)		 802,811
(1.38 %)		 18,630,883
(38.61 %)		 61,715
(0.94 %)
318 Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 refseq)
GCF_001685135.1		 48,591
(2.76 %)		 19,458
(1.57 %)		 24,783
(1.38 %)		 41,272
(1.95 %)		 40.78
(92.27 %)		 984,658
(7.81 %)		 80,670
(100.00 %)		 3,064,599
(35.21 %)		 866,309
(3.08 %)		 13,310,859
(28.76 %)		 35,558
(0.84 %)
319 Malayan pangolin YNU ManJav 2.0
GCF_014570535.1		 68,043
(3.50 %)		 18,167
(1.72 %)		 20,453
(1.54 %)		 n/a 40.83
(91.78 %)		 57,746
(8.23 %)		 17,969
(100.00 %)		 2,864,567
(34.23 %)		 277,996
(1.69 %)		 12,659,207
(25.72 %)		 33,486
(1.00 %)
320 Masai giraffe (MA1 2016 Penn St)
GCA_001651235.1		 n/a 20,950
(1.52 %)		 28,854
(1.33 %)		 n/a 41.39
(96.50 %)		 257,672
(3.48 %)		 770,838
(96.52 %)		 5,502,479
(43.94 %)		 531,418
(2.64 %)		 13,936,018
(36.18 %)		 40,504
(1.02 %)
321 meadow jumping mouse
GCA_004024765.1		 n/a 22,236
(1.08 %)		 44,719
(1.21 %)		 n/a 42.31
(99.88 %)		 7,610
(0.03 %)		 1,165,710
(99.97 %)		 6,135,446
(33.31 %)		 1,525,146
(3.34 %)		 13,854,475
(39.91 %)		 26,633
(0.68 %)
322 meadow vole (hap1 2024)
GCA_037038515.1		 n/a 19,134
(1.78 %)		 20,672
(1.55 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 60
(0.00 %)		 181
(100.00 %)		 4,818,689
(41.90 %)		 962,362
(4.16 %)		 12,161,222
(34.42 %)		 23,781
(0.74 %)
323 meadow vole (hap2 2024)
GCA_037039175.1		 n/a 19,001
(1.82 %)		 20,271
(1.68 %)		 n/a 42.58
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 143
(100.00 %)		 3,141,368
(21.37 %)		 898,900
(4.24 %)		 11,475,531
(32.14 %)		 22,186
(0.75 %)
324 meerkat (VVHF042 2019 DNA Zoo refseq)
GCF_006229205.1		 58,806
(2.67 %)		 19,009
(1.64 %)		 19,088
(1.36 %)		 n/a 41.68
(99.72 %)		 65,245
(0.28 %)		 63,791
(100.00 %)		 4,564,931
(40.13 %)		 634,179
(1.21 %)		 13,631,635
(32.17 %)		 64,858
(2.22 %)
325 Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 alternate hap 2022)
GCA_024711525.1		 n/a 18,555
(1.22 %)		 24,508
(1.35 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 181
(0.00 %)		 3,482
(100.00 %)		 6,419,007
(53.84 %)		 1,384,128
(15.63 %)		 11,486,822
(50.51 %)		 38,521
(1.60 %)
326 Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022)
GCA_024711535.1		 n/a 21,281
(1.16 %)		 28,592
(1.34 %)		 n/a 42.27
(100.00 %)		 182
(0.00 %)		 4,354
(100.00 %)		 4,378,955
(29.66 %)		 1,568,842
(17.75 %)		 12,889,786
(51.96 %)		 46,167
(1.71 %)
327 minke whale (2013 refseq)
GCF_000493695.1		 42,553
(2.38 %)		 19,159
(1.73 %)		 18,656
(1.42 %)		 n/a 40.94
(94.06 %)		 173,296
(5.96 %)		 184,072
(94.04 %)		 n/a 573,951
(1.48 %)		 13,504,347
(30.96 %)		 65,448
(1.38 %)
328 minke whale (alternate hap 2023)
GCA_950005055.1		 n/a 20,412
(1.46 %)		 27,421
(1.34 %)		 n/a 41.50
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 21,272
(100.00 %)		 3,811,435
(36.24 %)		 959,712
(10.27 %)		 12,159,896
(41.30 %)		 69,852
(1.62 %)
329 minke whale (primary hap 2023 refseq)
GCF_949987535.1		 61,711
(2.51 %)		 19,550
(1.49 %)		 21,499
(1.26 %)		 n/a 41.55
(99.99 %)		 1,177
(0.01 %)		 1,374
(100.00 %)		 4,006,927
(35.92 %)		 1,058,105
(12.08 %)		 12,708,103
(42.66 %)		 72,756
(1.59 %)
330 Mongolian gerbil (243 2017 Lucigen Corp.)
GCF_002204375.1		 40,346
(2.29 %)		 21,215
(1.83 %)		 24,305
(1.47 %)		 n/a 42.09
(95.23 %)		 91,601
(4.78 %)		 68,793
(100.00 %)		 4,821,343
(37.74 %)		 940,776
(1.82 %)		 13,848,274
(31.31 %)		 24,154
(0.74 %)
331 Mongolian gerbil (EAM2014 2019 BGI)
GCA_008131255.1		 n/a 19,952
(1.59 %)		 23,462
(1.36 %)		 n/a 41.98
(99.01 %)		 103,843
(0.97 %)		 412,933
(99.03 %)		 5,009,454
(0.00 %)		 1,042,929
(2.52 %)		 14,121,194
(34.63 %)		 26,044
(0.71 %)
332 Mongolian gerbil (TT.TT164.6M 2023)
GCF_030254825.1		 65,502
(2.97 %)		 19,045
(1.53 %)		 20,203
(1.29 %)		 n/a 41.87
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 193
(100.00 %)		 4,477,607
(37.21 %)		 1,124,432
(5.22 %)		 13,244,320
(39.20 %)		 25,300
(0.76 %)
333 monito del monte (mDroGli1 alternate hap 2021)
GCA_019395325.1		 n/a 16,419
(0.77 %)		 17,219
(0.89 %)		 n/a 39.03
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 9,959
(100.00 %)		 6,332,360
(29.69 %)		 1,065,454
(2.09 %)		 17,908,986
(42.25 %)		 13,856
(0.35 %)
334 monito del monte (mDroGli1 primary hap 2021 refseq)
GCF_019393635.1		 47,034
(2.02 %)		 18,399
(0.80 %)		 15,519
(0.85 %)		 n/a 39.11
(99.91 %)		 260
(0.09 %)		 17
(100.00 %)		 9,107,968
(41.08 %)		 1,249,635
(2.12 %)		 21,135,324
(42.80 %)		 16,598
(0.36 %)
335 Montane guinea pig
GCA_004027695.1		 n/a 20,064
(1.06 %)		 31,321
(1.18 %)		 39,905
(1.42 %)		 40.09
(99.88 %)		 11,321
(0.04 %)		 1,379,500
(99.96 %)		 4,730,634
(30.02 %)		 1,583,664
(6.57 %)		 15,806,339
(40.40 %)		 37,371
(0.76 %)
336 mountain beaver
GCA_004027875.1		 n/a 22,428
(1.10 %)		 38,670
(1.12 %)		 n/a 40.58
(99.89 %)		 7,253
(0.02 %)		 1,286,779
(99.98 %)		 5,859,004
(32.29 %)		 914,052
(2.37 %)		 16,249,666
(38.21 %)		 39,133
(0.76 %)
337 muskrat
GCA_004026605.1		 n/a 22,540
(1.52 %)		 32,136
(1.35 %)		 n/a 41.59
(99.93 %)		 6,243
(0.02 %)		 571,599
(99.98 %)		 4,437,736
(28.49 %)		 922,826
(2.38 %)		 13,945,732
(35.23 %)		 19,876
(0.50 %)
338 naked mole-rat (MEF-2018 2020)
GCA_014060925.1		 n/a 22,011
(1.30 %)		 21,392
(1.22 %)		 n/a 40.13
(95.11 %)		 139,535
(4.91 %)		 148,797
(95.09 %)		 4,885,102
(35.91 %)		 654,418
(1.90 %)		 16,401,315
(34.21 %)		 40,717
(0.98 %)
339 naked mole-rat (NMR 29 2012 refseq)
GCF_000247695.1		 74,574
(3.56 %)		 21,332
(1.74 %)		 20,861
(1.51 %)		 n/a 40.21
(88.43 %)		 110,424
(11.59 %)		 114,653
(88.41 %)		 4,179,991
(32.69 %)		 484,933
(0.92 %)		 13,672,561
(27.63 %)		 31,950
(0.88 %)
340 narwhal (Baffin Bay 2019)
GCF_005190385.1		 51,639
(2.71 %)		 18,741
(1.78 %)		 20,365
(1.40 %)		 33,148
(1.79 %)		 41.22
(99.52 %)		 18,323
(0.49 %)		 6,972
(100.00 %)		 4,011,742
(43.97 %)		 565,367
(1.22 %)		 12,720,018
(34.85 %)		 60,492
(1.58 %)
341 Natal long-fingered bat
GCF_001595765.1		 32,050
(3.03 %)		 18,015
(2.17 %)		 18,293
(1.87 %)		 n/a 42.07
(96.24 %)		 204,616
(3.79 %)		 1,269
(100.00 %)		 2,565,457
(28.95 %)		 376,532
(1.91 %)		 10,427,823
(26.35 %)		 63,261
(2.07 %)
342 neotropical fruit bat
GCF_014824575.2		 49,109
(2.78 %)		 17,703
(1.63 %)		 19,389
(1.60 %)		 n/a 42.32
(99.79 %)		 38,675
(0.21 %)		 26,068
(100.00 %)		 2,862,405
(29.31 %)		 366,960
(1.48 %)		 11,796,203
(31.27 %)		 59,091
(1.70 %)
343 Nilgiri tahr
GCA_004026825.1		 n/a 22,735
(1.44 %)		 34,961
(1.27 %)		 n/a 42.37
(99.93 %)		 10,387
(0.04 %)		 479,550
(99.96 %)		 5,793,761
(48.50 %)		 535,297
(1.34 %)		 13,378,352
(42.46 %)		 57,653
(1.29 %)
344 nine-banded armadillo (mDasNov1 hap1 2023)
GCA_030445055.1		 n/a 19,429
(1.06 %)		 22,396
(1.07 %)		 n/a 40.96
(99.27 %)		 845
(0.73 %)		 594
(100.00 %)		 4,369,568
(32.83 %)		 673,707
(1.55 %)		 18,586,102
