Mammals Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of mammals only.

See also: hub access, assembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 aardvark (SDZICR_OR568_19922 2012 Broad)
GCF_000298275.1		 25,594
(1.08 %)		 18,351
(1.06 %)		 20,358
(0.98 %)		 n/a 40.07
(76.89 %)		 411,144
(23.15 %)		 433,653
(76.85 %)		 n/a 536,700
(0.74 %)		 18,176,790
(39.08 %)		 26,235
(0.40 %)
2 African grass rat (maternal 2020)
GCA_011750645.1		 n/a 20,916
(2.01 %)		 19,513
(1.43 %)		 n/a 41.37
(98.89 %)		 1,526
(1.11 %)		 1,610
(100.00 %)		 4,928,847
(37.45 %)		 1,652,295
(5.20 %)		 13,507,965
(32.27 %)		 17,712
(0.51 %)
3 African grass rat (paternal 2020)
GCA_011762545.1		 n/a 20,796
(2.00 %)		 19,611
(1.43 %)		 n/a 41.42
(97.70 %)		 1,563
(2.30 %)		 1,740
(100.00 %)		 4,904,243
(37.25 %)		 1,672,608
(5.37 %)		 13,465,246
(32.19 %)		 17,677
(0.50 %)
4 African grass rat (v1 paternal X 2020 refseq)
GCF_011762505.1		 45,963
(2.46 %)		 20,878
(1.99 %)		 19,613
(1.43 %)		 37,929
(2.32 %)		 41.39
(99.19 %)		 1,624
(0.81 %)		 1,595
(100.00 %)		 4,939,557
(37.33 %)		 1,674,970
(5.40 %)		 13,613,429
(32.71 %)		 17,767
(0.51 %)
5 African grass rat (v2 paternal X 2024 genbank)
GCA_011762505.2		 n/a 19,637
(1.95 %)		 19,610
(1.43 %)		 n/a 41.39
(99.19 %)		 1,624
(0.81 %)		 1,596
(100.00 %)		 5,399,465
(42.90 %)		 1,674,970
(5.40 %)		 13,613,540
(32.71 %)		 17,767
(0.51 %)
6 African grass rat (v2 paternal X 2025 refseq)
GCF_011762505.2		 70,837
(3.51 %)		 19,640
(1.95 %)		 19,607
(1.43 %)		 n/a 41.39
(99.19 %)		 1,624
(0.81 %)		 1,595
(100.00 %)		 5,625,390
(42.96 %)		 1,674,970
(5.40 %)		 13,612,806
(32.71 %)		 17,767
(0.51 %)
7 African grass rat (v3 paternal hap 2024)
GCA_011762505.3		 n/a 20,986
(2.01 %)		 19,611
(1.43 %)		 n/a 41.39
(99.19 %)		 1,624
(0.81 %)		 1,596
(100.00 %)		 4,532,782
(33.95 %)		 1,674,970
(5.40 %)		 13,612,916
(32.71 %)		 17,767
(0.51 %)
8 African hunting dog
GCA_001887905.1		 n/a 18,956
(1.75 %)		 17,562
(1.41 %)		 n/a 40.98
(92.89 %)		 1,415,298
(7.28 %)		 803
(100.00 %)		 4,458,183
(39.99 %)		 658,637
(1.13 %)		 13,671,493
(28.24 %)		 47,644
(1.64 %)
9 African hunting dog (LycPic1hap1 2024)
GCA_040955645.1		 n/a 18,688
(1.61 %)		 19,670
(1.44 %)		 n/a 41.35
(100.00 %)		 82
(0.00 %)		 86
(100.00 %)		 4,281,139
(31.62 %)		 959,378
(2.78 %)		 12,859,760
(32.95 %)		 49,122
(2.32 %)
10 African hunting dog (LycPic1hap2 2024)
GCA_040955705.1		 n/a 19,463
(1.58 %)		 20,378
(1.42 %)		 n/a 41.30
(100.00 %)		 91
(0.00 %)		 77
(100.00 %)		 4,513,580
(32.16 %)		 1,008,611
(2.91 %)		 13,570,452
(33.71 %)		 50,954
(2.21 %)
11 African savanna elephant (2009 refseq)
GCF_000001905.1		 46,043
(2.30 %)		 19,169
(1.26 %)		 19,664
(1.10 %)		 n/a 40.76
(97.57 %)		 93,514
(2.45 %)		 95,866
(97.55 %)		 6,363,315
(57.54 %)		 365,797
(0.88 %)		 16,073,053
(44.89 %)		 33,513
(0.68 %)
12 African savanna elephant (hap1 mLoxAfr1 2023)
GCA_030020305.1		 n/a 18,845
(1.07 %)		 22,426
(1.10 %)		 n/a 41.34
(99.85 %)		 169
(0.15 %)		 1,253
(99.85 %)		 4,406,744
(29.55 %)		 925,868
(4.71 %)		 15,966,881
(50.49 %)		 68,531
(1.61 %)
13 African savanna elephant (hap2 2023 genbank)
GCA_030014295.1		 n/a 18,981
(1.10 %)		 22,759
(1.12 %)		 n/a 41.25
(99.90 %)		 231
(0.10 %)		 880
(100.00 %)		 4,426,756
(29.95 %)		 832,908
(4.08 %)		 16,118,910
(49.47 %)		 62,315
(1.49 %)
14 African savanna elephant (hap2 2023 refseq)
GCF_030014295.1		 64,034
(3.35 %)		 18,980
(1.10 %)		 21,593
(1.06 %)		 n/a 41.25
(99.90 %)		 231
(0.10 %)		 879
(100.00 %)		 4,426,749
(29.95 %)		 832,904
(4.08 %)		 16,118,888
(49.47 %)		 62,314
(1.49 %)
15 African soft-furred rat (Lowveld savanna grassland N552 2022)
GCA_021653895.1		 n/a 20,232
(2.08 %)		 18,517
(1.32 %)		 n/a 41.15
(100.00 %)		 n/a 7,311
(100.00 %)		 5,083,017
(39.13 %)		 1,337,200
(3.02 %)		 13,402,561
(30.35 %)		 17,841
(0.51 %)
16 African soft-furred rat (MVZ Mamm 221054 2021)
GCA_019843795.1		 n/a 26,123
(1.59 %)		 49,154
(1.23 %)		 n/a 41.38
(99.06 %)		 92,030
(0.93 %)		 412,491
(99.07 %)		 5,251,146
(37.28 %)		 1,541,020
(3.13 %)		 13,613,713
(32.35 %)		 21,054
(0.58 %)
17 agile gracile mouse opossum
GCF_016433145.1		 30,697
(1.32 %)		 17,361
(0.78 %)		 17,596
(0.81 %)		 n/a 37.86
(91.75 %)		 85,142
(8.25 %)		 60,714
(100.00 %)		 7,917,577
(49.04 %)		 1,054,566
(1.57 %)		 22,701,659
(37.69 %)		 27,301
(0.49 %)
18 Allen's wood mouse (MVZ Mamm 196246 2021)
GCA_019843855.1		 n/a 22,687
(1.16 %)		 46,299
(0.94 %)		 n/a 41.37
(99.72 %)		 75,967
(0.24 %)		 659,537
(99.76 %)		 6,139,432
(45.57 %)		 1,339,550
(3.13 %)		 12,293,115
(32.34 %)		 16,575
(0.44 %)
19 alpaca (2025)
GCF_048564905.1		 80,233
(3.11 %)		 18,667
(1.53 %)		 23,043
(1.52 %)		 n/a 41.92
(99.91 %)		 681
(0.09 %)		 519
(100.00 %)		 3,387,094
(33.34 %)		 395,581
(10.22 %)		 11,510,740
(36.96 %)		 72,497
(1.98 %)
20 alpaca (v3.2 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U)
GCF_000164845.4		 54,987
(3.56 %)		 18,439
(1.93 %)		 18,426
(1.63 %)		 n/a 41.40
(95.85 %)		 166,272
(4.17 %)		 77,389
(100.00 %)		 3,004,413
(33.17 %)		 315,092
(1.36 %)		 12,458,272
(24.89 %)		 54,502
(1.38 %)
21 Alpine marmot (2019)
GCF_001458135.2		 69,587
(3.43 %)		 19,047
(1.54 %)		 17,768
(1.39 %)		 n/a 39.80
(96.13 %)		 88,858
(3.88 %)		 14,031
(100.00 %)		 3,726,252
(26.48 %)		 746,953
(1.83 %)		 14,066,368
(30.30 %)		 30,191
(0.63 %)
22 Alston's brown mouse (SKS-2025a 2025)
GCA_049901635.1		 n/a 19,201
(1.73 %)		 20,397
(1.45 %)		 n/a 41.54
(100.00 %)		 n/a 7,689
(100.00 %)		 6,399,518
(45.04 %)		 1,172,526
(4.32 %)		 13,154,869
(32.85 %)		 17,916
(0.51 %)
23 Alvarez's mastiff bat (A012 2023)
GCA_031001765.1		 n/a 19,086
(1.55 %)		 22,040
(1.52 %)		 n/a 42.18
(99.99 %)		 1,182
(0.01 %)		 1,369
(99.99 %)		 3,846,728
(31.78 %)		 639,852
(2.90 %)		 11,937,936
(38.98 %)		 75,377
(2.21 %)
24 Alvarez's mastiff bat (hap1 2024)
GCA_037157525.1		 n/a 18,980
(1.50 %)		 22,394
(1.50 %)		 n/a 42.30
(100.00 %)		 80
(0.00 %)		 326
(100.00 %)		 3,896,863
(31.56 %)		 659,711
(4.74 %)		 11,945,162
(40.81 %)		 76,769
(2.57 %)
25 Alvarez's mastiff bat (hap2 2024)
GCA_037176705.1		 n/a 19,066
(1.48 %)		 22,356
(1.48 %)		 n/a 42.25
(100.00 %)		 75
(0.00 %)		 287
(100.00 %)		 3,908,607
(31.48 %)		 664,931
(5.23 %)		 11,892,191
(41.08 %)		 76,453
(2.43 %)
26 Amazon manatee (hap1 2025)
GCA_046562985.1		 n/a 17,917
(1.26 %)		 20,499
(1.11 %)		 n/a 40.77
(100.00 %)		 377
(0.00 %)		 550
(100.00 %)		 5,812,915
(56.93 %)		 431,488
(2.57 %)		 14,336,638
(47.98 %)		 33,775
(0.84 %)
27 Amazon manatee (hap2 2025)
GCA_046562895.1		 n/a 18,949
(1.23 %)		 21,655
(1.08 %)		 n/a 40.80
(100.00 %)		 294
(0.00 %)		 401
(100.00 %)		 6,218,266
(57.31 %)		 470,437
(3.04 %)		 15,241,157
(48.91 %)		 37,124
(0.86 %)
28 American beaver (hap1 2025)
GCA_047511655.1		 n/a 19,828
(1.45 %)		 20,376
(1.31 %)		 n/a 39.72
(100.00 %)		 181
(0.00 %)		 503
(100.00 %)		 4,030,880
(35.35 %)		 566,770
(2.63 %)		 14,198,970
(35.24 %)		 24,454
(0.96 %)
29 American beaver (hap1v2 2025)
GCA_047511655.2		 n/a 19,759
(1.46 %)		 19,656
(1.23 %)		 n/a 39.67
(100.00 %)		 181
(0.00 %)		 182
(100.00 %)		 4,077,829
(35.51 %)		 563,159
(2.55 %)		 14,502,350
(35.45 %)		 23,983
(0.89 %)
30 American beaver (hap2 2025)
GCA_047511605.1		 n/a 19,144
(1.44 %)		 18,959
(1.23 %)		 n/a 39.54
(100.00 %)		 194
(0.00 %)		 229
(100.00 %)		 3,981,637
(35.85 %)		 561,691
(2.26 %)		 14,374,940
(35.03 %)		 23,386
(0.80 %)
31 American beaver (hap2v2 2025)
GCA_047511605.2		 n/a 19,115
(1.44 %)		 18,756
(1.21 %)		 n/a 39.53
(100.00 %)		 194
(0.00 %)		 154
(100.00 %)		 4,032,632
(35.91 %)		 560,508
(2.24 %)		 14,349,713
(35.01 %)		 23,225
(0.77 %)
32 American beaver (mCasCan1.hap1v2 2025)
GCF_047511655.1		 79,343
(3.55 %)		 19,759
(1.46 %)		 19,920
(1.23 %)		 n/a 39.67
(100.00 %)		 181
(0.00 %)		 181
(100.00 %)		 4,023,733
(35.50 %)		 563,158
(2.55 %)		 14,502,226
(35.45 %)		 23,983
(0.89 %)
33 American beaver (Ward 2017 refseq)
GCF_001984765.1		 40,013
(2.15 %)		 20,867
(1.53 %)		 24,201
(1.33 %)		 n/a 39.72
(99.99 %)		 3,321
(0.01 %)		 21,157
(100.00 %)		 4,526,430
(33.75 %)		 486,353
(1.30 %)		 14,347,145
(31.96 %)		 23,046
(0.72 %)
34 American bison (2014 refseq)
GCF_000754665.1		 38,699
(2.34 %)		 19,782
(1.47 %)		 20,444
(1.25 %)		 n/a 41.82
(93.12 %)		 341,984
(6.92 %)		 470,415
(93.08 %)		 n/a 419,596
(0.95 %)		 13,519,877
(37.66 %)		 60,388
(1.03 %)
35 American black bear (L20-20 2025)
GCA_024610735.2		 n/a 18,082
(1.59 %)		 20,977
(1.43 %)		 n/a 42.93
(100.00 %)		 41
(0.00 %)		 298
(100.00 %)		 4,773,058
(45.96 %)		 641,956
(5.91 %)		 13,210,521
(35.54 %)		 68,976
(3.00 %)
36 American black bear (L20-20 alternate hap 2022)
GCA_024610745.1		 n/a 22,502
(1.17 %)		 43,431
(1.28 %)		 n/a 43.14
(99.99 %)		 n/a 77,311
(100.00 %)		 4,587,986
(32.30 %)		 773,829
(6.39 %)		 14,594,034
(35.67 %)		 78,849
(3.32 %)
37 American black bear (L20-20 primary hap 2022)
GCA_024610735.1		 n/a 18,458
(1.52 %)		 21,049
(1.43 %)		 n/a 42.93
(100.00 %)		 22
(0.00 %)		 317
(100.00 %)		 4,000,508
(32.69 %)		 641,903
(5.91 %)		 13,210,530
(35.54 %)		 68,981
(3.00 %)
38 American black bear (UA15103 2021)
GCF_020975775.1		 53,916
(3.11 %)		 18,840
(1.73 %)		 20,969
(1.50 %)		 n/a 42.09
(100.00 %)		 n/a 2,213
(100.00 %)		 3,936,528
(34.53 %)		 594,864
(2.90 %)		 13,725,005
(32.35 %)		 62,580
(1.91 %)
39 American mink (2018)
GCA_900108605.1		 n/a 18,686
(1.70 %)		 20,016
(1.50 %)		 36,997
(1.74 %)		 41.60
(92.95 %)		 154,172
(7.07 %)		 161,347
(92.93 %)		 4,350,343
(38.70 %)		 606,128
(1.17 %)		 13,605,797
(28.74 %)		 54,199
(1.98 %)
40 American mink (hap1 2024)
GCA_964106545.1		 n/a 19,203
(1.43 %)		 22,174
(1.33 %)		 n/a 42.39
(99.98 %)		 2,957
(0.02 %)		 435
(100.00 %)		 4,188,829
(30.04 %)		 802,295
(5.81 %)		 14,041,290
(37.98 %)		 65,430
(2.64 %)
41 American mink (hap2 2024)
GCA_964106205.1		 n/a 18,890
(1.43 %)		 21,684
(1.33 %)		 n/a 42.35
(99.98 %)		 2,849
(0.02 %)		 3,200
(99.98 %)		 4,158,563
(30.22 %)		 786,430
(5.25 %)		 13,845,377
(37.58 %)		 64,307
(2.75 %)
42 American mink (M4711 2021 Dalhousie U)
GCF_020171115.1		 50,253
(2.26 %)		 18,949
(1.49 %)		 20,914
(1.29 %)		 n/a 42.26
(100.00 %)		 n/a 183
(100.00 %)		 4,705,680
(39.15 %)		 795,684
(5.50 %)		 14,085,357
(37.99 %)		 63,307
(2.38 %)
43 American pika (hap1 2023)
GCF_030435755.1		 45,008
(1.93 %)		 17,997
(1.35 %)		 23,185
(1.49 %)		 n/a 44.16
(100.00 %)		 432
(0.00 %)		 5,864
(100.00 %)		 4,126,248
(43.60 %)		 628,344
(15.71 %)		 11,100,962
(42.69 %)		 60,350
(1.67 %)
44 American pika (hap2 2023)
GCA_030435715.1		 n/a 16,911
(1.23 %)		 21,107
(1.43 %)		 n/a 44.43
(100.00 %)		 375
(0.00 %)		 6,123
(100.00 %)		 1,808,768
(10.42 %)		 561,106
(21.05 %)		 10,283,513
(45.97 %)		 54,919
(1.33 %)
45 American pika 3.0 (2012 Broad refseq)
GCF_000292845.1		 26,240
(1.93 %)		 17,576
(1.61 %)		 20,076
(1.70 %)		 n/a 43.35
(87.20 %)		 122,542
(12.82 %)		 132,962
(87.18 %)		 2,761,257
(29.47 %)		 414,896
(1.07 %)		 10,968,698
(26.71 %)		 44,652
(1.14 %)
46 American pika 4.0 (UAM:Mamm:113957 2020)
GCF_014633375.1		 31,887
(1.92 %)		 17,532
(1.60 %)		 19,609
(1.65 %)		 n/a 43.35
(87.14 %)		 124,941
(12.88 %)		 9,351
(100.00 %)		 2,827,662
(29.77 %)		 414,980
(1.07 %)		 10,969,165
(26.69 %)		 44,743
(1.13 %)
47 American wolverine (FN33715 2022)
GCA_024509225.1		 n/a 18,360
(1.57 %)		 20,615
(1.47 %)		 n/a 41.70
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 758
(100.00 %)		 4,038,995
(32.25 %)		 664,825
(1.25 %)		 13,625,080
(33.05 %)		 56,595
(2.13 %)
48 Amur tiger (TaeGuk 2013 refseq)
GCF_000464555.1		 33,681
(2.23 %)		 17,929
(1.49 %)		 15,090
(1.29 %)		 n/a 41.40
(97.59 %)		 155,553
(2.44 %)		 157,032
(97.56 %)		 n/a 831,136
(1.67 %)		 13,654,437
(31.78 %)		 65,229
(1.60 %)
49 Angolan free-tailed bat
GCA_043748645.2		 n/a 18,321
(1.73 %)		 23,033
(1.67 %)		 n/a 42.90
(100.00 %)		 100
(0.00 %)		 34
(100.00 %)		 4,324,378
(43.44 %)		 558,565
(2.08 %)		 11,330,414
(35.72 %)		 103,798
(3.90 %)
50 Angolan free-tailed bat (Cote d'Ivoire 20210831_DDa 2024)
GCA_043748645.1		 n/a 18,528
(1.65 %)		 22,359
(1.64 %)		 n/a 42.89
(100.00 %)		 88
(0.00 %)		 44
(100.00 %)		 3,531,044
(35.70 %)		 555,304
(2.07 %)		 11,439,853
(36.03 %)		 102,112
(3.75 %)
51 Angolan free-tailed bat (Cote d'Ivoire 20210831_DDa alternate hap 2024)
GCA_043748605.1		 n/a 17,996
(1.77 %)		 23,084
(1.76 %)		 n/a 43.12
(100.00 %)		 n/a 1,670
(100.00 %)		 4,087,571
(42.52 %)		 525,056
(2.00 %)		 10,779,134
(34.81 %)		 100,610
(3.93 %)
52 Angus cow (Angus x Brahman F1 Angus haplotype 2018)
GCA_003369685.2		 n/a 19,096
(1.59 %)		 20,674
(1.34 %)		 n/a 41.99
(99.75 %)		 277
(0.25 %)		 1,435
(100.00 %)		 5,290,422
(47.51 %)		 478,946
(1.94 %)		 12,568,313
(41.15 %)		 45,850
(1.37 %)
53 Antarctic minke whale
GCA_000978805.1		 n/a 23,312
(1.49 %)		 45,535
(1.26 %)		 n/a 40.73
(99.37 %)		 299,456
(0.64 %)		 720,900
(99.36 %)		 4,011,313
(41.13 %)		 504,837
(1.04 %)		 13,553,641
(30.96 %)		 56,223
(1.31 %)
54 Antillean ghost-faced bat
GCA_004026545.1		 n/a 20,088
(1.74 %)		 31,558
(1.63 %)		 n/a 41.74
(99.97 %)		 1,835
(0.01 %)		 207,094
(99.99 %)		 3,025,044
(30.67 %)		 332,606
(0.70 %)		 12,504,556
(28.79 %)		 65,503
(2.30 %)
55 aoudad
GCA_002201775.1		 n/a 19,905
(1.62 %)		 27,488
(1.60 %)		 n/a 42.01
(95.96 %)		 186,672
(4.05 %)		 263,992
(95.95 %)		 5,418,013
(45.05 %)		 471,426
(1.19 %)		 13,396,252
(36.94 %)		 48,844
(1.32 %)
56 Arabian camel (Drom800 2019 refseq)
GCF_000803125.2		 64,532
(3.85 %)		 18,483
(1.89 %)		 20,554
(1.62 %)		 n/a 41.51
(99.22 %)		 47,342
(0.79 %)		 21,070
(100.00 %)		 3,233,022
(34.07 %)		 345,049
(1.55 %)		 13,383,050
(26.19 %)		 58,872
(1.79 %)
57 Arabian camel (hap2 2024)
GCA_036321565.1		 n/a 17,085
(1.73 %)		 19,317
(1.59 %)		 n/a 41.75
(100.00 %)		 210
(0.00 %)		 173
(100.00 %)		 2,818,446
(29.44 %)		 316,646
(8.90 %)		 11,192,133
(31.47 %)		 52,135
(1.67 %)
58 Arabian camel (paternal hap 2024 genbank)
GCA_036321535.1		 n/a 18,080
(1.66 %)		 20,345
(1.52 %)		 n/a 41.64
(100.00 %)		 195
(0.00 %)		 172
(100.00 %)		 3,040,473
(29.22 %)		 343,482
(10.93 %)		 11,797,012
(33.50 %)		 55,428
(1.61 %)
59 Arabian camel (paternal hap 2024 refseq)
GCF_036321535.1		 62,940
(3.46 %)		 18,078
(1.66 %)		 21,071
(1.56 %)		 n/a 41.64
(100.00 %)		 195
(0.00 %)		 171
(100.00 %)		 3,040,467
(29.22 %)		 343,480
(10.93 %)		 11,796,955
(33.50 %)		 55,427
(1.61 %)
60 Arctic fox (Blue_001 2021 refseq)
GCF_018345385.1		 60,759
(3.11 %)		 19,942
(1.72 %)		 19,529
(1.38 %)		 n/a 41.27
(100.00 %)		 529
(0.00 %)		 929
(100.00 %)		 4,821,229
(41.22 %)		 1,006,124
(2.31 %)		 13,556,149
(32.92 %)		 49,997
(2.23 %)
61 Arctic ground squirrel (AGS 11-09-20 2018)
GCF_003426925.1		 39,569
(2.25 %)		 18,954
(1.74 %)		 19,372
(1.45 %)		 n/a 39.95
(89.51 %)		 2,429,461
(10.59 %)		 15,883
(100.00 %)		 4,400,304
(32.67 %)		 672,831
(1.50 %)		 13,913,477
(26.41 %)		 27,575
(0.72 %)
62 Arctic ground squirrel (hap1 2024)
GCA_045843805.1		 n/a 20,255
(1.35 %)		 21,401
(1.44 %)		 n/a 40.08
(100.00 %)		 694
(0.00 %)		 2,530
(100.00 %)		 4,287,108
(25.85 %)		 895,123
(5.96 %)		 15,722,314
(36.45 %)		 34,781
(0.82 %)
63 Arctic ground squirrel (hap2 2024)
GCA_045843765.1		 n/a 18,385
(1.31 %)		 19,099
(1.34 %)		 n/a 39.97
(100.00 %)		 590
(0.00 %)		 2,307
(100.00 %)		 4,314,945
(35.63 %)		 820,736
(6.65 %)		 14,490,422
(35.95 %)		 31,201
(0.78 %)
64 Arctic ground squirrel (mUroPar1hap1 2024)
GCF_045843805.1		 45,939
(2.00 %)		 19,773
(1.41 %)		 20,880
(1.28 %)		 n/a 40.08
(100.00 %)		 694
(0.00 %)		 2,529
(100.00 %)		 5,291,989
(39.61 %)		 895,123
(5.96 %)		 15,722,212
(36.45 %)		 34,781
(0.82 %)
65 Asian palm civet
GCA_004024585.1		 n/a 22,124
(1.43 %)		 43,710
(1.39 %)		 n/a 42.52
(99.95 %)		 4,533
(0.02 %)		 442,658
(99.98 %)		 4,877,367
(40.32 %)		 754,440
(1.35 %)		 14,557,779
(32.29 %)		 148,246
(5.67 %)
66 Asiatic brush-tailed porcupine (POm2014 2021)
GCA_016801275.1		 n/a 18,688
(1.73 %)		 22,642
(1.64 %)		 n/a 41.26
(97.24 %)		 152,126
(2.77 %)		 303,244
(97.23 %)		 3,431,580
(28.56 %)		 667,375
(2.21 %)		 13,572,972
(26.90 %)		 42,853
(1.30 %)
67 Asiatic elephant (hap1 2025)
GCA_051911825.1		 n/a 18,110
(1.16 %)		 21,254
(1.07 %)		 n/a 41.12
(100.00 %)		 83
(0.00 %)		 106
(100.00 %)		 8,688,198
(60.75 %)		 617,944
(3.48 %)		 16,342,943
(48.24 %)		 54,726
(1.19 %)
68 Asiatic elephant (hap2 2025)
GCA_051911805.1		 n/a 17,315
(1.21 %)		 20,345
(1.11 %)		 n/a 41.03
(99.98 %)		 51
(0.02 %)		 88
(100.00 %)		 8,066,849
(59.94 %)		 495,013
(2.47 %)		 15,276,267
(46.85 %)		 44,484
(1.08 %)
69 Asiatic elephant (mEleMax1 alternate hap 2022)
GCA_024166345.1		 n/a 17,906
(1.18 %)		 21,966
(1.14 %)		 n/a 41.14
(100.00 %)		 n/a 6,361
(100.00 %)		 3,818,524
(29.72 %)		 533,426
(3.22 %)		 14,381,781
(47.30 %)		 50,264
(1.15 %)
70 Asiatic elephant (mEleMax1 primary hap 2022)
GCF_024166365.1		 61,202
(2.60 %)		 18,887
(1.13 %)		 21,194
(1.06 %)		 n/a 41.14
(99.90 %)		 126
(0.10 %)		 64
(100.00 %)		 4,358,470
(31.27 %)		 663,094
(4.56 %)		 16,261,778
(48.66 %)		 69,120
(1.32 %)
71 Asiatic mouflon (Amuf_v1 2020)
GCA_014523465.1		 n/a 19,569
(1.59 %)		 21,293
(1.35 %)		 n/a 41.97
(99.68 %)		 257
(0.32 %)		 128
(100.00 %)		 5,390,761
(47.15 %)		 451,837
(1.15 %)		 13,157,608
(40.67 %)		 44,158
(1.19 %)
72 Asiatic tapir (hap1 2023)
GCA_031878655.1		 n/a 18,969
(1.75 %)		 20,207
(1.36 %)		 n/a 41.25
(100.00 %)		 79
(0.00 %)		 262
(100.00 %)		 3,650,963
(38.06 %)		 355,322
(2.63 %)		 14,837,952
(31.37 %)		 37,174
(1.87 %)
73 Asiatic tapir (hap2 2023)
GCA_031878705.1		 n/a 18,931
(1.76 %)		 19,988
(1.37 %)		 n/a 41.16
(100.00 %)		 92
(0.00 %)		 193
(100.00 %)		 3,632,286
(38.21 %)		 350,074
(2.22 %)		 14,785,531
(30.90 %)		 36,699
(1.70 %)
74 ass (donkey Dezhou 2021)
GCF_016077325.2		 84,046
(4.01 %)		 18,838
(1.75 %)		 20,239
(1.42 %)		 69,689
(3.29 %)		 41.42
(99.86 %)		 1,922
(0.15 %)		 50
(100.00 %)		 3,840,509
(41.57 %)		 319,943
(0.81 %)		 14,889,114
(29.46 %)		 41,082
(1.37 %)
75 ass (donkey Dezhou DZ240498 2026)
GCA_054375355.1		 n/a 18,466
(1.53 %)		 21,452
(1.35 %)		 n/a 42.24
(100.00 %)		 n/a 32
(100.00 %)		 4,884,564
(46.47 %)		 681,289
(5.26 %)		 14,410,624
(36.71 %)		 42,583
(2.97 %)
76 ass (donkey D_3611 2024)
GCF_041296235.1		 92,510
(3.84 %)		 18,566
(1.54 %)		 21,504
(1.32 %)		 n/a 42.37
(99.94 %)		 7
(0.06 %)		 849
(100.00 %)		 3,555,052
(38.38 %)		 658,645
(5.79 %)		 14,242,715
(36.79 %)		 43,875
(3.45 %)
77 ass (donkey Maral har 2015 refseq)
GCF_001305755.1		 48,976
(3.12 %)		 18,838
(1.78 %)		 19,295
(1.44 %)		 n/a 41.28
(98.63 %)		 69,593
(1.38 %)		 2,167
(100.00 %)		 3,731,432
(40.84 %)		 289,737
(0.96 %)		 14,695,308
(28.58 %)		 40,025
(1.06 %)
78 Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap1.1 2024)
GCA_964270905.1		 n/a 18,773
(1.50 %)		 21,069
(1.29 %)		 n/a 42.18
(99.99 %)		 1,034
(0.01 %)		 900
(100.00 %)		 3,975,427
(35.64 %)		 1,054,000
(10.27 %)		 12,281,095
(41.92 %)		 79,762
(4.08 %)
79 Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap2.1 2024)
GCA_964270935.1		 n/a 17,961
(1.59 %)		 20,087
(1.36 %)		 n/a 42.05
(99.99 %)		 917
(0.01 %)		 1,796
(99.99 %)		 3,626,392
(35.51 %)		 824,778
(7.32 %)		 11,499,904
(39.18 %)		 74,348
(3.46 %)
80 Australian echidna (mTacAcu1 alternate hap 2020)
GCA_015852515.1		 n/a 13,505
(1.03 %)		 18,978
(1.47 %)		 n/a 45.32
(99.98 %)		 26
(0.02 %)		 3,482
(100.00 %)		 6,880,857
(41.88 %)		 1,099,932
(7.47 %)		 8,156,735
(56.68 %)		 70,515
(2.88 %)
81 Australian echidna (mTacAcu1 primary hap 2020)
GCF_015852505.1		 42,938
(2.28 %)		 14,891
(1.01 %)		 19,714
(1.45 %)		 n/a 45.30
(98.61 %)		 524
(1.39 %)		 310
(100.00 %)		 7,814,876
(42.89 %)		 1,219,764
(6.93 %)		 9,488,325
(55.68 %)		 78,364
(2.73 %)
82 Australian echidna (primary hap 2020)
GCA_015852505.1		 n/a 14,558
(1.03 %)		 19,716
(1.45 %)		 n/a 45.30
(98.61 %)		 524
(1.39 %)		 311
(100.00 %)		 11,576,251
(65.36 %)		 1,219,765
(6.93 %)		 9,488,197
(55.68 %)		 78,365
(2.74 %)
83 Bactrian camel (Alxa 2014 refseq)
GCF_000767855.1		 52,191
(3.64 %)		 18,303
(1.98 %)		 17,097
(1.64 %)		 n/a 41.32
(99.32 %)		 31,980
(0.69 %)		 67,435
(99.31 %)		 2,966,704
(34.06 %)		 306,997
(0.95 %)		 12,209,949
(25.43 %)		 49,790
(1.25 %)
84 Bactrian camel YW-2024 2025
GCF_048773025.1		 76,927
(4.47 %)		 18,239
(1.57 %)		 22,111
(1.51 %)		 n/a 41.95
(100.00 %)		 127
(0.00 %)		 158
(100.00 %)		 3,258,307
(30.21 %)		 377,352
(13.70 %)		 11,533,205
(36.22 %)		 65,887
(1.95 %)
85 banded mongoose
GCA_004023785.1		 n/a 21,568
(1.57 %)		 30,427
(1.43 %)		 n/a 42.00
(99.96 %)		 4,510
(0.02 %)		 316,874
(99.98 %)		 4,768,524
(40.51 %)		 684,187
(1.30 %)		 13,713,756
(33.42 %)		 78,648
(2.80 %)
86 bank vole
GCF_902806735.1		 56,423
(2.99 %)		 18,977
(1.71 %)		 18,408
(1.50 %)		 n/a 41.86
(98.62 %)		 53,506
(1.39 %)		 54,142
(98.61 %)		 3,222,366
(21.59 %)		 933,697
(2.20 %)		 12,831,232
(31.50 %)		 18,784
(0.42 %)
87 banner-tailed kangaroo rat
GCF_019054845.1		 43,753
(1.82 %)		 18,397
(1.18 %)		 24,180
(1.39 %)		 n/a 40.83
(100.00 %)		 n/a 2,026
(100.00 %)		 5,587,719
(30.97 %)		 1,363,513
(3.95 %)		 12,128,920
(48.74 %)		 36,371
(1.27 %)
88 banteng 2023
GCF_032452875.1		 71,974
(3.56 %)		 19,305
(1.36 %)		 21,174
(1.20 %)		 n/a 42.79
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 1,518
(100.00 %)		 3,344,481
(20.63 %)		 1,039,571
(11.74 %)		 13,031,356
(47.36 %)		 73,031
(1.72 %)
89 bat A.intermedius (hap2 2024)
GCA_038363225.1		 n/a 17,124
(1.63 %)		 18,342
(1.54 %)		 n/a 42.25
(100.00 %)		 56
(0.00 %)		 187
(100.00 %)		 2,597,378
(26.81 %)		 332,733
(4.43 %)		 10,957,327
(33.52 %)		 63,688
(2.22 %)
90 bat C.sowelli (hap1 2025)
GCA_051307085.1		 n/a 18,014
(1.42 %)		 20,809
(1.93 %)		 n/a 42.09
(100.00 %)		 68
(0.00 %)		 509
(100.00 %)		 3,004,656
(32.84 %)		 845,572
(16.12 %)		 11,658,155
(41.10 %)		 66,315
(3.59 %)
91 bat C.sowelli (hap2 2025)
GCA_051307135.1		 n/a 17,963
(1.56 %)		 20,587
(1.76 %)		 n/a 42.16
(100.00 %)		 58
(0.00 %)		 272
(100.00 %)		 2,925,013
(29.51 %)		 669,006
(8.09 %)		 11,656,071
(35.51 %)		 66,056
(3.20 %)
92 bat G.keenani (hap1 2025)
GCA_050655435.1		 n/a 17,710
(1.68 %)		 20,322
(1.57 %)		 n/a 42.06
(100.00 %)		 103
(0.00 %)		 188
(100.00 %)		 3,982,570
(44.25 %)		 413,159
(3.00 %)		 12,157,326
(33.66 %)		 69,493
(3.54 %)
93 bat G.keenani (hap2 2025)
GCA_050655445.1		 n/a 17,129
(1.75 %)		 19,351
(1.61 %)		 n/a 42.25
(100.00 %)		 57
(0.00 %)		 83
(100.00 %)		 3,507,996
(42.55 %)		 382,739
(1.78 %)		 11,541,032
(32.12 %)		 67,214
(3.68 %)
94 bat H.larvatus (alternate hap 2023)
GCA_031878685.1		 n/a 19,431
(1.77 %)		 23,767
(1.57 %)		 n/a 41.38
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 7,531
(100.00 %)		 4,390,631
(44.16 %)		 678,913
(4.61 %)		 11,883,673
(33.41 %)		 41,004
(1.20 %)
95 bat H.larvatus (China 20210929_DDb primary hap 2024)
GCA_043727955.1		 n/a 19,354
(1.74 %)		 21,367
(1.51 %)		 n/a 41.48
(100.00 %)		 190
(0.00 %)		 265
(100.00 %)		 3,860,506
(38.95 %)		 722,335
(7.13 %)		 11,994,816
(35.77 %)		 44,562
(1.21 %)
96 bat M.microtis (hap1 2025)
GCA_051107205.1		 n/a 18,403
(1.68 %)		 20,606
(1.62 %)		 n/a 42.65
(100.00 %)		 68
(0.00 %)		 190
(100.00 %)		 3,101,865
(28.94 %)		 356,434
(1.13 %)		 11,717,214
(32.98 %)		 78,560
(2.78 %)
97 bat M.microtis (hap2 2025)
GCA_051107335.1		 n/a 17,634
(1.72 %)		 19,795
(1.66 %)		 n/a 42.77
(100.00 %)		 64
(0.00 %)		 158
(100.00 %)		 2,904,392
(28.42 %)		 330,754
(1.09 %)		 11,070,209
(31.88 %)		 74,480
(2.76 %)
98 beluga whale (Cook Inlet, Alaska, USA DL-CIB17-05 2020)
GCA_009917745.1		 n/a 19,239
(1.79 %)		 22,513
(1.43 %)		 35,878
(1.82 %)		 41.25
(97.57 %)		 27,070
(2.43 %)		 52,780
(97.57 %)		 4,021,599
(43.53 %)		 544,323
(1.08 %)		 12,738,162
(33.47 %)		 59,710
(1.51 %)
99 beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v3 2019)
GCF_002288925.2		 59,413
(3.09 %)		 18,667
(1.79 %)		 20,314
(1.43 %)		 n/a 41.24
(98.49 %)		 24,414
(1.52 %)		 29,444
(98.48 %)		 4,001,248
(43.73 %)		 543,276
(1.11 %)		 12,802,735
(34.18 %)		 59,307
(1.53 %)
100 big brown bat (BU_THK_EF1 2012)
GCF_000308155.1		 59,162
(3.17 %)		 18,334
(1.94 %)		 20,121
(1.78 %)		 n/a 42.93
(89.41 %)		 160,269
(10.62 %)		 167,057
(89.38 %)		 2,842,065
(25.82 %)		 614,712
(1.89 %)		 10,407,733
(28.90 %)		 66,720
(2.99 %)
101 big brown bat (TK198812 2023)
GCA_027574615.1		 n/a 18,420
(1.89 %)		 21,275
(1.72 %)		 n/a 43.51
(100.00 %)		 75
(0.00 %)		 49
(100.00 %)		 4,895,568
(45.28 %)		 904,082
(3.80 %)		 10,530,742
(37.05 %)		 77,606
(3.68 %)
102 big brown bat (TK198812 2023)
GCF_027574615.1		 46,266
(2.61 %)		 18,620
(1.80 %)		 21,271
(1.72 %)		 n/a 43.51
(100.00 %)		 75
(0.00 %)		 48
(100.00 %)		 3,041,145
(25.08 %)		 904,075
(3.80 %)		 10,530,666
(37.05 %)		 77,605
(3.68 %)
103 bighorn sheep (Bighorn MfBH-ARS-UI-01 2024)
GCA_042477335.2		 n/a 19,021
(1.39 %)		 21,154
(1.33 %)		 n/a 43.91
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 41
(100.00 %)		 5,490,141
(54.04 %)		 826,352
(11.67 %)		 12,918,667
(46.86 %)		 52,254
(10.67 %)
104 bighorn sheep (BS48 2019)
GCA_004026945.1		 n/a 23,059
(1.34 %)		 36,486
(1.19 %)		 n/a 43.20
(99.90 %)		 9,412
(0.03 %)		 1,057,548
(99.97 %)		 6,321,577
(50.75 %)		 716,846
(1.66 %)		 13,904,326
(44.98 %)		 95,564
(1.72 %)
105 bighorn sheep (v2 Bighorn MfBH-ARS-UI-01 2024)
GCF_042477335.2		 78,636
(2.63 %)		 19,459
(1.36 %)		 21,150
(1.33 %)		 n/a 43.91
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 42
(100.00 %)		 3,963,383
(22.89 %)		 826,353
(11.67 %)		 12,918,743
(46.86 %)		 52,254
(10.67 %)
106 bilby (mMagLag1 2024)
GCA_037893015.1		 n/a 18,686
(0.72 %)		 17,238
(0.81 %)		 n/a 37.35
(99.66 %)		 4,431
(0.34 %)		 609
(100.00 %)		 6,263,094
(27.34 %)		 2,223,995
(5.89 %)		 23,994,844
(43.69 %)		 51,039
(3.47 %)
107 bilby (mMagLag1 2024)
GCF_037893015.1		 60,460
(3.10 %)		 18,687
(0.72 %)		 17,229
(0.81 %)		 n/a 37.35
(99.66 %)		 4,431
(0.34 %)		 608
(100.00 %)		 6,299,949
(27.49 %)		 2,223,987
(5.89 %)		 23,992,536
(43.69 %)		 51,039
(3.47 %)
108 black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap1 2024)
GCA_043290085.1		 n/a 20,713
(0.64 %)		 21,469
(0.64 %)		 n/a 41.74
(100.00 %)		 770
(0.00 %)		 470
(100.00 %)		 3,860,121
(14.52 %)		 1,230,113
(2.81 %)		 21,600,460
(65.53 %)		 49,878
(0.73 %)
109 black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap2 2024)
