Fish Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of fish only.

See also: hub access, assembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 Acadian redfish (fSebFas1 primary hap 2024 refseq)
GCF_043250625.1		 59,397
(10.47 %)		 15,453
(2.37 %)		 50,184
(6.16 %)		 n/a 40.90
(99.99 %)		 472
(0.01 %)		 204
(100.00 %)		 529,455
(3.89 %)		 444,047
(7.93 %)		 4,765,018
(37.01 %)		 39,918
(2.01 %)
2 alewife (anadromous, Long Island Sound Yale_2024_CS 2024)
GCF_046254945.1		 51,219
(7.63 %)		 15,894
(1.91 %)		 68,940
(6.15 %)		 n/a 43.01
(99.98 %)		 1,061
(0.02 %)		 329
(100.00 %)		 3,296,957
(52.37 %)		 1,419,758
(14.07 %)		 4,202,787
(42.59 %)		 48,047
(2.20 %)
3 alligator pipefish (LvHL_M 2021)
GCF_019802595.1		 54,226
(11.15 %)		 13,427
(2.67 %)		 46,903
(5.94 %)		 n/a 42.94
(100.00 %)		 144
(0.00 %)		 143
(100.00 %)		 1,200,994
(30.62 %)		 143,062
(2.20 %)		 3,921,676
(38.03 %)		 67,978
(8.92 %)
4 allis shad
GCF_017589495.1		 48,520
(8.47 %)		 15,371
(2.28 %)		 58,686
(5.84 %)		 n/a 42.99
(99.91 %)		 1,541
(0.09 %)		 1,095
(100.00 %)		 1,190,406
(9.30 %)		 1,205,679
(11.28 %)		 3,960,328
(38.81 %)		 36,494
(1.83 %)
5 Amazon molly
GCF_000485575.1		 56,958
(11.69 %)		 15,117
(2.64 %)		 30,114
(6.60 %)		 n/a 39.16
(95.38 %)		 36,429
(4.64 %)		 31,058
(95.36 %)		 346,461
(2.03 %)		 188,557
(1.44 %)		 5,139,633
(26.01 %)		 35,229
(1.82 %)
6 amberjack S.aureovittata (China HTS-2021-v1 2021)
GCF_021018895.1		 47,198
(13.10 %)		 15,500
(3.14 %)		 41,230
(6.67 %)		 n/a 40.79
(99.99 %)		 150
(0.01 %)		 31
(100.00 %)		 1,230,524
(26.57 %)		 398,694
(5.41 %)		 4,106,609
(25.60 %)		 15,656
(0.99 %)
7 American shad (fAloSap1 alternate hap 2021)
GCA_018492705.1		 n/a 15,901
(2.25 %)		 61,133
(6.37 %)		 n/a 43.14
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 5,411
(100.00 %)		 2,043,181
(23.64 %)		 1,141,539
(11.35 %)		 3,668,314
(38.60 %)		 40,218
(2.14 %)
8 American shad (primary hap 2021)
GCF_018492685.1		 70,400
(9.39 %)		 16,145
(2.29 %)		 60,087
(6.26 %)		 76,974
(8.55 %)		 43.18
(99.45 %)		 1,639
(0.55 %)		 74
(100.00 %)		 1,297,174
(9.39 %)		 1,245,221
(12.59 %)		 3,857,267
(39.43 %)		 42,699
(2.23 %)
9 Andian cavefish (hap1 2023 genbank)
GCA_030014385.1		 n/a 15,802
(1.97 %)		 47,186
(4.62 %)		 n/a 40.27
(100.00 %)		 198
(0.00 %)		 349
(100.00 %)		 2,616,870
(40.73 %)		 658,784
(9.71 %)		 5,197,126
(48.95 %)		 48,344
(2.62 %)
10 Andian cavefish (hap1 2023 refseq)
GCF_030014385.1		 42,881
(5.97 %)		 15,802
(1.97 %)		 47,186
(4.62 %)		 n/a 40.27
(100.00 %)		 198
(0.00 %)		 349
(100.00 %)		 2,616,870
(40.73 %)		 658,784
(9.71 %)		 5,197,126
(48.95 %)		 48,344
(2.62 %)
11 annual killifish
GCF_001266775.1		 38,517
(8.87 %)		 14,027
(2.45 %)		 27,798
(5.86 %)		 n/a 39.29
(80.23 %)		 1,025,519
(19.94 %)		 168,368
(80.17 %)		 349,927
(2.63 %)		 296,826
(3.18 %)		 5,039,517
(28.69 %)		 26,364
(1.18 %)
12 Antarctic jonasfish (primary hap 2024)
GCA_963971535.1		 n/a 16,678
(0.56 %)		 151,361
(4.03 %)		 n/a 44.57
(99.91 %)		 15,113
(0.09 %)		 5,983
(100.00 %)		 12,251,532
(51.73 %)		 3,521,157
(17.69 %)		 10,051,020
(68.37 %)		 494,595
(10.52 %)
13 Antarctic lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_951214905.1		 n/a 17,318
(1.49 %)		 80,097
(5.79 %)		 n/a 43.49
(100.00 %)		 n/a 11,436
(100.00 %)		 5,482,467
(36.71 %)		 1,454,729
(18.84 %)		 6,756,226
(47.56 %)		 92,057
(3.50 %)
14 Antarctic lanternfish (primary hap 2023)
GCA_951216825.1		 n/a 17,342
(1.44 %)		 78,914
(5.48 %)		 n/a 43.57
(99.96 %)		 3,179
(0.04 %)		 1,901
(100.00 %)		 5,980,457
(37.18 %)		 1,633,782
(21.76 %)		 6,279,725
(52.83 %)		 104,688
(3.57 %)
15 Antarctic spiny plunderfish (primary hap 2020)
GCA_902827135.1		 n/a 14,859
(1.97 %)		 60,431
(5.73 %)		 n/a 41.82
(99.99 %)		 1,039
(0.01 %)		 1,541
(100.00 %)		 461,253
(3.08 %)		 434,124
(6.81 %)		 3,499,945
(42.99 %)		 60,941
(3.20 %)
16 Arctic char (2024)
GCF_045679555.1		 101,825
(6.80 %)		 26,394
(1.53 %)		 107,089
(4.26 %)		 n/a 43.53
(99.98 %)		 3,854
(0.02 %)		 939
(100.00 %)		 1,090,104
(4.07 %)		 1,787,017
(23.51 %)		 9,220,961
(56.45 %)		 78,798
(2.30 %)
17 Arctic char (CBP00131 primary hap 2024)
GCA_036784965.1		 n/a 22,376
(1.44 %)		 97,559
(4.71 %)		 n/a 43.37
(99.97 %)		 3,235
(0.03 %)		 4,404
(99.97 %)		 999,920
(4.22 %)		 1,630,911
(26.08 %)		 7,875,105
(58.08 %)		 70,947
(2.59 %)
18 Arctic char (IW2-2015 2018)
GCF_002910315.2		 72,597
(5.72 %)		 23,967
(1.55 %)		 45,775
(3.69 %)		 n/a 43.16
(93.25 %)		 1,718,015
(6.84 %)		 16,700
(99.99 %)		 1,011,348
(4.06 %)		 1,666,148
(10.50 %)		 10,597,529
(44.77 %)		 76,282
(1.94 %)
19 Aristotle's catfish (alternate hap 2022)
GCA_946807865.1		 n/a 14,032
(2.44 %)		 39,770
(4.92 %)		 n/a 38.85
(100.00 %)		 n/a 7,617
(100.00 %)		 1,808,149
(37.98 %)		 583,449
(10.56 %)		 4,203,368
(40.67 %)		 24,867
(2.06 %)
20 Aristotle's catfish (primary hap 2022)
GCA_946808225.1		 n/a 15,455
(2.53 %)		 40,077
(4.90 %)		 86,346
(8.45 %)		 38.90
(99.98 %)		 795
(0.02 %)		 241
(100.00 %)		 2,045,691
(38.70 %)		 669,975
(11.72 %)		 4,638,765
(42.07 %)		 28,277
(1.93 %)
21 Arkansas darter
GCF_013103735.1		 51,282
(9.79 %)		 14,588
(2.90 %)		 42,306
(6.27 %)		 n/a 40.52
(99.50 %)		 35,052
(0.52 %)		 4,664
(100.00 %)		 418,294
(3.29 %)		 331,380
(3.74 %)		 4,153,309
(26.60 %)		 15,489
(0.95 %)
22 arroyo chub (AC-1 alternate hap 2022)
GCA_026230005.1		 n/a 17,862
(2.29 %)		 70,667
(5.50 %)		 n/a 40.01
(100.00 %)		 327
(0.00 %)		 179
(100.00 %)		 2,876,989
(50.39 %)		 700,511
(9.88 %)		 5,977,913
(44.08 %)		 104,320
(8.02 %)
23 arroyo chub (AC-1 primary hap 2022)
GCA_026230025.1		 n/a 18,025
(2.28 %)		 71,255
(5.50 %)		 n/a 40.03
(100.00 %)		 318
(0.00 %)		 341
(100.00 %)		 2,884,301
(50.42 %)		 702,464
(9.98 %)		 5,989,299
(44.18 %)		 105,945
(8.03 %)
24 Asian bonytongue (2019)
GCF_900964775.1		 50,328
(9.13 %)		 16,526
(2.73 %)		 38,780
(6.64 %)		 72,662
(8.52 %)		 44.16
(99.99 %)		 145
(0.01 %)		 72
(100.00 %)		 504,673
(3.06 %)		 216,136
(1.69 %)		 4,323,242
(26.50 %)		 88,517
(10.73 %)
25 Asian bonytongue (alternate hap)
GCA_900964985.2		 n/a 16,053
(2.73 %)		 74,777
(7.26 %)		 n/a 44.15
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,006
(100.00 %)		 482,351
(3.03 %)		 207,018
(1.68 %)		 4,139,370
(26.26 %)		 85,546
(10.82 %)
26 Asian redtail catfish (EC202008001 2021)
GCF_019097595.1		 51,030
(10.40 %)		 15,549
(2.60 %)		 42,858
(5.39 %)		 n/a 39.70
(100.00 %)		 107
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 1,718,992
(31.80 %)		 749,009
(14.09 %)		 4,206,758
(37.30 %)		 19,230
(1.16 %)
27 Atlantic bluefin tuna (primary hap 2024 genbank)
GCA_963924715.1		 n/a 15,722
(2.57 %)		 43,026
(5.68 %)		 n/a 39.77
(99.99 %)		 468
(0.01 %)		 120
(100.00 %)		 1,608,686
(33.02 %)		 253,749
(4.14 %)		 5,181,115
(27.80 %)		 14,488
(0.90 %)
28 Atlantic bluefin tuna (primary hap 2024 refseq)
GCF_963924715.1		 54,426
(12.09 %)		 15,720
(2.57 %)		 43,026
(5.68 %)		 n/a 39.77
(99.99 %)		 468
(0.01 %)		 119
(100.00 %)		 1,608,682
(33.02 %)		 253,749
(4.14 %)		 5,181,078
(27.80 %)		 14,488
(0.90 %)
29 Atlantic cod (2019)
GCF_902167405.1		 51,642
(11.92 %)		 14,055
(2.62 %)		 36,761
(8.42 %)		 68,438
(9.50 %)		 45.64
(96.48 %)		 1,216
(3.52 %)		 227
(100.00 %)		 790,946
(10.54 %)		 855,327
(13.06 %)		 2,851,161
(33.38 %)		 97,133
(7.82 %)
30 Atlantic cod (alternate hap)
GCA_902167395.1		 n/a 13,366
(2.68 %)		 66,599
(9.29 %)		 n/a 45.55
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 3,592
(100.00 %)		 696,727
(10.13 %)		 749,876
(13.00 %)		 2,554,769
(33.77 %)		 87,167
(8.03 %)
31 Atlantic halibut (2019 refseq)
GCF_009819705.1		 52,130
(11.46 %)		 14,961
(3.19 %)		 45,365
(7.48 %)		 69,662
(10.94 %)		 42.21
(99.43 %)		 290
(0.57 %)		 57
(100.00 %)		 428,321
(4.16 %)		 256,153
(3.73 %)		 3,725,981
(24.13 %)		 31,325
(2.25 %)
32 Atlantic halibut (alternate hap 2019)
GCA_009819745.1		 n/a 16,554
(3.01 %)		 54,832
(7.45 %)		 n/a 42.29
(100.00 %)		 62
(0.00 %)		 4,053
(100.00 %)		 494,008
(4.23 %)		 299,066
(3.87 %)		 4,272,649
(24.46 %)		 36,868
(2.33 %)
33 Atlantic herring (v2)
GCF_900700415.2		 50,946
(10.35 %)		 16,394
(2.60 %)		 61,637
(7.20 %)		 n/a 44.16
(99.89 %)		 1,990
(0.11 %)		 3,687
(99.89 %)		 1,269,688
(11.71 %)		 1,318,661
(13.43 %)		 3,732,801
(32.49 %)		 35,959
(1.97 %)
34 Atlantic horse mackerel (alternate hap 2021)
GCA_905171655.2		 n/a 15,331
(2.42 %)		 52,370
(6.91 %)		 n/a 41.96
(100.00 %)		 74
(0.00 %)		 1,049
(100.00 %)		 1,454,631
(18.29 %)		 383,946
(4.34 %)		 4,363,016
(32.69 %)		 56,416
(3.08 %)
35 Atlantic horse mackerel (primary hap 2021)
GCA_905171665.2		 n/a 15,262
(2.42 %)		 51,857
(6.86 %)		 n/a 41.94
(100.00 %)		 222
(0.00 %)		 153
(100.00 %)		 1,454,219
(18.25 %)		 384,609
(4.72 %)		 4,338,083
(32.80 %)		 56,553
(3.08 %)
36 Atlantic mackerel (primary hap 2023 genbank)
GCA_963691925.1		 n/a 15,291
(2.56 %)		 43,206
(5.92 %)		 n/a 39.78
(99.96 %)		 1,489
(0.04 %)		 666
(100.00 %)		 1,496,244
(26.83 %)		 395,543
(8.92 %)		 4,523,761
(29.92 %)		 13,309
(0.75 %)
37 Atlantic mackerel (primary hap 2023 refseq)
GCF_963691925.1		 34,357
(8.10 %)		 15,289
(2.56 %)		 43,205
(5.92 %)		 n/a 39.78
(99.96 %)		 1,489
(0.04 %)		 665
(100.00 %)		 1,496,240
(26.83 %)		 395,543
(8.92 %)		 4,523,726
(29.93 %)		 13,308
(0.75 %)
38 Atlantic salmon (refseq 2021)
GCF_905237065.1		 112,904
(5.61 %)		 28,077
(1.40 %)		 115,207
(3.75 %)		 183,727
(7.26 %)		 43.42
(100.00 %)		 211
(0.00 %)		 4,222
(100.00 %)		 1,300,611
(4.84 %)		 2,247,891
(25.01 %)		 10,731,814
(59.31 %)		 77,089
(1.86 %)
39 Atlantic salmon (Sally 2015)
GCF_000233375.1		 109,781
(5.45 %)		 26,968
(1.35 %)		 202,772
(19.11 %)		 n/a 43.10
(88.27 %)		 138,207
(11.73 %)		 241,570
(99.97 %)		 1,628,119
(9.46 %)		 2,496,917
(19.18 %)		 10,390,780
(51.80 %)		 79,791
(1.60 %)
40 Atlantic silverside (fMenMen1 hap1 2025)
GCA_048628825.1		 n/a 14,247
(3.16 %)		 47,091
(7.94 %)		 n/a 42.17
(99.99 %)		 867
(0.02 %)		 478
(100.00 %)		 352,705
(4.33 %)		 432,013
(10.15 %)		 2,954,922
(28.67 %)		 41,876
(4.47 %)
41 Atlantic silverside (fMenMen1 hap2 2025)
GCA_048544195.1		 n/a 14,127
(3.23 %)		 45,606
(7.98 %)		 n/a 42.03
(99.99 %)		 804
(0.01 %)		 567
(100.00 %)		 333,253
(4.04 %)		 384,132
(9.16 %)		 2,977,533
(27.98 %)		 40,432
(4.35 %)
42 Atlantic turbot (AOZZmale01 2020)
GCF_013347765.1		 60,214
(14.44 %)		 14,860
(3.40 %)		 50,921
(8.07 %)		 76,242
(9.93 %)		 43.38
(100.00 %)		 51
(0.00 %)		 127
(100.00 %)		 449,865
(5.00 %)		 299,255
(7.03 %)		 3,274,219
(25.77 %)		 67,338
(7.00 %)
43 Australian ruff (RE-2024a hap1 2024)
GCA_042242115.1		 n/a 15,457
(2.72 %)		 38,472
(5.59 %)		 n/a 39.70
(100.00 %)		 91
(0.00 %)		 625
(100.00 %)		 476,492
(3.25 %)		 242,097
(6.02 %)		 4,286,693
(33.41 %)		 9,322
(0.80 %)
44 Australian ruff (RE-2024a hap2 2024)
GCA_042242135.1		 n/a 15,534
(2.50 %)		 39,464
(5.26 %)		 n/a 39.77
(100.00 %)		 98
(0.00 %)		 552
(100.00 %)		 498,493
(3.22 %)		 271,314
(7.61 %)		 4,161,752
(38.16 %)		 9,637
(0.93 %)
45 ballan wrasse (2016)
GCF_900080235.1		 42,362
(9.30 %)		 16,129
(2.44 %)		 33,854
(5.87 %)		 n/a 40.89
(99.98 %)		 257
(0.02 %)		 13,466
(100.00 %)		 503,078
(3.93 %)		 321,407
(5.60 %)		 4,329,412
(30.36 %)		 21,221
(1.07 %)
46 ballan wrasse (primary hap 2024 genbank)
GCA_963930695.1		 n/a 15,142
(2.66 %)		 43,601
(6.21 %)		 n/a 40.59
(99.98 %)		 815
(0.02 %)		 133
(100.00 %)		 1,221,802
(30.10 %)		 290,738
(7.79 %)		 4,164,845
(30.34 %)		 17,126
(0.94 %)
47 ballan wrasse (primary hap 2024 refseq)
GCF_963930695.1		 48,592
(12.09 %)		 15,140
(2.66 %)		 43,304
(6.14 %)		 n/a 40.59
(99.98 %)		 815
(0.02 %)		 946
(99.98 %)		 1,221,797
(30.10 %)		 290,736
(7.79 %)		 4,164,799
(30.34 %)		 17,126
(0.94 %)
48 banded archerfish (alternate hap 2021)
GCA_017976295.1		 n/a 15,211
(3.23 %)		 41,620
(7.14 %)		 n/a 41.08
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 2,393
(100.00 %)		 785,178
(17.57 %)		 249,148
(8.36 %)		 3,391,653
(26.49 %)		 13,787
(0.93 %)
49 banded archerfish (primary hap 2021 refseq)
GCF_017976425.1		 42,399
(11.11 %)		 15,310
(3.17 %)		 41,147
(7.01 %)		 62,990
(9.37 %)		 41.11
(99.82 %)		 98
(0.18 %)		 96
(100.00 %)		 463,524
(3.35 %)		 271,913
(9.55 %)		 3,355,326
(28.08 %)		 15,089
(0.96 %)
50 banded electric knifefish (BG-103 2025)
GCF_052324685.1		 68,886
(11.99 %)		 16,359
(2.68 %)		 75,905
(8.35 %)		 n/a 43.73
(99.95 %)		 810
(0.05 %)		 840
(100.00 %)		 1,095,288
(18.40 %)		 868,255
(17.95 %)		 2,693,555
(36.32 %)		 81,652
(5.89 %)
51 banded killifish (hap1 2024)
GCA_037039145.1		 n/a 15,122
(1.44 %)		 65,809
(4.50 %)		 n/a 41.23
(99.74 %)		 293
(0.26 %)		 331
(100.00 %)		 2,545,429
(50.53 %)		 451,939
(5.50 %)		 5,807,705
(42.18 %)		 94,695
(3.92 %)
52 banded killifish (hap2 2024)
GCA_037038625.1		 n/a 15,024
(1.45 %)		 65,141
(4.53 %)		 n/a 41.23
(99.52 %)		 373
(0.48 %)		 196
(100.00 %)		 2,509,508
(50.53 %)		 441,892
(5.11 %)		 6,245,443
(38.22 %)		 93,198
(3.82 %)
53 barbel (alternate hap 2022)
GCA_936446605.1		 n/a 26,794
(3.15 %)		 76,434
(5.64 %)		 n/a 37.81
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 8,035
(100.00 %)		 4,084,361
(52.18 %)		 538,411
(4.25 %)		 7,659,980
(38.94 %)		 58,008
(2.90 %)
54 barbel (primary hap 2022)
GCA_936440315.1		 n/a 31,876
(3.30 %)		 85,063
(5.65 %)		 n/a 37.89
(100.00 %)		 108
(0.00 %)		 92
(100.00 %)		 4,839,533
(52.47 %)		 646,636
(4.57 %)		 8,240,279
(42.13 %)		 71,384
(3.04 %)
55 barramundi perch (ASB-BC8 2022)
GCF_001640805.2		 53,657
(13.68 %)		 16,073
(3.06 %)		 44,214
(6.63 %)		 n/a 40.76
(98.88 %)		 674
(1.12 %)		 2,997
(100.00 %)		 986,469
(19.78 %)		 237,272
(4.32 %)		 3,983,840
(23.58 %)		 16,237
(1.03 %)
56 beardfish (hap1 2025)
GCA_047511565.1		 n/a 15,938
(3.00 %)		 52,921
(7.52 %)		 n/a 43.38
(99.98 %)		 752
(0.02 %)		 327
(100.00 %)		 993,554
(11.81 %)		 755,389
(11.75 %)		 3,469,352
(30.25 %)		 68,008
(5.51 %)
57 beardfish (hap2 2025)
GCA_047511595.1		 n/a 15,940
(3.02 %)		 51,682
(7.42 %)		 n/a 43.31
(99.98 %)		 756
(0.02 %)		 200
(100.00 %)		 986,717
(11.69 %)		 754,642
(11.91 %)		 3,459,958
(30.32 %)		 67,732
(5.27 %)
58 Bermuda beardfish (OG660 hap1 2025)
GCA_048537225.1		 n/a 15,950
(2.82 %)		 53,175
(7.04 %)		 n/a 42.97
(99.99 %)		 481
(0.01 %)		 846
(100.00 %)		 1,017,817
(12.34 %)		 764,426
(15.65 %)		 3,524,564
(32.87 %)		 60,800
(4.43 %)
59 Bermuda beardfish (OG660 hap2 2025)
GCA_048537235.1		 n/a 15,811
(2.85 %)		 52,254
(7.09 %)		 n/a 43.06
(99.99 %)		 508
(0.01 %)		 461
(100.00 %)		 1,002,378
(12.22 %)		 753,750
(14.96 %)		 3,479,721
(32.11 %)		 60,513
(4.18 %)
60 bicolor damselfish
GCF_000690725.1		 32,951
(8.67 %)		 15,181
(2.55 %)		 31,420
(5.94 %)		 n/a 41.66
(93.68 %)		 44,409
(6.34 %)		 42,059
(93.66 %)		 351,453
(2.61 %)		 180,113
(1.20 %)		 5,016,154
(23.41 %)		 46,423
(2.30 %)
61 bight redfish (2022)
GCF_026898505.1		 34,914
(7.61 %)		 16,015
(2.73 %)		 54,287
(6.76 %)		 n/a 42.40
(100.00 %)		 n/a 8,310
(100.00 %)		 996,609
(9.55 %)		 631,344
(6.03 %)		 4,456,094
(29.17 %)		 37,522
(2.03 %)
62 bight redfish (hap1 2025)
GCA_048128805.1		 n/a 16,025
(2.63 %)		 53,351
(6.76 %)		 n/a 42.47
(99.98 %)		 699
(0.02 %)		 322
(100.00 %)		 995,401
(9.22 %)		 626,617
(9.80 %)		 4,302,378
(31.80 %)		 38,231
(2.50 %)
63 bight redfish (hap2 2025)
GCA_048129085.1		 n/a 15,902
(2.63 %)		 52,639
(6.71 %)		 n/a 42.44
(99.98 %)		 680
(0.02 %)		 204
(100.00 %)		 989,039
(9.11 %)		 628,091
(9.80 %)		 4,315,800
(31.97 %)		 37,729
(2.33 %)
64 black goby (alternate hap 2023)
GCA_951799965.1		 n/a 14,534
(2.11 %)		 56,906
(6.41 %)		 n/a 42.10
(100.00 %)		 n/a 3,523
(100.00 %)		 2,445,373
(45.07 %)		 452,878
(9.46 %)		 4,195,077
(39.49 %)		 77,592
(4.86 %)
65 black goby (primary hap 2023)
GCA_951799975.1		 n/a 14,455
(2.06 %)		 56,488
(6.31 %)		 n/a 42.10
(99.99 %)		 636
(0.01 %)		 298
(100.00 %)		 3,230,397
(55.09 %)		 494,440
(10.43 %)		 4,359,169
(40.46 %)		 81,684
(4.81 %)