(42.41 %)		 131,852
(2.78 %)
345 nine-banded armadillo (mDasNov1 hap1 2023)
GCA_030445055.2		 n/a 19,350
(1.07 %)		 22,207
(1.07 %)		 n/a 40.97
(99.27 %)		 823
(0.73 %)		 588
(100.00 %)		 4,330,716
(32.85 %)		 661,966
(1.52 %)		 18,302,021
(42.22 %)		 130,245
(2.79 %)
346 nine-banded armadillo (mDasNov1 hap2 2023)
GCF_030445035.1		 69,043
(2.70 %)		 20,516
(1.05 %)		 n/a n/a 41.00
(99.68 %)		 771
(0.32 %)		 539
(100.00 %)		 4,656,325
(32.86 %)		 726,574
(1.99 %)		 19,585,522
(43.65 %)		 140,990
(2.86 %)
347 nine-banded armadillo (v3.2 3-136 2012 Baylor)
GCF_000208655.3		 46,110
(1.87 %)		 20,820
(1.08 %)		 25,226
(1.08 %)		 n/a 40.77
(90.89 %)		 268,437
(9.13 %)		 314,788
(90.87 %)		 4,552,770
(34.01 %)		 651,225
(1.26 %)		 19,266,969
(38.27 %)		 139,490
(2.47 %)
348 North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 alternate hap 2022)
GCA_026167925.1		 n/a 19,342
(1.57 %)		 20,947
(1.48 %)		 n/a 42.40
(100.00 %)		 229
(0.00 %)		 1,006
(100.00 %)		 4,161,568
(23.13 %)		 1,278,205
(8.22 %)		 13,148,019
(37.60 %)		 23,523
(0.71 %)
349 North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 primary hap 2022)
GCA_026229955.1		 n/a 19,700
(1.54 %)		 22,354
(1.46 %)		 n/a 42.19
(100.00 %)		 244
(0.00 %)		 2,082
(100.00 %)		 6,089,884
(47.99 %)		 1,358,786
(9.39 %)		 13,799,349
(39.08 %)		 24,733
(0.70 %)
350 North American porcupine (mEreDor1 alternate hap 2023)
GCA_028500835.1		 n/a 15,210
(1.55 %)		 18,316
(1.43 %)		 n/a 41.06
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 5,051
(100.00 %)		 3,911,633
(40.55 %)		 565,546
(1.54 %)		 10,853,726
(32.61 %)		 40,925
(1.35 %)
351 North American porcupine (mEreDor1 primary hap 2023)
GCA_028451465.1		 n/a 18,102
(1.58 %)		 20,073
(1.40 %)		 n/a 41.03
(100.00 %)		 277
(0.00 %)		 116
(100.00 %)		 4,958,089
(41.64 %)		 719,163
(1.59 %)		 13,867,662
(33.89 %)		 51,299
(1.36 %)
352 North Atlantic right whale (hap1 2023)
GCA_028571275.1		 n/a 18,699
(1.61 %)		 20,354
(1.28 %)		 n/a 41.64
(99.84 %)		 385
(0.16 %)		 947
(100.00 %)		 3,815,900
(43.46 %)		 718,935
(11.38 %)		 11,928,210
(42.25 %)		 85,881
(1.90 %)
353 North Atlantic right whale (hap2 + XY 2023 refseq)
GCF_028564815.1		 49,646
(1.86 %)		 19,562
(1.46 %)		 21,631
(1.25 %)		 n/a 41.69
(99.83 %)		 367
(0.17 %)		 789
(100.00 %)		 1,368,536
(2.24 %)		 841,303
(13.08 %)		 12,527,582
(43.92 %)		 94,259
(1.92 %)
354 North Pacific right whale
GCA_004363455.1		 n/a 23,145
(1.43 %)		 38,161
(1.21 %)		 n/a 41.15
(99.88 %)		 7,094
(0.03 %)		 1,361,057
(99.97 %)		 5,039,622
(45.69 %)		 694,986
(1.31 %)		 14,063,101
(40.51 %)		 74,800
(1.52 %)
355 northern American river otter
GCF_010015895.1		 53,945
(2.18 %)		 18,974
(1.68 %)		 21,247
(1.45 %)		 n/a 41.41
(99.58 %)		 7,620
(0.42 %)		 13,541
(99.58 %)		 4,538,847
(41.18 %)		 685,281
(1.20 %)		 13,840,953
(32.61 %)		 53,559
(1.88 %)
356 northern bat (alternate hap 2023)
GCA_951640545.1		 n/a 18,343
(1.80 %)		 23,253
(1.77 %)		 n/a 43.55
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 4,899
(100.00 %)		 1,174,241
(2.96 %)		 825,170
(5.11 %)		 9,889,579
(36.12 %)		 76,164
(3.52 %)
357 northern bat (primary hap 2023)
GCA_951640355.1		 n/a 18,636
(1.75 %)		 21,446
(1.68 %)		 n/a 43.32
(99.99 %)		 1,423
(0.01 %)		 207
(100.00 %)		 1,259,729
(2.95 %)		 905,676
(6.25 %)		 10,554,535
(38.21 %)		 77,656
(3.27 %)
358 northern black mastiff bat (mMolNig1 2022)
GCA_026936385.1		 n/a 18,924
(1.53 %)		 22,934
(1.58 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 199
(0.00 %)		 146
(100.00 %)		 3,850,624
(31.21 %)		 648,359
(3.76 %)		 11,788,702
(39.25 %)		 85,908
(2.60 %)
359 northern bottlenose whale (alternate hap 2023)
GCA_949752845.1		 n/a 19,537
(1.44 %)		 27,826
(1.30 %)		 n/a 41.67
(100.00 %)		 n/a 23,401
(100.00 %)		 3,634,923
(35.56 %)		 672,860
(11.00 %)		 11,175,398
(41.72 %)		 62,007
(1.94 %)
360 northern bottlenose whale (primary hap 2023)
GCA_949752795.1		 n/a 19,073
(1.44 %)		 20,821
(1.21 %)		 n/a 41.81
(99.99 %)		 1,098
(0.01 %)		 757
(100.00 %)		 3,997,911
(34.76 %)		 769,275
(14.94 %)		 12,133,820
(44.83 %)		 67,258
(2.00 %)
361 northern elephant seal (BS05 2019 Broad)
GCA_004023865.1		 n/a 22,834
(1.54 %)		 36,083
(1.32 %)		 n/a 41.52
(99.94 %)		 9,483
(0.04 %)		 330,739
(99.96 %)		 4,849,944
(43.83 %)		 600,306
(1.16 %)		 13,420,049
(34.43 %)		 57,236
(1.62 %)
362 northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 genbank)
GCA_029215605.1		 n/a 19,278
(1.60 %)		 19,908
(1.39 %)		 n/a 41.84
(100.00 %)		 98
(0.00 %)		 596
(100.00 %)		 4,348,333
(34.40 %)		 621,985
(2.21 %)		 13,251,768
(35.32 %)		 69,898
(2.38 %)
363 Northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 refseq)
GCF_029215605.1		 74,106
(3.88 %)		 19,277
(1.60 %)		 20,000
(1.36 %)		 n/a 41.84
(100.00 %)		 98
(0.00 %)		 595
(100.00 %)		 4,348,327
(34.40 %)		 621,980
(2.21 %)		 13,251,706
(35.32 %)		 69,897
(2.38 %)
364 northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap2 2023)
GCA_029215635.1		 n/a 19,340
(1.59 %)		 19,732
(1.37 %)		 n/a 41.91
(100.00 %)		 60
(0.00 %)		 482
(100.00 %)		 4,365,070
(34.26 %)		 627,639
(2.43 %)		 13,174,494
(35.47 %)		 74,314
(2.49 %)
365 northern elephant seal (v3 JK_09032017 2022)
GCF_021288785.2		 53,819
(3.32 %)		 20,099
(1.75 %)		 20,957
(1.35 %)		 n/a 41.51
(99.35 %)		 39,936
(0.65 %)		 142,455
(100.00 %)		 4,368,400
(33.93 %)		 588,877
(1.19 %)		 13,745,426
(32.96 %)		 52,064
(1.59 %)
366 northern fur seal
GCF_003265705.1		 54,940
(2.43 %)		 23,408
(1.78 %)		 23,666
(1.43 %)		 52,089
(2.17 %)		 41.48
(98.01 %)		 38,666
(1.99 %)		 52,469
(98.01 %)		 5,047,032
(43.38 %)		 638,130
(1.06 %)		 14,922,442
(33.12 %)		 57,281
(1.44 %)
367 northern gundi
GCA_004027205.1		 n/a 18,035
(1.39 %)		 27,379
(1.57 %)		 n/a 42.68
(99.91 %)		 5,037
(0.02 %)		 865,110
(99.98 %)		 4,149,883
(27.83 %)		 654,063
(1.64 %)		 12,342,565
(33.72 %)		 47,533
(1.43 %)
368 northern mole vole
GCA_001685095.1		 n/a 23,252
(1.39 %)		 44,209
(1.25 %)		 n/a 41.68
(99.04 %)		 371,627
(0.98 %)		 722,087
(99.02 %)		 3,923,814
(25.79 %)		 898,453
(2.47 %)		 13,708,986
(29.04 %)		 16,583
(0.36 %)
369 northern white rhinoceros
GCA_004027795.1		 n/a 25,328
(1.34 %)		 61,003
(1.95 %)		 n/a 41.32
(99.90 %)		 7,054
(0.03 %)		 949,480
(99.97 %)		 4,330,882
(38.89 %)		 484,754
(1.12 %)		 15,544,248
(33.11 %)		 43,689
(2.08 %)
370 Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 genbank)
GCA_036323735.1		 114,725
(42.69 %)		 21,917
(1.75 %)		 19,476
(1.26 %)		 n/a 41.82
(99.86 %)		 220
(0.14 %)		 77
(100.00 %)		 4,700,726
(39.99 %)		 1,603,005
(5.45 %)		 13,451,813
(38.68 %)		 20,118
(0.44 %)
371 Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 refseq)
GCF_036323735.1		 114,725
(5.38 %)		 21,870
(1.74 %)		 19,989
(1.27 %)		 n/a 41.82
(99.86 %)		 220
(0.14 %)		 76