GCA_043290065.1		 n/a 19,814
(0.63 %)		 20,140
(0.63 %)		 n/a 41.82
(100.00 %)		 723
(0.00 %)		 315
(100.00 %)		 3,657,357
(14.24 %)		 1,158,716
(2.84 %)		 22,924,986
(64.53 %)		 46,774
(0.90 %)
110 black flying fox
GCF_000325575.1		 46,991
(3.15 %)		 18,089
(2.00 %)		 20,668
(1.75 %)		 n/a 39.74
(97.93 %)		 104,566
(2.08 %)		 170,164
(97.92 %)		 2,975,186
(34.05 %)		 481,859
(1.45 %)		 12,582,349
(26.52 %)		 62,483
(3.88 %)
111 black rat
GCF_011064425.1		 39,601
(2.37 %)		 20,793
(1.98 %)		 17,944
(1.37 %)		 n/a 42.14
(99.98 %)		 6,158
(0.02 %)		 2,173
(100.00 %)		 4,715,157
(41.57 %)		 1,432,294
(3.45 %)		 13,275,550
(32.36 %)		 18,055
(0.48 %)
112 black rhinoceros (alternate hap 2021)
GCA_020826835.1		 n/a 19,000
(1.37 %)		 22,547
(1.26 %)		 n/a 41.56
(99.97 %)		 178
(0.03 %)		 1,199
(100.00 %)		 4,340,245
(37.22 %)		 564,468
(8.07 %)		 14,384,523
(40.40 %)		 44,971
(1.16 %)
113 black rhinoceros (BS38 2019 Broad)
GCA_004027315.1		 n/a 21,713
(1.32 %)		 32,731
(1.18 %)		 n/a 41.22
(99.85 %)		 7,256
(0.02 %)		 2,029,914
(99.98 %)		 4,618,655
(36.76 %)		 618,834
(2.21 %)		 16,248,532
(40.32 %)		 44,113
(0.97 %)
114 black rhinoceros (primary hap 2021 refseq)
GCF_020826845.1		 56,268
(2.28 %)		 18,774
(1.38 %)		 22,348
(1.26 %)		 n/a 41.59
(99.95 %)		 215
(0.05 %)		 1,076
(100.00 %)		 4,200,390
(36.22 %)		 548,030
(8.34 %)		 14,347,693
(40.14 %)		 43,525
(1.14 %)
115 black-footed cat
GCA_004023925.1		 n/a 22,895
(1.14 %)		 51,789
(1.13 %)		 n/a 41.92
(99.90 %)		 13,476
(0.06 %)		 603,600
(99.94 %)		 5,261,265
(44.11 %)		 943,514
(1.77 %)		 13,681,435
(34.77 %)		 86,892
(2.23 %)
116 black-footed ferret (SB6536 2022)
GCF_022355385.1		 56,415
(2.78 %)		 18,681
(1.55 %)		 20,685
(1.40 %)		 n/a 41.55
(96.71 %)		 33,042
(3.30 %)		 20,575
(100.00 %)		 4,087,717
(30.94 %)		 695,805
(1.18 %)		 13,880,116
(32.08 %)		 54,060
(2.11 %)
117 black-lipped pika
GCF_017591425.1		 46,297
(2.64 %)		 18,529
(1.63 %)		 23,458
(1.83 %)		 n/a 43.71
(100.00 %)		 54
(0.00 %)		 2,214
(100.00 %)		 1,843,705
(12.62 %)		 471,798
(2.76 %)		 11,394,992
(31.27 %)		 63,124
(1.85 %)
118 Blainville's beaked whale (alternate hap 2022)
GCA_025094165.1		 n/a 17,838
(1.54 %)		 21,389
(1.35 %)		 n/a 41.71
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 5,198
(100.00 %)		 3,542,727
(35.35 %)		 650,369
(8.86 %)		 10,971,320
(41.15 %)		 62,389
(1.68 %)
119 Blainville's beaked whale (primary hap 2022 refseq)
GCF_025265405.1		 47,553
(2.07 %)		 19,041
(1.52 %)		 20,766
(1.27 %)		 n/a 41.70
(99.97 %)		 97
(0.03 %)		 74
(100.00 %)		 3,964,038
(35.29 %)		 765,957
(8.74 %)		 12,128,229
(41.78 %)		 70,851
(1.80 %)
120 blue whale (alternate hap JJ_BM4_2016_0621 2019)
GCA_008658375.1		 n/a 17,285
(1.80 %)		 21,295
(1.43 %)		 n/a 41.22
(100.00 %)		 n/a 12,574
(100.00 %)		 3,196,354
(43.47 %)		 467,194
(1.26 %)		 10,176,588
(33.66 %)		 56,916
(1.85 %)
121 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 primary hap 2020)
GCA_009873245.3		 n/a 19,151
(1.81 %)		 20,574
(1.41 %)		 n/a 40.88
(98.91 %)		 886
(1.09 %)		 106
(100.00 %)		 3,986,871
(44.21 %)		 579,629
(1.22 %)		 12,858,081
(34.60 %)		 67,032
(1.73 %)
122 Blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 alternate hap 2020)
GCA_008658375.2		 n/a 16,997
(1.82 %)		 20,609
(1.44 %)		 n/a 41.20
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 10,999
(100.00 %)		 3,126,800
(43.49 %)		 454,452
(1.23 %)		 9,916,868
(33.63 %)		 55,436
(1.85 %)
123 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v3 primary hap 2020)
GCF_009873245.2		 58,737
(2.71 %)		 19,162
(1.80 %)		 20,576
(1.41 %)		 36,291
(1.99 %)		 40.88
(98.91 %)		 886
(1.09 %)		 106
(100.00 %)		 3,986,870
(44.21 %)		 579,629
(1.22 %)		 12,858,384
(34.60 %)		 67,032
(1.73 %)
124 bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 alternate hap 2022)
GCA_022079275.1		 n/a 24,877
(1.23 %)		 48,382
(1.39 %)		 n/a 42.05
(99.98 %)		 4,716
(0.01 %)		 72,827
(99.99 %)		 6,403,412
(33.31 %)		 1,269,531
(1.94 %)		 17,771,689
(33.82 %)		 100,915
(3.00 %)
125 bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 primary hap 2022)
GCF_022079265.1		 45,417
(2.39 %)		 18,576
(1.65 %)		 20,510
(1.41 %)		 n/a 41.80
(100.00 %)		 24
(0.00 %)		 75
(100.00 %)		 4,970,082
(43.28 %)		 894,002
(1.80 %)		 13,648,384
(34.21 %)		 69,211
(2.68 %)
126 boreal woodland reindeer (boreal CA-31 2023)
GCA_019903745.2		 n/a 20,135
(1.60 %)		 22,598
(1.47 %)		 n/a 41.46
(96.98 %)		 34,682
(3.03 %)		 12,266
(100.00 %)		 3,134,107
(24.41 %)		 394,920
(0.92 %)		 13,154,929
(36.43 %)		 48,826
(1.07 %)
127 Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 alternate hap 2022)
GCA_024803775.1		 n/a 18,647
(0.96 %)		 23,998
(1.13 %)		 n/a 41.67
(100.00 %)		 124
(0.00 %)		 3,340
(100.00 %)		 3,775,862
(22.40 %)		 1,257,803
(21.71 %)		 9,347,543
(61.85 %)		 33,757
(1.35 %)
128 Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 primary hap 2022)
GCA_024803745.1		 n/a 17,791
(1.12 %)		 22,667
(1.29 %)		 n/a 41.66
(100.00 %)		 106
(0.00 %)		 2,898
(100.00 %)		 6,293,452
(41.30 %)		 1,076,688
(17.94 %)		 8,553,272
(57.13 %)		 31,102
(1.31 %)
129 Botta's pocket gopher (hap1 2023)
GCA_031878675.1		 n/a 18,247
(1.61 %)		 22,673
(1.83 %)		 n/a 41.12
(99.99 %)		 775
(0.01 %)		 835
(100.00 %)		 2,918,285
(18.64 %)		 868,090
(5.77 %)		 9,427,604
(40.78 %)		 27,049
(1.25 %)
130 Botta's pocket gopher (hap2 2023)
GCA_031878665.1		 n/a 17,612
(1.68 %)		 22,099
(1.91 %)		 n/a 41.23
(99.99 %)		 541
(0.01 %)		 365
(100.00 %)		 2,748,918
(17.16 %)		 827,542
(4.51 %)		 8,832,809
(39.20 %)		 26,416
(1.35 %)
131 boutu (hap1 2024)
GCA_036417435.1		 n/a 18,667
(1.46 %)		 20,817
(1.26 %)		 n/a 42.07
(100.00 %)		 284
(0.00 %)		 903
(100.00 %)		 4,004,895
(35.23 %)		 925,158
(12.15 %)		 11,999,784
(42.65 %)		 63,428
(1.55 %)
132 boutu (hap2 2024)
GCA_036417475.1		 n/a 17,954
(1.51 %)		 19,994
(1.30 %)		 n/a 42.02
(100.00 %)		 240
(0.00 %)		 800
(100.00 %)		 3,723,164
(34.96 %)		 809,880
(11.02 %)		 11,359,211
(41.42 %)		 60,067
(1.55 %)
133 Brahman cow (Angus x Brahman F1 Brahman haplotype 2018)
GCF_003369695.1		 63,234
(2.88 %)		 19,601
(1.57 %)		 21,699
(1.34 %)		 n/a 41.83
(99.94 %)		 302
(0.06 %)		 1,250
(100.00 %)		 5,524,454
(47.57 %)		 459,928
(1.40 %)		 13,208,799
(41.21 %)		 41,359
(1.10 %)
134 Brandt's bat
GCF_000412655.1		 46,912
(2.84 %)		 19,267
(1.75 %)		 18,495
(1.62 %)		 n/a 42.59
(94.06 %)		 155,664
(5.95 %)		 325,414
(94.05 %)		 2,897,662
(25.08 %)		 634,208
(3.20 %)		 11,323,618
(31.06 %)		 66,749
(1.59 %)
135 Brazilian free-tailed bat (alternate hap 2023)
GCA_030848815.1		 n/a 18,921
(1.72 %)		 22,946
(1.65 %)		 n/a 42.50
(100.00 %)		 n/a 3,728
(100.00 %)		 4,021,020
(40.28 %)		 637,136
(3.60 %)		 11,382,826
(36.28 %)		 70,547
(2.64 %)
136 Brazilian free-tailed bat (primary hap 2023)
GCA_030848825.1		 n/a 19,039
(1.66 %)		 21,660
(1.59 %)		 n/a 42.29
(100.00 %)		 20
(0.00 %)		 148
(100.00 %)		 3,805,818
(31.80 %)		 640,446
(2.50 %)		 11,793,353
(36.15 %)		 68,896
(2.40 %)
137 Brazilian guinea pig
GCA_000688575.1		 n/a 16,531
(1.49 %)		 11,177
(1.44 %)		 n/a 39.81
(64.76 %)		 2,565,595
(35.61 %)		 3,131
(100.00 %)		 2,529,479
(25.87 %)		 342,907
(0.66 %)		 10,719,517
(21.05 %)		 19,508
(0.31 %)
138 Brazilian tapir
GCA_004025025.1		 n/a 21,581
(1.61 %)		 30,818
(1.32 %)		 n/a 41.12
(99.93 %)		 2,273
(0.01 %)		 805,779
(99.99 %)		 3,877,938
(38.36 %)		 344,032
(0.79 %)		 15,601,710
(32.81 %)		 43,382
(1.17 %)
139 brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v2 2018)
GCF_003584765.2		 50,229
(2.92 %)		 18,811
(1.77 %)		 21,073
(1.52 %)		 n/a 41.84
(99.31 %)		 17,380
(0.70 %)		 21,813
(99.30 %)		 4,201,043
(40.86 %)		 567,586
(1.23 %)		 13,807,211
(30.86 %)		 62,125
(1.80 %)
140 brown bear (v2.0 North America Adak 2023)
GCF_023065955.2		 66,371
(4.20 %)		 18,615
(1.68 %)		 21,434
(1.53 %)		 n/a 42.29
(100.00 %)		 250
(0.00 %)		 362
(100.00 %)		 4,030,019
(33.22 %)		 630,008
(4.17 %)		 13,240,060
(32.92 %)		 64,814
(2.05 %)
141 brown big-eared bat (alternate hap 2023)
GCA_963455325.1		 n/a 18,932
(1.77 %)		 23,324
(1.64 %)		 n/a 43.04
(100.00 %)		 n/a 5,570
(100.00 %)		 4,970,484
(48.00 %)		 928,854
(4.06 %)		 10,332,383
(39.35 %)		 59,133
(2.45 %)
142 brown big-eared bat (primary hap 2023)
GCA_963455305.1		 n/a 19,138
(1.72 %)		 20,370
(1.54 %)		 n/a 43.08
(99.99 %)		 1,237
(0.01 %)		 65
(100.00 %)		 3,201,470
(26.24 %)		 957,903
(4.27 %)		 10,687,995
(39.65 %)		 60,671
(2.39 %)
143 brown big-eared bat (primary hap 2023)
GCF_963455305.1		 51,465
(2.81 %)		 18,957
(1.79 %)		 20,368
(1.54 %)		 n/a 43.08
(99.99 %)		 1,237
(0.01 %)		 64
(100.00 %)		 5,119,261
(48.27 %)		 957,900
(4.27 %)		 10,687,449
(39.65 %)		 60,670
(2.39 %)
144 brown-throated sloth
GCA_004027775.1		 n/a 17,043
(1.21 %)		 37,090
(1.36 %)		 n/a 42.76
(99.76 %)		 462
(0.00 %)		 1,772,267
(100.00 %)		 2,487,215
(36.18 %)		 316,812
(1.60 %)		 7,948,666
(37.96 %)		 62,325
(2.36 %)
145 bush duiker (CMD-5126 2019)
GCA_006408735.1		 n/a 21,234
(1.49 %)		 24,405
(1.37 %)		 n/a 42.55
(81.82 %)		 787,889
(18.24 %)		 810,213
(81.76 %)		 5,743,783
(45.60 %)		 588,471
(5.37 %)		 13,114,146
(31.74 %)		 52,826
(1.05 %)
146 cactus mouse (2023)
GCF_949786415.1		 47,537
(2.02 %)		 18,894
(1.46 %)		 20,159
(1.22 %)		 n/a 42.40
(99.98 %)		 2,603
(0.02 %)		 4,297
(100.00 %)		 7,181,232
(52.75 %)		 1,247,378
(18.35 %)		 13,329,318
(43.03 %)		 19,540
(0.49 %)
147 California mouse (IS 2022)
GCF_007827085.1		 62,273
(3.80 %)		 18,959
(1.75 %)		 19,378
(1.41 %)		 n/a 42.21
(100.00 %)		 547
(0.00 %)		 237
(100.00 %)		 5,970,582
(45.08 %)		 1,165,743
(3.67 %)		 13,734,349
(33.67 %)		 19,529
(0.58 %)
148 California sea lion (alternate hap 2019)
GCA_009762295.1		 n/a 18,348
(1.81 %)		 18,692
(1.47 %)		 n/a 41.58
(100.00 %)		 n/a 3,093
(100.00 %)		 3,722,619
(42.89 %)		 488,086
(1.26 %)		 10,893,132
(33.14 %)		 44,449
(1.57 %)
149 California sea lion (LMU 2018 refseq)
GCF_900631625.1		 69,240
(2.99 %)		 20,741
(1.78 %)		 20,298
(1.40 %)		 n/a 41.38
(99.81 %)		 47,716
(0.20 %)		 10,423
(100.00 %)		 4,530,259
(43.28 %)		 573,086
(1.12 %)		 13,442,336
(33.58 %)		 50,583
(1.46 %)
150 California sea lion (mZalCal1 alternate hap 2020)
GCA_009762295.2		 n/a 18,319
(1.81 %)		 18,772
(1.48 %)		 n/a 41.58
(100.00 %)		 n/a 3,096
(100.00 %)		 3,724,021
(42.91 %)		 488,356
(1.26 %)		 10,891,276
(33.15 %)		 44,467
(1.57 %)
151 California sea lion (primary hap 2020)
GCA_009762305.2		 n/a 20,939
(1.78 %)		 20,184
(1.40 %)		 n/a 41.40
(99.23 %)		 185
(0.77 %)		 47
(100.00 %)		 4,530,531
(43.69 %)		 590,246
(1.24 %)		 13,263,573
(33.76 %)		 51,899
(1.50 %)
152 California sea lion (v2 primary hap 2020)
GCF_009762305.2		 70,801
(3.05 %)		 20,915
(1.77 %)		 20,179
(1.40 %)		 44,926
(2.10 %)		 41.40
(99.23 %)		 185
(0.77 %)		 47
(100.00 %)		 4,525,652
(43.65 %)		 590,246
(1.24 %)		 13,263,648
(33.76 %)		 51,899
(1.50 %)
153 California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 alternate hap 2023)
GCA_028537755.1		 n/a 19,409
(1.86 %)		 20,578
(1.69 %)		 n/a 42.43
(100.00 %)		 43
(0.00 %)		 310
(100.00 %)		 3,161,054
(22.60 %)		 891,453
(5.62 %)		 11,087,206
(33.12 %)		 19,104
(0.65 %)
154 California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 primary hap 2023)
GCA_028537955.1		 n/a 19,681
(1.86 %)		 21,257
(1.62 %)		 n/a 42.24
(100.00 %)		 51
(0.00 %)		 350
(100.00 %)		 4,957,057
(42.33 %)		 943,226
(5.63 %)		 11,695,871
(33.83 %)		 20,062
(0.64 %)
155 Canada lynx (alternate hap LIC74 2019)
GCA_007474575.1		 n/a 12,029
(1.42 %)		 15,171
(1.16 %)		 n/a 41.46
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 15,036
(100.00 %)		 2,937,491
(43.50 %)		 544,410
(1.76 %)		 7,641,565
(32.72 %)		 39,082
(2.44 %)
156 Canada lynx (LIC74 primary hap 2020)
GCA_007474595.2		 n/a 18,286
(1.66 %)		 19,266
(1.35 %)		 n/a 41.70
(99.88 %)		 842
(0.12 %)		 55
(100.00 %)		 5,014,416
(43.75 %)		 904,528
(1.75 %)		 13,467,329
(34.19 %)		 66,805
(2.53 %)
157 Canada lynx (LIC74 v2 alternate hap 2020)
GCA_007474575.2		 n/a 12,041
(1.42 %)		 15,226
(1.16 %)		 n/a 41.46
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 15,046
(100.00 %)		 2,939,291
(43.50 %)		 544,849
(1.76 %)		 7,650,345
(32.74 %)		 39,099
(2.44 %)
158 Canada lynx (LIC74 v2 primary hap 2020)
GCF_007474595.2		 50,142
(2.69 %)		 18,273
(1.65 %)		 19,264
(1.35 %)		 n/a 41.70
(99.88 %)		 842
(0.12 %)		 54
(100.00 %)		 5,011,165
(43.72 %)		 904,525
(1.75 %)		 13,467,551
(34.19 %)		 66,799
(2.48 %)
159 Cantor's roundleaf bat
GCA_004027415.1		 n/a 23,788
(1.42 %)		 45,328
(1.68 %)		 38,254
(1.57 %)		 41.36
(99.91 %)		 6,366
(0.03 %)		 846,566
(99.97 %)		 3,997,370
(31.48 %)		 775,742
(1.42 %)		 12,770,948
(33.45 %)		 41,527
(1.41 %)
160 Cape elephant shrew
GCF_000299155.1		 25,406
(1.08 %)		 23,258
(1.07 %)		 24,266
(1.16 %)		 n/a 40.30
(86.29 %)		 279,394
(13.74 %)		 288,162
(86.26 %)		 3,765,232
(16.90 %)		 604,351
(0.89 %)		 20,072,078
(42.36 %)		 25,977
(0.42 %)
161 Cape golden mole (2012 Broad)
GCF_000296735.1		 25,323
(1.07 %)		 20,961
(1.07 %)		 21,723
(1.04 %)		 n/a 40.01
(79.93 %)		 370,844
(20.11 %)		 391,344
(79.89 %)		 4,924,640
(21.03 %)		 500,830
(1.95 %)		 18,946,663
(41.18 %)		 21,186
(0.33 %)
162 Cape rock hyrax (Dallas Zoo Isis #01D731 2014)
GCA_000152225.2		 n/a 18,455
(1.10 %)		 22,103
(1.12 %)		 n/a 41.00
(88.89 %)		 259,879
(11.14 %)		 325,568
(88.86 %)		 6,210,235
(51.92 %)		 381,915
(1.06 %)		 20,080,212
(36.28 %)		 29,690
(0.50 %)
163 Cape rock hyrax (US060 2019 Broad)
GCA_004026925.1		 n/a 21,401
(0.85 %)		 45,353
(1.14 %)		 n/a 41.08
(99.93 %)		 4,203
(0.01 %)		 1,048,940
(99.99 %)		 7,222,494
(54.48 %)		 430,286
(0.85 %)		 21,775,991
(44.61 %)		 37,158
(0.70 %)
164 capybara
GCA_004027455.1		 n/a 20,152
(1.22 %)		 28,931
(1.29 %)		 n/a 39.76
(99.93 %)		 5,747
(0.02 %)		 661,089
(99.98 %)		 4,220,878
(29.16 %)		 777,357
(2.04 %)		 15,214,944
(35.16 %)		 34,558
(0.85 %)
165 carabao (swamp buffalo K-KA32 2023)
GCF_029407905.1		 77,279
(2.89 %)		 19,433
(1.40 %)		 21,166
(1.23 %)		 n/a 42.77
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 115
(100.00 %)		 3,479,445
(21.92 %)		 547,054
(6.39 %)		 12,840,677
(45.22 %)		 99,752
(3.73 %)
166 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v2.0 2023 USDA)
GCF_002263795.3		 77,808
(4.11 %)		 19,428
(1.48 %)		 22,236
(1.33 %)		 n/a 42.01
(100.00 %)		 386
(0.00 %)		 1,958
(100.00 %)		 3,449,588
(22.63 %)		 596,092
(3.13 %)		 12,785,607
(42.11 %)		 46,864
(1.37 %)
167 cattle (Hereford UMD_3.1.1 2014)
GCF_000003055.6		 57,977
(2.74 %)		 19,583
(1.56 %)		 20,581
(1.31 %)		 n/a 41.82
(99.23 %)		 74,464
(0.78 %)		 75,598
(99.22 %)		 5,607,556
(49.02 %)		 440,521
(1.25 %)		 13,167,657
(40.78 %)		 42,869
(1.24 %)
168 Chacoan peccary (BS20 v2 2019 Broad)
GCA_004024745.2		 n/a 18,603
(1.52 %)		 22,330
(1.36 %)		 n/a 42.35
(98.12 %)		 57,013
(1.80 %)		 1,240,743
(98.20 %)		 5,255,211
(43.27 %)		 2,502,373
(4.37 %)		 12,968,788
(40.96 %)		 172,178
(3.66 %)
169 cheetah (Ajub_Pintada_27869175 2022)
GCF_027475565.1		 80,997
(4.53 %)		 18,420
(1.70 %)		 19,561
(1.40 %)		 n/a 41.59
(100.00 %)		 22
(0.00 %)		 195
(100.00 %)		 4,611,842
(35.10 %)		 837,685
(1.68 %)		 13,649,125
(33.06 %)		 60,367
(2.22 %)
170 cheetah (Rico 2018)
GCF_003709585.1		 72,154
(3.33 %)		 18,472
(1.70 %)		 20,443
(1.42 %)		 n/a 41.55
(99.55 %)		 24,173
(0.45 %)		 3,220
(100.00 %)		 4,853,945
(42.85 %)		 831,106
(1.53 %)		 13,663,571
(32.84 %)		 60,744
(2.17 %)
171 Chinese forest musk deer (Sichuan 2022)
GCF_022376915.1		 51,625
(2.80 %)		 19,565
(1.43 %)		 22,280
(1.29 %)		 n/a 42.30
(99.97 %)		 1,781
(0.03 %)		 2,446
(100.00 %)		 3,257,347
(21.65 %)		 399,120
(3.81 %)		 12,906,274
(43.79 %)		 46,689
(1.12 %)
172 Chinese hamster (17A/GY CHO 2020)
GCF_003668045.3		 55,440
(2.79 %)		 20,030
(1.84 %)		 18,721
(1.41 %)		 67,900
(3.41 %)		 41.51
(99.90 %)		 4,164
(0.10 %)		 647
(100.00 %)		 8,121,057
(33.74 %)		 1,095,058
(2.91 %)		 12,923,274
(32.25 %)		 19,341
(0.58 %)
173 Chinese hamster (CHO v1 2011 BGI)
GCF_000223135.1		 46,006
(2.59 %)		 20,602
(1.78 %)		 17,467
(1.35 %)		 n/a 41.37
(96.61 %)		 156,635
(3.40 %)		 265,787
(96.60 %)		 4,541,936
(33.03 %)		 1,072,129
(2.66 %)		 13,150,189
(30.04 %)		 12,522
(0.25 %)
174 Chinese hamster (CHO v2 2017 Eagle Genomics Ltd)
GCA_900186095.1		 n/a 19,874
(1.85 %)		 19,298
(1.44 %)		 n/a 41.45
(98.56 %)		 63,334
(1.45 %)		 71,598
(98.55 %)		 4,521,726
(33.66 %)		 1,060,619
(2.55 %)		 12,867,288
(31.26 %)		 17,960
(0.54 %)
175 Chinese hamster (CHO-K1 CHOZN v2.4 2022)
GCA_026545065.1		 n/a 20,293
(1.81 %)		 18,881
(1.42 %)		 n/a 41.62
(71.16 %)		 924,541
(28.93 %)		 1,236,122
(71.07 %)		 4,330,728
(30.92 %)		 987,319
(3.70 %)		 13,374,062
(21.92 %)		 18,838
(0.40 %)
176 Chinese pangolin (2020 Yunnan U)
GCF_014570555.1		 69,694
(3.21 %)		 18,206
(1.70 %)		 20,508
(1.48 %)		 n/a 40.79
(95.54 %)		 34,903
(4.47 %)		 4,694
(100.00 %)		 2,927,176
(35.60 %)		 269,964
(0.67 %)		 12,610,535
(29.10 %)		 35,278
(1.05 %)
177 Chinese pangolin (hap1 2023)
GCA_030020395.1		 n/a 18,675
(1.41 %)		 21,838
(1.29 %)		 n/a 41.07
(99.77 %)		 383
(0.23 %)		 662
(100.00 %)		 3,516,380
(43.45 %)		 618,194
(3.68 %)		 12,009,657
(39.02 %)		 47,708
(1.22 %)
178 Chinese pangolin (hap1 2023)
GCF_030020395.1		 71,445
(2.98 %)		 18,379
(1.34 %)		 21,837
(1.29 %)		 n/a 41.07
(99.77 %)		 383
(0.23 %)		 661
(100.00 %)		 3,318,871
(34.65 %)		 618,193
(3.68 %)		 12,009,669
(39.02 %)		 47,708
(1.22 %)
179 Chinese pangolin (hap2 mManPen7 2023)
GCA_030020945.1		 n/a 18,538
(1.34 %)		 21,724
(1.27 %)		 n/a 41.09
(99.48 %)		 190
(0.52 %)		 700
(100.00 %)		 3,362,899
(34.48 %)		 678,384
(4.11 %)		 12,024,241
(39.52 %)		 48,960
(1.19 %)
180 Chinese pangolin (MPE899 2014 WashU)
GCA_000738955.1		 n/a 18,749
(1.63 %)		 22,506
(1.40 %)		 n/a 40.93
(90.69 %)		 257,424
(9.33 %)		 230,927
(90.67 %)		 2,691,116
(34.48 %)		 316,518
(1.96 %)		 11,538,086
(25.40 %)		 30,693
(0.58 %)
181 Chinese rufous horseshoe bat
GCA_001888835.1		 n/a 26,871
(2.34 %)		 25,467
(1.89 %)		 n/a 40.52
(97.22 %)		 212,601
(2.80 %)		 63,439
(100.00 %)		 3,219,611
(33.86 %)		 495,126
(1.20 %)		 12,476,551
(27.16 %)		 32,993
(0.98 %)
182 Chinese rufous horseshoe bat (RSC01 2024)
GCA_036562045.1		 n/a 17,893
(1.95 %)		 19,249
(1.60 %)		 n/a 40.47
(100.00 %)		 286
(0.00 %)		 454
(100.00 %)		 3,055,304
(33.11 %)		 531,106
(1.34 %)		 11,858,144
(29.52 %)		 30,884
(1.08 %)
183 Chinese rufous horseshoe bat (RSC01 2024)
GCF_036562045.2		 67,162
(3.87 %)		 17,890
(1.94 %)		 19,248
(1.60 %)		 n/a 40.47
(100.00 %)		 286
(0.00 %)		 454
(100.00 %)		 3,325,750
(39.02 %)		 531,106
(1.34 %)		 11,858,028
(29.52 %)		 30,884
(1.08 %)
184 Chinese tree shrew (2013 BGI)
GCF_000334495.1		 47,005
(2.07 %)		 21,375
(1.39 %)		 19,231
(1.28 %)		 n/a 41.73
(95.10 %)		 191,695
(4.92 %)		 242,445
(95.08 %)		 5,060,321
(23.05 %)		 1,046,388
(4.15 %)		 14,978,259
(38.04 %)		 88,806
(1.44 %)
185 Chinese tree shrew (KIZ-2021 2023)
GCA_033439345.1		 n/a 22,218
(1.55 %)		 22,364
(1.36 %)		 n/a 41.78
(99.99 %)		 1,697
(0.01 %)		 1,645
(100.00 %)		 6,126,341
(42.08 %)		 1,035,957
(2.47 %)		 14,328,193
(41.14 %)		 90,914
(1.82 %)
186 Chiriquinan serotine (hap1 2025)
GCA_054100705.1		 n/a 17,992
(1.72 %)		 21,541
(1.60 %)		 n/a 43.57
(100.00 %)		 319
(0.00 %)		 133
(100.00 %)		 5,339,985
(49.93 %)		 956,399
(6.53 %)		 10,659,420
(39.61 %)		 80,046
(3.68 %)
187 chiru
GCA_000400835.1		 n/a 20,320
(1.60 %)		 42,654
(2.51 %)		 n/a 42.01
(93.04 %)		 283,069
(7.00 %)		 298,127
(93.00 %)		 5,342,241
(43.54 %)		 425,329
(1.25 %)		 13,714,420
(34.66 %)		 43,135
(1.89 %)
188 clouded leopard (mNeoNeb1 alternate hap 2023)
GCA_028018655.1		 n/a 16,430
(1.52 %)		 21,057
(1.44 %)		 n/a 41.79
(100.00 %)		 n/a 10,377
(100.00 %)		 3,845,437
(33.39 %)		 794,587
(2.14 %)		 10,765,695
(33.40 %)		 56,375
(2.45 %)
189 clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028018385.1		 81,219
(3.62 %)		 18,300
(1.65 %)		 20,361
(1.39 %)		 n/a 41.79
(99.94 %)		 181
(0.06 %)		 33
(100.00 %)		 4,224,269
(34.84 %)		 992,668
(2.08 %)		 13,618,866
(34.42 %)		 67,830
(2.45 %)
190 common bottlenose dolphin (maternal 2020)
GCA_011762535.1		 n/a 18,837
(1.77 %)		 20,857
(1.43 %)		 n/a 41.43
(99.73 %)		 649
(0.27 %)		 985
(100.00 %)		 4,073,893
(46.15 %)		 630,039
(2.15 %)		 12,628,219
(35.41 %)		 65,379
(1.89 %)
191 common bottlenose dolphin (maternal hap 2024)
GCA_011762595.2		 n/a 18,777
(1.77 %)		 20,526
(1.42 %)		 n/a 41.44
(99.74 %)		 674
(0.26 %)		 362
(100.00 %)		 4,064,487
(44.85 %)		 628,982
(2.12 %)		 12,490,633
(35.29 %)		 65,551
(1.90 %)
192 common bottlenose dolphin (maternal Y refseq 2020)
GCF_011762595.1		 67,220
(3.31 %)		 18,766
(1.77 %)		 20,528
(1.42 %)		 35,852
(1.58 %)		 41.44
(99.74 %)		 674
(0.26 %)		 362
(100.00 %)		 4,069,115
(46.17 %)		 628,982
(2.12 %)		 12,490,891
(35.29 %)		 65,551
(1.90 %)
193 common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 refseq)
GCF_001922835.1		 45,975
(2.99 %)		 17,255
(1.69 %)		 17,058
(1.34 %)		 n/a 40.85
(99.45 %)		 114,003
(0.57 %)		 2,648
(100.00 %)		 3,845,938
(43.89 %)		 514,631
(1.06 %)		 12,317,098
(32.18 %)		 48,030
(1.35 %)
194 common bottlenose dolphin (mTurTru1 2024)
GCF_011762595.2		 80,385
(4.33 %)		 18,770
(1.77 %)		 20,525
(1.42 %)		 n/a 41.44
(99.74 %)		 674
(0.26 %)		 361
(100.00 %)		 3,981,744
(44.78 %)		 628,982
(2.12 %)		 12,490,558
(35.29 %)		 65,551
(1.90 %)
195 common bottlenose dolphin (paternal 2020)
GCA_011762515.1		 n/a 18,537
(1.77 %)		 20,619
(1.44 %)		 n/a 41.42
(98.08 %)		 868
(1.92 %)		 1,166
(100.00 %)		 3,997,801
(45.93 %)		 609,838
(1.85 %)		 12,400,272
(34.53 %)		 64,630
(1.84 %)
196 common brushtail (alternate hap 2020)
GCA_011100645.1		 n/a 14,863
(0.75 %)		 15,426
(0.89 %)		 n/a 39.41
(100.00 %)		 313
(0.00 %)		 12,446
(100.00 %)		 5,846,769
(38.56 %)		 987,917
(1.99 %)		 16,764,356
(40.14 %)		 13,303
(0.35 %)
197 common brushtail (refseq 2020)
GCF_011100635.1		 37,661
(1.80 %)		 18,653
(0.80 %)		 15,375
(0.86 %)		 n/a 39.48
(99.44 %)		 1,796
(0.56 %)		 212
(100.00 %)		 7,598,116
(38.90 %)		 1,259,434
(1.97 %)		 22,071,306
(40.56 %)		 17,762
(0.38 %)
198 common dormouse
GCF_963383645.1		 31,384
(1.35 %)		 18,619
(1.42 %)		 22,414
(1.38 %)		 n/a 41.73
(99.99 %)		 1,805
(0.01 %)		 2,017
(99.99 %)		 6,589,540
(42.09 %)		 1,593,656
(4.46 %)		 12,228,695
(43.98 %)		 71,058
(1.88 %)
199 common pipistrelle (2020)
GCA_903992545.1		 n/a 17,216
(1.82 %)		 19,202
(1.79 %)		 n/a 42.55
(99.97 %)		 1,546
(0.03 %)		 323
(100.00 %)		 2,953,532
(23.94 %)		 805,142
(2.83 %)		 9,964,846
(34.69 %)		 57,295
(2.83 %)
200 common pipistrelle (alternate hap 2020)
GCA_903992515.1		 n/a 15,974
(1.72 %)		 20,563
(1.66 %)		 n/a 42.41
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 10,459
(100.00 %)		 2,634,333
(23.76 %)		 703,674
(2.65 %)		 8,909,525
(33.95 %)		 50,430
(2.54 %)
201 common pipistrelle (Broad 2019)
GCA_004026625.1		 n/a 21,938
(1.35 %)		 53,915
(1.60 %)		 n/a 42.88
(99.88 %)		 10,870
(0.05 %)		 736,974
(99.95 %)		 3,499,501
(22.91 %)		 1,046,301
(2.96 %)		 11,759,516
(37.96 %)		 92,062
(3.23 %)
202 common pipistrelle (hap1.1 2025)
GCA_965203405.1		 n/a 18,233
(1.77 %)		 21,445
(1.80 %)		 n/a 42.93
(99.98 %)		 1,650
(0.02 %)		 575
(100.00 %)		 3,324,262
(26.83 %)		 869,167
(7.44 %)		 10,218,519
(37.91 %)		 76,006
(3.29 %)
203 common pipistrelle (hap1.2 2025)
GCA_965203405.2		 n/a 18,176
(1.76 %)		 21,285
(1.78 %)		 n/a 42.95
(100.00 %)		 370
(0.00 %)		 254
(100.00 %)		 3,357,975
(26.71 %)		 873,676
(8.26 %)		 10,088,614
(38.25 %)		 78,890
(3.25 %)
204 common pipistrelle (hap2.1 2025)
GCA_965204225.1		 n/a 18,115
(1.81 %)		 21,233
(1.83 %)		 n/a 42.89
(99.98 %)		 1,602
(0.02 %)		 1,971
(99.98 %)		 3,303,323
(27.28 %)		 852,756
(5.65 %)		 10,047,424
(36.41 %)		 69,105
(3.25 %)
205 common pipistrelle (hap2.2 2025)
GCA_965204225.2		 n/a 18,092
(1.83 %)		 21,286
(1.85 %)		 n/a 42.90
(100.00 %)		 358
(0.00 %)		 656
(100.00 %)		 3,325,603
(27.55 %)		 851,200
(4.82 %)		 10,152,156
(36.08 %)		 66,359
(3.22 %)
206 common thicket rat (MVZ Mamm 221001 2021)
GCA_019843835.1		 n/a 25,148
(1.36 %)		 49,594
(1.08 %)		 n/a 41.11
(99.52 %)		 63,300
(0.44 %)		 572,372
(99.56 %)		 3,806,717
(32.04 %)		 1,181,694
(2.86 %)		 12,272,340
(28.58 %)		 16,373
(0.48 %)
207 common vampire bat (v2 HL8 alternate hap 2022 genbank)
GCA_022682395.2		 n/a 17,485
(1.76 %)		 18,907
(1.66 %)		 n/a 42.87
(99.99 %)		 576
(0.01 %)		 429
(100.00 %)		 2,592,246
(28.20 %)		 352,985
(2.87 %)		 10,737,944
(31.11 %)		 61,125
(2.28 %)
208 common vampire bat (v2 HL8 primary hap 2022 refseq)
GCF_022682495.2		 58,786
(3.38 %)		 18,507
(1.82 %)		 19,451
(1.59 %)		 n/a 42.99
(99.99 %)		 615
(0.01 %)		 574
(100.00 %)		 2,960,602
(36.90 %)		 431,577
(3.90 %)		 11,286,753
(32.62 %)		 71,507
(2.50 %)
209 common vampire bat (v3 DRU21DN04 2018)
GCF_002940915.2		 51,044
(3.24 %)		 18,503
(1.88 %)		 18,071
(1.68 %)		 n/a 42.15
(97.78 %)		 54,246
(2.23 %)		 83,364
(97.77 %)		 2,799,509
(29.62 %)		 275,242
(1.03 %)		 11,796,826
(28.19 %)		 51,634
(1.37 %)
210 common warthog (WHEZ1 2021)
GCF_016906955.1		 55,156
(2.64 %)		 18,264
(1.56 %)		 19,251
(1.34 %)		 54,816
(2.83 %)		 41.95
(99.61 %)		 523
(0.39 %)		 194
(100.00 %)		 3,898,243
(30.33 %)		 588,742
(1.17 %)		 12,955,929
(36.44 %)		 75,592
(1.86 %)
211 common wombat
GCF_900497805.2		 46,365
(1.78 %)		 19,437
(0.86 %)		 18,947
(0.96 %)		 n/a 38.86
(99.68 %)		 67,461
(0.33 %)		 14,183
(100.00 %)		 8,645,969
(41.99 %)		 1,203,246
(1.61 %)		 23,878,215
(39.11 %)		 18,752
(0.37 %)
212 Corsac fox (zsh2022 2023)
GCA_030463245.1		 n/a 19,527
(1.61 %)		 18,923
(1.35 %)		 n/a 41.24
(100.00 %)		 107
(0.00 %)		 202
(100.00 %)		 4,435,406
(32.05 %)		 981,019
(1.98 %)		 13,673,245
(32.65 %)		 49,252
(2.20 %)
213 coyote (coyote_06102 2023)
GCA_034620425.1		 n/a 19,251
(1.60 %)		 19,585
(1.40 %)		 n/a 41.18
(100.00 %)		 93
(0.00 %)		 120
(100.00 %)		 4,493,000
(32.28 %)		 982,814
(2.01 %)		 13,803,318
(33.09 %)		 50,777
(2.23 %)
214 creeping vole
GCF_018167655.1		 54,941
(2.31 %)		 23,033
(1.55 %)		 25,427
(1.53 %)		 n/a 44.23
(100.00 %)		 n/a 2,147
(100.00 %)		 4,549,519
(25.66 %)		 1,153,429
(13.60 %)		 13,568,297
(40.65 %)		 23,141
(0.54 %)
215 crested porcupine
GCA_004026905.1		 n/a 21,005