66 black perch (LCO1_2020_lvr alternate hap 2022)
GCA_022578405.1		 n/a 31,847
(2.01 %)		 153,565
(6.53 %)		 n/a 41.78
(99.99 %)		 639
(0.00 %)		 63,422
(100.00 %)		 2,786,840
(18.28 %)		 1,016,389
(7.50 %)		 8,844,631
(26.90 %)		 130,556
(4.42 %)
67 black perch (LCO1_2020_lvr primary hap 2022 refseq)
GCF_022577435.1		 42,351
(12.09 %)		 14,988
(3.02 %)		 47,106
(6.98 %)		 n/a 41.61
(100.00 %)		 234
(0.00 %)		 463
(100.00 %)		 1,017,142
(18.99 %)		 360,899
(8.75 %)		 3,761,447
(28.91 %)		 48,360
(4.43 %)
68 black porgy (SG-2024 2024)
GCA_041753875.1		 n/a 15,257
(2.73 %)		 47,477
(6.62 %)		 n/a 42.03
(100.00 %)		 n/a 24
(100.00 %)		 488,582
(3.19 %)		 254,655
(4.13 %)		 4,385,401
(24.08 %)		 32,461
(1.90 %)
69 black rockcod
GCF_000735185.1		 34,978
(8.49 %)		 12,601
(2.15 %)		 42,589
(6.13 %)		 n/a 40.62
(97.93 %)		 59,164
(2.09 %)		 72,571
(97.92 %)		 268,591
(2.71 %)		 238,334
(3.18 %)		 3,425,479
(29.48 %)		 31,009
(2.11 %)
70 black seabass (Rhode Island RG_2023a 2023)
GCF_030273125.1		 43,392
(8.45 %)		 15,522
(2.13 %)		 48,255
(5.50 %)		 n/a 38.69
(100.00 %)		 341
(0.00 %)		 92
(100.00 %)		 1,651,919
(22.26 %)		 782,601
(7.55 %)		 5,398,047
(38.87 %)		 24,508
(1.19 %)
71 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 1 2023)
GCA_028021495.1		 n/a 15,274
(2.92 %)		 51,453
(7.45 %)		 n/a 43.07
(99.99 %)		 373
(0.01 %)		 461
(100.00 %)		 1,239,364
(29.69 %)		 354,703
(9.63 %)		 3,006,556
(30.35 %)		 53,503
(4.48 %)
72 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 2 2023)
GCA_028022725.1		 n/a 15,043
(2.96 %)		 50,860
(7.54 %)		 n/a 42.98
(99.99 %)		 366
(0.01 %)		 109
(100.00 %)		 1,210,142
(29.44 %)		 340,820
(9.19 %)		 2,986,750
(29.89 %)		 52,010
(4.20 %)
73 blackspot tuskfish (SL-2024 2025)
GCA_047301625.1		 n/a 15,085
(2.21 %)		 48,479
(5.71 %)		 n/a 41.56
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 43
(100.00 %)		 499,447
(3.15 %)		 285,392
(5.12 %)		 5,443,017
(30.00 %)		 23,550
(1.23 %)
74 blackstripe livebearer (line A6 2022)
GCF_027474105.1		 44,847
(11.30 %)		 15,364
(2.86 %)		 51,122
(6.88 %)		 n/a 39.48
(99.99 %)		 89
(0.01 %)		 415
(100.00 %)		 1,160,519
(28.33 %)		 183,082
(4.75 %)		 4,354,804
(27.83 %)		 40,207
(2.97 %)
75 blacktail shiner (hap1 2024)
GCA_038021265.1		 n/a 17,403
(2.99 %)		 45,903
(5.38 %)		 n/a 38.64
(99.99 %)		 709
(0.01 %)		 673
(100.00 %)		 2,141,901
(35.77 %)		 482,931
(17.18 %)		 4,297,133
(46.82 %)		 41,889
(2.32 %)
76 blacktail shiner (hap2 2024)
GCA_038024135.1		 n/a 17,486
(2.97 %)		 46,833
(5.41 %)		 n/a 38.79
(99.99 %)		 720
(0.01 %)		 413
(100.00 %)		 2,165,269
(36.18 %)		 490,692
(17.84 %)		 4,251,333
(47.54 %)		 42,744
(2.37 %)
77 blue catfish (D&B 2022)
GCF_023375685.1		 48,929
(10.27 %)		 15,574
(2.62 %)		 44,035
(5.21 %)		 n/a 39.80
(98.04 %)		 171
(1.96 %)		 43
(100.00 %)		 2,180,806
(45.14 %)		 625,260
(6.63 %)		 5,137,199
(35.52 %)		 31,164
(1.89 %)
78 blue tilapia (BGI-SZ)
GCF_005870065.1		 36,881
(7.40 %)		 15,408
(2.38 %)		 27,235
(5.59 %)		 n/a 40.42
(89.87 %)		 53,539
(10.15 %)		 12,952
(100.00 %)		 867,639
(16.39 %)		 195,137
(1.62 %)		 5,293,484
(23.10 %)		 21,238
(1.02 %)
79 blue tilapia (Guangdong)
GCF_013358895.1		 57,860
(9.04 %)		 15,494
(1.98 %)		 57,878
(5.63 %)		 56,939
(8.11 %)		 40.66
(99.97 %)		 723
(0.03 %)		 304
(100.00 %)		 1,055,724
(20.14 %)		 324,841
(3.27 %)		 5,000,753
(32.08 %)		 32,357
(1.59 %)
80 blue whiting (primary hap 2024)
GCA_964030765.1		 n/a 13,097
(2.93 %)		 55,097
(8.76 %)		 n/a 45.82
(99.88 %)		 3,055
(0.12 %)		 3,832
(100.00 %)		 1,337,604
(32.27 %)		 749,185
(17.27 %)		 2,363,606
(35.06 %)		 78,815
(8.25 %)
81 bluestreak cleaner wrasse (JK-2023 2023)
GCA_030710495.1		 n/a 14,996
(2.68 %)		 44,244
(6.44 %)		 n/a 40.81
(100.00 %)		 211
(0.00 %)		 59
(100.00 %)		 1,619,681
(30.07 %)		 337,749
(4.31 %)		 4,541,709
(29.20 %)		 14,576
(0.85 %)
82 bluestripe pipefish (RoL2022-K1 2023)
GCF_030265055.1		 63,345
(14.83 %)		 14,387
(3.54 %)		 43,563
(7.96 %)		 n/a 41.68
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 57
(100.00 %)		 842,739
(18.67 %)		 356,558
(12.86 %)		 2,720,911
(41.08 %)		 40,187
(4.66 %)
83 blunt-snouted clingfish (alternate hap)
GCA_900650505.1		 n/a 12,494
(1.93 %)		 44,967
(5.14 %)		 n/a 38.20
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 7,675
(100.00 %)		 608,174
(4.23 %)		 390,755
(4.71 %)		 4,977,071
(42.41 %)		 23,532
(1.46 %)
84 blunt-snouted clingfish (v2 2020 genbank)
GCA_900634775.2		 n/a 14,499
(1.97 %)		 51,213
(5.47 %)		 n/a 38.27
(98.47 %)		 1,160
(1.53 %)		 442
(100.00 %)		 731,731
(4.21 %)		 471,623
(4.92 %)		 5,974,055
(42.88 %)		 29,052
(1.48 %)
85 Boeseman's rainbowfish (fMelBoe1 alternate hap 2021)
GCA_017639755.1		 n/a 13,882
(2.27 %)		 45,919
(5.98 %)		 n/a 39.50
(99.99 %)		 45
(0.01 %)		 3,194
(100.00 %)		 803,073
(13.60 %)		 258,404
(4.19 %)		 4,674,614
(28.36 %)		 15,524
(1.02 %)
86 Boeseman's rainbowfish (primary hap 2021)
GCF_017639745.1		 51,238
(8.77 %)		 15,174
(2.24 %)		 51,552
(6.21 %)		 n/a 39.65
(99.63 %)		 440
(0.37 %)		 93
(100.00 %)		 542,278
(3.15 %)		 303,669
(4.77 %)		 5,189,645
(29.11 %)		 18,525
(1.10 %)
87 Bolin's lanternfish (primary hap 2024)
GCA_963924005.1		 n/a 16,964
(1.77 %)		 67,673
(5.93 %)		 n/a 42.61
(99.97 %)		 1,785
(0.03 %)		 979
(100.00 %)		 4,285,965
(30.73 %)		 1,222,431
(20.69 %)		 6,105,881
(46.99 %)		 73,543
(3.28 %)
88 bonti-bonti (fTelBon1 alternate hap 2022)
GCA_933228925.1		 n/a 12,424
(1.95 %)		 46,550
(6.00 %)		 n/a 41.63
(100.00 %)		 n/a 4,619
(100.00 %)		 789,207
(14.61 %)		 348,482
(20.98 %)		 3,447,241
(38.72 %)		 27,035
(4.16 %)
89 bonti-bonti (primary hap 2022)
GCA_933228915.1		 n/a 14,929
(1.93 %)		 55,343
(5.90 %)		 n/a 41.66
(99.97 %)		 1,329
(0.03 %)		 146
(100.00 %)		 998,246
(14.90 %)		 443,155
(22.40 %)		 4,319,947
(40.01 %)		 34,018
(4.16 %)
90 bony fish B.hirsutus (HB-005 2024)
GCF_040956055.1		 24,050
(11.30 %)		 14,596
(4.48 %)		 52,760
(11.00 %)		 n/a 44.75
(99.96 %)		 1,486
(0.04 %)		 1,370
(100.00 %)		 471,281
(10.94 %)		 181,798
(7.38 %)		 2,008,576
(24.90 %)		 46,438
(14.87 %)
91 bony fish G.rarus (2020-XYJJ_v1 2022)
GCA_023029165.1		 n/a 17,903
(2.56 %)		 61,083
(4.83 %)		 n/a 39.20
(99.98 %)		 410
(0.02 %)		 46
(100.00 %)		 3,191,854
(60.59 %)		 577,156
(9.69 %)		 6,405,936
(42.87 %)		 47,551
(3.22 %)
92 bony fish P.dabryanus (BB 2023)
GCF_030506205.1		 86,420
(8.25 %)		 22,100
(2.28 %)		 59,296
(4.66 %)		 n/a 38.32
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 610
(100.00 %)		 3,555,303
(40.49 %)		 538,181
(9.64 %)		 6,137,303
(50.16 %)		 71,533
(4.06 %)
93 bony fish R.nasutus (DBWJ_T2T 2025)
GCA_048301585.1		 n/a 17,715
(2.98 %)		 44,183
(4.64 %)		 n/a 38.96
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 70
(100.00 %)		 613,768
(4.88 %)		 440,668
(11.76 %)		 5,264,302
(45.25 %)		 39,351
(3.96 %)
94 bony fish S.pulcher (SPU_LCO1_2020_fin primary hap 2022)
GCF_022749685.1		 37,003
(8.79 %)		 15,275
(2.46 %)		 46,371
(5.95 %)		 n/a 41.58
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 186
(100.00 %)		 1,369,180
(24.73 %)		 232,889
(8.56 %)		 4,426,024
(31.90 %)		 27,133
(1.64 %)
95 bony fish T.vachellii (PV-2020 2023)
GCF_030014155.1		 43,278
(10.19 %)		 15,613
(2.96 %)		 39,340
(5.77 %)		 n/a 39.31
(99.98 %)		 291
(0.02 %)		 78
(100.00 %)		 1,563,305
(33.23 %)		 689,312
(9.96 %)		 3,954,578
(35.31 %)		 20,152
(1.50 %)
96 Borax Lake chub (OS27281-9 2025)
GCF_051911475.1		 81,778
(6.98 %)		 17,407
(2.27 %)		 73,376
(5.83 %)		 n/a 40.13
(100.00 %)		 n/a 532
(100.00 %)		 3,842,976
(66.66 %)		 684,484
(9.77 %)		 6,131,520
(42.41 %)		 106,613
(7.33 %)
97 bowfin (hap1 2024 refseq)
GCF_036373705.1		 55,474
(7.85 %)		 13,848
(1.83 %)		 27,055
(4.43 %)		 n/a 40.75
(100.00 %)		 97
(0.00 %)		 389
(100.00 %)		 953,492
(13.69 %)		 387,699
(7.91 %)		 4,552,359
(37.72 %)		 46,301
(2.99 %)
98 bowfin (hap2 2024)
GCA_036365475.1		 n/a 13,813
(1.89 %)		 27,088
(4.55 %)		 n/a 40.60
(100.00 %)		 80
(0.00 %)		 297
(100.00 %)		 886,999
(13.24 %)		 358,077
(7.37 %)		 4,625,277
(36.22 %)		 43,764
(2.79 %)
99 Brauer's lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_963281105.1		 n/a 17,999
(1.60 %)		 76,655
(5.58 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 10,799
(100.00 %)		 5,994,257
(39.29 %)		 1,126,685
(10.35 %)		 6,996,991
(46.02 %)		 71,016
(3.36 %)
100 Brauer's lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963280865.1		 n/a 17,865
(1.56 %)		 76,506
(5.59 %)		 n/a 42.15
(99.96 %)		 2,704
(0.04 %)		 676
(100.00 %)		 6,391,921
(39.62 %)		 1,227,487
(11.70 %)		 6,669,558
(49.73 %)		 76,828
(3.96 %)
101 broad-nosed pipefish (SK-2024d hap1 2025)
GCA_048301445.1		 n/a 13,406
(4.62 %)		 41,458
(10.33 %)		 n/a 43.23
(100.00 %)		 78
(0.00 %)		 155
(100.00 %)		 205,224
(2.93 %)		 217,943
(13.58 %)		 1,368,592
(36.56 %)		 48,018
(12.44 %)
102 broad-nosed pipefish (SK-2024d hap2 2025)
GCA_048301605.1		 n/a 13,414
(4.78 %)		 41,481
(10.68 %)		 n/a 43.24
(100.00 %)		 90
(0.00 %)		 126
(100.00 %)		 203,521
(2.96 %)		 200,308
(11.44 %)		 1,413,994
(34.72 %)		 47,578
(12.59 %)
103 broad-nosed pipefish (Sweden RoL2023-S1 2023)
GCF_033458585.1		 49,639
(15.87 %)		 13,630
(3.98 %)		 43,263
(9.12 %)		 n/a 43.65
(100.00 %)		 40
(0.00 %)		 495
(100.00 %)		 727,223
(20.88 %)		 290,624
(20.53 %)		 1,369,709
(43.82 %)		 51,671
(14.43 %)
104 brook trout (EN_2023a 2023)
GCF_029448725.1		 92,568
(6.87 %)		 26,875
(1.47 %)		 114,101
(4.26 %)		 n/a 43.70
(99.83 %)		 4,299
(0.17 %)		 2,721
(100.00 %)		 5,005,012
(52.10 %)		 2,055,293
(26.66 %)		 9,701,968
(57.04 %)		 89,897
(2.49 %)
105 brown-marbled grouper (2020)
GCF_011397635.1		 49,218
(8.52 %)		 15,634
(1.92 %)		 53,710
(4.99 %)		 n/a 41.33
(100.00 %)		 205
(0.00 %)		 26
(100.00 %)		 632,147
(3.01 %)		 371,482
(3.01 %)		 6,438,110
(31.32 %)		 26,136
(0.96 %)
106 Burton's mouthbrooder (Broad 2011)
GCF_000239415.1		 47,805
(10.97 %)		 14,997
(2.72 %)		 25,504
(5.86 %)		 n/a 40.51
(84.10 %)		 61,073
(15.93 %)		 69,067
(84.07 %)		 311,174
(3.20 %)		 125,534
(0.72 %)		 4,461,288
(20.25 %)		 17,722
(0.91 %)
107 Burton's mouthbrooder (NCSU 2021)
GCF_018398535.1		 52,584
(12.38 %)		 15,229
(2.54 %)		 47,264
(5.92 %)		 n/a 40.68
(89.05 %)		 32,418
(10.97 %)		 7,421
(100.00 %)		 812,382
(17.52 %)		 158,486
(1.12 %)		 4,571,794
(23.61 %)		 22,763
(1.21 %)
108 butterfish (fScaArg1 alternate hap 2021)
GCA_020382915.1		 n/a 15,228
(3.42 %)		 41,322
(7.36 %)		 n/a 41.47
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 1,592
(100.00 %)		 972,098
(18.43 %)		 155,031
(1.41 %)		 3,452,400
(21.36 %)		 15,255
(1.12 %)
109 butterfish (primary hap 2021)
GCF_020382885.2		 52,841
(14.10 %)		 15,261
(3.43 %)		 40,580
(7.38 %)		 n/a 41.49
(99.70 %)		 77
(0.30 %)		 48
(100.00 %)		 413,775
(3.11 %)		 160,299
(1.55 %)		 3,420,994
(21.24 %)		 15,574
(1.13 %)
110 butterfly blenny (primary hap 2023)
GCA_963422515.1		 n/a 14,403
(2.47 %)		 61,860
(7.37 %)		 n/a 43.15
(99.96 %)		 1,625
(0.04 %)		 525
(100.00 %)		 959,651
(12.16 %)		 517,137
(13.14 %)		 3,775,081
(32.47 %)		 81,881
(6.68 %)
111 California grunion (hap1 2024)
GCF_036924035.1		 48,842
(7.86 %)		 15,030
(2.11 %)		 47,569
(5.39 %)		 n/a 41.54
(100.00 %)		 223
(0.00 %)		 296
(100.00 %)		 362,601
(2.31 %)		 342,827
(15.91 %)		 3,359,060
(39.76 %)		 28,098
(1.96 %)
112 California sheephead (SPU_LCO1_2020_fin alternate hap 2022)
GCA_022749735.1		 n/a 19,842
(2.16 %)		 72,007
(6.04 %)		 n/a 41.70
(99.97 %)		 2,679
(0.02 %)		 15,877
(99.98 %)		 1,911,945
(24.70 %)		 364,933
(8.56 %)		 6,201,042
(32.00 %)		 39,114
(1.56 %)
113 California sheephead (SPU_LCO1_2020_fin primary hap 2022)
GCA_022749685.1		 n/a 15,277
(2.46 %)		 46,371
(5.95 %)		 n/a 41.58
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 179
(100.00 %)		 1,369,186
(24.73 %)		 232,889
(8.56 %)		 4,426,065
(31.90 %)		 27,134
(1.64 %)
114 channel bull blenny (2019 refseq)
GCF_900634415.1		 40,788
(11.04 %)		 14,472
(3.02 %)		 24,012
(6.59 %)		 60,720
(10.43 %)		 40.96
(99.58 %)		 445
(0.42 %)		 322
(100.00 %)		 420,697
(5.49 %)		 320,518
(6.91 %)		 3,394,846
(28.67 %)		 20,453
(1.39 %)
115 channel bull blenny (alternate hap 2019)
GCA_900634435.1		 n/a 15,980
(2.79 %)		 53,680
(6.62 %)		 n/a 40.96
(100.00 %)		 10
(0.00 %)		 11,565
(100.00 %)		 451,656
(4.76 %)		 321,158
(5.51 %)		 3,800,099
(26.83 %)		 20,338
(1.21 %)
116 channel catfish (USDA103 2022)
GCA_001660625.3		 n/a 15,782
(2.56 %)		 45,562
(5.15 %)		 n/a 39.82
(99.35 %)		 100
(0.65 %)		 136
(100.00 %)		 2,357,987
(46.85 %)		 671,925
(8.67 %)		 5,043,595
(36.53 %)		 34,284
(2.16 %)
117 channel catfish (USDA103 v2.0 2022)
GCF_001660625.3		 59,187
(10.70 %)		 15,782
(2.57 %)		 45,562
(5.15 %)		 n/a 39.82
(99.35 %)		 100
(0.65 %)		 137
(100.00 %)		 2,257,240
(46.82 %)		 671,926
(8.67 %)		 5,043,664
(36.53 %)		 34,284
(2.16 %)
118 cherry salmon (Uvic2021 2024)
GCF_036934945.1		 80,307
(5.31 %)		 27,171
(1.38 %)		 123,048
(4.00 %)		 n/a 44.12
(99.94 %)		 4,047
(0.06 %)		 18,306
(100.00 %)		 1,207,353
(5.23 %)		 2,779,869
(27.93 %)		 11,429,057
(55.56 %)		 83,137
(1.99 %)
119 chevron butterflyfish (hap1 2024 refseq)
GCF_039877785.1		 38,623
(10.62 %)		 15,604
(3.07 %)		 48,037
(7.05 %)		 n/a 42.79
(100.00 %)		 49
(0.00 %)		 36
(100.00 %)		 1,224,649
(24.57 %)		 254,015
(3.62 %)		 3,657,926
(23.28 %)		 30,971
(2.02 %)
120 chevron butterflyfish (hap2 2024)
GCA_039877575.1		 n/a 15,116
(2.91 %)		 47,839
(7.01 %)		 n/a 42.73
(100.00 %)		 43
(0.00 %)		 71
(100.00 %)		 463,848
(3.80 %)		 254,561
(4.23 %)		 3,654,295
(24.08 %)		 30,593
(1.99 %)
121 chichlid (S. diagramma)
GCF_900408965.1		 61,496
(12.33 %)		 15,296
(2.30 %)		 50,818
(6.10 %)		 n/a 40.92
(100.00 %)		 942
(0.00 %)		 823
(100.00 %)		 920,881
(19.96 %)		 193,629
(1.36 %)		 4,724,179
(28.98 %)		 28,565
(1.65 %)
122 Chinaman-leatherjacket (Tasmania G7.1 2024)
GCF_046127955.1		 46,411
(11.83 %)		 14,102
(3.02 %)		 52,239
(7.87 %)		 n/a 45.59
(100.00 %)		 n/a 396
(100.00 %)		 809,090
(6.75 %)		 459,997
(7.66 %)		 2,973,747
(37.71 %)		 124,869
(12.74 %)
123 chinamanfish (OG11 2025)
GCA_048128715.1		 n/a 15,611
(1.87 %)		 46,283
(4.42 %)		 n/a 39.32
(100.00 %)		 72
(0.00 %)		 61
(100.00 %)		 663,907
(2.82 %)		 372,676
(3.23 %)		 7,551,541
(33.03 %)		 17,757
(0.80 %)
124 chinamanfish (OG11 2025)
GCA_048128725.1		 n/a 15,739
(1.88 %)		 46,290
(4.42 %)		 n/a 39.31
(100.00 %)		 70
(0.00 %)		 89
(100.00 %)		 663,559
(2.79 %)		 371,107
(3.14 %)		 7,519,173
(32.84 %)		 17,824
(0.70 %)
125 Chinese cavefish (2022)
GCF_024868665.1		 48,071
(11.91 %)		 16,738
(3.72 %)		 46,295
(6.80 %)		 n/a 39.61
(98.56 %)		 9,510
(1.45 %)		 1,039
(100.00 %)		 1,469,931
(44.44 %)		 188,838
(2.34 %)		 3,624,116
(35.94 %)		 44,615
(5.01 %)
126 Chinese large-mouth catfish (SWU-2019-XX 2020)
GCF_014805685.1		 49,690
(9.64 %)		 15,266
(2.70 %)		 40,151
(5.21 %)		 n/a 38.75
(99.82 %)		 597
(0.18 %)		 286
(100.00 %)		 772,209
(6.45 %)		 630,039
(7.45 %)		 4,729,261
(37.48 %)		 24,310
(1.76 %)
127 Chinese sucker (Aquarium Trade MX2 2022)
GCF_019703515.2		 89,018
(6.31 %)		 26,613
(1.64 %)		 77,184
(3.14 %)		 n/a 39.08
(100.00 %)		 224
(0.00 %)		 353
(100.00 %)		 9,298,177
(59.91 %)		 977,119
(3.49 %)		 13,499,422
(52.38 %)		 100,309
(2.90 %)
128 Chinook salmon (v1 2018 female)
GCF_002872995.1		 81,327
(5.14 %)		 27,462
(1.53 %)		 54,538
(3.80 %)		 n/a 43.55
(97.26 %)		 272,151
(2.76 %)		 15,944
(99.99 %)		 1,207,194
(4.55 %)		 2,524,408
(13.75 %)		 12,127,831
(47.56 %)		 87,959
(2.02 %)
129 Chinook salmon (v2 Ot180627B 2021 male rfseq)
GCF_018296145.1		 92,370
(5.73 %)		 26,372
(1.57 %)		 107,059
(4.12 %)		 157,582
(6.65 %)		 43.55
(99.99 %)		 2,334
(0.01 %)		 9,978
(99.99 %)		 1,483,168
(7.79 %)		 2,306,695
(23.48 %)		 10,038,888
(54.54 %)		 62,726
(1.40 %)
130 chub mackerel (fScoJap1 alternate hap 2022)
GCA_027409835.1		 n/a 15,165
(2.44 %)		 46,105
(6.16 %)		 n/a 39.93
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,163