(100.00 %)		 5,294,185
(42.75 %)		 1,603,005
(5.45 %)		 13,451,760
(38.68 %)		 20,118
(0.44 %)
372 Norway rat BN7 haplotype
GCA_015244455.1		 n/a 3,096
(1.64 %)		 2,450
(1.02 %)		 n/a 41.23
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 3,156
(100.00 %)		 517,347
(50.76 %)		 157,701
(3.90 %)		 1,502,752
(34.14 %)		 1,806
(0.40 %)
373 Norway rat BN7.2
GCF_015227675.2		 99,139
(4.10 %)		 21,526
(1.86 %)		 19,266
(1.33 %)		 54,530
(2.79 %)		 41.99
(99.19 %)		 581
(0.81 %)		 757
(99.19 %)		 5,029,005
(45.44 %)		 1,514,974
(3.57 %)		 13,450,428
(35.83 %)		 19,244
(0.46 %)
374 Norway rat celera
GCF_000002265.2		 39,745
(2.91 %)		 21,492
(1.95 %)		 19,112
(1.38 %)		 n/a 41.98
(95.28 %)		 111,391
(4.74 %)		 118,423
(95.26 %)		 9,721,869
(43.57 %)		 1,387,703
(3.05 %)		 13,224,921
(32.45 %)		 18,944
(0.42 %)
375 Norway rat Rnor6.0
GCF_000001895.5		 69,456
(3.34 %)		 22,369
(1.83 %)		 20,269
(1.32 %)		 n/a 41.93
(95.13 %)		 145,731
(4.89 %)		 76,195
(95.16 %)		 5,329,187
(44.14 %)		 1,620,304
(3.72 %)		 14,520,050
(33.09 %)		 22,600
(0.47 %)
376 Norway rat SHR/Utx RGD_8142385 2022
GCA_023515785.1		 n/a 21,116
(1.68 %)		 20,103
(1.27 %)		 57,027
(2.45 %)		 41.85
(99.82 %)		 1,256
(0.18 %)		 2,151
(100.00 %)		 4,704,388
(38.22 %)		 1,611,144
(5.76 %)		 13,524,575
(38.35 %)		 20,720
(0.48 %)
377 Norway rat SHRSP/BppUtx 2022
GCA_021556685.1		 n/a 22,366
(1.71 %)		 20,531
(1.26 %)		 57,580
(2.44 %)		 41.86
(99.94 %)		 1,610
(0.06 %)		 2,734
(100.00 %)		 5,238,574
(46.36 %)		 1,638,412
(5.87 %)		 13,769,141
(38.49 %)		 21,006
(0.49 %)
378 Norway rat WKY/Bbb 2022
GCA_023515805.1		 n/a 21,607
(1.68 %)		 21,244
(1.28 %)		 58,136
(2.47 %)		 41.92
(99.80 %)		 1,456
(0.20 %)		 3,553
(100.00 %)		 4,811,412
(38.21 %)		 1,650,950
(5.41 %)		 13,740,644
(38.24 %)		 21,449
(0.51 %)
379 nutria
GCA_004027025.1		 n/a 24,707
(1.00 %)		 47,533
(1.18 %)		 n/a 41.70
(99.84 %)		 15,249
(0.05 %)		 1,684,916
(99.95 %)		 6,961,690
(30.09 %)		 1,698,977
(3.31 %)		 15,207,563
(42.57 %)		 59,854
(1.00 %)
380 okapi
GCA_001660835.1		 n/a 21,483
(1.43 %)		 31,061
(1.26 %)		 n/a 41.48
(95.11 %)		 376,008
(4.86 %)		 1,213,177
(95.14 %)		 5,808,036
(42.90 %)		 619,044
(4.22 %)		 14,940,153
(35.17 %)		 47,417
(1.12 %)
381 Ord's kangaroo rat
GCF_000151885.1		 30,625
(2.21 %)		 17,959
(1.54 %)		 19,318
(1.54 %)		 n/a 42.06
(92.36 %)		 83,035
(7.65 %)		 148,226
(92.35 %)		 4,337,455
(33.76 %)		 1,140,316
(7.60 %)		 10,422,685
(36.59 %)		 61,921
(3.56 %)
382 pacarana
GCA_004027595.1		 n/a 20,748
(1.20 %)		 33,195
(1.31 %)		 n/a 41.81
(99.90 %)		 6,392
(0.02 %)		 1,164,830
(99.98 %)		 4,374,443
(30.16 %)		 660,811
(1.38 %)		 14,062,133
(35.99 %)		 59,382
(1.23 %)
383 Pacific pocket mouse (BS65 2019 Broad)
GCA_004363475.1		 n/a 21,575
(1.07 %)		 47,478
(1.31 %)		 n/a 41.87
(99.76 %)		 18,801
(0.07 %)		 2,428,619
(99.93 %)		 4,881,232
(20.80 %)		 1,352,971
(4.11 %)		 12,583,960
(48.42 %)		 74,961
(2.33 %)
384 Pacific pocket mouse (PPM17 2022 San Diego Zoo)
GCF_023159225.1		 46,202
(2.48 %)		 18,752
(1.50 %)		 22,526
(1.60 %)		 n/a 41.98
(99.96 %)		 1,807
(0.04 %)		 6,180
(100.00 %)		 3,313,319
(16.79 %)		 1,066,382
(10.88 %)		 9,981,468
(42.63 %)		 49,134
(2.83 %)
385 Pacific walrus
GCF_000321225.1		 27,163
(1.89 %)		 20,293
(1.71 %)		 20,982
(1.48 %)		 n/a 41.36
(95.85 %)		 66,766
(4.16 %)		 70,656
(95.84 %)		 4,372,578
(41.12 %)		 511,500
(1.05 %)		 13,507,582
(30.43 %)		 45,142
(1.29 %)
386 Pacific white-sided dolphin
GCF_003676395.1		 65,947
(3.26 %)		 18,743
(1.79 %)		 20,862
(1.45 %)		 31,917
(1.69 %)		 41.28
(99.56 %)		 16,699
(0.44 %)		 21,350
(99.56 %)		 3,971,820
(45.64 %)		 574,056
(1.14 %)		 12,602,965
(34.83 %)		 62,275
(1.67 %)
387 pale spear-nosed bat (alternate hap MPI-MPIP 2019)
GCA_004115245.1		 n/a 18,118
(1.63 %)		 23,536
(1.65 %)		 n/a 42.48
(100.00 %)		 38
(0.00 %)		 10,873
(100.00 %)		 3,001,130
(29.46 %)		 375,042
(0.79 %)		 11,813,971
(29.64 %)		 67,712
(4.23 %)
388 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 alternate hap 2020)
GCA_004115245.2		 n/a 18,116
(1.63 %)		 23,608
(1.65 %)		 n/a 42.48
(100.00 %)		 38
(0.00 %)		 10,895
(100.00 %)		 3,002,448
(29.46 %)		 375,226
(0.79 %)		 11,824,034
(29.65 %)		 67,718
(4.23 %)
389 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 primary hap 2020)
GCF_004126475.2		 54,932
(3.31 %)		 18,171
(1.69 %)		 20,025
(1.62 %)		 42,786
(3.39 %)		 42.38
(99.28 %)		 884
(0.72 %)		 77
(100.00 %)		 3,069,141
(30.00 %)		 385,664
(0.81 %)		 12,050,232
(30.57 %)		 63,905
(3.75 %)
390 Pallas's mastiff bat
GCF_014108415.1		 48,421
(2.20 %)		 18,667
(1.61 %)		 21,915
(1.59 %)		 n/a 42.35
(97.95 %)		 349
(2.05 %)		 60
(100.00 %)		 3,863,217
(32.76 %)		 624,933
(1.88 %)		 11,572,319
(37.09 %)		 79,984
(2.45 %)
391 pallid bat (TK200870 primary hap 2023)
GCA_027563665.1		 n/a 19,688
(1.69 %)		 21,998
(1.64 %)		 n/a 43.04
(99.72 %)		 234
(0.28 %)		 112
(99.99 %)		 2,794,986
(22.60 %)		 938,016
(3.72 %)		 11,241,518
(39.41 %)		 70,272
(2.89 %)
392 Parnell's mustached bat (2013)
GCA_000465405.1		 n/a 21,436
(1.40 %)		 57,232
(2.18 %)		 n/a 40.82
(99.34 %)		 265,720
(0.70 %)		 443,121
(99.30 %)		 2,780,805
(29.26 %)		 290,520
(0.63 %)		 12,354,814
(27.13 %)		 69,806
(1.89 %)
393 Parnell's mustached bat (Mesoamerican 2021)
GCF_021234165.1		 37,033
(2.48 %)		 18,339
(1.76 %)		 21,630
(1.69 %)		 n/a 41.32
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 333
(100.00 %)		 2,828,339
(30.56 %)		 333,670
(0.75 %)		 12,444,271
(30.90 %)		 53,180
(4.61 %)
394 particolored bat (primary hap 2024)
GCA_963924515.1		 n/a 17,913
(1.72 %)		 20,720
(1.72 %)		 n/a 43.54
(99.99 %)		 980
(0.01 %)		 185
(100.00 %)		 2,932,869
(21.94 %)		 874,665
(4.83 %)		 10,263,103
(37.46 %)		 77,397
(4.55 %)
395 Patagonian cavy
GCA_004027295.1		 n/a 21,143
(0.94 %)		 40,887
(1.10 %)		 n/a 39.86
(99.87 %)		 6,223
(0.02 %)		 1,911,987
(99.98 %)		 5,194,890
(30.95 %)		 892,551
(2.11 %)		 17,052,577
(40.22 %)		 45,730
(0.84 %)
396 Pere David's deer
GCA_002443075.1		 n/a 20,723
(1.65 %)		 23,551
(1.43 %)		 n/a 41.58
(97.49 %)		 144,642
(2.51 %)		 339,454
(97.49 %)		 5,171,293
(43.30 %)		 427,987
(1.20 %)		 13,665,133
(35.97 %)		 48,374
(1.14 %)
397 Philippine flying lemur (mCynVol1 alternate hap 2022)
GCA_027409165.1		 n/a 18,794
(1.72 %)		 21,421
(1.40 %)		 n/a 40.18
(100.00 %)		 n/a 1,750
(100.00 %)		 4,001,442
(39.37 %)		 547,894
(2.75 %)		 13,870,563
(34.33 %)		 40,162
(1.31 %)
398 Philippine flying lemur (mCynVol1 primary hap 2022 genbank)
GCA_027409185.1		 n/a 20,384
(1.64 %)		 22,124
(1.29 %)		 n/a 40.24
(100.00 %)		 116
(0.00 %)		 131
(100.00 %)		 4,492,423
(39.31 %)		 627,842
(4.79 %)		 15,561,515
(36.57 %)		 45,336
(1.27 %)
399 Philippine flying lemur (mCynVol1 primary hap 2022 refseq)
GCF_027409185.1		 44,950
(1.91 %)		 20,385