(1.32 %)		 35,975
(1.39 %)		 n/a 41.51
(99.89 %)		 4,351
(0.02 %)		 1,140,949
(99.98 %)		 4,303,147
(30.69 %)		 600,488
(1.19 %)		 14,049,490
(33.80 %)		 57,196
(1.33 %)
216 crested rat (2021)
GCA_907164525.1		 n/a 18,829
(1.57 %)		 20,084
(1.23 %)		 n/a 40.89
(92.16 %)		 116,236
(7.85 %)		 153,441
(92.15 %)		 6,937,911
(48.56 %)		 1,051,397
(2.16 %)		 13,178,644
(37.15 %)		 22,912
(0.47 %)
217 Crete spiny mouse (2024)
GCA_964271855.1		 n/a 19,467
(1.76 %)		 18,734
(1.43 %)		 n/a 42.87
(100.00 %)		 184
(0.00 %)		 113
(100.00 %)		 4,718,848
(32.83 %)		 1,327,449
(6.80 %)		 12,893,458
(34.03 %)		 21,236
(0.61 %)
218 Crete spiny mouse (2025)
GCA_964271855.5		 n/a 19,050
(1.82 %)		 18,719
(1.43 %)		 n/a 42.87
(100.00 %)		 184
(0.00 %)		 112
(100.00 %)		 5,710,100
(41.99 %)		 1,327,449
(6.80 %)		 12,893,310
(34.03 %)		 21,236
(0.61 %)
219 Cuvier's beaked whale
GCA_004364475.1		 n/a 23,700
(0.90 %)		 51,715
(0.86 %)		 n/a 42.01
(99.76 %)		 3,229
(0.01 %)		 3,761,505
(99.99 %)		 6,544,424
(43.61 %)		 1,417,186
(3.11 %)		 16,127,873
(42.25 %)		 68,668
(1.15 %)
220 cyclops roundleaf bat (Cote d'Ivoire 20210929_DDa alternate hap 2024)
GCA_043880225.1		 n/a 18,335
(1.64 %)		 20,207
(1.46 %)		 n/a 41.56
(100.00 %)		 n/a 1,440
(100.00 %)		 4,675,929
(43.51 %)		 742,038
(2.58 %)		 11,746,853
(36.11 %)		 47,949
(1.04 %)
221 cyclops roundleaf bat (Cote d'Ivoire 20210929_DDa primary hap 2024)
GCA_043880285.1		 n/a 18,610
(1.67 %)		 19,098
(1.39 %)		 n/a 41.56
(99.99 %)		 334
(0.01 %)		 73
(100.00 %)		 4,077,286
(41.85 %)		 754,689
(2.64 %)		 11,873,386
(36.16 %)		 48,137
(1.04 %)
222 Damara mole-rat DMR 1.0 (2014 BGI)
GCF_000743615.1		 52,373
(2.57 %)		 17,983
(1.45 %)		 17,063
(1.43 %)		 n/a 40.34
(97.96 %)		 87,815
(2.05 %)		 162,545
(97.95 %)		 4,053,433
(30.86 %)		 545,281
(1.74 %)		 13,406,483
(30.65 %)		 37,008
(0.74 %)
223 Damara mole-rat DMR 1.0 HiC (2020 DNA Zoo)
GCF_012274545.1		 58,091
(2.74 %)		 17,780
(1.44 %)		 16,515
(1.42 %)		 n/a 40.34
(97.94 %)		 88,899
(2.07 %)		 73,970
(100.00 %)		 4,035,140
(30.95 %)		 544,772
(1.73 %)		 13,390,872
(30.61 %)		 37,008
(0.74 %)
224 dassie-rat
GCA_004026965.1		 n/a 20,479
(1.16 %)		 42,937
(1.41 %)		 n/a 41.86
(99.89 %)		 9,645
(0.04 %)		 920,324
(99.96 %)		 4,563,054
(28.83 %)		 660,623
(1.92 %)		 12,899,807
(34.48 %)		 46,569
(1.25 %)
225 Daubenton's bat (alternate hap 2023)
GCA_963242275.1		 n/a 18,895
(1.78 %)		 24,235
(1.81 %)		 n/a 43.39
(100.00 %)		 n/a 4,930
(100.00 %)		 2,813,870
(23.75 %)		 718,406
(5.18 %)		 9,977,320
(37.24 %)		 62,910
(2.66 %)
226 Daubenton's bat (hap1.2 2025)
GCA_963259705.2		 n/a 19,016
(1.77 %)		 22,392
(1.66 %)		 n/a 43.17
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 176
(100.00 %)		 5,102,002
(45.10 %)		 815,584
(6.94 %)		 10,416,086
(39.34 %)		 66,271
(2.56 %)
227 Daubenton's bat (hap2.2 2025)
GCA_963242275.2		 n/a 18,127
(1.87 %)		 21,346
(1.75 %)		 n/a 43.37
(100.00 %)		 136
(0.00 %)		 208
(100.00 %)		 4,712,850
(43.86 %)		 726,883
(5.33 %)		 9,942,977
(37.29 %)		 62,442
(2.66 %)
228 Daubenton's bat (primary hap 2023 refseq)
GCF_963259705.1		 64,558
(3.32 %)		 19,141
(1.72 %)		 22,133
(1.66 %)		 n/a 43.18
(99.99 %)		 1,099
(0.01 %)		 121
(100.00 %)		 3,040,232
(24.03 %)		 796,911
(6.38 %)		 10,478,180
(38.84 %)		 64,920
(2.51 %)
229 Daurian ground squirrel
GCA_002406435.1		 n/a 20,990
(1.31 %)		 17,575
(1.17 %)		 n/a 39.77
(96.15 %)		 141,850
(3.84 %)		 502,654
(96.16 %)		 5,783,538
(34.36 %)		 924,038
(3.73 %)		 17,533,301
(30.85 %)		 27,955
(0.39 %)
230 David's myotis bat
GCF_000327345.1		 37,645
(2.70 %)		 18,744
(1.78 %)		 17,565
(1.62 %)		 n/a 42.69
(91.23 %)		 223,511
(8.80 %)		 325,280
(91.20 %)		 2,680,166
(23.79 %)		 532,273
(1.90 %)		 11,016,028
(29.55 %)		 59,615
(1.59 %)
231 Davis's round-eared bat (hap1 2025)
GCA_051307075.1		 n/a 17,736
(1.53 %)		 21,703
(1.45 %)		 n/a 42.03
(100.00 %)		 153
(0.00 %)		 311
(100.00 %)		 4,450,174
(45.25 %)		 390,322
(7.86 %)		 12,108,244
(37.90 %)		 76,695
(4.57 %)
232 Davis's round-eared bat (hap2 2025)
GCA_051307065.1		 n/a 16,878
(1.65 %)		 20,512
(1.56 %)		 n/a 42.17
(100.00 %)		 113
(0.00 %)		 148
(100.00 %)		 3,720,522
(43.45 %)		 352,035
(4.96 %)		 11,326,247
(34.44 %)		 72,242
(4.65 %)
233 degu (3935 2012 refseq)
GCF_000260255.1		 48,165
(2.13 %)		 22,242
(1.41 %)		 22,101
(1.46 %)		 n/a 41.38
(84.36 %)		 252,772
(15.68 %)		 259,904
(84.32 %)		 4,901,673
(27.74 %)		 898,945
(1.50 %)		 14,282,003
(29.30 %)		 40,135
(0.82 %)
234 desert hamster (2022)
GCF_943737965.1		 37,291
(2.11 %)		 19,744
(1.74 %)		 20,215
(1.50 %)		 n/a 41.31
(100.00 %)		 n/a 2,079
(100.00 %)		 4,038,079
(31.01 %)		 1,132,871
(2.71 %)		 11,946,112
(32.62 %)		 17,053
(0.51 %)
235 Desmarest's hutia
GCA_004027915.1		 n/a 23,535
(0.78 %)		 50,796
(0.95 %)		 n/a 42.03
(99.83 %)		 3,492
(0.01 %)		 2,355,850
(99.99 %)		 5,790,506
(26.72 %)		 1,062,134
(1.71 %)		 16,977,224
(35.29 %)		 54,479
(1.01 %)
236 dingo (2020 Alpine COOINDA U.NSW)
GCF_012295265.1		 102,060
(4.04 %)		 19,777
(1.69 %)		 20,341
(1.41 %)		 n/a 41.29
(99.69 %)		 325
(0.31 %)		 477
(100.00 %)		 4,950,808
(42.83 %)		 1,033,921
(2.36 %)		 13,745,703
(33.32 %)		 51,835
(2.25 %)
237 dingo (Sandy 2020 James Cook U)
GCF_003254725.2		 104,332
(4.50 %)		 19,710
(1.72 %)		 19,857
(1.42 %)		 n/a 41.24
(100.00 %)		 69
(0.00 %)		 159
(100.00 %)		 4,547,906
(33.32 %)		 993,474
(2.19 %)		 13,701,060
(33.18 %)		 51,216
(2.28 %)
238 dog (Basenji MU ID 185726 2019)
GCA_004886185.2		 n/a 19,889
(1.67 %)		 20,501
(1.39 %)		 n/a 41.36
(99.99 %)		 1,388
(0.01 %)		 3,630
(99.99 %)		 4,950,227
(43.32 %)		 1,059,639
(2.97 %)		 13,694,849
(33.70 %)		 51,443
(2.16 %)
239 dog (Basenji UNSW-BAS-2019 2021)
GCA_013276365.2		 n/a 19,310
(1.60 %)		 19,947
(1.42 %)		 n/a 41.21
(100.00 %)		 149
(0.00 %)		 631
(100.00 %)		 4,452,916
(32.14 %)		 960,590
(2.23 %)		 13,685,353
(33.01 %)		 50,715
(2.22 %)
240 dog (Bernese Mountain Dog BD 2023)
GCA_031010765.1		 n/a 19,211
(1.60 %)		 20,327
(1.44 %)		 n/a 41.20
(100.00 %)		 641
(0.00 %)		 175
(100.00 %)		 4,471,016
(32.18 %)		 984,776
(2.03 %)		 13,719,474
(32.88 %)		 51,050
(2.25 %)
241 dog (Bernese Mountain Dog OD 2023)
GCA_031010635.1		 n/a 19,279
(1.60 %)		 20,348
(1.44 %)		 n/a 41.21
(100.00 %)		 1,015
(0.00 %)		 159
(100.00 %)		 4,491,081
(32.21 %)		 996,142
(2.01 %)		 13,761,195
(32.97 %)		 51,490
(2.25 %)
242 dog (boxer Tasha 2011)
GCF_000002285.3		 82,536
(3.63 %)		 19,772
(1.66 %)		 19,565
(1.39 %)		 n/a 41.31
(99.25 %)		 23,876
(0.76 %)		 27,106
(99.24 %)		 4,918,098
(43.29 %)		 991,835
(2.81 %)		 13,644,959
(33.60 %)		 53,269
(2.07 %)
243 dog (boxer Tasha 2020)
GCF_000002285.5		 93,761
(3.84 %)		 19,392
(1.71 %)		 19,572
(1.42 %)		 52,141
(3.27 %)		 41.26
(100.00 %)		 1,028
(0.00 %)		 147
(100.00 %)		 23,927,903
(42.42 %)		 972,851
(2.05 %)		 13,611,845
(33.11 %)		 50,679
(2.26 %)
244 dog (Cairn Terrier CA611 2023)
GCA_031010295.1		 n/a 19,255
(1.61 %)		 20,479
(1.45 %)		 n/a 41.19
(100.00 %)		 262
(0.00 %)		 141
(100.00 %)		 4,490,019
(32.25 %)		 989,383
(1.99 %)		 13,710,808
(32.97 %)		 50,883
(2.22 %)
245 dog (German shepard Mischka 2020)
GCF_011100685.1		 96,734
(3.71 %)		 20,135
(1.64 %)		 20,871
(1.38 %)		 56,772
(3.19 %)		 41.50
(100.00 %)		 585
(0.00 %)		 2,782
(100.00 %)		 20,264,827
(43.87 %)		 1,152,879
(3.22 %)		 13,784,690
(34.30 %)		 53,518
(2.23 %)
246 dog (German Shepherd Nala 2020)
GCA_008641055.3		 n/a 19,757
(1.69 %)		 20,201
(1.41 %)		 n/a 41.32
(99.74 %)		 458
(0.26 %)		 410
(100.00 %)		 4,974,233
(43.03 %)		 1,048,366
(2.46 %)		 13,881,889
(33.61 %)		 51,900
(2.21 %)
247 dog (Labrador retriever 2023)
GCA_031165255.1		 n/a 19,256
(1.61 %)		 20,247
(1.44 %)		 n/a 41.18
(100.00 %)		 516
(0.00 %)		 675
(100.00 %)		 4,456,220
(32.19 %)		 960,584
(1.96 %)		 13,688,006
(32.82 %)		 50,670
(2.21 %)
248 dog (labrador SID07034 2020)
GCF_014441545.1		 99,420
(3.87 %)		 19,870
(1.70 %)		 20,252
(1.41 %)		 54,322
(3.23 %)		 41.19
(99.47 %)		 575
(0.53 %)		 376
(100.00 %)		 4,981,985
(42.28 %)		 1,019,772
(1.97 %)		 13,959,750
(32.77 %)		 52,469
(2.25 %)
249 dog (poodle 2003)
GCA_000181415.1		 n/a 12,852
(0.53 %)		 24,666
(0.57 %)		 n/a 41.09
(99.86 %)		 n/a 1,089,636
(100.00 %)		 3,212,912
(39.08 %)		 549,098
(1.63 %)		 8,833,799
(29.80 %)		 41,068
(1.31 %)
250 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2017 WashU)
GCF_000181335.3		 72,076
(3.30 %)		 18,662
(1.64 %)		 20,897
(1.37 %)		 n/a 41.73
(98.20 %)		 436
(1.80 %)		 5,079
(98.20 %)		 5,086,462
(43.51 %)		 964,126
(2.68 %)		 13,947,871
(33.33 %)		 69,701
(2.41 %)
251 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021 WashU)
GCA_000181335.5		 n/a 18,378
(1.53 %)		 21,242
(1.40 %)		 n/a 41.73
(98.21 %)		 422
(1.79 %)		 5,010
(98.31 %)		 4,683,703
(33.33 %)		 964,129
(2.68 %)		 13,948,305
(33.33 %)		 69,725
(2.42 %)
252 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021)
GCA_000181335.6		 n/a 18,357
(1.55 %)		 20,085
(1.38 %)		 n/a 41.76
(98.18 %)		 422
(1.82 %)		 1,254
(98.28 %)		 4,661,997
(33.78 %)		 947,221
(2.58 %)		 13,867,949
(33.67 %)		 68,011
(2.41 %)
253 domestic cat (Fca126 2021 Texas A&M U)
GCF_018350175.1		 99,222
(4.40 %)		 18,456
(1.66 %)		 19,833
(1.39 %)		 94,133
(5.63 %)		 41.81
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 102
(100.00 %)		 4,965,571
(43.65 %)		 932,424
(1.95 %)		 13,596,808
(33.85 %)		 67,329
(2.48 %)
254 domestic cattle (Tuli MAZUNGA 2024)
GCA_040285425.1		 n/a 19,454
(1.36 %)		 22,081
(1.21 %)		 n/a 44.04
(99.98 %)		 31
(0.02 %)		 878
(100.00 %)		 6,506,177
(50.93 %)		 1,038,848
(13.71 %)		 11,547,434
(49.22 %)		 84,199
(8.81 %)
255 domestic cattle (Wagyu 3DWFS0412 2024)
GCA_040286185.1		 n/a 19,252
(1.32 %)		 22,269
(1.20 %)		 n/a 43.83
(99.96 %)		 17
(0.04 %)		 407
(99.99 %)		 6,783,665
(51.29 %)		 1,072,289
(13.17 %)		 12,697,022
(49.18 %)		 89,666
(8.32 %)
256 domestic ferret (JIRA1106 JCVI 2020)
GCF_011764305.1		 68,868
(3.09 %)		 19,019
(1.55 %)		 21,812
(1.42 %)		 n/a 41.90
(100.00 %)		 n/a 1,224
(100.00 %)		 4,650,028
(39.49 %)		 745,115
(2.02 %)		 13,758,447
(36.14 %)		 58,684
(2.16 %)
257 domestic ferret (Sable 2011 Broad)
GCA_000239315.1		 n/a 18,778
(1.67 %)		 19,571
(1.47 %)		 n/a 41.48
(96.89 %)		 72,670
(3.12 %)		 76,914
(96.88 %)		 4,491,876
(40.13 %)		 618,556
(1.07 %)		 13,721,938
(31.04 %)		 54,600
(1.94 %)
258 domestic guinea pig (051 PalLab524CR 2023)
GCF_034190915.1		 79,333
(3.55 %)		 17,999
(1.09 %)		 21,509
(1.20 %)		 n/a 40.64
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 672
(100.00 %)		 5,037,431
(41.68 %)		 886,785
(13.97 %)		 14,620,284
(42.71 %)		 39,682
(0.89 %)
259 domestic guinea pig (2N 2008 refseq)
GCF_000151735.1		 44,762
(2.31 %)		 18,301
(1.33 %)		 20,111
(1.34 %)		 n/a 39.95
(97.81 %)		 58,460
(2.20 %)		 61,604
(97.80 %)		 4,257,852
(38.85 %)		 658,533
(1.25 %)		 14,547,726
(34.19 %)		 37,093
(0.85 %)
260 domestic yak (maiwa yakHY00 2019)
GCA_005887515.3		 n/a 18,672
(1.39 %)		 19,408
(1.24 %)		 n/a 41.97
(100.00 %)		 646
(0.00 %)		 343
(100.00 %)		 3,570,978
(23.00 %)		 583,762
(8.57 %)		 14,055,227
(40.52 %)		 43,883
(1.17 %)
261 dugong (hap1 mDugDug1 2023)
GCA_030035585.1		 n/a 18,354
(1.22 %)		 20,434
(1.08 %)		 n/a 40.65
(100.00 %)		 96
(0.00 %)		 198
(100.00 %)		 4,458,084
(33.00 %)		 444,499
(1.79 %)		 15,031,940
(47.42 %)		 29,863
(0.83 %)
262 dugong (hap2 mDugDug1 2023)
GCA_030020955.1		 n/a 18,538
(1.23 %)		 20,775
(1.09 %)		 n/a 40.64
(100.00 %)		 89
(0.00 %)		 167
(100.00 %)		 4,455,227
(33.01 %)		 444,021
(1.73 %)		 14,946,847
(47.37 %)		 29,828
(0.79 %)
263 dwarf fruit-eating bat (hap1 2025)
GCA_051107565.1		 n/a 17,834
(1.67 %)		 19,738
(1.55 %)		 n/a 42.25
(100.00 %)		 77
(0.00 %)		 106
(100.00 %)		 3,731,962
(43.43 %)		 377,985
(3.87 %)		 11,915,741
(34.43 %)		 72,159
(2.56 %)
264 dwarf fruit-eating bat (hap2 2025)
GCA_051107595.1		 n/a 16,790
(1.71 %)		 18,246
(1.55 %)		 n/a 42.24
(100.00 %)		 43
(0.00 %)		 102
(100.00 %)		 3,412,455
(42.90 %)		 339,875
(3.98 %)		 10,947,746
(33.73 %)		 65,083
(2.56 %)
265 dwarf mongoose
GCA_004023845.1		 n/a 21,478
(1.57 %)		 32,174
(1.43 %)		 n/a 41.83
(99.94 %)		 10,815
(0.05 %)		 200,185
(99.95 %)		 4,574,991
(40.34 %)		 595,520
(1.11 %)		 13,720,585
(32.94 %)		 70,689
(2.42 %)
266 eastern cottontail (primary hap 2023)
GCA_949820135.1		 n/a 18,522
(1.26 %)		 22,314
(1.28 %)		 n/a 43.69
(100.00 %)		 316
(0.00 %)		 99
(100.00 %)		 3,699,683
(20.55 %)		 935,350
(11.22 %)		 13,112,318
(44.07 %)		 99,224
(2.27 %)
267 eastern European house mouse (PWK_PhJ v2 2022)
GCA_921998335.2		 n/a 21,903
(2.13 %)		 19,801
(1.40 %)		 108,675
(4.42 %)		 41.79
(99.89 %)		 207
(0.11 %)		 211
(100.00 %)		 4,630,645
(40.56 %)		 1,531,506
(3.70 %)		 13,011,312
(35.48 %)		 22,270
(0.54 %)
268 eastern mole
GCA_004024925.1		 n/a 19,631
(1.57 %)		 32,414
(1.63 %)		 n/a 42.02
(99.91 %)		 7,239
(0.03 %)		 647,535
(99.97 %)		 3,145,725
(29.42 %)		 554,620
(1.75 %)		 10,663,504
(32.88 %)		 55,063
(3.69 %)
269 eastern quoll
GCA_020854095.1		 n/a 15,715
(0.80 %)		 16,750
(0.93 %)		 n/a 36.19
(100.00 %)		 431
(0.00 %)		 76
(100.00 %)		 5,256,999
(24.81 %)		 1,280,160
(3.39 %)		 21,362,866
(41.74 %)		 24,508
(0.70 %)
270 eastern spiny mouse (2021)
GCA_907164435.1		 n/a 20,397
(1.93 %)		 20,515
(1.44 %)		 n/a 42.68
(98.12 %)		 109,220
(1.90 %)		 19,837
(99.90 %)		 4,701,702
(33.98 %)		 1,304,933
(2.91 %)		 13,145,044
(31.05 %)		 19,636
(0.56 %)
271 eastern woodrat (hap1 2025)
GCA_050000055.1		 n/a 19,460
(1.37 %)		 22,249
(1.25 %)		 n/a 40.82
(100.00 %)		 154
(0.00 %)		 1,382
(100.00 %)		 7,741,791
(54.00 %)		 2,194,305
(10.09 %)		 13,803,906
(42.49 %)		 22,114
(0.48 %)
272 eastern woodrat (hap2 2025)
GCA_050000045.1		 n/a 18,460
(1.50 %)		 21,237
(1.36 %)		 n/a 41.08
(100.00 %)		 154
(0.00 %)		 942
(100.00 %)		 6,975,151
(51.59 %)		 1,843,248
(8.41 %)		 12,873,831
(39.03 %)		 20,366
(0.52 %)
273 Egyptian rousette (1219 2016 Boston U)
GCF_001466805.2		 54,791
(4.93 %)		 18,221
(2.05 %)		 24,192
(1.88 %)		 46,601
(2.22 %)		 40.02
(99.97 %)		 638
(0.03 %)		 2,490
(100.00 %)		 2,815,693
(32.23 %)		 440,119
(1.01 %)		 12,346,041
(26.86 %)		 56,244
(6.54 %)
274 Egyptian rousette (primary hap 2025)
GCA_014176215.2		 n/a 17,319
(2.06 %)		 22,433
(1.85 %)		 n/a 40.05
(98.63 %)		 250
(1.37 %)		 27
(100.00 %)		 3,010,528
(35.56 %)		 434,429
(1.02 %)		 12,031,135
(26.53 %)		 53,517
(6.74 %)
275 Egyptian rousette (v1 2020 refseq)
GCF_014176215.1		 65,163
(4.76 %)		 17,642
(2.07 %)		 22,317
(1.84 %)		 n/a 40.05
(98.59 %)		 242
(1.41 %)		 29
(100.00 %)		 2,821,248
(33.05 %)		 434,414
(1.02 %)		 12,031,597
(26.52 %)		 53,573
(4.84 %)
276 Egyptian spiny mouse (US019 2019)
GCA_004027535.1		 n/a 23,498
(1.69 %)		 36,970
(1.40 %)		 30,076
(1.58 %)		 42.71
(99.88 %)		 20,469
(0.09 %)		 391,811
(99.91 %)		 4,983,574
(35.17 %)		 1,342,514
(3.45 %)		 13,029,270
(32.79 %)		 19,944
(0.55 %)
277 elk (wapiti)
GCF_019320065.1		 66,846
(3.00 %)		 20,090
(1.67 %)		 21,999
(1.44 %)		 n/a 41.62
(99.93 %)		 6,643
(0.08 %)		 185
(100.00 %)		 4,884,711
(43.14 %)		 429,925
(1.65 %)		 13,135,255
(37.85 %)		 47,099
(1.31 %)
278 ermine (2020)
GCF_009829155.1		 74,345
(3.19 %)		 18,855
(1.65 %)		 20,667
(1.43 %)		 44,584
(2.07 %)		 41.56
(99.12 %)		 199
(0.88 %)		 94
(100.00 %)		 4,647,934
(41.44 %)		 714,174
(1.30 %)		 13,845,904
(33.42 %)		 56,065
(2.25 %)
279 ermine (alternate hap 2020)
GCA_009829165.1		 n/a 13,583
(1.65 %)		 15,403
(1.46 %)		 n/a 41.72
(100.00 %)		 n/a 3,327
(100.00 %)		 3,139,035
(40.57 %)		 480,111
(1.29 %)		 9,106,061
(31.93 %)		 39,139
(2.25 %)
280 ermine (hap1.1 2025)
GCA_965636865.1		 n/a 18,538
(1.35 %)		 23,646
(1.36 %)		 n/a 42.25
(100.00 %)		 212
(0.00 %)		 1,036
(100.00 %)		 6,455,322
(46.66 %)		 881,285
(5.47 %)		 13,096,768
(42.14 %)		 93,973
(3.17 %)
281 ermine (hap2.1 2025)
GCA_965636855.1		 n/a 17,654
(1.42 %)		 22,483
(1.40 %)		 n/a 42.07
(100.00 %)		 139
(0.00 %)		 1,083
(100.00 %)		 5,945,296
(44.94 %)		 800,358
(4.39 %)		 12,526,091
(40.11 %)		 85,220
(2.90 %)
282 ermine (primary hap 2020)
GCA_009829155.1		 n/a 18,855
(1.65 %)		 20,668
(1.43 %)		 n/a 41.56
(99.12 %)		 199
(0.88 %)		 94
(100.00 %)		 4,647,997
(41.44 %)		 714,178
(1.30 %)		 13,845,820
(33.42 %)		 56,065
(2.25 %)
283 Eurasian badger (2021)
GCA_922990625.1		 n/a 19,332
(1.42 %)		 22,424
(1.40 %)		 n/a 42.47
(100.00 %)		 27
(0.00 %)		 726
(100.00 %)		 4,362,536
(31.74 %)		 801,232
(4.02 %)		 13,893,672
(37.73 %)		 65,806
(4.13 %)
284 Eurasian badger (v3.2 2022)
GCA_922984935.2		 n/a 19,268
(1.40 %)		 22,121
(1.36 %)		 41,043
(1.93 %)		 42.48
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 538
(100.00 %)		 4,417,203
(31.72 %)		 821,664
(4.02 %)		 13,814,720
(38.08 %)		 66,524
(3.95 %)
285 Eurasian beaver (alternate hap 2025)
GCA_977035955.1		 n/a 14,184
(1.28 %)		 14,518
(1.21 %)		 n/a 40.16
(99.94 %)		 12,413
(0.06 %)		 17,640
(99.94 %)		 2,894,516
(33.23 %)		 469,512
(3.63 %)		 8,909,825
(39.95 %)		 18,772
(1.65 %)
286 Eurasian beaver (primary hap 2025)
GCA_977036005.1		 n/a 20,316
(1.47 %)		 20,429
(1.25 %)		 n/a 39.69
(100.00 %)		 237
(0.00 %)		 228
(100.00 %)		 4,115,552
(36.09 %)		 562,383
(2.69 %)		 14,321,638
(36.02 %)		 24,219
(0.75 %)
287 Eurasian field mouse (2024)
GCA_964023405.1		 n/a 20,487
(1.88 %)		 19,707
(1.34 %)		 n/a 42.15
(100.00 %)		 182
(0.00 %)		 61
(100.00 %)		 5,115,510
(39.18 %)		 1,868,284
(4.29 %)		 13,503,826
(37.29 %)		 26,414
(0.61 %)
288 Eurasian red squirrel (alternate hap 2019)
GCA_902685485.1		 n/a 12,437
(1.51 %)		 12,702
(1.22 %)		 n/a 40.06
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 10,657
(100.00 %)		 2,303,176
(35.38 %)		 353,996
(1.49 %)		 7,218,556
(31.67 %)		 24,268
(1.07 %)
289 Eurasian red squirrel (primary hap 2019)
GCF_902686455.1		 65,975
(3.30 %)		 20,156
(1.54 %)		 21,025
(1.36 %)		 n/a 40.08
(94.33 %)		 1,177
(5.67 %)		 1,815
(94.33 %)		 5,315,833
(42.85 %)		 704,218
(1.42 %)		 14,991,523
(31.49 %)		 48,159
(1.04 %)
290 Eurasian red squirrel (v1.2 2020)
GCA_902686455.2		 n/a 21,309
(1.58 %)		 21,026
(1.36 %)		 33,465
(1.53 %)		 40.08
(94.33 %)		 1,177
(5.67 %)		 639
(100.00 %)		 4,677,412
(35.73 %)		 704,218
(1.42 %)		 14,992,063
(31.49 %)		 48,159
(1.04 %)
291 Eurasian river otter (2020)
GCF_902655055.1		 67,269
(2.96 %)		 18,842
(1.54 %)		 20,178
(1.40 %)		 n/a 41.59
(100.00 %)		 185
(0.00 %)		 44
(100.00 %)		 4,259,294
(33.39 %)		 713,721
(1.36 %)		 13,626,048
(34.37 %)		 57,073
(1.82 %)
292 Eurasian river otter (alternate hap 2019)
GCA_902653095.1		 n/a 9,910
(1.59 %)		 11,315
(1.31 %)		 n/a 41.85
(100.00 %)		 n/a 8,506
(100.00 %)		 2,052,338
(42.25 %)		 316,084
(1.64 %)		 6,222,460
(33.12 %)		 27,057
(1.96 %)
293 Eurasian river otter (primary hap 2020)
GCA_902655055.2		 n/a 19,133
(1.66 %)		 20,177
(1.40 %)		 n/a 41.59
(100.00 %)		 185
(0.00 %)		 44
(100.00 %)		 4,736,483
(42.28 %)		 713,721
(1.36 %)		 13,625,976
(34.37 %)		 57,073
(1.82 %)
294 Eurasian water vole (alternate hap 2020)
GCA_903992525.1		 n/a 16,761
(1.66 %)		 19,715
(1.37 %)		 n/a 42.13
(100.00 %)		 105
(0.00 %)		 16,473
(100.00 %)		 3,118,266
(26.44 %)		 829,463
(2.82 %)		 9,700,482
(31.37 %)		 14,146
(0.57 %)
295 Eurasian water vole (primary hap 2021)
GCA_903992535.2		 n/a 19,126
(1.84 %)		 19,054
(1.47 %)		 n/a 42.15
(99.74 %)		 873
(0.26 %)		 215
(100.00 %)		 5,439,454
(42.21 %)		 1,088,163
(2.91 %)		 12,853,486
(32.42 %)		 19,000
(0.58 %)
296 Eurasian water vole (v2 2021)
GCF_903992535.2		 45,544
(2.51 %)		 19,733
(1.78 %)		 19,053
(1.47 %)		 36,935
(2.27 %)		 42.15
(99.74 %)		 873
(0.26 %)		 215
(100.00 %)		 3,993,912
(25.74 %)		 1,088,163
(2.91 %)		 12,853,770
(32.42 %)		 19,000
(0.58 %)
297 European badger
GCF_922984935.2		 57,137
(2.48 %)		 18,649
(1.45 %)		 22,117
(1.36 %)		 n/a 42.48
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 537
(100.00 %)		 6,255,467
(47.25 %)		 821,660
(4.02 %)		 13,814,631
(38.08 %)		 66,524
(3.95 %)
298 European free-tailed bat (hap1.1 2025)
GCA_976988885.1		 n/a 19,367
(1.49 %)		 21,955
(1.44 %)		 n/a 42.35
(100.00 %)		 174
(0.00 %)		 641
(100.00 %)		 4,439,364
(40.01 %)		 680,470
(8.16 %)		 11,487,613
(43.09 %)		 73,991
(1.99 %)
299 European free-tailed bat (hap2.1 2025)
GCA_976988855.1		 n/a 19,630
(1.68 %)		 21,945
(1.52 %)		 n/a 42.25
(100.00 %)		 121
(0.00 %)		 370
(100.00 %)		 4,242,872
(41.74 %)		 637,498
(4.18 %)		 11,360,772
(39.15 %)		 69,324
(2.22 %)
300 European ground squirrel (alternate hap 2024)
GCA_964194095.1		 n/a 15,410
(1.11 %)		 21,126
(1.11 %)		 n/a 39.96
(100.00 %)		 n/a 28,045
(100.00 %)		 3,186,054
(30.28 %)		 656,568
(16.12 %)		 9,975,571
(43.35 %)		 28,808
(1.24 %)
301 European ground squirrel (primary hap 2024)
GCF_964194105.1		 58,589
(2.31 %)		 20,075
(1.28 %)		 20,268
(1.19 %)		 n/a 39.90
(99.99 %)		 1,436
(0.01 %)		 1,933
(99.99 %)		 4,479,230
(31.86 %)		 882,536
(12.27 %)		 14,881,793
(41.66 %)		 39,275
(0.88 %)
302 European hare (LE1 primary hap 2023)
GCF_033115175.1		 46,528
(2.09 %)		 19,392
(1.25 %)		 23,070
(1.29 %)		 n/a 44.03
(100.00 %)		 418
(0.00 %)		 651
(100.00 %)		 4,011,592
(19.81 %)		 1,000,204
(8.44 %)		 13,414,251
(44.25 %)		 98,831
(2.33 %)
303 European harvest mouse
GCF_963924665.1		 35,455
(1.84 %)		 20,235
(1.71 %)		 19,365
(1.32 %)		 n/a 40.05
(99.99 %)		 2,020
(0.02 %)		 893
(100.00 %)		 5,424,328
(37.31 %)		 1,223,387
(18.26 %)		 11,906,806
(42.51 %)		 17,423
(0.62 %)
304 European harvest mouse (alternate hap 2024)
GCA_963924645.1		 n/a 3,404
(1.16 %)		 2,956
(0.83 %)		 n/a 39.56
(100.00 %)		 n/a 5,020
(100.00 %)		 741,789
(44.38 %)		 265,801
(43.28 %)		 1,048,943
(61.65 %)		 3,244
(3.57 %)
305 European harvest mouse (primary hap 2024)
GCA_963924665.1		 n/a 20,236
(1.71 %)		 19,368
(1.32 %)		 n/a 40.05
(99.99 %)		 2,020
(0.02 %)		 894
(100.00 %)		 4,892,811
(36.49 %)		 1,223,387
(18.26 %)		 11,907,631
(42.51 %)		 17,423
(0.62 %)
306 European mink (alternate hap 2023)
GCA_030435785.1		 n/a 15,419
(1.50 %)		 21,175
(1.51 %)		 n/a 42.09
(100.00 %)		 n/a 12,043
(100.00 %)		 2,952,218
(30.62 %)		 538,508
(2.18 %)		 9,303,303
(34.20 %)		 47,810
(2.50 %)
307 European mink (primary hap 2023 refseq)
GCF_030435805.1		 69,556
(3.13 %)		 18,706
(1.46 %)		 21,193
(1.37 %)		 n/a 41.85
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 25
(100.00 %)		 4,237,791
(30.90 %)		 792,897
(2.69 %)		 13,417,195
(36.59 %)		 67,132
(2.54 %)
308 European mole (hap1 2024)
GCA_964194135.1		 n/a 18,085
(1.69 %)		 19,509
(1.58 %)		 n/a 42.08
(99.99 %)		 1,056
(0.01 %)		 464
(100.00 %)		 2,569,380
(23.32 %)		 565,465
(2.18 %)		 10,506,666
(33.68 %)		 46,367
(3.09 %)
309 European mole (hap2 2024)
GCA_964194205.1		 n/a 18,064
(1.69 %)		 19,764
(1.59 %)		 n/a 42.07
(99.99 %)		 1,040
(0.01 %)		 1,396
(99.99 %)		 2,567,492
(23.34 %)		 570,250
(2.16 %)		 10,485,959
(33.56 %)		 46,213
(3.27 %)
310 European mole (mTalEur1.hap1.1 2024)
GCF_964194135.1		 32,332
(1.69 %)		 17,635
(1.77 %)		 19,511
(1.58 %)		 n/a 42.08
(99.99 %)		 1,056
(0.01 %)		 1,519
(99.99 %)		 4,036,401
(41.00 %)		 565,464
(2.18 %)		 10,506,260
(33.68 %)		 46,366
(3.09 %)
311 European pine marten
GCF_963455335.1		 39,266
(2.23 %)		 17,953
(1.59 %)		 20,814
(1.41 %)		 n/a 42.38
(99.98 %)		 2,250
(0.02 %)		 476
(100.00 %)		 5,504,277
(42.55 %)		 707,333
(3.28 %)		 13,714,536
(34.73 %)		 61,480
(4.29 %)
312 European pine marten (primary hap 2023)
GCA_963455335.1		 n/a 18,336
(1.50 %)		 20,807
(1.41 %)		 n/a 42.38
(99.98 %)		 2,250
(0.02 %)		 477
(100.00 %)		 4,096,160
(31.55 %)		 707,337
(3.28 %)		 13,715,382
(34.73 %)		 61,481
(4.29 %)
313 European shrew (alternate hap 2023)
GCA_027595995.1		 n/a 17,506
(1.26 %)		 25,527
(1.52 %)		 n/a 43.20
(100.00 %)		 n/a 5,699
(100.00 %)		 2,400,784
(15.19 %)		 1,062,793
(3.20 %)		 13,284,496
(41.93 %)		 77,009
(2.86 %)
314 European shrew (GB8-d 2012)
GCF_000181275.1		 23,525
(1.54 %)		 17,290
(1.33 %)		 22,005
(1.50 %)		 n/a 42.90
(90.49 %)		 188,953
(9.54 %)		 201,798
(90.46 %)		 4,400,127
(33.22 %)		 946,629
(2.03 %)		 13,377,581
(35.30 %)		 77,851
(2.58 %)
315 European shrew (primary hap 2023)
GCF_027595985.1		 44,643
(2.60 %)		 17,479
(1.26 %)		 21,293
(1.37 %)		 n/a 43.24
(99.46 %)		 1,427
(0.54 %)		 65
(100.00 %)		 2,474,584
(15.18 %)		 1,107,884
(3.28 %)		 13,638,467
(41.72 %)		 79,785
(2.86 %)
316 European snow vole (alternate hap 2023)
GCA_950005115.1		 n/a 18,364
(1.79 %)		 20,379
(1.63 %)		 n/a 42.19
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 4,256
(100.00 %)		 3,049,618
(22.22 %)		 852,708
(4.50 %)		 10,501,392
(33.34 %)		 17,629
(0.60 %)
317 European snow vole (primary hap 2023 refseq)
GCF_950005125.1		 47,025
(2.69 %)		 19,592
(1.78 %)		 21,173
(1.56 %)		 n/a 41.98
(100.00 %)		 197
(0.00 %)		 160
(100.00 %)		 5,048,186
(44.12 %)		 998,537
(5.14 %)		 12,204,053
(34.97 %)		 20,725
(0.63 %)
318 European suslik (primary hap 2024)
GCA_964194105.1		 n/a 20,075
(1.28 %)		 20,274
(1.19 %)		 n/a 39.90
(99.99 %)		 1,436
(0.01 %)		 502
(100.00 %)		 4,357,247
(31.78 %)		 882,536
(12.27 %)		 14,882,486
(41.66 %)		 39,275
(0.88 %)
319 European woodmouse (2022 refseq)
GCF_947179515.1		 54,113
(2.24 %)		 19,959
(1.65 %)		 19,953
(1.25 %)		 n/a 41.23
(99.99 %)		 1,129
(0.01 %)		 497
(100.00 %)		 4,863,650
(37.41 %)		 1,795,997
(8.95 %)		 13,681,732
(40.58 %)		 23,961
(0.53 %)
320 European woodmouse (alternate hap 2022)
GCA_947179525.1		 n/a 18,692
(1.72 %)		 22,021
(1.36 %)		 n/a 41.56
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 10,863
(100.00 %)		 4,055,957
(36.08 %)		 1,513,576
(9.53 %)		 11,306,811
(39.67 %)		 20,865
(0.55 %)
321 fallow deer (Ldn47 2023)
GCF_033118175.1		 57,013
(2.35 %)		 20,187
(1.33 %)		 23,290
(1.33 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 44
(0.00 %)		 284
(100.00 %)		 3,308,241
(20.72 %)		 513,748
(18.20 %)		 12,996,819
(48.19 %)		 214,480
(2.98 %)
322 fallow deer (maternal hap SK-2024 2025)
GCA_048126745.1		 n/a 20,072
(1.51 %)		 22,668
(1.37 %)		 n/a 41.80
(100.00 %)		 147
(0.00 %)		 1,369
(100.00 %)		 4,623,335
(34.75 %)		 475,143
(7.51 %)		 13,000,703
(41.56 %)		 112,581
(2.00 %)
323 fallow deer (paternal hap SK-2024 2025)
GCA_048127045.1		 n/a 18,238
(1.57 %)		 20,307
(1.42 %)		 n/a 41.46
(100.00 %)		 242
(0.00 %)		 388
(100.00 %)		 4,244,450
(35.89 %)		 405,446
(2.83 %)		 12,211,643
(38.55 %)		 52,418