(100.00 %)		 1,546,066
(27.08 %)		 537,737
(9.87 %)		 4,485,153
(30.70 %)		 14,774
(0.81 %)
131 chub mackerel (primary hap 2022 refseq)
GCF_027409825.1		 34,390
(6.95 %)		 15,348
(2.35 %)		 46,858
(6.07 %)		 n/a 40.01
(99.92 %)		 1,572
(0.08 %)		 360
(100.00 %)		 1,669,322
(28.44 %)		 638,340
(11.55 %)		 4,613,373
(32.38 %)		 16,290
(0.85 %)
132 chum salmon (Oke142-1_Chum_Gynogen 2020)
GCF_012931545.1		 76,338
(6.27 %)		 23,186
(1.70 %)		 90,881
(4.14 %)		 n/a 43.06
(95.36 %)		 242,238
(4.66 %)		 28,109
(99.98 %)		 1,143,292
(6.07 %)		 1,487,818
(12.14 %)		 8,992,314
(46.24 %)		 51,797
(1.25 %)
133 chum salmon (PuntledgeMale-10-30-2019 2022)
GCF_023373465.1		 205,598
(6.68 %)		 26,582
(1.42 %)		 119,437
(4.14 %)		 120,379
(5.87 %)		 43.89
(99.99 %)		 3,433
(0.01 %)		 17,480
(99.99 %)		 1,160,500
(5.63 %)		 2,584,312
(31.72 %)		 10,621,107
(55.67 %)		 68,538
(1.53 %)
134 climbing perch (alternate hap 2019)
GCA_900650485.1		 n/a 14,940
(3.51 %)		 39,688
(7.41 %)		 n/a 40.40
(99.61 %)		 36
(0.39 %)		 2,641
(100.00 %)		 307,993
(2.63 %)		 121,935
(1.79 %)		 3,190,928
(20.98 %)		 10,131
(0.86 %)
135 climbing perch (v1.3 2021)
GCA_900324465.3		 n/a 15,241
(3.53 %)		 39,067
(7.54 %)		 67,055
(11.68 %)		 40.40
(99.35 %)		 266
(0.65 %)		 51
(100.00 %)		 633,883
(15.28 %)		 130,249
(1.89 %)		 3,325,008
(21.31 %)		 10,500
(0.87 %)
136 clown anemonefish (DU_AmpOce 2017)
GCF_002776465.1		 53,580
(9.24 %)		 15,685
(2.23 %)		 33,477
(5.63 %)		 n/a 39.47
(99.94 %)		 1,406
(0.06 %)		 6,405
(100.00 %)		 431,950
(2.92 %)		 381,394
(4.84 %)		 4,952,343
(31.95 %)		 23,543
(1.15 %)
137 clown anemonefish (Okinawa individual 3 2022)
GCF_022539595.1		 53,925
(11.11 %)		 15,702
(2.37 %)		 47,805
(5.50 %)		 n/a 39.59
(99.98 %)		 1,454
(0.02 %)		 354
(100.00 %)		 1,346,903
(35.25 %)		 401,782
(5.36 %)		 4,891,035
(31.59 %)		 23,489
(1.28 %)
138 coho salmon (150728-3 2019)
GCF_002021735.2		 100,863
(6.58 %)		 27,072
(1.56 %)		 50,811
(3.95 %)		 125,873
(5.26 %)		 43.55
(99.98 %)		 5,631
(0.02 %)		 4,482
(100.00 %)		 1,491,966
(6.88 %)		 2,135,217
(25.52 %)		 10,152,659
(54.74 %)		 65,662
(1.36 %)
139 common bream (primary hap 2024)
GCA_963993115.1		 n/a 18,114
(2.63 %)		 66,549
(6.11 %)		 n/a 38.62
(99.99 %)		 685
(0.01 %)		 215
(100.00 %)		 2,639,968
(48.46 %)		 659,243
(7.55 %)		 5,950,358
(40.47 %)		 62,337
(3.61 %)
140 common carp (R8XR3 2021)
GCA_905221575.1		 n/a 30,973
(3.47 %)		 83,657
(5.95 %)		 n/a 37.06
(100.00 %)		 372
(0.00 %)		 674
(100.00 %)		 3,324,121
(41.45 %)		 707,134
(4.72 %)		 8,110,561
(39.08 %)		 44,388
(1.60 %)
141 common carp (SPL01 2021)
GCF_018340385.1		 91,197
(7.89 %)		 31,041
(2.89 %)		 89,244
(5.01 %)		 n/a 37.11
(99.53 %)		 26,351
(0.48 %)		 6,701
(100.00 %)		 1,634,612
(6.00 %)		 919,239
(3.97 %)		 10,192,037
(38.56 %)		 52,638
(1.62 %)
142 common dab (primary hap 2023)
GCF_963576545.1		 36,211
(8.34 %)		 14,995
(2.62 %)		 50,844
(6.89 %)		 n/a 42.67
(99.99 %)		 275
(0.01 %)		 338
(100.00 %)		 1,186,799
(32.17 %)		 307,864
(16.34 %)		 3,562,802
(35.00 %)		 41,657
(2.72 %)
143 common dace (hap1.1 2025)
GCA_965113295.1		 n/a 18,484
(2.43 %)		 69,931
(5.95 %)		 n/a 39.03
(99.98 %)		 1,202
(0.02 %)		 876
(100.00 %)		 938,148
(4.74 %)		 828,944
(9.34 %)		 5,833,273
(42.65 %)		 78,182
(4.87 %)
144 common dace (hap2.1 2025)
GCA_965113325.1		 n/a 17,904
(2.46 %)		 68,908
(5.96 %)		 n/a 38.98
(99.98 %)		 1,147
(0.02 %)		 530
(100.00 %)		 3,428,827
(55.24 %)		 796,220
(8.80 %)		 5,775,180
(41.93 %)		 77,105
(4.67 %)
145 common seabream (hap1.1 2025)
GCA_965226575.1		 n/a 15,435
(2.40 %)		 54,036
(6.66 %)		 n/a 41.73
(99.99 %)		 536
(0.01 %)		 576
(100.00 %)		 495,544
(2.96 %)		 454,601
(9.69 %)		 4,614,163
(29.34 %)		 29,859
(1.71 %)
146 common seabream (hap2.1 2025)
GCA_965225695.1		 n/a 15,519
(2.52 %)		 53,533
(6.93 %)		 n/a 41.68
(99.99 %)		 535
(0.01 %)		 784
(99.99 %)		 472,383
(2.92 %)		 337,781
(6.08 %)		 4,705,623
(26.82 %)		 29,198
(1.68 %)
147 common seadragon (TA_2022b 2022)
GCF_024500385.1		 60,947
(12.28 %)		 13,706
(2.67 %)		 42,956
(5.71 %)		 n/a 42.24
(100.00 %)		 196
(0.00 %)		 1,259
(100.00 %)		 1,417,848
(37.47 %)		 173,323
(3.85 %)		 3,968,694
(40.23 %)		 70,253
(6.29 %)
148 common sole (alternate hap 2023)
GCA_958295035.1		 n/a 14,904
(2.99 %)		 43,194
(7.09 %)		 n/a 40.77
(100.00 %)		 n/a 1,318
(100.00 %)		 1,128,080
(18.77 %)		 328,975
(8.35 %)		 3,952,898
(31.64 %)		 26,979
(2.08 %)
149 common sole (primary hap 2023 refseq)
GCF_958295425.1		 55,359
(12.02 %)		 14,844
(2.94 %)		 42,832
(6.93 %)		 n/a 40.87
(99.99 %)		 373
(0.01 %)		 242
(100.00 %)		 1,149,243
(19.12 %)		 342,238
(9.71 %)		 3,906,753
(32.84 %)		 27,772
(2.71 %)
150 common whitefish (fCorLav1.hap1.1 2024)
GCA_964263955.1		 n/a 29,103
(1.36 %)		 124,287
(3.94 %)		 n/a 43.87
(99.96 %)		 5,995
(0.04 %)		 11,150
(100.00 %)		 1,655,140
(4.68 %)		 1,843,550
(17.63 %)		 9,367,555
(61.56 %)		 112,654
(3.84 %)
151 common whitefish (fCorLav1.hap2.1 2024)
GCA_964263835.1		 n/a 25,968
(1.48 %)		 104,922
(4.18 %)		 n/a 43.67
(99.96 %)		 4,689
(0.04 %)		 8,669
(99.96 %)		 1,320,339
(4.08 %)		 1,364,334
(15.61 %)		 7,674,742
(61.10 %)		 94,019
(3.82 %)
152 convict blenny (fPhoLeu1 alternate hap 2021)
GCA_020510965.1		 n/a 5,231
(0.27 %)		 47,644
(1.48 %)		 n/a 44.62
(99.99 %)		 144
(0.01 %)		 21,561
(99.99 %)		 2,803,873
(49.20 %)		 655,416
(2.69 %)		 7,558,550
(67.05 %)		 181,626
(10.52 %)
153 convict blenny (primary hap 2021)
GCA_020510985.1		 n/a n/a 134,417
(1.50 %)		 n/a 44.52
(99.13 %)		 2,580
(0.87 %)		 512
(100.00 %)		 9,062,541
(49.33 %)		 2,097,650
(2.66 %)		 20,502,207
(74.78 %)		 568,042
(10.14 %)
154 copperband butterflyfish (fCheRos1 alternate hap 2021)
GCA_017976315.1		 n/a 13,622
(2.81 %)		 43,285
(6.93 %)		 n/a 42.59
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,125
(100.00 %)		 1,741,373
(32.89 %)		 182,926
(2.01 %)		 3,659,106
(21.68 %)		 27,693
(1.89 %)
155 copperband butterflyfish (primary hap 2021)
GCF_017976325.1		 35,291
(10.46 %)		 15,210
(3.03 %)		 44,916
(6.99 %)		 61,755
(8.99 %)		 42.57
(100.00 %)		 60
(0.00 %)		 29
(100.00 %)		 406,118
(2.95 %)		 199,450
(2.10 %)		 3,861,745
(21.57 %)		 29,106
(1.85 %)
156 corkwing wrasse (primary hap 2022)
GCA_947650265.1		 n/a 14,740
(2.91 %)		 45,483
(7.26 %)		 n/a 41.82
(99.96 %)		 1,379
(0.04 %)		 395
(100.00 %)		 936,676
(24.41 %)		 306,192
(9.29 %)		 3,495,456
(28.75 %)		 29,142
(2.35 %)
157 Corydoras catfish unclassified (C115 2021)
GCA_019802505.1		 n/a 14,695
(2.68 %)		 51,799
(6.37 %)		 n/a 42.12
(100.00 %)		 n/a 2,080
(100.00 %)		 1,969,654
(37.02 %)		 663,295
(11.19 %)		 3,764,275
(45.19 %)		 67,226
(8.43 %)
158 crested bigscale (hap1.1 2025)
GCA_964638095.1		 n/a 17,935
(1.34 %)		 104,307
(6.12 %)		 n/a 44.53
(99.96 %)		 2,975
(0.04 %)		 2,930
(100.00 %)		 5,608,839
(57.44 %)		 1,825,932
(20.35 %)		 6,375,759
(51.18 %)		 149,374
(4.78 %)
159 crested bigscale (hap2.1 2025)
GCA_964638665.1		 n/a 17,775
(1.43 %)		 100,017
(6.38 %)		 n/a 44.59
(99.96 %)		 2,894
(0.04 %)		 4,301
(99.96 %)		 5,332,080
(56.26 %)		 1,737,704
(18.88 %)		 6,064,583
(49.72 %)		 141,258
(4.70 %)
160 crested weedfish (hap1 OG76 2025)
GCA_049082185.1		 n/a 14,740
(2.96 %)		 58,554
(8.04 %)		 n/a 44.56
(99.96 %)		 1,180
(0.04 %)		 793
(100.00 %)		 711,944
(7.44 %)		 537,707
(8.17 %)		 3,418,045
(29.92 %)		 95,750
(8.49 %)
161 crested weedfish (hap2 OG76 2025)
GCA_049082045.1		 n/a 13,849
(3.08 %)		 53,198
(8.16 %)		 n/a 44.70
(99.96 %)		 1,089
(0.04 %)		 513
(100.00 %)		 649,032
(7.21 %)		 483,451
(7.55 %)		 3,155,766
(28.97 %)		 88,490
(8.53 %)
162 crucian carp (alternate hap 2023)
GCA_963082795.1		 n/a 4,509
(3.03 %)		 16,936
(7.22 %)		 n/a 38.67
(100.00 %)		 n/a 3,713
(100.00 %)		 430,197
(46.38 %)		 101,926
(7.54 %)		 1,077,239
(32.21 %)		 10,612
(4.11 %)
163 crucian carp (primary hap 2023 refseq)
GCF_963082965.1		 90,094
(6.75 %)		 29,386
(2.81 %)		 88,291
(5.37 %)		 n/a 38.31
(99.99 %)		 832
(0.01 %)		 277
(100.00 %)		 3,481,382
(45.81 %)		 802,773
(6.54 %)		 8,190,783
(44.41 %)		 83,696
(3.82 %)
164 cuckoo wrasse (primary hap 2023)
GCF_963584025.1		 51,190
(10.37 %)		 15,144
(2.59 %)		 43,207
(5.98 %)		 n/a 40.77
(99.98 %)		 570
(0.02 %)		 324
(100.00 %)		 1,435,625
(29.39 %)		 330,276
(12.54 %)		 4,196,830
(33.83 %)		 19,310
(1.01 %)
165 cunner (fTauAds1 alternate hap 2021)
GCA_020745675.1		 n/a 14,861
(2.74 %)		 42,996
(6.34 %)		 n/a 41.31
(99.99 %)		 31
(0.01 %)		 1,476
(100.00 %)		 1,373,727
(30.17 %)		 220,572
(4.38 %)		 4,176,936
(27.32 %)		 17,129
(1.04 %)
166 cunner (primary hap 2021)
GCA_020745685.1		 n/a 15,192
(2.74 %)		 43,564
(6.38 %)		 n/a 41.31
(99.41 %)		 283
(0.59 %)		 64
(100.00 %)		 1,419,667
(30.50 %)		 243,024
(4.81 %)		 4,334,690
(27.65 %)		 17,974
(1.06 %)
167 Dalai köbertrulling (WHDGS20190420 2020)
GCF_015846415.1		 49,121
(12.72 %)		 16,501
(4.06 %)		 40,671
(7.11 %)		 n/a 38.77
(100.00 %)		 116
(0.00 %)		 167
(100.00 %)		 1,213,719
(40.21 %)		 134,299
(3.43 %)		 3,676,403
(30.98 %)		 29,879
(3.18 %)
168 Danionella translucida (Bolton 2019)
GCA_007224835.1		 n/a 16,341
(3.18 %)		 41,545
(5.47 %)		 n/a 38.57
(98.69 %)		 8,366
(1.31 %)		 36,005
(98.69 %)		 300,659
(2.50 %)		 212,357
(6.15 %)		 4,267,143
(35.05 %)		 23,311
(2.18 %)
169 Danionella translucida (fDanTra1 2020)
GCA_903798025.1		 n/a 15,965
(3.73 %)		 37,421
(5.87 %)		 n/a 38.52
(94.12 %)		 18,487
(5.88 %)		 29,831
(94.12 %)		 251,333
(2.28 %)		 132,120
(1.41 %)		 4,061,554
(28.83 %)		 16,871
(1.57 %)
170 dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 refseq)
GCF_021462225.1		 56,220
(7.59 %)		 15,422
(1.71 %)		 50,084
(4.18 %)		 n/a 40.18
(99.46 %)		 409
(0.54 %)		 72
(100.00 %)		 369,606
(1.86 %)		 176,954
(1.87 %)		 6,142,638
(38.35 %)		 32,973
(1.28 %)
171 delta smelt
GCF_021917145.1		 41,807
(14.97 %)		 14,549
(4.09 %)		 44,849
(9.74 %)		 n/a 44.99
(99.92 %)		 1,474
(0.08 %)		 376
(100.00 %)		 387,882
(5.57 %)		 383,522
(9.22 %)		 1,814,696
(32.48 %)		 28,299
(3.33 %)
172 denticle herring (alternate hap 2019)
GCA_900700345.2		 n/a 14,119
(3.95 %)		 47,988
(8.57 %)		 n/a 43.51
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 1,972
(100.00 %)		 312,660
(2.77 %)		 160,575
(2.83 %)		 2,525,528
(27.70 %)		 50,830
(8.72 %)
173 denticle herring (v2 2020)
GCA_900700375.2		 n/a 16,559
(3.78 %)		 58,823
(8.66 %)		 74,128
(10.47 %)		 43.69
(99.18 %)		 464
(0.82 %)		 461
(100.00 %)		 403,512
(3.23 %)		 224,284
(4.61 %)		 2,948,738
(28.79 %)		 64,661
(9.49 %)
174 doctor fish G.rufa (2025)
GCF_049309525.1		 56,413
(6.01 %)		 18,728
(2.09 %)		 57,498
(4.48 %)		 n/a 37.04
(99.47 %)		 14,924
(0.54 %)		 1,000
(100.00 %)		 928,901
(3.56 %)		 923,200
(13.04 %)		 6,338,918
(52.94 %)		 64,694
(3.55 %)
175 dorado (hap1 2023)
GCA_030448965.1		 n/a 16,788
(2.12 %)		 50,338
(4.68 %)		 n/a 41.27
(98.12 %)		 641
(1.88 %)		 182
(100.00 %)		 2,709,759
(34.74 %)		 798,364
(14.84 %)		 5,418,190
(36.02 %)		 30,055
(1.31 %)
176 dorado (hap2 2023 refseq)
GCF_030463535.1		 45,512
(7.65 %)		 16,797
(2.11 %)		 50,411
(4.67 %)		 n/a 41.29
(99.15 %)		 726
(0.85 %)		 103
(100.00 %)		 871,278
(4.83 %)		 805,806
(14.65 %)		 5,615,217
(36.69 %)		 30,083
(1.31 %)
177 double-spotted pufferfish T.bimaculatus (TB-2018 2019)
GCA_004026145.2		 n/a 14,760
(4.56 %)		 56,353
(11.37 %)		 n/a 45.56
(99.97 %)		 1,033
(0.03 %)		 1,158
(100.00 %)		 292,029
(9.69 %)		 192,568
(5.53 %)		 1,623,924
(22.71 %)		 51,743
(9.31 %)
178 dwarf seahorse (Florida 2022)
GCF_025434085.1		 51,366
(12.50 %)		 13,736
(3.19 %)		 50,537
(7.64 %)		 n/a 44.73
(100.00 %)		 79
(0.00 %)		 213
(100.00 %)		 986,789
(36.30 %)		 235,862
(13.25 %)		 2,323,084
(41.85 %)		 68,121
(17.75 %)
179 eastern happy (primary hap 2024)
GCA_964374335.1		 n/a 15,554
(2.13 %)		 55,328
(6.30 %)		 n/a 41.16
(100.00 %)		 40
(0.00 %)		 31
(100.00 %)		 933,060
(24.43 %)		 252,509
(4.84 %)		 4,460,314
(32.70 %)		 34,184
(2.09 %)
180 eastern happy (v3 2021)
GCA_900246225.5		 n/a 15,552
(2.29 %)		 52,465
(6.26 %)		 86,437
(9.40 %)		 41.07
(99.87 %)		 490
(0.13 %)		 364
(100.00 %)		 1,309,350
(35.93 %)		 217,916
(1.89 %)		 4,547,434
(30.78 %)		 33,005
(1.88 %)
181 electric eel (alternate hap 2020)
GCA_013347915.1		 n/a 12,020
(3.63 %)		 38,881
(7.31 %)		 n/a 42.77
(100.00 %)		 n/a 2,629
(100.00 %)		 429,509
(7.66 %)		 432,260
(11.41 %)		 2,049,609
(24.32 %)		 35,597
(4.37 %)
182 electric eel (MRS-EE1 2018 U Wisconsin)
GCF_003665695.1		 40,618
(11.48 %)		 15,837
(3.85 %)		 23,074
(6.63 %)		 n/a 42.56
(96.95 %)		 119,361
(3.09 %)		 8,786
(100.00 %)		 519,014
(5.41 %)		 516,718
(6.65 %)		 3,020,801
(21.49 %)		 41,947
(3.71 %)
183 electric eel (primary hap 2020 refseq)
GCF_013358815.1		 48,958
(12.10 %)		 15,950
(3.66 %)		 48,976
(7.25 %)		 54,541
(8.42 %)		 42.49
(98.20 %)		 227
(1.80 %)		 89
(100.00 %)		 567,625
(7.41 %)		 564,286
(10.86 %)		 2,935,360
(24.79 %)		 44,501
(3.93 %)
184 electric eel (QZ-2024a 2024)
GCA_041902795.1		 n/a 16,358
(2.62 %)		 62,068
(6.39 %)		 n/a 41.74
(99.75 %)		 49
(0.25 %)		 460
(100.00 %)		 701,679
(6.15 %)		 756,011
(21.53 %)		 2,660,355
(42.28 %)		 50,381
(3.85 %)
185 elephant fish B.brachyistius (T26 2022)
GCF_023856365.1		 82,153
(9.98 %)		 16,513
(2.13 %)		 79,047
(6.37 %)		 n/a 44.15
(99.99 %)		 234
(0.01 %)		 1,425
(100.00 %)		 923,543
(11.79 %)		 425,650
(9.45 %)		 3,525,237
(34.97 %)		 91,552
(5.39 %)
186 emerald rockcod
GCF_902827165.1		 44,179
(8.48 %)		 15,275
(2.20 %)		 57,830
(6.43 %)		 63,731
(6.65 %)		 40.94
(99.99 %)		 932
(0.01 %)		 864
(100.00 %)		 460,185
(3.64 %)		 399,729
(6.87 %)		 3,533,188
(40.09 %)		 52,191
(2.51 %)
187 Eurasian minnow (alternate hap 2023)
GCA_949152275.1		 n/a 17,920
(3.03 %)		 59,697
(6.61 %)		 n/a 39.13
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 4,949
(100.00 %)		 2,285,870
(44.17 %)		 480,649
(10.13 %)		 4,833,803
(39.56 %)		 57,737
(4.15 %)
188 Eurasian minnow (primary hap 2023)
GCA_949152265.1		 n/a 17,661
(3.01 %)		 58,218
(6.54 %)		 n/a 39.21
(99.98 %)		 881
(0.02 %)		 125
(100.00 %)		 2,346,939
(44.27 %)		 502,415
(11.23 %)		 4,890,830
(40.45 %)		 60,482
(4.22 %)
189 European anchovy (BLACKSEA-1 2023)
GCF_034702125.1		 48,154
(5.87 %)		 15,415
(1.33 %)		 77,712
(5.08 %)		 n/a 44.45
(99.99 %)		 9,202
(0.02 %)		 1,922
(100.00 %)		 4,406,534
(31.73 %)		 2,331,293
(15.35 %)		 6,863,540
(50.47 %)		 80,927
(2.32 %)
190 European chub (alternate hap 2023)
GCA_949319155.1		 n/a 17,416
(2.74 %)		 60,936
(6.02 %)		 n/a 38.65
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 7,437
(100.00 %)		 2,377,147
(47.98 %)		 578,235
(8.27 %)		 5,267,308
(40.22 %)		 50,909
(3.45 %)
191 European chub (primary hap 2023)
GCA_949319135.1		 n/a 18,028
(2.64 %)		 64,206
(6.04 %)		 n/a 38.73
(99.99 %)		 588
(0.01 %)		 106
(100.00 %)		 2,649,943
(48.88 %)		 666,129
(9.08 %)		 5,751,610
(41.56 %)		 58,471
(3.64 %)
192 European conger (primary hap 2023 refseq)
GCF_963514075.1		 54,631
(7.46 %)		 17,072
(1.89 %)		 34,801
(5.07 %)		 n/a 43.89
(99.98 %)		 1,009
(0.02 %)		 380
(100.00 %)		 761,522
(5.99 %)		 913,306
(13.25 %)		 5,767,879
(35.48 %)		 120,990
(6.12 %)
193 European flounder (alternate hap 2023)
GCA_949316195.1		 n/a 14,690
(3.17 %)		 48,422
(7.90 %)		 n/a 42.61
(100.00 %)		 n/a 1,915
(100.00 %)		 1,138,190
(26.31 %)		 249,865
(4.72 %)		 3,352,038
(25.55 %)		 36,828
(3.13 %)
194 European flounder (primary hap 2023 genbank)
GCA_949316205.1		 n/a 14,753
(3.17 %)		 47,618
(7.81 %)		 n/a 42.59
(99.98 %)		 482
(0.02 %)		 109
(100.00 %)		 1,160,784
(27.06 %)		 251,985
(5.23 %)		 3,353,121
(26.00 %)		 37,130
(2.79 %)
195 European flounder (primary hap 2023 refseq)
GCF_949316205.1		 48,969
(12.45 %)		 14,751
(3.17 %)		 47,618
(7.81 %)		 n/a 42.59
(99.98 %)		 482
(0.02 %)		 108
(100.00 %)		 1,160,781
(27.06 %)		 251,983
(5.23 %)		 3,353,086
(26.00 %)		 37,129
(2.79 %)
196 European perch
GCF_010015445.1		 55,605
(8.20 %)		 15,430
(2.07 %)		 55,499