(1.64 %)		 22,123
(1.29 %)		 n/a 40.24
(100.00 %)		 116
(0.00 %)		 130
(100.00 %)		 4,492,417
(39.31 %)		 627,841
(4.79 %)		 15,561,458
(36.57 %)		 45,336
(1.27 %)
400 pig (Bamei 2023)
GCA_030704935.1		 n/a 18,472
(1.44 %)		 19,911
(1.28 %)		 n/a 42.63
(99.98 %)		 878
(0.02 %)		 379
(100.00 %)		 3,996,827
(27.97 %)		 2,094,728
(7.23 %)		 12,677,118
(40.57 %)		 81,791
(2.82 %)
401 pig (Duroc 2017)
GCF_000003025.6		 77,695
(4.05 %)		 18,980
(1.64 %)		 19,453
(1.32 %)		 59,876
(4.84 %)		 41.87
(98.81 %)		 544
(1.19 %)		 1,313
(98.81 %)		 5,021,184
(45.67 %)		 710,994
(1.32 %)		 13,243,289
(36.33 %)		 79,132
(1.82 %)
402 pig (USMARCv1 2017)
GCA_002844635.1		 n/a 19,458
(1.54 %)		 21,487
(1.27 %)		 58,655
(2.58 %)		 42.49
(95.20 %)		 661
(4.80 %)		 14,157
(100.00 %)		 5,159,244
(47.53 %)		 902,079
(3.63 %)		 13,145,120
(36.86 %)		 82,442
(2.62 %)
403 plains zebra (Etosha38 2022 UCLA)
GCF_021613505.1		 55,779
(2.87 %)		 19,529
(1.76 %)		 21,214
(1.39 %)		 n/a 41.38
(99.04 %)		 14,595
(0.96 %)		 11,098
(100.00 %)		 3,683,862
(38.74 %)		 314,723
(0.68 %)		 15,217,328
(29.38 %)		 41,391
(1.27 %)
404 platypus (alternate hap Pmale09 2020)
GCA_004115175.2		 n/a 13,244
(1.26 %)		 19,241
(1.68 %)		 n/a 46.27
(100.00 %)		 25
(0.00 %)		 5,868
(100.00 %)		 4,420,884
(51.59 %)		 513,006
(3.13 %)		 7,749,797
(49.18 %)		 81,538
(8.24 %)
405 platypus (Pmale09 v4 2020)
GCF_004115215.2		 51,392
(3.07 %)		 14,778
(1.26 %)		 18,888
(1.63 %)		 n/a 46.14
(99.18 %)		 515
(0.82 %)		 322
(100.00 %)		 5,071,089
(51.34 %)		 578,614
(2.89 %)		 9,113,848
(48.93 %)		 87,796
(6.47 %)
406 polar bear (Baiyulong BGI 2014 refseq)
GCF_000687225.1		 35,764
(2.39 %)		 18,466
(1.69 %)		 15,384
(1.38 %)		 n/a 41.65
(98.35 %)		 110,343
(1.67 %)		 134,162
(98.33 %)		 4,123,540
(40.16 %)		 553,196
(1.29 %)		 13,765,581
(29.91 %)		 54,907
(1.17 %)
407 polar bear (UCSC 2021)
GCF_017311325.1		 52,188
(2.92 %)		 18,588
(1.75 %)		 20,731
(1.54 %)		 n/a 41.88
(99.60 %)		 45,532
(0.41 %)		 3,900
(100.00 %)		 4,204,162
(40.75 %)		 572,129
(1.75 %)		 13,926,894
(30.79 %)		 63,315
(1.93 %)
408 prairie deer mouse (Baylor 2013)
GCF_000500345.1		 50,187
(2.51 %)		 20,427
(1.69 %)		 20,874
(1.45 %)		 n/a 42.34
(94.06 %)		 182,263
(5.97 %)		 212,962
(94.03 %)		 n/a 1,229,123
(2.83 %)		 14,447,916
(30.09 %)		 23,246
(0.56 %)
409 prairie deer mouse (Harvard 2020)
GCF_003704035.1		 69,779
(3.28 %)		 19,755
(1.73 %)		 19,194
(1.43 %)		 n/a 42.28
(95.07 %)		 147,442
(4.96 %)		 155,966
(95.04 %)		 4,751,621
(29.04 %)		 1,172,212
(2.66 %)		 13,934,672
(29.87 %)		 22,444
(0.57 %)
410 prairie vole
GCF_000317375.1		 40,484
(2.72 %)		 19,648
(1.91 %)		 19,489
(1.62 %)		 n/a 42.25
(92.03 %)		 180,677
(8.00 %)		 187,012
(92.00 %)		 3,779,126
(25.51 %)		 879,192
(2.11 %)		 12,360,347
(27.34 %)		 18,233
(0.52 %)
411 proboscis bat (hap1 2024)
GCA_037038545.1		 n/a 17,919
(1.46 %)		 19,330
(1.31 %)		 n/a 40.78
(100.00 %)		 68
(0.00 %)		 41
(100.00 %)		 3,707,234
(28.28 %)		 643,817
(2.22 %)		 12,106,384
(41.48 %)		 54,438
(1.38 %)
412 proboscis bat (hap2 2024)
GCA_037038555.1		 n/a 17,253
(1.51 %)		 18,507
(1.35 %)		 n/a 40.91
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 38
(100.00 %)		 3,466,835
(27.96 %)		 585,261
(1.91 %)		 11,364,898
(40.65 %)		 50,527
(1.37 %)
413 pronghorn (PH2016 2021)
GCA_021018645.1		 n/a 21,848
(1.58 %)		 27,614
(1.56 %)		 n/a 41.70
(96.83 %)		 74,027
(3.17 %)		 140,480
(96.83 %)		 3,335,744
(24.40 %)		 405,435
(4.11 %)		 13,855,606
(34.67 %)		 48,670
(1.19 %)
414 Przewalski's horse (Burgud 2014 refseq)
GCF_000696695.1		 45,076
(2.76 %)		 19,546
(1.69 %)		 22,107
(1.36 %)		 n/a 41.27
(99.13 %)		 80,963
(0.88 %)		 134,060
(99.12 %)		 3,787,533
(40.54 %)		 435,607
(1.73 %)		 14,738,418
(28.36 %)		 40,752
(0.94 %)
415 puma (L17-30 alternate hap 2023)
GCA_028749965.1		 n/a 18,380
(1.53 %)		 20,701
(1.40 %)		 n/a 41.91
(100.00 %)		 96
(0.00 %)		 304
(100.00 %)		 4,881,674
(33.96 %)		 978,817
(2.17 %)		 13,422,986
(35.08 %)		 69,437
(2.62 %)
416 puma (L17-30 primary hap 2023)
GCA_028749985.1		 n/a 17,553
(1.53 %)		 19,299
(1.39 %)		 n/a 41.89
(100.00 %)		 134
(0.00 %)		 390
(100.00 %)		 4,629,539
(33.53 %)		 919,008
(2.02 %)		 12,766,157
(34.70 %)		 65,437
(2.53 %)
417 puma (SC36_Marlon 2018 refseq)
GCF_003327715.1		 25,575
(1.43 %)		 17,664
(1.57 %)		 16,565
(1.29 %)		 n/a 41.36
(95.34 %)		 178,992
(4.69 %)		 2,175
(100.00 %)		 4,885,335
(42.70 %)		 833,138
(1.76 %)		 13,705,778
(31.28 %)		 58,912
(1.65 %)
418 punctate agouti
GCA_004363535.1		 n/a 22,612
(1.05 %)		 45,433
(1.19 %)		 n/a 40.79
(99.92 %)		 6,459
(0.02 %)		 993,123
(99.98 %)		 5,671,738
(32.53 %)		 945,722
(1.69 %)		 17,003,309
(36.58 %)		 85,696
(1.65 %)
419 pygmy sperm whale
GCA_004363705.1		 n/a 22,661
(1.30 %)		 42,546
(1.15 %)		 n/a 41.89
(99.89 %)		 6,053
(0.02 %)		 1,258,125
(99.98 %)		 5,185,912
(43.65 %)		 836,752
(1.88 %)		 14,150,125
(39.88 %)		 95,344
(2.15 %)
420 pygmy sperm whale (mKogBre1 2022 refseq)
GCF_026419965.1		 56,261
(2.22 %)		 18,496
(1.55 %)		 20,718
(1.32 %)		 n/a 42.05
(99.81 %)		 143
(0.19 %)		 581
(100.00 %)		 3,817,659
(34.51 %)		 758,297
(7.42 %)		 12,196,998
(39.96 %)		 101,353
(2.90 %)
421 pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 2 2022)
GCA_026419985.1		 n/a 18,550
(1.51 %)		 20,491
(1.29 %)		 n/a 42.18
(99.99 %)		 138
(0.01 %)		 391
(100.00 %)		 3,860,112
(33.83 %)		 820,375
(9.58 %)		 12,159,196
(41.59 %)		 106,168
(2.78 %)
422 rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 refseq)
GCF_009806435.1		 83,045
(4.16 %)		 19,486
(1.31 %)		 23,267
(1.31 %)		 n/a 43.83
(97.68 %)		 18,178
(2.32 %)		 3,160
(100.00 %)		 4,072,524
(21.41 %)		 976,273
(2.33 %)		 13,766,413
(39.76 %)		 113,371
(2.46 %)
423 rabbit (Thorbecke 2009 Broad refseq)
GCF_000003625.3		 43,655
(2.34 %)		 18,665
(1.39 %)		 20,095
(1.24 %)		 n/a 43.75
(95.14 %)		 80,789
(4.88 %)		 84,024
(95.12 %)		 4,890,480
(44.71 %)		 883,939
(1.73 %)		 13,254,520
(38.27 %)		 110,337
(2.33 %)
424 raccoon dog (2021)
GCF_905146905.1		 52,564
(2.89 %)		 19,628
(1.60 %)		 20,274
(1.43 %)		 n/a 41.28
(99.98 %)		 70
(0.02 %)		 811
(100.00 %)		 4,499,368
(31.98 %)		 1,005,212
(2.04 %)		 13,884,201
(32.95 %)		 52,450
(2.27 %)
425 Rambouillet sheep (Baylor 2017)
GCF_002742125.1		 50,096
(2.48 %)		 19,992
(1.47 %)		 22,506
(1.31 %)		 41,290
(1.46 %)		 41.91
(99.99 %)		 4,847
(0.01 %)		 7,486
(99.99 %)		 5,764,757
(47.38 %)		 507,629
(1.55 %)		 14,138,601
(41.27 %)		 51,748
(1.29 %)
426 Rambouillet sheep (U.Idaho 2021)
GCF_016772045.1		 70,474
(3.21 %)		 19,413
(1.59 %)		 21,222
(1.35 %)		 n/a 41.99
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 142
(100.00 %)		 5,300,958
(46.83 %)		 455,553
(1.24 %)		 13,023,443
(40.62 %)		 43,959
(1.30 %)
427 ratel
GCA_004024625.1		 n/a 22,196
(1.21 %)		 35,937