(1.36 %)
324 false killer whale (hap1 2024 genbank)
GCA_039906515.1		 n/a 18,718
(1.50 %)		 20,929
(1.32 %)		 n/a 42.08
(99.90 %)		 123
(0.10 %)		 439
(100.00 %)		 3,958,932
(35.76 %)		 1,002,329
(11.61 %)		 12,193,131
(41.85 %)		 79,158
(3.74 %)
325 false killer whale (hap1 2024 refseq)
GCF_039906515.1		 75,958
(3.31 %)		 18,718
(1.50 %)		 20,982
(1.32 %)		 n/a 42.08
(99.90 %)		 123
(0.10 %)		 438
(100.00 %)		 3,958,926
(35.76 %)		 1,002,329
(11.61 %)		 12,193,061
(41.85 %)		 79,158
(3.74 %)
326 false killer whale (hap2 2024)
GCA_039906525.1		 n/a 17,866
(1.45 %)		 21,079
(1.46 %)		 n/a 42.37
(99.08 %)		 133
(0.92 %)		 416
(100.00 %)		 3,852,502
(34.98 %)		 1,112,185
(16.42 %)		 11,435,533
(44.17 %)		 75,215
(4.36 %)
327 fat dormouse (US078 2019)
GCA_004027185.1		 n/a 23,122
(1.24 %)		 48,677
(1.27 %)		 n/a 42.33
(99.92 %)		 10,685
(0.04 %)		 444,115
(99.96 %)		 6,783,404
(37.03 %)		 1,642,515
(3.72 %)		 12,706,289
(39.97 %)		 65,521
(1.47 %)
328 fat sand rat (mPsaObe1 2021)
GCF_907164565.1		 43,224
(2.50 %)		 18,543
(1.78 %)		 20,094
(1.42 %)		 n/a 41.95
(99.11 %)		 50,482
(0.90 %)		 11,389
(100.00 %)		 4,686,377
(43.10 %)		 920,563
(1.85 %)		 12,813,848
(35.08 %)		 22,480
(0.71 %)
329 fat sand rat (Psa_ob012049795 2017)
GCA_002215935.1		 n/a 21,644
(1.71 %)		 31,665
(1.41 %)		 n/a 41.99
(99.99 %)		 n/a 96,427
(100.00 %)		 4,646,110
(38.87 %)		 946,664
(2.24 %)		 13,134,526
(33.94 %)		 26,411
(0.73 %)
330 fat-tailed dunnart (SCR6 2025)
GCF_048593235.1		 60,212
(2.43 %)		 15,763
(0.77 %)		 16,031
(0.89 %)		 n/a 36.12
(99.99 %)		 1,908
(0.01 %)		 8
(100.00 %)		 5,302,378
(24.47 %)		 1,450,227
(3.79 %)		 20,870,714
(44.26 %)		 24,586
(0.65 %)
331 fat-tailed dunnart (SCR6 hap1 2025)
GCA_048593235.1		 n/a 15,762
(0.77 %)		 16,035
(0.89 %)		 n/a 36.12
(99.99 %)		 1,908
(0.01 %)		 1,915
(99.99 %)		 5,302,372
(24.47 %)		 1,450,220
(3.79 %)		 20,870,654
(44.26 %)		 24,585
(0.65 %)
332 fat-tailed dunnart (SCR6 hap2 2025)
GCA_048593295.1		 n/a 16,012
(0.77 %)		 16,430
(0.90 %)		 n/a 36.18
(99.99 %)		 1,730
(0.01 %)		 1,737
(99.99 %)		 5,361,847
(24.48 %)		 1,474,744
(3.79 %)		 21,021,671
(44.20 %)		 25,669
(0.69 %)
333 fin whale (hap1.1 2025)
GCA_965194825.1		 n/a 19,491
(1.21 %)		 22,538
(1.06 %)		 n/a 42.19
(99.99 %)		 1,516
(0.01 %)		 2,612
(100.00 %)		 4,598,236
(35.34 %)		 1,716,315
(24.14 %)		 12,260,919
(52.40 %)		 82,683
(1.47 %)
334 fin whale (hap2.1 2025)
GCA_965194765.1		 n/a 18,684
(1.40 %)		 21,322
(1.20 %)		 n/a 41.87
(99.99 %)		 1,258
(0.01 %)		 3,706
(99.99 %)		 4,103,716
(36.69 %)		 1,030,821
(16.12 %)		 11,633,934
(45.82 %)		 74,782
(1.60 %)
335 finback whale
GCF_965194825.1		 88,327
(5.86 %)		 19,923
(1.28 %)		 22,534
(1.06 %)		 n/a 42.19
(99.99 %)		 1,516
(0.01 %)		 2,611
(100.00 %)		 4,839,138
(57.33 %)		 1,716,315
(24.14 %)		 12,260,862
(52.40 %)		 82,683
(1.47 %)
336 fishing cat (Anna 2022 U Missouri)
GCF_022837055.1		 68,085
(2.86 %)		 18,432
(1.63 %)		 19,912
(1.37 %)		 n/a 41.91
(100.00 %)		 63
(0.00 %)		 192
(100.00 %)		 4,777,906
(34.85 %)		 937,432
(2.30 %)		 13,438,032
(34.55 %)		 70,402
(2.61 %)
337 Florida manatee (CSIC 2023)
GCA_030013775.1		 n/a 19,432
(1.24 %)		 24,035
(1.14 %)		 n/a 40.66
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 15,641
(100.00 %)		 4,400,331
(33.07 %)		 439,615
(1.04 %)		 14,884,753
(46.98 %)		 32,563
(0.80 %)
338 Florida manatee (Lorelei 2012 refseq)
GCF_000243295.1		 39,664
(2.08 %)		 18,308
(1.37 %)		 20,588
(1.23 %)		 32,868
(1.38 %)		 40.73
(89.24 %)		 160,167
(10.78 %)		 166,490
(89.22 %)		 n/a 389,315
(0.74 %)		 14,633,038
(38.46 %)		 27,462
(0.64 %)
339 fossa
GCA_004023885.1		 n/a 21,156
(1.56 %)		 29,809
(1.38 %)		 n/a 41.51
(99.94 %)		 6,335
(0.03 %)		 470,371
(99.97 %)		 4,962,168
(42.36 %)		 814,639
(1.52 %)		 13,708,904
(34.14 %)		 78,033
(2.52 %)
340 Gambian giant pouched rat
GCA_004027575.1		 n/a 21,189
(1.59 %)		 32,806
(1.43 %)		 n/a 42.11
(99.88 %)		 7,473
(0.03 %)		 1,110,425
(99.97 %)		 4,137,605
(24.57 %)		 1,071,627
(2.76 %)		 12,905,250
(32.78 %)		 32,359
(0.80 %)
341 gaur (Gaur_Henry_Doorly_Zoo_5443 2020)
GCA_014182915.2		 n/a 19,130
(1.53 %)		 21,239
(1.30 %)		 n/a 41.83
(99.99 %)		 2,194
(0.01 %)		 635
(100.00 %)		 6,520,228
(50.46 %)		 466,916
(1.41 %)		 13,425,286
(41.25 %)		 41,833
(1.15 %)
342 gayal (CVASU_BF_001 2021)
GCA_017311355.1		 n/a 24,549
(1.09 %)		 55,194
(1.15 %)		 n/a 42.05
(99.91 %)		 n/a 1,262,134
(100.00 %)		 3,691,398
(22.78 %)		 677,397
(2.00 %)		 14,380,670
(42.36 %)		 75,114
(1.33 %)
343 gayal (Nagaland 2019)
GCA_007844835.1		 n/a 22,715
(1.55 %)		 23,635
(1.33 %)		 n/a 41.67
(96.51 %)		 301,761
(3.52 %)		 306,776
(96.48 %)		 6,243,468
(45.69 %)		 518,664
(1.99 %)		 15,147,647
(37.64 %)		 45,586
(0.89 %)
344 Geoffroy's bat (hap1.1 2025)
GCA_965115925.1		 n/a 19,320
(1.74 %)		 21,940
(1.65 %)		 n/a 42.55
(99.99 %)		 1,540
(0.01 %)		 404
(100.00 %)		 3,707,500
(37.60 %)		 733,107
(7.78 %)		 10,515,474
(39.35 %)		 60,200
(2.41 %)
345 Geoffroy's bat (hap1.2 2025)
GCA_965115925.2		 n/a 18,831
(1.81 %)		 22,032
(1.67 %)		 n/a 42.55
(100.00 %)		 226
(0.00 %)		 306
(100.00 %)		 4,958,159
(48.46 %)		 733,004
(7.77 %)		 10,528,813
(39.34 %)		 59,971
(2.41 %)
346 Geoffroy's bat (hap2.1 2025)
GCA_965115945.1		 n/a 18,718
(1.71 %)		 20,961
(1.62 %)		 n/a 42.29
(99.98 %)		 1,597
(0.02 %)		 2,101
(99.98 %)		 3,662,405
(37.72 %)		 717,069
(7.80 %)		 10,298,372
(39.22 %)		 56,300
(2.26 %)
347 Geoffroy's bat (hap2.2 2025)
GCA_965115945.2		 n/a 18,471
(1.79 %)		 21,274
(1.64 %)		 n/a 42.31
(100.00 %)		 264
(0.00 %)		 418
(100.00 %)		 4,911,358
(48.79 %)		 719,004
(7.65 %)		 10,340,272
(39.15 %)		 56,616
(2.24 %)
348 Geoffroy's cat
GCF_018350155.1		 85,344
(3.53 %)		 18,469
(1.66 %)		 19,516
(1.36 %)		 93,795
(4.83 %)		 41.75
(100.00 %)		 45
(0.00 %)		 82
(100.00 %)		 5,021,854
(43.23 %)		 930,175
(1.84 %)		 13,757,469
(34.29 %)		 65,918
(2.36 %)
349 giant anteater
GCA_004026745.1		 n/a 24,383
(0.91 %)		 44,315
(0.93 %)		 n/a 39.53
(99.88 %)		 8,283
(0.02 %)		 1,629,691
(99.98 %)		 5,333,757
(35.57 %)		 575,140
(0.91 %)		 21,181,213
(39.97 %)		 57,558
(0.94 %)
350 giant otter
GCA_004024605.1		 n/a 21,199
(1.46 %)		 30,565
(1.34 %)		 n/a 41.71
(99.93 %)		 7,431
(0.03 %)		 652,159
(99.97 %)		 5,113,769
(41.55 %)		 788,677
(1.46 %)		 14,385,279
(35.77 %)		 82,376
(2.05 %)
351 giant panda (Jingjing v3 2020)
GCF_002007445.2		 65,481
(3.27 %)		 19,077
(1.67 %)		 20,176
(1.39 %)		 n/a 41.68
(98.09 %)		 189,277
(1.92 %)		 73,514
(100.00 %)		 4,012,144
(34.40 %)		 617,803
(1.99 %)		 14,216,587
(30.41 %)		 59,449
(1.50 %)
352 goat (v2 San Clemente 2016 USDA)
GCF_001704415.2		 47,172
(2.31 %)		 19,342
(1.38 %)		 22,346
(1.24 %)		 n/a 43.16
(100.00 %)		 790
(0.00 %)		 29,886
(100.00 %)		 3,502,527
(22.45 %)		 760,831
(7.07 %)		 13,024,178
(44.85 %)		 125,662
(4.00 %)
353 Gobi jerboa
GCA_004027895.1		 n/a 22,410
(0.91 %)		 45,268
(1.02 %)		 n/a 41.94
(99.88 %)		 10,987
(0.04 %)		 1,295,369
(99.96 %)		 8,828,417
(40.19 %)		 1,979,806
(6.43 %)		 14,759,732
(47.73 %)		 24,314
(0.52 %)
354 golden hamster (Baylor 2021)
GCF_017639785.1		 67,831
(3.37 %)		 19,354
(1.71 %)		 19,863
(1.47 %)		 69,903
(4.39 %)		 42.04
(96.99 %)		 711
(3.01 %)		 7,058
(96.99 %)		 3,981,818
(27.65 %)		 976,456
(3.46 %)		 12,580,903
(32.87 %)		 21,268
(0.61 %)
355 golden hamster (Broad 2013 refseq)
GCF_000349665.1		 42,636
(2.91 %)		 18,976
(1.82 %)		 19,149
(1.51 %)		 29,936
(1.96 %)		 42.01
(82.92 %)		 216,216
(17.12 %)		 237,700
(82.88 %)		 3,599,795
(26.09 %)		 790,256
(1.69 %)		 12,003,956
(24.29 %)		 18,591
(0.51 %)
356 golden jackal (CA01 2025)
GCF_053574225.1		 115,457
(4.37 %)		 19,332
(1.58 %)		 21,009
(1.39 %)		 n/a 41.58
(100.00 %)		 59
(0.00 %)		 306
(100.00 %)		 6,089,485
(46.31 %)		 1,184,044
(5.44 %)		 13,574,928
(35.96 %)		 54,314
(2.19 %)
357 golden spiny mouse (2020)
GCA_903995435.1		 n/a 20,001
(1.90 %)		 19,127
(1.50 %)		 n/a 42.51
(99.65 %)		 880
(0.35 %)		 623
(100.00 %)		 4,976,496
(36.34 %)		 1,305,613
(3.34 %)		 12,957,738
(32.33 %)		 20,760
(0.59 %)
358 golden spiny mouse (2020)
GCF_903995435.1		 36,997
(1.96 %)		 20,006
(1.91 %)		 19,132
(1.50 %)		 n/a 42.51
(99.65 %)		 880
(0.35 %)		 623
(100.00 %)		 4,785,907
(32.61 %)		 1,305,613
(3.34 %)		 12,958,061
(32.33 %)		 20,760
(0.59 %)
359 golden-mantled ground squirrel (hap1 2025 genbank)
GCA_048772815.1		 n/a 20,967
(0.89 %)		 24,137
(0.94 %)		 n/a 39.52
(99.99 %)		 1,448
(0.01 %)		 8,087
(100.00 %)		 5,547,018
(29.30 %)		 1,312,047
(10.07 %)		 15,174,898
(52.73 %)		 40,182
(0.59 %)
360 golden-mantled ground squirrel (hap1 2025 refseq)
GCF_048772815.1		 49,173
(1.30 %)		 19,845
(0.90 %)		 24,244
(0.94 %)		 n/a 39.52
(99.99 %)		 1,448
(0.01 %)		 8,088
(100.00 %)		 8,197,827
(62.01 %)		 1,312,047
(10.07 %)		 15,174,958
(52.73 %)		 40,182
(0.59 %)
361 golden-mantled ground squirrel (hap2 2025 genbank)
GCA_048772825.1		 n/a 19,719
(1.16 %)		 22,611
(1.21 %)		 n/a 39.48
(100.00 %)		 643
(0.00 %)		 2,820
(100.00 %)		 4,725,546
(31.70 %)		 997,950
(3.53 %)		 14,753,550
(39.53 %)		 33,465
(0.69 %)
362 golden-mantled ground squirrel (hap2 2025 refseq)
GCF_048772825.1		 46,395
(1.71 %)		 18,853
(1.19 %)		 22,613
(1.21 %)		 n/a 39.48
(100.00 %)		 643
(0.00 %)		 2,821
(100.00 %)		 6,984,115
(50.68 %)		 997,950
(3.53 %)		 14,753,604
(39.53 %)		 33,465
(0.69 %)
363 gracile shrew mole
GCA_004024945.1		 n/a 19,165
(1.25 %)		 43,816
(1.48 %)		 n/a 41.08
(99.89 %)		 8,248
(0.04 %)		 732,083
(99.96 %)		 2,957,465
(23.76 %)		 783,289
(2.60 %)		 11,503,344
(31.38 %)		 92,729
(3.60 %)
364 gray fox (Vermont ataVT051 2023)
GCA_032313775.1		 n/a 19,352
(1.42 %)		 20,724
(1.33 %)		 n/a 42.10
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 898
(100.00 %)		 4,418,039
(36.90 %)		 1,050,244
(11.63 %)		 13,240,305
(39.50 %)		 89,246
(2.69 %)
365 gray seal (241Hg 2020)
GCF_012393455.1		 79,009
(3.73 %)		 19,882
(1.73 %)		 22,416
(1.46 %)		 n/a 41.44
(100.00 %)		 117
(0.00 %)		 6,880
(100.00 %)		 4,448,588
(43.28 %)		 557,710
(1.32 %)		 13,340,576
(33.41 %)		 55,637
(1.78 %)
366 gray seal (hap1.1 2025)
GCA_964656455.1		 n/a 19,291
(1.73 %)		 20,301
(1.41 %)		 n/a 41.56
(99.99 %)		 1,130
(0.01 %)		 171
(100.00 %)		 4,245,582
(34.81 %)		 600,624
(2.16 %)		 13,240,803
(34.28 %)		 56,932
(1.78 %)
367 gray seal (hap2.1 2025)
GCA_964656465.1		 n/a 19,222
(1.73 %)		 20,205
(1.41 %)		 n/a 41.54
(99.99 %)		 1,110
(0.01 %)		 1,233
(99.99 %)		 4,236,942
(34.95 %)		 601,409
(1.99 %)		 13,226,667
(34.03 %)		 57,067
(1.82 %)
368 gray seal (mHalGry1.hap1.1 2025)
GCF_964656455.1		 70,736
(3.27 %)		 18,889
(1.71 %)		 20,343
(1.40 %)		 n/a 41.56
(99.99 %)		 1,130
(0.01 %)		 1,300
(99.99 %)		 5,332,627
(44.68 %)		 600,622
(2.16 %)		 13,240,769
(34.28 %)		 56,931
(1.78 %)
369 gray short-tailed opossum
GCA_027887165.2		 n/a 16,583
(0.75 %)		 16,408
(0.86 %)		 n/a 37.92
(99.11 %)		 2,255
(0.89 %)		 14
(100.00 %)		 9,126,134
(61.38 %)		 1,096,062
(2.60 %)		 22,321,931
(43.37 %)		 28,894
(0.57 %)
370 gray short-tailed opossum (mMonDom1 alternate hap 2023)
GCA_027917375.1		 n/a 12,662
(0.70 %)		 15,124
(0.89 %)		 n/a 37.74
(100.00 %)		 24
(0.00 %)		 8,086
(100.00 %)		 4,098,004
(25.33 %)		 806,470
(2.98 %)		 16,244,072
(43.39 %)		 24,879
(0.67 %)
371 gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027887165.1		 73,383
(3.04 %)		 16,637
(0.72 %)		 16,036
(0.85 %)		 n/a 37.92
(99.11 %)		 2,255
(0.89 %)		 13
(100.00 %)		 5,562,359
(25.40 %)		 1,096,620
(2.60 %)		 22,322,748
(43.37 %)		 28,894
(0.57 %)
372 gray short-tailed opossum (MonDom5 2007)
GCF_000002295.2		 68,388
(2.34 %)		 16,663
(0.75 %)		 16,162
(0.84 %)		 n/a 37.82
(97.26 %)		 67,660
(2.75 %)		 72,674
(97.25 %)		 7,753,175
(55.85 %)		 1,051,473
(2.34 %)		 22,274,001
(42.23 %)		 30,883
(0.53 %)
373 gray squirrel (2020)
GCF_902686445.1		 59,073
(2.48 %)		 20,752
(1.49 %)		 21,107
(1.31 %)		 32,732
(1.45 %)		 40.06
(99.98 %)		 1,824
(0.02 %)		 752
(100.00 %)		 4,605,578
(34.50 %)		 728,192
(1.65 %)		 15,467,412
(33.91 %)		 51,878
(1.11 %)
374 gray squirrel (alternate hap 2019)
GCA_902685475.1		 n/a 17,156
(1.53 %)		 18,190
(1.33 %)		 n/a 40.25
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 9,510
(100.00 %)		 3,455,580
(34.94 %)		 530,053
(1.56 %)		 10,927,458
(32.64 %)		 38,976
(1.13 %)
375 gray squirrel (primary hap 2020)
GCA_902686445.2		 n/a 20,739
(1.50 %)		 21,110
(1.31 %)		 n/a 40.06
(99.98 %)		 1,824
(0.02 %)		 753
(100.00 %)		 4,732,857
(35.28 %)		 728,193
(1.65 %)		 15,466,750
(33.91 %)		 51,878
(1.11 %)
376 gray wolf (2021)
GCA_905319855.2		 n/a 19,474
(1.55 %)		 20,394
(1.40 %)		 72,806
(4.12 %)		 41.49
(100.00 %)		 166
(0.00 %)		 82
(100.00 %)		 4,550,524
(31.76 %)		 1,063,944
(3.96 %)		 13,588,117
(34.74 %)		 51,996
(2.15 %)
377 gray wolf (alternate hap 2021)
GCA_905319845.1		 n/a 12,760
(1.57 %)		 14,423
(1.42 %)		 n/a 41.35
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 5,537
(100.00 %)		 2,725,227
(31.66 %)		 616,862
(3.40 %)		 8,041,744
(32.68 %)		 32,293
(2.35 %)
378 great fruit-eating bat (hap1 2025)
GCA_038363095.4		 n/a 18,198
(1.65 %)		 19,926
(1.51 %)		 n/a 42.45
(100.00 %)		 44
(0.00 %)		 487
(100.00 %)		 3,105,608
(36.84 %)		 379,427
(5.52 %)		 11,651,533
(35.11 %)		 72,337
(2.76 %)
379 great fruit-eating bat (mArtLit1hap2 2024)
GCA_038363175.2		 n/a 16,978
(1.61 %)		 18,544
(1.54 %)		 n/a 42.42
(100.00 %)		 54
(0.00 %)		 312
(100.00 %)		 2,601,985
(26.67 %)		 331,187
(4.87 %)		 10,884,729
(33.93 %)		 63,610
(2.71 %)
380 great fruit-eating bat (v2 hap1 2024)
GCA_038363095.2		 n/a 18,051
(1.56 %)		 19,955
(1.51 %)		 n/a 42.45
(100.00 %)		 45
(0.00 %)		 487
(100.00 %)		 2,841,143
(26.67 %)		 379,430
(5.52 %)		 11,651,542
(35.11 %)		 72,337
(2.76 %)
381 great roundleaf bat (v2 ML-2016 2016)
GCF_001890085.2		 50,908
(3.26 %)		 18,993
(2.01 %)		 19,633
(1.65 %)		 41,769
(2.41 %)		 41.11
(87.42 %)		 172,750
(12.60 %)		 7,387
(100.00 %)		 2,946,981
(30.72 %)		 495,272
(1.05 %)		 11,587,728
(25.43 %)		 32,949
(0.96 %)
382 greater bulldog bat
GCA_004026585.1		 n/a 20,774
(1.62 %)		 28,140
(1.63 %)		 n/a 40.92
(99.94 %)		 6,171
(0.03 %)		 304,393
(99.97 %)		 3,288,598
(29.60 %)		 478,424
(1.16 %)		 11,427,553
(35.29 %)		 44,124
(1.99 %)
383 Greater cane rat
GCA_004025085.1		 n/a 20,383
(0.98 %)		 47,456
(1.25 %)		 n/a 42.85
(99.83 %)		 8,825
(0.03 %)		 1,898,466
(99.97 %)		 5,569,185
(30.19 %)		 946,696
(3.12 %)		 13,144,109
(41.83 %)		 97,686
(2.61 %)
384 greater horseshoe bat (MPI-CBG alternate hap 2019)
GCA_004115295.1		 n/a 14,896
(1.85 %)		 18,939
(1.59 %)		 n/a 40.69
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 13,426
(100.00 %)		 2,426,330
(34.43 %)		 418,341
(1.36 %)		 8,763,234
(27.86 %)		 24,370
(1.08 %)
385 greater horseshoe bat (MPI-CBG mRhiFer1 2019)
GCA_004115265.3		 n/a 18,510
(1.96 %)		 20,357
(1.68 %)		 n/a 40.54
(99.64 %)		 158
(0.36 %)		 135
(100.00 %)		 3,547,476
(40.33 %)		 564,790
(1.35 %)		 12,217,002
(29.39 %)		 32,445
(1.06 %)
386 greater horseshoe bat (v2 MPI-CBG 2019)
GCF_004115265.2		 53,353
(3.13 %)		 18,641
(1.97 %)		 20,359
(1.68 %)		 n/a 40.54
(99.64 %)		 158
(0.36 %)		 134
(100.00 %)		 3,218,744
(34.52 %)		 564,789
(1.35 %)		 12,217,020
(29.39 %)		 32,445
(1.06 %)
387 greater Indian rhinoceros (Sample0755 2023)
GCA_028646465.1		 n/a 19,533
(1.67 %)		 23,705
(1.37 %)		 n/a 41.10
(101.83 %)		 33,235
(0.47 %)		 275,222
(99.99 %)		 5,364,142
(46.33 %)		 487,256
(1.17 %)		 16,182,706
(30.52 %)		 42,131
(1.13 %)
388 greater mouse-eared bat
GCA_014108235.2		 n/a 18,686
(1.94 %)		 21,567
(1.74 %)		 n/a 43.11
(98.56 %)		 600
(1.44 %)		 51
(100.00 %)		 4,876,518
(44.95 %)		 752,949
(2.84 %)		 10,383,290
(35.84 %)		 60,936
(2.45 %)
389 greater mouse-eared bat (2020 Bat1K)
GCF_014108235.1		 70,930
(3.43 %)		 19,052
(1.84 %)		 21,498
(1.73 %)		 n/a 43.11
(98.55 %)		 538
(1.45 %)		 93
(100.00 %)		 3,088,083
(26.27 %)		 753,124
(2.84 %)		 10,383,466
(35.84 %)		 61,023
(2.69 %)
390 Greater mouse-tailed bat (20210906_DDa alternate hap 2024)
GCA_043880455.1		 n/a 16,611
(1.60 %)		 22,294
(1.43 %)		 n/a 42.59
(100.00 %)		 n/a 8,359
(100.00 %)		 4,914,747
(44.93 %)		 593,619
(4.20 %)		 10,708,461
(39.52 %)		 222,795
(3.47 %)
391 greater mouse-tailed bat (20210906_DDa primary hap 2024)
GCA_043880545.1		 n/a 18,582
(1.55 %)		 20,954
(1.35 %)		 n/a 42.46
(100.00 %)		 152
(0.00 %)		 106
(100.00 %)		 4,158,629
(40.30 %)		 696,150
(4.67 %)		 12,702,667
(41.11 %)		 257,446
(3.38 %)
392 greater sac-winged bat (alternate hap 2024)
GCA_036850925.1		 n/a 17,838
(1.44 %)		 21,425
(1.45 %)		 n/a 41.86
(100.00 %)		 n/a 2,167
(100.00 %)		 6,139,040
(42.07 %)		 974,353
(2.52 %)		 11,694,399
(43.03 %)		 96,465
(2.06 %)
393 greater sac-winged bat (primary hap 2024 refseq)
GCF_036850765.1		 55,259
(2.53 %)		 18,321
(1.40 %)		 21,048
(1.35 %)		 n/a 41.71
(98.73 %)		 468
(1.27 %)		 256
(100.00 %)		 4,247,145
(29.53 %)		 1,031,385
(2.50 %)		 12,465,157
(43.30 %)		 101,620
(2.01 %)
394 greater spear-nosed bat (2021 Texas Tech U)
GCF_019186645.2		 50,563
(2.96 %)		 18,224
(1.70 %)		 20,689
(1.67 %)		 n/a 42.27
(100.00 %)		 55
(0.00 %)		 534
(100.00 %)		 2,961,591
(0.00 %)		 387,908
(0.97 %)		 12,179,612
(30.91 %)		 62,189
(5.35 %)
395 grey whale
GCA_004363415.1		 n/a 21,827
(1.52 %)		 32,191
(1.24 %)		 n/a 41.22
(99.88 %)		 10,622
(0.04 %)		 1,046,770
(99.96 %)		 4,841,166
(45.56 %)		 780,015
(1.83 %)		 13,559,563
(39.86 %)		 72,343
(1.59 %)
396 grey whale (mEscRob2 alternate hap 2023)
GCA_028021475.1		 n/a 19,129
(1.37 %)		 24,628
(1.24 %)		 n/a 41.83
(100.00 %)		 n/a 14,442
(100.00 %)		 3,892,130
(35.74 %)		 874,864
(15.70 %)		 11,484,916
(45.69 %)		 73,507
(1.72 %)
397 grey whale (primary hap 2023 genbank)
GCA_028021215.1		 n/a 19,288
(1.38 %)		 21,791
(1.21 %)		 n/a 41.74
(100.00 %)		 279
(0.00 %)		 704
(100.00 %)		 4,116,900
(35.85 %)		 966,065
(16.74 %)		 12,154,173
(46.39 %)		 77,011
(1.59 %)
398 grey whale (primary hap 2023 refseq)
GCF_028021215.1		 49,276
(1.90 %)		 19,295
(1.38 %)		 21,790
(1.21 %)		 n/a 41.74
(100.00 %)		 279
(0.00 %)		 703
(100.00 %)		 4,116,894
(35.85 %)		 966,064
(16.74 %)		 12,154,101
(46.39 %)		 77,011
(1.59 %)
399 hairy big-eared bat (US037 2019 Broad)
GCA_004026765.1		 n/a 21,360
(1.44 %)		 37,376
(1.52 %)		 n/a 42.38
(99.94 %)		 3,218
(0.01 %)		 553,308
(99.99 %)		 3,519,246
(30.77 %)		 393,318
(0.85 %)		 12,525,258
(34.42 %)		 84,875
(2.37 %)
400 Hanaki's dwarf bat (2024)
GCA_964339955.1		 n/a 17,856
(1.76 %)		 20,604
(1.75 %)		 n/a 42.55
(100.00 %)		 306
(0.00 %)		 141
(100.00 %)		 3,697,250
(33.21 %)		 842,827
(8.27 %)		 10,094,062
(38.40 %)		 61,715
(2.96 %)
401 Hanaki's dwarf bat (2025)
GCA_964339955.5		 n/a 17,654
(1.85 %)		 20,599
(1.75 %)		 n/a 42.55
(100.00 %)		 306
(0.00 %)		 141
(100.00 %)		 4,660,276
(45.88 %)		 842,822
(8.27 %)		 10,093,872
(38.40 %)		 61,715
(2.96 %)
402 harbor porpoise (alternate hap 2024)
GCA_963924725.1		 n/a 19,112
(1.54 %)		 22,516
(1.29 %)		 n/a 42.02
(100.00 %)		 n/a 7,636
(100.00 %)		 4,295,938
(43.35 %)		 1,111,088
(11.90 %)		 12,254,452
(42.18 %)		 77,325
(3.31 %)
403 harbor porpoise (primary hap 2024 genbank)
GCA_963924675.1		 n/a 18,529
(1.58 %)		 20,583
(1.34 %)		 n/a 41.72
(99.99 %)		 966
(0.01 %)		 442
(100.00 %)		 3,760,716
(36.18 %)		 888,368
(7.18 %)		 12,379,240
(39.04 %)		 71,530
(2.69 %)
404 harbor porpoise (primary hap 2024 refseq)
GCF_963924675.1		 33,578
(1.54 %)		 18,528
(1.58 %)		 20,582
(1.34 %)		 n/a 41.72
(99.99 %)		 966
(0.01 %)		 1,405
(99.99 %)		 3,760,713
(36.18 %)		 888,368
(7.18 %)		 12,379,181
(39.04 %)		 71,530
(2.69 %)
405 harbor seal
GCF_004348235.1		 50,657
(2.98 %)		 19,484
(1.76 %)		 20,771
(1.44 %)		 33,296
(1.58 %)		 41.38
(99.09 %)		 16,480
(0.91 %)		 21,161
(99.09 %)		 4,526,182
(43.28 %)		 576,921
(1.11 %)		 13,421,780
(33.06 %)		 54,592
(1.70 %)
406 Hawaiian monk seal (2021 Johns Hopkins U)
GCF_002201575.2		 37,605
(1.99 %)		 19,483
(1.73 %)		 19,767
(1.35 %)		 n/a 41.41
(98.23 %)		 25,763
(1.77 %)		 7,487
(100.00 %)		 4,575,217
(43.59 %)		 583,394
(1.11 %)		 13,374,131
(33.69 %)		 52,067
(1.50 %)
407 hazel dormouse
GCA_004027005.1		 n/a 21,556
(1.24 %)		 40,971
(1.33 %)		 n/a 41.60
(99.91 %)		 15,076
(0.06 %)		 481,881
(99.94 %)		 6,679,641
(33.98 %)		 1,653,419
(3.72 %)		 12,685,676
(43.98 %)		 71,478
(1.57 %)
408 hazel dormouse (alternate hap 2023)
GCA_963383665.1		 n/a 11,130
(1.23 %)		 22,071
(1.36 %)		 n/a 42.15
(99.99 %)		 n/a 31,856
(100.00 %)		 2,958,239
(41.25 %)		 788,242
(4.52 %)		 6,056,268
(41.88 %)		 36,143
(1.96 %)
409 hazel dormouse (primary hap 2023)
GCA_963383645.1		 n/a 18,620
(1.42 %)		 22,403
(1.38 %)		 n/a 41.73
(99.99 %)		 1,805
(0.01 %)		 214
(100.00 %)		 6,063,911
(41.66 %)		 1,593,657
(4.46 %)		 12,229,281
(43.98 %)		 71,058
(1.88 %)
410 hippopotamus (BS01 2019 Broad)
GCA_004027065.1		 n/a 24,267
(1.55 %)		 34,820
(1.30 %)		 n/a 41.43
(99.91 %)		 4,730
(0.02 %)		 972,599
(99.98 %)		 4,579,311
(41.26 %)		 606,731
(1.02 %)		 14,514,493
(36.58 %)		 54,753
(1.59 %)
411 hippopotamus (HIP001 2018)
GCA_002995585.1		 n/a 22,343
(1.70 %)		 31,687
(1.45 %)		 n/a 40.96
(94.63 %)		 153,125
(5.38 %)		 281,897
(94.62 %)		 3,952,905
(38.55 %)		 476,243
(1.97 %)		 14,216,817
(27.43 %)		 48,380
(1.43 %)
412 hippopotamus (mHipAmp2 hap1 2023)
GCA_030028035.1		 n/a 20,391
(1.63 %)		 20,668
(1.37 %)		 n/a 41.62
(100.00 %)		 83
(0.00 %)		 545
(100.00 %)		 3,778,764
(35.17 %)		 563,345
(3.63 %)		 13,524,869
(35.56 %)		 48,164
(1.90 %)
413 hippopotamus (v2 hap2 2023 refseq)
GCF_030028045.1		 64,153
(2.73 %)		 20,331
(1.62 %)		 20,633
(1.37 %)		 n/a 41.60
(100.00 %)		 226
(0.00 %)		 357
(100.00 %)		 3,783,440
(35.17 %)		 567,797
(3.38 %)		 13,462,531
(35.48 %)		 48,365
(1.91 %)
414 hirola (BS46 2019 Broad)
GCA_004027495.1		 n/a 22,264
(1.40 %)		 36,984
(1.26 %)		 n/a 42.31
(99.93 %)		 9,287
(0.03 %)		 545,176
(99.97 %)		 5,809,405
(48.62 %)		 465,001
(1.08 %)		 13,326,245
(42.35 %)		 48,312
(1.15 %)
415 Hispaniolan solenodon
GCA_004363575.1		 n/a 18,805
(1.55 %)		 27,454
(1.64 %)		 n/a 39.98
(99.96 %)		 5,186
(0.02 %)		 181,804
(99.98 %)		 2,669,787
(26.78 %)		 431,610
(1.04 %)		 13,429,711
(27.35 %)		 53,444
(2.30 %)
416 hispid cotton rat
GCA_004025045.1		 n/a 25,324
(1.49 %)		 31,681
(1.31 %)		 39,953
(1.43 %)		 39.77
(99.89 %)		 13,744
(0.05 %)		 897,290
(99.95 %)		 4,384,099
(28.17 %)		 1,132,313
(3.34 %)		 14,729,737
(38.08 %)		 17,558
(0.40 %)
417 hoary bat (Cryan_1219 primary hap 2025)
GCA_011751065.5		 n/a 18,411
(1.72 %)		 20,852
(1.49 %)		 n/a 41.93
(97.36 %)		 35,513
(2.65 %)		 37,763
(97.35 %)		 4,953,747
(48.32 %)		 773,513
(2.08 %)		 11,116,507
(38.56 %)		 61,320
(2.76 %)
418 Hoffmann's two-fingered sloth
GCA_000164785.2		 n/a 24,546
(1.30 %)		 30,273
(1.15 %)		 n/a 39.80
(98.09 %)		 101,085
(1.91 %)		 370,035
(98.09 %)		 5,145,551
(52.20 %)		 614,819
(1.62 %)		 17,932,269
(39.26 %)		 55,943
(1.04 %)
419 hog-nosed bat
GCA_004027555.1		 n/a 20,591
(1.30 %)		 39,589
(1.39 %)		 n/a 40.99
(99.88 %)		 6,224
(0.03 %)		 1,230,480
(99.97 %)		 4,081,924
(31.12 %)		 1,008,077
(2.20 %)		 12,068,828
(39.98 %)		 55,567
(2.02 %)
420 Honduran yellow-shouldered bat (v2.1 Veracruz 20B 2020)
GCF_014824575.3		 49,071
(2.78 %)		 17,588
(1.64 %)		 19,357
(1.60 %)		 n/a 42.32
(99.79 %)		 38,648
(0.21 %)		 25,848
(100.00 %)		 2,708,400
(27.89 %)		 366,870
(1.48 %)		 11,795,308
(31.27 %)		 59,066
(1.72 %)
421 horse (maternal 2024)
GCA_036418255.1		 n/a 16,789
(1.65 %)		 18,017
(1.36 %)		 n/a 42.07
(100.00 %)		 210
(0.00 %)		 821
(100.00 %)		 3,146,381
(34.68 %)		 430,664
(5.91 %)		 13,246,059
(32.62 %)		 37,293
(2.80 %)
422 horse (paternal hap 2024)
GCA_036426135.1		 n/a 19,073
(1.67 %)		 20,636
(1.38 %)		 n/a 42.08
(100.00 %)		 114
(0.00 %)		 602
(100.00 %)		 3,521,953
(35.39 %)		 461,571
(5.26 %)		 14,833,688
(32.77 %)		 43,527
(2.54 %)
423 horse (thoroughbred H_3958 2024)
GCF_041296265.1		 124,629
(3.91 %)		 18,742
(1.47 %)		 21,901
(1.39 %)		 n/a 42.90
(99.96 %)		 5
(0.04 %)		 625
(100.00 %)		 3,600,073
(33.96 %)		 709,759
(8.89 %)		 14,396,691
(35.72 %)		 48,802
(5.67 %)
424 horse (Twilight 2018)
GCF_002863925.1		 76,388
(4.03 %)		 18,997
(1.73 %)		 20,914
(1.42 %)		 113,346
(6.08 %)		 41.50
(99.62 %)		 6,294
(0.38 %)		 4,701
(100.00 %)		 4,080,319
(44.85 %)		 395,037
(1.44 %)		 15,169,517
(29.93 %)		 44,825
(1.77 %)
425 Hottentot golden mole (hap1 2026)
GCA_054824725.1		 n/a 23,545
(0.65 %)		 25,587
(0.69 %)		 n/a 41.75
(100.00 %)		 397
(0.00 %)		 2,994
(100.00 %)		 15,378,633
(76.69 %)		 1,709,398
(27.18 %)		 17,909,037
(71.38 %)		 48,162
(0.41 %)
426 house mouse (129S1_SvImJv1 2016)
GCA_001624185.1		 n/a 21,289
(2.22 %)		 18,626
(1.42 %)		 102,148
(4.16 %)		 41.77
(85.00 %)		 366,945
(15.05 %)		 62,882
(95.15 %)		 5,075,137
(40.38 %)		 1,400,072
(2.80 %)		 13,497,076
(26.20 %)		 16,957
(0.40 %)
427 house mouse (129S1_SvImJ_v3 2022)
GCA_921998555.2		 n/a 21,780
(2.13 %)		 19,436
(1.37 %)		 110,376
(4.47 %)		 41.79
(99.60 %)		 1,557
(0.40 %)		 188
(100.00 %)		 4,653,663
(40.74 %)		 1,550,342
(3.54 %)		 12,930,784
(35.48 %)		 23,211
(0.57 %)
428 house mouse (AKR_J v3 2022)
GCA_922000895.2		 n/a 21,721
(2.13 %)		 19,324
(1.37 %)		 110,654
(4.48 %)		 41.80
(99.85 %)		 2,714
(0.15 %)		 201
(100.00 %)		 4,645,513
(40.70 %)		 1,547,237
(3.56 %)		 13,016,932
(35.69 %)		 23,309
(0.57 %)
429 house mouse (alternate hap 2023)
GCA_949316305.1		 n/a 661
(0.88 %)		 720
(0.54 %)		 n/a 38.59
(100.00 %)		 n/a 1,806
(100.00 %)		 97,279
(72.21 %)		 40,071
(55.89 %)		 208,928
(64.94 %)		 506
(0.31 %)
430 house mouse (A_J v3 2022)
GCA_921998355.2		 n/a 21,869
(2.13 %)		 19,400
(1.37 %)		 110,389
(4.48 %)		 41.80
(99.39 %)		 608
(0.61 %)		 163
(100.00 %)		 4,668,553
(40.80 %)		 1,556,835
(3.58 %)		 12,995,938
(35.53 %)		 23,203
(0.56 %)
431 house mouse (BALB_cJ v3 2022)
GCA_921997145.2		 n/a 21,891
(2.13 %)		 19,499
(1.37 %)		 110,461
(4.47 %)		 41.79
(99.80 %)		 274
(0.20 %)		 217
(100.00 %)		 4,673,990
(40.79 %)		 1,560,327
(3.63 %)		 13,018,071
(35.70 %)		 23,196
(0.56 %)
432 house mouse (C3H_HeJ v3 2022)
GCA_921997125.2		 n/a 21,793
(2.13 %)		 19,516
(1.38 %)		 110,049
(4.46 %)		 41.79
(99.05 %)		 844
(0.95 %)		 174
(100.00 %)		 4,657,005
(40.76 %)		 1,551,107
(3.53 %)		 12,949,100
(35.32 %)		 23,262
(0.56 %)
433 house mouse (C57BL/6J 2012)
GCA_000185105.2		 n/a 21,313