(5.43 %)		 n/a 40.90
(99.97 %)		 801
(0.03 %)		 303
(100.00 %)		 684,094
(5.16 %)		 634,788
(7.48 %)		 5,182,241
(37.07 %)		 44,049
(1.94 %)
197 European plaice (alternate hap 2022)
GCA_947347695.1		 n/a 14,619
(2.94 %)		 50,389
(7.92 %)		 n/a 42.58
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 3,222
(100.00 %)		 430,112
(3.88 %)		 299,581
(6.89 %)		 3,182,258
(27.97 %)		 40,094
(3.66 %)
198 European plaice (primary hap 2022 refseq)
GCF_947347685.1		 46,467
(10.51 %)		 14,818
(2.71 %)		 51,453
(7.41 %)		 n/a 42.51
(99.97 %)		 1,072
(0.03 %)		 355
(100.00 %)		 476,314
(3.63 %)		 520,729
(13.27 %)		 3,283,360
(33.55 %)		 47,050
(4.45 %)
199 European seabass (2021)
GCF_905237075.1		 62,470
(13.08 %)		 15,582
(2.89 %)		 44,472
(6.56 %)		 69,435
(12.92 %)		 40.38
(99.85 %)		 272
(0.15 %)		 303
(100.00 %)		 1,210,970
(24.30 %)		 278,140
(4.02 %)		 4,343,442
(26.18 %)		 15,975
(0.93 %)
200 European smelt (primary hap 2023 genbank)
GCA_963692335.1		 n/a 15,640
(3.79 %)		 50,248
(9.36 %)		 n/a 45.42
(99.90 %)		 2,462
(0.10 %)		 1,038
(100.00 %)		 1,648,435
(31.35 %)		 508,368
(13.05 %)		 1,992,832
(35.86 %)		 33,284
(4.05 %)
201 European smelt (primary hap 2023 refseq)
GCF_963692335.1		 46,762
(14.07 %)		 15,639
(3.79 %)		 50,238
(9.36 %)		 n/a 45.42
(99.90 %)		 2,462
(0.10 %)		 1,007
(100.00 %)		 1,648,428
(31.34 %)		 508,368
(13.05 %)		 1,992,793
(35.86 %)		 33,284
(4.05 %)
202 European sprat (primary hap 2023)
GCA_963457725.1		 n/a 16,181
(2.44 %)		 63,544
(7.17 %)		 n/a 43.83
(99.96 %)		 1,501
(0.04 %)		 387
(100.00 %)		 2,109,362
(31.42 %)		 1,300,159
(14.91 %)		 3,634,744
(35.44 %)		 35,552
(1.87 %)
203 fathead minnow
GCF_016745375.1		 57,312
(8.34 %)		 18,039
(3.02 %)		 52,431
(6.01 %)		 n/a 38.45
(86.78 %)		 5,594
(13.23 %)		 911
(100.00 %)		 657,027
(4.09 %)		 444,571
(6.23 %)		 4,902,960
(35.69 %)		 49,361
(2.78 %)
204 flathead mullet
GCF_022458985.1		 48,689
(12.71 %)		 14,908
(3.00 %)		 45,084
(6.96 %)		 75,582
(11.23 %)		 41.90
(99.97 %)		 445
(0.04 %)		 24
(100.00 %)		 469,841
(3.23 %)		 207,738
(2.31 %)		 3,955,233
(24.74 %)		 45,885
(3.03 %)
205 flavescent peacock cichlid (primary hap 2025)
GCA_965226115.1		 n/a 15,528
(2.10 %)		 55,124
(6.16 %)		 n/a 41.15
(100.00 %)		 31
(0.00 %)		 23
(100.00 %)		 946,588
(24.66 %)		 252,409
(5.14 %)		 4,403,110
(33.26 %)		 35,478
(2.07 %)
206 flier cichlid (alternate hap MPI-CPG 2019)
GCA_007364235.1		 n/a 17,494
(2.06 %)		 62,257
(5.73 %)		 n/a 41.17
(99.98 %)		 13
(0.02 %)		 9,305
(99.98 %)		 1,140,986
(16.60 %)		 316,083
(2.17 %)		 6,036,560
(30.48 %)		 26,445
(1.22 %)
207 flier cichlid (MPI-CPG 2019 refseq)
GCF_007364275.1		 43,842
(8.12 %)		 15,434
(2.15 %)		 26,448
(5.90 %)		 64,657
(6.60 %)		 41.23
(98.19 %)		 744
(1.81 %)		 188
(100.00 %)		 1,014,141
(16.95 %)		 287,035
(2.21 %)		 5,305,890
(30.67 %)		 24,130
(1.26 %)
208 freshwater garfish (fXenCan1 alternate hap 2020)
GCA_014839645.1		 n/a 13,745
(2.58 %)		 50,416
(6.72 %)		 n/a 41.33
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 5,171
(100.00 %)		 442,646
(4.09 %)		 276,927
(5.42 %)		 3,741,267
(26.25 %)		 28,827
(2.28 %)
209 freshwater garfish (primary hap 2020)
GCA_014839995.1		 n/a 14,625
(2.57 %)		 52,879
(6.72 %)		 n/a 41.41
(98.98 %)		 1,373
(1.02 %)		 410
(100.00 %)		 492,828
(4.29 %)		 318,631
(5.94 %)		 3,977,536
(27.41 %)		 32,390
(2.33 %)
210 giant grouper (andai-2023 2024)
GCA_041903045.1		 n/a 15,652
(1.85 %)		 56,048
(5.08 %)		 n/a 41.35
(100.00 %)		 7
(0.00 %)		 176
(100.00 %)		 640,534
(2.88 %)		 384,479
(4.59 %)		 6,438,939
(33.27 %)		 28,221
(1.10 %)
211 giant grouper (Andai001 2019)
GCF_005281545.1		 45,328
(7.65 %)		 15,661
(1.91 %)		 53,910
(4.91 %)		 n/a 41.26
(96.40 %)		 23,415
(3.61 %)		 4,201
(100.00 %)		 604,763
(2.71 %)		 357,944
(2.52 %)		 6,501,327
(30.28 %)		 26,431
(0.91 %)
212 gilthead seabream (alternate hap 2019)
GCA_900880695.1		 n/a 13,090
(2.37 %)		 48,927
(6.41 %)		 n/a 41.97
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 7,241
(100.00 %)		 422,758
(2.89 %)		 231,452
(2.54 %)		 3,818,141
(24.36 %)		 38,368
(2.40 %)
213 gilthead seabream (v2 2021)
GCA_900880675.2		 n/a 15,752
(2.45 %)		 56,395
(6.58 %)		 n/a 41.94
(99.96 %)		 1,050
(0.04 %)		 176
(100.00 %)		 1,474,134
(29.50 %)		 305,809
(3.03 %)		 4,701,691
(25.69 %)		 47,327
(2.41 %)
214 golden-line barbel
GCF_001515645.1		 74,257
(6.73 %)		 29,486
(2.77 %)		 55,545
(5.32 %)		 n/a 37.54
(89.58 %)		 136,894
(10.45 %)		 168,074
(89.55 %)		 1,118,646
(5.04 %)		 718,426
(6.54 %)		 9,092,306
(37.16 %)		 70,606
(1.91 %)
215 goldfish
GCF_003368295.1		 116,745
(8.75 %)		 35,097
(2.94 %)		 68,251
(6.12 %)		 n/a 37.48
(99.99 %)		 2,247
(0.01 %)		 8,463
(99.99 %)		 1,693,800
(5.39 %)		 916,195
(5.01 %)		 9,731,118
(40.19 %)		 66,585
(2.06 %)
216 grass carp (HZGC_01 2021)
GCF_019924925.1		 67,821
(11.16 %)		 18,195
(3.27 %)		 48,459
(5.67 %)		 n/a 37.48
(99.98 %)		 150
(0.02 %)		 31
(100.00 %)		 654,416
(3.33 %)		 429,734
(3.77 %)		 5,501,085
(40.21 %)		 26,282
(1.58 %)
217 great blue-spotted mudskipper (Guang Dong 2022)
GCF_026225935.1		 36,357
(7.09 %)		 14,512
(1.92 %)		 45,809
(4.61 %)		 n/a 39.76
(99.63 %)		 3,407
(0.37 %)		 600
(100.00 %)		 2,662,894
(54.47 %)		 803,911
(10.32 %)		 5,763,692
(48.31 %)		 53,808
(2.65 %)
218 great blue-spotted mudskipper (pooled male+femail 2014 BGI)
GCF_000788275.1		 25,835
(5.19 %)		 14,212
(1.97 %)		 27,894
(4.68 %)		 n/a 39.49
(93.15 %)		 92,327
(6.89 %)		 108,947
(93.11 %)		 552,368
(5.00 %)		 742,395
(8.07 %)		 5,901,720
(42.46 %)		 44,972
(1.97 %)
219 greater amberjack
GCF_002260705.1		 33,769
(9.11 %)		 15,336
(2.93 %)		 22,220
(6.07 %)		 n/a 40.86
(99.17 %)		 9,742
(0.82 %)		 34,656
(100.00 %)		 573,770
(4.04 %)		 368,800
(3.72 %)		 4,449,534
(24.71 %)		 15,850
(0.98 %)
220 greater argentine (alternate hap 2023)
GCA_951799415.1		 n/a 15,483
(3.45 %)		 47,484
(7.95 %)		 n/a 44.71
(100.00 %)		 n/a 4,805
(100.00 %)		 1,400,150
(23.78 %)		 738,163
(17.35 %)		 2,460,977
(35.90 %)		 20,794
(2.09 %)
221 greater argentine (primary hap 2023)
GCA_951799395.1		 n/a 16,553
(3.15 %)		 51,766
(7.37 %)		 n/a 44.75
(99.95 %)		 1,752
(0.05 %)		 1,085
(100.00 %)		 1,674,762
(26.07 %)		 900,455
(18.62 %)		 2,849,256
(39.22 %)		 26,022
(2.30 %)
222 greater pipefish (v1 alternate hap 2019)
GCA_901709685.1		 n/a 10,795
(5.59 %)		 33,380
(12.07 %)		 n/a 43.29
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 1,848
(100.00 %)		 140,376
(2.96 %)		 81,000
(3.32 %)		 1,318,564
(23.30 %)		 34,104
(12.82 %)
223 greater pipefish (v1.2 2020 refseq)
GCF_901709675.1		 47,335
(18.32 %)		 13,477
(5.26 %)		 42,380
(12.01 %)		 37,563
(15.76 %)		 43.46
(100.00 %)		 43
(0.00 %)		 87
(100.00 %)		 193,407
(3.05 %)		 125,716
(4.25 %)		 1,676,004
(25.93 %)		 46,327
(10.97 %)
224 greater pipefish (v2 2023 genbank)
GCA_948146105.1		 n/a 13,412
(4.76 %)		 45,946
(11.50 %)		 n/a 44.34
(99.99 %)		 95
(0.01 %)		 251
(100.00 %)		 494,547
(20.10 %)		 204,804
(10.66 %)		 1,444,044
(34.08 %)		 47,904
(17.47 %)
225 greater pipefish (v2 alternate haplotype 2023)
GCA_948146095.1		 n/a 13,681
(4.93 %)		 45,034
(11.64 %)		 n/a 43.88
(100.00 %)		 n/a 4,533
(100.00 %)		 460,038
(18.47 %)		 163,838
(7.90 %)		 1,681,190
(29.08 %)		 47,523
(15.60 %)
226 greater sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_949358355.1		 n/a 13,432
(2.10 %)		 50,930
(6.39 %)		 n/a 41.05
(100.00 %)		 n/a 4,952
(100.00 %)		 2,495,763
(38.80 %)		 473,105
(6.27 %)		 3,444,123
(38.56 %)		 35,298
(1.94 %)
227 greater sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949357725.1		 n/a 15,028
(2.35 %)		 50,436
(6.30 %)		 n/a 41.10
(99.97 %)		 1,188
(0.03 %)		 1,568
(100.00 %)		 2,688,222
(39.74 %)		 549,362
(7.60 %)		 3,564,661
(40.05 %)		 37,043
(1.94 %)
228 green swordtail
GCF_003331165.1		 52,602
(11.81 %)		 14,955
(2.58 %)		 47,115
(6.33 %)		 n/a 39.09
(99.71 %)		 661
(0.29 %)		 272
(100.00 %)		 328,469
(2.10 %)		 162,178
(2.35 %)		 4,801,050
(28.86 %)		 37,217
(2.39 %)
229 grey gurnard (primary hap 2023)
GCA_963514095.1		 n/a 14,752
(2.74 %)		 58,725
(8.49 %)		 n/a 43.13
(99.98 %)		 553
(0.02 %)		 322
(100.00 %)		 1,860,845
(35.64 %)		 378,045
(9.39 %)		 3,208,482
(30.12 %)		 66,857
(4.99 %)
230 gudgeon (alternate hap 2023)
GCA_949357705.1		 n/a 16,645
(1.92 %)		 62,533
(4.55 %)		 n/a 39.69
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 7,253
(100.00 %)		 5,166,731
(67.78 %)		 750,850
(11.35 %)		 5,903,440
(54.20 %)		 90,235
(5.58 %)
231 gudgeon (primary hap 2023)
GCA_949357685.1		 n/a 17,136
(1.90 %)		 63,611
(4.50 %)		 n/a 39.74
(99.99 %)		 1,046
(0.01 %)		 233
(100.00 %)		 5,662,029
(68.75 %)		 825,757
(11.99 %)		 6,236,024
(55.15 %)		 99,559
(5.68 %)
232 Gulf pipefish (Florida 2022)
GCF_024217435.2		 53,176
(17.83 %)		 13,439
(4.00 %)		 41,519
(8.87 %)		 n/a 44.92
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 495
(100.00 %)		 644,597
(20.82 %)		 180,309
(16.78 %)		 1,339,434
(43.63 %)		 51,080
(18.49 %)
233 Gulf pipefish (RoL_Ssco_1.1 Florida 2022 refseq)
GCF_024217435.1		 58,583
(18.27 %)		 13,442
(4.00 %)		 41,565
(8.87 %)		 n/a 44.92
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 496
(100.00 %)		 253,033
(3.86 %)		 180,311
(16.78 %)		 1,339,521
(43.63 %)		 51,080
(18.49 %)
234 Gulf pipefish (RoL_Ssco_1.2 Florida 2022 genbank)
GCA_024217435.4		 n/a 13,441
(4.00 %)		 41,519
(8.87 %)		 n/a 44.92
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 496
(100.00 %)		 644,601
(20.82 %)		 180,310
(16.78 %)		 1,339,461
(43.63 %)		 51,080
(18.49 %)
235 guppy
GCF_000633615.1		 48,303
(11.25 %)		 14,436
(2.72 %)		 44,759
(6.24 %)		 n/a 39.33
(90.86 %)		 458,354
(9.22 %)		 40,143
(90.84 %)		 340,480
(2.43 %)		 167,943
(1.50 %)		 4,695,380
(25.63 %)		 35,188
(1.91 %)
236 honeycomb rockfish (fSebUmb1 alternate hap 2020)
GCA_015220095.1		 n/a 15,058
(2.50 %)		 46,340
(5.85 %)		 n/a 40.71
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 2,131
(100.00 %)		 1,642,351
(37.42 %)		 389,169
(5.43 %)		 4,687,710
(35.55 %)		 34,408
(1.75 %)
237 honeycomb rockfish (primary hap 2020)
GCF_015220745.1		 57,752
(9.94 %)		 15,244
(2.44 %)		 47,034
(5.98 %)		 63,546
(8.88 %)		 40.77
(99.83 %)		 215
(0.17 %)		 138
(100.00 %)		 524,161
(3.79 %)		 422,265
(6.20 %)		 4,827,148
(36.22 %)		 37,878
(1.84 %)
238 horned golden-line barbel
GCF_001515625.1		 74,598
(6.94 %)		 30,802
(3.11 %)		 57,655
(5.63 %)		 n/a 37.18
(91.91 %)		 150,790
(8.11 %)		 314,962
(91.89 %)		 1,147,234
(4.93 %)		 708,513
(4.77 %)		 9,080,512
(35.95 %)		 63,217
(1.71 %)
239 humpback grouper (ca_2020 2021)
GCA_019925165.1		 n/a 15,747
(1.90 %)		 53,724
(4.85 %)		 n/a 41.28
(100.00 %)		 518
(0.00 %)		 306
(100.00 %)		 2,548,626
(45.61 %)		 366,695
(6.82 %)		 6,355,082
(33.14 %)		 22,330
(0.83 %)
240 humphead wrasse
GCF_018320785.1		 42,229
(6.60 %)		 15,287
(1.66 %)		 47,025
(4.13 %)		 n/a 39.53
(100.00 %)		 284
(0.00 %)		 46
(100.00 %)		 447,458
(2.27 %)		 310,170
(4.65 %)		 8,002,463
(32.97 %)		 12,252
(0.38 %)
241 Indian glassy fish (alternate hap 2019)
GCA_900651595.1		 n/a 14,412
(3.70 %)		 41,944
(8.58 %)		 n/a 42.27
(99.58 %)		 230
(0.42 %)		 2,242
(100.00 %)		 304,774
(2.86 %)		 140,555
(2.80 %)		 2,689,154
(24.08 %)		 15,419
(1.38 %)
242 Indian glassy fish (v2 2020)
GCA_900634625.2		 n/a 15,339
(3.60 %)		 44,099
(8.47 %)		 57,867
(10.10 %)		 42.38
(98.08 %)		 1,523
(1.92 %)		 157
(100.00 %)		 346,399
(3.02 %)		 163,524
(3.00 %)		 2,755,274
(25.07 %)		 17,931
(1.47 %)
243 Indian medaka
GCF_002922805.2		 49,295
(10.27 %)		 14,591
(2.49 %)		 52,982
(6.37 %)		 n/a 39.04
(94.83 %)		 51,550
(5.20 %)		 8,493
(100.00 %)		 319,151
(2.20 %)		 208,690
(2.67 %)		 5,412,546
(33.29 %)		 40,721
(2.36 %)
244 Indo-Pacific tarpon (2020)
GCF_013368585.1		 41,570
(6.90 %)		 18,302
(2.47 %)		 29,762
(5.45 %)		 74,968
(7.01 %)		 43.02
(99.97 %)		 63
(0.03 %)		 207
(100.00 %)		 603,558
(3.71 %)		 433,446
(4.32 %)		 5,341,985
(22.07 %)		 78,561
(3.69 %)
245 Japanese flounder
GCF_001970005.1		 37,838
(12.25 %)		 14,521
(3.39 %)		 30,773
(7.34 %)		 n/a 41.64
(81.04 %)		 40,314
(18.97 %)		 9,525
(100.00 %)		 332,322
(2.84 %)		 164,916
(1.16 %)		 3,476,344
(17.36 %)		 21,768
(1.42 %)
246 Japanese flounder (ysfri-2021 2022)
GCF_024713975.1		 60,200
(14.08 %)		 14,987
(3.26 %)		 42,919
(7.40 %)		 n/a 41.54
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 25
(100.00 %)		 850,797
(19.88 %)		 308,390
(6.45 %)		 3,329,304
(26.55 %)		 23,373
(1.76 %)
247 Japanese medaka
GCF_002234675.1		 50,526
(10.32 %)		 14,325
(2.50 %)		 27,912
(6.71 %)		 91,652
(11.67 %)		 40.84
(99.93 %)		 491
(0.07 %)		 25
(100.00 %)		 384,317
(4.42 %)		 163,041
(3.07 %)		 4,631,750
(34.91 %)		 41,215
(2.89 %)
248 jewelled blenny (2019)
GCF_902148845.1		 42,877
(8.61 %)		 15,188
(2.40 %)		 41,262
(7.86 %)		 58,418
(6.97 %)		 44.34
(98.69 %)		 602
(1.31 %)		 203
(100.00 %)		 667,122
(4.21 %)		 442,004
(5.09 %)		 4,388,570
(26.54 %)		 121,464
(9.36 %)
249 jewelled blenny (alternate hap 2019)
GCA_902148835.1		 n/a 15,945
(2.17 %)		 101,825
(8.93 %)		 n/a 44.49
(99.63 %)		 9
(0.37 %)		 4,516
(100.00 %)		 744,228
(4.25 %)		 519,896
(5.73 %)		 4,677,160
(28.52 %)		 138,484
(9.55 %)
250 John dory (alternate hap 2023)
GCA_960530785.1		 n/a 14,960
(2.23 %)		 74,436
(6.65 %)		 n/a 43.94
(100.00 %)		 n/a 5,370
(100.00 %)		 1,620,688
(23.00 %)		 902,057
(13.66 %)		 4,547,953
(39.90 %)		 129,990
(12.07 %)
251 John dory (primary hap 2023)
GCA_960531495.1		 n/a 14,906
(2.33 %)		 72,029
(6.72 %)		 n/a 43.92
(99.98 %)		 887
(0.02 %)		 191
(100.00 %)		 1,609,654
(22.82 %)		 897,264
(13.58 %)		 4,548,467
(39.80 %)		 129,147
(11.75 %)
252 kelp grouper (mb 2019)
GCF_006386435.1		 45,790
(8.57 %)		 15,561
(1.99 %)		 53,188
(5.12 %)		 n/a 41.32
(97.02 %)		 48,394
(2.99 %)		 4,563
(100.00 %)		 574,889
(2.73 %)		 367,135
(2.64 %)		 6,420,280
(29.10 %)		 28,979
(1.07 %)
253 kelp perch (BFR_SWC_R1_liver_20210118 2023)
GCF_029030835.1		 40,680
(11.49 %)		 14,847
(3.17 %)		 46,307
(7.10 %)		 n/a 41.87
(100.00 %)		 n/a 1,003
(100.00 %)		 967,639
(17.54 %)		 319,567
(5.43 %)		 3,743,006
(26.82 %)		 47,481
(4.63 %)
254 Korean giant-fin mudskipper (v1 alternate hap 2020 genbank)
GCA_009829135.1		 n/a 13,470
(2.34 %)		 42,799
(5.73 %)		 n/a 40.16
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,799
(100.00 %)		 394,414
(4.41 %)		 509,973
(7.17 %)		 4,581,968
(38.91 %)		 34,522
(2.54 %)
255 Korean giant-fin mudskipper (v1.2 primary hap 2023)
GCF_009829125.3		 33,236
(8.44 %)		 14,601
(2.46 %)		 44,145
(5.80 %)		 n/a 40.22
(99.05 %)		 701
(0.95 %)		 122
(100.00 %)		 1,755,227
(42.93 %)		 551,482
(7.22 %)		 4,887,087
(38.97 %)		 37,287
(2.58 %)
256 lake trout
GCF_016432855.1		 65,012
(4.57 %)		 26,528
(1.53 %)		 112,119
(4.47 %)		 76,885
(3.80 %)		 43.50
(99.99 %)		 3,264
(0.01 %)		 4,121
(100.00 %)		 1,387,896
(5.81 %)		 1,797,785
(19.28 %)		 9,643,314
(54.44 %)		 85,419
(2.52 %)
257 lake whitefish (EN20210322 male 2021 Laval U)
GCF_018398675.1		 78,867
(4.31 %)		 27,579
(1.38 %)		 113,850
(3.63 %)		 n/a 44.18
(100.00 %)		 1,716
(0.00 %)		 6,355
(100.00 %)		 1,729,029
(6.03 %)		 1,781,307
(15.24 %)		 9,311,548
(61.16 %)		 126,142
(4.04 %)
258 lake whitefish (EN_2021a female 2021 Laval U)
GCF_020615455.1		 87,259
(4.53 %)		 28,366
(1.38 %)		 117,266
(3.71 %)		 n/a 44.12
(100.00 %)		 1,159
(0.00 %)		 7,334
(100.00 %)		 1,768,537
(6.02 %)		 1,793,716
(15.51 %)		 9,525,312
(61.13 %)		 126,485
(3.95 %)
259 lantern fish (primary hap 2024)
GCA_963921795.1		 n/a 17,851
(1.28 %)		 83,249
(5.18 %)		 n/a 42.69
(99.97 %)		 2,397
(0.03 %)		 709
(100.00 %)		 7,797,173
(37.37 %)		 1,593,818
(10.64 %)		 7,610,300
(54.05 %)		 127,942
(3.84 %)
260 large yellow croaker
GCF_000972845.2		 49,927
(11.76 %)		 15,365
(3.00 %)		 26,101
(6.66 %)		 n/a 41.34
(99.67 %)		 7,424
(0.33 %)		 9,998
(100.00 %)		 478,685
(3.50 %)		 306,063
(3.37 %)		 4,199,578
(24.80 %)		 28,138
(2.09 %)
261 large-eye snaggletooth (alternate hap 2023)