(1.18 %)		 n/a 42.00
(99.85 %)		 6,511
(0.02 %)		 2,074,823
(99.98 %)		 6,171,383
(41.93 %)		 877,669
(1.49 %)		 15,269,908
(41.22 %)		 95,094
(1.91 %)
428 red bat
GCA_004026805.1		 n/a 27,510
(1.22 %)		 65,467
(1.48 %)		 n/a 42.69
(99.94 %)		 6,380
(0.02 %)		 525,280
(99.98 %)		 4,644,227
(28.24 %)		 1,170,868
(2.68 %)		 15,628,238
(39.97 %)		 125,564
(3.55 %)
429 red deer (2021)
GCF_910594005.1		 68,992
(2.68 %)		 20,470
(1.48 %)		 22,563
(1.32 %)		 n/a 42.98
(100.00 %)		 40
(0.00 %)		 144
(100.00 %)		 5,501,063
(44.60 %)		 503,301
(12.23 %)		 13,102,622
(44.55 %)		 88,756
(1.66 %)
430 red deer (alternate hap 2021)
GCA_910593805.1		 n/a 18,817
(1.29 %)		 21,916
(1.20 %)		 n/a 44.23
(100.00 %)		 22
(0.00 %)		 4,021
(100.00 %)		 3,279,005
(20.48 %)		 472,706
(21.87 %)		 11,466,609
(50.26 %)		 128,858
(2.07 %)
431 red fox
GCF_003160815.1		 43,495
(2.67 %)		 19,826
(1.69 %)		 18,893
(1.40 %)		 n/a 41.08
(97.06 %)		 246,167
(2.96 %)		 82,424
(100.00 %)		 4,919,102
(40.79 %)		 954,461
(2.46 %)		 14,190,625
(30.86 %)		 53,204
(1.88 %)
432 reed vole (MF-2015 2020)
GCF_014885135.2		 55,722
(3.60 %)		 19,808
(1.93 %)		 20,787
(1.69 %)		 n/a 42.36
(95.60 %)		 67,118
(4.40 %)		 10,460
(100.00 %)		 3,130,955
(20.09 %)		 831,969
(2.09 %)		 11,985,657
(28.48 %)		 18,764
(0.58 %)
433 Reeves' muntjac (alternate hap 2024)
GCA_963930665.1		 n/a 18,947
(1.29 %)		 24,114
(1.28 %)		 n/a 42.75
(100.00 %)		 n/a 8,892
(100.00 %)		 3,375,476
(23.21 %)		 654,539
(6.64 %)		 11,132,469
(48.29 %)		 79,357
(2.66 %)
434 reindeer (2023)
GCA_963422255.1		 n/a 21,329
(1.58 %)		 25,201
(1.59 %)		 n/a 41.46
(98.35 %)		 131,886
(1.65 %)		 259,765
(98.35 %)		 3,254,173
(23.49 %)		 440,431
(2.00 %)		 14,258,607
(36.17 %)		 48,931
(1.20 %)
435 reindeer (US061 2019)
GCA_004026565.1		 n/a 24,150
(1.39 %)		 39,911
(1.41 %)		 n/a 42.08
(99.89 %)		 4,769
(0.02 %)		 1,365,508
(99.98 %)		 6,083,178
(46.10 %)		 546,470
(1.23 %)		 14,434,855
(43.16 %)		 55,319
(1.23 %)
436 Rice's whale (hap1 2023)
GCA_028017805.1		 n/a 19,396
(1.48 %)		 21,693
(1.26 %)		 n/a 41.62
(97.80 %)		 131
(2.20 %)		 1,039
(100.00 %)		 3,973,936
(35.55 %)		 987,571
(11.66 %)		 12,473,459
(42.11 %)		 74,971
(1.64 %)
437 Rice's whale (hap2 2023 refseq)
GCF_028023285.1		 59,888
(2.34 %)		 19,291
(1.53 %)		 21,195
(1.30 %)		 n/a 41.44
(99.90 %)		 334
(0.10 %)		 774
(100.00 %)		 3,917,923
(36.26 %)		 828,521
(9.28 %)		 12,518,796
(41.08 %)		 73,126
(1.69 %)
438 Rickett's big-footed myotis (AB-2021 2024)
GCA_036010255.1		 n/a 18,982
(1.81 %)		 22,002
(1.76 %)		 n/a 43.12
(100.00 %)		 n/a 105
(100.00 %)		 2,909,847
(24.53 %)		 757,964
(3.03 %)		 10,561,925
(36.25 %)		 57,318
(2.32 %)
439 Ryukyu mouse (v2 2017)
GCF_900094665.2		 53,779
(2.85 %)		 21,351
(2.29 %)		 18,073
(1.39 %)		 n/a 41.70
(89.05 %)		 306,599
(10.98 %)		 30,835
(92.70 %)		 4,479,912
(35.83 %)		 1,351,677
(2.59 %)		 12,964,608
(27.49 %)		 15,963
(0.43 %)
440 Saanen dairy goat
GCA_015443085.1		 n/a 19,257
(1.54 %)		 21,221
(1.32 %)		 n/a 42.30
(100.00 %)		 170
(0.00 %)		 1,362
(100.00 %)		 5,336,862
(47.58 %)		 515,161
(2.87 %)		 13,144,895
(41.67 %)		 58,623
(2.22 %)
441 saddleback dolphin (alternate hap 2023)
GCA_949987525.1		 n/a 18,509
(1.54 %)		 22,514
(1.36 %)		 n/a 41.95
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 7,427
(100.00 %)		 3,675,922
(35.75 %)		 950,374
(10.49 %)		 11,670,399
(40.31 %)		 63,587
(3.15 %)
442 saddleback dolphin (primary hap 2023 refseq)
GCF_949987515.1		 46,746
(2.39 %)		 18,624
(1.49 %)		 20,662
(1.31 %)		 n/a 42.06
(99.99 %)		 968
(0.01 %)		 630
(100.00 %)		 4,020,676
(35.99 %)		 1,259,549
(13.09 %)		 12,359,748
(42.64 %)		 66,179
(3.91 %)
443 saiga antelope
GCA_004024985.1		 n/a 23,736
(0.84 %)		 55,133
(0.88 %)		 n/a 42.52
(99.87 %)		 2,867
(0.01 %)		 1,775,066
(99.99 %)		 6,485,113
(49.43 %)		 447,097
(0.88 %)		 13,972,753
(44.46 %)		 46,883
(0.82 %)
444 Schreibers' long-fingered bat
GCA_004026525.1		 n/a 20,147
(2.06 %)		 31,271
(1.82 %)		 n/a 42.27
(99.94 %)		 6,918
(0.04 %)		 184,538
(99.96 %)		 2,772,932
(29.66 %)		 366,782
(1.13 %)		 10,477,531
(28.60 %)		 62,520
(2.73 %)
445 scimitar-horned oryx
GCF_014754425.2		 51,527
(2.72 %)		 19,713
(1.57 %)		 21,928
(1.32 %)		 n/a 41.74
(99.30 %)		 16,241
(0.70 %)		 9,089
(100.00 %)		 5,435,109
(46.76 %)		 414,279
(0.98 %)		 13,490,956
(40.45 %)		 42,961
(1.10 %)
446 Screaming hairy armadillo
GCA_004027955.1		 n/a 24,532
(0.39 %)		 56,725
(0.46 %)		 n/a 39.68
(99.70 %)		 2,747
(0.01 %)		 7,680,080
(99.99 %)		 8,978,735
(36.02 %)		 1,516,551
(1.58 %)		 32,918,217
(47.67 %)		 234,762
(1.56 %)
447 sea otter (GAN:26980312 2017 refseq)
GCF_002288905.1		 38,127
(2.16 %)		 18,578
(1.64 %)		 20,913
(1.44 %)		 34,179
(1.77 %)		 41.56
(98.79 %)		 23,134
(1.21 %)		 29,589
(98.79 %)		 4,703,044
(41.42 %)		 721,750
(1.39 %)		 14,065,653
(32.89 %)		 55,388
(1.87 %)
448 Seba's short-tailed bat
GCA_004027735.1		 n/a 21,878
(0.94 %)		 55,858
(1.10 %)		 n/a 42.70
(99.84 %)		 3,864
(0.01 %)		 1,929,203
(99.99 %)		 3,802,235
(28.35 %)		 606,320
(1.03 %)		 15,171,250
(31.99 %)		 118,227
(2.28 %)
449 sheep (OAR_USU_Benz2616 2023)
GCF_016772045.2		 89,680
(5.44 %)		 19,308
(1.52 %)		 21,506
(1.35 %)		 n/a 42.01
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 143
(100.00 %)		 3,275,767
(22.85 %)		 464,346
(1.26 %)		 12,987,607
(40.61 %)		 44,477
(1.28 %)
450 sheep (Texel 2015)
GCA_000298735.2		 n/a 19,179
(1.56 %)		 19,001
(1.26 %)		 48,105
(1.85 %)		 41.90
(98.94 %)		 44,566
(1.07 %)		 48,481
(98.93 %)		 5,429,824
(46.13 %)		 540,267
(1.64 %)		 13,509,668
(38.83 %)		 43,911
(1.13 %)
451 shrew mouse
GCF_900095145.1		 46,279
(2.64 %)		 20,549
(2.23 %)		 18,979
(1.49 %)		 94,079
(3.98 %)		 41.89
(90.53 %)		 269,643
(9.50 %)		 17,879
(93.73 %)		 4,788,498
(38.32 %)		 1,499,714
(3.03 %)		 13,021,757
(27.83 %)		 16,787
(0.47 %)
452 Siberian hamster (SSSS 2022)
GCA_023856395.1		 n/a 18,375
(1.83 %)		 17,066
(1.44 %)		 n/a 41.27
(99.64 %)		 88,601
(0.37 %)		 7,756
(100.00 %)		 3,152,242
(21.63 %)		 1,087,009
(2.64 %)		 12,055,167
(29.20 %)		 15,455
(0.48 %)
453 Siberian musk deer (BS20 2019 Broad)
GCA_004024705.1		 n/a 23,440
(1.32 %)		 37,497
(1.19 %)		 n/a 42.32
(99.86 %)		 19,764
(0.07 %)		 1,195,467
(99.93 %)		 6,726,950
(49.79 %)		 437,480
(1.57 %)		 14,155,240
(46.22 %)		 49,177
(1.05 %)
454 small Madagascar hedgehog
GCF_000313985.2		 37,090
(1.93 %)		 18,969
(1.19 %)		 19,298
(1.31 %)		 n/a 43.01
(88.43 %)		 270,406
(11.60 %)		 7,490
(100.00 %)		 3,789,337
(28.89 %)		 429,226
(0.87 %)		 16,951,112
(32.23 %)		 39,993
(0.70 %)
455 smoky shrew (2023)
GCF_029834395.1		 37,165
(1.66 %)		 17,572
(1.06 %)		 24,146
(1.29 %)		 n/a 43.43
(100.00 %)		 n/a 497
(100.00 %)		 2,593,080
(14.11 %)		 1,194,567
(7.25 %)		 14,051,522
(48.20 %)		 107,473
(2.80 %)