(2.28 %)		 19,336
(1.53 %)		 n/a 41.71
(91.01 %)		 189,267
(9.02 %)		 191,581
(90.98 %)		 4,937,032
(40.05 %)		 1,409,489
(2.64 %)		 13,090,524
(27.69 %)		 16,523
(0.40 %)
434 house mouse (C57BL_6J T2T 2024)
GCA_964188535.1		 n/a 21,496
(1.92 %)		 19,278
(1.25 %)		 n/a 41.31
(99.85 %)		 108
(0.15 %)		 345
(99.85 %)		 4,519,975
(46.81 %)		 1,564,206
(14.33 %)		 12,267,542
(42.16 %)		 23,119
(0.55 %)
435 house mouse (CBA_J v3 2022)
GCA_921998905.2		 n/a 21,829
(2.13 %)		 19,841
(1.39 %)		 110,858
(4.48 %)		 41.79
(99.52 %)		 658
(0.48 %)		 145
(100.00 %)		 4,658,032
(40.77 %)		 1,552,298
(3.59 %)		 12,948,038
(35.52 %)		 23,232
(0.56 %)
436 house mouse (DBA_2J v3 2022)
GCA_921998315.2		 n/a 22,302
(2.08 %)		 19,749
(1.35 %)		 113,269
(4.42 %)		 41.72
(100.00 %)		 153
(0.00 %)		 361
(100.00 %)		 4,785,676
(41.69 %)		 1,597,598
(4.56 %)		 13,190,158
(36.58 %)		 24,140
(0.59 %)
437 house mouse (FVB_NJ v3 2022)
GCA_921998635.2		 n/a 21,633
(2.15 %)		 19,565
(1.40 %)		 110,246
(4.50 %)		 41.82
(98.35 %)		 6,244
(1.65 %)		 384
(100.00 %)		 4,621,601
(40.42 %)		 1,537,622
(3.48 %)		 12,818,729
(34.77 %)		 22,696
(0.55 %)
438 house mouse (LP_J v3 2022)
GCA_947599735.1		 n/a 22,452
(1.91 %)		 19,841
(1.23 %)		 110,073
(3.98 %)		 41.29
(99.99 %)		 386
(0.01 %)		 515
(100.00 %)		 4,839,574
(46.33 %)		 1,645,163
(11.88 %)		 12,936,515
(41.49 %)		 24,374
(0.54 %)
439 house mouse (NOD_ShiLtJ v3 2022)
GCA_921998325.2		 n/a 21,797
(2.13 %)		 19,521
(1.38 %)		 109,890
(4.48 %)		 41.80
(99.50 %)		 1,462
(0.50 %)		 170
(100.00 %)		 4,650,016
(40.74 %)		 1,547,220
(3.54 %)		 12,918,125
(35.45 %)		 23,253
(0.56 %)
440 house mouse (NZO_HlLtJ v3 2022)
GCA_947593165.1		 n/a 22,481
(1.93 %)		 19,932
(1.26 %)		 109,670
(4.03 %)		 41.34
(100.00 %)		 234
(0.00 %)		 441
(100.00 %)		 4,822,230
(45.92 %)		 1,637,027
(11.19 %)		 13,082,730
(41.04 %)		 24,187
(0.54 %)
441 house mouse (primary hap 2023)
GCA_949316315.1		 n/a 22,351
(1.96 %)		 19,629
(1.26 %)		 n/a 41.38
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 179
(100.00 %)		 4,774,018
(45.31 %)		 1,620,102
(10.50 %)		 13,181,250
(40.47 %)		 23,955
(0.54 %)
442 house mouse C57BL/6J 2020 GRC
GCF_000001635.27		 136,224
(4.84 %)		 22,409
(2.02 %)		 19,480
(1.31 %)		 140,725
(4.83 %)		 41.67
(97.30 %)		 334
(2.70 %)		 22,273
(97.30 %)		 5,361,085
(45.51 %)		 1,641,063
(3.41 %)		 12,722,791
(36.04 %)		 23,794
(0.53 %)
443 house mouse C57BL_6NJ (2016)
GCA_001632555.1		 n/a 21,177
(2.23 %)		 18,495
(1.42 %)		 103,002
(4.20 %)		 41.76
(82.53 %)		 410,660
(17.53 %)		 49,821
(96.37 %)		 5,081,049
(40.22 %)		 1,392,942
(2.58 %)		 13,476,268
(25.21 %)		 16,877
(0.39 %)
444 house mouse C57BL_6NJ (2022)
GCA_921999865.2		 n/a 21,817
(2.13 %)		 19,349
(1.37 %)		 n/a 41.79
(99.76 %)		 1,127
(0.24 %)		 214
(100.00 %)		 4,661,104
(40.76 %)		 1,552,079
(3.56 %)		 12,953,662
(35.57 %)		 23,204
(0.56 %)
445 humpback whale (KW2013002 2024)
GCA_041834305.1		 n/a 19,463
(1.32 %)		 22,424
(1.19 %)		 n/a 42.05
(100.00 %)		 88
(0.00 %)		 1,355
(100.00 %)		 4,164,459
(34.02 %)		 1,281,751
(18.33 %)		 12,412,281
(48.28 %)		 82,412
(1.67 %)
446 Iberian mole (v2.1 TD23 2020)
GCF_014898055.3		 56,986
(3.41 %)		 18,431
(1.69 %)		 20,317
(1.59 %)		 n/a 41.89
(99.89 %)		 3,575
(0.11 %)		 3,202
(100.00 %)		 2,635,974
(23.38 %)		 496,514
(1.29 %)		 10,969,546
(32.61 %)		 47,466
(2.89 %)
447 Indian false vampire
GCA_004026885.1		 n/a 20,067
(1.37 %)		 36,544
(1.53 %)		 32,548
(1.37 %)		 40.84
(99.83 %)		 6,266
(0.02 %)		 1,909,067
(99.98 %)		 4,096,409
(31.50 %)		 699,311
(1.81 %)		 12,307,198
(39.96 %)		 92,830
(3.12 %)
448 Indian flying fox
GCF_902729225.1		 64,763
(3.85 %)		 18,222
(2.01 %)		 23,187
(1.82 %)		 45,389
(2.18 %)		 39.83
(99.10 %)		 17,500
(0.90 %)		 16,113
(100.00 %)		 2,972,300
(34.11 %)		 487,157
(1.49 %)		 12,486,528
(27.37 %)		 57,869
(3.73 %)
449 Indian short-nosed fruit bat (CYSPWHU 2023)
GCA_030015415.1		 n/a 17,560
(2.04 %)		 21,687
(1.83 %)		 n/a 39.77
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 181
(100.00 %)		 2,598,385
(30.48 %)		 486,921
(1.41 %)		 11,828,726
(27.28 %)		 37,476
(5.58 %)
450 Indochinese shrew (US011 2019 Broad)
GCA_004027635.1		 n/a 18,870
(0.51 %)		 55,636
(0.81 %)		 n/a 39.81
(99.83 %)		 5,267
(0.02 %)		 2,420,679
(99.98 %)		 4,130,068
(16.60 %)		 1,663,335
(3.30 %)		 18,728,711
(46.19 %)		 31,453
(0.55 %)
451 Indus River dolphin
GCA_004363435.1		 n/a 24,321
(1.30 %)		 47,065
(1.14 %)		 n/a 41.72
(99.88 %)		 11,702
(0.04 %)		 1,110,492
(99.96 %)		 5,093,308
(45.60 %)		 845,860
(1.72 %)		 13,162,111
(41.37 %)		 68,257
(1.40 %)
452 Inner Mongolia cashmere goat (2024)
GCA_041735815.1		 n/a 19,123
(1.40 %)		 21,508
(1.26 %)		 n/a 43.19
(100.00 %)		 n/a 31
(100.00 %)		 3,982,368
(23.76 %)		 650,129
(7.44 %)		 12,858,872
(44.33 %)		 99,144
(2.87 %)
453 intermediate fruit-eating bat (hap1 2024)
GCA_038363145.1		 n/a 18,022
(1.56 %)		 19,824
(1.51 %)		 n/a 42.28
(100.00 %)		 81
(0.00 %)		 419
(100.00 %)		 2,827,417
(26.82 %)		 371,479
(4.97 %)		 11,603,093
(34.64 %)		 71,574
(2.28 %)
454 intermediate horseshoe bat (China 20211001_DDa alternate hap 2024)
GCA_043727925.1		 n/a 17,564
(1.87 %)		 20,064
(1.66 %)		 n/a 41.05
(100.00 %)		 n/a 2,194
(100.00 %)		 3,406,902
(41.38 %)		 537,189
(4.88 %)		 11,454,141
(30.99 %)		 32,338
(1.09 %)
455 intermediate horseshoe bat (China 20211001_DDa primary hap 2024)
GCA_043728065.1		 n/a 18,239
(1.76 %)		 20,378
(1.53 %)		 n/a 41.40
(100.00 %)		 37
(0.00 %)		 2,195
(100.00 %)		 3,438,644
(42.82 %)		 584,006
(9.54 %)		 12,207,998
(35.49 %)		 34,491
(1.02 %)
456 intermediate roundleaf bat (primary hap 2023)
GCA_031876335.1		 n/a 19,064
(1.67 %)		 20,800
(1.49 %)		 n/a 41.55
(100.00 %)		 119
(0.00 %)		 69
(100.00 %)		 3,393,548
(30.92 %)		 723,545
(6.58 %)		 12,073,117
(35.40 %)		 43,736
(1.20 %)
457 jaguar
GCF_046562875.1		 75,496
(3.58 %)		 18,871
(1.64 %)		 21,072
(1.41 %)		 n/a 41.76
(100.00 %)		 200
(0.00 %)		 86
(100.00 %)		 5,097,978
(41.83 %)		 982,066
(2.10 %)		 13,365,317
(34.16 %)		 66,000
(2.75 %)
458 jaguar (BS21 2019)
GCA_004023805.1		 n/a 21,431
(1.51 %)		 32,835
(1.35 %)		 n/a 41.70
(99.89 %)		 21,329
(0.09 %)		 460,121
(99.91 %)		 5,420,861
(43.75 %)		 1,049,353
(1.93 %)		 13,848,545
(34.90 %)		 71,066
(2.37 %)
459 jaguar (hap1 2025 genbank)
GCA_046562885.1		 n/a 17,882
(1.68 %)		 19,103
(1.41 %)		 n/a 41.66
(100.00 %)		 140
(0.00 %)		 115
(100.00 %)		 4,622,385
(41.25 %)		 893,297
(1.89 %)		 12,851,116
(33.53 %)		 61,319
(2.55 %)
460 jaguar (hap1 2025 refseq)
GCF_046562885.1		 72,531
(3.71 %)		 17,886
(1.68 %)		 19,296
(1.42 %)		 n/a 41.66
(100.00 %)		 140
(0.00 %)		 116
(100.00 %)		 4,733,281
(41.33 %)		 893,299
(1.89 %)		 12,851,153
(33.54 %)		 61,319
(2.55 %)
461 jaguar (hap1 2025)
GCA_046562885.2		 n/a 17,884
(1.68 %)		 19,104
(1.41 %)		 n/a 41.66
(100.00 %)		 140
(0.00 %)		 115
(100.00 %)		 4,733,274
(41.33 %)		 893,297
(1.89 %)		 12,851,116
(33.53 %)		 61,319
(2.55 %)
462 jaguar (hap2 2025)
GCA_046562875.1		 n/a 18,867
(1.64 %)		 20,784
(1.40 %)		 n/a 41.76
(100.00 %)		 200
(0.00 %)		 85
(100.00 %)		 4,977,843
(41.75 %)		 982,064
(2.10 %)		 13,365,332
(34.16 %)		 66,000
(2.75 %)
463 jaguar (hap2 2025)
GCA_046562875.2		 n/a 18,869
(1.64 %)		 20,781
(1.40 %)		 n/a 41.76
(100.00 %)		 200
(0.00 %)		 85
(100.00 %)		 5,097,971
(41.83 %)		 982,064
(2.10 %)		 13,365,332
(34.16 %)		 66,000
(2.75 %)
464 jaguar (Sample0147 2023)
GCF_028533385.1		 71,578
(4.12 %)		 19,122
(1.67 %)		 21,950
(1.36 %)		 n/a 41.58
(99.31 %)		 56,371
(0.70 %)		 36,243
(100.00 %)		 4,552,854
(33.37 %)		 897,371
(1.63 %)		 13,732,912
(32.89 %)		 63,777
(2.41 %)
465 jaguarundi
GCF_014898765.1		 72,564
(3.15 %)		 18,602
(1.64 %)		 20,510
(1.39 %)		 n/a 41.75
(97.85 %)		 42,499
(2.16 %)		 10,948
(100.00 %)		 5,035,745
(43.29 %)		 907,329
(1.61 %)		 13,590,905
(33.57 %)		 69,090
(2.29 %)
466 Jamaican fruit-eating bat (1a 2020 Wuhan U)
GCF_014825515.1		 48,692
(2.72 %)		 19,921
(1.66 %)		 23,614
(1.68 %)		 39,384
(2.12 %)		 41.95
(98.87 %)		 110,840
(1.13 %)		 56,740
(100.00 %)		 2,972,388
(28.79 %)		 405,474
(2.15 %)		 12,458,880
(30.65 %)		 61,973
(1.87 %)
467 Jamaican fruit-eating bat (2021)
GCF_021234435.1		 55,114
(3.18 %)		 17,875
(1.68 %)		 19,958
(1.66 %)		 n/a 42.00
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 868
(100.00 %)		 2,697,287
(28.17 %)		 318,700
(0.84 %)		 11,750,329
(31.61 %)		 61,951
(1.93 %)
468 Japanese wild mouse (2022)
GCA_921999095.2		 n/a 23,292
(2.05 %)		 20,114
(1.31 %)		 n/a 41.71
(100.00 %)		 397
(0.00 %)		 1,449
(100.00 %)		 4,952,306
(42.53 %)		 1,635,456
(4.60 %)		 12,838,321
(38.56 %)		 24,168
(0.56 %)
469 Java mouse-deer (US108 2019 Broad)
GCA_004024965.1		 n/a 23,081
(1.38 %)		 38,181
(1.41 %)		 n/a 42.73
(99.91 %)		 2,829
(0.01 %)		 1,159,819
(99.99 %)		 4,791,310
(34.97 %)		 448,498
(1.92 %)		 13,175,375
(39.89 %)		 68,778
(2.92 %)
470 killer whale (2022)
GCF_937001465.1		 78,479
(3.76 %)		 18,710
(1.51 %)		 21,101
(1.30 %)		 34,448
(1.49 %)		 41.91
(100.00 %)		 123
(0.00 %)		 448
(100.00 %)		 3,955,401
(36.81 %)		 844,672
(9.94 %)		 12,233,568
(41.63 %)		 77,307
(3.08 %)
471 killer whale (alternate hap 2022)
GCA_937001455.1		 n/a 14,982
(1.50 %)		 19,185
(1.30 %)		 n/a 42.13
(100.00 %)		 n/a 12,410
(100.00 %)		 2,752,892
(35.61 %)		 589,217
(10.15 %)		 8,371,032
(41.11 %)		 57,347
(3.41 %)
472 killer whale (Morgan 2013)
GCF_000331955.2		 70,972
(3.55 %)		 18,736
(1.86 %)		 20,365
(1.48 %)		 n/a 41.35
(94.82 %)		 78,441
(5.20 %)		 80,100
(94.80 %)		 3,978,339
(43.98 %)		 555,737
(1.13 %)		 12,773,973
(31.51 %)		 61,145
(1.59 %)
473 killer whale (primary hap 2022)
GCA_937001465.1		 n/a 18,847
(1.59 %)		 21,099
(1.30 %)		 n/a 41.91
(100.00 %)		 123
(0.00 %)		 448
(100.00 %)		 4,361,647
(43.69 %)		 844,672
(9.94 %)		 12,233,548
(41.63 %)		 77,307
(3.08 %)
474 klipspringer (KSP-560 2019)
GCA_006410675.1		 n/a 22,317
(1.37 %)		 27,606
(1.31 %)		 n/a 42.04
(89.74 %)		 371,212
(10.28 %)		 396,104
(89.72 %)		 6,379,883
(45.04 %)		 726,514
(5.64 %)		 15,472,957
(34.77 %)		 50,579
(1.00 %)
475 koala (Bilbo 61053 2022)
GCA_003287225.2		 n/a 17,087
(0.81 %)		 14,711
(0.86 %)		 n/a 39.05
(100.00 %)		 669
(0.00 %)		 1,246
(100.00 %)		 6,280,029
(29.77 %)		 1,123,294
(2.02 %)		 21,796,316
(39.24 %)		 15,957
(0.35 %)
476 koala (Bilbo 61053 2022)
GCF_003287225.1		 50,393
(2.58 %)		 17,125
(0.85 %)		 14,711
(0.86 %)		 n/a 39.05
(100.00 %)		 669
(0.00 %)		 1,246
(100.00 %)		 10,370,789
(60.23 %)		 1,123,294
(2.02 %)		 21,796,035
(39.24 %)		 15,957
(0.35 %)
477 koala (Bilbo 61053 2025)
GCA_003287225.3		 n/a 17,123
(0.85 %)		 14,700
(0.86 %)		 n/a 39.06
(100.00 %)		 664
(0.00 %)		 1,239
(100.00 %)		 10,358,875
(60.22 %)		 1,121,543
(2.02 %)		 21,754,367
(39.21 %)		 15,940
(0.35 %)
478 Kuhl's pipistrelle (2020)
GCF_014108245.1		 65,654
(3.37 %)		 17,918
(1.89 %)		 20,819
(1.86 %)		 n/a 42.57
(99.31 %)		 394
(0.69 %)		 202
(100.00 %)		 2,897,422
(23.58 %)		 797,420
(2.76 %)		 10,057,100
(34.56 %)		 55,965
(2.99 %)
479 Kuhl's pipistrelle (primary hap 2025)
GCA_014108245.2		 n/a 17,770
(2.01 %)		 20,646
(1.86 %)		 n/a 42.57
(99.31 %)		 522
(0.69 %)		 82
(100.00 %)		 4,542,064
(41.94 %)		 797,434
(2.76 %)		 10,057,037
(34.56 %)		 55,766
(2.87 %)
480 large flying fox
GCF_000151845.1		 52,243
(3.10 %)		 18,454
(1.91 %)		 23,631
(1.73 %)		 n/a 39.82
(91.80 %)		 189,340
(8.24 %)		 225,433
(91.76 %)		 3,117,045
(36.49 %)		 504,277
(3.03 %)		 13,025,556
(25.00 %)		 78,404
(3.24 %)
481 large Japanese field mouse (IB14-021 2017)
GCA_002335545.1		 n/a 22,630
(1.74 %)		 33,810
(1.26 %)		 n/a 42.04
(57.78 %)		 4,289,924
(42.35 %)		 4,626,044
(57.65 %)		 3,638,537
(31.76 %)		 1,048,253
(1.87 %)		 12,039,926
(16.61 %)		 19,817
(0.34 %)
482 large tree shrew (BS70 2022)
GCA_026018925.1		 n/a 21,678
(1.34 %)		 22,317
(1.25 %)		 n/a 42.17
(100.00 %)		 1,188
(0.00 %)		 1,198
(100.00 %)		 5,530,547
(22.20 %)		 1,357,640
(10.13 %)		 14,334,312
(46.09 %)		 123,453
(2.17 %)
483 large tree shrew (BS70 2025)
GCA_026018925.2		 n/a 21,760
(1.34 %)		 22,479
(1.26 %)		 n/a 42.17
(100.00 %)		 1,263
(0.00 %)		 1,209
(100.00 %)		 6,876,878
(36.82 %)		 1,357,671
(10.13 %)		 14,333,971
(46.09 %)		 123,449
(2.17 %)
484 least weasel (hap1.1 2025 genbank)
GCA_964662115.1		 n/a 19,085
(1.11 %)		 23,074
(1.09 %)		 n/a 43.54
(99.98 %)		 2,938
(0.02 %)		 3,189
(100.00 %)		 4,687,333
(25.05 %)		 908,610
(10.98 %)		 12,922,050
(49.64 %)		 68,749
(2.22 %)
485 least weasel (hap1.1 2025 refseq)
GCF_964662115.1		 87,413
(2.56 %)		 19,035
(1.16 %)		 23,079
(1.09 %)		 n/a 43.54
(99.98 %)		 2,938
(0.02 %)		 6,117
(99.98 %)		 6,208,263
(57.37 %)		 908,609
(10.98 %)		 12,922,009
(49.64 %)		 68,748
(2.22 %)
486 least weasel (hap2.1 2025)
GCA_964662095.1		 n/a 18,255
(1.29 %)		 22,201
(1.27 %)		 n/a 42.68
(99.98 %)		 2,709
(0.02 %)		 4,948
(99.98 %)		 4,268,233
(27.47 %)		 787,850
(6.40 %)		 12,592,088
(42.54 %)		 62,416
(2.34 %)
487 leopard (Hobbes primary hap 2022)
GCF_024362965.1		 70,501
(3.29 %)		 18,472
(1.56 %)		 20,388
(1.41 %)		 n/a 41.75
(99.99 %)		 335
(0.01 %)		 382
(100.00 %)		 4,634,038
(33.80 %)		 932,991
(2.25 %)		 13,686,652
(34.03 %)		 65,793
(2.64 %)
488 leopard (Maewha 2016 refseq)
GCF_001857705.1		 73,279
(3.20 %)		 18,881
(1.63 %)		 21,010
(1.44 %)		 n/a 41.71
(96.17 %)		 214,953
(3.85 %)		 265,330
(96.15 %)		 5,247,029
(42.87 %)		 1,059,446
(5.13 %)		 14,265,573
(32.20 %)		 77,001
(2.45 %)
489 leopard cat
GCF_016509475.1		 59,965
(3.05 %)		 18,472
(1.65 %)		 19,934
(1.38 %)		 n/a 41.80
(100.00 %)		 56
(0.00 %)		 123
(100.00 %)		 4,978,115
(43.28 %)		 901,754
(1.84 %)		 13,596,535
(34.23 %)		 67,390
(2.50 %)
490 Leschenault's rousette (2020)
GCA_015472975.1		 n/a 17,815
(2.05 %)		 23,917
(1.90 %)		 n/a 40.13
(99.14 %)		 100,669
(0.88 %)		 108,810
(99.12 %)		 2,688,705
(31.20 %)		 428,968
(1.19 %)		 12,245,385
(26.51 %)		 58,118
(6.81 %)
491 lesser Egyptian jerboa (2021)
GCF_020740685.1		 51,730
(1.99 %)		 20,129
(1.24 %)		 22,089
(1.24 %)		 40,414
(1.76 %)		 42.00
(99.52 %)		 561
(0.48 %)		 160
(100.00 %)		 7,346,291
(41.25 %)		 1,187,587
(2.92 %)		 14,222,177
(44.13 %)		 34,688
(0.86 %)
492 lesser Egyptian jerboa (alternate hap 2021)
GCA_020740715.1		 n/a 17,777
(1.27 %)		 19,232
(1.28 %)		 n/a 42.13
(92.75 %)		 2,875
(7.25 %)		 508
(100.00 %)		 6,476,967
(33.93 %)		 999,133
(2.78 %)		 11,809,834
(40.52 %)		 29,872
(0.82 %)
493 lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 refseq)
GCF_000280705.1		 25,978
(1.44 %)		 19,408
(1.38 %)		 20,312
(1.35 %)		 n/a 41.87
(87.17 %)		 326,464
(12.87 %)		 337,360
(87.13 %)		 6,125,934
(38.31 %)		 832,825
(1.53 %)		 13,661,612
(33.98 %)		 26,669
(0.59 %)
494 lesser Egyptian jerboa (primary hap 2021)
GCA_020740685.1		 n/a 20,129
(1.24 %)		 22,086
(1.24 %)		 n/a 42.00
(99.52 %)		 561
(0.48 %)		 159
(100.00 %)		 6,288,871
(38.51 %)		 1,187,585
(2.92 %)		 14,221,962
(44.13 %)		 34,688
(0.86 %)
495 lesser false vampire bat (Vietnam 20211001_DDb alternate hap 2024)
GCA_043880535.1		 n/a 1,572
(0.57 %)		 3,175
(1.45 %)		 n/a 41.82
(100.00 %)		 n/a 2,678
(100.00 %)		 286,260
(35.16 %)		 107,917
(13.71 %)		 1,232,326
(51.86 %)		 5,144
(2.91 %)
496 lesser false vampire bat (Vietnam 20211001_DDb primary hap 2024)
GCA_043880595.1		 n/a 18,484
(1.87 %)		 24,356
(1.84 %)		 n/a 41.88
(97.91 %)		 866
(2.09 %)		 617
(99.68 %)		 3,419,622
(36.65 %)		 663,182
(2.53 %)		 11,508,574
(30.58 %)		 84,174
(4.85 %)
497 lesser horseshoe bat (hap1 2024)
GCA_964194185.1		 n/a 19,031
(1.88 %)		 21,003
(1.63 %)		 n/a 40.81
(99.99 %)		 1,627
(0.01 %)		 723
(100.00 %)		 3,133,745
(33.46 %)		 660,064
(3.79 %)		 11,720,176
(32.32 %)		 35,414
(1.75 %)
498 lesser horseshoe bat (hap2 2024)
GCA_964194215.1		 n/a 18,875
(1.72 %)		 21,166
(1.58 %)		 n/a 41.18
(99.99 %)		 1,648
(0.01 %)		 2,727
(99.99 %)		 3,160,659
(34.00 %)		 696,130
(6.23 %)		 11,662,645
(34.26 %)		 36,176
(1.80 %)
499 lesser horseshoe bat (hap2.2 2025)
GCA_964194215.2		 n/a 18,974
(1.81 %)		 21,191
(1.58 %)		 n/a 41.18
(100.00 %)		 56
(0.00 %)		 1,036
(100.00 %)		 3,652,081
(41.23 %)		 696,117
(6.18 %)		 11,690,617
(34.28 %)		 36,376
(1.84 %)
500 lesser horseshoe bat (mRhiHip2.hap1.1 2024)
GCF_964194185.1		 59,989
(3.28 %)		 18,874
(1.86 %)		 21,002
(1.63 %)		 n/a 40.81
(99.99 %)		 1,627
(0.01 %)		 723
(100.00 %)		 3,621,058
(40.92 %)		 660,064
(3.79 %)		 11,719,468
(32.32 %)		 35,414
(1.75 %)
501 lesser noctule (v2 hap1 2025)
GCA_964264875.2		 n/a 18,342
(1.54 %)		 22,974
(1.62 %)		 n/a 43.04
(100.00 %)		 302
(0.00 %)		 588
(100.00 %)		 4,258,096
(37.31 %)		 1,289,911
(11.51 %)		 9,694,758
(42.52 %)		 65,974
(2.80 %)
502 lesser noctule (v2 hap2 2025)
GCA_964264895.2		 n/a 17,492
(1.62 %)		 22,188
(1.72 %)		 n/a 43.10
(100.00 %)		 247
(0.00 %)		 920
(100.00 %)		 3,886,341
(36.52 %)		 1,139,308
(10.89 %)		 9,356,457
(40.65 %)		 62,254
(3.00 %)
503 lesser panda (RP43 2017)
GCA_002007465.1		 n/a 19,120
(1.69 %)		 20,591
(1.50 %)		 n/a 41.60
(98.56 %)		 137,333
(1.45 %)		 148,922
(98.55 %)		 4,513,888
(40.87 %)		 692,778
(1.62 %)		 13,691,859
(31.36 %)		 64,369
(2.52 %)
504 lesser sac-winged bat (alternate hap 2024)
GCA_036851165.1		 n/a 18,593
(1.42 %)		 23,334
(1.46 %)		 n/a 41.84
(100.00 %)		 n/a 4,715
(100.00 %)		 6,471,175
(42.04 %)		 1,030,472
(2.62 %)		 12,509,696
(42.43 %)		 96,414
(2.05 %)
505 lesser sac-winged bat (primary hap 2024 refseq)
GCF_036850995.1		 53,210
(2.49 %)		 18,323
(1.42 %)		 21,350
(1.39 %)		 n/a 41.84
(99.24 %)		 573
(0.76 %)		 168
(100.00 %)		 4,224,344
(28.69 %)		 1,030,576
(2.60 %)		 12,591,989
(42.30 %)		 98,189
(2.06 %)
506 lion
GCF_018350215.1		 67,745
(2.86 %)		 17,956
(1.69 %)		 19,033
(1.40 %)		 61,242
(3.04 %)		 41.71
(100.00 %)		 55
(0.00 %)		 99
(100.00 %)		 4,666,951
(42.23 %)		 889,987
(1.87 %)		 13,151,686
(33.40 %)		 62,675
(2.56 %)
507 little brown bat
GCF_000147115.1		 50,660
(2.76 %)		 19,314
(1.86 %)		 22,683
(1.70 %)		 n/a 42.50
(96.66 %)		 61,131
(3.35 %)		 72,785
(96.65 %)		 3,682,263
(37.05 %)		 634,854
(2.15 %)		 10,841,759
(33.45 %)		 57,630
(1.79 %)
508 little pocket mouse (longimembris alternate hap 2022)
GCA_024363435.1		 n/a 19,150
(1.52 %)		 23,435
(1.64 %)		 n/a 42.08
(100.00 %)		 229
(0.00 %)		 718
(100.00 %)		 n/a 1,051,300
(12.43 %)		 9,858,628
(43.20 %)		 48,101
(2.62 %)
509 little pocket mouse (longimembris primary hap 2022)
GCA_024363575.1		 n/a 19,760
(1.50 %)		 24,317
(1.63 %)		 n/a 42.09
(100.00 %)		 215
(0.00 %)		 1,135
(100.00 %)		 3,913,744
(28.43 %)		 1,095,577
(12.70 %)		 10,273,833
(43.74 %)		 49,636
(2.61 %)
510 little tube-nosed bat
GCA_004026665.1		 n/a 22,009
(1.26 %)		 45,725
(1.35 %)		 n/a 43.80
(99.90 %)		 6,795
(0.03 %)		 886,972
(99.97 %)		 3,372,804
(23.57 %)		 1,014,476
(3.00 %)		 11,948,592
(41.18 %)		 71,530
(2.05 %)
511 long-finned pilot whale (alternate hap 2024)
GCA_963455345.2		 n/a 17,552
(1.56 %)		 25,954
(1.35 %)		 n/a 42.12
(100.00 %)		 n/a 28,097
(100.00 %)		 3,815,058
(48.74 %)		 789,873
(8.23 %)		 9,845,230
(38.66 %)		 58,137
(3.47 %)
512 long-finned pilot whale (v2 primary hap 2024 refseq)
GCF_963455315.2		 61,447
(2.80 %)		 18,725
(1.51 %)		 20,946
(1.39 %)		 n/a 42.38
(99.99 %)		 1,084
(0.01 %)		 2,076
(99.99 %)		 4,125,452
(35.62 %)		 1,577,896
(12.03 %)		 12,347,170
(42.01 %)		 71,822
(5.51 %)
513 long-finned pilot whale (X-22926-18 2019)
GCF_006547405.1		 66,117
(3.28 %)		 18,772
(1.80 %)		 21,031
(1.46 %)		 33,672
(1.78 %)		 41.29
(99.58 %)		 14,859
(0.42 %)		 20,999
(99.58 %)		 3,962,125
(45.58 %)		 557,247
(1.11 %)		 12,616,535
(34.70 %)		 62,905
(1.69 %)
514 long-footed potoroo (2021)
GCA_904812075.1		 n/a 278
(19.06 %)		 223
(16.20 %)		 n/a 51.14
(99.50 %)		 n/a 1,479
(100.00 %)		 194
(1.83 %)		 54
(0.32 %)		 2,088
(5.90 %)		 51
(2.47 %)
515 long-tailed chinchilla
GCF_000276665.1		 54,854
(2.98 %)		 18,096
(1.59 %)		 19,514
(1.52 %)		 n/a 41.06
(95.56 %)		 78,817
(4.46 %)		 81,656
(95.54 %)		 4,018,866
(30.94 %)		 607,082
(1.15 %)		 13,528,234
(28.15 %)		 46,931
(1.25 %)
516 long-tongued fruit bat (US102 2019 Broad)
GCA_004027375.1		 n/a 19,208
(1.99 %)		 31,180
(1.92 %)		 n/a 39.56
(99.97 %)		 2,056
(0.01 %)		 174,041
(99.99 %)		 2,893,453
(32.61 %)		 597,516
(1.76 %)		 12,093,608
(28.14 %)		 63,015
(4.70 %)
517 Lowland paca
GCA_004365215.1		 n/a 21,953
(0.62 %)		 56,356
(0.80 %)		 n/a 40.83
(99.78 %)		 3,060
(0.01 %)		 3,771,510
(99.99 %)		 5,892,507
(29.20 %)		 802,811
(1.38 %)		 18,630,883
(38.61 %)		 61,715
(0.94 %)
518 Malayan pangolin (MJ-LG 2024)
GCF_040802235.1		 87,404
(4.24 %)		 18,382
(1.54 %)		 19,802
(1.30 %)		 n/a 41.03
(100.00 %)		 90
(0.00 %)		 63
(100.00 %)		 3,146,889
(38.39 %)		 384,539
(2.15 %)		 12,642,995
(34.68 %)		 48,454
(1.30 %)
519 Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 refseq)
GCF_001685135.1		 48,591
(2.76 %)		 19,458
(1.57 %)		 24,783
(1.38 %)		 41,272
(1.95 %)		 40.78
(92.27 %)		 984,658
(7.81 %)		 80,670
(100.00 %)		 3,064,599
(35.21 %)		 866,309
(3.08 %)		 13,310,859
(28.76 %)		 35,558
(0.84 %)
520 Malayan pangolin YNU ManJav 2.0
GCF_014570535.1		 68,043
(3.50 %)		 18,167
(1.72 %)		 20,453
(1.54 %)		 n/a 40.83
(91.78 %)		 57,746
(8.23 %)		 17,969
(100.00 %)		 2,864,567
(34.23 %)		 277,996
(1.69 %)		 12,659,207
(25.72 %)		 33,486
(1.00 %)
521 marsupial mole (Waite Creek area ABTC07570 2025)
GCA_048126345.1		 n/a 25,281
(0.80 %)		 18,740
(0.87 %)		 n/a 37.80
(99.99 %)		 196
(0.01 %)		 889
(99.99 %)		 6,538,990
(26.08 %)		 1,450,668
(2.40 %)		 21,374,371
(47.19 %)		 17,923
(0.30 %)
522 Masai giraffe (MA1 2016 Penn St)
GCA_001651235.1		 n/a 20,950
(1.52 %)		 28,854
(1.33 %)		 n/a 41.39
(96.50 %)		 257,672
(3.48 %)		 770,838
(96.52 %)		 5,502,479
(43.94 %)		 531,418
(2.64 %)		 13,936,018
(36.18 %)		 40,504
(1.02 %)
523 meadow jumping mouse
GCA_004024765.1		 n/a 22,236
(1.08 %)		 44,719
(1.21 %)		 n/a 42.31
(99.88 %)		 7,610
(0.03 %)		 1,165,710
(99.97 %)		 6,135,446
(33.31 %)		 1,525,146
(3.34 %)		 13,854,475
(39.91 %)		 26,633
(0.68 %)
524 meadow vole (hap1 2024 genbank)
GCA_037038515.1		 n/a 19,134
(1.78 %)		 20,672
(1.55 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 60
(0.00 %)		 181
(100.00 %)		 4,818,689
(41.90 %)		 962,362
(4.16 %)		 12,161,222
(34.42 %)		 23,781
(0.74 %)
525 meadow vole (hap1 2024 refseq)
GCF_037038515.1		 56,969
(2.88 %)		 19,974
(1.74 %)		 20,672
(1.55 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 60
(0.00 %)		 180
(100.00 %)		 4,116,239
(33.62 %)		 962,362
(4.16 %)		 12,161,153
(34.42 %)		 23,781
(0.74 %)
526 meadow vole (hap2 2024)
GCA_037039175.1		 n/a 19,001
(1.82 %)		 20,271
(1.68 %)		 n/a 42.58
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 143
(100.00 %)		 3,141,368
(21.37 %)		 898,900
(4.24 %)		 11,475,531
(32.14 %)		 22,186
(0.75 %)
527 meerkat (VVHF042 2019 DNA Zoo refseq)
GCF_006229205.1		 58,806
(2.67 %)		 19,009
(1.64 %)		 19,088
(1.36 %)		 n/a 41.68
(99.72 %)		 65,245
(0.28 %)		 63,791
(100.00 %)		 4,564,931
(40.13 %)		 634,179
(1.21 %)		 13,631,635
(32.17 %)		 64,858
(2.22 %)
528 melon-headed whale (hap1 2025)
GCA_051427945.1		 n/a 18,643
(1.64 %)		 20,840
(1.43 %)		 n/a 42.07
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 204
(100.00 %)		 5,100,394
(52.00 %)		 1,312,199
(7.54 %)		 12,322,262
(38.99 %)		 69,873
(4.58 %)
529 melon-headed whale (hap2 2025)
GCA_051427955.1		 n/a 17,790
(1.73 %)		 19,805
(1.50 %)		 n/a 41.92
(100.00 %)		 65
(0.00 %)		 167
(100.00 %)		 4,595,309
(50.05 %)		 975,539
(5.44 %)		 11,730,402
(37.10 %)		 65,883
(3.79 %)
530 Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 alternate hap 2022)
GCA_024711525.1		 n/a 18,555
(1.22 %)		 24,508
(1.35 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 181
(0.00 %)		 3,482
(100.00 %)		 6,419,007
(53.84 %)		 1,384,128
(15.63 %)		 11,486,822
(50.51 %)		 38,521
(1.60 %)
531 Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022)
GCA_024711535.1		 n/a 21,281
(1.16 %)		 28,592
(1.34 %)		 n/a 42.27
(100.00 %)		 182
(0.00 %)		 4,354
(100.00 %)		 4,378,955
(29.66 %)		 1,568,842
(17.75 %)		 12,889,786
(51.96 %)		 46,167
(1.71 %)
532 Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022)
GCF_024711535.1		 68,331
(2.37 %)		 21,280
(1.16 %)		 28,582
(1.34 %)		 n/a 42.27
(100.00 %)		 182
(0.00 %)		 4,535
(100.00 %)		 4,378,949
(29.66 %)		 1,568,842
(17.75 %)		 12,889,725
(51.96 %)		 46,167
(1.71 %)
533 Merriam's long-tongued bat (hap1 2024)
GCA_039655065.1		 n/a 18,172
(1.67 %)		 20,736
(1.60 %)		 n/a 42.19
(100.00 %)		 47
(0.00 %)		 82
(100.00 %)		 2,998,913
(29.48 %)		 418,833
(1.07 %)		 11,783,716
(32.96 %)		 65,956
(4.38 %)
534 Merriam's long-tongued bat (hap2 2024)
GCA_039656995.1		 n/a 18,105
(1.68 %)		 20,751
(1.60 %)		 n/a 42.18
(100.00 %)		 45
(0.00 %)		 71
(100.00 %)		 2,994,788
(29.48 %)		 415,375
(1.07 %)		 11,752,432
(32.88 %)		 65,597
(4.38 %)
535 mesic four-striped grass rat (FMNH 192475 2021)
GCA_019844195.1		 n/a 18,926
(2.00 %)		 20,713
(1.46 %)		 n/a 41.06
(99.08 %)		 121,340
(0.94 %)		 152,293
(99.06 %)		 6,081,188
(43.08 %)		 1,497,646
(3.55 %)		 13,086,584
(30.02 %)		 15,700
(0.46 %)
536 Mexican gray wolf (hap1 2025 refseq)
GCF_048164855.1		 112,768
(4.40 %)		 19,582
(1.52 %)		 20,911
(1.39 %)		 n/a 41.56
(100.00 %)		 167
(0.00 %)		 249
(100.00 %)		 4,598,813
(31.70 %)		 1,102,136
(4.40 %)		 13,591,364
(35.18 %)		 53,470
(2.24 %)
537 Mexican gray wolf (hap2 2025)
GCA_048164845.1		 n/a 18,738
(1.56 %)		 19,759
(1.41 %)		 n/a 41.58
(100.00 %)		 124
(0.00 %)		 155
(100.00 %)		 4,265,479
(32.40 %)		 1,030,876
(4.11 %)		 12,818,772
(34.22 %)		 50,269
(2.22 %)
538 minke whale (2013 refseq)
GCF_000493695.1		 42,553
(2.38 %)		 19,159
(1.73 %)		 18,656
(1.42 %)		 n/a 40.94
(94.06 %)		 173,296
(5.96 %)		 184,072
(94.04 %)		 n/a 573,951
(1.48 %)		 13,504,347
(30.96 %)		 65,448
(1.38 %)
539 minke whale (alternate hap 2023)
GCA_950005055.1		 n/a 20,412
(1.46 %)		 27,421
(1.34 %)		 n/a 41.50
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 21,272
(100.00 %)		 3,811,435
(36.24 %)		 959,712
(10.27 %)		 12,159,896
(41.30 %)		 69,852
(1.62 %)
540 minke whale (primary hap 2023 refseq)
GCF_949987535.1		 61,711
(2.51 %)		 19,550
(1.49 %)		 21,499
(1.26 %)		 n/a 41.55
(99.99 %)		 1,177
(0.01 %)		 1,374
(100.00 %)		 4,006,927
(35.92 %)		 1,058,105
(12.08 %)		 12,708,103
(42.66 %)		 72,756
(1.59 %)