GCA_949987545.1		 n/a 15,841
(2.36 %)		 79,276
(8.51 %)		 n/a 46.35
(100.00 %)		 n/a 5,761
(100.00 %)		 2,935,570
(42.17 %)		 1,208,602
(21.28 %)		 3,157,730
(42.63 %)		 88,759
(6.30 %)
262 large-eye snaggletooth (primary hap 2023)
GCA_949987555.1		 n/a 16,376
(2.19 %)		 82,947
(7.99 %)		 n/a 46.31
(99.94 %)		 2,631
(0.06 %)		 1,522
(100.00 %)		 3,333,323
(43.58 %)		 1,553,932
(25.91 %)		 3,393,507
(46.78 %)		 99,668
(6.39 %)
263 largemouth bass (2-A1 2021)
GCA_019677235.1		 n/a 15,790
(2.31 %)		 50,332
(5.65 %)		 n/a 40.87
(99.96 %)		 672
(0.04 %)		 202
(100.00 %)		 464,845
(2.71 %)		 255,513
(3.69 %)		 5,124,388
(29.65 %)		 25,920
(1.67 %)
264 largemouth bass (LMB-PRFRI aquatic 2020)
GCF_014851395.1		 55,170
(9.49 %)		 16,635
(2.18 %)		 56,707
(5.52 %)		 n/a 40.86
(99.85 %)		 2,909
(0.15 %)		 4,753
(100.00 %)		 497,281
(2.60 %)		 269,495
(3.70 %)		 5,496,732
(29.60 %)		 28,733
(1.66 %)
265 largescale foureyes (fAnaAna1 alternate hap 2020)
GCA_014839705.1		 n/a 8,132
(2.11 %)		 25,878
(4.67 %)		 n/a 38.55
(100.00 %)		 n/a 5,088
(100.00 %)		 260,789
(2.73 %)		 158,564
(2.12 %)		 3,023,128
(27.39 %)		 9,678
(1.02 %)
266 largescale foureyes (primary hap 2020)
GCA_014839685.1		 n/a 14,774
(2.18 %)		 42,858
(4.83 %)		 58,247
(6.94 %)		 38.54
(99.96 %)		 107
(0.04 %)		 33
(100.00 %)		 506,950
(2.73 %)		 305,170
(2.13 %)		 6,194,879
(29.85 %)		 17,881
(0.94 %)
267 leafy seadragon (BA_2022a 2022)
GCF_024500275.1		 46,242
(10.23 %)		 13,712
(2.62 %)		 43,369
(5.56 %)		 n/a 42.40
(100.00 %)		 76
(0.00 %)		 1,537
(100.00 %)		 1,406,779
(35.37 %)		 202,983
(7.44 %)		 3,933,128
(41.19 %)		 70,560
(7.78 %)
268 lemon sole (primary hap 2024)
GCA_964266715.1		 n/a 14,961
(2.55 %)		 52,234
(6.83 %)		 n/a 41.57
(99.99 %)		 409
(0.01 %)		 1,601
(100.00 %)		 1,233,052
(39.33 %)		 366,741
(18.98 %)		 3,296,338
(36.77 %)		 44,712
(2.85 %)
269 leopard coralgrouper
GCF_008729295.1		 38,671
(7.52 %)		 15,538
(2.18 %)		 57,480
(5.26 %)		 n/a 39.54
(98.22 %)		 3,611
(1.77 %)		 94,260
(100.00 %)		 629,451
(3.42 %)		 385,539
(3.83 %)		 6,343,655
(29.35 %)		 27,018
(1.26 %)
270 leopard coralgrouper (2020)
GCA_011397275.1		 n/a 14,279
(2.33 %)		 42,076
(5.46 %)		 n/a 39.56
(99.93 %)		 1,076
(0.07 %)		 110
(100.00 %)		 549,895
(3.48 %)		 327,803
(5.10 %)		 5,415,686
(29.83 %)		 22,432
(1.37 %)
271 leopard coralgrouper (mb 2020)
GCA_008729295.2		 n/a 15,538
(2.19 %)		 57,440
(5.26 %)		 n/a 39.54
(98.22 %)		 3,611
(1.77 %)		 94,259
(100.00 %)		 627,843
(3.43 %)		 385,539
(3.83 %)		 6,342,852
(29.35 %)		 27,018
(1.26 %)
272 lesser salmon catfish (fNeoGra1 alternate hap 2023)
GCA_027579805.1		 n/a 15,487
(0.88 %)		 85,135
(3.39 %)		 n/a 42.43
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 6,593
(100.00 %)		 5,572,163
(49.59 %)		 1,052,072
(6.02 %)		 7,246,646
(62.69 %)		 157,768
(4.38 %)
273 lesser salmon catfish (primary hap 2023 refseq)
GCF_027579695.1		 53,323
(3.35 %)		 15,955
(0.92 %)		 85,700
(3.30 %)		 n/a 42.44
(99.43 %)		 334
(0.57 %)		 38
(100.00 %)		 6,041,262
(71.88 %)		 1,126,468
(6.51 %)		 7,609,180
(62.74 %)		 166,630
(4.38 %)
274 lesser sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_950004245.1		 n/a 13,792
(2.19 %)		 51,353
(6.60 %)		 n/a 41.16
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 3,620
(100.00 %)		 2,536,362
(38.05 %)		 513,115
(7.50 %)		 3,542,854
(37.60 %)		 31,814
(1.79 %)
275 lesser sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949987685.1		 n/a 13,908
(2.19 %)		 50,634
(6.50 %)		 n/a 41.22
(99.97 %)		 1,017
(0.03 %)		 701
(100.00 %)		 2,698,640
(39.19 %)		 577,328
(8.51 %)		 3,615,231
(39.17 %)		 33,251
(1.82 %)
276 lesser weever (primary hap 2023)
GCA_963691815.1		 n/a 15,269
(2.44 %)		 52,449
(6.28 %)		 n/a 41.81
(99.99 %)		 606
(0.02 %)		 133
(100.00 %)		 1,879,201
(31.40 %)		 449,901
(9.89 %)		 4,248,556
(33.21 %)		 43,864
(3.01 %)
277 limp eelpout (alternate hap 2023)
GCA_949748265.1		 n/a 15,033
(2.98 %)		 51,296
(7.68 %)		 n/a 43.01
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 2,700
(100.00 %)		 1,099,919
(28.68 %)		 314,919
(9.57 %)		 2,620,601
(30.23 %)		 49,248
(4.19 %)
278 limp eelpout (primary hap 2023)
GCA_949748355.1		 n/a 15,060
(2.89 %)		 50,064
(7.31 %)		 n/a 41.88
(99.98 %)		 589
(0.02 %)		 534
(100.00 %)		 1,116,427
(28.18 %)		 315,489
(13.14 %)		 2,598,812
(33.21 %)		 50,192
(3.82 %)
279 live sharksucker (alternate hap 2019)
GCA_900963505.1		 n/a 14,632
(3.51 %)		 40,441
(7.51 %)		 n/a 41.42
(99.96 %)		 19
(0.04 %)		 1,405
(100.00 %)		 435,742
(3.57 %)		 139,003
(1.51 %)		 3,161,165
(22.06 %)		 16,302
(1.34 %)
280 live sharksucker (v2 2021)
GCA_900963305.2		 n/a 14,975
(3.53 %)		 40,908
(7.56 %)		 n/a 41.43
(99.89 %)		 140
(0.11 %)		 38
(100.00 %)		 772,309
(14.49 %)		 146,353
(1.65 %)		 3,204,473
(21.79 %)		 16,807
(1.33 %)
281 longspined bullhead (.1 primary hap 2021)
GCA_910589615.1		 n/a 15,027
(3.10 %)		 51,137
(7.71 %)		 n/a 42.22
(99.99 %)		 242
(0.01 %)		 27
(100.00 %)		 452,844
(4.81 %)		 417,308
(9.63 %)		 3,262,282
(28.51 %)		 55,527
(4.38 %)
282 longspined bullhead (fTauBub2.1 alternate hap 2021)
GCA_910589325.1		 n/a 15,137
(3.09 %)		 52,499
(7.75 %)		 n/a 42.22
(100.00 %)		 n/a 1,778
(100.00 %)		 448,166
(4.67 %)		 416,181
(8.95 %)		 3,288,388
(27.99 %)		 55,747
(4.41 %)
283 lumpfish (alternate hap 2019)
GCA_009769515.1		 n/a 12,848
(3.32 %)		 43,711
(8.09 %)		 n/a 42.84
(100.00 %)		 n/a 1,866
(100.00 %)		 407,698
(6.03 %)		 360,501
(11.29 %)		 2,456,041
(28.07 %)		 45,916
(5.21 %)
284 lumpfish (primary hap v2.1 2023 genbank)
GCA_963457625.1		 n/a 14,944
(3.23 %)		 50,328
(8.09 %)		 n/a 42.82
(99.97 %)		 954
(0.03 %)		 232
(100.00 %)		 1,034,598
(25.93 %)		 434,819
(13.21 %)		 2,907,371
(30.18 %)		 55,066
(5.20 %)
285 lumpfish (v1 primary hap 2019 refseq)
GCF_009769545.1		 41,612
(11.11 %)		 14,752
(3.31 %)		 49,223
(8.10 %)		 52,721
(8.34 %)		 42.83
(98.22 %)		 347
(1.78 %)		 48
(100.00 %)		 478,386
(6.02 %)		 421,632
(11.07 %)		 2,928,619
(27.99 %)		 53,321
(5.09 %)
286 lyretail cichlid
GCF_000239395.1		 38,273
(10.03 %)		 14,804
(2.69 %)		 23,751
(5.79 %)		 n/a 40.44
(80.94 %)		 109,100
(19.10 %)		 118,181
(80.90 %)		 695,696
(14.49 %)		 119,381
(1.10 %)		 4,539,429
(19.49 %)		 18,098
(0.91 %)
287 Malawi cichlid R.sp.'chilingali' (2024)
GCA_963969265.1		 n/a 15,501
(2.18 %)		 54,090
(6.20 %)		 n/a 41.17
(99.99 %)		 422
(0.01 %)		 82
(100.00 %)		 1,727,328
(38.16 %)		 259,351
(4.71 %)		 4,381,278
(33.25 %)		 35,281
(1.93 %)
288 mandarin fish (FFG_IHB_CAS 2021)
GCF_020085105.1		 64,831
(12.89 %)		 15,283
(2.75 %)		 43,349
(6.02 %)		 n/a 40.35
(100.00 %)		 93
(0.00 %)		 65
(100.00 %)		 441,324
(3.38 %)		 206,420
(2.54 %)		 4,582,841
(27.41 %)		 15,999
(1.17 %)
289 mandarin fish (RoL2022-P1 2023)
GCF_027744825.2		 49,029
(12.41 %)		 14,186
(3.08 %)		 55,502
(8.05 %)		 n/a 43.27
(100.00 %)		 19
(0.00 %)		 97
(100.00 %)		 321,832
(4.91 %)		 114,318
(16.04 %)		 2,300,636
(32.10 %)		 46,312
(5.05 %)
290 mangrove rivulus
GCF_001649575.2		 46,187
(11.82 %)		 14,522
(2.87 %)		 46,641
(6.86 %)		 n/a 40.03
(94.31 %)		 32,278
(5.70 %)		 300
(100.00 %)		 345,678
(2.32 %)		 146,263
(1.33 %)		 4,718,292
(27.30 %)		 39,541
(2.69 %)
291 marbled rockcod (alternate hap 2023)
GCA_949606865.1		 n/a 14,564
(1.72 %)		 71,604
(6.41 %)		 n/a 41.49
(100.00 %)		 n/a 8,737
(100.00 %)		 1,662,251
(42.29 %)		 439,119
(12.96 %)		 3,776,125
(45.00 %)		 56,507
(2.83 %)
292 marbled rockcod (primary hap 2023)
GCA_949606895.1		 n/a 15,070
(1.79 %)		 71,367
(6.50 %)		 n/a 41.46
(99.92 %)		 4,157
(0.08 %)		 943
(100.00 %)		 1,717,591
(42.63 %)		 474,348
(12.30 %)		 4,011,319
(44.93 %)		 59,531
(2.83 %)
293 Mariana snailfish (Mariana Trench HS2019 2023)
GCF_029220125.1		 44,376
(10.91 %)		 14,032
(2.80 %)		 60,400
(8.09 %)		 n/a 43.84
(99.86 %)		 974
(0.14 %)		 200
(100.00 %)		 1,157,953
(36.57 %)		 569,832
(12.19 %)		 2,864,996
(37.65 %)		 98,423
(9.53 %)
294 Mexican tetra (2017 WashU)
GCF_000372685.2		 47,018
(6.00 %)		 16,516
(1.68 %)		 33,920
(4.24 %)		 n/a 38.00
(96.73 %)		 621
(3.27 %)		 2,415
(100.00 %)		 1,125,511
(6.89 %)		 1,113,607
(11.76 %)		 8,546,053
(42.44 %)		 44,933
(1.77 %)
295 Mexican tetra (ESR-SI-001 2022)
GCF_023375975.1		 71,254
(7.50 %)		 16,674
(1.63 %)		 52,903
(4.12 %)		 101,896
(6.64 %)		 38.24
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 109
(100.00 %)		 1,155,823
(4.90 %)		 1,363,316
(12.23 %)		 7,667,721
(47.23 %)		 48,358
(1.88 %)
296 Mexican tetra (Pach_M1 Pachon cave 2021)
GCA_019721115.1		 n/a 16,698
(1.62 %)		 62,818
(5.14 %)		 74,339
(6.58 %)		 38.41
(99.99 %)		 334
(0.01 %)		 195
(100.00 %)		 1,194,830
(5.04 %)		 1,460,981
(11.81 %)		 7,590,179
(47.66 %)		 50,533
(2.46 %)
297 Midas cichlid (2014)
GCA_000751415.1		 n/a 15,067
(2.44 %)		 45,263
(5.54 %)		 n/a 40.74
(92.95 %)		 617,558
(7.14 %)		 624,195
(92.86 %)		 867,309
(14.82 %)		 199,669
(1.16 %)		 5,215,762
(25.14 %)		 13,920
(0.64 %)
298 milkfish (2019)
GCF_902362185.1		 30,812
(7.61 %)		 16,869
(3.41 %)		 21,377
(6.58 %)		 n/a 41.53
(99.36 %)		 112
(0.64 %)		 31
(100.00 %)		 958,774
(8.18 %)		 731,733
(9.10 %)		 3,702,024
(26.31 %)		 22,089
(1.27 %)
299 milkfish (alternate hap 2019)
GCA_902362175.1		 n/a 16,565
(3.38 %)		 42,094
(6.75 %)		 n/a 41.51
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 1,937
(100.00 %)		 930,392
(8.11 %)		 708,375
(9.04 %)		 3,612,575
(26.46 %)		 21,531
(1.27 %)
300 minispotted lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963454915.1		 n/a 17,701
(1.62 %)		 73,433
(5.69 %)		 n/a 42.20
(99.98 %)		 1,398
(0.02 %)		 388
(100.00 %)		 6,438,444
(40.32 %)		 1,202,669
(11.51 %)		 7,055,665
(47.04 %)		 74,954
(3.44 %)
301 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 alternate hap 2022)
GCA_023349535.1		 n/a 15,176
(3.17 %)		 47,458
(7.48 %)		 n/a 42.05
(99.99 %)		 927
(0.02 %)		 486
(100.00 %)		 1,167,409
(26.98 %)		 438,114
(8.08 %)		 3,351,987
(27.25 %)		 45,298
(3.39 %)
302 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 primary hap 2022)
GCA_023349555.1		 n/a 14,480
(3.19 %)		 44,951
(7.47 %)		 n/a 42.05
(99.98 %)		 936
(0.02 %)		 725
(100.00 %)		 1,101,582
(26.86 %)		 415,846
(8.16 %)		 3,162,480
(27.08 %)		 42,657
(3.44 %)
303 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 primary hap 2022)
GCF_023349555.1		 40,276
(12.25 %)		 14,478
(3.19 %)		 44,951
(7.47 %)		 n/a 42.05
(99.98 %)		 936
(0.02 %)		 1,660
(99.98 %)		 1,101,578
(26.86 %)		 415,846
(8.16 %)		 3,162,428
(27.08 %)		 42,657
(3.44 %)
304 Monterrey platyfish
GCF_001444195.1		 53,100
(12.11 %)		 14,672
(2.71 %)		 27,552
(6.74 %)		 n/a 39.02
(99.85 %)		 229
(0.15 %)		 68
(100.00 %)		 305,761
(2.11 %)		 134,157
(2.14 %)		 4,687,726
(28.26 %)		 33,082
(2.28 %)
305 mormyrid electric fish (MSU_618 2025)
GCF_048594095.1		 77,155
(10.70 %)		 16,413
(2.24 %)		 85,893
(7.33 %)		 n/a 43.96
(100.00 %)		 249
(0.00 %)		 407
(100.00 %)		 447,893
(2.43 %)		 464,565
(9.46 %)		 3,801,201
(29.32 %)		 93,225
(5.54 %)
306 mummichog (Maine)
GCF_000826765.1		 41,183
(7.38 %)		 14,602
(1.92 %)		 57,194
(5.03 %)		 35,597
(6.40 %)		 40.58
(91.29 %)		 123,625
(8.75 %)		 120,723
(91.25 %)		 447,158
(2.19 %)		 235,336
(1.39 %)		 6,518,990
(26.03 %)		 54,589
(2.39 %)
307 mummichog (U. Missouri)
GCF_011125445.2		 56,612
(6.89 %)		 15,361
(1.60 %)		 69,801
(5.20 %)		 n/a 40.76
(99.88 %)		 2,820
(0.12 %)		 1,031
(100.00 %)		 636,480
(2.75 %)		 392,130
(3.32 %)		 7,023,777
(32.98 %)		 81,101
(3.45 %)
308 New Zealand spotty (alternate hap 2019 genbank)
GCA_009762545.1		 n/a 13,566
(2.17 %)		 40,774
(5.21 %)		 n/a 40.81
(100.00 %)		 n/a 3,286
(100.00 %)		 472,659
(4.46 %)		 348,429
(5.17 %)		 4,169,213
(33.57 %)		 16,368
(0.83 %)
309 New Zealand spotty (primary hap 2019 genbank)
GCA_009762535.1		 n/a 14,609
(2.22 %)		 43,262
(5.33 %)		 60,241
(8.02 %)		 40.86
(98.32 %)		 1,135
(1.69 %)		 468
(100.00 %)		 519,324
(4.65 %)		 393,329
(5.54 %)		 4,522,265
(33.34 %)		 18,302
(0.85 %)
310 New Zealand spotty (primary hap refseq)
GCF_009762535.1		 45,555
(9.06 %)		 14,609
(2.22 %)		 43,259
(5.33 %)		 60,241
(8.02 %)		 40.86
(98.32 %)		 1,135
(1.69 %)		 467
(100.00 %)		 517,755
(4.63 %)		 393,328
(5.54 %)		 4,522,224
(33.34 %)		 18,299
(0.85 %)
311 Nile tilapia
GCF_001858045.2		 77,397
(10.87 %)		 15,599
(1.99 %)		 32,839
(6.04 %)		 n/a 40.73
(99.99 %)		 551
(0.01 %)		 2,460
(100.00 %)		 600,869
(5.40 %)		 291,105
(3.17 %)		 4,958,128
(31.15 %)		 32,038
(1.81 %)
312 ninespine stickleback (alternate hap 2023)
GCA_949316245.1		 n/a 13,050
(3.93 %)		 44,650
(10.12 %)		 n/a 44.10
(100.00 %)		 n/a 1,934
(100.00 %)		 512,583
(14.83 %)		 156,305
(8.46 %)		 2,005,803
(27.09 %)		 59,674
(9.19 %)
313 ninespine stickleback (NSP_V7 2020)
GCF_902500615.1		 51,166
(15.31 %)		 14,765
(3.99 %)		 49,191
(9.80 %)		 n/a 44.37
(99.99 %)		 341
(0.01 %)		 1,667
(100.00 %)		 380,357
(3.60 %)		 188,301
(6.29 %)		 2,422,266
(25.70 %)		 72,584
(9.69 %)
314 ninespine stickleback (primary hap 2023 genbank)
GCA_949316345.1		 n/a 14,600
(3.83 %)		 49,927
(9.98 %)		 n/a 44.12
(99.97 %)		 738
(0.03 %)		 175
(100.00 %)		 599,088
(14.68 %)		 186,747
(10.27 %)		 2,273,942
(28.36 %)		 70,136
(9.39 %)
315 ninespine stickleback (primary hap 2023 refseq)
GCF_949316345.1		 57,816
(15.11 %)		 14,598
(3.83 %)		 49,473
(9.87 %)		 n/a 44.12
(99.97 %)		 738
(0.03 %)		 174
(100.00 %)		 599,085
(14.68 %)		 186,746
(10.27 %)		 2,273,889
(28.36 %)		 70,136
(9.39 %)
316 North African catfish (Netherlands MV-2021 2022)
GCF_024256425.1		 51,085
(7.42 %)		 15,809
(2.17 %)		 43,728
(4.54 %)		 n/a 39.00
(100.00 %)		 n/a 48
(100.00 %)		 2,472,286
(44.73 %)		 560,123
(5.68 %)		 6,203,876
(38.64 %)		 42,187
(2.72 %)
317 North African catfish (Netherlands MV-2021 alternate hap 2022)
GCA_024256465.1		 n/a 15,704
(2.16 %)		 43,094
(4.57 %)		 n/a 38.93
(99.99 %)		 115
(0.01 %)		 104
(100.00 %)		 1,034,605
(5.50 %)		 566,093
(5.52 %)		 6,229,176
(38.50 %)		 41,022
(2.53 %)
318 North African catfish (Netherlands MV-2021 primary hap 2022)
GCA_024256435.1		 n/a 15,762
(2.12 %)		 43,732
(4.51 %)		 n/a 38.98
(100.00 %)		 180
(0.00 %)		 278
(100.00 %)		 1,071,044
(5.64 %)		 581,680
(6.16 %)		 6,228,783
(39.01 %)		 42,159
(2.70 %)
319 northern cavefish (hap1 2024)
GCA_046255685.1		 n/a 14,295
(2.22 %)		 50,623
(6.07 %)		 n/a 42.09
(99.99 %)		 466
(0.01 %)		 892
(100.00 %)		 1,941,831
(49.35 %)		 650,256
(17.85 %)		 3,210,410
(44.77 %)		 55,251
(4.79 %)
320 northern cavefish (hap2 2024)
GCA_046255725.1		 n/a 14,542
(2.12 %)		 51,650
(5.81 %)		 n/a 41.56
(99.99 %)		 484
(0.01 %)		 667
(100.00 %)		 2,014,967
(51.82 %)		 755,698
(19.90 %)		 3,290,098
(47.08 %)		 57,881
(4.66 %)
321 northern pike
GCF_004634155.1		 66,376
(9.11 %)		 16,778
(2.37 %)		 27,040
(5.41 %)		 n/a 42.29
(99.99 %)		 584
(0.01 %)		 908
(100.00 %)		 1,065,458
(31.14 %)		 531,451
(7.80 %)		 4,677,366
(33.26 %)		 44,793
(2.82 %)
322 northern pike (alternate hap 2020)
GCA_011004835.1		 n/a 11,782
(2.41 %)		 40,748
(5.68 %)		 n/a 42.32
(99.93 %)		 11
(0.07 %)		 3,813
(100.00 %)		 700,818
(30.15 %)		 372,729
(7.71 %)		 3,058,655
(31.76 %)		 29,687
(2.57 %)
323 northern pike (primary hap 2020 refseq)
GCF_011004845.1		 63,720
(9.28 %)		 16,618
(2.41 %)		 55,784
(5.64 %)		 82,941
(8.82 %)		 42.22
(99.89 %)		 112
(0.11 %)		 53
(100.00 %)		 984,415
(29.15 %)		 524,708
(7.32 %)		 4,691,096
(32.91 %)		 42,910
(2.52 %)
324 northern snakehead (prfri 2023)
GCF_033026475.1		 61,639
(13.32 %)		 15,131
(2.87 %)		 35,444
(5.74 %)		 n/a 39.76
(100.00 %)		 52
(0.00 %)		 291
(100.00 %)		 830,033
(26.45 %)		 152,304
(8.77 %)		 3,778,846
(29.39 %)		 8,436
(0.70 %)
325 ocellated dragonet (captive hap1 2024)
GCA_044231665.1		 n/a 13,787
(3.68 %)		 60,819
(10.07 %)		 n/a 45.42
(100.00 %)		 99
(0.00 %)		 108
(100.00 %)		 259,874
(3.38 %)		 94,885
(3.76 %)		 2,302,967
(21.04 %)		 58,433
(13.25 %)
326 ocellated dragonet (captive hap2 2024)