456 snow leopard (11264 2022)
GCF_023721935.1		 53,556
(3.37 %)		 18,780
(1.67 %)		 21,038
(1.40 %)		 n/a 41.60
(99.30 %)		 23,786
(0.70 %)		 2,636
(100.00 %)		 4,714,429
(34.93 %)		 919,518
(1.59 %)		 13,711,504
(33.24 %)		 64,690
(2.41 %)
457 snowshoe hare
GCA_004026855.1		 n/a 23,263
(0.88 %)		 55,811
(1.01 %)		 n/a 44.12
(99.87 %)		 10,153
(0.03 %)		 1,602,982
(99.97 %)		 4,767,120
(21.29 %)		 1,040,992
(2.22 %)		 15,680,144
(43.23 %)		 126,152
(2.28 %)
458 social tuco-tuco
GCA_004027165.1		 n/a 25,166
(1.12 %)		 41,316
(1.26 %)		 n/a 40.71
(99.89 %)		 16,191
(0.06 %)		 823,762
(99.94 %)		 5,390,906
(28.28 %)		 1,027,922
(2.15 %)		 15,241,308
(38.39 %)		 31,883
(0.72 %)
459 soprano pipistrelle (alternate hap 2023)
GCA_949987765.1		 n/a 17,590
(1.81 %)		 21,597
(1.85 %)		 n/a 42.88
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,717
(100.00 %)		 2,734,555
(21.46 %)		 795,752
(6.56 %)		 9,601,735
(36.35 %)		 62,524
(3.25 %)
460 soprano pipistrelle (primary hap 2023)
GCA_949987585.1		 n/a 18,056
(1.78 %)		 21,158
(1.79 %)		 n/a 42.67
(100.00 %)		 161
(0.00 %)		 249
(100.00 %)		 2,899,535
(21.64 %)		 853,717
(7.80 %)		 10,162,216
(37.72 %)		 63,256
(3.06 %)
461 South African ground squirrel
GCA_004024805.1		 n/a 22,802
(1.44 %)		 33,892
(1.27 %)		 n/a 39.97
(99.92 %)		 9,745
(0.04 %)		 587,115
(99.96 %)		 5,256,998
(34.93 %)		 594,122
(1.27 %)		 14,462,947
(33.96 %)		 34,141
(0.80 %)
462 Southeastern Asian house mouse (2022)
GCA_921999005.2		 n/a 21,799
(2.13 %)		 19,729
(1.40 %)		 110,356
(4.43 %)		 41.78
(99.19 %)		 278
(0.81 %)		 151
(100.00 %)		 4,663,228
(40.41 %)		 1,549,985
(3.70 %)		 13,012,600
(34.99 %)		 21,349
(0.52 %)
463 southern elephant seal
GCF_011800145.1		 53,210
(2.86 %)		 19,520
(1.73 %)		 20,727
(1.41 %)		 39,634
(1.86 %)		 41.45
(99.36 %)		 22,850
(0.64 %)		 1,115
(100.00 %)		 4,728,105
(43.75 %)		 585,443
(1.13 %)		 13,463,979
(33.65 %)		 53,182
(1.62 %)
464 southern grasshopper mouse (2020)
GCF_903995425.1		 47,152
(2.39 %)		 19,356
(1.68 %)		 18,821
(1.36 %)		 n/a 41.81
(98.94 %)		 2,143
(1.06 %)		 2,949
(100.00 %)		 4,850,460
(28.64 %)		 1,195,836
(2.72 %)		 13,540,762
(32.73 %)		 18,046
(0.54 %)
465 southern multimammate mouse
GCF_008632895.1		 69,045
(3.04 %)		 20,313
(2.11 %)		 17,745
(1.38 %)		 n/a 41.39
(91.90 %)		 146,713
(8.12 %)		 28
(100.00 %)		 4,875,400
(38.43 %)		 1,454,350
(2.93 %)		 13,104,717
(28.82 %)		 16,715
(0.45 %)
466 southern tamandua (mTamTet1 alternate hap 2022)
GCA_023853755.1		 n/a 20,179
(1.21 %)		 24,249
(1.19 %)		 n/a 39.54
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 7,866
(100.00 %)		 3,953,031
(35.88 %)		 531,111
(1.14 %)		 16,354,874
(39.96 %)		 59,907
(1.35 %)
467 southern tamandua (mTamTet1 primary hap 2022)
GCA_023851605.1		 n/a 20,058
(1.26 %)		 22,196
(1.13 %)		 n/a 39.48
(99.44 %)		 961
(0.56 %)		 201
(100.00 %)		 4,037,291
(46.02 %)		 593,019
(1.17 %)		 18,033,833
(40.56 %)		 65,039
(1.33 %)
468 southern three-banded armadillo
GCA_004025125.1		 n/a 29,138
(0.73 %)		 56,522
(0.75 %)		 n/a 39.20
(99.82 %)		 15,801
(0.04 %)		 2,941,308
(99.96 %)		 6,990,740
(38.88 %)		 839,452
(1.23 %)		 24,805,397
(43.95 %)		 71,951
(0.98 %)
469 southern two-toed sloth (mChoDid1 alternate hap 2020)
GCA_015220265.1		 n/a 22,897
(1.23 %)		 27,007
(1.18 %)		 n/a 39.87
(100.00 %)		 70
(0.00 %)		 12,050
(100.00 %)		 4,502,020
(38.27 %)		 576,759
(1.02 %)		 17,143,050
(40.65 %)		 51,339
(1.15 %)
470 southern two-toed sloth (mChoDid1 primary hap 2020)
GCF_015220235.1		 63,054
(2.39 %)		 21,998
(1.29 %)		 23,177
(1.18 %)		 45,345
(1.69 %)		 39.89
(97.48 %)		 1,243
(2.52 %)		 146
(100.00 %)		 4,559,690
(39.66 %)		 577,607
(1.02 %)		 16,594,630
(40.50 %)		 51,430
(1.14 %)
471 southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 refseq)
GCF_000283155.1		 37,037
(2.11 %)		 18,398
(1.71 %)		 19,753
(1.44 %)		 n/a 40.90
(96.05 %)		 54,737
(3.96 %)		 57,824
(96.04 %)		 3,685,898
(38.31 %)		 421,694
(0.97 %)		 14,765,529
(28.93 %)		 36,281
(1.02 %)
472 Sowerby's beaked whale
GCA_004027085.1		 n/a 22,800
(1.32 %)		 38,247
(1.17 %)		 n/a 41.68
(99.84 %)		 8,597
(0.03 %)		 1,810,317
(99.97 %)		 5,520,986
(45.05 %)		 1,081,962
(2.69 %)		 13,480,261
(43.01 %)		 69,001
(1.39 %)
473 sperm whale (SW-GA 2023)
GCF_002837175.3		 62,615
(2.83 %)		 19,485
(1.75 %)		 22,707
(1.41 %)		 n/a 41.33
(95.82 %)		 121,387
(4.20 %)		 133,555
(95.80 %)		 3,906,439
(36.43 %)		 691,647
(2.39 %)		 13,489,368
(32.95 %)		 86,751
(2.23 %)
474 star-nosed mole
GCF_000260355.1		 30,444
(2.86 %)		 16,116
(1.82 %)		 17,403
(1.78 %)		 n/a 41.55
(95.10 %)		 82,557
(4.92 %)		 84,595
(95.08 %)		 1,855,039
(18.90 %)		 308,473
(0.86 %)		 9,571,561
(26.02 %)		 48,079
(2.76 %)
475 Steller sea lion
GCF_004028035.1		 46,044
(2.38 %)		 21,171
(1.78 %)		 21,626
(1.43 %)		 36,701
(1.75 %)		 41.38
(99.41 %)		 18,994
(0.59 %)		 24,485
(99.41 %)		 4,556,415
(43.53 %)		 577,797
(1.09 %)		 13,545,012
(33.71 %)		 51,355
(1.45 %)
476 Stephens's kangaroo rat
GCA_004024685.1		 n/a 20,638
(1.19 %)		 43,541
(1.37 %)		 n/a 41.90
(99.85 %)		 8,882
(0.04 %)		 1,278,525
(99.96 %)		 4,886,095
(30.36 %)		 1,229,832
(5.30 %)		 11,334,494
(44.33 %)		 38,450
(1.17 %)
477 steppe mouse (ZRU 2018)
GCA_003336285.1		 n/a 22,032
(2.17 %)		 20,891
(1.41 %)		 n/a 41.70
(95.78 %)		 123,681
(4.24 %)		 161,217
(95.76 %)		 4,964,415
(42.35 %)		 1,414,584
(2.75 %)		 12,989,925
(31.80 %)		 17,544
(0.44 %)
478 straw-colored fruit bat
GCA_000465285.1		 n/a 20,161
(1.66 %)		 40,283
(1.50 %)		 n/a 39.24
(99.62 %)		 154,908
(0.40 %)		 288,446
(99.60 %)		 2,814,732
(32.92 %)		 372,539
(1.01 %)		 12,351,823
(25.93 %)		 67,245
(2.34 %)
479 stripe-headed round-eared bat
GCA_004024845.1		 n/a 20,248
(1.62 %)		 29,173
(1.61 %)		 n/a 42.04
(99.96 %)		 2,860
(0.01 %)		 252,670
(99.99 %)		 3,018,746
(29.48 %)		 333,243
(0.74 %)		 12,128,116
(30.51 %)		 59,513
(1.87 %)
480 striped dolphin (alternate hap 2023)
GCA_951394445.1		 n/a 18,204
(1.54 %)		 21,036
(1.34 %)		 n/a 42.07
(100.00 %)		 n/a 3,464
(100.00 %)		 3,767,720
(35.65 %)		 1,102,723
(10.92 %)		 11,794,617
(40.96 %)		 67,537
(3.57 %)
481 striped dolphin (primary hap 2023)
GCA_951394435.1		 n/a 18,595
(1.48 %)		 20,637
(1.29 %)		 n/a 42.18
(99.99 %)		 993
(0.01 %)		 639
(100.00 %)		 4,097,623
(35.88 %)		 1,442,973
(13.60 %)		 12,327,244
(43.08 %)		 68,498
(4.29 %)
482 striped hyena (BS54 2019 Broad)
GCA_004023945.1		 n/a 22,373
(1.45 %)		 39,382
(1.45 %)		 n/a 41.66
(99.93 %)		 11,849
(0.05 %)		 362,072
(99.95 %)		 5,048,667
(42.42 %)		 712,073
(1.24 %)		 13,879,012
(34.58 %)		 69,835
(2.20 %)
483 striped hyena (Hyena2069 2018 Potsdam U)
GCF_003009895.1		 48,870
(2.41 %)		 18,793
(1.67 %)		 20,950
(1.44 %)		 n/a 41.56
(99.29 %)		 23,058
(0.71 %)		 5,761
(100.00 %)		 4,782,500
(41.88 %)		 701,157