541 Mongolian gerbil (243 2017 Lucigen Corp.)
GCF_002204375.1		 40,359
(2.29 %)		 21,215
(1.83 %)		 24,305
(1.47 %)		 n/a 42.09
(95.23 %)		 91,601
(4.78 %)		 68,793
(100.00 %)		 4,821,343
(37.74 %)		 940,776
(1.82 %)		 13,848,274
(31.31 %)		 24,154
(0.74 %)
542 Mongolian gerbil (EAM2014 2019 BGI)
GCA_008131255.1		 n/a 19,952
(1.59 %)		 23,462
(1.36 %)		 n/a 41.98
(99.01 %)		 103,843
(0.97 %)		 412,933
(99.03 %)		 5,009,454
(0.00 %)		 1,042,929
(2.52 %)		 14,121,194
(34.63 %)		 26,044
(0.71 %)
543 Mongolian gerbil (TT.TT164.6M 2023)
GCF_030254825.1		 65,502
(2.97 %)		 19,045
(1.53 %)		 20,203
(1.29 %)		 n/a 41.87
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 193
(100.00 %)		 4,477,607
(37.21 %)		 1,124,432
(5.22 %)		 13,244,320
(39.20 %)		 25,300
(0.76 %)
544 monito del monte (mDroGli1 alternate hap 2021)
GCA_019395325.1		 n/a 16,419
(0.77 %)		 17,219
(0.89 %)		 n/a 39.03
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 9,959
(100.00 %)		 6,332,360
(29.69 %)		 1,065,454
(2.09 %)		 17,908,986
(42.25 %)		 13,856
(0.35 %)
545 monito del monte (primary hap 2021 refseq)
GCF_019393635.1		 47,034
(2.02 %)		 18,399
(0.80 %)		 15,519
(0.85 %)		 n/a 39.11
(99.91 %)		 260
(0.09 %)		 17
(100.00 %)		 9,107,968
(41.08 %)		 1,249,635
(2.12 %)		 21,135,324
(42.80 %)		 16,598
(0.36 %)
546 Montane guinea pig
GCA_004027695.1		 n/a 20,064
(1.06 %)		 31,321
(1.18 %)		 39,905
(1.42 %)		 40.09
(99.88 %)		 11,321
(0.04 %)		 1,379,500
(99.96 %)		 4,730,634
(30.02 %)		 1,583,664
(6.57 %)		 15,806,339
(40.40 %)		 37,371
(0.76 %)
547 moose/elk (2024)
GCA_964270355.1		 n/a 19,816
(1.60 %)		 22,341
(1.44 %)		 n/a 41.70
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 1,737
(100.00 %)		 3,099,775
(24.20 %)		 406,796
(2.52 %)		 13,117,056
(38.34 %)		 50,644
(1.33 %)
548 moose/elk (AALL_1980 2023)
GCA_015832495.2		 n/a 19,116
(1.66 %)		 21,184
(1.45 %)		 n/a 41.55
(95.50 %)		 71,769
(4.51 %)		 77,708
(95.49 %)		 3,026,678
(23.77 %)		 373,266
(0.91 %)		 13,167,376
(34.08 %)		 44,302
(1.21 %)
549 moose/elk (MIG12-28694850 2019)
GCA_007570765.1		 n/a 21,375
(1.65 %)		 26,769
(1.42 %)		 n/a 41.64
(92.66 %)		 83,831
(7.35 %)		 131,373
(92.65 %)		 5,022,053
(43.27 %)		 384,658
(1.22 %)		 13,422,381
(34.52 %)		 49,216
(1.18 %)
550 Mount Data shrew rat (FMNH 198792 2021)
GCA_019843965.1		 n/a 18,266
(2.07 %)		 18,451
(1.45 %)		 n/a 41.51
(99.45 %)		 47,796
(0.55 %)		 61,989
(99.45 %)		 5,656,524
(42.94 %)		 1,120,762
(2.44 %)		 12,212,163
(29.98 %)		 15,204
(0.46 %)
551 mountain beaver
GCA_004027875.1		 n/a 22,428
(1.10 %)		 38,670
(1.12 %)		 n/a 40.58
(99.89 %)		 7,253
(0.02 %)		 1,286,779
(99.98 %)		 5,859,004
(32.29 %)		 914,052
(2.37 %)		 16,249,666
(38.21 %)		 39,133
(0.76 %)
552 mountain bongo (Barney_WCC 2024)
GCA_040438115.1		 n/a 19,857
(1.47 %)		 21,826
(1.20 %)		 n/a 41.99
(96.15 %)		 62,885
(3.86 %)		 34,537
(100.00 %)		 6,342,707
(52.09 %)		 474,043
(1.33 %)		 13,361,157
(42.94 %)		 42,078
(0.91 %)
553 muskrat
GCA_004026605.1		 n/a 22,540
(1.52 %)		 32,136
(1.35 %)		 n/a 41.59
(99.93 %)		 6,243
(0.02 %)		 571,599
(99.98 %)		 4,437,736
(28.49 %)		 922,826
(2.38 %)		 13,945,732
(35.23 %)		 19,876
(0.50 %)
554 naked mole-rat (2022)
GCA_944319725.1		 n/a 20,755
(1.51 %)		 20,024
(1.35 %)		 n/a 39.98
(99.96 %)		 2,332
(0.04 %)		 264
(100.00 %)		 3,593,261
(30.76 %)		 529,045
(1.14 %)		 13,294,831
(36.07 %)		 32,235
(0.93 %)
555 naked mole-rat (maternal 2024)
GCA_964261345.1		 n/a 19,980
(1.56 %)		 19,365
(1.33 %)		 n/a 39.96
(99.93 %)		 2,238
(0.07 %)		 263
(100.00 %)		 5,099,610
(44.65 %)		 523,459
(1.13 %)		 13,036,461
(35.91 %)		 31,614
(0.92 %)
556 naked mole-rat (MEF-2018 2020)
GCA_014060925.1		 n/a 22,011
(1.30 %)		 21,392
(1.22 %)		 n/a 40.13
(95.11 %)		 139,535
(4.91 %)		 148,797
(95.09 %)		 4,885,102
(35.91 %)		 654,418
(1.90 %)		 16,401,315
(34.21 %)		 40,717
(0.98 %)
557 naked mole-rat (NMR 29 2012 refseq)
GCF_000247695.1		 74,587
(3.56 %)		 21,332
(1.74 %)		 20,861
(1.51 %)		 n/a 40.21
(88.43 %)		 110,424
(11.59 %)		 114,653
(88.41 %)		 4,179,991
(32.69 %)		 484,933
(0.92 %)		 13,672,561
(27.63 %)		 31,950
(0.88 %)
558 naked mole-rat (pHap 2024)
GCA_964261355.1		 n/a 19,953
(1.57 %)		 19,579
(1.35 %)		 n/a 39.98
(99.91 %)		 2,381
(0.09 %)		 264
(100.00 %)		 5,097,978
(44.61 %)		 523,861
(1.13 %)		 13,168,788
(36.09 %)		 31,789
(0.93 %)
559 narwhal
GCA_005190385.4		 n/a 18,678
(1.79 %)		 19,820
(1.40 %)		 n/a 41.26
(100.00 %)		 323
(0.00 %)		 91
(100.00 %)		 4,018,392
(43.94 %)		 611,903
(1.52 %)		 12,641,524
(35.02 %)		 60,518
(1.78 %)
560 narwhal (Baffin Bay 2019)
GCF_005190385.1		 51,639
(2.71 %)		 18,741
(1.78 %)		 20,365
(1.40 %)		 33,148
(1.79 %)		 41.22
(99.52 %)		 18,323
(0.49 %)		 6,972
(100.00 %)		 4,011,742
(43.97 %)		 565,367
(1.22 %)		 12,720,018
(34.85 %)		 60,492
(1.58 %)
561 narwhal (Baffin Bay Population NGI 2022)
GCA_005190385.3		 n/a 18,681
(1.79 %)		 19,816
(1.40 %)		 n/a 41.26
(100.00 %)		 313
(0.00 %)		 101
(100.00 %)		 3,618,235
(37.24 %)		 612,229
(1.52 %)		 12,641,632
(35.02 %)		 60,518
(1.78 %)
562 Natal long-fingered bat
GCF_001595765.1		 32,050
(3.03 %)		 18,015
(2.17 %)		 18,293
(1.87 %)		 n/a 42.07
(96.24 %)		 204,616
(3.79 %)		 1,269
(100.00 %)		 2,565,457
(28.95 %)		 376,532
(1.91 %)		 10,427,823
(26.35 %)		 63,261
(2.07 %)
563 Nathusius's pipistrelle (hap1.1 2025)
GCA_964656225.1		 n/a 18,001
(1.75 %)		 21,219
(1.77 %)		 n/a 42.26
(99.98 %)		 1,836
(0.02 %)		 1,062
(100.00 %)		 3,664,854
(32.90 %)		 906,692
(8.55 %)		 10,164,440
(37.98 %)		 56,705
(2.75 %)
564 Nathusius's pipistrelle (hap1.2 2025)
GCA_964656225.2		 n/a 17,671
(1.80 %)		 21,057
(1.71 %)		 n/a 42.19
(100.00 %)		 307
(0.00 %)		 410
(100.00 %)		 4,579,266
(45.39 %)		 943,644
(11.48 %)		 9,925,875
(39.77 %)		 56,485
(2.63 %)
565 Nathusius's pipistrelle (hap2.1 2025)
GCA_964656075.1		 n/a 17,899
(1.71 %)		 20,808
(1.69 %)		 n/a 42.15
(99.98 %)		 1,832
(0.02 %)		 2,485
(99.98 %)		 3,637,576
(31.92 %)		 930,013
(11.25 %)		 9,967,930
(39.61 %)		 56,237
(2.62 %)
566 Nathusius's pipistrelle (hap2.2 2025)
GCA_964656075.2		 n/a 17,650
(1.86 %)		 21,005
(1.78 %)		 n/a 42.30
(100.00 %)		 306
(0.00 %)		 759
(100.00 %)		 4,580,609
(44.28 %)		 888,097
(8.14 %)		 10,070,978
(37.75 %)		 56,514
(2.79 %)
567 Nathusius's pipistrelle (primary hap 2024)
GCA_963693515.1		 n/a 17,944
(1.86 %)		 20,545
(1.83 %)		 n/a 42.45
(100.00 %)		 263
(0.00 %)		 154
(100.00 %)		 3,628,328
(34.57 %)		 838,723
(4.04 %)		 10,155,601
(35.22 %)		 56,332
(2.92 %)
568 Natterer's bat
GCF_964212035.1		 36,662
(2.62 %)		 18,650
(1.78 %)		 22,423
(1.68 %)		 n/a 43.15
(100.00 %)		 225
(0.00 %)		 212
(100.00 %)		 5,075,897
(48.88 %)		 801,041
(5.78 %)		 10,278,311
(38.66 %)		 64,639
(2.57 %)
569 Natterer's bat (hap1.2 2025)
GCA_964212035.2		 n/a 19,475
(1.82 %)		 22,424
(1.68 %)		 n/a 43.15
(100.00 %)		 225
(0.00 %)		 212
(100.00 %)		 3,841,654
(38.99 %)		 801,041
(5.78 %)		 10,278,311
(38.66 %)		 64,639
(2.57 %)
570 Natterer's bat (hap2.2 2025)
GCA_964212025.2		 n/a 18,368
(1.91 %)		 21,701
(1.80 %)		 n/a 43.27
(100.00 %)		 136
(0.00 %)		 309
(100.00 %)		 3,509,151
(38.16 %)		 704,537
(5.21 %)		 9,806,703
(36.74 %)		 61,004
(2.65 %)
571 neotropical fruit bat
GCF_014824575.2		 49,109
(2.78 %)		 17,703
(1.63 %)		 19,389
(1.60 %)		 n/a 42.32
(99.79 %)		 38,675
(0.21 %)		 26,068
(100.00 %)		 2,862,405
(29.31 %)		 366,960
(1.48 %)		 11,796,203
(31.27 %)		 59,091
(1.70 %)
572 Nilgiri tahr
GCA_004026825.1		 n/a 22,735
(1.44 %)		 34,961
(1.27 %)		 n/a 42.37
(99.93 %)		 10,387
(0.04 %)		 479,550
(99.96 %)		 5,793,761
(48.50 %)		 535,297
(1.34 %)		 13,378,352
(42.46 %)		 57,653
(1.29 %)
573 nine-banded armadillo (hap2 2023)
GCA_030445035.2		 n/a 21,049
(1.11 %)		 24,419
(1.07 %)		 n/a 41.00
(99.67 %)		 793
(0.33 %)		 546
(100.00 %)		 5,507,356
(53.38 %)		 738,321
(2.02 %)		 19,755,425
(43.69 %)		 142,597
(2.85 %)
574 nine-banded armadillo (v2 hap1 2023)
GCA_030445055.2		 n/a 19,350
(1.07 %)		 22,207
(1.07 %)		 n/a 40.97
(99.27 %)		 823
(0.73 %)		 588
(100.00 %)		 4,330,716
(32.85 %)		 661,966
(1.52 %)		 18,302,021
(42.22 %)		 130,245
(2.79 %)
575 nine-banded armadillo (v2 hap2 2023)
GCF_030445035.2		 72,174
(2.47 %)		 21,051
(1.11 %)		 24,418
(1.07 %)		 n/a 41.00
(99.67 %)		 793
(0.33 %)		 546
(100.00 %)		 5,412,063
(53.31 %)		 738,320
(2.02 %)		 19,755,423
(43.69 %)		 142,597
(2.85 %)
576 nine-banded armadillo (v3.2 3-136 2012 Baylor)
GCF_000208655.3		 46,110
(1.87 %)		 20,820
(1.08 %)		 25,226
(1.08 %)		 n/a 40.77
(90.89 %)		 268,437
(9.13 %)		 314,788
(90.87 %)		 4,552,770
(34.01 %)		 651,225
(1.26 %)		 19,266,969
(38.27 %)		 139,490
(2.47 %)
577 North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 alternate hap 2022)
GCA_026167925.1		 n/a 19,342
(1.57 %)		 20,947
(1.48 %)		 n/a 42.40
(100.00 %)		 229
(0.00 %)		 1,006
(100.00 %)		 4,161,568
(23.13 %)		 1,278,205
(8.22 %)		 13,148,019
(37.60 %)		 23,523
(0.71 %)
578 North American deer mouse (v1 MVZ:Mamm:240117 primary hap 2022)
GCA_026229955.1		 n/a 19,700
(1.54 %)		 22,354
(1.46 %)		 n/a 42.19
(100.00 %)		 244
(0.00 %)		 2,082
(100.00 %)		 6,089,884
(47.99 %)		 1,358,786
(9.39 %)		 13,799,349
(39.08 %)		 24,733
(0.70 %)
579 North American deer mouse (v2 MVZ:Mamm:240117 primary hap 2026)
GCA_026229955.2		 n/a 19,460
(1.53 %)		 21,066
(1.38 %)		 n/a 42.19
(100.00 %)		 477
(0.00 %)		 1,632
(100.00 %)		 7,214,715
(49.58 %)		 1,352,727
(9.20 %)		 13,819,592
(38.94 %)		 24,484
(0.70 %)
580 North American porcupine (mEreDor1 alternate hap 2023)
GCA_028500835.1		 n/a 15,210
(1.55 %)		 18,316
(1.43 %)		 n/a 41.06
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 5,051
(100.00 %)		 3,911,633
(40.55 %)		 565,546
(1.54 %)		 10,853,726
(32.61 %)		 40,925
(1.35 %)
581 North American porcupine (mEreDor1 primary hap 2023)
GCA_028451465.1		 n/a 18,102
(1.58 %)		 20,073
(1.40 %)		 n/a 41.03
(100.00 %)		 277
(0.00 %)		 116
(100.00 %)		 4,958,089
(41.64 %)		 719,163
(1.59 %)		 13,867,662
(33.89 %)		 51,299
(1.36 %)
582 North Atlantic bottlenose whale
GCF_949752795.1		 33,287
(1.31 %)		 19,106
(1.50 %)		 20,818
(1.21 %)		 n/a 41.81
(99.99 %)		 1,098
(0.01 %)		 756
(100.00 %)		 5,163,512
(53.86 %)		 769,275
(14.94 %)		 12,133,394
(44.83 %)		 67,258
(2.00 %)
583 North Atlantic right whale (hap2 + XY 2023 refseq)
GCF_028564815.1		 49,646
(1.86 %)		 19,562
(1.46 %)		 21,631
(1.25 %)		 n/a 41.69
(99.83 %)		 367
(0.17 %)		 789
(100.00 %)		 1,368,536
(2.24 %)		 841,303
(13.08 %)		 12,527,582
(43.92 %)		 94,259
(1.92 %)
584 North Atlantic right whale (hap2._XY 2023)
GCA_028564815.2		 n/a 19,476
(1.53 %)		 21,630
(1.25 %)		 n/a 41.69
(99.83 %)		 367
(0.17 %)		 788
(100.00 %)		 4,812,242
(53.57 %)		 841,302
(13.08 %)		 12,527,493
(43.92 %)		 94,259
(1.92 %)
585 North Atlantic right whale (v1 hap1 2023)
GCA_028571275.1		 n/a 18,699
(1.61 %)		 20,354
(1.28 %)		 n/a 41.64
(99.84 %)		 385
(0.16 %)		 947
(100.00 %)		 3,815,900
(43.46 %)		 718,935
(11.38 %)		 11,928,210
(42.25 %)		 85,881
(1.90 %)
586 North Atlantic right whale (v2 hap1 2023)
GCA_028571275.2		 n/a 18,673
(1.52 %)		 20,481
(1.29 %)		 n/a 41.64
(99.84 %)		 381
(0.16 %)		 938
(100.00 %)		 1,270,626
(2.25 %)		 714,265
(11.41 %)		 11,856,103
(42.12 %)		 85,484
(1.90 %)
587 North Pacific right whale
GCA_004363455.1		 n/a 23,145
(1.43 %)		 38,161
(1.21 %)		 n/a 41.15
(99.88 %)		 7,094
(0.03 %)		 1,361,057
(99.97 %)		 5,039,622
(45.69 %)		 694,986
(1.31 %)		 14,063,101
(40.51 %)		 74,800
(1.52 %)
588 northern American river otter
GCF_010015895.1		 53,945
(2.18 %)		 18,974
(1.68 %)		 21,247
(1.45 %)		 n/a 41.41
(99.58 %)		 7,620
(0.42 %)		 13,541
(99.58 %)		 4,538,847
(41.18 %)		 685,281
(1.20 %)		 13,840,953
(32.61 %)		 53,559
(1.88 %)
589 northern bat (alternate hap 2023)
GCA_951640545.1		 n/a 18,343
(1.80 %)		 23,253
(1.77 %)		 n/a 43.55
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 4,899
(100.00 %)		 1,174,241
(2.96 %)		 825,170
(5.11 %)		 9,889,579
(36.12 %)		 76,164
(3.52 %)
590 northern bat (primary hap 2023)
GCA_951640355.1		 n/a 18,636
(1.75 %)		 21,446
(1.68 %)		 n/a 43.32
(99.99 %)		 1,423
(0.01 %)		 207
(100.00 %)		 1,259,729
(2.95 %)		 905,676
(6.25 %)		 10,554,535
(38.21 %)		 77,656
(3.27 %)
591 northern black mastiff bat (mMolNig1 2022)
GCA_026936385.1		 n/a 18,924
(1.53 %)		 22,934
(1.58 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 199
(0.00 %)		 146
(100.00 %)		 3,850,624
(31.21 %)		 648,359
(3.76 %)		 11,788,702
(39.25 %)		 85,908
(2.60 %)
592 northern black mastiff bat (mMolNig1hap1 2024)
GCA_039880945.1		 n/a 18,933
(1.44 %)		 23,629
(1.50 %)		 n/a 42.60
(100.00 %)		 113
(0.00 %)		 366
(100.00 %)		 4,027,155
(30.73 %)		 712,278
(5.22 %)		 12,003,034
(41.58 %)		 96,116
(3.02 %)
593 northern black mastiff bat (mMolNig1hap2 2024)
GCA_039880925.1		 n/a 18,305
(1.49 %)		 22,534
(1.56 %)		 n/a 42.75
(100.00 %)		 80
(0.00 %)		 282
(100.00 %)		 3,783,543
(30.10 %)		 656,592
(4.68 %)		 11,353,707
(40.26 %)		 92,041
(3.01 %)
594 northern bottlenose whale (alternate hap 2023)
GCA_949752845.1		 n/a 19,537
(1.44 %)		 27,826
(1.30 %)		 n/a 41.67
(100.00 %)		 n/a 23,401
(100.00 %)		 3,634,923
(35.56 %)		 672,860
(11.00 %)		 11,175,398
(41.72 %)		 62,007
(1.94 %)
595 northern bottlenose whale (primary hap 2023)
GCA_949752795.1		 n/a 19,073
(1.44 %)		 20,821
(1.21 %)		 n/a 41.81
(99.99 %)		 1,098
(0.01 %)		 757
(100.00 %)		 3,997,911
(34.76 %)		 769,275
(14.94 %)		 12,133,820
(44.83 %)		 67,258
(2.00 %)
596 northern elephant seal (BS05 2019 Broad)
GCA_004023865.1		 n/a 22,834
(1.54 %)		 36,083
(1.32 %)		 n/a 41.52
(99.94 %)		 9,483
(0.04 %)		 330,739
(99.96 %)		 4,849,944
(43.83 %)		 600,306
(1.16 %)		 13,420,049
(34.43 %)		 57,236
(1.62 %)
597 northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 genbank)
GCA_029215605.1		 n/a 19,278
(1.60 %)		 19,908
(1.39 %)		 n/a 41.84
(100.00 %)		 98
(0.00 %)		 596
(100.00 %)		 4,348,333
(34.40 %)		 621,985
(2.21 %)		 13,251,768
(35.32 %)		 69,898
(2.38 %)
598 Northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 refseq)
GCF_029215605.1		 74,106
(3.88 %)		 19,277
(1.60 %)		 20,000
(1.36 %)		 n/a 41.84
(100.00 %)		 98
(0.00 %)		 595
(100.00 %)		 4,348,327
(34.40 %)		 621,980
(2.21 %)		 13,251,706
(35.32 %)		 69,897
(2.38 %)
599 northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap2 2023)
GCA_029215635.1		 n/a 19,340
(1.59 %)		 19,732
(1.37 %)		 n/a 41.91
(100.00 %)		 60
(0.00 %)		 482
(100.00 %)		 4,365,070
(34.26 %)		 627,639
(2.43 %)		 13,174,494
(35.47 %)		 74,314
(2.49 %)
600 northern elephant seal (v3 JK_09032017 2022)
GCF_021288785.2		 53,819
(3.32 %)		 20,099
(1.75 %)		 20,957
(1.35 %)		 n/a 41.51
(99.35 %)		 39,936
(0.65 %)		 142,455
(100.00 %)		 4,368,400
(33.93 %)		 588,877
(1.19 %)		 13,745,426
(32.96 %)		 52,064
(1.59 %)
601 northern fur seal
GCF_003265705.1		 54,953
(2.43 %)		 23,408
(1.78 %)		 23,666
(1.43 %)		 52,089
(2.17 %)		 41.48
(98.01 %)		 38,666
(1.99 %)		 52,469
(98.01 %)		 5,047,032
(43.38 %)		 638,130
(1.06 %)		 14,922,442
(33.12 %)		 57,281
(1.44 %)
602 northern fur seal (GAN/ISIS: 27379988/994484 2025)
GCF_003265705.2		 71,169
(3.14 %)		 21,276
(1.78 %)		 21,276
(1.42 %)		 n/a 41.44
(98.05 %)		 30,369
(1.95 %)		 43,734
(98.05 %)		 4,118,994
(34.95 %)		 578,801
(1.07 %)		 13,530,999
(33.27 %)		 51,258
(1.43 %)
603 northern gundi (hap1 2025)
GCA_048771875.1		 n/a 16,996
(1.51 %)		 21,787
(1.66 %)		 n/a 42.28
(100.00 %)		 117
(0.00 %)		 535
(100.00 %)		 3,293,772
(27.51 %)		 602,403
(3.02 %)		 11,827,700
(30.64 %)		 44,220
(1.55 %)
604 northern gundi (hap2 2025)
GCA_048771865.1		 n/a 17,037
(1.43 %)		 21,690
(1.55 %)		 n/a 42.88
(100.00 %)		 115
(0.00 %)		 1,031
(100.00 %)		 3,527,940
(26.81 %)		 646,620
(6.32 %)		 11,343,462
(34.09 %)		 47,125
(1.51 %)
605 northern gundi (US049 2019)
GCA_004027205.1		 n/a 18,035
(1.39 %)		 27,379
(1.57 %)		 n/a 42.68
(99.91 %)		 5,037
(0.02 %)		 865,110
(99.98 %)		 4,149,883
(27.83 %)		 654,063
(1.64 %)		 12,342,565
(33.72 %)		 47,533
(1.43 %)
606 northern mole vole
GCA_001685095.1		 n/a 23,252
(1.39 %)		 44,209
(1.25 %)		 n/a 41.68
(99.04 %)		 371,627
(0.98 %)		 722,087
(99.02 %)		 3,923,814
(25.79 %)		 898,453
(2.47 %)		 13,708,986
(29.04 %)		 16,583
(0.36 %)
607 northern three-toed jerboa (halli NM19106 2024)
GCA_036346955.1		 n/a 19,574
(1.25 %)		 21,306
(1.23 %)		 n/a 42.16
(99.93 %)		 954
(0.07 %)		 487
(100.00 %)		 6,447,286
(38.11 %)		 1,321,523
(3.44 %)		 13,986,035
(43.83 %)		 30,337
(0.84 %)
608 northern white rhinoceros
GCA_004027795.1		 n/a 25,328
(1.34 %)		 61,003
(1.95 %)		 n/a 41.32
(99.90 %)		 7,054
(0.03 %)		 949,480
(99.97 %)		 4,330,882
(38.89 %)		 484,754
(1.12 %)		 15,544,248
(33.11 %)		 43,689
(2.08 %)
609 northern woolly horseshoe bat (20210929_DDc alternate hap 2024)
GCA_043748905.1		 n/a 17,474
(1.85 %)		 19,891
(1.65 %)		 n/a 40.73
(100.00 %)		 n/a 1,329
(100.00 %)		 3,473,169
(40.23 %)		 618,364
(2.01 %)		 11,013,083
(30.75 %)		 32,427
(1.26 %)
610 northern woolly horseshoe bat (20210929_DDc primary hap 2024)
GCA_043748575.1		 n/a 18,475
(1.82 %)		 19,990
(1.56 %)		 n/a 40.72
(100.00 %)		 63
(0.00 %)		 68
(100.00 %)		 3,507,612
(39.92 %)		 711,081
(2.15 %)		 11,788,205
(32.17 %)		 35,670
(1.25 %)
611 Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 genbank)
GCA_036323735.1		 114,725
(42.69 %)		 21,917
(1.75 %)		 19,476
(1.26 %)		 n/a 41.82
(99.86 %)		 220
(0.14 %)		 77
(100.00 %)		 4,700,726
(39.99 %)		 1,603,005
(5.45 %)		 13,451,813
(38.68 %)		 20,118
(0.44 %)
612 Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 refseq)
GCF_036323735.1		 114,725
(5.38 %)		 21,870
(1.74 %)		 19,989
(1.27 %)		 n/a 41.82
(99.86 %)		 220
(0.14 %)		 76
(100.00 %)		 5,294,185
(42.75 %)		 1,603,005
(5.45 %)		 13,451,760
(38.68 %)		 20,118
(0.44 %)
613 Norway rat (F344/Stm 2024)
GCA_041222355.1		 n/a 21,764
(1.78 %)		 20,141
(1.30 %)		 n/a 41.87
(99.96 %)		 234
(0.04 %)		 120
(100.00 %)		 4,636,987
(39.98 %)		 1,579,595
(5.22 %)		 13,544,768
(38.06 %)		 20,127
(0.46 %)
614 Norway rat (LE/Stm RGD_629485 2026)
GCA_058775275.1		 n/a 22,033
(1.74 %)		 20,312
(1.28 %)		 n/a 41.84
(100.00 %)		 255
(0.00 %)		 1,330
(100.00 %)		 4,747,037
(40.17 %)		 1,613,740
(6.08 %)		 13,369,040
(38.80 %)		 20,630
(0.51 %)
615 Norway rat (v1 SHRSP/BppUtx 2022)
GCA_021556685.1		 n/a 22,366
(1.71 %)		 20,531
(1.26 %)		 57,580
(2.44 %)		 41.86
(99.94 %)		 1,610
(0.06 %)		 2,734
(100.00 %)		 5,238,574
(46.36 %)		 1,638,412
(5.87 %)		 13,769,141
(38.49 %)		 21,006
(0.49 %)
616 Norway rat (v2 T2T SHRSP/BbbUtx 2026)
GCA_021556685.2		 n/a 21,935
(1.75 %)		 20,183
(1.28 %)		 n/a 41.87
(100.00 %)		 7
(0.00 %)		 192
(100.00 %)		 4,752,792
(40.32 %)		 1,617,613
(5.77 %)		 13,383,610
(38.76 %)		 20,532
(0.56 %)
617 Norway rat BN7 haplotype
GCA_015244455.1		 n/a 3,096
(1.64 %)		 2,450
(1.02 %)		 n/a 41.23
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 3,156
(100.00 %)		 517,347
(50.76 %)		 157,701
(3.90 %)		 1,502,752
(34.14 %)		 1,806
(0.40 %)
618 Norway rat BN7.2
GCF_015227675.2		 97,432
(4.08 %)		 21,526
(1.86 %)		 19,266
(1.33 %)		 54,530
(2.79 %)		 41.99
(99.19 %)		 581
(0.81 %)		 757
(99.19 %)		 5,029,005
(45.44 %)		 1,514,974
(3.57 %)		 13,450,428
(35.83 %)		 19,244
(0.46 %)
619 Norway rat celera
GCF_000002265.2		 39,745
(2.91 %)		 21,492
(1.95 %)		 19,112
(1.38 %)		 n/a 41.98
(95.28 %)		 111,391
(4.74 %)		 118,423
(95.26 %)		 9,721,869
(43.57 %)		 1,387,703
(3.05 %)		 13,224,921
(32.45 %)		 18,944
(0.42 %)
620 Norway rat Dahl SR JrHsd (RGD_1582184 2024)
GCA_045688005.1		 n/a 21,901
(1.75 %)		 20,001
(1.28 %)		 n/a 41.84
(99.81 %)		 299
(0.19 %)		 141
(100.00 %)		 4,717,442
(40.25 %)		 1,598,987
(5.75 %)		 13,553,199
(38.60 %)		 20,297
(0.46 %)
621 Norway rat Lyon Hypertensive(RGD_10755352 2024)
GCA_045687965.1		 n/a 21,971
(1.75 %)		 20,095
(1.28 %)		 n/a 41.85
(99.93 %)		 269
(0.07 %)		 133
(100.00 %)		 4,719,614
(40.23 %)		 1,601,400
(5.83 %)		 13,552,374
(38.67 %)		 20,429
(0.47 %)
622 Norway rat Lyon Normot (RGD_10755354 2024)
GCA_045687995.1		 n/a 21,928
(1.75 %)		 20,321
(1.29 %)		 n/a 41.85
(99.84 %)		 302
(0.16 %)		 154
(100.00 %)		 4,723,406
(40.27 %)		 1,602,417
(5.79 %)		 13,563,546
(38.65 %)		 20,456
(0.47 %)
623 Norway rat Rnor6.0
GCF_000001895.5		 69,456
(3.34 %)		 22,369
(1.83 %)		 20,269
(1.32 %)		 n/a 41.93
(95.13 %)		 145,731
(4.89 %)		 76,195
(95.16 %)		 5,329,187
(44.14 %)		 1,620,304
(3.72 %)		 14,520,050
(33.09 %)		 22,600
(0.47 %)
624 Norway rat SHR/Utx RGD_8142385 2022
GCA_023515785.1		 n/a 21,116
(1.68 %)		 20,103
(1.27 %)		 57,027
(2.45 %)		 41.85
(99.82 %)		 1,256
(0.18 %)		 2,151
(100.00 %)		 4,704,388
(38.22 %)		 1,611,144
(5.76 %)		 13,524,575
(38.35 %)		 20,720
(0.48 %)
625 Norway rat WKY/Bbb 2022
GCA_023515805.1		 n/a 21,607
(1.68 %)		 21,244
(1.28 %)		 58,136
(2.47 %)		 41.92
(99.80 %)		 1,456
(0.20 %)		 3,553
(100.00 %)		 4,811,412
(38.21 %)		 1,650,950
(5.41 %)		 13,740,644
(38.24 %)		 21,449
(0.51 %)
626 nutria
GCA_004027025.1		 n/a 24,707
(1.00 %)		 47,533
(1.18 %)		 n/a 41.70
(99.84 %)		 15,249
(0.05 %)		 1,684,916
(99.95 %)		 6,961,690
(30.09 %)		 1,698,977
(3.31 %)		 15,207,563
(42.57 %)		 59,854
(1.00 %)
627 okapi
GCA_001660835.1		 n/a 21,483
(1.43 %)		 31,061
(1.26 %)		 n/a 41.48
(95.11 %)		 376,008
(4.86 %)		 1,213,177
(95.14 %)		 5,808,036
(42.90 %)		 619,044
(4.22 %)		 14,940,153
(35.17 %)		 47,417
(1.12 %)
628 Okinawa island spiny rat (P-3 2024)
GCA_047150545.1		 n/a 20,516
(1.33 %)		 20,222
(0.99 %)		 n/a 40.89
(100.00 %)		 19
(0.00 %)		 53
(100.00 %)		 9,452,355
(48.57 %)		 2,252,101
(4.71 %)		 12,808,891
(51.48 %)		 20,770
(0.36 %)
629 Okinawa island spiny rat (P-3 primary hap 2023)
GCA_036184385.1		 n/a 18,829
(1.78 %)		 19,061
(1.29 %)		 n/a 41.18
(100.00 %)		 250
(0.00 %)		 1,778
(100.00 %)		 6,918,941
(46.48 %)		 1,550,409
(4.06 %)		 12,787,294
(38.04 %)		 19,458
(0.47 %)
630 Ord's kangaroo rat
GCF_000151885.1		 30,625
(2.21 %)		 17,959
(1.54 %)		 19,318
(1.54 %)		 n/a 42.06
(92.36 %)		 83,035
(7.65 %)		 148,226
(92.35 %)		 4,337,455
(33.76 %)		 1,140,316
(7.60 %)		 10,422,685
(36.59 %)		 61,921
(3.56 %)
631 pacarana
GCA_004027595.1		 n/a 20,748
(1.20 %)		 33,195
(1.31 %)		 n/a 41.81
(99.90 %)		 6,392
(0.02 %)		 1,164,830
(99.98 %)		 4,374,443
(30.16 %)		 660,811
(1.38 %)		 14,062,133
(35.99 %)		 59,382
(1.23 %)
632 Pacific pocket mouse (BS65 2019 Broad)
GCA_004363475.1		 n/a 21,575
(1.07 %)		 47,478
(1.31 %)		 n/a 41.87
(99.76 %)		 18,801
(0.07 %)		 2,428,619
(99.93 %)		 4,881,232
(20.80 %)		 1,352,971
(4.11 %)		 12,583,960
(48.42 %)		 74,961
(2.33 %)
633 Pacific pocket mouse (PPM17 2022 San Diego Zoo)
GCF_023159225.1		 46,202
(2.48 %)		 18,752
(1.50 %)		 22,526
(1.60 %)		 n/a 41.98
(99.96 %)		 1,807
(0.04 %)		 6,180
(100.00 %)		 3,313,319
(16.79 %)		 1,066,382
(10.88 %)		 9,981,468
(42.63 %)		 49,134
(2.83 %)
634 Pacific walrus
GCF_000321225.1		 27,163
(1.89 %)		 20,293
(1.71 %)		 20,982
(1.48 %)		 n/a 41.36
(95.85 %)		 66,766
(4.16 %)		 70,656
(95.84 %)		 4,372,578
(41.12 %)		 511,500
(1.05 %)		 13,507,582
(30.43 %)		 45,142
(1.29 %)
635 Pacific white-sided dolphin
GCF_003676395.1		 65,970
(3.26 %)		 18,743
(1.79 %)		 20,862
(1.45 %)		 31,917
(1.69 %)		 41.28
(99.56 %)		 16,699
(0.44 %)		 21,350
(99.56 %)		 3,971,820
(45.64 %)		 574,056
(1.14 %)		 12,602,965
(34.83 %)		 62,275
(1.67 %)
636 pale spear-nosed bat (alternate hap MPI-MPIP 2019)
GCA_004115245.1		 n/a 18,118
(1.63 %)		 23,536
(1.65 %)		 n/a 42.48
(100.00 %)		 38
(0.00 %)		 10,873
(100.00 %)		 3,001,130
(29.46 %)		 375,042
(0.79 %)		 11,813,971
(29.64 %)		 67,712
(4.23 %)
637 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP mPhyDis1 primary hap 2020)
GCA_004126475.3		 n/a 18,167
(1.70 %)		 20,017
(1.62 %)		 n/a 42.38
(99.28 %)		 884
(0.72 %)		 78
(100.00 %)		 3,071,886
(30.03 %)		 385,665
(0.81 %)		 12,049,923
(30.57 %)		 63,918
(4.33 %)
638 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 alternate hap 2020)
GCA_004115245.2		 n/a 18,116
(1.63 %)		 23,608
(1.65 %)		 n/a 42.48
(100.00 %)		 38
(0.00 %)		 10,895
(100.00 %)		 3,002,448
(29.46 %)		 375,226
(0.79 %)		 11,824,034
(29.65 %)		 67,718
(4.23 %)
639 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 primary hap 2020)
GCF_004126475.2		 54,932
(3.31 %)		 18,171
(1.69 %)		 20,025
(1.62 %)		 42,786
(3.39 %)		 42.38
(99.28 %)		 884
(0.72 %)		 77
(100.00 %)		 3,069,141
(30.00 %)		 385,664
(0.81 %)		 12,050,232
(30.57 %)		 63,905
(3.75 %)
640 Pallas's mastiff bat
GCA_014108415.2		 n/a 18,473
(1.70 %)		 21,847
(1.58 %)		 n/a 42.35
(97.96 %)		 373
(2.04 %)		 45
(100.00 %)		 4,907,773
(46.09 %)		 624,938
(1.88 %)		 11,572,201
(37.09 %)		 79,987
(2.48 %)
641 Pallas's mastiff bat
GCF_014108415.1		 48,421
(2.20 %)		 18,667
(1.61 %)		 21,915
(1.59 %)		 n/a 42.35
(97.95 %)		 349
(2.05 %)		 60
(100.00 %)		 3,863,217
(32.76 %)		 624,933
(1.88 %)		 11,572,319
(37.09 %)		 79,984
(2.45 %)
642 pallid bat
GCA_027563665.2		 n/a 19,038
(1.74 %)		 21,934
(1.63 %)		 n/a 43.04
(99.72 %)		 234
(0.28 %)		 108
(99.99 %)		 5,341,178
(49.43 %)		 937,994
(3.72 %)		 11,240,393
(39.42 %)		 70,270
(2.89 %)
643 pallid bat (TK200870 alternate hap 2023)
GCA_027595915.1		 n/a 19,085
(1.74 %)		 22,770
(1.68 %)		 n/a 43.01
(100.00 %)		 n/a 1,839
(100.00 %)		 5,323,924
(49.33 %)		 928,982
(3.65 %)		 11,123,530
(39.36 %)		 70,095
(2.89 %)
644 pallid bat (TK200870 primary hap 2023)
GCA_027563665.1		 n/a 19,688
(1.69 %)		 21,998
(1.64 %)		 n/a 43.04
(99.72 %)		 234
(0.28 %)		 112
(99.99 %)		 2,794,986
(22.60 %)		 938,016
(3.72 %)		 11,241,518
(39.41 %)		 70,272
(2.89 %)
645 Parnell's mustached bat (2013)
GCA_000465405.1		 n/a 21,436
(1.40 %)		 57,232
(2.18 %)		 n/a 40.82
(99.34 %)		 265,720
(0.70 %)		 443,121
(99.30 %)		 2,780,805
(29.26 %)		 290,520
(0.63 %)		 12,354,814
(27.13 %)		 69,806
(1.89 %)
646 Parnell's mustached bat (Mesoamerican 2021)
GCF_021234165.1		 37,033
(2.48 %)		 18,339
(1.76 %)		 21,630
(1.69 %)		 n/a 41.32
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 333
(100.00 %)		 2,828,339
(30.56 %)		 333,670
(0.75 %)		 12,444,271
(30.90 %)		 53,180
(4.61 %)
647 particolored bat (hap1.2 2025)
GCA_963924515.2		 n/a 17,612
(1.78 %)		 20,793
(1.69 %)		 n/a 43.57
(100.00 %)		 189
(0.00 %)		 273
(100.00 %)		 5,418,781
(46.24 %)		 903,727
(5.36 %)		 10,321,898
(38.41 %)		 78,516
(4.52 %)
648 particolored bat (hap2.2 2025)
GCA_963924695.2		 n/a 16,887
(1.81 %)		 20,042
(1.72 %)		 n/a 43.67
(100.00 %)		 128
(0.00 %)		 395
(100.00 %)		 5,048,325
(44.60 %)		 836,727
(4.41 %)		 9,638,999
(37.87 %)		 76,656
(4.63 %)
649 particolored bat (primary hap 2024)
GCA_963924515.1		 n/a 17,913
(1.72 %)		 20,720
(1.72 %)		 n/a 43.54
(99.99 %)		 980
(0.01 %)		 185
(100.00 %)		 2,932,869
(21.94 %)		 874,665
(4.83 %)		 10,263,103
(37.46 %)		 77,397
(4.55 %)
650 Patagonian cavy
GCA_004027295.1		 n/a 21,143
(0.94 %)		 40,887
(1.10 %)		 n/a 39.86
(99.87 %)		 6,223
(0.02 %)		 1,911,987
(99.98 %)		 5,194,890
(30.95 %)		 892,551
(2.11 %)		 17,052,577
(40.22 %)		 45,730
(0.84 %)
651 Pere David's deer
GCA_002443075.1		 n/a 20,723
(1.65 %)		 23,551
(1.43 %)		 n/a 41.58
(97.49 %)		 144,642
(2.51 %)		 339,454
(97.49 %)		 5,171,293
(43.30 %)		 427,987
(1.20 %)		 13,665,133
(35.97 %)		 48,374
(1.14 %)
652 Philippine flying lemur (mCynVol1 alternate hap 2022)
GCA_027409165.1		 n/a 18,794
(1.72 %)		 21,421
(1.40 %)		 n/a 40.18
(100.00 %)		 n/a 1,750
(100.00 %)		 4,001,442
(39.37 %)		 547,894
(2.75 %)		 13,870,563
(34.33 %)		 40,162
(1.31 %)
653 Philippine flying lemur (primary hap 2022 genbank)
GCA_027409185.1		 n/a 20,384
(1.64 %)		 22,124
(1.29 %)		 n/a 40.24
(100.00 %)		 116
(0.00 %)		 131
(100.00 %)		 4,492,423
(39.31 %)		 627,842
(4.79 %)		 15,561,515
(36.57 %)		 45,336
(1.27 %)
654 Philippine flying lemur (primary hap 2022 refseq)
GCF_027409185.1		 44,950
(1.91 %)		 20,385
(1.64 %)		 22,123
(1.29 %)		 n/a 40.24
(100.00 %)		 116
(0.00 %)		 130
(100.00 %)		 4,492,417
(39.31 %)		 627,841
(4.79 %)		 15,561,458
(36.57 %)		 45,336
(1.27 %)
655 pig (Bamei 2023)
GCA_030704935.1		 n/a 18,472
(1.44 %)		 19,911
(1.28 %)		 n/a 42.63
(99.98 %)		 878
(0.02 %)		 379
(100.00 %)		 3,996,827
(27.97 %)		 2,094,728
(7.23 %)		 12,677,118
(40.57 %)		 81,791
(2.82 %)
656 pig (Bamei 2025)
GCA_030704935.2		 n/a 17,940
(1.49 %)		 20,133
(1.29 %)		 n/a 42.64
(100.00 %)		 n/a 21
(100.00 %)		 6,650,808
(50.63 %)		 1,731,111
(5.80 %)		 12,817,015
(40.05 %)		 81,487
(2.80 %)
657 pig (Duroc 2017)
GCF_000003025.6		 77,695
(4.05 %)		 18,980
(1.64 %)		 19,453
(1.32 %)		 59,876
(4.84 %)		 41.87