GCA_044231645.1		 n/a 13,709
(3.65 %)		 60,517
(9.98 %)		 n/a 45.43
(100.00 %)		 111
(0.00 %)		 129
(100.00 %)		 272,479
(3.57 %)		 101,623
(4.29 %)		 2,384,412
(21.91 %)		 58,256
(13.22 %)
327 Old Calabar mormyrid (PKING1 2018)
GCF_002872115.1		 61,915
(11.48 %)		 15,987
(2.73 %)		 33,963
(6.66 %)		 n/a 43.93
(92.03 %)		 49,579
(7.99 %)		 4,666
(100.00 %)		 348,463
(2.27 %)		 314,129
(2.95 %)		 4,259,711
(20.83 %)		 76,846
(4.18 %)
328 old wife E.armatus (hap1 2024)
GCF_043641665.1		 32,231
(8.81 %)		 15,382
(3.41 %)		 41,015
(7.24 %)		 n/a 42.00
(100.00 %)		 114
(0.00 %)		 136
(100.00 %)		 1,143,877
(18.90 %)		 219,801
(2.87 %)		 3,652,133
(23.09 %)		 19,721
(1.34 %)
329 old wife E.armatus (hap2 2024)
GCA_043640875.1		 n/a 15,360
(3.42 %)		 41,012
(7.26 %)		 n/a 41.99
(100.00 %)		 100
(0.00 %)		 94
(100.00 %)		 438,416
(3.46 %)		 219,275
(2.83 %)		 3,623,998
(22.85 %)		 19,710
(1.32 %)
330 orangethroat darter
GCF_008692095.1		 55,448
(8.29 %)		 15,000
(2.25 %)		 49,918
(5.41 %)		 n/a 40.91
(99.57 %)		 101,221
(0.47 %)		 3,119
(100.00 %)		 566,915
(3.75 %)		 509,018
(6.60 %)		 5,142,090
(31.18 %)		 26,702
(1.46 %)
331 orbiculate cardinalfish (2019)
GCF_902148855.1		 46,571
(5.47 %)		 15,761
(1.50 %)		 31,563
(4.00 %)		 59,905
(3.98 %)		 37.90
(99.73 %)		 1,844
(0.27 %)		 340
(100.00 %)		 1,257,250
(5.57 %)		 979,214
(8.64 %)		 6,386,731
(48.59 %)		 29,320
(0.87 %)
332 orbiculate cardinalfish (alternate hap 2019)
GCA_902148825.1		 n/a 14,018
(1.51 %)		 45,251
(3.61 %)		 n/a 37.73
(99.94 %)		 142
(0.06 %)		 7,038
(99.94 %)		 1,041,393
(5.09 %)		 744,623
(6.94 %)		 6,250,631
(45.53 %)		 22,522
(0.77 %)
333 oriental weatherfish (2024)
GCF_027580225.2		 72,545
(8.62 %)		 17,655
(2.31 %)		 50,007
(4.93 %)		 n/a 38.17
(100.00 %)		 110
(0.00 %)		 61
(100.00 %)		 446,769
(2.37 %)		 424,953
(7.13 %)		 6,268,308
(45.46 %)		 53,150
(3.31 %)
334 oriental weatherfish (BS_2022a 2023)
GCF_027580225.1		 68,792
(8.54 %)		 17,223
(2.28 %)		 49,697
(5.11 %)		 n/a 38.10
(99.99 %)		 614
(0.01 %)		 358
(100.00 %)		 2,925,549
(40.35 %)		 402,676
(5.35 %)		 5,933,365
(45.71 %)		 56,843
(3.18 %)
335 Osbeck's grenadier anchovy (Shantou hap1 2025)
GCA_048544215.1		 n/a 14,679
(2.30 %)		 51,447
(6.15 %)		 n/a 44.09
(99.99 %)		 1,177
(0.01 %)		 180
(100.00 %)		 1,452,983
(14.50 %)		 1,649,878
(17.81 %)		 4,184,643
(38.57 %)		 36,016
(2.07 %)
336 Osbeck's grenadier anchovy (Shantou hap2 2025)
GCA_048544225.1		 n/a 15,600
(2.30 %)		 54,714
(6.21 %)		 n/a 43.99
(99.99 %)		 1,132
(0.01 %)		 184
(100.00 %)		 1,505,689
(14.07 %)		 1,691,834
(17.30 %)		 4,407,291
(38.23 %)		 38,205
(2.14 %)
337 oyster pompano (Australia AG129_WGS33_773 2025)
GCF_046630095.1		 60,285
(14.61 %)		 15,290
(2.96 %)		 42,088
(6.53 %)		 n/a 41.26
(100.00 %)		 n/a 150
(100.00 %)		 534,470
(3.96 %)		 267,099
(3.88 %)		 4,094,899
(24.75 %)		 14,784
(1.60 %)
338 P.nyererei 1_Seehausen
GCF_000239375.1		 40,001
(9.36 %)		 14,904
(2.72 %)		 24,732
(5.87 %)		 n/a 40.60
(84.20 %)		 60,817
(15.83 %)		 68,050
(84.17 %)		 306,171
(3.27 %)		 124,292
(0.75 %)		 4,414,831
(20.66 %)		 18,455
(0.96 %)
339 Pacific bluefin tuna (20180606_amami#17_male 2023)
GCA_021601225.2		 n/a 15,791
(2.58 %)		 43,533
(5.61 %)		 n/a 39.67
(100.00 %)		 269
(0.00 %)		 849
(100.00 %)		 1,627,265
(32.11 %)		 249,744
(3.17 %)		 5,205,419
(26.82 %)		 13,305
(0.67 %)
340 Pacific cod (2023)
GCF_031168955.1		 49,430
(13.67 %)		 13,542
(2.89 %)		 64,214
(9.77 %)		 n/a 45.55
(99.92 %)		 4,826
(0.09 %)		 24
(100.00 %)		 1,117,561
(38.30 %)		 685,851
(13.38 %)		 2,330,116
(34.15 %)		 87,761
(8.68 %)
341 Pacific halibut (PH-IPHC-18 2020)
GCF_013339905.1		 48,776
(12.61 %)		 14,747
(3.15 %)		 45,075
(7.30 %)		 n/a 42.24
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 120
(100.00 %)		 410,917
(4.22 %)		 246,500
(4.66 %)		 3,680,698
(25.23 %)		 31,508
(2.30 %)
342 Pacific halibut (QCI-W04-F060 2022)
GCF_022539355.2		 46,697
(12.50 %)		 14,862
(3.15 %)		 45,824
(7.30 %)		 n/a 42.17
(99.95 %)		 1,131
(0.05 %)		 53
(100.00 %)		 407,699
(3.94 %)		 247,330
(3.84 %)		 3,838,896
(24.75 %)		 31,782
(2.27 %)
343 Pacific saury (AMF1-May2022 2023)
GCF_033807715.1		 54,344
(6.52 %)		 15,214
(1.67 %)		 74,345
(6.13 %)		 n/a 41.49
(99.96 %)		 900
(0.04 %)		 759
(100.00 %)		 805,776
(5.16 %)		 849,901
(11.48 %)		 4,645,552
(43.92 %)		 106,026
(5.14 %)
344 panther danio (primary hap 2020)
GCF_903798145.1		 40,657
(5.52 %)		 17,858
(2.46 %)		 42,119
(3.16 %)		 n/a 36.32
(98.82 %)		 1,821
(1.18 %)		 342
(100.00 %)		 3,973,354
(56.67 %)		 940,639
(7.81 %)		 8,701,639
(50.54 %)		 29,684
(1.18 %)
345 parallel lanternfish (alternate hap 2024)
GCA_964188415.1		 n/a 15,421
(1.80 %)		 62,324
(6.15 %)		 n/a 42.79
(99.90 %)		 4,955
(0.10 %)		 4,978
(99.90 %)		 4,032,523
(34.18 %)		 982,411
(16.51 %)		 5,189,655
(46.47 %)		 64,543
(3.14 %)
346 parallel lanternfish (primary hap 2024)
GCA_964188405.1		 n/a 16,917
(1.64 %)		 72,190
(5.85 %)		 n/a 42.91
(99.96 %)		 2,729
(0.04 %)		 24
(100.00 %)		 4,976,327
(35.08 %)		 1,258,755
(18.52 %)		 6,268,804
(48.21 %)		 81,193
(3.23 %)
347 Patagonian blennie (Puerto Natales JMC-PN-2008 2024)
GCF_036324505.1		 42,701
(12.59 %)		 14,986
(3.15 %)		 46,289
(7.75 %)		 n/a 40.99
(99.97 %)		 380
(0.03 %)		 27
(100.00 %)		 1,031,762
(25.30 %)		 219,393
(4.63 %)		 3,436,780
(25.57 %)		 16,570
(1.12 %)
348 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 2 2023)
GCA_027942885.1		 n/a 15,317
(2.02 %)		 61,647
(6.35 %)		 n/a 41.37
(99.99 %)		 135
(0.01 %)		 469
(99.99 %)		 981,519
(15.40 %)		 319,637
(12.45 %)		 3,706,473
(36.77 %)		 50,353
(2.98 %)
349 pejerrey (hap1 2023 genbank)
GCA_027942865.1		 n/a 15,242
(2.07 %)		 60,994
(6.53 %)		 n/a 41.51
(99.99 %)		 282
(0.01 %)		 189
(100.00 %)		 975,354
(15.76 %)		 315,625
(10.49 %)		 3,601,904
(35.09 %)		 49,121
(3.07 %)
350 pejerrey (hap1 2023 refseq)
GCF_027942865.1		 47,443
(8.28 %)		 15,242
(2.07 %)		 60,994
(6.53 %)		 n/a 41.51
(99.99 %)		 282
(0.01 %)		 189
(100.00 %)		 440,063
(2.87 %)		 315,625
(10.49 %)		 3,601,808
(35.09 %)		 49,121
(3.07 %)
351 peladilla (fAplTae1 alternate hap 2021)
GCA_017639685.1		 n/a 16,729
(3.56 %)		 56,451
(8.61 %)		 n/a 45.00
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 5,701
(100.00 %)		 1,153,359
(18.94 %)		 829,887
(14.54 %)		 2,793,018
(28.79 %)		 49,469
(4.32 %)
352 peladilla (primary hap 2021)
GCA_017639675.1		 n/a 13,829
(3.83 %)		 41,932
(8.64 %)		 n/a 45.01
(98.24 %)		 1,158
(1.77 %)		 41
(100.00 %)		 930,246
(18.49 %)		 660,569
(13.71 %)		 2,316,198
(27.66 %)		 41,023
(4.40 %)
353 pencil smelt N.antarctica (primary hap 2024)
GCA_963989245.1		 n/a 17,996
(2.00 %)		 89,591
(7.93 %)		 n/a 45.22
(99.94 %)		 3,299
(0.06 %)		 1,177
(100.00 %)		 2,828,457
(30.93 %)		 1,676,413
(19.87 %)		 4,137,400
(48.69 %)		 78,669
(4.37 %)
354 picturesque dragonet (SynPic1 hap1 2024)
GCA_044231685.1		 n/a 13,827
(3.46 %)		 53,000
(8.90 %)		 n/a 43.38
(100.00 %)		 122
(0.00 %)		 364
(100.00 %)		 222,800
(3.83 %)		 105,428
(7.84 %)		 2,500,710
(25.24 %)		 41,125
(5.45 %)
355 picturesque dragonet (SynPic1 hap2 2024)
GCA_044231675.1		 n/a 13,816
(3.52 %)		 52,689
(9.01 %)		 n/a 43.48
(100.00 %)		 100
(0.00 %)		 300
(100.00 %)		 223,762
(3.25 %)		 105,291
(6.28 %)		 2,579,336
(24.55 %)		 41,114
(5.50 %)
356 pike-perch
GCF_008315115.2		 65,418
(8.54 %)		 15,731
(2.23 %)		 52,240
(5.69 %)		 n/a 40.87
(99.98 %)		 711
(0.02 %)		 337
(100.00 %)		 629,999
(5.16 %)		 567,578
(7.41 %)		 4,697,709
(36.49 %)		 39,666
(1.93 %)
357 pinecone soldierfish (2019)
GCF_902150065.1		 40,770
(8.72 %)		 15,738
(2.42 %)		 26,691
(5.69 %)		 57,069
(6.14 %)		 41.83
(99.78 %)		 253
(0.22 %)		 87
(100.00 %)		 1,063,888
(5.90 %)		 646,820
(4.30 %)		 4,938,857
(28.11 %)		 41,636
(2.04 %)
358 pinecone soldierfish (alternate hap 2019)
GCA_902148815.1		 n/a 15,563
(2.38 %)		 54,264
(6.19 %)		 n/a 41.81
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 2,193
(100.00 %)		 1,040,418
(5.81 %)		 623,499
(4.08 %)		 4,888,400
(27.89 %)		 40,331
(2.02 %)
359 pink cusk-eel (Tasmania CSIRO-AG114 2024)
GCF_046128005.1		 40,370
(14.18 %)		 14,305
(3.83 %)		 42,250
(9.00 %)		 n/a 44.35
(100.00 %)		 n/a 598
(100.00 %)		 544,423
(6.21 %)		 349,202
(8.94 %)		 2,573,015
(26.48 %)		 39,781
(3.80 %)
360 pink salmon
GCF_021184085.1		 91,140
(4.89 %)		 27,187
(1.37 %)		 124,120
(3.88 %)		 n/a 44.28
(99.96 %)		 5,213
(0.04 %)		 22,556
(99.99 %)		 1,343,135
(0.00 %)		 2,906,520
(28.95 %)		 10,882,087
(57.26 %)		 97,805
(3.04 %)
361 ploughfish
GCF_902827175.1		 50,551
(7.66 %)		 14,699
(1.83 %)		 66,348
(6.06 %)		 62,492
(5.74 %)		 41.52
(99.98 %)		 1,569
(0.02 %)		 2,618
(100.00 %)		 467,937
(3.05 %)		 412,361
(6.64 %)		 3,498,382
(45.08 %)		 73,879
(3.55 %)
362 pollack (alternate hap 2023)
GCA_949987605.1		 n/a 14,050
(2.77 %)		 63,249
(8.86 %)		 n/a 45.41
(100.00 %)		 n/a 4,970
(100.00 %)		 708,455
(9.71 %)		 797,241
(15.67 %)		 2,785,159
(33.18 %)		 78,151
(7.95 %)
363 pollack (primary hap 2023)
GCA_949987615.1		 n/a 14,126
(2.81 %)		 61,907
(8.75 %)		 n/a 45.67
(99.94 %)		 1,810
(0.06 %)		 616
(100.00 %)		 753,034
(10.17 %)		 850,189
(15.72 %)		 2,888,555
(33.70 %)		 80,883
(8.43 %)
364 pond loach (2024)
GCF_030506205.2		 63,171
(8.66 %)		 17,091
(2.42 %)		 45,877
(5.02 %)		 n/a 38.27
(99.98 %)		 1,120
(0.02 %)		 220
(100.00 %)		 409,390
(2.50 %)		 390,110
(8.52 %)		 5,401,936
(44.65 %)		 52,115
(4.00 %)
365 predatory carp (Z2021 2022)
GCF_024489055.1		 56,688
(7.63 %)		 17,670
(2.67 %)		 54,522
(5.25 %)		 n/a 37.95
(100.00 %)		 181
(0.00 %)		 51
(100.00 %)		 3,087,358
(61.37 %)		 553,846
(7.14 %)		 6,036,124
(43.52 %)		 47,942
(3.56 %)
366 prehistoric monster fish (2019 refseq)
GCF_902500255.1		 45,404
(2.55 %)		 14,664
(0.76 %)		 72,609
(2.41 %)		 57,391
(2.04 %)		 41.99
(99.49 %)		 2,554
(0.51 %)		 464
(100.00 %)		 1,310,663
(2.79 %)		 786,401
(3.65 %)		 9,901,286
(59.90 %)		 172,199
(5.45 %)
367 prehistoric monster fish (alternate hap 2019)
GCA_902500245.1		 n/a 10,944
(0.64 %)		 59,123
(2.21 %)		 n/a 41.96
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 19,587
(100.00 %)		 947,336
(2.69 %)		 554,284
(3.27 %)		 7,314,941
(58.56 %)		 125,285
(5.42 %)
368 rainbow smelt (fOsmMor3 primary hap 2024)
GCA_038355195.1		 n/a 15,639
(3.89 %)		 49,368
(9.40 %)		 n/a 45.55
(99.93 %)		 1,907
(0.07 %)		 365
(100.00 %)		 1,655,350
(30.53 %)		 511,512
(12.09 %)		 2,015,264
(35.19 %)		 32,410
(4.33 %)
369 rainbow smelt (fOsmMor3 primary hap 2024)
GCF_038355195.1		 39,606
(12.43 %)		 15,641
(3.89 %)		 49,368
(9.40 %)		 n/a 45.55
(99.93 %)		 1,907
(0.07 %)		 366
(100.00 %)		 1,655,356
(30.53 %)		 511,513
(12.09 %)		 2,015,303
(35.19 %)		 32,410
(4.33 %)
370 rainbow trout (Arlee)
GCF_013265735.2		 119,271
(6.51 %)		 27,513
(1.62 %)		 109,524
(4.38 %)		 138,073
(5.21 %)		 43.45
(99.74 %)		 486
(0.26 %)		 939
(100.00 %)		 1,537,455
(7.32 %)		 2,083,211
(23.10 %)		 10,092,840
(53.71 %)		 73,586
(2.16 %)
371 rainbow trout (Swanson)
GCF_002163495.1		 79,286
(6.41 %)		 25,179
(1.70 %)		 98,339
(4.18 %)		 115,853
(5.33 %)		 42.67
(88.52 %)		 427,894
(11.54 %)		 139,800
(99.96 %)		 1,332,141
(5.52 %)		 1,604,760
(8.18 %)		 9,451,984
(44.00 %)		 56,604
(1.05 %)
372 Rankin cod (hap1 2025)
GCA_048129235.1		 n/a 15,661
(1.94 %)		 54,906
(5.30 %)		 n/a 41.36
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 386
(100.00 %)		 591,994
(2.64 %)		 396,424
(6.16 %)		 6,144,028
(31.24 %)		 24,792
(1.05 %)
373 Rankin cod (hap2 2025)
GCA_048129065.1		 n/a 15,830
(2.03 %)		 54,183
(5.34 %)		 n/a 41.30
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 199
(100.00 %)		 2,922,062
(42.12 %)		 374,226
(5.08 %)		 6,124,255
(30.17 %)		 24,493
(0.98 %)
374 razorback sucker (HMW12.3.18 2022)
GCF_025860055.1		 72,004
(5.94 %)		 27,195
(1.88 %)		 81,269
(3.63 %)		 n/a 39.59
(99.96 %)		 1,873
(0.04 %)		 1,746
(100.00 %)		 7,035,382
(51.89 %)		 1,021,269
(5.98 %)		 12,768,853
(46.85 %)		 109,185
(4.70 %)
375 red drum (XU1910 2020)
GCA_014183145.1		 n/a 15,655
(3.01 %)		 47,717
(6.87 %)		 n/a 40.98
(95.57 %)		 11,577
(4.42 %)		 34,462
(100.00 %)		 470,579
(3.16 %)		 231,051
(1.91 %)		 4,345,700
(23.24 %)		 20,149
(1.25 %)
376 red seabream (2024)
GCA_040436345.1		 n/a 15,424
(2.55 %)		 50,764
(6.70 %)		 n/a 41.21
(100.00 %)		 278
(0.00 %)		 302
(100.00 %)		 1,851,763
(34.79 %)		 322,891
(6.05 %)		 4,847,079
(26.99 %)		 23,370
(1.27 %)
377 red seabream (2024)
GCF_040436345.1		 36,326
(8.73 %)		 15,416
(2.51 %)		 50,764
(6.70 %)		 n/a 41.21
(100.00 %)		 278
(0.00 %)		 25
(100.00 %)		 474,006
(3.07 %)		 322,892
(6.05 %)		 4,847,143
(26.99 %)		 23,370
(1.27 %)
378 red-bellied piranha (fPygNat1 alternate hap 2020)
GCA_015220065.1		 n/a 4,539
(2.01 %)		 14,061
(4.35 %)		 n/a 40.48
(100.00 %)		 n/a 1,751
(100.00 %)		 759,605
(49.59 %)		 161,693
(7.99 %)		 1,684,737
(29.93 %)		 7,525
(1.31 %)
379 red-bellied piranha (Pna-1 2016)
GCF_001682695.1		 47,129
(6.06 %)		 17,089
(1.80 %)		 33,378
(4.02 %)		 n/a 40.45
(97.38 %)		 62,964
(2.59 %)		 325,620
(97.41 %)		 898,445
(4.81 %)		 863,000
(6.48 %)		 7,757,382
(34.74 %)		 34,329
(1.24 %)
380 red-bellied piranha (primary hap 2020)
GCF_015220715.1		 54,818
(7.05 %)		 16,817
(1.87 %)		 52,672
(4.24 %)		 76,011
(5.65 %)		 40.58
(99.17 %)		 303
(0.83 %)		 55
(100.00 %)		 817,566
(5.40 %)		 689,236
(8.30 %)		 7,296,459
(35.73 %)		 33,087
(1.38 %)
381 redfish (Tasmania AG114_WGS23_722 - 3 2025)
GCF_046629955.1		 37,802
(8.56 %)		 16,430
(2.60 %)		 56,127
(6.62 %)		 n/a 42.14
(100.00 %)		 n/a 6,232
(100.00 %)		 1,061,195
(9.52 %)		 653,833
(5.90 %)		 4,595,588
(30.15 %)		 38,922
(2.20 %)
382 reedfish (2021)
GCF_900747795.2		 44,478
(2.01 %)		 13,108
(0.46 %)		 23,157
(1.29 %)		 n/a 39.37
(99.18 %)		 1,431
(0.82 %)		 169
(100.00 %)		 8,636,520
(39.34 %)		 1,069,643
(2.91 %)		 19,980,572
(47.52 %)		 89,023
(1.13 %)
383 reedfish (v1 alternate hap 2019)
GCA_900700845.2		 n/a 9,950
(0.37 %)		 31,611
(1.22 %)		 n/a 39.44
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 38,598
(100.00 %)		 1,300,565
(2.57 %)		 685,834
(2.21 %)		 14,691,576
(45.66 %)		 63,365
(1.11 %)
384 ringed pipefish (RoL2022-P2 2023)
GCF_027744805.1		 56,261
(13.18 %)		 14,197
(2.71 %)		 45,193
(6.30 %)		 n/a 41.67
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 157
(100.00 %)		 941,095
(17.66 %)		 238,999
(5.27 %)		 4,283,692
(41.06 %)		 43,014
(4.07 %)
385 Rio pearlfish (Nwh7 v2 2021)
GCF_014905685.2		 25,353
(3.88 %)		 14,334
(1.56 %)		 137,348
(9.74 %)		 n/a 41.06
(92.01 %)		 100,521
(8.02 %)		 18,998
(100.00 %)		 635,526
(3.14 %)		 444,158
(3.06 %)		 6,203,124
(42.81 %)		 52,308
(2.11 %)
386 river trout (v2 2021)
GCA_901001165.2		 n/a 27,928
(1.66 %)		 110,791
(4.44 %)		 n/a 43.36
(96.90 %)		 3,941
(3.10 %)		 1,441
(100.00 %)		 4,690,842
(57.30 %)		 1,789,507
(15.87 %)		 9,819,763
(52.37 %)		 70,821
(1.77 %)
387 roach minnow (alternate hap 2023)
GCA_951802655.1		 n/a 18,165
(2.73 %)		 62,580
(6.00 %)		 n/a 38.74
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 4,612
(100.00 %)		 2,483,904
(48.29 %)		 584,363
(7.55 %)		 5,582,076
(40.38 %)		 60,229
(3.53 %)
388 roach minnow (primary hap 2023)
GCA_951802725.1		 n/a 18,132
(2.65 %)		 63,523
(6.01 %)		 n/a 38.80
(99.99 %)		 471
(0.01 %)		 86
(100.00 %)		 2,613,900
(48.90 %)		 625,102
(8.21 %)		 5,738,444
(41.24 %)		 65,328
(3.68 %)
389 rock gunnel (alternate hap 2021)
GCA_910591705.2		 n/a 15,291
(3.29 %)		 45,865
(7.56 %)		 n/a 42.26
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,165
(100.00 %)		 1,131,154
(25.69 %)		 269,583
(5.08 %)		 3,371,712
(24.64 %)		 36,810
(2.68 %)
390 rock gunnel (primary hap 2021)
GCA_910591455.2		 n/a 15,181
(3.34 %)		 44,153
(7.53 %)		 51,135
(7.40 %)		 42.31
(99.98 %)		 418
(0.02 %)		 101
(100.00 %)		 1,121,704
(25.48 %)		 269,467
(4.88 %)		 3,358,709
(24.69 %)		 36,987
(3.02 %)
391 rohu (BAU-BD-2019 2022)
GCF_022985175.1		 52,514
(8.81 %)		 17,664
(3.05 %)		 48,403