(1.32 %)		 13,436,624
(33.05 %)		 58,977
(2.20 %)
484 Sumatran rhinoceros (Ipuh 2017)
GCA_002844835.1		 n/a 20,368
(1.53 %)		 24,204
(1.23 %)		 n/a 41.05
(95.54 %)		 50,876
(4.40 %)		 1,112,463
(95.60 %)		 4,516,240
(39.90 %)		 561,540
(1.56 %)		 15,821,451
(34.68 %)		 45,201
(1.03 %)
485 Sunda flying lemur (2014 WashU)
GCF_000696425.1		 34,734
(1.83 %)		 21,356
(1.55 %)		 25,832
(1.21 %)		 n/a 40.21
(87.96 %)		 412,608
(12.07 %)		 511,878
(87.93 %)		 4,961,153
(38.35 %)		 854,441
(3.33 %)		 17,562,576
(28.82 %)		 82,988
(1.05 %)
486 Sunda flying lemur (US047 2019 Broad)
GCA_004027255.1		 n/a 24,882
(1.29 %)		 43,546
(1.12 %)		 n/a 40.46
(99.88 %)		 5,895
(0.02 %)		 1,655,642
(99.98 %)		 5,807,241
(38.62 %)		 953,765
(2.48 %)		 18,836,777
(37.68 %)		 114,955
(1.43 %)
487 tailed tailless bat
GCA_004027475.1		 n/a 19,920
(1.58 %)		 28,017
(1.58 %)		 n/a 41.76
(99.95 %)		 4,640
(0.02 %)		 341,895
(99.98 %)		 3,139,817
(30.43 %)		 381,536
(0.81 %)		 12,069,229
(32.73 %)		 54,528
(2.15 %)
488 takin (Tak-1 2022)
GCF_023091745.1		 31,914
(1.65 %)		 19,290
(1.42 %)		 21,656
(1.27 %)		 n/a 43.32
(100.00 %)		 152
(0.00 %)		 1,363
(100.00 %)		 3,256,033
(21.01 %)		 714,375
(8.32 %)		 13,010,154
(44.58 %)		 49,134
(7.43 %)
489 Talazac's shrew tenrec
GCA_004026705.1		 n/a 22,605
(0.81 %)		 50,725
(1.09 %)		 n/a 43.03
(99.93 %)		 6,619
(0.02 %)		 795,514
(99.98 %)		 3,493,378
(14.58 %)		 705,274
(1.31 %)		 20,975,335
(36.85 %)		 70,793
(1.26 %)
490 tammar wallaby (mMacEug1 alternate hap 2023)
GCA_028389975.1		 n/a 11,133
(0.77 %)		 13,869
(0.98 %)		 n/a 38.63
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 14,285
(100.00 %)		 3,114,522
(26.10 %)		 661,874
(3.02 %)		 11,667,649
(38.41 %)		 12,393
(0.46 %)
491 tammar wallaby (mMacEug1 primary hap 2023)
GCA_028372415.1		 n/a 17,652
(0.77 %)		 15,774
(0.88 %)		 n/a 38.73
(99.81 %)		 515
(0.19 %)		 315
(100.00 %)		 5,836,160
(26.14 %)		 1,193,709
(2.72 %)		 22,682,658
(39.52 %)		 23,629
(0.48 %)
492 Tasmanian devil
GCF_902635505.1		 52,057
(2.36 %)		 15,918
(0.85 %)		 16,111
(0.91 %)		 n/a 36.16
(100.00 %)		 354
(0.00 %)		 106
(100.00 %)		 6,789,158
(44.28 %)		 1,246,027
(2.19 %)		 21,434,803
(41.20 %)		 23,609
(0.65 %)
493 thirteen-lined ground squirrel (2021 HiC)
GCF_016881025.1		 69,352
(3.50 %)		 18,934
(1.68 %)		 16,775
(1.37 %)		 n/a 39.91
(93.25 %)		 146,412
(6.77 %)		 7,132
(100.00 %)		 4,262,890
(35.64 %)		 640,624
(1.64 %)		 14,118,452
(27.90 %)		 28,317
(0.64 %)
494 tiger
GCF_018350195.1		 71,226
(2.84 %)		 18,513
(1.68 %)		 19,919
(1.39 %)		 n/a 41.64
(100.00 %)		 65
(0.00 %)		 131
(100.00 %)		 4,878,003
(42.77 %)		 912,595
(1.82 %)		 13,804,650
(33.76 %)		 64,312
(2.55 %)
495 Townsend's big-eared bat (haplotype 1 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022)
GCA_026230055.1		 n/a 19,370
(1.77 %)		 21,062
(1.61 %)		 n/a 42.81
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 610
(100.00 %)		 2,923,694
(25.49 %)		 772,382
(3.25 %)		 10,654,074
(37.41 %)		 48,226
(2.42 %)
496 Townsend's big-eared bat (haplotype 2 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022)
GCA_026230045.1		 n/a 18,627
(1.82 %)		 20,108
(1.67 %)		 n/a 42.95
(100.00 %)		 217
(0.00 %)		 182
(100.00 %)		 2,733,927
(24.79 %)		 715,258
(3.17 %)		 10,099,456
(36.35 %)		 47,139
(2.58 %)
497 Transcaucasian mole vole
GCA_001685075.1		 n/a 20,173
(1.62 %)		 18,627
(1.30 %)		 n/a 41.51
(96.09 %)		 440,846
(3.96 %)		 499,269
(96.04 %)		 3,827,136
(25.51 %)		 810,597
(2.65 %)		 13,634,524
(27.54 %)		 9,596
(0.16 %)
498 Upper Galilee mountains blind mole rat (2095 2014 refseq)
GCF_000622305.1		 54,667
(2.07 %)		 19,704
(1.26 %)		 21,262
(1.20 %)		 n/a 41.26
(95.18 %)		 201,121
(4.83 %)		 356,097
(95.17 %)		 6,165,645
(34.95 %)		 1,197,750
(2.77 %)		 16,282,383
(36.21 %)		 22,905
(0.49 %)
499 Vancouver Island marmot (RANI-1049 2019)
GCA_005458795.1		 n/a 19,867
(1.62 %)		 15,893
(1.33 %)		 n/a 39.77
(94.43 %)		 296,819
(5.60 %)		 315,631
(94.40 %)		 4,452,628
(33.94 %)		 751,210
(1.84 %)		 13,917,879
(30.08 %)		 26,541
(0.58 %)
500 vaquita (alternate hap mPhoSin1 2019)
GCA_008692045.1		 n/a 9,367
(1.66 %)		 11,297
(1.30 %)		 n/a 41.50
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 9,470
(100.00 %)		 1,708,360
(43.81 %)		 267,584
(1.67 %)		 5,373,410
(33.52 %)		 29,783
(1.94 %)
501 vaquita (mPhoSin1 2019)
GCF_008692025.1		 60,106
(3.00 %)		 18,611
(1.76 %)		 20,103
(1.39 %)		 35,176
(2.22 %)		 41.36
(99.66 %)		 212
(0.34 %)		 64
(100.00 %)		 4,067,454
(44.25 %)		 602,407
(1.34 %)		 12,468,582
(35.55 %)		 66,806
(1.79 %)
502 water buffalo (Mediterranean 2018)
GCF_003121395.1		 69,771
(3.14 %)		 19,465
(1.58 %)		 21,849
(1.37 %)		 46,051
(1.86 %)		 41.81
(99.99 %)		 410
(0.01 %)		 509
(100.00 %)		 5,407,697
(47.11 %)		 473,976
(1.54 %)		 13,015,899
(41.23 %)		 43,120
(1.15 %)
503 water buffalo (Murrah 2021)
GCF_019923935.1		 80,552
(3.26 %)		 19,402
(1.59 %)		 20,375
(1.31 %)		 n/a 41.75
(100.00 %)		 659
(0.00 %)		 26
(100.00 %)		 5,358,548
(47.11 %)		 447,338
(1.14 %)		 13,034,537
(41.28 %)		 40,189
(1.07 %)
504 Weddell seal (WS11-02 2013 refseq)
GCF_000349705.1		 48,251
(2.73 %)		 21,063
(1.73 %)		 22,333
(1.43 %)		 n/a 41.39
(70.44 %)		 152,836
(29.58 %)		 169,547
(70.42 %)		 4,420,479
(41.72 %)		 471,256
(0.66 %)		 13,410,237
(22.09 %)		 48,738
(1.01 %)
505 western European hedgehog (2012 refseq)
GCF_000296755.1		 29,923
(1.67 %)		 18,067
(1.33 %)		 19,777
(1.35 %)		 n/a 41.54
(85.94 %)		 219,764
(14.09 %)		 225,567
(85.91 %)		 6,594,783
(45.66 %)		 1,271,533
(2.29 %)		 12,374,161
(42.02 %)		 28,528
(0.71 %)
506 western European hedgehog (alternate hap 2023)
GCA_950295305.1		 n/a 14,370
(1.06 %)		 24,297
(1.27 %)		 n/a 42.08
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 26,601
(100.00 %)		 3,360,923
(19.59 %)		 1,043,098
(3.92 %)		 8,511,380
(53.68 %)		 23,321
(0.97 %)
507 western European hedgehog (primary hap 2023 refseq)
GCF_950295315.1		 61,103
(2.36 %)		 18,125
(1.16 %)		 20,689
(1.21 %)		 n/a 42.00
(99.97 %)		 3,760
(0.03 %)		 1,174
(100.00 %)		 4,891,329
(19.68 %)		 1,507,929
(3.81 %)		 12,571,105
(54.50 %)		 32,667
(0.90 %)
508 western European house mouse (WSB_EiJ v3 2022)
GCA_921998345.2		 n/a 21,722
(2.14 %)		 19,586
(1.39 %)		 108,856
(4.46 %)		 41.81
(98.87 %)		 1,233
(1.13 %)		 233
(100.00 %)		 4,634,551
(40.61 %)		 1,541,826
(3.49 %)		 13,030,566
(35.21 %)		 22,985
(0.56 %)
509 western spotted skunk
GCA_004023965.1		 n/a 21,665
(1.46 %)		 34,370
(1.32 %)		 n/a 41.61
(99.92 %)		 11,822
(0.05 %)		 433,831
(99.95 %)		 4,889,781
(40.77 %)		 901,906
(2.30 %)		 13,931,764
(34.80 %)		 54,394
(1.54 %)
510 western wild mouse (SPRET_EiJ v3 2022)
GCA_921997135.2		 n/a 21,699
(2.10 %)		 18,837
(1.32 %)		 n/a 41.69
(99.51 %)		 1,576
(0.49 %)		 143
(100.00 %)		 4,507,329