(98.81 %)		 544
(1.19 %)		 1,313
(98.81 %)		 5,021,184
(45.67 %)		 710,994
(1.32 %)		 13,243,289
(36.33 %)		 79,132
(1.82 %)
658 pig (Norwegian landrace 2024)
GCA_963921485.1		 n/a 18,500
(1.46 %)		 19,718
(1.29 %)		 n/a 42.45
(100.00 %)		 n/a 54
(100.00 %)		 4,068,783
(28.54 %)		 1,511,605
(5.52 %)		 12,867,101
(39.59 %)		 82,002
(2.44 %)
659 pig (USMARCv1 2017)
GCA_002844635.1		 n/a 19,458
(1.54 %)		 21,487
(1.27 %)		 58,655
(2.58 %)		 42.49
(95.20 %)		 661
(4.80 %)		 14,157
(100.00 %)		 5,159,244
(47.53 %)		 902,079
(3.63 %)		 13,145,120
(36.86 %)		 82,442
(2.62 %)
660 pig (Wuzhishan WZS1 2025)
GCA_048338725.1		 n/a 18,525
(1.46 %)		 19,792
(1.29 %)		 n/a 42.55
(100.00 %)		 n/a 20
(100.00 %)		 4,084,482
(28.40 %)		 1,424,314
(5.35 %)		 12,927,595
(39.56 %)		 81,967
(2.96 %)
661 plains viscacha rat (AO245 2017)
GCA_002564285.1		 n/a 23,367
(0.78 %)		 50,706
(0.93 %)		 n/a 41.26
(99.73 %)		 124,165
(0.16 %)		 1,682,965
(99.84 %)		 5,295,703
(27.32 %)		 1,024,529
(1.81 %)		 16,181,193
(35.22 %)		 46,628
(0.97 %)
662 plains zebra (Etosha38 2022 UCLA)
GCF_021613505.1		 55,794
(2.87 %)		 19,529
(1.76 %)		 21,214
(1.39 %)		 n/a 41.38
(99.04 %)		 14,595
(0.96 %)		 11,098
(100.00 %)		 3,683,862
(38.74 %)		 314,723
(0.68 %)		 15,217,328
(29.38 %)		 41,391
(1.27 %)
663 platypus (alternate hap Pmale09 2020)
GCA_004115175.2		 n/a 13,244
(1.26 %)		 19,241
(1.68 %)		 n/a 46.27
(100.00 %)		 25
(0.00 %)		 5,868
(100.00 %)		 4,420,884
(51.59 %)		 513,006
(3.13 %)		 7,749,797
(49.18 %)		 81,538
(8.24 %)
664 platypus (Pmale09 primary hap 2020)
GCA_004115215.4		 n/a 14,555
(1.24 %)		 18,891
(1.63 %)		 n/a 46.14
(99.18 %)		 515
(0.82 %)		 322
(100.00 %)		 7,731,079
(57.03 %)		 578,617
(2.89 %)		 9,113,668
(48.93 %)		 87,861
(7.92 %)
665 platypus (Pmale09 v4 2020)
GCF_004115215.2		 51,379
(3.07 %)		 14,778
(1.26 %)		 18,888
(1.63 %)		 n/a 46.14
(99.18 %)		 515
(0.82 %)		 322
(100.00 %)		 5,071,089
(51.34 %)		 578,614
(2.89 %)		 9,113,848
(48.93 %)		 87,796
(6.47 %)
666 polar bear (Baiyulong BGI 2014 refseq)
GCF_000687225.1		 35,751
(2.39 %)		 18,466
(1.69 %)		 15,384
(1.38 %)		 n/a 41.65
(98.35 %)		 110,343
(1.67 %)		 134,162
(98.33 %)		 4,123,540
(40.16 %)		 553,196
(1.29 %)		 13,765,581
(29.91 %)		 54,907
(1.17 %)
667 polar bear (UCSC 2021)
GCF_017311325.1		 52,175
(2.92 %)		 18,588
(1.75 %)		 20,731
(1.54 %)		 n/a 41.88
(99.60 %)		 45,532
(0.41 %)		 3,900
(100.00 %)		 4,204,162
(40.75 %)		 572,129
(1.75 %)		 13,926,894
(30.79 %)		 63,315
(1.93 %)
668 prairie deer mouse (Baylor 2013)
GCF_000500345.1		 50,187
(2.51 %)		 20,427
(1.69 %)		 20,874
(1.45 %)		 n/a 42.34
(94.06 %)		 182,263
(5.97 %)		 212,962
(94.03 %)		 n/a 1,229,123
(2.83 %)		 14,447,916
(30.09 %)		 23,246
(0.56 %)
669 prairie deer mouse (BWxNUB_F1_BW_parent 2025)
GCF_049852395.1		 84,704
(3.63 %)		 19,312
(1.68 %)		 20,354
(1.41 %)		 n/a 42.31
(100.00 %)		 106
(0.00 %)		 25
(100.00 %)		 6,577,724
(45.25 %)		 1,288,198
(5.24 %)		 13,978,540
(35.31 %)		 23,724
(0.69 %)
670 prairie deer mouse (Harvard 2020)
GCF_003704035.1		 69,779
(3.28 %)		 19,755
(1.73 %)		 19,194
(1.43 %)		 n/a 42.28
(95.07 %)		 147,442
(4.96 %)		 155,966
(95.04 %)		 4,751,621
(29.04 %)		 1,172,212
(2.66 %)		 13,934,672
(29.87 %)		 22,444
(0.57 %)
671 prairie vole
GCF_000317375.1		 40,484
(2.72 %)		 19,648
(1.91 %)		 19,489
(1.62 %)		 n/a 42.25
(92.03 %)		 180,677
(8.00 %)		 187,012
(92.00 %)		 3,779,126
(25.51 %)		 879,192
(2.11 %)		 12,360,347
(27.34 %)		 18,233
(0.52 %)
672 proboscis bat (hap1 2024)
GCA_037038545.1		 n/a 17,919
(1.46 %)		 19,330
(1.31 %)		 n/a 40.78
(100.00 %)		 68
(0.00 %)		 41
(100.00 %)		 3,707,234
(28.28 %)		 643,817
(2.22 %)		 12,106,384
(41.48 %)		 54,438
(1.38 %)
673 proboscis bat (hap2 2024)
GCA_037038555.1		 n/a 17,253
(1.51 %)		 18,507
(1.35 %)		 n/a 40.91
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 38
(100.00 %)		 3,466,835
(27.96 %)		 585,261
(1.91 %)		 11,364,898
(40.65 %)		 50,527
(1.37 %)
674 pronghorn (PH2016 2021)
GCA_021018645.1		 n/a 21,848
(1.58 %)		 27,614
(1.56 %)		 n/a 41.70
(96.83 %)		 74,027
(3.17 %)		 140,480
(96.83 %)		 3,335,744
(24.40 %)		 405,435
(4.11 %)		 13,855,606
(34.67 %)		 48,670
(1.19 %)
675 Przewalski's gazelle (PLG-pushi 2019)
GCA_006410515.1		 n/a 19,722
(1.52 %)		 21,663
(1.29 %)		 n/a 42.49
(95.93 %)		 557,686
(4.13 %)		 831,816
(95.87 %)		 5,438,181
(47.21 %)		 408,156
(1.63 %)		 13,068,837
(39.30 %)		 67,544
(1.31 %)
676 Przewalski's horse (Burgud 2014 refseq)
GCF_000696695.1		 45,089
(2.76 %)		 19,546
(1.69 %)		 22,107
(1.36 %)		 n/a 41.27
(99.13 %)		 80,963
(0.88 %)		 134,060
(99.12 %)		 3,787,533
(40.54 %)		 435,607
(1.73 %)		 14,738,418
(28.36 %)		 40,752
(0.94 %)
677 Przewalski's horse (Varuska primary hap 2024)
GCF_037783145.1		 117,131
(4.09 %)		 18,569
(1.70 %)		 20,018
(1.38 %)		 n/a 42.23
(100.00 %)		 310
(0.00 %)		 2,146
(100.00 %)		 3,768,149
(39.86 %)		 632,308
(5.35 %)		 14,449,518
(32.71 %)		 42,166
(4.46 %)
678 puma (L17-30 alternate hap 2023)
GCA_028749965.1		 n/a 18,380
(1.53 %)		 20,701
(1.40 %)		 n/a 41.91
(100.00 %)		 96
(0.00 %)		 304
(100.00 %)		 4,881,674
(33.96 %)		 978,817
(2.17 %)		 13,422,986
(35.08 %)		 69,437
(2.62 %)
679 puma (L17-30 primary hap 2023)
GCA_028749985.1		 n/a 17,553
(1.53 %)		 19,299
(1.39 %)		 n/a 41.89
(100.00 %)		 134
(0.00 %)		 390
(100.00 %)		 4,629,539
(33.53 %)		 919,008
(2.02 %)		 12,766,157
(34.70 %)		 65,437
(2.53 %)
680 puma (SC36_Marlon 2018 refseq)
GCF_003327715.1		 25,588
(1.44 %)		 17,664
(1.57 %)		 16,565
(1.29 %)		 n/a 41.36
(95.34 %)		 178,992
(4.69 %)		 2,175
(100.00 %)		 4,885,335
(42.70 %)		 833,138
(1.76 %)		 13,705,778
(31.28 %)		 58,912
(1.65 %)
681 punctate agouti
GCA_004363535.1		 n/a 22,612
(1.05 %)		 45,433
(1.19 %)		 n/a 40.79
(99.92 %)		 6,459
(0.02 %)		 993,123
(99.98 %)		 5,671,738
(32.53 %)		 945,722
(1.69 %)		 17,003,309
(36.58 %)		 85,696
(1.65 %)
682 Punta de Vaca leaf-eared mouse (GD2095 2023)
GCA_033318265.1		 n/a 18,332
(1.50 %)		 18,296
(1.29 %)		 n/a 40.01
(100.00 %)		 133
(0.00 %)		 437
(100.00 %)		 3,825,722
(28.38 %)		 915,865
(11.98 %)		 13,456,122
(37.89 %)		 18,577
(0.50 %)
683 pygmy sperm whale
GCA_004363705.1		 n/a 22,661
(1.30 %)		 42,546
(1.15 %)		 n/a 41.89
(99.89 %)		 6,053
(0.02 %)		 1,258,125
(99.98 %)		 5,185,912
(43.65 %)		 836,752
(1.88 %)		 14,150,125
(39.88 %)		 95,344
(2.15 %)
684 pygmy sperm whale (haplotype 1 2022 refseq)
GCF_026419965.1		 73,518
(2.67 %)		 18,496
(1.55 %)		 20,718
(1.32 %)		 n/a 42.05
(99.81 %)		 143
(0.19 %)		 581
(100.00 %)		 3,817,659
(34.51 %)		 758,297
(7.42 %)		 12,196,998
(39.96 %)		 101,353
(2.90 %)
685 pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 2 2022)
GCA_026419985.1		 n/a 18,550
(1.51 %)		 20,491
(1.29 %)		 n/a 42.18
(99.99 %)		 138
(0.01 %)		 391
(100.00 %)		 3,860,112
(33.83 %)		 820,375
(9.58 %)		 12,159,196
(41.59 %)		 106,168
(2.78 %)
686 Pyrenean desman (IBE-C5619 2021)
GCA_019455555.1		 n/a 17,527
(1.87 %)		 20,474
(1.83 %)		 n/a 41.67
(98.52 %)		 63,679
(1.49 %)		 75,985
(98.51 %)		 2,147,379
(23.41 %)		 327,740
(0.98 %)		 10,539,226
(28.05 %)		 44,487
(4.39 %)
687 rabbit (A946 2020)
GCA_013371645.1		 n/a 19,881
(1.40 %)		 22,566
(1.32 %)		 n/a 44.09
(99.92 %)		 4,254
(0.08 %)		 5,157
(99.93 %)		 5,202,709
(44.78 %)		 1,059,544
(2.39 %)		 13,897,372
(40.69 %)		 119,691
(2.74 %)
688 rabbit (alternate hap 2024)
GCA_964237575.1		 n/a 12,274
(1.39 %)		 16,482
(1.38 %)		 n/a 44.19
(100.00 %)		 n/a 10,111
(100.00 %)		 3,613,446
(49.48 %)		 579,915
(3.18 %)		 7,084,192
(39.81 %)		 65,573
(2.79 %)
689 rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 refseq)
GCF_009806435.1		 83,033
(4.16 %)		 19,486
(1.31 %)		 23,267
(1.31 %)		 n/a 43.83
(97.68 %)		 18,178
(2.32 %)		 3,160
(100.00 %)		 4,072,524
(21.41 %)		 976,273
(2.33 %)		 13,766,413
(39.76 %)		 113,371
(2.46 %)
690 rabbit (primary hap 2024 refseq)
GCF_964237555.1		 95,289
(4.22 %)		 19,385
(1.31 %)		 22,631
(1.31 %)		 n/a 44.02
(99.98 %)		 2,276
(0.02 %)		 221
(100.00 %)		 4,099,586
(21.20 %)		 1,062,900
(3.78 %)		 13,416,814
(41.72 %)		 116,523
(2.66 %)
691 rabbit (Thorbecke 2009 Broad refseq)
GCF_000003625.3		 43,642
(2.34 %)		 18,665
(1.39 %)		 20,095
(1.24 %)		 n/a 43.75
(95.14 %)		 80,789
(4.88 %)		 84,024
(95.12 %)		 4,890,480
(44.71 %)		 883,939
(1.73 %)		 13,254,520
(38.27 %)		 110,337
(2.33 %)
692 raccoon dog (2021)
GCF_905146905.1		 52,577
(2.89 %)		 19,628
(1.60 %)		 20,274
(1.43 %)		 n/a 41.28
(99.98 %)		 70
(0.02 %)		 811
(100.00 %)		 4,499,368
(31.98 %)		 1,005,212
(2.04 %)		 13,884,201
(32.95 %)		 52,450
(2.27 %)
693 Rambouillet sheep (Baylor 2017)
GCF_002742125.1		 50,083
(2.48 %)		 19,992
(1.47 %)		 22,506
(1.31 %)		 41,290
(1.46 %)		 41.91
(99.99 %)		 4,847
(0.01 %)		 7,486
(99.99 %)		 5,764,757
(47.38 %)		 507,629
(1.55 %)		 14,138,601
(41.27 %)		 51,748
(1.29 %)
694 Rambouillet sheep (U.Idaho 2021)
GCF_016772045.1		 70,461
(3.21 %)		 19,413
(1.59 %)		 21,222
(1.35 %)		 n/a 41.99
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 142
(100.00 %)		 5,300,958
(46.83 %)		 455,553
(1.24 %)		 13,023,443
(40.62 %)		 43,959
(1.30 %)
695 ratel
GCA_004024625.1		 n/a 22,196
(1.21 %)		 35,937
(1.18 %)		 n/a 42.00
(99.85 %)		 6,511
(0.02 %)		 2,074,823
(99.98 %)		 6,171,383
(41.93 %)		 877,669
(1.49 %)		 15,269,908
(41.22 %)		 95,094
(1.91 %)
696 red bat
GCA_004026805.1		 n/a 27,510
(1.22 %)		 65,467
(1.48 %)		 n/a 42.69
(99.94 %)		 6,380
(0.02 %)		 525,280
(99.98 %)		 4,644,227
(28.24 %)		 1,170,868
(2.68 %)		 15,628,238
(39.97 %)		 125,564
(3.55 %)
697 red deer
GCA_910593805.2		 n/a 20,412
(1.37 %)		 22,827
(1.25 %)		 n/a 43.54
(100.00 %)		 102
(0.00 %)		 500
(100.00 %)		 5,927,428
(40.11 %)		 501,561
(16.00 %)		 12,984,298
(46.91 %)		 108,724
(1.86 %)
698 red deer
GCA_910594005.2		 n/a 20,226
(1.25 %)		 23,009
(1.19 %)		 n/a 44.31
(100.00 %)		 110
(0.00 %)		 965
(100.00 %)		 6,158,139
(37.49 %)		 572,918
(22.39 %)		 12,897,105
(51.16 %)		 136,992
(2.02 %)
699 red deer (2021)
GCF_910594005.1		 68,992
(2.68 %)		 20,470
(1.48 %)		 22,563
(1.32 %)		 n/a 42.98
(100.00 %)		 40
(0.00 %)		 144
(100.00 %)		 5,501,063
(44.60 %)		 503,301
(12.23 %)		 13,102,622
(44.55 %)		 88,756
(1.66 %)
700 red deer (alternate hap 2021)
GCA_910593805.1		 n/a 18,817
(1.29 %)		 21,916
(1.20 %)		 n/a 44.23
(100.00 %)		 22
(0.00 %)		 4,021
(100.00 %)		 3,279,005
(20.48 %)		 472,706
(21.87 %)		 11,466,609
(50.26 %)		 128,858
(2.07 %)
701 red fox (BD-2025 2025)
GCF_048418805.1		 84,632
(3.45 %)		 19,565
(1.57 %)		 19,909
(1.38 %)		 n/a 41.31
(100.00 %)		 104
(0.00 %)		 289
(100.00 %)		 4,480,315
(31.76 %)		 1,010,887
(2.70 %)		 13,766,344
(33.12 %)		 50,763
(2.22 %)
702 red fox (hap1 2024)
GCA_964106825.2		 n/a 19,622
(1.57 %)		 20,371
(1.38 %)		 n/a 41.34
(99.98 %)		 1,845
(0.02 %)		 461
(100.00 %)		 4,519,485
(31.91 %)		 1,018,114
(2.59 %)		 13,810,284
(32.99 %)		 52,053
(2.31 %)
703 red fox (hap2 2024)
GCA_964106925.2		 n/a 19,517
(1.57 %)		 20,105
(1.37 %)		 n/a 41.31
(99.99 %)		 1,819
(0.02 %)		 350
(100.00 %)		 4,487,839
(31.79 %)		 1,010,106
(2.64 %)		 13,838,711
(33.07 %)		 51,373
(2.26 %)
704 red fox (tameXaggressive cross 2018)
GCF_003160815.1		 43,508
(2.67 %)		 19,826
(1.69 %)		 18,893
(1.40 %)		 n/a 41.08
(97.06 %)		 246,167
(2.96 %)		 82,424
(100.00 %)		 4,919,102
(40.79 %)		 954,461
(2.46 %)		 14,190,625
(30.86 %)		 53,204
(1.88 %)
705 reed vole (MF-2015 2020)
GCF_014885135.2		 55,722
(3.60 %)		 19,808
(1.93 %)		 20,787
(1.69 %)		 n/a 42.36
(95.60 %)		 67,118
(4.40 %)		 10,460
(100.00 %)		 3,130,955
(20.09 %)		 831,969
(2.09 %)		 11,985,657
(28.48 %)		 18,764
(0.58 %)
706 Reeves' muntjac
GCA_963930625.2		 n/a 19,215
(1.54 %)		 22,411
(1.38 %)		 n/a 41.94
(100.00 %)		 37
(0.00 %)		 242
(100.00 %)		 5,985,581
(48.42 %)		 555,815
(2.95 %)		 13,147,360
(40.36 %)		 59,987
(1.80 %)
707 Reeves' muntjac (alternate hap 2024)
GCA_963930665.1		 n/a 18,947
(1.29 %)		 24,114
(1.28 %)		 n/a 42.75
(100.00 %)		 n/a 8,892
(100.00 %)		 3,375,476
(23.21 %)		 654,539
(6.64 %)		 11,132,469
(48.29 %)		 79,357
(2.66 %)
708 Reeves' muntjac (primary hap 2024)
GCF_963930625.1		 52,442
(2.57 %)		 19,577
(1.52 %)		 22,283
(1.38 %)		 n/a 41.89
(99.99 %)		 682
(0.01 %)		 267
(100.00 %)		 3,294,672
(23.89 %)		 527,436
(2.98 %)		 13,137,581
(39.89 %)		 57,436
(1.81 %)
709 reindeer (2023)
GCA_963422255.1		 n/a 21,329
(1.58 %)		 25,201
(1.59 %)		 n/a 41.46
(98.35 %)		 131,886
(1.65 %)		 259,765
(98.35 %)		 3,254,173
(23.49 %)		 440,431
(2.00 %)		 14,258,607
(36.17 %)		 48,931
(1.20 %)
710 reindeer (US061 2019)
GCA_004026565.1		 n/a 24,150
(1.39 %)		 39,911
(1.41 %)		 n/a 42.08
(99.89 %)		 4,769
(0.02 %)		 1,365,508
(99.98 %)		 6,083,178
(46.10 %)		 546,470
(1.23 %)		 14,434,855
(43.16 %)		 55,319
(1.23 %)
711 Rice's whale (hap1 2023)
GCA_028017805.1		 n/a 19,396
(1.48 %)		 21,693
(1.26 %)		 n/a 41.62
(97.80 %)		 131
(2.20 %)		 1,039
(100.00 %)		 3,973,936
(35.55 %)		 987,571
(11.66 %)		 12,473,459
(42.11 %)		 74,971
(1.64 %)
712 Rice's whale (hap2 2023 refseq)
GCF_028023285.1		 59,888
(2.34 %)		 19,291
(1.53 %)		 21,195
(1.30 %)		 n/a 41.44
(99.90 %)		 334
(0.10 %)		 774
(100.00 %)		 3,917,923
(36.26 %)		 828,521
(9.28 %)		 12,518,796
(41.08 %)		 73,126
(1.69 %)
713 Rickett's big-footed myotis (AB-2021 2024)
GCA_036010255.1		 n/a 18,982
(1.81 %)		 22,002
(1.76 %)		 n/a 43.12
(100.00 %)		 n/a 105
(100.00 %)		 2,909,847
(24.53 %)		 757,964
(3.03 %)		 10,561,925
(36.25 %)		 57,318
(2.32 %)
714 Risso's dolphin
GCF_964374135.1		 37,640
(1.92 %)		 18,598
(1.56 %)		 20,984
(1.29 %)		 n/a 42.25
(99.99 %)		 1,138
(0.01 %)		 2,283
(99.99 %)		 5,101,286
(54.29 %)		 1,342,544
(11.28 %)		 12,274,011
(41.76 %)		 76,936
(4.65 %)
715 Risso's dolphin (hap1.1 2024)
GCA_964374135.1		 n/a 18,825
(1.58 %)		 20,986
(1.29 %)		 n/a 42.25
(99.99 %)		 1,138
(0.01 %)		 1,150
(100.00 %)		 4,405,513
(43.51 %)		 1,342,544
(11.28 %)		 12,274,096
(41.76 %)		 76,936
(4.65 %)
716 Risso's dolphin (hap2.1 2024)
GCA_964374185.1		 n/a 18,061
(1.68 %)		 20,080
(1.36 %)		 n/a 41.97
(99.99 %)		 1,073
(0.01 %)		 2,135
(99.99 %)		 3,948,427
(43.52 %)		 848,222
(8.00 %)		 11,527,950
(38.76 %)		 70,117
(3.31 %)
717 root vole (2023)
GCA_963919705.1		 n/a 19,293
(1.92 %)		 20,635
(1.67 %)		 n/a 42.30
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 268
(100.00 %)		 4,396,130
(38.90 %)		 891,534
(2.66 %)		 12,119,692
(31.39 %)		 19,542
(0.63 %)
718 Ryukyu mouse (v2 2017)
GCF_900094665.2		 53,792
(2.85 %)		 21,351
(2.29 %)		 18,073
(1.39 %)		 n/a 41.70
(89.05 %)		 306,599
(10.98 %)		 30,835
(92.70 %)		 4,479,912
(35.83 %)		 1,351,677
(2.59 %)		 12,964,608
(27.49 %)		 15,963
(0.43 %)
719 Saanen dairy goat
GCA_015443085.1		 n/a 19,257
(1.54 %)		 21,221
(1.32 %)		 n/a 42.30
(100.00 %)		 170
(0.00 %)		 1,362
(100.00 %)		 5,336,862
(47.58 %)		 515,161
(2.87 %)		 13,144,895
(41.67 %)		 58,623
(2.22 %)
720 saddleback dolphin (alternate hap 2023)
GCA_949987525.1		 n/a 18,509
(1.54 %)		 22,514
(1.36 %)		 n/a 41.95
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 7,427
(100.00 %)		 3,675,922
(35.75 %)		 950,374
(10.49 %)		 11,670,399
(40.31 %)		 63,587
(3.15 %)
721 saddleback dolphin (alternate hap 2024)
GCA_949987525.2		 n/a 18,426
(1.62 %)		 22,420
(1.35 %)		 n/a 41.95
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 7,427
(100.00 %)		 4,448,346
(50.40 %)		 950,374
(10.49 %)		 11,670,399
(40.31 %)		 63,587
(3.15 %)
722 saddleback dolphin (primary hap 2024)
GCA_949987515.2		 n/a 18,542
(1.57 %)		 20,620
(1.32 %)		 n/a 42.06
(99.99 %)		 968
(0.01 %)		 631
(100.00 %)		 4,890,277
(52.33 %)		 1,258,165
(13.09 %)		 12,359,469
(42.64 %)		 66,188
(3.91 %)
723 saddleback dolphin (v1 primary hap 2023 refseq)
GCF_949987515.1		 46,746
(2.39 %)		 18,624
(1.49 %)		 20,662
(1.31 %)		 n/a 42.06
(99.99 %)		 968
(0.01 %)		 630
(100.00 %)		 4,020,676
(35.99 %)		 1,259,549
(13.09 %)		 12,359,748
(42.64 %)		 66,179
(3.91 %)
724 saddleback dolphin (v2 primary hap 2024 refseq)
GCF_949987515.2		 46,014
(2.36 %)		 18,616
(1.49 %)		 20,618
(1.32 %)		 n/a 42.06
(99.99 %)		 968
(0.01 %)		 1,598
(99.99 %)		 4,020,525
(35.99 %)		 1,258,165
(13.09 %)		 12,359,758
(42.64 %)		 66,188
(3.91 %)
725 saiga antelope
GCA_004024985.1		 n/a 23,736
(0.84 %)		 55,133
(0.88 %)		 n/a 42.52
(99.87 %)		 2,867
(0.01 %)		 1,775,066
(99.99 %)		 6,485,113
(49.43 %)		 447,097
(0.88 %)		 13,972,753
(44.46 %)		 46,883
(0.82 %)
726 Schreibers' long-fingered ba
GCF_964146895.1		 50,853
(3.35 %)		 18,113
(2.10 %)		 21,266
(1.89 %)		 n/a 42.51
(100.00 %)		 140
(0.00 %)		 186
(100.00 %)		 2,843,364
(34.45 %)		 457,565
(5.58 %)		 10,220,082
(31.02 %)		 59,522
(2.81 %)
727 Schreibers' long-fingered bat (US075 2019)
GCA_004026525.1		 n/a 20,147
(2.06 %)		 31,271
(1.82 %)		 n/a 42.27
(99.94 %)		 6,918
(0.04 %)		 184,538
(99.96 %)		 2,772,932
(29.66 %)		 366,782
(1.13 %)		 10,477,531
(28.60 %)		 62,520
(2.73 %)
728 Schreibers' long-fingered bat (v2 hap1 2025)
GCA_964146895.2		 n/a 18,109
(2.10 %)		 21,263
(1.89 %)		 n/a 42.51
(100.00 %)		 140
(0.00 %)		 186
(100.00 %)		 2,812,261
(34.39 %)		 457,565
(5.58 %)		 10,220,083
(31.02 %)		 59,522
(2.81 %)
729 Schreibers' long-fingered bat (v2 hap2 2025)
GCA_964145185.2		 n/a 17,286
(2.19 %)		 20,474
(1.95 %)		 n/a 42.64
(100.00 %)		 86
(0.00 %)		 254
(100.00 %)		 2,610,773
(33.65 %)		 389,844
(4.42 %)		 9,728,138
(29.49 %)		 56,508
(2.97 %)
730 scimitar-horned oryx
GCF_014754425.2		 51,527
(2.72 %)		 19,713
(1.57 %)		 21,928
(1.32 %)		 n/a 41.74
(99.30 %)		 16,241
(0.70 %)		 9,089
(100.00 %)		 5,435,109
(46.76 %)		 414,279
(0.98 %)		 13,490,956
(40.45 %)		 42,961
(1.10 %)
731 Screaming hairy armadillo
GCA_004027955.1		 n/a 24,532
(0.39 %)		 56,725
(0.46 %)		 n/a 39.68
(99.70 %)		 2,747
(0.01 %)		 7,680,080
(99.99 %)		 8,978,735
(36.02 %)		 1,516,551
(1.58 %)		 32,918,217
(47.67 %)		 234,762
(1.56 %)
732 sea otter (GAN:26980312 2017 refseq)
GCF_002288905.1		 38,140
(2.17 %)		 18,578
(1.64 %)		 20,913
(1.44 %)		 34,179
(1.77 %)		 41.56
(98.79 %)		 23,134
(1.21 %)		 29,589
(98.79 %)		 4,703,044
(41.42 %)		 721,750
(1.39 %)		 14,065,653
(32.89 %)		 55,388
(1.87 %)
733 Seba's short-tailed bat
GCA_004027735.1		 n/a 21,878
(0.94 %)		 55,858
(1.10 %)		 n/a 42.70
(99.84 %)		 3,864
(0.01 %)		 1,929,203
(99.99 %)		 3,802,235
(28.35 %)		 606,320
(1.03 %)		 15,171,250
(31.99 %)		 118,227
(2.28 %)
734 sei whale
GCF_965194805.1		 89,176
(6.49 %)		 19,289
(1.32 %)		 21,865
(1.14 %)		 n/a 41.99
(99.99 %)		 1,179
(0.01 %)		 2,571
(100.00 %)		 4,862,311
(59.97 %)		 1,097,215
(21.14 %)		 12,203,838
(50.47 %)		 80,128
(1.58 %)
735 sei whale (hap1.1 2025)
GCA_965194805.1		 n/a 19,292
(1.27 %)		 21,865
(1.14 %)		 n/a 41.99
(99.99 %)		 1,179
(0.01 %)		 2,572
(100.00 %)		 4,525,289
(42.25 %)		 1,097,216
(21.14 %)		 12,203,884
(50.47 %)		 80,128
(1.58 %)
736 sei whale (hap2.1 2025)
GCA_965194725.1		 n/a 19,313
(1.37 %)		 21,662
(1.17 %)		 n/a 41.68
(99.99 %)		 1,066
(0.01 %)		 2,917
(99.99 %)		 4,418,625
(42.98 %)		 875,114
(15.81 %)		 12,360,254
(46.52 %)		 78,537
(1.66 %)
737 sheep (hu hu3095 2024)
GCA_040805955.1		 n/a 19,388
(1.42 %)		 21,612
(1.28 %)		 n/a 43.17
(100.00 %)		 n/a 28
(100.00 %)		 5,311,536
(44.06 %)		 653,238
(7.29 %)		 12,937,231
(44.10 %)		 63,230
(6.03 %)
738 sheep (OAR_USU_Benz2616 2023)
GCF_016772045.2		 89,680
(5.44 %)		 19,308
(1.52 %)		 21,506
(1.35 %)		 n/a 42.01
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 143
(100.00 %)		 3,275,767
(22.85 %)		 464,346
(1.26 %)		 12,987,607
(40.61 %)		 44,477
(1.28 %)
739 sheep (Texel 2015)
GCA_000298735.2		 n/a 19,179
(1.56 %)		 19,001
(1.26 %)		 48,105
(1.85 %)		 41.90
(98.94 %)		 44,566
(1.07 %)		 48,481
(98.93 %)		 5,429,824
(46.13 %)		 540,267
(1.64 %)		 13,509,668
(38.83 %)		 43,911
(1.13 %)
740 short-tailed shrew (CBP01580 primary hap 2026)
GCA_051295465.2		 n/a 16,479
(1.36 %)		 21,313
(1.48 %)		 n/a 42.66
(99.98 %)		 2,066
(0.02 %)		 2,486
(99.98 %)		 6,370,533
(45.64 %)		 1,336,462
(5.34 %)		 11,780,354
(42.31 %)		 51,740
(1.94 %)
741 shrew mouse
GCF_900095145.1		 46,279
(2.64 %)		 20,549
(2.23 %)		 18,979
(1.49 %)		 94,079
(3.98 %)		 41.89
(90.53 %)		 269,643
(9.50 %)		 17,879
(93.73 %)		 4,788,498
(38.32 %)		 1,499,714
(3.03 %)		 13,021,757
(27.83 %)		 16,787
(0.47 %)
742 Siberian hamster (SSSS 2022)
GCA_023856395.1		 n/a 18,375
(1.83 %)		 17,066
(1.44 %)		 n/a 41.27
(99.64 %)		 88,601
(0.37 %)		 7,756
(100.00 %)		 3,152,242
(21.63 %)		 1,087,009
(2.64 %)		 12,055,167
(29.20 %)		 15,455
(0.48 %)
743 Siberian musk deer (BS20 2019 Broad)
GCA_004024705.1		 n/a 23,440
(1.32 %)		 37,497
(1.19 %)		 n/a 42.32
(99.86 %)		 19,764
(0.07 %)		 1,195,467
(99.93 %)		 6,726,950
(49.79 %)		 437,480
(1.57 %)		 14,155,240
(46.22 %)		 49,177
(1.05 %)
744 sika deer (Changchun, China MLH-2022 2023)
GCA_034195675.1		 n/a 20,087
(1.59 %)		 23,556
(1.46 %)		 n/a 41.66
(99.97 %)		 1,724
(0.03 %)		 1,889
(100.00 %)		 3,925,148
(27.17 %)		 419,490
(1.24 %)		 13,364,988
(37.79 %)		 47,630
(1.31 %)
745 small Madagascar hedgehog
GCF_000313985.2		 37,090
(1.93 %)		 18,969
(1.19 %)		 19,298
(1.31 %)		 n/a 43.01
(88.43 %)		 270,406
(11.60 %)		 7,490
(100.00 %)		 3,789,337
(28.89 %)		 429,226
(0.87 %)		 16,951,112
(32.23 %)		 39,993
(0.70 %)
746 smoky shrew (2023)
GCF_029834395.1		 37,165
(1.66 %)		 17,572
(1.06 %)		 24,146
(1.29 %)		 n/a 43.43
(100.00 %)		 n/a 497
(100.00 %)		 2,593,080
(14.11 %)		 1,194,567
(7.25 %)		 14,051,522
(48.20 %)		 107,473
(2.80 %)
747 snow leopard (11264 2022)
GCF_023721935.1		 53,569
(3.37 %)		 18,780
(1.67 %)		 21,038
(1.40 %)		 n/a 41.60
(99.30 %)		 23,786
(0.70 %)		 2,636
(100.00 %)		 4,714,429
(34.93 %)		 919,518
(1.59 %)		 13,711,504
(33.24 %)		 64,690
(2.41 %)
748 snowshoe hare
GCA_004026855.1		 n/a 23,263
(0.88 %)		 55,811
(1.01 %)		 n/a 44.12
(99.87 %)		 10,153
(0.03 %)		 1,602,982
(99.97 %)		 4,767,120
(21.29 %)		 1,040,992
(2.22 %)		 15,680,144
(43.23 %)		 126,152
(2.28 %)
749 social tuco-tuco
GCA_004027165.1		 n/a 25,166
(1.12 %)		 41,316
(1.26 %)		 n/a 40.71
(99.89 %)		 16,191
(0.06 %)		 823,762
(99.94 %)		 5,390,906
(28.28 %)		 1,027,922
(2.15 %)		 15,241,308
(38.39 %)		 31,883
(0.72 %)
750 Soft-furred tree mouse (WYS1704033 2022)
GCA_023101885.1		 n/a 20,505
(1.36 %)		 25,606
(1.53 %)		 n/a 42.21
(99.64 %)		 3,794
(0.36 %)		 1,243
(100.00 %)		 5,973,279
(45.08 %)		 1,551,851
(4.63 %)		 13,570,249
(38.60 %)		 73,762
(1.53 %)
751 soprano pipistrelle (alternate hap 2023)
GCA_949987765.1		 n/a 17,590
(1.81 %)		 21,597
(1.85 %)		 n/a 42.88
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,717
(100.00 %)		 2,734,555
(21.46 %)		 795,752
(6.56 %)		 9,601,735
(36.35 %)		 62,524
(3.25 %)
752 soprano pipistrelle (hap1.2 2025)
GCA_949987585.2		 n/a 17,999
(1.88 %)		 21,396
(1.80 %)		 n/a 42.74
(100.00 %)		 122
(0.00 %)		 330
(100.00 %)		 4,426,108
(44.40 %)		 866,819
(7.44 %)		 10,132,985
(37.65 %)		 64,680
(3.15 %)
753 soprano pipistrelle (hap2.2 2025)
GCA_949987765.2		 n/a 17,269
(1.90 %)		 20,534
(1.83 %)		 n/a 42.89
(100.00 %)		 87
(0.00 %)		 369
(100.00 %)		 4,151,522
(43.86 %)		 809,312
(8.01 %)		 9,615,104
(37.56 %)		 63,890
(3.24 %)
754 soprano pipistrelle (primary hap 2023)
GCA_949987585.1		 n/a 18,056
(1.78 %)		 21,158
(1.79 %)		 n/a 42.67
(100.00 %)		 161
(0.00 %)		 249
(100.00 %)		 2,899,535
(21.64 %)		 853,717
(7.80 %)		 10,162,216
(37.72 %)		 63,256
(3.06 %)
755 South African ground squirrel
GCA_004024805.1		 n/a 22,802
(1.44 %)		 33,892
(1.27 %)		 n/a 39.97
(99.92 %)		 9,745
(0.04 %)		 587,115
(99.96 %)		 5,256,998
(34.93 %)		 594,122
(1.27 %)		 14,462,947
(33.96 %)		 34,141
(0.80 %)
756 Southeastern Asian house mouse (2016)
GCA_001624445.1		 n/a 21,103
(2.24 %)		 18,682
(1.45 %)		 102,099
(4.16 %)		 41.83
(86.23 %)		 424,005
(13.83 %)		 52,352
(97.85 %)		 4,990,851
(39.88 %)		 1,356,202
(2.67 %)		 13,469,640
(26.15 %)		 16,724
(0.41 %)
757 Southeastern Asian house mouse (2022)
GCA_921999005.2		 n/a 21,799
(2.13 %)		 19,729
(1.40 %)		 110,356
(4.43 %)		 41.78
(99.19 %)		 278
(0.81 %)		 151
(100.00 %)		 4,663,228
(40.41 %)		 1,549,985
(3.70 %)		 13,012,600
(34.99 %)		 21,349
(0.52 %)
758 Southeastern Asian house mouse (T2T 2024)
GCA_964188545.1		 n/a 22,529
(1.85 %)		 20,409
(1.22 %)		 n/a 41.10
(99.90 %)		 78
(0.10 %)		 416
(99.90 %)		 4,880,101
(47.77 %)		 1,689,287
(15.13 %)		 12,822,147
(42.92 %)		 22,642
(0.54 %)
759 Southern African pygmy mouse (2020)
GCA_902729485.2		 n/a 21,253
(2.02 %)		 24,053
(1.41 %)		 n/a 41.62
(85.36 %)		 63,317
(14.65 %)		 92,356
(85.35 %)		 5,677,434
(41.24 %)		 1,683,338
(3.20 %)		 13,320,768
(28.29 %)		 21,132
(0.44 %)
760 southern elephant seal
GCF_011800145.1		 53,210
(2.86 %)		 19,520
(1.73 %)		 20,727
(1.41 %)		 39,634
(1.86 %)		 41.45
(99.36 %)		 22,850
(0.64 %)		 1,115
(100.00 %)		 4,728,105
(43.75 %)		 585,443
(1.13 %)		 13,463,979
(33.65 %)		 53,182
(1.62 %)
761 southern flying squirrel (Volans SFS_CC1 2021)
GCA_020662805.1		 n/a 19,813
(1.54 %)		 25,643
(1.37 %)		 n/a 40.48
(98.33 %)		 53,082
(1.67 %)		 114,190
(98.33 %)		 5,649,834
(41.22 %)		 689,166
(1.55 %)		 14,561,421
(30.61 %)		 37,158
(0.90 %)
762 southern grasshopper mouse (2020)
GCA_903995425.1		 n/a 19,395
(1.68 %)		 18,821
(1.36 %)		 n/a 41.81
(98.94 %)		 2,143
(1.06 %)		 2,949
(100.00 %)		 4,850,480
(28.64 %)		 1,195,836
(2.72 %)		 13,539,823
(32.73 %)		 18,046
(0.54 %)
763 southern grasshopper mouse (2020)
GCF_903995425.1		 47,152
(2.39 %)		 19,356
(1.68 %)		 18,821
(1.36 %)		 n/a 41.81
(98.94 %)		 2,143
(1.06 %)		 2,949
(100.00 %)		 4,850,460
(28.64 %)		 1,195,836
(2.72 %)		 13,540,762
(32.73 %)		 18,046
(0.54 %)
764 Southern marsupial mole (Waite Creek area ABTC07570 2026)
GCA_048126345.2		 n/a 24,714
(0.82 %)		 18,971
(0.87 %)		 n/a 37.80
(99.99 %)		 211
(0.01 %)		 688
(100.00 %)		 13,545,658
(58.39 %)		 1,450,475
(2.40 %)		 21,374,274
(47.19 %)		 17,923
(0.30 %)
765 southern multimammate mouse
GCF_008632895.1		 69,058
(3.04 %)		 20,313
(2.11 %)		 17,745
(1.38 %)		 n/a 41.39
(91.90 %)		 146,713
(8.12 %)		 28
(100.00 %)		 4,875,400
(38.43 %)		 1,454,350
(2.93 %)		 13,104,717
(28.82 %)		 16,715
(0.45 %)
766 southern tamandua (mTamTet1 alternate hap 2022)
GCA_023853755.1		 n/a 20,179
(1.21 %)		 24,249
(1.19 %)		 n/a 39.54
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 7,866
(100.00 %)		 3,953,031
(35.88 %)		 531,111
(1.14 %)		 16,354,874
(39.96 %)		 59,907
(1.35 %)
767 southern tamandua (mTamTet1 primary hap 2022)
GCA_023851605.1		 n/a 20,058
(1.26 %)		 22,196
(1.13 %)		 n/a 39.48
(99.44 %)		 961
(0.56 %)		 201
(100.00 %)		 4,037,291
(46.02 %)		 593,019
(1.17 %)		 18,033,833
(40.56 %)		 65,039
(1.33 %)
768 southern tamandua (mTamTet1 primary hap 2022)
GCF_023851605.1		 84,279
(3.04 %)		 20,960
(1.28 %)		 22,188
(1.13 %)		 n/a 39.48
(99.44 %)		 961
(0.56 %)		 200
(100.00 %)		 4,793,649
(47.24 %)		 593,018
(1.17 %)		 18,033,318
(40.56 %)		 65,039
(1.33 %)
769 southern three-banded armadillo
GCA_004025125.1		 n/a 29,138
(0.73 %)		 56,522
(0.75 %)		 n/a 39.20
(99.82 %)		 15,801
(0.04 %)		 2,941,308
(99.96 %)		 6,990,740
(38.88 %)		 839,452
(1.23 %)		 24,805,397
(43.95 %)		 71,951
(0.98 %)
770 southern two-toed sloth (mChoDid1 alternate hap 2020)
GCA_015220265.1		 n/a 22,897
(1.23 %)		 27,007
(1.18 %)		 n/a 39.87
(100.00 %)		 70
(0.00 %)		 12,050
(100.00 %)		 4,502,020
(38.27 %)		 576,759
(1.02 %)		 17,143,050
(40.65 %)		 51,339
(1.15 %)
771 southern two-toed sloth (mChoDid1 primary hap 2020)
GCF_015220235.1		 63,054
(2.39 %)		 21,998
(1.29 %)		 23,177
(1.18 %)		 45,345
(1.69 %)		 39.89
(97.48 %)		 1,243
(2.52 %)		 146
(100.00 %)		 4,559,690
(39.66 %)		 577,607
(1.02 %)		 16,594,630
(40.50 %)		 51,430
(1.14 %)
772 southern two-toed sloth (primary hap 2020)
GCA_015220235.1		 n/a 22,250
(1.38 %)		 23,180
(1.18 %)		 n/a 39.89
(97.48 %)		 1,240
(2.52 %)		 146
(100.00 %)		 4,830,544
(50.68 %)		 577,607
(1.02 %)		 16,594,148
(40.49 %)		 51,430
(1.14 %)
773 southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 refseq)
GCF_000283155.1		 37,037
(2.11 %)		 18,398
(1.71 %)		 19,753
(1.44 %)		 n/a 40.90
(96.05 %)		 54,737
(3.96 %)		 57,824
(96.04 %)		 3,685,898
(38.31 %)		 421,694
(0.97 %)		 14,765,529
(28.93 %)		 36,281
(1.02 %)
774 Sowerby's beaked whale
GCF_964165515.1		 50,568
(2.18 %)		 19,470
(1.39 %)		 22,885
(1.24 %)		 n/a 42.04
(99.99 %)		 1,095
(0.01 %)		 2,696
(99.99 %)		 4,774,485
(38.32 %)		 825,474
(10.97 %)		 11,375,525
(45.31 %)		 76,527
(3.10 %)
775 Sowerby's beaked whale (hap1 2024)
GCA_964165515.1		 n/a 19,471
(1.39 %)		 22,951
(1.24 %)		 n/a 42.04
(99.99 %)		 1,095
(0.01 %)		 1,604
(100.00 %)		 4,307,839
(34.31 %)		 825,475
(10.97 %)		 11,375,945
(45.31 %)		 76,527
(3.10 %)
776 Sowerby's beaked whale (hap2 2024)
GCA_964148845.1		 n/a 18,591
(1.46 %)		 21,588
(1.27 %)		 n/a 42.00
(99.99 %)		 974
(0.01 %)		 2,126
(99.99 %)		 3,961,403
(34.20 %)		 742,897
(9.73 %)		 10,832,739
(43.68 %)		 70,803
(2.85 %)
777 Sowerby's beaked whale (US080 2019)
GCA_004027085.1		 n/a 22,800
(1.32 %)		 38,247
(1.17 %)		 n/a 41.68
(99.84 %)		 8,597
(0.03 %)		 1,810,317
(99.97 %)		 5,520,986
(45.05 %)		 1,081,962
(2.69 %)		 13,480,261
(43.01 %)		 69,001
(1.39 %)
778 sperm whale (SW-GA 2023)
GCF_002837175.3		 62,616
(2.83 %)		 19,485
(1.75 %)		 22,707
(1.41 %)		 n/a 41.33
(95.82 %)		 121,387
(4.20 %)		 133,555
(95.80 %)		 3,906,439
(36.43 %)		 691,647
(2.39 %)		 13,489,368
(32.95 %)		 86,751
(2.23 %)
779 spotted hyena (KB4526 2019)
GCF_008692635.1		 44,813
(2.42 %)		 17,929
(1.62 %)		 18,444
(1.40 %)		 n/a 41.48
(99.10 %)		 259,266
(0.92 %)		 283,944
(99.08 %)		 5,744,848
(42.15 %)		 646,532
(1.63 %)		 13,599,442
(32.09 %)		 61,299
(2.04 %)
780 spotted-tailed quoll (Chaos hap1 2025)
GCA_048593285.1		 n/a 15,188
(0.80 %)		 15,406
(0.90 %)		 n/a 36.07
(99.97 %)		 151
(0.03 %)		 157
(99.97 %)		 4,933,924
(23.65 %)		 1,239,006
(2.76 %)		 20,612,787
(41.98 %)		 21,700
(0.64 %)
781 spotted-tailed quoll (Chaos hap2 2025)
GCA_048593245.1		 n/a 15,441
(0.80 %)		 15,791
(0.92 %)		 n/a 36.12
(99.99 %)		 118
(0.01 %)		 124
(99.99 %)		 4,962,547
(23.62 %)		 1,257,253
(2.87 %)		 20,652,321
(42.01 %)		 22,718
(0.69 %)
782 star-nosed mole
GCF_000260355.1		 30,444
(2.86 %)		 16,116
(1.82 %)		 17,403
(1.78 %)		 n/a 41.55
(95.10 %)		 82,557
(4.92 %)		 84,595
(95.08 %)		 1,855,039
(18.90 %)		 308,473
(0.86 %)		 9,571,561
(26.02 %)		 48,079
(2.76 %)
783 Steller sea lion
GCF_004028035.1		 46,044
(2.38 %)		 21,171
(1.78 %)		 21,626
(1.43 %)		 36,701
(1.75 %)		 41.38
(99.41 %)		 18,994
(0.59 %)		 24,485
(99.41 %)		 4,556,415
(43.53 %)		 577,797
(1.09 %)		 13,545,012
(33.71 %)		 51,355
(1.45 %)
784 Stephens's kangaroo rat
GCA_004024685.1		 n/a 20,638
(1.19 %)		 43,541
(1.37 %)		 n/a 41.90
(99.85 %)		 8,882
(0.04 %)		 1,278,525
(99.96 %)		 4,886,095
(30.36 %)		 1,229,832
(5.30 %)		 11,334,494
(44.33 %)		 38,450
(1.17 %)
785 steppe mouse (ZRU 2018)
GCA_003336285.1		 n/a 22,032
(2.17 %)		 20,891
(1.41 %)		 n/a 41.70
(95.78 %)		 123,681
(4.24 %)		 161,217
(95.76 %)		 4,964,415
(42.35 %)		 1,414,584
(2.75 %)		 12,989,925
(31.80 %)		 17,544
(0.44 %)
786 Stoliczka's trident bat (China 2021113_DDA alternate hap 2024)
GCA_043727795.1		 n/a 18,498
(1.82 %)		 20,345
(1.58 %)		 n/a 41.33
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 2,228
(100.00 %)		 4,403,018
(41.05 %)		 809,880
(2.56 %)		 11,206,839
(32.61 %)		 38,354
(1.36 %)
787 Stoliczka's trident bat (China 2021113_DDA primary hap 2024)
GCA_043727835.1		 n/a 19,605
(1.80 %)		 20,075
(1.48 %)		 n/a 41.32
(100.00 %)		 87
(0.00 %)		 80
(100.00 %)		 4,110,913
(40.46 %)		 838,212
(2.48 %)		 11,938,168
(33.52 %)		 40,424
(1.32 %)
788 straw-colored fruit bat
GCA_000465285.1		 n/a 20,161
(1.66 %)		 40,283
(1.50 %)		 n/a 39.24
(99.62 %)		 154,908
(0.40 %)		 288,446
(99.60 %)		 2,814,732
(32.92 %)		 372,539
(1.01 %)		 12,351,823
(25.93 %)		 67,245
(2.34 %)
789 stripe-headed round-eared bat
GCA_004024845.1		 n/a 20,248
(1.62 %)		 29,173
(1.61 %)		 n/a 42.04
(99.96 %)		 2,860
(0.01 %)		 252,670
(99.99 %)		 3,018,746
(29.48 %)		 333,243
(0.74 %)		 12,128,116
(30.51 %)		 59,513
(1.87 %)
790 striped dolphin (alternate hap 2023)
GCA_951394445.1		 n/a 18,204
(1.54 %)		 21,036
(1.34 %)		 n/a 42.07
(100.00 %)		 n/a 3,464
(100.00 %)		 3,767,720
(35.65 %)		 1,102,723
(10.92 %)		 11,794,617
(40.96 %)		 67,537
(3.57 %)
791 striped dolphin (primary hap 2023 genbank)
GCA_951394435.1		 n/a 18,595
(1.48 %)		 20,637
(1.29 %)		 n/a 42.18
(99.99 %)		 993
(0.01 %)		 639
(100.00 %)		 4,097,623
(35.88 %)		 1,442,973
(13.60 %)		 12,327,244
(43.08 %)		 68,498
(4.29 %)
792 striped dolphin (primary hap 2023 refseq)
GCF_951394435.1		 55,298
(2.72 %)		 18,760
(1.55 %)		 20,645
(1.29 %)		 n/a 42.18
(99.99 %)		 993
(0.01 %)		 1,630
(99.99 %)		 5,991,283
(52.35 %)		 1,442,973
(13.60 %)		 12,326,846
(43.08 %)		 68,498
(4.29 %)
793 striped hyena (BS54 2019 Broad)
GCA_004023945.1		 n/a 22,373
(1.45 %)		 39,382
(1.45 %)		 n/a 41.66
(99.93 %)		 11,849
(0.05 %)		 362,072
(99.95 %)		 5,048,667
(42.42 %)		 712,073
(1.24 %)		 13,879,012
(34.58 %)		 69,835
(2.20 %)
794 striped hyena (Hyena2069 2018 Potsdam U)
GCF_003009895.1		 48,870
(2.41 %)		 18,793
(1.67 %)		 20,950
(1.44 %)		 n/a 41.56
(99.29 %)		 23,058
(0.71 %)		 5,761
(100.00 %)		 4,782,500
(41.88 %)		 701,157
(1.32 %)		 13,436,624
(33.05 %)		 58,977
(2.20 %)
795 sugar glider (PSGF00001 2023)
GCA_028583685.1		 n/a 19,326
(0.81 %)		 17,560
(0.95 %)		 n/a 38.95
(98.12 %)		 85,933
(1.89 %)		 1,895
(100.00 %)		 6,382,198
(27.07 %)		 1,058,207
(1.74 %)		 22,508,040
(39.84 %)		 16,224
(0.33 %)
796 sugar glider (PSGF00001 2023)
GCF_028583685.1		 55,990
(2.41 %)		 19,328
(0.81 %)		 17,559
(0.95 %)		 n/a 38.95
(98.12 %)		 85,933
(1.89 %)		 1,896
(100.00 %)		 6,382,203
(27.07 %)		 1,058,208
(1.74 %)		 22,508,106
(39.84 %)		 16,224
(0.33 %)
797 Sumatran rhinoceros (Ipuh 2017)
GCA_002844835.1		 n/a 20,368
(1.53 %)		 24,204
(1.23 %)		 n/a 41.05
(95.54 %)		 50,876
(4.40 %)		 1,112,463
(95.60 %)		 4,516,240
(39.90 %)		 561,540
(1.56 %)		 15,821,451
(34.68 %)		 45,201
(1.03 %)
798 Sumatran serow (serow.1 2024)
GCF_032405125.1		 36,400
(1.65 %)		 19,192
(1.42 %)		 22,014
(1.41 %)		 n/a 43.08
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 159
(100.00 %)		 3,242,768
(21.18 %)		 612,565
(8.05 %)		 12,812,990
(44.37 %)		 75,177
(5.86 %)
799 Sunda flying lemur (2014 WashU)
GCF_000696425.1		 34,734
(1.83 %)		 21,356
(1.55 %)		 25,832
(1.21 %)		 n/a 40.21
(87.96 %)		 412,608
(12.07 %)		 511,878
(87.93 %)		 4,961,153
(38.35 %)		 854,441
(3.33 %)		 17,562,576
(28.82 %)		 82,988
(1.05 %)
800 Sunda flying lemur (US047 2019 Broad)
GCA_004027255.1		 n/a 24,882
(1.29 %)		 43,546
(1.12 %)		 n/a 40.46
(99.88 %)		 5,895
(0.02 %)		 1,655,642
(99.98 %)		 5,807,241
(38.62 %)		 953,765
(2.48 %)		 18,836,777
(37.68 %)		 114,955
(1.43 %)
801 tailed tailless bat
GCA_004027475.1		 n/a 19,920
(1.58 %)		 28,017
(1.58 %)		 n/a 41.76
(99.95 %)		 4,640
(0.02 %)		 341,895
(99.98 %)		 3,139,817
(30.43 %)		 381,536
(0.81 %)		 12,069,229
(32.73 %)		 54,528
(2.15 %)
802 tailess tenrec (hap1 2025)
GCA_050624435.1		 n/a 21,323
(0.86 %)		 25,222
(1.02 %)		 n/a 44.80
(100.00 %)		 175
(0.00 %)		 2,180
(100.00 %)		 5,682,996
(38.93 %)		 1,001,072
(14.26 %)		 17,866,411
(50.04 %)		 53,320
(1.01 %)
803 tailess tenrec (hap1 2025)
GCF_050624435.1		 45,770
(1.60 %)		 21,323
(0.86 %)		 25,223
(1.02 %)		 n/a 44.80
(100.00 %)		 175
(0.00 %)		 2,180
(100.00 %)		 5,633,466
(38.91 %)		 1,001,072
(14.26 %)		 17,866,411
(50.04 %)		 53,320
(1.01 %)
804 tailess tenrec (hap2 2025)
GCA_050624465.1		 n/a 20,180
(0.96 %)		 23,467
(1.13 %)		 n/a 44.21
(100.00 %)		 160
(0.00 %)		 1,233
(100.00 %)		 5,074,733
(40.88 %)		 791,473
(8.15 %)		 16,742,233
(44.91 %)		 47,409
(1.01 %)
805 takin (Tak-1 2022)
GCF_023091745.1		 31,927
(1.65 %)		 19,290
(1.42 %)		 21,656
(1.27 %)		 n/a 43.32
(100.00 %)		 152
(0.00 %)		 1,363
(100.00 %)		 3,256,033
(21.01 %)		 714,375
(8.32 %)		 13,010,154
(44.58 %)		 49,134
(7.43 %)
806 Talazac's shrew tenrec
GCA_004026705.1		 n/a 22,605
(0.81 %)		 50,725
(1.09 %)		 n/a 43.03
(99.93 %)		 6,619
(0.02 %)		 795,514
(99.98 %)		 3,493,378
(14.58 %)		 705,274
(1.31 %)		 20,975,335
(36.85 %)		 70,793
(1.26 %)
807 tammar wallaby (alternate hap 2023)
GCA_028389975.1		 n/a 11,133
(0.77 %)		 13,869
(0.98 %)		 n/a 38.63
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 14,285
(100.00 %)		 3,114,522
(26.10 %)		 661,874
(3.02 %)		 11,667,649
(38.41 %)		 12,393
(0.46 %)
808 tammar wallaby (Barry hap1 2025)
GCA_048593335.1		 n/a 17,491
(0.79 %)		 15,701
(0.88 %)		 n/a 38.69
(100.00 %)		 32
(0.00 %)		 40
(100.00 %)		 5,762,317
(26.52 %)		 1,078,692
(1.83 %)		 22,476,051
(38.99 %)		 22,756
(0.48 %)
809 tammar wallaby (Barry hap2 2025)
GCA_048593345.1		 n/a 17,037
(0.79 %)		 15,066
(0.87 %)		 n/a 38.62
(100.00 %)		 16
(0.00 %)		 24
(100.00 %)		 5,608,153
(26.57 %)		 1,050,173
(1.77 %)		 21,856,273
(38.96 %)		 21,811
(0.47 %)
810 tammar wallaby (v2 primary hap 2023 refseq)
GCF_028372415.1		 73,219
(3.07 %)		 17,615
(0.77 %)		 15,415
(0.86 %)		 n/a 38.73
(99.81 %)		 515
(0.19 %)		 272
(100.00 %)		 5,866,314
(26.30 %)		 1,193,604
(2.72 %)		 22,677,480
(39.53 %)		 23,590
(0.47 %)
811 Tasmanian devil (McLovin hap1 2025)
GCA_048593225.1		 n/a 15,725
(0.77 %)		 16,721
(0.92 %)		 n/a 36.17
(99.49 %)		 1,514
(0.51 %)		 1,521
(99.49 %)		 5,222,976
(23.42 %)		 1,357,438
(3.95 %)		 21,705,122
(42.26 %)		 24,443
(0.70 %)
812 Tasmanian devil (McLovin hap2 2025)
GCA_048593325.1		 n/a 15,165
(0.76 %)		 15,663
(0.91 %)		 n/a 36.00
(99.11 %)		 2,578
(0.89 %)		 2,584
(99.11 %)		 5,039,957
(23.64 %)		 1,257,168
(2.97 %)		 20,893,744
(41.44 %)		 22,574
(0.67 %)
813 Tasmanian devil (primary hap 2019)
GCF_902635505.1		 52,070
(2.36 %)		 15,918
(0.85 %)		 16,111
(0.91 %)		 n/a 36.16
(100.00 %)		 354
(0.00 %)		 106
(100.00 %)		 6,789,158
(44.28 %)		 1,246,027
(2.19 %)		 21,434,803
(41.20 %)		 23,609
(0.65 %)
814 Tasmanian wolf (PY-MV-C5757 2022)
GCA_007646695.3		 n/a 15,896
(0.81 %)		 37,523
(1.30 %)		 n/a 36.26
(90.01 %)		 295,304
(10.01 %)		 149,109
(100.00 %)		 9,159,284
(56.14 %)		 1,604,085
(2.22 %)		 21,839,162
(35.42 %)		 46,604
(0.74 %)
815 thirteen-lined ground squirrel (2021 HiC)
GCF_016881025.1		 69,352
(3.50 %)		 18,934
(1.68 %)		 16,775
(1.37 %)		 n/a 39.91
(93.25 %)		 146,412
(6.77 %)		 7,132
(100.00 %)		 4,262,890
(35.64 %)		 640,624
(1.64 %)		 14,118,452
(27.90 %)		 28,317
(0.64 %)
816 thirteen-lined ground squirrel (hap1 2025)
GCA_052094955.1		 n/a 19,425
(1.31 %)		 21,287
(1.27 %)		 n/a 40.31
(99.99 %)		 1,444
(0.01 %)		 5,280
(100.00 %)		 6,062,160
(43.45 %)		 940,716
(10.02 %)		 16,322,133
(37.64 %)		 34,544
(0.73 %)
817 thirteen-lined ground squirrel (hap2 2025)
GCA_052094965.1		 n/a 17,228
(1.41 %)		 17,999
(1.30 %)		 n/a 39.81
(99.99 %)		 1,000
(0.01 %)		 1,438
(100.00 %)		 5,253,166
(38.98 %)		 750,953
(4.01 %)		 14,542,518
(32.77 %)		 27,458
(0.71 %)
818 thirteen-lined ground squirrel (mIctTri1hap1 2025)
GCF_052094955.1		 91,025
(3.74 %)		 19,425
(1.31 %)		 20,977
(1.20 %)		 n/a 40.31
(99.99 %)		 1,444
(0.01 %)		 5,279
(100.00 %)		 6,062,154
(43.45 %)		 940,716
(10.02 %)		 16,322,064
(37.64 %)		 34,544
(0.73 %)
819 Tibetan sand fox (lyu1992 2022)
GCA_024500485.1		 n/a 19,552
(1.59 %)		 19,307
(1.35 %)		 n/a 41.25
(100.00 %)		 145
(0.00 %)		 234
(100.00 %)		 4,500,832
(32.18 %)		 999,068
(2.01 %)		 13,646,015
(32.98 %)		 49,402
(2.19 %)
820 tiger
GCF_018350195.1		 71,226
(2.84 %)		 18,513
(1.68 %)		 19,919
(1.39 %)		 n/a 41.64
(100.00 %)		 65
(0.00 %)		 131
(100.00 %)		 4,878,003
(42.77 %)		 912,595
(1.82 %)		 13,804,650
(33.76 %)		 64,312
(2.55 %)
821 Townsend's big-eared bat (COTO_CA2020_CCGPhap1 2025)
GCA_026230055.2		 n/a 18,747
(1.81 %)		 21,398
(1.62 %)		 n/a 42.82
(100.00 %)		 256
(0.00 %)		 381
(100.00 %)		 5,017,312
(48.85 %)		 779,839
(3.26 %)		 10,740,034
(37.51 %)		 49,071
(2.44 %)
822 Townsend's big-eared bat (COTO_CA2020_CCGPhap2 2025)
GCA_026230045.2		 n/a 17,913
(1.88 %)		 19,986
(1.66 %)		 n/a 42.93
(100.00 %)		 239
(0.00 %)		 165
(100.00 %)		 4,617,916
(47.27 %)		 707,796
(3.14 %)		 9,951,985
(36.27 %)		 46,302
(2.55 %)
823 Townsend's big-eared bat (haplotype 1 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022)
GCA_026230055.1		 n/a 19,370
(1.77 %)		 21,062
(1.61 %)		 n/a 42.81
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 610
(100.00 %)		 2,923,694
(25.49 %)		 772,382
(3.25 %)		 10,654,074
(37.41 %)		 48,226
(2.42 %)
824 Townsend's big-eared bat (haplotype 2 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022)
GCA_026230045.1		 n/a 18,627
(1.82 %)		 20,108
(1.67 %)		 n/a 42.95
(100.00 %)		 217
(0.00 %)		 182
(100.00 %)		 2,733,927
(24.79 %)		 715,258
(3.17 %)		 10,099,456
(36.35 %)		 47,139
(2.58 %)
825 Transcaucasian mole vole
GCA_001685075.1		 n/a 20,173
(1.62 %)		 18,627
(1.30 %)		 n/a 41.51
(96.09 %)		 440,846
(3.96 %)		 499,269
(96.04 %)		 3,827,136
(25.51 %)		 810,597
(2.65 %)		 13,634,524
(27.54 %)		 9,596
(0.16 %)
826 Trefoil horseshoe bat (Malaysia alternate hap 2024)
GCA_043728055.1		 n/a 17,828
(1.84 %)		 20,454
(1.63 %)		 n/a 40.66
(100.00 %)		 n/a 2,403
(100.00 %)		 3,519,024
(41.02 %)		 627,372
(2.04 %)		 11,034,851
(31.87 %)		 33,992
(1.29 %)
827 trefoil horseshoe bat (Malaysia primary hap 2024)
GCA_043728145.1		 n/a 18,871
(1.79 %)		 20,351
(1.55 %)		 n/a 40.66
(99.99 %)		 397
(0.01 %)		 136
(100.00 %)		 3,580,957
(40.75 %)		 683,947
(2.19 %)		 11,464,418
(33.39 %)		 37,175
(1.31 %)
828 True's beaked whale
GCF_964341445.1		 51,240
(1.91 %)		 19,491
(1.24 %)		 24,573
(1.13 %)		 n/a 42.48
(99.99 %)		 1,240
(0.01 %)		 2,756
(100.00 %)		 5,445,244
(60.47 %)		 949,926
(20.01 %)		 10,981,870
(51.51 %)		 91,880
(2.74 %)
829 True's beaked whale (hap1.1 2024)
GCA_964341445.1		 n/a 19,530
(1.21 %)		 24,576
(1.13 %)		 n/a 42.48
(99.99 %)		 1,240
(0.01 %)		 2,757
(100.00 %)		 4,847,855
(34.88 %)		 949,927
(20.01 %)		 10,981,914
(51.51 %)		 91,880
(2.74 %)
830 True's beaked whale (hap2.1 2024)
GCA_964341485.1		 n/a 19,313
(1.40 %)		 22,642
(1.25 %)		 n/a 42.03
(99.99 %)		 1,073
(0.01 %)		 2,457
(99.99 %)		 4,540,507
(37.61 %)		 826,104
(12.82 %)		 11,296,445
(45.25 %)		 80,840
(2.24 %)
831 Upper Galilee mountains blind mole rat (2095 2014 refseq)
GCF_000622305.1		 54,680
(2.07 %)		 19,704
(1.26 %)		 21,262
(1.20 %)		 n/a 41.26
(95.18 %)		 201,121
(4.83 %)		 356,097
(95.17 %)		 6,165,645
(34.95 %)		 1,197,750
(2.77 %)		 16,282,383
(36.21 %)		 22,905
(0.49 %)
832 Vancouver Island marmot (RANI-1049 2019)
GCA_005458795.1		 n/a 19,867
(1.62 %)		 15,893
(1.33 %)		 n/a 39.77
(94.43 %)		 296,819
(5.60 %)		 315,631
(94.40 %)		 4,452,628
(33.94 %)		 751,210
(1.84 %)		 13,917,879
(30.08 %)		 26,541
(0.58 %)
833 vaquita (alternate hap mPhoSin1 2019)
GCA_008692045.1		 n/a 9,367
(1.66 %)		 11,297
(1.30 %)		 n/a 41.50
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 9,470
(100.00 %)		 1,708,360
(43.81 %)		 267,584
(1.67 %)		 5,373,410
(33.52 %)		 29,783
(1.94 %)
834 vaquita (mPhoSin1 2019)
GCF_008692025.1		 60,106
(3.00 %)		 18,611
(1.76 %)		 20,103
(1.39 %)		 35,176
(2.22 %)		 41.36
(99.66 %)		 212
(0.34 %)		 64
(100.00 %)		 4,067,454
(44.25 %)		 602,407
(1.34 %)		 12,468,582
(35.55 %)		 66,806
(1.79 %)
835 water buffalo (Mediterranean 2018)
GCF_003121395.1		 69,771
(3.14 %)		 19,465
(1.58 %)		 21,849
(1.37 %)		 46,051
(1.86 %)		 41.81
(99.99 %)		 410
(0.01 %)		 509
(100.00 %)		 5,407,697
(47.11 %)		 473,976
(1.54 %)		 13,015,899
(41.23 %)		 43,120
(1.15 %)
836 water buffalo (Murrah 2021)
GCF_019923935.1		 80,565
(3.26 %)		 19,402
(1.59 %)		 20,375
(1.31 %)		 n/a 41.75
(100.00 %)		 659
(0.00 %)		 26
(100.00 %)		 5,358,548
(47.11 %)		 447,338
(1.14 %)		 13,034,537
(41.28 %)		 40,189
(1.07 %)
837 water vole (JQ59JK4JDI 2023)
GCA_019206885.2		 n/a 18,401
(2.03 %)		 18,085
(1.65 %)		 n/a 42.19
(89.99 %)		 161,581
(10.04 %)		 2,585
(100.00 %)		 4,771,963
(38.17 %)		 705,400
(1.96 %)		 11,410,837
(25.00 %)		 16,195
(0.52 %)
838 Weddell seal (WS11-02 2013 refseq)
GCF_000349705.1		 48,264
(2.73 %)		 21,063
(1.73 %)		 22,333
(1.43 %)		 n/a 41.39
(70.44 %)		 152,836
(29.58 %)		 169,547
(70.42 %)		 4,420,479
(41.72 %)		 471,256
(0.66 %)		 13,410,237
(22.09 %)		 48,738
(1.01 %)
839 western European hedgehog (2012 refseq)
GCF_000296755.1		 29,923
(1.67 %)		 18,067
(1.33 %)		 19,777
(1.35 %)		 n/a 41.54
(85.94 %)		 219,764
(14.09 %)		 225,567
(85.91 %)		 6,594,783
(45.66 %)		 1,271,533
(2.29 %)		 12,374,161
(42.02 %)		 28,528
(0.71 %)
840 western European hedgehog (alternate hap 2023)
GCA_950295305.1		 n/a 14,370
(1.06 %)		 24,297
(1.27 %)		 n/a 42.08
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 26,601
(100.00 %)		 3,360,923
(19.59 %)		 1,043,098
(3.92 %)		 8,511,380
(53.68 %)		 23,321
(0.97 %)
841 western European hedgehog (primary hap 2023 refseq)
GCF_950295315.1		 61,103
(2.36 %)		 18,125
(1.16 %)		 20,689
(1.21 %)		 n/a 42.00
(99.97 %)		 3,760
(0.03 %)		 1,174
(100.00 %)		 4,891,329
(19.68 %)		 1,507,929
(3.81 %)		 12,571,105
(54.50 %)		 32,667
(0.90 %)
842 western European house mouse (C57BL/6 2026)
GCA_056825265.1		 n/a 22,725
(1.91 %)		 20,127
(1.25 %)		 n/a 41.32
(100.00 %)		 n/a 22
(100.00 %)		 5,054,625
(45.46 %)		 1,712,800
(10.08 %)		 12,627,747
(41.14 %)		 24,439
(0.56 %)
843 western European house mouse (WSB_EiJ v3 2022)
GCA_921998345.2		 n/a 21,722
(2.14 %)		 19,586
(1.39 %)		 108,856
(4.46 %)		 41.81
(98.87 %)		 1,233
(1.13 %)		 233
(100.00 %)		 4,634,551
(40.61 %)		 1,541,826
(3.49 %)		 13,030,566
(35.21 %)		 22,985
(0.56 %)
844 western roe deer (2023)
GCA_951849835.1		 n/a 20,291
(1.29 %)		 23,555
(1.23 %)		 n/a 42.31
(100.00 %)		 n/a 212
(100.00 %)		 4,204,612
(25.49 %)		 848,463
(7.79 %)		 12,687,776
(48.28 %)		 57,315
(1.25 %)
845 western spotted skunk
GCA_004023965.1		 n/a 21,665
(1.46 %)		 34,370
(1.32 %)		 n/a 41.61
(99.92 %)		 11,822
(0.05 %)		 433,831
(99.95 %)		 4,889,781
(40.77 %)		 901,906
(2.30 %)		 13,931,764
(34.80 %)		 54,394
(1.54 %)
846 western wild mouse (SPRET_EiJ v3 2022)
GCA_921997135.2		 n/a 21,699
(2.10 %)		 18,837
(1.32 %)		 n/a 41.69
(99.51 %)		 1,576
(0.49 %)		 143
(100.00 %)		 4,507,329
(41.24 %)		 1,517,241
(3.77 %)		 12,832,499
(36.17 %)		 22,568
(0.53 %)
847 whiskered bat (hap1 2024)
GCA_964094495.2		 n/a 19,504
(1.78 %)		 22,272
(1.73 %)		 n/a 42.99
(99.99 %)		 1,566
(0.02 %)		 533
(100.00 %)		 3,046,246
(25.06 %)		 753,151
(4.86 %)		 10,596,418
(37.62 %)		 66,785
(2.55 %)
848 whiskered bat (hap1.2 2025)
GCA_964094495.3		 n/a 19,023
(1.85 %)		 22,199
(1.73 %)		 n/a 43.02
(100.00 %)		 267
(0.00 %)		 241
(100.00 %)		 5,005,820
(47.73 %)		 756,354
(4.85 %)		 10,602,346
(37.72 %)		 67,615
(2.61 %)
849 whiskered bat (hap2 2024)
GCA_964195625.1		 n/a 18,681
(1.83 %)		 21,523
(1.79 %)		 n/a 43.13
(99.99 %)		 1,414
(0.01 %)		 1,741
(99.99 %)		 2,849,223
(24.50 %)		 688,594
(4.80 %)		 9,968,980
(36.80 %)		 64,365
(2.68 %)
850 white-beaked dolphin (alternate hap 2023)
GCA_949774935.1		 n/a 17,639
(1.50 %)		 25,684
(1.35 %)		 n/a 42.08
(100.00 %)		 n/a 25,619
(100.00 %)		 3,039,324
(36.05 %)		 637,912
(8.02 %)		 9,746,398
(38.98 %)		 56,325
(3.33 %)
851 white-beaked dolphin (primary hap 2023 refseq)
GCF_949774975.1		 59,995
(2.43 %)		 18,737
(1.57 %)		 20,767
(1.34 %)		 n/a 41.91
(99.99 %)		 1,070
(0.01 %)		 410
(100.00 %)		 3,820,566
(36.21 %)		 922,103
(8.43 %)		 12,304,360
(39.74 %)		 68,551
(3.58 %)
852 white-footed mouse (LL stock 2020)
GCF_004664715.2		 54,479
(2.82 %)		 19,971
(1.69 %)		 20,132
(1.42 %)		 n/a 42.23
(99.95 %)		 2,299
(0.05 %)		 1,857
(100.00 %)		 5,060,487
(30.71 %)		 1,258,073
(2.85 %)		 14,007,098
(32.99 %)		 23,456
(0.67 %)
853 white-tailed deer (Illinois 20LAN1187 2024)
GCF_023699985.2		 68,660
(3.60 %)		 19,951
(1.73 %)		 21,804
(1.48 %)		 n/a 41.56
(100.00 %)		 294
(0.00 %)		 718
(100.00 %)		 4,512,173
(43.10 %)		 402,481
(1.14 %)		 12,813,223
(37.56 %)		 45,863
(1.30 %)
854 white-tailed deer (Pink-7 2017 refseq)
GCF_002102435.1		 57,787
(2.93 %)		 20,661
(1.75 %)		 23,085
(1.50 %)		 40,987
(1.94 %)		 41.55
(99.10 %)		 107,058
(0.91 %)		 48,653
(99.10 %)		 4,800,704
(41.29 %)		 413,129
(2.59 %)		 13,296,779
(34.22 %)		 44,165
(1.19 %)
855 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 alternate hap 2022)
GCA_024140225.1		 n/a 12,198
(1.10 %)		 18,494
(1.29 %)		 n/a 39.87
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 14,841
(100.00 %)		 1,725,021
(17.81 %)		 802,415
(4.26 %)		 8,321,474
(45.72 %)		 15,669
(0.79 %)
856 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 primary hap 2022)
GCF_024139225.1		 40,430
(1.81 %)		 17,575
(1.21 %)		 21,880
(1.35 %)		 47,496
(1.55 %)		 39.81
(99.57 %)		 1,010
(0.43 %)		 147
(100.00 %)		 2,846,063
(18.57 %)		 1,252,362
(3.89 %)		 13,776,063
(46.50 %)		 24,589
(0.78 %)
857 white-toothed pygmy shrew (primary hap 2022)
GCA_024139225.1		 n/a 17,350
(1.25 %)		 21,890
(1.35 %)		 n/a 39.81
(99.57 %)		 1,010
(0.43 %)		 148
(100.00 %)		 6,924,771
(50.26 %)		 1,252,365
(3.89 %)		 13,775,765
(46.50 %)		 24,589
(0.78 %)
858 wild Bactrian camel (BCGSAC Cfer 1.0 YT-003-E 2020)
GCF_009834535.1		 70,235
(4.11 %)		 18,202
(1.93 %)		 20,199
(1.66 %)		 42,728
(2.35 %)		 41.66
(99.99 %)		 2,345
(0.01 %)		 2,043
(100.00 %)		 3,091,018
(33.31 %)		 332,720
(5.33 %)		 12,161,286
(28.79 %)		 55,524
(1.75 %)
859 wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 refseq)
GCF_000311805.1		 34,726
(2.40 %)		 18,746
(1.96 %)		 17,104
(1.61 %)		 n/a 41.28
(98.83 %)		 60,971
(1.18 %)		 68,872
(98.82 %)		 2,991,821
(33.93 %)		 353,632
(1.23 %)		 12,349,615
(25.12 %)		 45,437
(1.02 %)
860 wild goat
GCA_000978405.1		 n/a 19,104
(1.48 %)		 16,198
(1.21 %)		 n/a 41.91
(91.72 %)		 279,195
(8.31 %)		 368,693
(91.69 %)		 5,563,294
(45.39 %)		 452,402
(1.99 %)		 13,802,376
(35.47 %)		 41,935
(0.63 %)
861 wild yak (GX-2022 2023)
GCF_027580195.1		 52,505
(2.90 %)		 19,278
(1.60 %)		 20,813
(1.31 %)		 n/a 41.87
(100.00 %)		 196
(0.00 %)		 2,040
(100.00 %)		 5,706,841
(46.71 %)		 464,013
(1.82 %)		 12,973,198
(41.46 %)		 42,508
(1.32 %)
862 wild yak (yakQH1 2013)
GCF_000298355.1		 29,789
(1.92 %)		 19,936
(1.62 %)		 19,914
(1.32 %)		 n/a 41.71
(95.48 %)		 192,006
(4.54 %)		 233,198
(95.46 %)		 5,348,663
(46.08 %)		 449,880
(1.38 %)		 13,572,902
(36.62 %)		 41,147
(0.82 %)
863 winter white dwarf (Siberian hamster Psun_Stras_1 2023)
GCA_030556225.1		 n/a 18,177
(1.88 %)		 18,942
(1.54 %)		 n/a 41.50
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 742
(100.00 %)		 5,398,126
(39.36 %)		 1,168,723
(3.56 %)		 12,272,233
(30.38 %)		 18,332
(0.60 %)
864 woodchuck (v1.1 L192 2022)
GCF_021218885.2		 68,030
(3.47 %)		 19,116
(1.55 %)		 21,017
(1.38 %)		 n/a 39.92
(100.00 %)		 47
(0.00 %)		 3,380
(100.00 %)		 5,285,788
(43.20 %)		 912,552
(2.73 %)		 14,538,866
(35.15 %)		 36,914
(1.02 %)
865 woodland dormouse
GCA_004027655.1		 n/a 23,556
(1.09 %)		 55,517
(1.33 %)		 n/a 41.52
(99.86 %)		 15,691
(0.06 %)		 1,283,630
(99.94 %)		 7,674,195
(34.99 %)		 1,698,258
(3.76 %)		 13,705,886
(42.23 %)		 68,562
(1.41 %)
866 woodland thicket rat
GCF_004785775.1		 43,129
(2.40 %)		 22,710
(2.13 %)		 21,042
(1.49 %)		 n/a 41.17
(98.57 %)		 76,623
(1.44 %)		 23,656
(100.00 %)		 4,732,544
(38.04 %)		 1,424,025
(3.23 %)		 13,549,399
(30.42 %)		 18,232
(0.48 %)
867 woolly hare (The Qinghai-Tibet Plateau SH-2023 2024)
GCA_036325905.1		 n/a 19,363
(1.28 %)		 22,239
(1.28 %)		 n/a 44.08
(100.00 %)		 240
(0.00 %)		 112
(100.00 %)		 4,432,114
(42.23 %)		 966,165
(7.11 %)		 13,263,822
(43.77 %)		 96,755
(2.28 %)
868 Yangtze finless porpoise (v2 wild 2018 refseq)
GCF_003031525.2		 43,310
(2.49 %)		 18,747
(1.81 %)		 19,638
(1.46 %)		 n/a 41.28
(99.29 %)		 52,647
(0.72 %)		 66,343
(99.28 %)		 3,547,466
(35.83 %)		 540,760
(1.65 %)		 12,691,756
(32.88 %)		 59,050
(1.48 %)
869 Yangtze River dolphin (v1.1 BGI 2013 refseq)
GCF_000442215.2		 26,128
(1.61 %)		 18,978
(1.74 %)		 20,661
(1.39 %)		 n/a 41.24
(98.69 %)		 123,788
(1.33 %)		 148,598
(98.67 %)		 3,788,303
(37.04 %)		 690,288
(1.96 %)		 12,841,906
(35.04 %)		 62,458
(1.54 %)
870 yellow-bellied marmot (hap1 2025 refseq)
GCF_047511675.1		 55,299
(2.52 %)		 19,502
(1.44 %)		 20,297
(1.34 %)		 n/a 39.90
(100.00 %)		 330
(0.00 %)		 813
(100.00 %)		 4,038,893
(29.07 %)		 978,915
(3.28 %)		 14,404,633
(34.97 %)		 36,674
(1.05 %)
871 yellow-bellied marmot (hap2 2025)
GCA_047512175.1		 n/a 18,677
(1.51 %)		 19,370
(1.40 %)		 n/a 40.03
(100.00 %)		 307
(0.00 %)		 329
(100.00 %)		 3,694,109
(28.05 %)		 793,102
(2.43 %)		 13,585,913
(33.39 %)		 33,990
(1.02 %)
872 yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.1 2019)
GCF_003676075.3		 42,667
(2.16 %)		 19,547
(1.52 %)		 21,406
(1.40 %)		 n/a 39.89
(97.96 %)		 35,509
(2.04 %)		 66,442
(97.96 %)		 3,814,223
(27.39 %)		 800,865
(1.96 %)		 14,323,977
(32.63 %)		 34,122
(0.91 %)
873 yellow-footed antechinus (v2 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021)
GCF_016432865.1		 47,618
(2.51 %)		 15,703
(0.78 %)		 16,155
(0.90 %)		 n/a 36.21
(99.99 %)		 620
(0.01 %)		 486
(100.00 %)		 5,191,383
(23.81 %)		 1,269,772
(2.59 %)		 21,430,585
(42.69 %)		 28,118
(0.66 %)
874 yellow-spotted hyrax
GCA_004026845.1		 n/a 20,424
(0.86 %)		 43,984
(1.27 %)		 n/a 40.93
(99.94 %)		 3,815
(0.01 %)		 971,748
(99.99 %)		 5,365,974
(31.41 %)		 435,699
(1.22 %)		 21,229,266
(45.17 %)		 38,521
(0.68 %)
875 yellow-spotted hyrax (mHetBru1 2023)
GCA_028571685.1		 n/a 17,610
(1.00 %)		 20,322
(1.04 %)		 n/a 40.80
(100.00 %)		 276
(0.00 %)		 62
(100.00 %)		 3,295,935
(23.58 %)		 389,907
(6.37 %)		 19,525,382
(45.90 %)		 31,831
(0.63 %)
876 yellow-spotted hyrax (mHetBru1 alternate hap 2023)
GCA_028571665.1		 n/a 16,320
(1.03 %)		 20,318
(1.13 %)		 n/a 40.93
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 4,169
(100.00 %)		 2,911,332
(23.50 %)		 347,110
(4.57 %)		 17,256,419
(44.04 %)		 28,674
(0.68 %)
877 Yong Hoi Sen's woolly horseshoe bat (Malaysia 20210929_DDd alternate hap 2024)
GCA_043880365.1		 n/a 18,844
(1.70 %)		 23,805
(1.54 %)		 n/a 41.26
(100.00 %)		 n/a 8,862
(100.00 %)		 3,638,702
(42.22 %)		 847,774
(6.68 %)		 11,654,541
(34.78 %)		 34,055
(3.45 %)
878 Yong Hoi Sen's woolly horseshoe bat (Malaysia 20210929_DDd primary hap 2024)
GCA_043880425.1		 n/a 18,352
(1.71 %)		 20,233
(1.46 %)		 n/a 41.73
(100.00 %)		 196
(0.00 %)		 1,530
(100.00 %)		 3,466,695
(41.95 %)		 934,524
(8.81 %)		 11,690,112
(36.30 %)		 35,257
(5.20 %)
879 Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP alternate hap 2023)
GCA_028536395.1		 n/a 19,188
(1.79 %)		 21,673
(1.72 %)		 n/a 43.03
(100.00 %)		 215
(0.00 %)		 250
(100.00 %)		 3,043,589
(24.76 %)		 773,853
(4.49 %)		 10,648,494
(37.26 %)		 61,910
(2.52 %)
880 Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP primary hap 2023 refseq)
GCF_028538775.1		 48,707
(3.25 %)		 18,807
(1.93 %)		 21,046
(1.76 %)		 n/a 43.22
(100.00 %)		 209
(0.00 %)		 684
(100.00 %)		 3,552,235
(38.46 %)		 719,552
(4.26 %)		 10,089,365
(36.35 %)		 60,974
(2.61 %)
881 zebra duiker (hap1 2025)
GCA_054099735.1		 n/a 19,411
(1.04 %)		 23,174
(0.98 %)		 n/a 46.14
(100.00 %)		 185
(0.00 %)		 598
(100.00 %)		 6,742,800
(39.85 %)		 699,303
(26.55 %)		 12,357,908
(58.45 %)		 605,557
(5.20 %)
882 zebra duiker (hap2 2025)
GCA_054099755.1		 n/a 19,383
(1.06 %)		 23,042
(0.98 %)		 n/a 46.07
(100.00 %)		 162
(0.00 %)		 677
(100.00 %)		 6,681,000
(40.47 %)		 636,475
(26.14 %)		 12,329,686
(57.66 %)		 583,195
(5.17 %)
883 zebu cattle (Hainan HN024 2024)
GCA_039881165.1		 n/a 19,162
(1.53 %)		 20,991
(1.34 %)		 n/a 41.77
(99.99 %)		 350
(0.01 %)		 292
(100.00 %)		 3,296,209
(23.14 %)		 440,574
(1.28 %)		 12,824,144
(40.98 %)		 39,400
(1.07 %)
884 zebu cattle (Nelore 2014 refseq)
GCF_000247795.1		 39,830
(2.52 %)		 18,603
(1.59 %)		 18,779
(1.29 %)		 n/a 41.75
(92.62 %)		 6,941,272
(7.66 %)		 253,770
(92.59 %)		 5,119,428
(46.84 %)		 358,908
(0.88 %)		 13,431,672
(36.60 %)		 35,241
(0.84 %)
885 zebu cattle (Sahiwal x Tharparkar maternal NIAB-ARS_2022 2023)
GCF_029378745.1		 70,745
(4.27 %)		 19,546
(1.58 %)		 21,187
(1.33 %)		 n/a 41.86
(100.00 %)		 283
(0.00 %)		 67
(100.00 %)		 5,530,890
(46.61 %)		 459,827
(1.43 %)		 13,190,355
(41.36 %)		 42,544
(1.21 %)
TOTALS:total assembly count 885

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 619 assemblies assembly stats track stats
Mammals 885 assemblies assembly stats track stats
Birds 569 assemblies assembly stats track stats
Fishes 691 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 443 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1958 assemblies assembly stats track stats
Plants 449 assemblies assembly stats track stats
Fungi 4129 assemblies assembly stats track stats
Viruses 15067 assemblies assembly stats track stats
Archaea 2732 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 22466 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 691 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 464 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 5522 assemblies assembly stats track stats