(5.24 %)		 n/a 36.06
(83.93 %)		 5,144
(16.07 %)		 2,870
(100.00 %)		 2,600,095
(49.94 %)		 683,499
(4.34 %)		 6,000,462
(35.96 %)		 33,741
(1.62 %)
392 Rosablanca catfish (hap2 2023)
GCA_030015355.1		 n/a 15,434
(2.01 %)		 44,991
(4.63 %)		 n/a 40.24
(100.00 %)		 192
(0.00 %)		 302
(100.00 %)		 2,506,810
(40.54 %)		 613,867
(8.67 %)		 5,070,851
(48.32 %)		 46,071
(2.57 %)
393 rouch bullseye (RE-2024b hap1 2024 refseq)
GCF_042242105.1		 32,256
(9.05 %)		 15,283
(3.03 %)		 44,299
(6.93 %)		 n/a 41.85
(100.00 %)		 87
(0.00 %)		 441
(100.00 %)		 1,115,191
(21.73 %)		 271,391
(5.93 %)		 3,651,073
(24.53 %)		 19,771
(1.39 %)
394 rough bullseye (RE-2024b hap2 2024)
GCA_042242125.1		 n/a 14,475
(2.89 %)		 44,413
(7.11 %)		 n/a 42.15
(100.00 %)		 93
(0.00 %)		 84
(100.00 %)		 1,762,151
(30.90 %)		 262,291
(5.80 %)		 3,580,461
(24.37 %)		 19,851
(1.40 %)
395 rudd (Europe DD20220513a primary hap 2022)
GCA_024453875.1		 n/a 17,895
(2.55 %)		 64,448
(5.84 %)		 n/a 38.93
(99.99 %)		 418
(0.01 %)		 110
(100.00 %)		 2,661,155
(49.83 %)		 673,071
(10.59 %)		 5,755,954
(42.48 %)		 66,952
(4.46 %)
396 rudd (fScaEry2.hap1.1 2024)
GCA_964197995.1		 n/a 18,254
(2.38 %)		 68,852
(5.71 %)		 n/a 39.02
(99.99 %)		 836
(0.01 %)		 759
(100.00 %)		 2,854,977
(51.13 %)		 754,287
(11.81 %)		 5,942,764
(44.17 %)		 72,686
(4.52 %)
397 sablefish (Golden Eagle Sablefish UVic2021 2023)
GCF_027596085.1		 34,548
(9.49 %)		 15,280
(3.00 %)		 46,259
(6.95 %)		 n/a 40.45
(99.99 %)		 723
(0.01 %)		 8,212
(99.99 %)		 1,335,152
(28.19 %)		 415,384
(6.53 %)		 3,948,379
(27.81 %)		 22,854
(1.61 %)
398 sailfin molly
GCF_001443285.1		 53,986
(11.41 %)		 15,048
(2.71 %)		 33,482
(6.71 %)		 n/a 39.18
(83.41 %)		 41,735
(16.61 %)		 54,623
(83.39 %)		 357,919
(2.18 %)		 189,502
(1.23 %)		 4,873,063
(22.51 %)		 34,138
(1.62 %)
399 salamanderfish (hap1 2025)
GCA_049190665.1		 n/a 15,661
(2.59 %)		 68,929
(8.14 %)		 n/a 45.02
(99.96 %)		 1,365
(0.04 %)		 2,987
(100.00 %)		 2,234,544
(43.47 %)		 1,192,255
(16.84 %)		 3,383,827
(41.37 %)		 108,808
(9.86 %)
400 salamanderfish (hap2 2025)
GCA_049190655.1		 n/a 15,427
(2.54 %)		 67,522
(7.97 %)		 n/a 44.96
(99.96 %)		 1,366
(0.04 %)		 1,559
(100.00 %)		 2,195,227
(44.71 %)		 1,219,658
(17.45 %)		 3,319,218
(42.93 %)		 108,314
(9.71 %)
401 sansaifugu (HTHZ2018 2019)
GCF_003711565.1		 56,023
(20.10 %)		 13,998
(4.84 %)		 48,737
(11.56 %)		 n/a 45.63
(99.99 %)		 250
(0.01 %)		 868
(100.00 %)		 304,980
(15.98 %)		 171,631
(4.98 %)		 1,616,965
(21.60 %)		 48,338
(9.79 %)
402 sardine (primary hap 2023 genbank)
GCA_963854185.1		 n/a 16,071
(2.33 %)		 64,180
(7.08 %)		 n/a 44.44
(99.96 %)		 1,654
(0.04 %)		 241
(100.00 %)		 1,503,111
(11.74 %)		 1,507,024
(15.48 %)		 4,027,638
(37.52 %)		 68,874
(3.56 %)
403 sardine (primary hap 2023 refseq)
GCF_963854185.1		 48,146
(9.15 %)		 16,069
(2.33 %)		 64,178
(7.08 %)		 n/a 44.44
(99.96 %)		 1,654
(0.04 %)		 240
(100.00 %)		 1,503,108
(11.74 %)		 1,507,022
(15.48 %)		 4,027,614
(37.52 %)		 68,873
(3.56 %)
404 scribbled pipefish (RoL2023-P3 2023)
GCF_030265065.1		 51,267
(7.00 %)		 13,854
(1.32 %)		 48,980
(3.46 %)		 n/a 39.44
(100.00 %)		 9
(0.00 %)		 109
(100.00 %)		 1,805,346
(21.21 %)		 512,153
(12.76 %)		 6,260,589
(63.96 %)		 96,908
(3.65 %)
405 sea stickleback (SK-2024b hap1 2025)
GCA_048126635.1		 n/a 14,310
(4.44 %)		 47,336
(10.19 %)		 n/a 44.83
(99.99 %)		 241
(0.01 %)		 38
(100.00 %)		 446,827
(13.86 %)		 192,599
(8.52 %)		 2,033,160
(22.85 %)		 61,012
(13.03 %)
406 sea stickleback (SK-2024b hap2 2025)
GCA_048127205.1		 n/a 14,237
(4.44 %)		 46,701
(10.13 %)		 n/a 44.75
(99.99 %)		 276
(0.01 %)		 52
(100.00 %)		 413,494
(14.42 %)		 189,429
(8.99 %)		 1,996,715
(23.13 %)		 60,252
(12.60 %)
407 Senegalese sole
GCF_019176455.1		 46,446
(12.02 %)		 15,155
(3.15 %)		 43,828
(7.31 %)		 n/a 40.92
(99.99 %)		 662
(0.01 %)		 1,937
(100.00 %)		 522,618
(4.22 %)		 317,280
(4.23 %)		 4,040,245
(28.25 %)		 26,946
(1.79 %)
408 shanny (alternate hap 2023)
GCA_963383635.1		 n/a 14,728
(2.46 %)		 62,094
(7.09 %)		 n/a 42.32
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 3,847
(100.00 %)		 939,151
(11.90 %)		 472,983
(7.68 %)		 4,326,183
(28.40 %)		 64,290
(4.16 %)
409 shanny (primary hap 2023)
GCA_963383615.1		 n/a 15,032
(2.44 %)		 62,625
(6.97 %)		 n/a 42.07
(99.98 %)		 598
(0.02 %)		 847
(100.00 %)		 967,197
(11.85 %)		 498,286
(8.15 %)		 4,397,828
(28.96 %)		 65,744
(4.06 %)
410 sharptooth jobfish (hap1 2024)
GCA_045363895.1		 n/a 15,800
(1.77 %)		 51,791
(4.52 %)		 n/a 39.82
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 283
(100.00 %)		 777,839
(3.19 %)		 459,791
(3.90 %)		 7,958,604
(35.17 %)		 21,711
(0.94 %)
411 sharptooth jobfish (hap2 2024)
GCA_045363885.1		 n/a 15,879
(1.78 %)		 51,774
(4.52 %)		 n/a 39.81
(100.00 %)		 76
(0.00 %)		 172
(100.00 %)		 778,842
(3.19 %)		 462,247
(3.82 %)		 7,956,116
(35.13 %)		 21,587
(0.91 %)
412 sheepshead minnow
GCF_000732505.1		 37,892
(7.02 %)		 14,749
(2.02 %)		 25,480
(4.66 %)		 n/a 38.19
(86.93 %)		 113,210
(13.10 %)		 110,959
(86.90 %)		 363,397
(1.88 %)		 195,191
(1.43 %)		 6,444,762
(27.47 %)		 18,269
(0.66 %)
413 shortfin molly
GCF_001443325.1		 54,473
(11.42 %)		 15,104
(2.72 %)		 33,717
(6.74 %)		 n/a 39.23
(84.81 %)		 37,507
(15.20 %)		 50,598
(84.80 %)		 328,347
(2.03 %)		 172,112
(1.18 %)		 4,876,942
(22.80 %)		 34,271
(1.66 %)
414 Siamese fighting fish (v1 alternate hap 2019)
GCA_900651605.1		 n/a 14,510
(4.12 %)		 60,058
(10.77 %)		 n/a 45.51
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 3,705
(100.00 %)		 249,671
(3.68 %)		 182,366
(4.87 %)		 1,939,533
(22.55 %)		 72,474
(13.55 %)
415 Siamese fighting fish (v4 primary hap 2023)
GCF_900634795.4		 59,291
(19.85 %)		 14,594
(4.32 %)		 55,265
(10.96 %)		 n/a 45.31
(99.99 %)		 321
(0.01 %)		 36
(100.00 %)		 384,203
(19.38 %)		 175,898
(4.39 %)		 1,946,630
(23.16 %)		 70,331
(13.13 %)
416 Siamese fighting fish (v5.4 alternate hap 2023)
GCA_900651605.2		 n/a 14,737
(4.05 %)		 61,568
(10.70 %)		 n/a 45.50
(100.00 %)		 108
(0.00 %)		 3,872
(100.00 %)		 392,585
(19.23 %)		 190,741
(5.09 %)		 1,994,824
(23.20 %)		 74,259
(13.49 %)
417 silver carp (IHB0807247 2022)
GCA_022817975.1		 n/a 17,684
(3.64 %)		 46,034
(5.41 %)		 n/a 37.14
(95.48 %)		 65,388
(4.54 %)		 47,685
(100.00 %)		 2,382,486
(47.36 %)		 302,138
(3.05 %)		 5,269,318
(35.19 %)		 18,811
(0.87 %)
418 silver crucian carp (wild population from Czech Republic Cgi1373 2022)
GCF_023724105.1		 131,179
(9.80 %)		 29,612
(2.99 %)		 81,338
(5.43 %)		 n/a 37.63
(99.92 %)		 2,597
(0.08 %)		 51
(100.00 %)		 3,277,259
(45.05 %)		 801,192
(7.96 %)		 7,910,205
(42.51 %)		 60,236
(2.18 %)
419 silver spinyfin (hap1 2025)
GCA_048569125.1		 n/a 16,906
(1.39 %)		 115,931
(7.77 %)		 n/a 44.10
(99.96 %)		 3,365
(0.04 %)		 5,504
(100.00 %)		 4,606,608
(53.63 %)		 1,428,326
(25.54 %)		 4,395,832
(51.22 %)		 166,807
(7.52 %)
420 silver spinyfin (hap2 2025)
GCA_048569135.1		 n/a 17,409
(1.14 %)		 146,413
(8.24 %)		 n/a 44.20
(99.96 %)		 3,473
(0.04 %)		 8,068
(99.96 %)		 2,051,529
(14.72 %)		 1,808,246
(28.36 %)		 4,967,915
(54.93 %)		 208,486
(7.83 %)
421 smalleye Pacific opah (hap1 2023)
GCA_029633845.1		 n/a 13,661
(1.11 %)		 75,418
(4.21 %)		 n/a 45.01
(99.96 %)		 3,120
(0.04 %)		 1,059
(100.00 %)		 4,634,757
(53.53 %)		 1,006,319
(17.13 %)		 5,273,732
(51.16 %)		 145,115
(7.59 %)
422 smalleye Pacific opah (hap2 2023 refseq)
GCF_029633865.1		 34,018
(4.17 %)		 13,617
(1.10 %)		 74,639
(4.12 %)		 n/a 44.94
(99.96 %)		 3,115
(0.04 %)		 544
(100.00 %)		 4,603,649
(53.23 %)		 1,009,241
(18.00 %)		 5,236,063
(51.65 %)		 143,632
(7.43 %)
423 smallmouth bass
GCF_021292245.1		 55,932
(9.40 %)		 15,509
(2.37 %)		 49,387
(5.61 %)		 n/a 40.72
(99.65 %)		 34,581
(0.36 %)		 15,020
(100.00 %)		 445,979
(2.50 %)		 249,630
(2.49 %)		 5,071,015
(28.28 %)		 23,875
(1.36 %)
424 snake pipefish (RoL-2023_Sb 2023)
GCF_033978785.1		 57,883
(4.39 %)		 15,654
(1.03 %)		 72,123
(3.58 %)		 n/a 38.64
(100.00 %)		 2,564
(0.00 %)		 424
(100.00 %)		 3,149,025
(23.73 %)		 1,621,410
(19.58 %)		 7,534,195
(67.22 %)		 122,765
(3.07 %)
425 sockeye salmon (On170113-E2 v2 2019)
GCF_006149115.2		 75,641
(6.10 %)		 24,075
(1.71 %)		 98,364
(4.30 %)		 n/a 43.37
(96.15 %)		 25,658
(3.85 %)		 36,660
(99.99 %)		 949,725
(3.53 %)		 1,465,583
(10.82 %)		 8,853,884
(48.52 %)		 62,850
(1.45 %)
426 sockeye salmon (Pitt River 2024)
GCF_034236695.1		 80,798
(5.59 %)		 26,218
(1.35 %)		 116,746
(3.87 %)		 n/a 44.03
(99.93 %)		 4,351
(0.07 %)		 12,436
(100.00 %)		 6,356,046
(54.95 %)		 2,840,516
(31.41 %)		 10,575,179
(57.52 %)		 77,648
(1.61 %)
427 South Georgia icefish (v2 primary hap 2022)
GCF_902827115.2		 42,862
(7.09 %)		 14,776
(1.80 %)		 68,955
(6.18 %)		 n/a 42.07
(99.90 %)		 2,603
(0.11 %)		 1,563
(100.00 %)		 512,600
(3.45 %)		 473,958
(7.19 %)		 3,590,436
(45.74 %)		 88,970
(4.31 %)
428 southern bluefin tuna (alternate hap 2021)
GCA_910596085.1		 n/a 15,727
(2.61 %)		 43,177
(5.74 %)		 n/a 39.72
(100.00 %)		 n/a 895
(100.00 %)		 1,590,386
(33.53 %)		 246,800
(2.86 %)		 5,173,834
(26.85 %)		 14,473
(0.87 %)
429 southern bluefin tuna (primary hap 2021 refseq)
GCF_910596095.1		 58,429
(11.06 %)		 15,626
(2.56 %)		 42,730
(5.74 %)		 n/a 39.73
(100.00 %)		 184
(0.00 %)		 58
(100.00 %)		 554,276
(3.42 %)		 247,764
(2.94 %)		 5,176,851
(26.85 %)		 14,097
(0.88 %)
430 southern platyfish
GCF_002775205.1		 46,380
(11.15 %)		 14,674
(2.66 %)		 28,368
(6.82 %)		 n/a 38.97
(99.53 %)		 156
(0.47 %)		 102
(100.00 %)		 323,402
(2.76 %)		 146,477
(2.33 %)		 4,741,552
(28.27 %)		 34,667
(2.13 %)
431 Southwestern China cavefish
GCF_001515605.1		 74,330
(6.97 %)		 30,906
(3.19 %)		 55,474
(5.66 %)		 n/a 37.28
(92.69 %)		 168,741
(7.34 %)		 254,423
(92.66 %)		 1,129,104
(5.02 %)		 730,197
(4.59 %)		 8,910,005
(36.97 %)		 64,238
(1.79 %)
432 spangled emperor (hap1 2024)
GCA_045362495.1		 n/a 15,554
(1.75 %)		 58,641
(5.19 %)		 n/a 40.59
(100.00 %)		 196
(0.00 %)		 226
(100.00 %)		 682,449
(3.01 %)		 409,809
(4.43 %)		 7,114,584
(28.98 %)		 37,214
(1.53 %)
433 spangled emperor (hap2 2024)
GCA_045362485.1		 n/a 15,490
(1.77 %)		 57,993
(5.20 %)		 n/a 40.57
(100.00 %)		 244
(0.00 %)		 151
(100.00 %)		 677,985
(3.03 %)		 408,391
(4.33 %)		 7,184,861
(29.15 %)		 36,602
(1.46 %)
434 spiny chromis (Palm Island Apoly-LR-REF 2022)
GCF_021347895.1		 57,656
(10.03 %)		 15,810
(2.14 %)		 58,218
(5.77 %)		 n/a 40.33
(99.99 %)		 871
(0.01 %)		 81
(100.00 %)		 1,505,948
(35.31 %)		 346,542
(4.71 %)		 5,210,329
(31.65 %)		 36,529
(1.65 %)
435 spiny chromis (Palm Islands 2017)
GCF_002109545.1		 38,931
(8.84 %)		 15,624
(2.29 %)		 35,942
(5.59 %)		 n/a 40.01
(85.05 %)		 209,115
(15.01 %)		 30,414
(100.00 %)		 372,901
(2.33 %)		 278,854
(1.99 %)		 5,622,334
(22.61 %)		 25,079
(0.95 %)
436 spotted green pufferfish (2004)
GCA_000180735.1		 n/a 13,641
(5.13 %)		 57,982
(13.46 %)		 n/a 46.43
(91.24 %)		 18,974
(8.76 %)		 44,686
(91.24 %)		 252,877
(4.38 %)		 159,939
(3.51 %)		 1,689,462
(18.66 %)		 51,580
(13.42 %)
437 spotted sea bass (ZS-2023 2023)
GCA_031216445.1		 n/a 15,425
(3.14 %)		 43,414
(6.98 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 n/a 109
(100.00 %)		 447,804
(3.49 %)		 241,876
(3.25 %)		 3,757,088
(26.25 %)		 23,346
(2.49 %)
438 spotted tilapia (v1 MD_Pm_ZW 2024)
GCF_036321145.1		 46,818
(8.35 %)		 14,938
(2.04 %)		 55,475
(6.12 %)		 n/a 40.81
(100.00 %)		 23
(0.00 %)		 792
(100.00 %)		 505,488
(2.57 %)		 269,742
(4.14 %)		 4,697,020
(30.74 %)		 30,399
(1.90 %)
439 spotted tilapia (v2 MD_Pm_ZW 2024)
GCF_036321145.2		 48,380
(8.37 %)		 15,470
(2.04 %)		 57,237
(6.11 %)		 n/a 40.81
(100.00 %)		 24
(0.00 %)		 791
(100.00 %)		 523,070
(2.57 %)		 277,554
(4.08 %)		 4,872,723
(30.67 %)		 31,383
(1.89 %)
440 spotted wolffish (MPS153535 2025)
GCF_050575085.1		 49,857
(11.48 %)		 15,196
(3.01 %)		 47,823
(7.37 %)		 n/a 41.99
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 328
(100.00 %)		 430,253
(4.48 %)		 288,471
(10.10 %)		 3,247,212
(28.89 %)		 36,945
(3.24 %)
441 sterlet (maternal hap 2022 refseq)
GCF_902713425.1		 110,167
(7.62 %)		 25,364
(1.76 %)		 40,715
(4.06 %)		 n/a 40.11
(100.00 %)		 433
(0.00 %)		 1,731
(100.00 %)		 4,055,215
(43.14 %)		 1,124,096
(10.13 %)		 9,426,172
(41.81 %)		 64,522
(2.85 %)
442 sterlet (v2 paternal hap 2022)
GCA_902713435.2		 n/a 24,717
(1.73 %)		 40,151
(4.13 %)		 74,807
(5.54 %)		 40.09
(99.99 %)		 475
(0.01 %)		 1,517
(100.00 %)		 1,844,596
(9.77 %)		 1,119,340
(9.88 %)		 9,372,934
(41.58 %)		 65,007
(2.74 %)
443 stone loach (alternate hap 2022)
GCA_947034905.1		 n/a 16,177
(4.18 %)		 40,160
(7.35 %)		 n/a 39.58
(100.00 %)		 n/a 2,237
(100.00 %)		 1,208,781
(38.02 %)		 121,854
(7.96 %)		 2,956,942
(32.61 %)		 27,787
(3.58 %)
444 stone loach (primary hap 2022)
GCA_947034865.1		 n/a 16,419
(3.98 %)		 40,677
(7.21 %)		 n/a 39.69
(99.97 %)		 825
(0.03 %)		 100
(100.00 %)		 1,324,513
(39.84 %)		 143,170
(9.30 %)		 3,000,881
(34.30 %)		 30,130
(3.71 %)
445 stone moroko (DD20220531a primary hap 2022)
GCF_024679245.1		 59,497
(6.82 %)		 17,172
(2.25 %)		 57,383
(4.85 %)		 n/a 39.18
(99.99 %)		 497
(0.01 %)		 81
(100.00 %)		 4,750,810
(63.58 %)		 649,426
(10.14 %)		 6,511,384
(46.74 %)		 74,723
(4.45 %)
446 straightnose pipefish (RoL-2023_Sa 2023)
GCF_033978795.1		 56,498
(4.86 %)		 14,602
(1.00 %)		 64,279
(2.96 %)		 n/a 39.74
(100.00 %)		 1,172
(0.00 %)		 473
(100.00 %)		 2,984,285
(27.54 %)		 1,402,691
(20.35 %)		 7,915,062
(67.02 %)		 140,374
(3.90 %)
447 striated frogfish (MH-2024 2024)
GCF_040054535.1		 45,220
(12.66 %)		 14,509
(3.35 %)		 46,221
(7.95 %)		 n/a 42.02
(100.00 %)		 18
(0.00 %)		 42
(100.00 %)		 791,570
(25.79 %)		 305,491
(6.68 %)		 3,000,938
(29.61 %)		 36,818
(4.17 %)
448 striped catfish (fPanHyp1 alternate hap 2022)
GCA_027382375.1		 n/a 15,871
(2.85 %)		 42,287
(5.51 %)		 n/a 38.96
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 3,274
(100.00 %)		 1,826,752
(37.53 %)		 592,022
(6.69 %)		 4,899,884
(32.33 %)		 17,357
(1.25 %)
449 striped catfish (primary hap 2022 refseq)
GCF_027358585.1		 53,859
(11.99 %)		 16,033
(2.86 %)		 41,619
(5.48 %)		 n/a 38.99
(99.49 %)		 236
(0.51 %)		 58
(100.00 %)		 1,870,234
(37.80 %)		 605,570
(6.82 %)		 5,059,429
(32.43 %)		 17,919
(1.29 %)
450 striped catfish Indonesia
GCF_009078355.1		 50,044
(9.61 %)		 15,665
(2.76 %)		 41,398
(5.35 %)		 n/a 38.86
(99.98 %)		 463
(0.02 %)		 150
(100.00 %)		 777,186
(5.69 %)		 603,962
(6.24 %)		 5,141,987
(32.41 %)		 17,264
(1.20 %)
451 striped catfish Vietnam
GCF_003671635.1		 40,992
(9.44 %)		 15,295
(2.91 %)		 20,865
(5.31 %)		 n/a 38.71
(97.32 %)		 23,755
(2.69 %)		 567
(100.00 %)		 693,498
(4.75 %)		 489,286
(3.69 %)		 4,849,313
(30.04 %)		 15,076
(0.95 %)
452 striped sea-bass
GCF_004916995.1		 32,103
(10.78 %)		 14,422
(3.07 %)		 38,188
(6.41 %)		 n/a 40.19
(99.19 %)		 73,335
(0.86 %)		 630
(100.00 %)		 365,581
(2.59 %)		 142,967
(0.99 %)		 4,151,813
(22.73 %)		 13,730
(0.95 %)
453 Sumatra barb
GCF_018831695.1		 54,947
(11.16 %)		 18,745
(3.98 %)		 49,520
(6.36 %)		 n/a 38.24
(99.95 %)		 5,075
(0.05 %)		 1,122
(100.00 %)		 638,783
(6.33 %)		 357,159
(7.71 %)		 4,520,846
(32.46 %)		 46,339
(3.96 %)
454 swamp eel
GCF_001952655.1		 43,831
(10.64 %)		 14,741
(2.98 %)		 20,099
(5.80 %)		 n/a 40.90
(92.01 %)		 51,257
(8.01 %)		 71,879
(91.99 %)		 266,195
(1.84 %)		 95,726
(1.16 %)		 3,596,747
(21.95 %)		 7,065
(0.42 %)
455 swordfish
GCF_016859285.1		 47,986
(9.92 %)		 15,208
(2.84 %)		 42,556
(5.91 %)		 n/a 40.69
(99.97 %)		 449
(0.03 %)		 1,482
(100.00 %)		 484,543
(3.59 %)		 230,762
(3.41 %)		 4,496,150
(23.94 %)		 27,129
(2.10 %)
456 tambaqui
GCF_904425465.1		 46,601
(6.55 %)		 17,150
(1.88 %)		 50,327
(4.03 %)		 n/a 39.33
(100.00 %)		 420
(0.00 %)		 1,269
(100.00 %)		 753,112
(4.00 %)		 676,948
(5.71 %)		 8,317,676
(35.32 %)		 25,784
(0.92 %)
457 thickback sole (primary hap 2023)
GCA_963457635.1		 n/a 14,720
(2.58 %)		 45,918
(6.44 %)		 n/a 40.37
(99.99 %)		 454
(0.01 %)		 188
(100.00 %)		 1,242,704
(17.37 %)		 518,293
(15.23 %)		 3,986,694
(40.18 %)		 51,441
(3.53 %)
458 thicklip grey mullet (primary hap 2023)
GCA_963514085.1		 n/a 15,347
(2.73 %)		 50,294
(7.25 %)		 n/a 42.30
(99.98 %)		 610
(0.02 %)		 393
(100.00 %)		 1,157,324
(26.70 %)		 229,196
(4.33 %)		 3,694,790
(27.54 %)		 38,929
(2.20 %)
459 threadfin butterflyfish (fChaAug3hap1 2025)
GCF_051107435.1		 44,089
(11.63 %)		 15,141
(2.93 %)		 45,805
(6.86 %)		 n/a 42.61
(100.00 %)		 19
(0.00 %)		 187
(100.00 %)		 1,201,894
(23.61 %)		 240,001
(6.49 %)		 3,662,205
(24.22 %)		 26,438
(2.03 %)
460 three-spined stickleback
GCF_016920845.1		 50,181
(16.09 %)		 14,935
(3.99 %)		 53,773
(9.96 %)		 n/a 44.66
(99.24 %)		 3,125
(0.76 %)		 2,937
(100.00 %)		 368,987
(9.09 %)		 160,564
(2.89 %)		 2,308,841
(21.91 %)		 80,336
(11.49 %)
461 three-spined stickleback (hap1 2024)
GCA_964276395.1		 n/a 14,939
(3.72 %)		 56,284
(10.07 %)		 n/a 44.71
(99.99 %)		 331
(0.01 %)		 133
(100.00 %)		 573,569
(20.53 %)		 206,699
(9.01 %)		 2,335,009
(27.29 %)		 84,009
(12.41 %)
462 three-spined stickleback (hap2 2024)
GCA_964276385.1		 n/a 13,591
(3.79 %)		 50,693
(10.19 %)		 n/a 44.72
(99.99 %)		 309
(0.01 %)		 479
(99.99 %)		 505,547
(19.86 %)		 181,092
(8.75 %)		 2,117,454
(27.02 %)		 75,434
(12.33 %)
463 threespot wrasse (MK-OKI-2021-1 2023)
GCF_033239565.1		 40,418
(8.77 %)		 15,124
(2.26 %)		 46,507
(5.67 %)		 n/a 40.89
(99.99 %)		 117
(0.01 %)		 228
(100.00 %)		 539,144
(3.57 %)		 361,249
(6.62 %)		 5,059,734
(33.65 %)		 22,689
(1.57 %)
464 tidewater goby (DKJ021-1_F 2022)
GCA_026437355.1		 n/a 13,912
(1.87 %)		 62,727
(6.28 %)		 n/a 42.90
(99.99 %)		 894
(0.01 %)		 755
(100.00 %)		 1,981,480
(37.86 %)		 652,950
(27.50 %)		 3,680,829
(47.75 %)		 96,414
(8.01 %)
465 tidewater goby (DKJ021-1_Fhap1 2022 refseq)
GCF_026437365.1		 43,108
(6.07 %)		 14,279
(1.78 %)		 65,726
(6.14 %)		 n/a 42.96
(99.99 %)		 794
(0.01 %)		 821
(100.00 %)		 411,442
(6.11 %)		 708,255
(30.28 %)		 3,809,301
(49.66 %)		 101,682
(8.04 %)
466 tiger tail seahorse (QL1 v2 2016)
GCF_001891065.2		 47,037
(13.33 %)		 13,806
(3.76 %)		 52,367
(8.81 %)		 n/a 43.30
(93.08 %)		 22,977
(6.92 %)		 55,891
(93.08 %)		 356,857
(3.66 %)		 155,338
(3.36 %)		 2,806,278
(24.56 %)		 61,010
(7.71 %)
467 tongue sole
GCF_000523025.1		 45,186
(16.40 %)		 14,186
(3.98 %)		 20,816
(8.22 %)		 n/a 40.82
(94.88 %)		 33,269
(5.14 %)		 62,912
(94.86 %)		 423,833
(4.34 %)		 235,739
(3.33 %)		 3,085,031
(24.78 %)		 17,094
(1.42 %)
468 topmouth culter (CATC2023 2024)
GCA_040182925.1		 n/a 17,927
(2.80 %)		 55,175
(5.53 %)		 n/a 37.59
(100.00 %)		 31
(0.00 %)		 37
(100.00 %)		 3,036,659
(56.67 %)		 587,658
(6.36 %)		 5,970,645
(42.75 %)		 39,224
(2.23 %)
469 torafugu (alternate hap 2019)
GCA_901000745.3		 n/a 13,635
(4.82 %)		 48,723
(11.83 %)		 n/a 45.60
(99.82 %)		 38
(0.18 %)		 2,012
(100.00 %)		 249,793
(9.32 %)		 151,193
(4.49 %)		 1,577,144
(20.25 %)		 46,936
(9.72 %)
470 torafugu (fTakRub1.2 2019 refseq)
GCF_901000725.2		 53,489
(18.32 %)		 14,527
(4.79 %)		 28,597
(10.65 %)		 55,587
(14.38 %)		 45.67
(99.04 %)		 402
(0.96 %)		 128
(100.00 %)		 281,011
(10.36 %)		 178,921
(5.32 %)		 1,642,756
(20.86 %)		 49,975
(9.63 %)
471 torafugu (fTakRub1.3 2021 genbank)
GCA_901000725.3		 n/a 14,527
(4.79 %)		 51,181
(11.72 %)		 n/a 45.67
(99.04 %)		 402
(0.96 %)		 128
(100.00 %)		 325,077
(14.03 %)		 178,921
(5.32 %)		 1,642,754
(20.86 %)		 49,975
(9.63 %)
472 trahira (v1 hap1 2024 refseq)
GCF_029633855.1		 55,764
(7.71 %)		 17,259
(2.05 %)		 47,792
(4.36 %)		 n/a 40.99
(94.51 %)		 989
(5.49 %)		 598
(100.00 %)		 2,407,637
(30.93 %)		 742,073
(14.33 %)		 5,715,475
(37.52 %)		 29,012
(2.12 %)
473 trahira (v2 hap1 2024 genbank)
GCA_029633855.2		 n/a 17,256
(2.05 %)		 47,792
(4.36 %)		 n/a 40.99
(94.51 %)		 989
(5.49 %)		 597
(100.00 %)		 2,407,631
(30.93 %)		 742,073
(14.33 %)		 5,715,418
(37.52 %)		 29,012
(2.12 %)
474 trahira (v2 hap2 2024)
GCA_029633875.2		 n/a 15,041
(2.01 %)		 42,180
(4.38 %)		 n/a 41.03
(96.21 %)		 792
(3.79 %)		 594
(98.65 %)		 1,069,159
(7.06 %)		 653,554
(15.46 %)		 4,921,631
(38.75 %)		 26,440
(2.18 %)
475 trumpetfish (SK-2024c 2025)
GCA_048301465.1		 n/a 14,730
(2.84 %)		 50,956
(7.07 %)		 n/a 43.20
(100.00 %)		 179
(0.00 %)		 161
(100.00 %)		 548,208
(5.35 %)		 356,364
(7.30 %)		 3,448,877
(26.01 %)		 26,685
(1.80 %)
476 trumpetfish (SK-2024c 2025)
GCA_048301475.1		 n/a 14,680
(2.80 %)		 50,753
(6.99 %)		 n/a 43.14
(100.00 %)		 187
(0.00 %)		 248
(100.00 %)		 559,722
(5.35 %)		 382,817
(8.57 %)		 3,423,208
(26.76 %)		 26,739
(1.77 %)
477 turbot (primary hap 2023)
GCA_963854745.1		 n/a 14,816
(3.44 %)		 49,680
(8.16 %)		 n/a 43.40
(99.97 %)		 805
(0.03 %)		 108
(100.00 %)		 808,348
(19.20 %)		 301,230
(7.15 %)		 3,267,772
(25.91 %)		 66,132
(6.90 %)
478 turbot (ysfricsl-2021 2022)
GCF_022379125.1		 57,298
(14.93 %)		 14,887
(3.52 %)		 49,403
(8.32 %)		 87,351
(14.65 %)		 43.54
(100.00 %)		 n/a 28
(100.00 %)		 455,017
(0.00 %)		 297,185
(5.03 %)		 3,312,612
(24.33 %)		 65,633
(7.08 %)
479 turquoise killifish (GRZ 2015)
GCF_001465895.1		 40,386
(7.85 %)		 14,339
(2.08 %)		 84,906
(20.47 %)		 57,218
(6.01 %)		 42.51
(68.98 %)		 85,562
(31.04 %)		 68,911
(68.97 %)		 392,114
(2.78 %)		 307,607
(2.09 %)		 4,777,941
(27.62 %)		 61,105
(2.15 %)
480 turquoise killifish (GRZ-AD 2024)
GCF_043380555.1		 56,976
(5.74 %)		 14,604
(1.25 %)		 72,207
(4.35 %)		 n/a 44.51
(100.00 %)		 369
(0.00 %)		 304
(100.00 %)		 2,858,575
(46.12 %)		 660,603
(29.65 %)		 4,283,242
(61.88 %)		 118,966
(11.71 %)
481 turquoise killifish (MZM-0403 2023)
GCF_027789165.1		 54,501
(6.75 %)		 14,227
(1.27 %)		 69,161
(4.33 %)		 n/a 44.33
(93.22 %)		 3,093
(6.78 %)		 2,681
(100.00 %)		 2,760,581
(47.64 %)		 635,213
(25.56 %)		 4,136,925
(56.55 %)		 110,696
(10.50 %)
482 walking catfish (CIFAMagur01 2020)
GCA_013621035.1		 n/a 15,895
(2.18 %)		 46,934
(4.73 %)		 n/a 39.83
(99.95 %)		 605
(0.05 %)		 3,484
(100.00 %)		 1,061,538
(6.25 %)		 611,618
(5.19 %)		 5,978,835
(37.11 %)		 54,666
(3.50 %)
483 walleye pollock (NIFS_2021 2022)
GCF_026213295.1		 49,084
(12.15 %)		 14,241
(2.71 %)		 70,653
(9.29 %)		 n/a 45.59
(99.96 %)		 2,816
(0.04 %)		 168
(100.00 %)		 1,274,742
(38.63 %)		 797,757
(14.11 %)		 2,725,416
(34.38 %)		 95,149
(8.09 %)
484 warty frogfish (fAntMac1 alternate hap 2020)
GCA_013347815.1		 n/a 14,197
(3.33 %)		 44,782
(7.70 %)		 n/a 41.82
(100.00 %)		 n/a 2,294
(100.00 %)		 396,279
(4.74 %)		 275,154
(5.76 %)		 2,933,132
(29.41 %)		 35,104
(4.08 %)
485 warty frogfish (primary hap 2020)
GCA_013358685.1		 n/a 14,494
(3.34 %)		 45,310
(7.77 %)		 n/a 41.86
(99.87 %)		 219
(0.13 %)		 155
(100.00 %)		 413,753
(4.95 %)		 290,313
(6.11 %)		 3,010,996
(29.71 %)		 36,840
(4.18 %)
486 western mosquitofish
GCF_019740435.1		 54,016
(12.31 %)		 14,667
(2.80 %)		 44,358
(6.62 %)		 n/a 38.94
(97.42 %)		 181
(2.58 %)		 37
(100.00 %)		 348,476
(2.56 %)		 158,728
(2.21 %)		 4,604,959
(26.85 %)		 30,624
(1.94 %)
487 western speckled dace (OS25496 2023)
GCF_029890125.1		 46,203
(5.36 %)		 16,945
(2.57 %)		 65,343
(6.35 %)		 n/a 39.74
(100.00 %)		 n/a 930
(100.00 %)		 2,528,154
(48.24 %)		 549,447
(8.24 %)		 5,157,802
(41.42 %)		 84,874
(6.05 %)
488 westslope cutthroat trout (Uvic-CL-2024 2024)
GCF_045791955.1		 85,126
(5.62 %)		 27,822
(1.58 %)		 113,187
(4.31 %)		 n/a 43.47
(99.99 %)		 1,381
(0.01 %)		 4,647
(99.99 %)		 1,200,605
(4.82 %)		 2,237,797
(24.56 %)		 10,339,252
(54.27 %)		 70,550
(1.65 %)
489 White Sands pupfish
GCF_016077235.1		 46,084
(6.27 %)		 14,817
(1.71 %)		 52,055
(4.88 %)		 n/a 39.01
(100.00 %)		 n/a 2,003
(100.00 %)		 489,894
(2.67 %)		 304,277
(3.91 %)		 6,371,712
(38.05 %)		 41,820
(1.75 %)
490 wolf-eel
GCF_004355925.1		 43,638
(14.00 %)		 14,930
(3.24 %)		 31,372
(7.30 %)		 n/a 42.10
(92.86 %)		 23,891
(7.15 %)		 33,400
(92.85 %)		 379,343
(3.26 %)		 244,853
(2.39 %)		 3,432,622
(22.07 %)		 30,581
(2.04 %)
491 woolly sculpin (alternate hap CAN_PGR_092001 2022)
GCA_023055415.1		 n/a 14,753
(3.49 %)		 49,516
(8.47 %)		 n/a 43.00
(100.00 %)		 222
(0.00 %)		 171
(100.00 %)		 458,382
(5.18 %)		 420,718
(8.01 %)		 3,146,054
(25.71 %)		 69,817
(7.20 %)
492 woolly sculpin (CAN_PGR_092001 2022)
GCA_023055335.1		 n/a 14,847
(3.48 %)		 50,136
(8.43 %)		 n/a 42.99
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 443
(100.00 %)		 461,903
(5.20 %)		 422,251
(8.03 %)		 3,180,804
(25.81 %)		 70,183
(7.15 %)
493 woolly sculpin (CAN_PGR_092001 primary hap 2022)
GCF_023055335.1		 42,410
(12.47 %)		 14,845
(3.48 %)		 50,132
(8.43 %)		 n/a 42.99
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 661
(100.00 %)		 461,895
(5.20 %)		 422,249
(8.03 %)		 3,180,722
(25.81 %)		 70,181
(7.15 %)
494 worm pipefish (v2.1 RoL_2023-P12025)
GCF_033978685.3		 47,694
(3.96 %)		 14,177
(1.01 %)		 59,392
(2.97 %)		 n/a 39.43
(100.00 %)		 40
(0.00 %)		 230
(100.00 %)		 1,246,897
(5.46 %)		 1,548,619
(19.15 %)		 6,596,258
(69.80 %)		 148,788
(5.04 %)
495 Wuchang bream
GCF_018812025.1		 68,781
(8.86 %)		 18,247
(2.62 %)		 57,323
(5.24 %)		 n/a 37.64
(99.83 %)		 1,281
(0.17 %)		 243
(100.00 %)		 801,110
(0.00 %)		 559,399
(5.04 %)		 6,340,567
(43.09 %)		 45,067
(2.52 %)
496 X-ray tetra P.maxillaris (Tingi 2024)
GCA_045781885.1		 n/a 16,642
(2.04 %)		 47,150
(4.32 %)		 n/a 38.74
(100.00 %)		 n/a 157
(100.00 %)		 3,230,699
(43.68 %)		 893,937
(8.12 %)		 7,684,185
(38.36 %)		 29,533
(1.14 %)
497 Yangtze koukloug (SWU-2019 2020)
GCF_012432095.1		 63,938
(10.50 %)		 17,502
(3.25 %)		 52,519
(5.86 %)		 n/a 37.23
(99.62 %)		 617
(0.38 %)		 353
(100.00 %)		 2,297,102
(50.34 %)		 368,423
(3.28 %)		 5,171,389
(38.98 %)		 32,824
(2.00 %)
498 yellow and blueback fusilier (OG672 2025)
GCA_048129025.1		 n/a 15,641
(1.95 %)		 52,141
(5.13 %)		 n/a 40.61
(100.00 %)		 17
(0.00 %)		 250
(100.00 %)		 607,010
(2.66 %)		 288,837
(3.91 %)		 6,785,488
(31.37 %)		 39,560
(1.65 %)
499 yellow and blueback fusilier (OG672 2025)
GCA_048129055.1		 n/a 15,666
(1.88 %)		 53,049
(5.01 %)		 n/a 40.71
(100.00 %)		 29
(0.00 %)		 324
(100.00 %)		 620,903
(2.64 %)		 305,809
(5.18 %)		 6,707,330
(33.41 %)		 45,863
(1.88 %)
500 yellow catfish (hzauxx_2018 2022)
GCF_022655615.1		 64,819
(11.15 %)		 15,680
(2.87 %)		 41,108
(5.68 %)		 n/a 39.49
(99.94 %)		 817
(0.06 %)		 517
(100.00 %)		 839,496
(9.42 %)		 756,396
(11.12 %)		 4,051,149
(35.45 %)		 24,342
(1.72 %)
501 yellow catfish (Tf-2017 2018)
GCF_003724035.1		 54,374
(10.66 %)		 15,584
(2.85 %)		 22,598
(5.58 %)		 n/a 39.55
(99.11 %)		 1,760
(0.89 %)		 663
(100.00 %)		 883,218
(10.65 %)		 797,020
(11.09 %)		 4,092,065
(35.46 %)		 24,238
(1.72 %)
502 yellow perch (YP-PL-M2 2019)
GCF_004354835.1		 47,121
(7.78 %)		 15,458
(2.26 %)		 28,572
(5.62 %)		 n/a 40.84
(99.95 %)		 831
(0.05 %)		 268
(100.00 %)		 620,402
(4.92 %)		 540,302
(7.26 %)		 4,770,842
(35.92 %)		 35,251
(1.63 %)
503 yellowfin seabream (v.2019 alternate hap 2020)
GCA_904848175.1		 n/a 814
(1.87 %)		 3,814
(6.84 %)		 n/a 42.36
(99.98 %)		 80
(0.02 %)		 349
(100.00 %)		 38,000
(5.03 %)		 29,516
(7.35 %)		 232,988
(20.37 %)		 2,289
(2.07 %)
504 yellowfin seabream (v.2019 primary hap 2020)
GCF_904848185.1		 63,974
(13.26 %)		 15,178
(2.82 %)		 46,332
(6.73 %)		 84,160
(11.62 %)		 42.09
(100.00 %)		 149
(0.00 %)		 66
(100.00 %)		 499,939
(3.43 %)		 254,361
(2.64 %)		 4,420,217
(22.81 %)		 31,005
(1.79 %)
505 yellowfin tuna (alternate hap 2021)
GCA_914744365.1		 n/a 15,959
(2.63 %)		 43,025
(5.73 %)		 n/a 39.71
(100.00 %)		 n/a 640
(100.00 %)		 1,427,221
(28.44 %)		 257,108
(3.15 %)		 5,197,531
(26.91 %)		 13,909
(0.83 %)
506 yellowfin tuna (primary hap 2021)
GCF_914725855.1		 57,835
(11.36 %)		 15,616
(2.53 %)		 42,750
(5.72 %)		 n/a 39.73
(100.00 %)		 70
(0.00 %)		 68
(100.00 %)		 569,665
(3.53 %)		 259,656
(3.34 %)		 5,175,692
(27.05 %)		 14,420
(0.88 %)
507 yellowtail amberjack (v2 SW California HSWRI2012SDOR001 2017)
GCF_002814215.2		 40,948
(9.95 %)		 15,673
(2.75 %)		 53,235
(6.33 %)		 n/a 40.72
(97.79 %)		 33,661
(2.21 %)		 98,345
(100.00 %)		 1,337,427
(24.48 %)		 522,121
(4.83 %)		 4,649,096
(25.00 %)		 16,819
(0.86 %)
508 zebra mbuna (Mazinzi reef 2018)
GCF_000238955.4		 51,025
(8.37 %)		 15,901
(2.10 %)		 32,136
(6.12 %)		 n/a 41.16
(99.99 %)		 641
(0.01 %)		 1,690
(100.00 %)		 565,771
(6.22 %)		 253,037
(2.53 %)		 4,679,743
(31.57 %)		 36,689
(2.00 %)
509 zebra mbuna (NMK-2024a 2024)
GCF_041146795.1		 64,053
(10.53 %)		 15,646
(2.13 %)		 55,412
(6.16 %)		 n/a 41.21
(98.83 %)		 155
(1.17 %)		 63
(100.00 %)		 1,445,623
(39.84 %)		 261,983
(5.12 %)		 4,357,683
(32.79 %)		 35,968
(2.14 %)
510 zebrafish (fDanRer4 alternate hap 2022)
GCA_944039255.1		 n/a 6,365
(2.41 %)		 16,467
(3.26 %)		 n/a 36.72
(100.00 %)		 n/a 4,719
(100.00 %)		 1,317,027
(59.43 %)		 323,062
(10.58 %)		 3,014,570
(45.46 %)		 14,563
(1.98 %)
511 zebrafish (GRCz12tu Tuebingen 2025)
GCF_049306965.1		 122,338
(8.09 %)		 18,033
(2.41 %)		 44,966
(3.23 %)		 n/a 37.14
(100.00 %)		 13,351
(0.00 %)		 26
(100.00 %)		 3,807,410
(60.58 %)		 965,679
(12.22 %)		 8,736,108
(52.67 %)		 45,856
(2.03 %)
512 zebrafish (T5D 2021)
GCA_018400075.1		 n/a 17,774
(2.54 %)		 44,221
(3.24 %)		 n/a 36.52
(99.87 %)		 20,876
(0.14 %)		 20,901
(99.86 %)		 4,138,008
(61.22 %)		 894,145
(6.79 %)		 9,494,379
(47.68 %)		 42,482
(2.03 %)
513 zebrafish (WGS:CAHPTA01 2020)
GCA_903684865.1		 n/a 17,535
(2.50 %)		 44,169
(3.34 %)		 n/a 36.57
(99.99 %)		 712
(0.01 %)		 1,252
(100.00 %)		 3,891,854
(61.07 %)		 927,173
(7.78 %)		 8,621,517
(50.27 %)		 44,554
(2.12 %)
514 zebrafish (WGS:CAHPTB02 2020)
GCA_903684855.2		 n/a 17,692
(2.51 %)		 43,578
(3.27 %)		 n/a 36.56
(99.99 %)		 1,352
(0.01 %)		 755
(100.00 %)		 3,937,397
(60.86 %)		 936,258
(7.76 %)		 8,732,369
(50.44 %)		 44,812
(2.09 %)
515 zebrafish (WGS:CALUEM01 primary hap 2022)
GCA_944039275.1		 n/a 18,065
(2.46 %)		 44,526
(3.30 %)		 n/a 37.08
(99.99 %)		 381
(0.01 %)		 73
(100.00 %)		 4,804,769
(44.04 %)		 954,645
(10.72 %)		 8,694,743
(51.88 %)		 44,936
(2.02 %)
516 zebrafish GRCz11
GCF_000002035.6		 72,965
(6.43 %)		 22,246
(2.54 %)		 51,134
(7.13 %)		 n/a 36.60
(99.72 %)		 20,258
(0.28 %)		 34,617
(99.73 %)		 4,595,932
(57.92 %)		 1,077,677
(6.47 %)		 10,772,232
(49.45 %)		 53,471
(2.06 %)
517 zig-zag eel (alternate hap)
GCA_900700395.1		 n/a 1,204
(2.88 %)		 4,065
(7.13 %)		 n/a 41.24
(99.99 %)		 n/a 1,437
(100.00 %)		 26,319
(3.19 %)		 14,209
(3.21 %)		 211,357
(18.05 %)		 1,253
(1.49 %)
518 zig-zag eel (v1.2 2019 refseq)
GCF_900324485.2		 45,001
(12.01 %)		 15,037
(3.35 %)		 40,235
(7.28 %)		 60,496
(9.39 %)		 40.66
(97.76 %)		 238
(2.24 %)		 123
(100.00 %)		 348,230
(2.87 %)		 157,728
(2.01 %)		 3,180,025
(23.44 %)		 12,807
(1.08 %)
519 zig-zag eel (v1.3 2021 genbank)
GCA_900324485.3		 n/a 15,036
(3.35 %)		 40,234
(7.28 %)		 n/a 40.66
(97.76 %)		 238
(2.24 %)		 123
(100.00 %)		 671,614
(20.98 %)		 157,728
(2.01 %)		 3,180,040
(23.44 %)		 12,807
(1.08 %)
TOTALS:total assembly count 519

Additional hubs with collections of assemblies
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Primates 602 assemblies assembly stats track stats
Mammals 715 assemblies assembly stats track stats
Birds 453 assemblies assembly stats track stats
Fishes 519 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 347 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1541 assemblies assembly stats track stats
Plants 435 assemblies assembly stats track stats
Fungi 3995 assemblies assembly stats track stats
Viruses 15005 assemblies assembly stats track stats
Archaea 2663 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 21837 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 687 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 464 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 5058 assemblies assembly stats track stats