(41.24 %)		 1,517,241
(3.77 %)		 12,832,499
(36.17 %)		 22,568
(0.53 %)
511 white-beaked dolphin (alternate hap 2023)
GCA_949774935.1		 n/a 17,639
(1.50 %)		 25,684
(1.35 %)		 n/a 42.08
(100.00 %)		 n/a 25,619
(100.00 %)		 3,039,324
(36.05 %)		 637,912
(8.02 %)		 9,746,398
(38.98 %)		 56,325
(3.33 %)
512 white-beaked dolphin (primary hap 2023 refseq)
GCF_949774975.1		 59,982
(2.43 %)		 18,737
(1.57 %)		 20,767
(1.34 %)		 n/a 41.91
(99.99 %)		 1,070
(0.01 %)		 410
(100.00 %)		 3,820,566
(36.21 %)		 922,103
(8.43 %)		 12,304,360
(39.74 %)		 68,551
(3.58 %)
513 white-footed mouse
GCF_004664715.2		 54,479
(2.82 %)		 19,971
(1.69 %)		 20,132
(1.42 %)		 n/a 42.23
(99.95 %)		 2,299
(0.05 %)		 1,857
(100.00 %)		 5,060,487
(30.71 %)		 1,258,073
(2.85 %)		 14,007,098
(32.99 %)		 23,456
(0.67 %)
514 white-tailed deer (Pink-7 2017 refseq)
GCF_002102435.1		 57,774
(2.93 %)		 20,661
(1.75 %)		 23,085
(1.50 %)		 40,987
(1.94 %)		 41.55
(99.10 %)		 107,058
(0.91 %)		 48,653
(99.10 %)		 4,800,704
(41.29 %)		 413,129
(2.59 %)		 13,296,779
(34.22 %)		 44,165
(1.19 %)
515 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 alternate hap 2022)
GCA_024140225.1		 n/a 12,198
(1.10 %)		 18,494
(1.29 %)		 n/a 39.87
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 14,841
(100.00 %)		 1,725,021
(17.81 %)		 802,415
(4.26 %)		 8,321,474
(45.72 %)		 15,669
(0.79 %)
516 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 primary hap 2022)
GCF_024139225.1		 40,430
(1.81 %)		 17,575
(1.21 %)		 21,880
(1.35 %)		 47,496
(1.55 %)		 39.81
(99.57 %)		 1,010
(0.43 %)		 147
(100.00 %)		 2,846,063
(18.57 %)		 1,252,362
(3.89 %)		 13,776,063
(46.50 %)		 24,589
(0.78 %)
517 wild Bactrian camel (BCGSAC Cfer 1.0 YT-003-E 2020)
GCF_009834535.1		 70,235
(4.11 %)		 18,202
(1.93 %)		 20,199
(1.66 %)		 42,728
(2.35 %)		 41.66
(99.99 %)		 2,345
(0.01 %)		 2,043
(100.00 %)		 3,091,018
(33.31 %)		 332,720
(5.33 %)		 12,161,286
(28.79 %)		 55,524
(1.75 %)
518 wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 refseq)
GCF_000311805.1		 34,726
(2.40 %)		 18,746
(1.96 %)		 17,104
(1.61 %)		 n/a 41.28
(98.83 %)		 60,971
(1.18 %)		 68,872
(98.82 %)		 2,991,821
(33.93 %)		 353,632
(1.23 %)		 12,349,615
(25.12 %)		 45,437
(1.02 %)
519 wild goat
GCA_000978405.1		 n/a 19,104
(1.48 %)		 16,198
(1.21 %)		 n/a 41.91
(91.72 %)		 279,195
(8.31 %)		 368,693
(91.69 %)		 5,563,294
(45.39 %)		 452,402
(1.99 %)		 13,802,376
(35.47 %)		 41,935
(0.63 %)
520 wild yak
GCF_000298355.1		 29,776
(1.92 %)		 19,936
(1.62 %)		 19,914
(1.32 %)		 n/a 41.71
(95.48 %)		 192,006
(4.54 %)		 233,198
(95.46 %)		 5,348,663
(46.08 %)		 449,880
(1.38 %)		 13,572,902
(36.62 %)		 41,147
(0.82 %)
521 woodchuck (v1.1 L192 2022)
GCF_021218885.2		 68,030
(3.47 %)		 19,116
(1.55 %)		 21,017
(1.38 %)		 n/a 39.92
(100.00 %)		 47
(0.00 %)		 3,380
(100.00 %)		 5,285,788
(43.20 %)		 912,552
(2.73 %)		 14,538,866
(35.15 %)		 36,914
(1.02 %)
522 woodland dormouse
GCA_004027655.1		 n/a 23,556
(1.09 %)		 55,517
(1.33 %)		 n/a 41.52
(99.86 %)		 15,691
(0.06 %)		 1,283,630
(99.94 %)		 7,674,195
(34.99 %)		 1,698,258
(3.76 %)		 13,705,886
(42.23 %)		 68,562
(1.41 %)
523 woodland thicket rat
GCF_004785775.1		 43,129
(2.40 %)		 22,710
(2.13 %)		 21,042
(1.49 %)		 n/a 41.17
(98.57 %)		 76,623
(1.44 %)		 23,656
(100.00 %)		 4,732,544
(38.04 %)		 1,424,025
(3.23 %)		 13,549,399
(30.42 %)		 18,232
(0.48 %)
524 Yangtze finless porpoise (v2 wild 2018 refseq)
GCF_003031525.2		 43,297
(2.49 %)		 18,747
(1.81 %)		 19,638
(1.46 %)		 n/a 41.28
(99.29 %)		 52,647
(0.72 %)		 66,343
(99.28 %)		 3,547,466
(35.83 %)		 540,760
(1.65 %)		 12,691,756
(32.88 %)		 59,050
(1.48 %)
525 Yangtze River dolphin (v1.1 BGI 2013 refseq)
GCF_000442215.2		 26,115
(1.61 %)		 18,978
(1.74 %)		 20,661
(1.39 %)		 n/a 41.24
(98.69 %)		 123,788
(1.33 %)		 148,598
(98.67 %)		 3,788,303
(37.04 %)		 690,288
(1.96 %)		 12,841,906
(35.04 %)		 62,458
(1.54 %)
526 yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.1 2019)
GCF_003676075.3		 42,654
(2.16 %)		 19,547
(1.52 %)		 21,406
(1.40 %)		 n/a 39.89
(97.96 %)		 35,509
(2.04 %)		 66,442
(97.96 %)		 3,814,223
(27.39 %)		 800,865
(1.96 %)		 14,323,977
(32.63 %)		 34,122
(0.91 %)
527 yellow-footed antechinus (v2 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021)
GCF_016432865.1		 47,606
(2.50 %)		 15,703
(0.78 %)		 16,155
(0.90 %)		 n/a 36.21
(99.99 %)		 620
(0.01 %)		 486
(100.00 %)		 5,191,383
(23.81 %)		 1,269,772
(2.59 %)		 21,430,585
(42.69 %)		 28,118
(0.66 %)
528 yellow-spotted hyrax
GCA_004026845.1		 n/a 20,424
(0.86 %)		 43,984
(1.27 %)		 n/a 40.93
(99.94 %)		 3,815
(0.01 %)		 971,748
(99.99 %)		 5,365,974
(31.41 %)		 435,699
(1.22 %)		 21,229,266
(45.17 %)		 38,521
(0.68 %)
529 yellow-spotted hyrax (mHetBru1 2023)
GCA_028571685.1		 n/a 17,610
(1.00 %)		 20,322
(1.04 %)		 n/a 40.80
(100.00 %)		 276
(0.00 %)		 62
(100.00 %)		 3,295,935
(23.58 %)		 389,907
(6.37 %)		 19,525,382
(45.90 %)		 31,831
(0.63 %)
530 yellow-spotted hyrax (mHetBru1 alternate hap 2023)
GCA_028571665.1		 n/a 16,320
(1.03 %)		 20,318
(1.13 %)		 n/a 40.93
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 4,169
(100.00 %)		 2,911,332
(23.50 %)		 347,110
(4.57 %)		 17,256,419
(44.04 %)		 28,674
(0.68 %)
531 Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP alternate hap 2023)
GCA_028536395.1		 n/a 19,188
(1.79 %)		 21,673
(1.72 %)		 n/a 43.03
(100.00 %)		 215
(0.00 %)		 250
(100.00 %)		 3,043,589
(24.76 %)		 773,853
(4.49 %)		 10,648,494
(37.26 %)		 61,910
(2.52 %)
532 Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP primary hap 2023)
GCA_028538775.1		 n/a 18,587
(1.82 %)		 21,049
(1.76 %)		 n/a 43.22
(100.00 %)		 209
(0.00 %)		 685
(100.00 %)		 2,890,086
(24.28 %)		 719,555
(4.26 %)		 10,089,514
(36.35 %)		 60,975
(2.61 %)
533 zebu cattle (Nelore 2014 refseq)
GCF_000247795.1		 39,817
(2.52 %)		 18,603
(1.59 %)		 18,779
(1.29 %)		 n/a 41.75
(92.62 %)		 6,941,272
(7.66 %)		 253,770
(92.59 %)		 5,119,428
(46.84 %)		 358,908
(0.88 %)		 13,431,672
(36.60 %)		 35,241
(0.84 %)
TOTALS:total assembly count 533

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 214 assemblies assembly stats track stats
Mammals 533 assemblies assembly stats track stats
Birds 353 assemblies assembly stats track stats
Fishes 387 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 220 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 698 assemblies assembly stats track stats
Plants 296 assemblies assembly stats track stats
Fungi 648 assemblies assembly stats track stats
Viruses 281 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 96 assemblies assembly stats track stats
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VGP - Vertebrate Genome Project 865 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats