Mammals Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of mammals only.

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count	common name link to genome browser	ncbiRefSeq	xenoRefGene	augustus genes	Ensembl genes	gc5 base	gaps	assembly sequences	Repeat Masker	TRF simpleRepeat	window Masker	cpg islands
1	aardvark (SDZICR_OR568_19922 2012 Broad) GCF_000298275.1	25,594 (1.08 %)	18,351 (1.06 %)	20,358 (0.98 %)	n/a	40.07 (76.89 %)	411,144 (23.15 %)	433,653 (76.85 %)	n/a	536,700 (0.74 %)	18,176,790 (39.08 %)	26,235 (0.40 %)
2	African grass rat (maternal 2020) GCA_011750645.1	n/a	20,916 (2.01 %)	19,513 (1.43 %)	n/a	41.37 (98.89 %)	1,526 (1.11 %)	1,610 (100.00 %)	4,928,847 (37.45 %)	1,652,295 (5.20 %)	13,507,965 (32.27 %)	17,712 (0.51 %)
3	African grass rat (paternal 2020) GCA_011762545.1	n/a	20,796 (2.00 %)	19,611 (1.43 %)	n/a	41.42 (97.70 %)	1,563 (2.30 %)	1,740 (100.00 %)	4,904,243 (37.25 %)	1,672,608 (5.37 %)	13,465,246 (32.19 %)	17,677 (0.50 %)
4	African grass rat (v1 paternal X 2020 refseq) GCF_011762505.1	45,963 (2.46 %)	20,878 (1.99 %)	19,613 (1.43 %)	37,929 (2.32 %)	41.39 (99.19 %)	1,624 (0.81 %)	1,595 (100.00 %)	4,939,557 (37.33 %)	1,674,970 (5.40 %)	13,613,429 (32.71 %)	17,767 (0.51 %)
5	African grass rat (v2 paternal X 2024 genbank) GCA_011762505.2	n/a	19,637 (1.95 %)	19,610 (1.43 %)	n/a	41.39 (99.19 %)	1,624 (0.81 %)	1,596 (100.00 %)	5,399,465 (42.90 %)	1,674,970 (5.40 %)	13,613,540 (32.71 %)	17,767 (0.51 %)
6	African grass rat (v2 paternal X 2025 refseq) GCF_011762505.2	70,837 (3.51 %)	19,640 (1.95 %)	19,607 (1.43 %)	n/a	41.39 (99.19 %)	1,624 (0.81 %)	1,595 (100.00 %)	5,625,390 (42.96 %)	1,674,970 (5.40 %)	13,612,806 (32.71 %)	17,767 (0.51 %)
7	African grass rat (v3 paternal hap 2024) GCA_011762505.3	n/a	20,986 (2.01 %)	19,611 (1.43 %)	n/a	41.39 (99.19 %)	1,624 (0.81 %)	1,596 (100.00 %)	4,532,782 (33.95 %)	1,674,970 (5.40 %)	13,612,916 (32.71 %)	17,767 (0.51 %)
8	African hunting dog GCA_001887905.1	n/a	18,956 (1.75 %)	17,562 (1.41 %)	n/a	40.98 (92.89 %)	1,415,298 (7.28 %)	803 (100.00 %)	4,458,183 (39.99 %)	658,637 (1.13 %)	13,671,493 (28.24 %)	47,644 (1.64 %)
9	African hunting dog (LycPic1hap1 2024) GCA_040955645.1	n/a	18,688 (1.61 %)	19,670 (1.44 %)	n/a	41.35 (100.00 %)	82 (0.00 %)	86 (100.00 %)	4,281,139 (31.62 %)	959,378 (2.78 %)	12,859,760 (32.95 %)	49,122 (2.32 %)
10	African hunting dog (LycPic1hap2 2024) GCA_040955705.1	n/a	19,463 (1.58 %)	20,378 (1.42 %)	n/a	41.30 (100.00 %)	91 (0.00 %)	77 (100.00 %)	4,513,580 (32.16 %)	1,008,611 (2.91 %)	13,570,452 (33.71 %)	50,954 (2.21 %)
11	African savanna elephant (2009 refseq) GCF_000001905.1	46,043 (2.30 %)	19,169 (1.26 %)	19,664 (1.10 %)	n/a	40.76 (97.57 %)	93,514 (2.45 %)	95,866 (97.55 %)	6,363,315 (57.54 %)	365,797 (0.88 %)	16,073,053 (44.89 %)	33,513 (0.68 %)
12	African savanna elephant (hap1 mLoxAfr1 2023) GCA_030020305.1	n/a	18,845 (1.07 %)	22,426 (1.10 %)	n/a	41.34 (99.85 %)	169 (0.15 %)	1,253 (99.85 %)	4,406,744 (29.55 %)	925,868 (4.71 %)	15,966,881 (50.49 %)	68,531 (1.61 %)
13	African savanna elephant (hap2 2023 genbank) GCA_030014295.1	n/a	18,981 (1.10 %)	22,759 (1.12 %)	n/a	41.25 (99.90 %)	231 (0.10 %)	880 (100.00 %)	4,426,756 (29.95 %)	832,908 (4.08 %)	16,118,910 (49.47 %)	62,315 (1.49 %)
14	African savanna elephant (hap2 2023 refseq) GCF_030014295.1	64,034 (3.35 %)	18,980 (1.10 %)	21,593 (1.06 %)	n/a	41.25 (99.90 %)	231 (0.10 %)	879 (100.00 %)	4,426,749 (29.95 %)	832,904 (4.08 %)	16,118,888 (49.47 %)	62,314 (1.49 %)
15	African soft-furred rat (Lowveld savanna grassland N552 2022) GCA_021653895.1	n/a	20,232 (2.08 %)	18,517 (1.32 %)	n/a	41.15 (100.00 %)	n/a	7,311 (100.00 %)	5,083,017 (39.13 %)	1,337,200 (3.02 %)	13,402,561 (30.35 %)	17,841 (0.51 %)
16	African soft-furred rat (MVZ Mamm 221054 2021) GCA_019843795.1	n/a	26,123 (1.59 %)	49,154 (1.23 %)	n/a	41.38 (99.06 %)	92,030 (0.93 %)	412,491 (99.07 %)	5,251,146 (37.28 %)	1,541,020 (3.13 %)	13,613,713 (32.35 %)	21,054 (0.58 %)
17	agile gracile mouse opossum GCF_016433145.1	30,697 (1.32 %)	17,361 (0.78 %)	17,596 (0.81 %)	n/a	37.86 (91.75 %)	85,142 (8.25 %)	60,714 (100.00 %)	7,917,577 (49.04 %)	1,054,566 (1.57 %)	22,701,659 (37.69 %)	27,301 (0.49 %)
18	Allen's wood mouse (MVZ Mamm 196246 2021) GCA_019843855.1	n/a	22,687 (1.16 %)	46,299 (0.94 %)	n/a	41.37 (99.72 %)	75,967 (0.24 %)	659,537 (99.76 %)	6,139,432 (45.57 %)	1,339,550 (3.13 %)	12,293,115 (32.34 %)	16,575 (0.44 %)
19	alpaca (2025) GCF_048564905.1	80,233 (3.11 %)	18,667 (1.53 %)	23,043 (1.52 %)	n/a	41.92 (99.91 %)	681 (0.09 %)	519 (100.00 %)	3,387,094 (33.34 %)	395,581 (10.22 %)	11,510,740 (36.96 %)	72,497 (1.98 %)
20	alpaca (v3.2 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U) GCF_000164845.4	54,987 (3.56 %)	18,439 (1.93 %)	18,426 (1.63 %)	n/a	41.40 (95.85 %)	166,272 (4.17 %)	77,389 (100.00 %)	3,004,413 (33.17 %)	315,092 (1.36 %)	12,458,272 (24.89 %)	54,502 (1.38 %)
21	Alpine marmot (2019) GCF_001458135.2	69,587 (3.43 %)	19,047 (1.54 %)	17,768 (1.39 %)	n/a	39.80 (96.13 %)	88,858 (3.88 %)	14,031 (100.00 %)	3,726,252 (26.48 %)	746,953 (1.83 %)	14,066,368 (30.30 %)	30,191 (0.63 %)
22	Alvarez's mastiff bat (A012 2023) GCA_031001765.1	n/a	19,086 (1.55 %)	22,040 (1.52 %)	n/a	42.18 (99.99 %)	1,182 (0.01 %)	1,369 (99.99 %)	3,846,728 (31.78 %)	639,852 (2.90 %)	11,937,936 (38.98 %)	75,377 (2.21 %)
23	Alvarez's mastiff bat (hap1 2024) GCA_037157525.1	n/a	18,980 (1.50 %)	22,394 (1.50 %)	n/a	42.30 (100.00 %)	80 (0.00 %)	326 (100.00 %)	3,896,863 (31.56 %)	659,711 (4.74 %)	11,945,162 (40.81 %)	76,769 (2.57 %)
24	Alvarez's mastiff bat (hap2 2024) GCA_037176705.1	n/a	19,066 (1.48 %)	22,356 (1.48 %)	n/a	42.25 (100.00 %)	75 (0.00 %)	287 (100.00 %)	3,908,607 (31.48 %)	664,931 (5.23 %)	11,892,191 (41.08 %)	76,453 (2.43 %)
25	Amazon manatee (hap1 2025) GCA_046562985.1	n/a	17,917 (1.26 %)	20,499 (1.11 %)	n/a	40.77 (100.00 %)	377 (0.00 %)	550 (100.00 %)	5,812,915 (56.93 %)	431,488 (2.57 %)	14,336,638 (47.98 %)	33,775 (0.84 %)
26	Amazon manatee (hap2 2025) GCA_046562895.1	n/a	18,949 (1.23 %)	21,655 (1.08 %)	n/a	40.80 (100.00 %)	294 (0.00 %)	401 (100.00 %)	6,218,266 (57.31 %)	470,437 (3.04 %)	15,241,157 (48.91 %)	37,124 (0.86 %)
27	American beaver (hap1 2025) GCA_047511655.1	n/a	19,828 (1.45 %)	20,376 (1.31 %)	n/a	39.72 (100.00 %)	181 (0.00 %)	503 (100.00 %)	4,030,880 (35.35 %)	566,770 (2.63 %)	14,198,970 (35.24 %)	24,454 (0.96 %)
28	American beaver (hap2 2025) GCA_047511605.1	n/a	19,144 (1.44 %)	18,959 (1.23 %)	n/a	39.54 (100.00 %)	194 (0.00 %)	229 (100.00 %)	3,981,637 (35.85 %)	561,691 (2.26 %)	14,374,940 (35.03 %)	23,386 (0.80 %)
29	American beaver (mCasCan1.hap1v2 2025) GCF_047511655.1	79,343 (3.55 %)	19,759 (1.46 %)	19,920 (1.23 %)	n/a	39.67 (100.00 %)	181 (0.00 %)	181 (100.00 %)	4,023,733 (35.50 %)	563,158 (2.55 %)	14,502,226 (35.45 %)	23,983 (0.89 %)
30	American beaver (Ward 2017 refseq) GCF_001984765.1	40,013 (2.15 %)	20,867 (1.53 %)	24,201 (1.33 %)	n/a	39.72 (99.99 %)	3,321 (0.01 %)	21,157 (100.00 %)	4,526,430 (33.75 %)	486,353 (1.30 %)	14,347,145 (31.96 %)	23,046 (0.72 %)
31	American bison (2014 refseq) GCF_000754665.1	38,699 (2.34 %)	19,782 (1.47 %)	20,444 (1.25 %)	n/a	41.82 (93.12 %)	341,984 (6.92 %)	470,415 (93.08 %)	n/a	419,596 (0.95 %)	13,519,877 (37.66 %)	60,388 (1.03 %)
32	American black bear (L20-20 alternate hap 2022) GCA_024610745.1	n/a	22,502 (1.17 %)	43,431 (1.28 %)	n/a	43.14 (99.99 %)	n/a	77,311 (100.00 %)	4,587,986 (32.30 %)	773,829 (6.39 %)	14,594,034 (35.67 %)	78,849 (3.32 %)
33	American black bear (L20-20 primary hap 2022) GCA_024610735.1	n/a	18,458 (1.52 %)	21,049 (1.43 %)	n/a	42.93 (100.00 %)	22 (0.00 %)	317 (100.00 %)	4,000,508 (32.69 %)	641,903 (5.91 %)	13,210,530 (35.54 %)	68,981 (3.00 %)
34	American black bear (UA15103 2021) GCF_020975775.1	53,916 (3.11 %)	18,840 (1.73 %)	20,969 (1.50 %)	n/a	42.09 (100.00 %)	n/a	2,213 (100.00 %)	3,936,528 (34.53 %)	594,864 (2.90 %)	13,725,005 (32.35 %)	62,580 (1.91 %)
35	American mink (2018) GCA_900108605.1	n/a	18,686 (1.70 %)	20,016 (1.50 %)	36,997 (1.74 %)	41.60 (92.95 %)	154,172 (7.07 %)	161,347 (92.93 %)	4,350,343 (38.70 %)	606,128 (1.17 %)	13,605,797 (28.74 %)	54,199 (1.98 %)
36	American mink (hap1 2024) GCA_964106545.1	n/a	19,203 (1.43 %)	22,174 (1.33 %)	n/a	42.39 (99.98 %)	2,957 (0.02 %)	435 (100.00 %)	4,188,829 (30.04 %)	802,295 (5.81 %)	14,041,290 (37.98 %)	65,430 (2.64 %)
37	American mink (hap2 2024) GCA_964106205.1	n/a	18,890 (1.43 %)	21,684 (1.33 %)	n/a	42.35 (99.98 %)	2,849 (0.02 %)	3,200 (99.98 %)	4,158,563 (30.22 %)	786,430 (5.25 %)	13,845,377 (37.58 %)	64,307 (2.75 %)
38	American mink (M4711 2021 Dalhousie U) GCF_020171115.1	50,253 (2.26 %)	18,949 (1.49 %)	20,914 (1.29 %)	n/a	42.26 (100.00 %)	n/a	183 (100.00 %)	4,705,680 (39.15 %)	795,684 (5.50 %)	14,085,357 (37.99 %)	63,307 (2.38 %)
39	American pika (hap1 2023) GCF_030435755.1	45,008 (1.93 %)	17,997 (1.35 %)	23,185 (1.49 %)	n/a	44.16 (100.00 %)	432 (0.00 %)	5,864 (100.00 %)	4,126,248 (43.60 %)	628,344 (15.71 %)	11,100,962 (42.69 %)	60,350 (1.67 %)
40	American pika (hap2 2023) GCA_030435715.1	n/a	16,911 (1.23 %)	21,107 (1.43 %)	n/a	44.43 (100.00 %)	375 (0.00 %)	6,123 (100.00 %)	1,808,768 (10.42 %)	561,106 (21.05 %)	10,283,513 (45.97 %)	54,919 (1.33 %)
41	American pika 3.0 (2012 Broad refseq) GCF_000292845.1	26,240 (1.93 %)	17,576 (1.61 %)	20,076 (1.70 %)	n/a	43.35 (87.20 %)	122,542 (12.82 %)	132,962 (87.18 %)	2,761,257 (29.47 %)	414,896 (1.07 %)	10,968,698 (26.71 %)	44,652 (1.14 %)
42	American pika 4.0 (UAM:Mamm:113957 2020) GCF_014633375.1	31,887 (1.92 %)	17,532 (1.60 %)	19,609 (1.65 %)	n/a	43.35 (87.14 %)	124,941 (12.88 %)	9,351 (100.00 %)	2,827,662 (29.77 %)	414,980 (1.07 %)	10,969,165 (26.69 %)	44,743 (1.13 %)
43	American wolverine (FN33715 2022) GCA_024509225.1	n/a	18,360 (1.57 %)	20,615 (1.47 %)	n/a	41.70 (100.00 %)	53 (0.00 %)	758 (100.00 %)	4,038,995 (32.25 %)	664,825 (1.25 %)	13,625,080 (33.05 %)	56,595 (2.13 %)
44	Amur tiger (TaeGuk 2013 refseq) GCF_000464555.1	33,681 (2.23 %)	17,929 (1.49 %)	15,090 (1.29 %)	n/a	41.40 (97.59 %)	155,553 (2.44 %)	157,032 (97.56 %)	n/a	831,136 (1.67 %)	13,654,437 (31.78 %)	65,229 (1.60 %)
45	Angolan free-tailed bat (Cote d'Ivoire 20210831_DDa 2024) GCA_043748645.1	n/a	18,528 (1.65 %)	22,359 (1.64 %)	n/a	42.89 (100.00 %)	88 (0.00 %)	44 (100.00 %)	3,531,044 (35.70 %)	555,304 (2.07 %)	11,439,853 (36.03 %)	102,112 (3.75 %)
46	Angus cow (Angus x Brahman F1 Angus haplotype 2018) GCA_003369685.2	n/a	19,096 (1.59 %)	20,674 (1.34 %)	n/a	41.99 (99.75 %)	277 (0.25 %)	1,435 (100.00 %)	5,290,422 (47.51 %)	478,946 (1.94 %)	12,568,313 (41.15 %)	45,850 (1.37 %)
47	Antarctic minke whale GCA_000978805.1	n/a	23,312 (1.49 %)	45,535 (1.26 %)	n/a	40.73 (99.37 %)	299,456 (0.64 %)	720,900 (99.36 %)	4,011,313 (41.13 %)	504,837 (1.04 %)	13,553,641 (30.96 %)	56,223 (1.31 %)
48	Antillean ghost-faced bat GCA_004026545.1	n/a	20,088 (1.74 %)	31,558 (1.63 %)	n/a	41.74 (99.97 %)	1,835 (0.01 %)	207,094 (99.99 %)	3,025,044 (30.67 %)	332,606 (0.70 %)	12,504,556 (28.79 %)	65,503 (2.30 %)
49	aoudad GCA_002201775.1	n/a	19,905 (1.62 %)	27,488 (1.60 %)	n/a	42.01 (95.96 %)	186,672 (4.05 %)	263,992 (95.95 %)	5,418,013 (45.05 %)	471,426 (1.19 %)	13,396,252 (36.94 %)	48,844 (1.32 %)
50	Arabian camel (Drom800 2019 refseq) GCF_000803125.2	64,532 (3.85 %)	18,483 (1.89 %)	20,554 (1.62 %)	n/a	41.51 (99.22 %)	47,342 (0.79 %)	21,070 (100.00 %)	3,233,022 (34.07 %)	345,049 (1.55 %)	13,383,050 (26.19 %)	58,872 (1.79 %)
51	Arabian camel (hap2 2024) GCA_036321565.1	n/a	17,085 (1.73 %)	19,317 (1.59 %)	n/a	41.75 (100.00 %)	210 (0.00 %)	173 (100.00 %)	2,818,446 (29.44 %)	316,646 (8.90 %)	11,192,133 (31.47 %)	52,135 (1.67 %)
52	Arabian camel (paternal hap 2024 genbank) GCA_036321535.1	n/a	18,080 (1.66 %)	20,345 (1.52 %)	n/a	41.64 (100.00 %)	195 (0.00 %)	172 (100.00 %)	3,040,473 (29.22 %)	343,482 (10.93 %)	11,797,012 (33.50 %)	55,428 (1.61 %)
53	Arabian camel (paternal hap 2024 refseq) GCF_036321535.1	62,940 (3.46 %)	18,078 (1.66 %)	21,071 (1.56 %)	n/a	41.64 (100.00 %)	195 (0.00 %)	171 (100.00 %)	3,040,467 (29.22 %)	343,480 (10.93 %)	11,796,955 (33.50 %)	55,427 (1.61 %)
54	Arctic fox (Blue_001 2021 refseq) GCF_018345385.1	60,759 (3.11 %)	19,942 (1.72 %)	19,529 (1.38 %)	n/a	41.27 (100.00 %)	529 (0.00 %)	929 (100.00 %)	4,821,229 (41.22 %)	1,006,124 (2.31 %)	13,556,149 (32.92 %)	49,997 (2.23 %)
55	Arctic ground squirrel (AGS 11-09-20 2018) GCF_003426925.1	39,569 (2.25 %)	18,954 (1.74 %)	19,372 (1.45 %)	n/a	39.95 (89.51 %)	2,429,461 (10.59 %)	15,883 (100.00 %)	4,400,304 (32.67 %)	672,831 (1.50 %)	13,913,477 (26.41 %)	27,575 (0.72 %)
56	Arctic ground squirrel (hap1 2024) GCA_045843805.1	n/a	20,255 (1.35 %)	21,401 (1.44 %)	n/a	40.08 (100.00 %)	694 (0.00 %)	2,530 (100.00 %)	4,287,108 (25.85 %)	895,123 (5.96 %)	15,722,314 (36.45 %)	34,781 (0.82 %)
57	Arctic ground squirrel (hap2 2024) GCA_045843765.1	n/a	18,385 (1.31 %)	19,099 (1.34 %)	n/a	39.97 (100.00 %)	590 (0.00 %)	2,307 (100.00 %)	4,314,945 (35.63 %)	820,736 (6.65 %)	14,490,422 (35.95 %)	31,201 (0.78 %)
58	Arctic ground squirrel (mUroPar1hap1 2024) GCF_045843805.1	45,939 (2.00 %)	19,773 (1.41 %)	20,880 (1.28 %)	n/a	40.08 (100.00 %)	694 (0.00 %)	2,529 (100.00 %)	5,291,989 (39.61 %)	895,123 (5.96 %)	15,722,212 (36.45 %)	34,781 (0.82 %)
59	Asian palm civet GCA_004024585.1	n/a	22,124 (1.43 %)	43,710 (1.39 %)	n/a	42.52 (99.95 %)	4,533 (0.02 %)	442,658 (99.98 %)	4,877,367 (40.32 %)	754,440 (1.35 %)	14,557,779 (32.29 %)	148,246 (5.67 %)
60	Asiatic brush-tailed porcupine (POm2014 2021) GCA_016801275.1	n/a	18,688 (1.73 %)	22,642 (1.64 %)	n/a	41.26 (97.24 %)	152,126 (2.77 %)	303,244 (97.23 %)	3,431,580 (28.56 %)	667,375 (2.21 %)	13,572,972 (26.90 %)	42,853 (1.30 %)
61	Asiatic elephant (mEleMax1 alternate hap 2022) GCA_024166345.1	n/a	17,906 (1.18 %)	21,966 (1.14 %)	n/a	41.14 (100.00 %)	n/a	6,361 (100.00 %)	3,818,524 (29.72 %)	533,426 (3.22 %)	14,381,781 (47.30 %)	50,264 (1.15 %)
62	Asiatic elephant (mEleMax1 primary hap 2022) GCF_024166365.1	61,202 (2.60 %)	18,887 (1.13 %)	21,194 (1.06 %)	n/a	41.14 (99.90 %)	126 (0.10 %)	64 (100.00 %)	4,358,470 (31.27 %)	663,094 (4.56 %)	16,261,778 (48.66 %)	69,120 (1.32 %)
63	Asiatic mouflon (Amuf_v1 2020) GCA_014523465.1	n/a	19,569 (1.59 %)	21,293 (1.35 %)	n/a	41.97 (99.68 %)	257 (0.32 %)	128 (100.00 %)	5,390,761 (47.15 %)	451,837 (1.15 %)	13,157,608 (40.67 %)	44,158 (1.19 %)
64	Asiatic tapir (hap1 2023) GCA_031878655.1	n/a	18,969 (1.75 %)	20,207 (1.36 %)	n/a	41.25 (100.00 %)	79 (0.00 %)	262 (100.00 %)	3,650,963 (38.06 %)	355,322 (2.63 %)	14,837,952 (31.37 %)	37,174 (1.87 %)
65	Asiatic tapir (hap2 2023) GCA_031878705.1	n/a	18,931 (1.76 %)	19,988 (1.37 %)	n/a	41.16 (100.00 %)	92 (0.00 %)	193 (100.00 %)	3,632,286 (38.21 %)	350,074 (2.22 %)	14,785,531 (30.90 %)	36,699 (1.70 %)
66	ass (Dezhou 2021) GCF_016077325.2	84,046 (4.01 %)	18,838 (1.75 %)	20,239 (1.42 %)	69,689 (3.29 %)	41.42 (99.86 %)	1,922 (0.15 %)	50 (100.00 %)	3,840,509 (41.57 %)	319,943 (0.81 %)	14,889,114 (29.46 %)	41,082 (1.37 %)
67	ass (Donkey D_3611 2024) GCF_041296235.1	92,510 (3.84 %)	18,566 (1.54 %)	21,504 (1.32 %)	n/a	42.37 (99.94 %)	7 (0.06 %)	849 (100.00 %)	3,555,052 (38.38 %)	658,645 (5.79 %)	14,242,715 (36.79 %)	43,875 (3.45 %)
68	ass (Maral har 2015 refseq) GCF_001305755.1	48,976 (3.12 %)	18,838 (1.78 %)	19,295 (1.44 %)	n/a	41.28 (98.63 %)	69,593 (1.38 %)	2,167 (100.00 %)	3,731,432 (40.84 %)	289,737 (0.96 %)	14,695,308 (28.58 %)	40,025 (1.06 %)
69	Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap1.1 2024) GCA_964270905.1	n/a	18,773 (1.50 %)	21,069 (1.29 %)	n/a	42.18 (99.99 %)	1,034 (0.01 %)	900 (100.00 %)	3,975,427 (35.64 %)	1,054,000 (10.27 %)	12,281,095 (41.92 %)	79,762 (4.08 %)
70	Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap2.1 2024) GCA_964270935.1	n/a	17,961 (1.59 %)	20,087 (1.36 %)	n/a	42.05 (99.99 %)	917 (0.01 %)	1,796 (99.99 %)	3,626,392 (35.51 %)	824,778 (7.32 %)	11,499,904 (39.18 %)	74,348 (3.46 %)
71	Australian echidna (mTacAcu1 alternate hap 2020) GCA_015852515.1	n/a	13,505 (1.03 %)	18,978 (1.47 %)	n/a	45.32 (99.98 %)	26 (0.02 %)	3,482 (100.00 %)	6,880,857 (41.88 %)	1,099,932 (7.47 %)	8,156,735 (56.68 %)	70,515 (2.88 %)
72	Australian echidna (mTacAcu1 primary hap 2020) GCF_015852505.1	42,938 (2.28 %)	14,891 (1.01 %)	19,714 (1.45 %)	n/a	45.30 (98.61 %)	524 (1.39 %)	310 (100.00 %)	7,814,876 (42.89 %)	1,219,764 (6.93 %)	9,488,325 (55.68 %)	78,364 (2.73 %)
73	Bactrian camel (Alxa 2014 refseq) GCF_000767855.1	52,191 (3.64 %)	18,303 (1.98 %)	17,097 (1.64 %)	n/a	41.32 (99.32 %)	31,980 (0.69 %)	67,435 (99.31 %)	2,966,704 (34.06 %)	306,997 (0.95 %)	12,209,949 (25.43 %)	49,790 (1.25 %)
74	Bactrian camel YW-2024 2025 GCF_048773025.1	76,927 (4.47 %)	18,239 (1.57 %)	22,111 (1.51 %)	n/a	41.95 (100.00 %)	127 (0.00 %)	158 (100.00 %)	3,258,307 (30.21 %)	377,352 (13.70 %)	11,533,205 (36.22 %)	65,887 (1.95 %)
75	banded mongoose GCA_004023785.1	n/a	21,568 (1.57 %)	30,427 (1.43 %)	n/a	42.00 (99.96 %)	4,510 (0.02 %)	316,874 (99.98 %)	4,768,524 (40.51 %)	684,187 (1.30 %)	13,713,756 (33.42 %)	78,648 (2.80 %)
76	bank vole GCF_902806735.1	56,423 (2.99 %)	18,977 (1.71 %)	18,408 (1.50 %)	n/a	41.86 (98.62 %)	53,506 (1.39 %)	54,142 (98.61 %)	3,222,366 (21.59 %)	933,697 (2.20 %)	12,831,232 (31.50 %)	18,784 (0.42 %)
77	banner-tailed kangaroo rat GCF_019054845.1	43,753 (1.82 %)	18,397 (1.18 %)	24,180 (1.39 %)	n/a	40.83 (100.00 %)	n/a	2,026 (100.00 %)	5,587,719 (30.97 %)	1,363,513 (3.95 %)	12,128,920 (48.74 %)	36,371 (1.27 %)
78	banteng 2023 GCF_032452875.1	71,974 (3.56 %)	19,305 (1.36 %)	21,174 (1.20 %)	n/a	42.79 (100.00 %)	84 (0.00 %)	1,518 (100.00 %)	3,344,481 (20.63 %)	1,039,571 (11.74 %)	13,031,356 (47.36 %)	73,031 (1.72 %)
79	bat A.intermedius (hap2 2024) GCA_038363225.1	n/a	17,124 (1.63 %)	18,342 (1.54 %)	n/a	42.25 (100.00 %)	56 (0.00 %)	187 (100.00 %)	2,597,378 (26.81 %)	332,733 (4.43 %)	10,957,327 (33.52 %)	63,688 (2.22 %)
80	bat H.larvatus (China 20210929_DDb primary hap 2024) GCA_043727955.1	n/a	19,354 (1.74 %)	21,367 (1.51 %)	n/a	41.48 (100.00 %)	190 (0.00 %)	265 (100.00 %)	3,860,506 (38.95 %)	722,335 (7.13 %)	11,994,816 (35.77 %)	44,562 (1.21 %)
81	beluga whale (Cook Inlet, Alaska, USA DL-CIB17-05 2020) GCA_009917745.1	n/a	19,239 (1.79 %)	22,513 (1.43 %)	35,878 (1.82 %)	41.25 (97.57 %)	27,070 (2.43 %)	52,780 (97.57 %)	4,021,599 (43.53 %)	544,323 (1.08 %)	12,738,162 (33.47 %)	59,710 (1.51 %)
82	beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v3 2019) GCF_002288925.2	59,413 (3.09 %)	18,667 (1.79 %)	20,314 (1.43 %)	n/a	41.24 (98.49 %)	24,414 (1.52 %)	29,444 (98.48 %)	4,001,248 (43.73 %)	543,276 (1.11 %)	12,802,735 (34.18 %)	59,307 (1.53 %)
83	big brown bat (BU_THK_EF1 2012) GCF_000308155.1	59,162 (3.17 %)	18,334 (1.94 %)	20,121 (1.78 %)	n/a	42.93 (89.41 %)	160,269 (10.62 %)	167,057 (89.38 %)	2,842,065 (25.82 %)	614,712 (1.89 %)	10,407,733 (28.90 %)	66,720 (2.99 %)
84	big brown bat (TK198812 2023) GCF_027574615.1	46,266 (2.61 %)	18,620 (1.80 %)	21,271 (1.72 %)	n/a	43.51 (100.00 %)	75 (0.00 %)	48 (100.00 %)	3,041,145 (25.08 %)	904,075 (3.80 %)	10,530,666 (37.05 %)	77,605 (3.68 %)
85	bighorn sheep (BS48 2019) GCA_004026945.1	n/a	23,059 (1.34 %)	36,486 (1.19 %)	n/a	43.20 (99.90 %)	9,412 (0.03 %)	1,057,548 (99.97 %)	6,321,577 (50.75 %)	716,846 (1.66 %)	13,904,326 (44.98 %)	95,564 (1.72 %)
86	bighorn sheep (v2 Bighorn MfBH-ARS-UI-01 2024) GCF_042477335.2	78,636 (2.63 %)	19,459 (1.36 %)	21,150 (1.33 %)	n/a	43.91 (100.00 %)	3 (0.00 %)	42 (100.00 %)	3,963,383 (22.89 %)	826,353 (11.67 %)	12,918,743 (46.86 %)	52,254 (10.67 %)
87	bilby (mMagLag1 2024) GCA_037893015.1	n/a	18,686 (0.72 %)	17,238 (0.81 %)	n/a	37.35 (99.66 %)	4,431 (0.34 %)	609 (100.00 %)	6,263,094 (27.34 %)	2,223,995 (5.89 %)	23,994,844 (43.69 %)	51,039 (3.47 %)
88	bilby (mMagLag1 2024) GCF_037893015.1	60,460 (3.10 %)	18,687 (0.72 %)	17,229 (0.81 %)	n/a	37.35 (99.66 %)	4,431 (0.34 %)	608 (100.00 %)	6,299,949 (27.49 %)	2,223,987 (5.89 %)	23,992,536 (43.69 %)	51,039 (3.47 %)
89	black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap1 2024) GCA_043290085.1	n/a	20,713 (0.64 %)	21,469 (0.64 %)	n/a	41.74 (100.00 %)	770 (0.00 %)	470 (100.00 %)	3,860,121 (14.52 %)	1,230,113 (2.81 %)	21,600,460 (65.53 %)	49,878 (0.73 %)
90	black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap2 2024) GCA_043290065.1	n/a	19,814 (0.63 %)	20,140 (0.63 %)	n/a	41.82 (100.00 %)	723 (0.00 %)	315 (100.00 %)	3,657,357 (14.24 %)	1,158,716 (2.84 %)	22,924,986 (64.53 %)	46,774 (0.90 %)
91	black flying fox GCF_000325575.1	46,991 (3.15 %)	18,089 (2.00 %)	20,668 (1.75 %)	n/a	39.74 (97.93 %)	104,566 (2.08 %)	170,164 (97.92 %)	2,975,186 (34.05 %)	481,859 (1.45 %)	12,582,349 (26.52 %)	62,483 (3.88 %)
92	black rat GCF_011064425.1	39,601 (2.37 %)	20,793 (1.98 %)	17,944 (1.37 %)	n/a	42.14 (99.98 %)	6,158 (0.02 %)	2,173 (100.00 %)	4,715,157 (41.57 %)	1,432,294 (3.45 %)	13,275,550 (32.36 %)	18,055 (0.48 %)
93	black rhinoceros (alternate hap 2021) GCA_020826835.1	n/a	19,000 (1.37 %)	22,547 (1.26 %)	n/a	41.56 (99.97 %)	178 (0.03 %)	1,199 (100.00 %)	4,340,245 (37.22 %)	564,468 (8.07 %)	14,384,523 (40.40 %)	44,971 (1.16 %)
94	black rhinoceros (BS38 2019 Broad) GCA_004027315.1	n/a	21,713 (1.32 %)	32,731 (1.18 %)	n/a	41.22 (99.85 %)	7,256 (0.02 %)	2,029,914 (99.98 %)	4,618,655 (36.76 %)	618,834 (2.21 %)	16,248,532 (40.32 %)	44,113 (0.97 %)
95	black rhinoceros (primary hap 2021 refseq) GCF_020826845.1	56,268 (2.28 %)	18,774 (1.38 %)	22,348 (1.26 %)	n/a	41.59 (99.95 %)	215 (0.05 %)	1,076 (100.00 %)	4,200,390 (36.22 %)	548,030 (8.34 %)	14,347,693 (40.14 %)	43,525 (1.14 %)
96	black-footed cat GCA_004023925.1	n/a	22,895 (1.14 %)	51,789 (1.13 %)	n/a	41.92 (99.90 %)	13,476 (0.06 %)	603,600 (99.94 %)	5,261,265 (44.11 %)	943,514 (1.77 %)	13,681,435 (34.77 %)	86,892 (2.23 %)
97	black-footed ferret (SB6536 2022) GCF_022355385.1	56,415 (2.78 %)	18,681 (1.55 %)	20,685 (1.40 %)	n/a	41.55 (96.71 %)	33,042 (3.30 %)	20,575 (100.00 %)	4,087,717 (30.94 %)	695,805 (1.18 %)	13,880,116 (32.08 %)	54,060 (2.11 %)
98	black-lipped pika GCF_017591425.1	46,297 (2.64 %)	18,529 (1.63 %)	23,458 (1.83 %)	n/a	43.71 (100.00 %)	54 (0.00 %)	2,214 (100.00 %)	1,843,705 (12.62 %)	471,798 (2.76 %)	11,394,992 (31.27 %)	63,124 (1.85 %)
99	Blainville's beaked whale (alternate hap 2022) GCA_025094165.1	n/a	17,838 (1.54 %)	21,389 (1.35 %)	n/a	41.71 (100.00 %)	1 (0.00 %)	5,198 (100.00 %)	3,542,727 (35.35 %)	650,369 (8.86 %)	10,971,320 (41.15 %)	62,389 (1.68 %)
100	Blainville's beaked whale (primary hap 2022 refseq) GCF_025265405.1	47,553 (2.07 %)	19,041 (1.52 %)	20,766 (1.27 %)	n/a	41.70 (99.97 %)	97 (0.03 %)	74 (100.00 %)	3,964,038 (35.29 %)	765,957 (8.74 %)	12,128,229 (41.78 %)	70,851 (1.80 %)
101	blue whale (alternate hap JJ_BM4_2016_0621 2019) GCA_008658375.1	n/a	17,285 (1.80 %)	21,295 (1.43 %)	n/a	41.22 (100.00 %)	n/a	12,574 (100.00 %)	3,196,354 (43.47 %)	467,194 (1.26 %)	10,176,588 (33.66 %)	56,916 (1.85 %)
102	Blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 alternate hap 2020) GCA_008658375.2	n/a	16,997 (1.82 %)	20,609 (1.44 %)	n/a	41.20 (100.00 %)	3 (0.00 %)	10,999 (100.00 %)	3,126,800 (43.49 %)	454,452 (1.23 %)	9,916,868 (33.63 %)	55,436 (1.85 %)
103	blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v3 primary hap 2020) GCF_009873245.2	58,737 (2.71 %)	19,162 (1.80 %)	20,576 (1.41 %)	36,291 (1.99 %)	40.88 (98.91 %)	886 (1.09 %)	106 (100.00 %)	3,986,870 (44.21 %)	579,629 (1.22 %)	12,858,384 (34.60 %)	67,032 (1.73 %)
104	bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 alternate hap 2022) GCA_022079275.1	n/a	24,877 (1.23 %)	48,382 (1.39 %)	n/a	42.05 (99.98 %)	4,716 (0.01 %)	72,827 (99.99 %)	6,403,412 (33.31 %)	1,269,531 (1.94 %)	17,771,689 (33.82 %)	100,915 (3.00 %)
105	bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 primary hap 2022) GCF_022079265.1	45,417 (2.39 %)	18,576 (1.65 %)	20,510 (1.41 %)	n/a	41.80 (100.00 %)	24 (0.00 %)	75 (100.00 %)	4,970,082 (43.28 %)	894,002 (1.80 %)	13,648,384 (34.21 %)	69,211 (2.68 %)
106	boreal woodland reindeer (boreal CA-31 2023) GCA_019903745.2	n/a	20,135 (1.60 %)	22,598 (1.47 %)	n/a	41.46 (96.98 %)	34,682 (3.03 %)	12,266 (100.00 %)	3,134,107 (24.41 %)	394,920 (0.92 %)	13,154,929 (36.43 %)	48,826 (1.07 %)
107	Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 alternate hap 2022) GCA_024803775.1	n/a	18,647 (0.96 %)	23,998 (1.13 %)	n/a	41.67 (100.00 %)	124 (0.00 %)	3,340 (100.00 %)	3,775,862 (22.40 %)	1,257,803 (21.71 %)	9,347,543 (61.85 %)	33,757 (1.35 %)
108	Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 primary hap 2022) GCA_024803745.1	n/a	17,791 (1.12 %)	22,667 (1.29 %)	n/a	41.66 (100.00 %)	106 (0.00 %)	2,898 (100.00 %)	6,293,452 (41.30 %)	1,076,688 (17.94 %)	8,553,272 (57.13 %)	31,102 (1.31 %)
109	Botta's pocket gopher (hap1 2023) GCA_031878675.1	n/a	18,247 (1.61 %)	22,673 (1.83 %)	n/a	41.12 (99.99 %)	775 (0.01 %)	835 (100.00 %)	2,918,285 (18.64 %)	868,090 (5.77 %)	9,427,604 (40.78 %)	27,049 (1.25 %)
110	Botta's pocket gopher (hap2 2023) GCA_031878665.1	n/a	17,612 (1.68 %)	22,099 (1.91 %)	n/a	41.23 (99.99 %)	541 (0.01 %)	365 (100.00 %)	2,748,918 (17.16 %)	827,542 (4.51 %)	8,832,809 (39.20 %)	26,416 (1.35 %)
111	boutu (hap1 2024) GCA_036417435.1	n/a	18,667 (1.46 %)	20,817 (1.26 %)	n/a	42.07 (100.00 %)	284 (0.00 %)	903 (100.00 %)	4,004,895 (35.23 %)	925,158 (12.15 %)	11,999,784 (42.65 %)	63,428 (1.55 %)
112	boutu (hap2 2024) GCA_036417475.1	n/a	17,954 (1.51 %)	19,994 (1.30 %)	n/a	42.02 (100.00 %)	240 (0.00 %)	800 (100.00 %)	3,723,164 (34.96 %)	809,880 (11.02 %)	11,359,211 (41.42 %)	60,067 (1.55 %)
113	Brahman cow (Angus x Brahman F1 Brahman haplotype 2018) GCF_003369695.1	63,234 (2.88 %)	19,601 (1.57 %)	21,699 (1.34 %)	n/a	41.83 (99.94 %)	302 (0.06 %)	1,250 (100.00 %)	5,524,454 (47.57 %)	459,928 (1.40 %)	13,208,799 (41.21 %)	41,359 (1.10 %)
114	Brandt's bat GCF_000412655.1	46,912 (2.84 %)	19,267 (1.75 %)	18,495 (1.62 %)	n/a	42.59 (94.06 %)	155,664 (5.95 %)	325,414 (94.05 %)	2,897,662 (25.08 %)	634,208 (3.20 %)	11,323,618 (31.06 %)	66,749 (1.59 %)
115	Brazilian free-tailed bat (primary hap 2023) GCA_030848825.1	n/a	19,039 (1.66 %)	21,660 (1.59 %)	n/a	42.29 (100.00 %)	20 (0.00 %)	148 (100.00 %)	3,805,818 (31.80 %)	640,446 (2.50 %)	11,793,353 (36.15 %)	68,896 (2.40 %)
116	Brazilian guinea pig GCA_000688575.1	n/a	16,531 (1.49 %)	11,177 (1.44 %)	n/a	39.81 (64.76 %)	2,565,595 (35.61 %)	3,131 (100.00 %)	2,529,479 (25.87 %)	342,907 (0.66 %)	10,719,517 (21.05 %)	19,508 (0.31 %)
117	Brazilian tapir GCA_004025025.1	n/a	21,581 (1.61 %)	30,818 (1.32 %)	n/a	41.12 (99.93 %)	2,273 (0.01 %)	805,779 (99.99 %)	3,877,938 (38.36 %)	344,032 (0.79 %)	15,601,710 (32.81 %)	43,382 (1.17 %)
118	brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v2 2018) GCF_003584765.2	50,229 (2.92 %)	18,811 (1.77 %)	21,073 (1.52 %)	n/a	41.84 (99.31 %)	17,380 (0.70 %)	21,813 (99.30 %)	4,201,043 (40.86 %)	567,586 (1.23 %)	13,807,211 (30.86 %)	62,125 (1.80 %)
119	brown bear (v2.0 North America Adak 2023) GCF_023065955.2	66,371 (4.20 %)	18,615 (1.68 %)	21,434 (1.53 %)	n/a	42.29 (100.00 %)	250 (0.00 %)	362 (100.00 %)	4,030,019 (33.22 %)	630,008 (4.17 %)	13,240,060 (32.92 %)	64,814 (2.05 %)
120	brown big-eared bat (primary hap 2023) GCA_963455305.1	n/a	19,138 (1.72 %)	20,370 (1.54 %)	n/a	43.08 (99.99 %)	1,237 (0.01 %)	65 (100.00 %)	3,201,470 (26.24 %)	957,903 (4.27 %)	10,687,995 (39.65 %)	60,671 (2.39 %)
121	brown-throated sloth GCA_004027775.1	n/a	17,043 (1.21 %)	37,090 (1.36 %)	n/a	42.76 (99.76 %)	462 (0.00 %)	1,772,267 (100.00 %)	2,487,215 (36.18 %)	316,812 (1.60 %)	7,948,666 (37.96 %)	62,325 (2.36 %)
122	cactus mouse (2023) GCF_949786415.1	47,537 (2.02 %)	18,894 (1.46 %)	20,159 (1.22 %)	n/a	42.40 (99.98 %)	2,603 (0.02 %)	4,297 (100.00 %)	7,181,232 (52.75 %)	1,247,378 (18.35 %)	13,329,318 (43.03 %)	19,540 (0.49 %)
123	California mouse (IS 2022) GCF_007827085.1	62,273 (3.80 %)	18,959 (1.75 %)	19,378 (1.41 %)	n/a	42.21 (100.00 %)	547 (0.00 %)	237 (100.00 %)	5,970,582 (45.08 %)	1,165,743 (3.67 %)	13,734,349 (33.67 %)	19,529 (0.58 %)
124	California sea lion (alternate hap 2019) GCA_009762295.1	n/a	18,348 (1.81 %)	18,692 (1.47 %)	n/a	41.58 (100.00 %)	n/a	3,093 (100.00 %)	3,722,619 (42.89 %)	488,086 (1.26 %)	10,893,132 (33.14 %)	44,449 (1.57 %)
125	California sea lion (LMU 2018 refseq) GCF_900631625.1	69,240 (2.99 %)	20,741 (1.78 %)	20,298 (1.40 %)	n/a	41.38 (99.81 %)	47,716 (0.20 %)	10,423 (100.00 %)	4,530,259 (43.28 %)	573,086 (1.12 %)	13,442,336 (33.58 %)	50,583 (1.46 %)
126	California sea lion (mZalCal1 alternate hap 2020) GCA_009762295.2	n/a	18,319 (1.81 %)	18,772 (1.48 %)	n/a	41.58 (100.00 %)	n/a	3,096 (100.00 %)	3,724,021 (42.91 %)	488,356 (1.26 %)	10,891,276 (33.15 %)	44,467 (1.57 %)
127	California sea lion (v2 primary hap 2020) GCF_009762305.2	70,801 (3.05 %)	20,915 (1.77 %)	20,179 (1.40 %)	44,926 (2.10 %)	41.40 (99.23 %)	185 (0.77 %)	47 (100.00 %)	4,525,652 (43.65 %)	590,246 (1.24 %)	13,263,648 (33.76 %)	51,899 (1.50 %)
128	California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 alternate hap 2023) GCA_028537755.1	n/a	19,409 (1.86 %)	20,578 (1.69 %)	n/a	42.43 (100.00 %)	43 (0.00 %)	310 (100.00 %)	3,161,054 (22.60 %)	891,453 (5.62 %)	11,087,206 (33.12 %)	19,104 (0.65 %)
129	California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 primary hap 2023) GCA_028537955.1	n/a	19,681 (1.86 %)	21,257 (1.62 %)	n/a	42.24 (100.00 %)	51 (0.00 %)	350 (100.00 %)	4,957,057 (42.33 %)	943,226 (5.63 %)	11,695,871 (33.83 %)	20,062 (0.64 %)
130	Canada lynx (alternate hap LIC74 2019) GCA_007474575.1	n/a	12,029 (1.42 %)	15,171 (1.16 %)	n/a	41.46 (100.00 %)	3 (0.00 %)	15,036 (100.00 %)	2,937,491 (43.50 %)	544,410 (1.76 %)	7,641,565 (32.72 %)	39,082 (2.44 %)
131	Canada lynx (LIC74 v2 alternate hap 2020) GCA_007474575.2	n/a	12,041 (1.42 %)	15,226 (1.16 %)	n/a	41.46 (100.00 %)	5 (0.00 %)	15,046 (100.00 %)	2,939,291 (43.50 %)	544,849 (1.76 %)	7,650,345 (32.74 %)	39,099 (2.44 %)
132	Canada lynx (LIC74 v2 primary hap 2020) GCF_007474595.2	50,142 (2.69 %)	18,273 (1.65 %)	19,264 (1.35 %)	n/a	41.70 (99.88 %)	842 (0.12 %)	54 (100.00 %)	5,011,165 (43.72 %)	904,525 (1.75 %)	13,467,551 (34.19 %)	66,799 (2.48 %)
133	Cantor's roundleaf bat GCA_004027415.1	n/a	23,788 (1.42 %)	45,328 (1.68 %)	38,254 (1.57 %)	41.36 (99.91 %)	6,366 (0.03 %)	846,566 (99.97 %)	3,997,370 (31.48 %)	775,742 (1.42 %)	12,770,948 (33.45 %)	41,527 (1.41 %)
134	Cape elephant shrew GCF_000299155.1	25,406 (1.08 %)	23,258 (1.07 %)	24,266 (1.16 %)	n/a	40.30 (86.29 %)	279,394 (13.74 %)	288,162 (86.26 %)	3,765,232 (16.90 %)	604,351 (0.89 %)	20,072,078 (42.36 %)	25,977 (0.42 %)
135	Cape golden mole (2012 Broad) GCF_000296735.1	25,323 (1.07 %)	20,961 (1.07 %)	21,723 (1.04 %)	n/a	40.01 (79.93 %)	370,844 (20.11 %)	391,344 (79.89 %)	4,924,640 (21.03 %)	500,830 (1.95 %)	18,946,663 (41.18 %)	21,186 (0.33 %)
136	Cape rock hyrax (Dallas Zoo Isis #01D731 2014) GCA_000152225.2	n/a	18,455 (1.10 %)	22,103 (1.12 %)	n/a	41.00 (88.89 %)	259,879 (11.14 %)	325,568 (88.86 %)	6,210,235 (51.92 %)	381,915 (1.06 %)	20,080,212 (36.28 %)	29,690 (0.50 %)
137	Cape rock hyrax (US060 2019 Broad) GCA_004026925.1	n/a	21,401 (0.85 %)	45,353 (1.14 %)	n/a	41.08 (99.93 %)	4,203 (0.01 %)	1,048,940 (99.99 %)	7,222,494 (54.48 %)	430,286 (0.85 %)	21,775,991 (44.61 %)	37,158 (0.70 %)
138	capybara GCA_004027455.1	n/a	20,152 (1.22 %)	28,931 (1.29 %)	n/a	39.76 (99.93 %)	5,747 (0.02 %)	661,089 (99.98 %)	4,220,878 (29.16 %)	777,357 (2.04 %)	15,214,944 (35.16 %)	34,558 (0.85 %)
139	carabao (swamp buffalo K-KA32 2023) GCF_029407905.1	77,279 (2.89 %)	19,433 (1.40 %)	21,166 (1.23 %)	n/a	42.77 (100.00 %)	21 (0.00 %)	115 (100.00 %)	3,479,445 (21.92 %)	547,054 (6.39 %)	12,840,677 (45.22 %)	99,752 (3.73 %)
140	cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v2.0 2023 USDA) GCF_002263795.3	77,808 (4.11 %)	19,428 (1.48 %)	22,236 (1.33 %)	n/a	42.01 (100.00 %)	386 (0.00 %)	1,958 (100.00 %)	3,449,588 (22.63 %)	596,092 (3.13 %)	12,785,607 (42.11 %)	46,864 (1.37 %)
141	cattle (Hereford UMD_3.1.1 2014) GCF_000003055.6	57,977 (2.74 %)	19,583 (1.56 %)	20,581 (1.31 %)	n/a	41.82 (99.23 %)	74,464 (0.78 %)	75,598 (99.22 %)	5,607,556 (49.02 %)	440,521 (1.25 %)	13,167,657 (40.78 %)	42,869 (1.24 %)
142	Chacoan peccary (BS20 v2 2019 Broad) GCA_004024745.2	n/a	18,603 (1.52 %)	22,330 (1.36 %)	n/a	42.35 (98.12 %)	57,013 (1.80 %)	1,240,743 (98.20 %)	5,255,211 (43.27 %)	2,502,373 (4.37 %)	12,968,788 (40.96 %)	172,178 (3.66 %)
143	cheetah (Ajub_Pintada_27869175 2022) GCF_027475565.1	80,997 (4.53 %)	18,420 (1.70 %)	19,561 (1.40 %)	n/a	41.59 (100.00 %)	22 (0.00 %)	195 (100.00 %)	4,611,842 (35.10 %)	837,685 (1.68 %)	13,649,125 (33.06 %)	60,367 (2.22 %)
144	cheetah (Rico 2018) GCF_003709585.1	72,154 (3.33 %)	18,472 (1.70 %)	20,443 (1.42 %)	n/a	41.55 (99.55 %)	24,173 (0.45 %)	3,220 (100.00 %)	4,853,945 (42.85 %)	831,106 (1.53 %)	13,663,571 (32.84 %)	60,744 (2.17 %)
145	Chinese forest musk deer (Sichuan 2022) GCF_022376915.1	51,625 (2.80 %)	19,565 (1.43 %)	22,280 (1.29 %)	n/a	42.30 (99.97 %)	1,781 (0.03 %)	2,446 (100.00 %)	3,257,347 (21.65 %)	399,120 (3.81 %)	12,906,274 (43.79 %)	46,689 (1.12 %)
146	Chinese hamster (17A/GY CHO 2020) GCF_003668045.3	55,440 (2.79 %)	20,030 (1.84 %)	18,721 (1.41 %)	67,900 (3.41 %)	41.51 (99.90 %)	4,164 (0.10 %)	647 (100.00 %)	8,121,057 (33.74 %)	1,095,058 (2.91 %)	12,923,274 (32.25 %)	19,341 (0.58 %)
147	Chinese hamster (CHO v1 2011 BGI) GCF_000223135.1	46,006 (2.59 %)	20,602 (1.78 %)	17,467 (1.35 %)	n/a	41.37 (96.61 %)	156,635 (3.40 %)	265,787 (96.60 %)	4,541,936 (33.03 %)	1,072,129 (2.66 %)	13,150,189 (30.04 %)	12,522 (0.25 %)
148	Chinese hamster (CHO v2 2017 Eagle Genomics Ltd) GCA_900186095.1	n/a	19,874 (1.85 %)	19,298 (1.44 %)	n/a	41.45 (98.56 %)	63,334 (1.45 %)	71,598 (98.55 %)	4,521,726 (33.66 %)	1,060,619 (2.55 %)	12,867,288 (31.26 %)	17,960 (0.54 %)
149	Chinese hamster (CHO-K1 CHOZN v2.4 2022) GCA_026545065.1	n/a	20,293 (1.81 %)	18,881 (1.42 %)	n/a	41.62 (71.16 %)	924,541 (28.93 %)	1,236,122 (71.07 %)	4,330,728 (30.92 %)	987,319 (3.70 %)	13,374,062 (21.92 %)	18,838 (0.40 %)
150	Chinese pangolin (2020 Yunnan U) GCF_014570555.1	69,694 (3.21 %)	18,206 (1.70 %)	20,508 (1.48 %)	n/a	40.79 (95.54 %)	34,903 (4.47 %)	4,694 (100.00 %)	2,927,176 (35.60 %)	269,964 (0.67 %)	12,610,535 (29.10 %)	35,278 (1.05 %)
151	Chinese pangolin (hap1 2023) GCF_030020395.1	71,445 (2.98 %)	18,379 (1.34 %)	21,837 (1.29 %)	n/a	41.07 (99.77 %)	383 (0.23 %)	661 (100.00 %)	3,318,871 (34.65 %)	618,193 (3.68 %)	12,009,669 (39.02 %)	47,708 (1.22 %)
152	Chinese pangolin (hap2 mManPen7 2023) GCA_030020945.1	n/a	18,538 (1.34 %)	21,724 (1.27 %)	n/a	41.09 (99.48 %)	190 (0.52 %)	700 (100.00 %)	3,362,899 (34.48 %)	678,384 (4.11 %)	12,024,241 (39.52 %)	48,960 (1.19 %)
153	Chinese pangolin (MPE899 2014 WashU) GCA_000738955.1	n/a	18,749 (1.63 %)	22,506 (1.40 %)	n/a	40.93 (90.69 %)	257,424 (9.33 %)	230,927 (90.67 %)	2,691,116 (34.48 %)	316,518 (1.96 %)	11,538,086 (25.40 %)	30,693 (0.58 %)
154	Chinese rufous horseshoe bat GCA_001888835.1	n/a	26,871 (2.34 %)	25,467 (1.89 %)	n/a	40.52 (97.22 %)	212,601 (2.80 %)	63,439 (100.00 %)	3,219,611 (33.86 %)	495,126 (1.20 %)	12,476,551 (27.16 %)	32,993 (0.98 %)
155	Chinese rufous horseshoe bat (RSC01 2024) GCA_036562045.1	n/a	17,893 (1.95 %)	19,249 (1.60 %)	n/a	40.47 (100.00 %)	286 (0.00 %)	454 (100.00 %)	3,055,304 (33.11 %)	531,106 (1.34 %)	11,858,144 (29.52 %)	30,884 (1.08 %)
156	Chinese rufous horseshoe bat (RSC01 2024) GCF_036562045.2	67,162 (3.87 %)	17,890 (1.94 %)	19,248 (1.60 %)	n/a	40.47 (100.00 %)	286 (0.00 %)	454 (100.00 %)	3,325,750 (39.02 %)	531,106 (1.34 %)	11,858,028 (29.52 %)	30,884 (1.08 %)
157	Chinese tree shrew (2013 BGI) GCF_000334495.1	47,005 (2.07 %)	21,375 (1.39 %)	19,231 (1.28 %)	n/a	41.73 (95.10 %)	191,695 (4.92 %)	242,445 (95.08 %)	5,060,321 (23.05 %)	1,046,388 (4.15 %)	14,978,259 (38.04 %)	88,806 (1.44 %)
158	Chinese tree shrew (KIZ-2021 2023) GCA_033439345.1	n/a	22,218 (1.55 %)	22,364 (1.36 %)	n/a	41.78 (99.99 %)	1,697 (0.01 %)	1,645 (100.00 %)	6,126,341 (42.08 %)	1,035,957 (2.47 %)	14,328,193 (41.14 %)	90,914 (1.82 %)
159	chiru GCA_000400835.1	n/a	20,320 (1.60 %)	42,654 (2.51 %)	n/a	42.01 (93.04 %)	283,069 (7.00 %)	298,127 (93.00 %)	5,342,241 (43.54 %)	425,329 (1.25 %)	13,714,420 (34.66 %)	43,135 (1.89 %)
160	clouded leopard (mNeoNeb1 alternate hap 2023) GCA_028018655.1	n/a	16,430 (1.52 %)	21,057 (1.44 %)	n/a	41.79 (100.00 %)	n/a	10,377 (100.00 %)	3,845,437 (33.39 %)	794,587 (2.14 %)	10,765,695 (33.40 %)	56,375 (2.45 %)
161	clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 refseq) GCF_028018385.1	81,219 (3.62 %)	18,300 (1.65 %)	20,361 (1.39 %)	n/a	41.79 (99.94 %)	181 (0.06 %)	33 (100.00 %)	4,224,269 (34.84 %)	992,668 (2.08 %)	13,618,866 (34.42 %)	67,830 (2.45 %)
162	common bottlenose dolphin (maternal 2020) GCA_011762535.1	n/a	18,837 (1.77 %)	20,857 (1.43 %)	n/a	41.43 (99.73 %)	649 (0.27 %)	985 (100.00 %)	4,073,893 (46.15 %)	630,039 (2.15 %)	12,628,219 (35.41 %)	65,379 (1.89 %)
163	common bottlenose dolphin (maternal Y refseq 2020) GCF_011762595.1	67,220 (3.31 %)	18,766 (1.77 %)	20,528 (1.42 %)	35,852 (1.58 %)	41.44 (99.74 %)	674 (0.26 %)	362 (100.00 %)	4,069,115 (46.17 %)	628,982 (2.12 %)	12,490,891 (35.29 %)	65,551 (1.90 %)
164	common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 refseq) GCF_001922835.1	45,975 (2.99 %)	17,255 (1.69 %)	17,058 (1.34 %)	n/a	40.85 (99.45 %)	114,003 (0.57 %)	2,648 (100.00 %)	3,845,938 (43.89 %)	514,631 (1.06 %)	12,317,098 (32.18 %)	48,030 (1.35 %)
165	common bottlenose dolphin (mTurTru1 2024) GCF_011762595.2	80,385 (4.33 %)	18,770 (1.77 %)	20,525 (1.42 %)	n/a	41.44 (99.74 %)	674 (0.26 %)	361 (100.00 %)	3,981,744 (44.78 %)	628,982 (2.12 %)	12,490,558 (35.29 %)	65,551 (1.90 %)
166	common bottlenose dolphin (paternal 2020) GCA_011762515.1	n/a	18,537 (1.77 %)	20,619 (1.44 %)	n/a	41.42 (98.08 %)	868 (1.92 %)	1,166 (100.00 %)	3,997,801 (45.93 %)	609,838 (1.85 %)	12,400,272 (34.53 %)	64,630 (1.84 %)
167	common brushtail (alternate hap 2020) GCA_011100645.1	n/a	14,863 (0.75 %)	15,426 (0.89 %)	n/a	39.41 (100.00 %)	313 (0.00 %)	12,446 (100.00 %)	5,846,769 (38.56 %)	987,917 (1.99 %)	16,764,356 (40.14 %)	13,303 (0.35 %)
168	common brushtail (refseq 2020) GCF_011100635.1	37,661 (1.80 %)	18,653 (0.80 %)	15,375 (0.86 %)	n/a	39.48 (99.44 %)	1,796 (0.56 %)	212 (100.00 %)	7,598,116 (38.90 %)	1,259,434 (1.97 %)	22,071,306 (40.56 %)	17,762 (0.38 %)
169	common pipistrelle (2020) GCA_903992545.1	n/a	17,216 (1.82 %)	19,202 (1.79 %)	n/a	42.55 (99.97 %)	1,546 (0.03 %)	323 (100.00 %)	2,953,532 (23.94 %)	805,142 (2.83 %)	9,964,846 (34.69 %)	57,295 (2.83 %)
170	common pipistrelle (alternate hap 2020) GCA_903992515.1	n/a	15,974 (1.72 %)	20,563 (1.66 %)	n/a	42.41 (100.00 %)	12 (0.00 %)	10,459 (100.00 %)	2,634,333 (23.76 %)	703,674 (2.65 %)	8,909,525 (33.95 %)	50,430 (2.54 %)
171	common pipistrelle (Broad 2019) GCA_004026625.1	n/a	21,938 (1.35 %)	53,915 (1.60 %)	n/a	42.88 (99.88 %)	10,870 (0.05 %)	736,974 (99.95 %)	3,499,501 (22.91 %)	1,046,301 (2.96 %)	11,759,516 (37.96 %)	92,062 (3.23 %)
172	common pipistrelle (hap1.1 2025) GCA_965203405.1	n/a	18,233 (1.77 %)	21,445 (1.80 %)	n/a	42.93 (99.98 %)	1,650 (0.02 %)	575 (100.00 %)	3,324,262 (26.83 %)	869,167 (7.44 %)	10,218,519 (37.91 %)	76,006 (3.29 %)
173	common pipistrelle (hap2.1 2025) GCA_965204225.1	n/a	18,115 (1.81 %)	21,233 (1.83 %)	n/a	42.89 (99.98 %)	1,602 (0.02 %)	1,971 (99.98 %)	3,303,323 (27.28 %)	852,756 (5.65 %)	10,047,424 (36.41 %)	69,105 (3.25 %)
174	common thicket rat (MVZ Mamm 221001 2021) GCA_019843835.1	n/a	25,148 (1.36 %)	49,594 (1.08 %)	n/a	41.11 (99.52 %)	63,300 (0.44 %)	572,372 (99.56 %)	3,806,717 (32.04 %)	1,181,694 (2.86 %)	12,272,340 (28.58 %)	16,373 (0.48 %)
175	common vampire bat (v2 HL8 alternate hap 2022 genbank) GCA_022682395.2	n/a	17,485 (1.76 %)	18,907 (1.66 %)	n/a	42.87 (99.99 %)	576 (0.01 %)	429 (100.00 %)	2,592,246 (28.20 %)	352,985 (2.87 %)	10,737,944 (31.11 %)	61,125 (2.28 %)
176	common vampire bat (v2 HL8 primary hap 2022 refseq) GCF_022682495.2	58,786 (3.38 %)	18,507 (1.82 %)	19,451 (1.59 %)	n/a	42.99 (99.99 %)	615 (0.01 %)	574 (100.00 %)	2,960,602 (36.90 %)	431,577 (3.90 %)	11,286,753 (32.62 %)	71,507 (2.50 %)
177	common vampire bat (v3 DRU21DN04 2018) GCF_002940915.2	51,044 (3.24 %)	18,503 (1.88 %)	18,071 (1.68 %)	n/a	42.15 (97.78 %)	54,246 (2.23 %)	83,364 (97.77 %)	2,799,509 (29.62 %)	275,242 (1.03 %)	11,796,826 (28.19 %)	51,634 (1.37 %)
178	common warthog (WHEZ1 2021) GCF_016906955.1	55,156 (2.64 %)	18,264 (1.56 %)	19,251 (1.34 %)	54,816 (2.83 %)	41.95 (99.61 %)	523 (0.39 %)	194 (100.00 %)	3,898,243 (30.33 %)	588,742 (1.17 %)	12,955,929 (36.44 %)	75,592 (1.86 %)
179	common wombat GCF_900497805.2	46,365 (1.78 %)	19,437 (0.86 %)	18,947 (0.96 %)	n/a	38.86 (99.68 %)	67,461 (0.33 %)	14,183 (100.00 %)	8,645,969 (41.99 %)	1,203,246 (1.61 %)	23,878,215 (39.11 %)	18,752 (0.37 %)
180	Corsac fox (zsh2022 2023) GCA_030463245.1	n/a	19,527 (1.61 %)	18,923 (1.35 %)	n/a	41.24 (100.00 %)	107 (0.00 %)	202 (100.00 %)	4,435,406 (32.05 %)	981,019 (1.98 %)	13,673,245 (32.65 %)	49,252 (2.20 %)
181	coyote (coyote_06102 2023) GCA_034620425.1	n/a	19,251 (1.60 %)	19,585 (1.40 %)	n/a	41.18 (100.00 %)	93 (0.00 %)	120 (100.00 %)	4,493,000 (32.28 %)	982,814 (2.01 %)	13,803,318 (33.09 %)	50,777 (2.23 %)
182	creeping vole GCF_018167655.1	54,941 (2.31 %)	23,033 (1.55 %)	25,427 (1.53 %)	n/a	44.23 (100.00 %)	n/a	2,147 (100.00 %)	4,549,519 (25.66 %)	1,153,429 (13.60 %)	13,568,297 (40.65 %)	23,141 (0.54 %)
183	crested porcupine GCA_004026905.1	n/a	21,005 (1.32 %)	35,975 (1.39 %)	n/a	41.51 (99.89 %)	4,351 (0.02 %)	1,140,949 (99.98 %)	4,303,147 (30.69 %)	600,488 (1.19 %)	14,049,490 (33.80 %)	57,196 (1.33 %)
184	crested rat (2021) GCA_907164525.1	n/a	18,829 (1.57 %)	20,084 (1.23 %)	n/a	40.89 (92.16 %)	116,236 (7.85 %)	153,441 (92.15 %)	6,937,911 (48.56 %)	1,051,397 (2.16 %)	13,178,644 (37.15 %)	22,912 (0.47 %)
185	Crete spiny mouse (2024) GCA_964271855.1	n/a	19,467 (1.76 %)	18,734 (1.43 %)	n/a	42.87 (100.00 %)	184 (0.00 %)	113 (100.00 %)	4,718,848 (32.83 %)	1,327,449 (6.80 %)	12,893,458 (34.03 %)	21,236 (0.61 %)
186	Cuvier's beaked whale GCA_004364475.1	n/a	23,700 (0.90 %)	51,715 (0.86 %)	n/a	42.01 (99.76 %)	3,229 (0.01 %)	3,761,505 (99.99 %)	6,544,424 (43.61 %)	1,417,186 (3.11 %)	16,127,873 (42.25 %)	68,668 (1.15 %)
187	cyclops roundleaf bat (Cote d'Ivoire 20210929_DDa primary hap 2024) GCA_043880285.1	n/a	18,610 (1.67 %)	19,098 (1.39 %)	n/a	41.56 (99.99 %)	334 (0.01 %)	73 (100.00 %)	4,077,286 (41.85 %)	754,689 (2.64 %)	11,873,386 (36.16 %)	48,137 (1.04 %)
188	Damara mole-rat DMR 1.0 (2014 BGI) GCF_000743615.1	52,373 (2.57 %)	17,983 (1.45 %)	17,063 (1.43 %)	n/a	40.34 (97.96 %)	87,815 (2.05 %)	162,545 (97.95 %)	4,053,433 (30.86 %)	545,281 (1.74 %)	13,406,483 (30.65 %)	37,008 (0.74 %)
189	Damara mole-rat DMR 1.0 HiC (2020 DNA Zoo) GCF_012274545.1	58,091 (2.74 %)	17,780 (1.44 %)	16,515 (1.42 %)	n/a	40.34 (97.94 %)	88,899 (2.07 %)	73,970 (100.00 %)	4,035,140 (30.95 %)	544,772 (1.73 %)	13,390,872 (30.61 %)	37,008 (0.74 %)
190	dassie-rat GCA_004026965.1	n/a	20,479 (1.16 %)	42,937 (1.41 %)	n/a	41.86 (99.89 %)	9,645 (0.04 %)	920,324 (99.96 %)	4,563,054 (28.83 %)	660,623 (1.92 %)	12,899,807 (34.48 %)	46,569 (1.25 %)
191	Daubenton's bat (alternate hap 2023) GCA_963242275.1	n/a	18,895 (1.78 %)	24,235 (1.81 %)	n/a	43.39 (100.00 %)	n/a	4,930 (100.00 %)	2,813,870 (23.75 %)	718,406 (5.18 %)	9,977,320 (37.24 %)	62,910 (2.66 %)
192	Daubenton's bat (primary hap 2023 refseq) GCF_963259705.1	64,558 (3.32 %)	19,141 (1.72 %)	22,133 (1.66 %)	n/a	43.18 (99.99 %)	1,099 (0.01 %)	121 (100.00 %)	3,040,232 (24.03 %)	796,911 (6.38 %)	10,478,180 (38.84 %)	64,920 (2.51 %)
193	Daurian ground squirrel GCA_002406435.1	n/a	20,990 (1.31 %)	17,575 (1.17 %)	n/a	39.77 (96.15 %)	141,850 (3.84 %)	502,654 (96.16 %)	5,783,538 (34.36 %)	924,038 (3.73 %)	17,533,301 (30.85 %)	27,955 (0.39 %)
194	David's myotis bat GCF_000327345.1	37,645 (2.70 %)	18,744 (1.78 %)	17,565 (1.62 %)	n/a	42.69 (91.23 %)	223,511 (8.80 %)	325,280 (91.20 %)	2,680,166 (23.79 %)	532,273 (1.90 %)	11,016,028 (29.55 %)	59,615 (1.59 %)
195	degu (3935 2012 refseq) GCF_000260255.1	48,165 (2.13 %)	22,242 (1.41 %)	22,101 (1.46 %)	n/a	41.38 (84.36 %)	252,772 (15.68 %)	259,904 (84.32 %)	4,901,673 (27.74 %)	898,945 (1.50 %)	14,282,003 (29.30 %)	40,135 (0.82 %)
196	desert hamster (2022) GCF_943737965.1	37,291 (2.11 %)	19,744 (1.74 %)	20,215 (1.50 %)	n/a	41.31 (100.00 %)	n/a	2,079 (100.00 %)	4,038,079 (31.01 %)	1,132,871 (2.71 %)	11,946,112 (32.62 %)	17,053 (0.51 %)
197	Desmarest's hutia GCA_004027915.1	n/a	23,535 (0.78 %)	50,796 (0.95 %)	n/a	42.03 (99.83 %)	3,492 (0.01 %)	2,355,850 (99.99 %)	5,790,506 (26.72 %)	1,062,134 (1.71 %)	16,977,224 (35.29 %)	54,479 (1.01 %)
198	dingo (2020 Alpine COOINDA U.NSW) GCF_012295265.1	102,060 (4.04 %)	19,777 (1.69 %)	20,341 (1.41 %)	n/a	41.29 (99.69 %)	325 (0.31 %)	477 (100.00 %)	4,950,808 (42.83 %)	1,033,921 (2.36 %)	13,745,703 (33.32 %)	51,835 (2.25 %)
199	dingo (Sandy 2020 James Cook U) GCF_003254725.2	104,332 (4.50 %)	19,710 (1.72 %)	19,857 (1.42 %)	n/a	41.24 (100.00 %)	69 (0.00 %)	159 (100.00 %)	4,547,906 (33.32 %)	993,474 (2.19 %)	13,701,060 (33.18 %)	51,216 (2.28 %)
200	dog (Basenji MU ID 185726 2019) GCA_004886185.2	n/a	19,889 (1.67 %)	20,501 (1.39 %)	n/a	41.36 (99.99 %)	1,388 (0.01 %)	3,630 (99.99 %)	4,950,227 (43.32 %)	1,059,639 (2.97 %)	13,694,849 (33.70 %)	51,443 (2.16 %)
201	dog (Basenji UNSW-BAS-2019 2021) GCA_013276365.2	n/a	19,310 (1.60 %)	19,947 (1.42 %)	n/a	41.21 (100.00 %)	149 (0.00 %)	631 (100.00 %)	4,452,916 (32.14 %)	960,590 (2.23 %)	13,685,353 (33.01 %)	50,715 (2.22 %)
202	dog (Bernese Mountain Dog BD 2023) GCA_031010765.1	n/a	19,211 (1.60 %)	20,327 (1.44 %)	n/a	41.20 (100.00 %)	641 (0.00 %)	175 (100.00 %)	4,471,016 (32.18 %)	984,776 (2.03 %)	13,719,474 (32.88 %)	51,050 (2.25 %)
203	dog (Bernese Mountain Dog OD 2023) GCA_031010635.1	n/a	19,279 (1.60 %)	20,348 (1.44 %)	n/a	41.21 (100.00 %)	1,015 (0.00 %)	159 (100.00 %)	4,491,081 (32.21 %)	996,142 (2.01 %)	13,761,195 (32.97 %)	51,490 (2.25 %)
204	dog (boxer Tasha 2011) GCF_000002285.3	82,536 (3.63 %)	19,772 (1.66 %)	19,565 (1.39 %)	n/a	41.31 (99.25 %)	23,876 (0.76 %)	27,106 (99.24 %)	4,918,098 (43.29 %)	991,835 (2.81 %)	13,644,959 (33.60 %)	53,269 (2.07 %)
205	dog (boxer Tasha 2020) GCF_000002285.5	93,761 (3.84 %)	19,392 (1.71 %)	19,572 (1.42 %)	52,141 (3.27 %)	41.26 (100.00 %)	1,028 (0.00 %)	147 (100.00 %)	23,927,903 (42.42 %)	972,851 (2.05 %)	13,611,845 (33.11 %)	50,679 (2.26 %)
206	dog (Cairn Terrier CA611 2023) GCA_031010295.1	n/a	19,255 (1.61 %)	20,479 (1.45 %)	n/a	41.19 (100.00 %)	262 (0.00 %)	141 (100.00 %)	4,490,019 (32.25 %)	989,383 (1.99 %)	13,710,808 (32.97 %)	50,883 (2.22 %)
207	dog (German shepard Mischka 2020) GCF_011100685.1	96,734 (3.71 %)	20,135 (1.64 %)	20,871 (1.38 %)	56,772 (3.19 %)	41.50 (100.00 %)	585 (0.00 %)	2,782 (100.00 %)	20,264,827 (43.87 %)	1,152,879 (3.22 %)	13,784,690 (34.30 %)	53,518 (2.23 %)
208	dog (German Shepherd Nala 2020) GCA_008641055.3	n/a	19,757 (1.69 %)	20,201 (1.41 %)	n/a	41.32 (99.74 %)	458 (0.26 %)	410 (100.00 %)	4,974,233 (43.03 %)	1,048,366 (2.46 %)	13,881,889 (33.61 %)	51,900 (2.21 %)
209	dog (Labrador retriever 2023) GCA_031165255.1	n/a	19,256 (1.61 %)	20,247 (1.44 %)	n/a	41.18 (100.00 %)	516 (0.00 %)	675 (100.00 %)	4,456,220 (32.19 %)	960,584 (1.96 %)	13,688,006 (32.82 %)	50,670 (2.21 %)
210	dog (labrador SID07034 2020) GCF_014441545.1	99,420 (3.87 %)	19,870 (1.70 %)	20,252 (1.41 %)	54,322 (3.23 %)	41.19 (99.47 %)	575 (0.53 %)	376 (100.00 %)	4,981,985 (42.28 %)	1,019,772 (1.97 %)	13,959,750 (32.77 %)	52,469 (2.25 %)
211	domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2017 WashU) GCF_000181335.3	72,076 (3.30 %)	18,662 (1.64 %)	20,897 (1.37 %)	n/a	41.73 (98.20 %)	436 (1.80 %)	5,079 (98.20 %)	5,086,462 (43.51 %)	964,126 (2.68 %)	13,947,871 (33.33 %)	69,701 (2.41 %)
212	domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021 WashU) GCA_000181335.5	n/a	18,378 (1.53 %)	21,242 (1.40 %)	n/a	41.73 (98.21 %)	422 (1.79 %)	5,010 (98.31 %)	4,683,703 (33.33 %)	964,129 (2.68 %)	13,948,305 (33.33 %)	69,725 (2.42 %)
213	domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021) GCA_000181335.6	n/a	18,357 (1.55 %)	20,085 (1.38 %)	n/a	41.76 (98.18 %)	422 (1.82 %)	1,254 (98.28 %)	4,661,997 (33.78 %)	947,221 (2.58 %)	13,867,949 (33.67 %)	68,011 (2.41 %)
214	domestic cat (Fca126 2021 Texas A&M U) GCF_018350175.1	99,222 (4.40 %)	18,456 (1.66 %)	19,833 (1.39 %)	94,133 (5.63 %)	41.81 (100.00 %)	39 (0.00 %)	102 (100.00 %)	4,965,571 (43.65 %)	932,424 (1.95 %)	13,596,808 (33.85 %)	67,329 (2.48 %)
215	domestic cattle (Tuli MAZUNGA 2024) GCA_040285425.1	n/a	19,454 (1.36 %)	22,081 (1.21 %)	n/a	44.04 (99.98 %)	31 (0.02 %)	878 (100.00 %)	6,506,177 (50.93 %)	1,038,848 (13.71 %)	11,547,434 (49.22 %)	84,199 (8.81 %)
216	domestic cattle (Wagyu 3DWFS0412 2024) GCA_040286185.1	n/a	19,252 (1.32 %)	22,269 (1.20 %)	n/a	43.83 (99.96 %)	17 (0.04 %)	407 (99.99 %)	6,783,665 (51.29 %)	1,072,289 (13.17 %)	12,697,022 (49.18 %)	89,666 (8.32 %)
217	domestic ferret (JIRA1106 JCVI 2020) GCF_011764305.1	68,868 (3.09 %)	19,019 (1.55 %)	21,812 (1.42 %)	n/a	41.90 (100.00 %)	n/a	1,224 (100.00 %)	4,650,028 (39.49 %)	745,115 (2.02 %)	13,758,447 (36.14 %)	58,684 (2.16 %)
218	domestic ferret (Sable 2011 Broad) GCA_000239315.1	n/a	18,778 (1.67 %)	19,571 (1.47 %)	n/a	41.48 (96.89 %)	72,670 (3.12 %)	76,914 (96.88 %)	4,491,876 (40.13 %)	618,556 (1.07 %)	13,721,938 (31.04 %)	54,600 (1.94 %)
219	domestic guinea pig (051 PalLab524CR 2023) GCF_034190915.1	79,333 (3.55 %)	17,999 (1.09 %)	21,509 (1.20 %)	n/a	40.64 (100.00 %)	84 (0.00 %)	672 (100.00 %)	5,037,431 (41.68 %)	886,785 (13.97 %)	14,620,284 (42.71 %)	39,682 (0.89 %)
220	domestic guinea pig (2N 2008 refseq) GCF_000151735.1	44,762 (2.31 %)	18,301 (1.33 %)	20,111 (1.34 %)	n/a	39.95 (97.81 %)	58,460 (2.20 %)	61,604 (97.80 %)	4,257,852 (38.85 %)	658,533 (1.25 %)	14,547,726 (34.19 %)	37,093 (0.85 %)
221	domestic yak (maiwa yakHY00 2019) GCA_005887515.3	n/a	18,672 (1.39 %)	19,408 (1.24 %)	n/a	41.97 (100.00 %)	646 (0.00 %)	343 (100.00 %)	3,570,978 (23.00 %)	583,762 (8.57 %)	14,055,227 (40.52 %)	43,883 (1.17 %)
222	dugong (hap1 mDugDug1 2023) GCA_030035585.1	n/a	18,354 (1.22 %)	20,434 (1.08 %)	n/a	40.65 (100.00 %)	96 (0.00 %)	198 (100.00 %)	4,458,084 (33.00 %)	444,499 (1.79 %)	15,031,940 (47.42 %)	29,863 (0.83 %)
223	dugong (hap2 mDugDug1 2023) GCA_030020955.1	n/a	18,538 (1.23 %)	20,775 (1.09 %)	n/a	40.64 (100.00 %)	89 (0.00 %)	167 (100.00 %)	4,455,227 (33.01 %)	444,021 (1.73 %)	14,946,847 (47.37 %)	29,828 (0.79 %)
224	dwarf mongoose GCA_004023845.1	n/a	21,478 (1.57 %)	32,174 (1.43 %)	n/a	41.83 (99.94 %)	10,815 (0.05 %)	200,185 (99.95 %)	4,574,991 (40.34 %)	595,520 (1.11 %)	13,720,585 (32.94 %)	70,689 (2.42 %)
225	eastern cottontail (primary hap 2023) GCA_949820135.1	n/a	18,522 (1.26 %)	22,314 (1.28 %)	n/a	43.69 (100.00 %)	316 (0.00 %)	99 (100.00 %)	3,699,683 (20.55 %)	935,350 (11.22 %)	13,112,318 (44.07 %)	99,224 (2.27 %)
226	eastern European house mouse (PWK_PhJ v2 2022) GCA_921998335.2	n/a	21,903 (2.13 %)	19,801 (1.40 %)	108,675 (4.42 %)	41.79 (99.89 %)	207 (0.11 %)	211 (100.00 %)	4,630,645 (40.56 %)	1,531,506 (3.70 %)	13,011,312 (35.48 %)	22,270 (0.54 %)
227	eastern mole GCA_004024925.1	n/a	19,631 (1.57 %)	32,414 (1.63 %)	n/a	42.02 (99.91 %)	7,239 (0.03 %)	647,535 (99.97 %)	3,145,725 (29.42 %)	554,620 (1.75 %)	10,663,504 (32.88 %)	55,063 (3.69 %)
228	eastern quoll GCA_020854095.1	n/a	15,715 (0.80 %)	16,750 (0.93 %)	n/a	36.19 (100.00 %)	431 (0.00 %)	76 (100.00 %)	5,256,999 (24.81 %)	1,280,160 (3.39 %)	21,362,866 (41.74 %)	24,508 (0.70 %)
229	eastern spiny mouse (2021) GCA_907164435.1	n/a	20,397 (1.93 %)	20,515 (1.44 %)	n/a	42.68 (98.12 %)	109,220 (1.90 %)	19,837 (99.90 %)	4,701,702 (33.98 %)	1,304,933 (2.91 %)	13,145,044 (31.05 %)	19,636 (0.56 %)
230	Egyptian rousette (1219 2016 Boston U) GCF_001466805.2	54,791 (4.93 %)	18,221 (2.05 %)	24,192 (1.88 %)	46,601 (2.22 %)	40.02 (99.97 %)	638 (0.03 %)	2,490 (100.00 %)	2,815,693 (32.23 %)	440,119 (1.01 %)	12,346,041 (26.86 %)	56,244 (6.54 %)
231	Egyptian rousette (v1 2020 refseq) GCF_014176215.1	65,163 (4.76 %)	17,642 (2.07 %)	22,317 (1.84 %)	n/a	40.05 (98.59 %)	242 (1.41 %)	29 (100.00 %)	2,821,248 (33.05 %)	434,414 (1.02 %)	12,031,597 (26.52 %)	53,573 (4.84 %)
232	Egyptian spiny mouse (US019 2019) GCA_004027535.1	n/a	23,498 (1.69 %)	36,970 (1.40 %)	30,076 (1.58 %)	42.71 (99.88 %)	20,469 (0.09 %)	391,811 (99.91 %)	4,983,574 (35.17 %)	1,342,514 (3.45 %)	13,029,270 (32.79 %)	19,944 (0.55 %)
233	elk (wapiti) GCF_019320065.1	66,846 (3.00 %)	20,090 (1.67 %)	21,999 (1.44 %)	n/a	41.62 (99.93 %)	6,643 (0.08 %)	185 (100.00 %)	4,884,711 (43.14 %)	429,925 (1.65 %)	13,135,255 (37.85 %)	47,099 (1.31 %)
234	ermine (2020) GCF_009829155.1	74,345 (3.19 %)	18,855 (1.65 %)	20,667 (1.43 %)	44,584 (2.07 %)	41.56 (99.12 %)	199 (0.88 %)	94 (100.00 %)	4,647,934 (41.44 %)	714,174 (1.30 %)	13,845,904 (33.42 %)	56,065 (2.25 %)
235	ermine (alternate hap 2020) GCA_009829165.1	n/a	13,583 (1.65 %)	15,403 (1.46 %)	n/a	41.72 (100.00 %)	n/a	3,327 (100.00 %)	3,139,035 (40.57 %)	480,111 (1.29 %)	9,106,061 (31.93 %)	39,139 (2.25 %)
236	Eurasian badger (2021) GCA_922990625.1	n/a	19,332 (1.42 %)	22,424 (1.40 %)	n/a	42.47 (100.00 %)	27 (0.00 %)	726 (100.00 %)	4,362,536 (31.74 %)	801,232 (4.02 %)	13,893,672 (37.73 %)	65,806 (4.13 %)
237	Eurasian badger (v3.2 2022) GCA_922984935.2	n/a	19,268 (1.40 %)	22,121 (1.36 %)	41,043 (1.93 %)	42.48 (100.00 %)	101 (0.00 %)	538 (100.00 %)	4,417,203 (31.72 %)	821,664 (4.02 %)	13,814,720 (38.08 %)	66,524 (3.95 %)
238	Eurasian field mouse (2024) GCA_964023405.1	n/a	20,487 (1.88 %)	19,707 (1.34 %)	n/a	42.15 (100.00 %)	182 (0.00 %)	61 (100.00 %)	5,115,510 (39.18 %)	1,868,284 (4.29 %)	13,503,826 (37.29 %)	26,414 (0.61 %)
239	Eurasian red squirrel (alternate hap 2019) GCA_902685485.1	n/a	12,437 (1.51 %)	12,702 (1.22 %)	n/a	40.06 (100.00 %)	2 (0.00 %)	10,657 (100.00 %)	2,303,176 (35.38 %)	353,996 (1.49 %)	7,218,556 (31.67 %)	24,268 (1.07 %)
240	Eurasian red squirrel (v1.2 2020) GCA_902686455.2	n/a	21,309 (1.58 %)	21,026 (1.36 %)	33,465 (1.53 %)	40.08 (94.33 %)	1,177 (5.67 %)	639 (100.00 %)	4,677,412 (35.73 %)	704,218 (1.42 %)	14,992,063 (31.49 %)	48,159 (1.04 %)
241	Eurasian river otter (2020) GCF_902655055.1	67,269 (2.96 %)	18,842 (1.54 %)	20,178 (1.40 %)	n/a	41.59 (100.00 %)	185 (0.00 %)	44 (100.00 %)	4,259,294 (33.39 %)	713,721 (1.36 %)	13,626,048 (34.37 %)	57,073 (1.82 %)
242	Eurasian river otter (alternate hap 2019) GCA_902653095.1	n/a	9,910 (1.59 %)	11,315 (1.31 %)	n/a	41.85 (100.00 %)	n/a	8,506 (100.00 %)	2,052,338 (42.25 %)	316,084 (1.64 %)	6,222,460 (33.12 %)	27,057 (1.96 %)
243	Eurasian water vole (alternate hap 2020) GCA_903992525.1	n/a	16,761 (1.66 %)	19,715 (1.37 %)	n/a	42.13 (100.00 %)	105 (0.00 %)	16,473 (100.00 %)	3,118,266 (26.44 %)	829,463 (2.82 %)	9,700,482 (31.37 %)	14,146 (0.57 %)
244	Eurasian water vole (v2 2021) GCF_903992535.2	45,544 (2.51 %)	19,733 (1.78 %)	19,053 (1.47 %)	36,935 (2.27 %)	42.15 (99.74 %)	873 (0.26 %)	215 (100.00 %)	3,993,912 (25.74 %)	1,088,163 (2.91 %)	12,853,770 (32.42 %)	19,000 (0.58 %)
245	European hare (LE1 primary hap 2023) GCF_033115175.1	46,528 (2.09 %)	19,392 (1.25 %)	23,070 (1.29 %)	n/a	44.03 (100.00 %)	418 (0.00 %)	651 (100.00 %)	4,011,592 (19.81 %)	1,000,204 (8.44 %)	13,414,251 (44.25 %)	98,831 (2.33 %)
246	European harvest mouse (primary hap 2024) GCA_963924665.1	n/a	20,236 (1.71 %)	19,368 (1.32 %)	n/a	40.05 (99.99 %)	2,020 (0.02 %)	894 (100.00 %)	4,892,811 (36.49 %)	1,223,387 (18.26 %)	11,907,631 (42.51 %)	17,423 (0.62 %)
247	European mink (alternate hap 2023) GCA_030435785.1	n/a	15,419 (1.50 %)	21,175 (1.51 %)	n/a	42.09 (100.00 %)	n/a	12,043 (100.00 %)	2,952,218 (30.62 %)	538,508 (2.18 %)	9,303,303 (34.20 %)	47,810 (2.50 %)
248	European mink (primary hap 2023 refseq) GCF_030435805.1	69,556 (3.13 %)	18,706 (1.46 %)	21,193 (1.37 %)	n/a	41.85 (100.00 %)	39 (0.00 %)	25 (100.00 %)	4,237,791 (30.90 %)	792,897 (2.69 %)	13,417,195 (36.59 %)	67,132 (2.54 %)
249	European mole (hap1 2024) GCA_964194135.1	n/a	18,085 (1.69 %)	19,509 (1.58 %)	n/a	42.08 (99.99 %)	1,056 (0.01 %)	464 (100.00 %)	2,569,380 (23.32 %)	565,465 (2.18 %)	10,506,666 (33.68 %)	46,367 (3.09 %)
250	European mole (hap2 2024) GCA_964194205.1	n/a	18,064 (1.69 %)	19,764 (1.59 %)	n/a	42.07 (99.99 %)	1,040 (0.01 %)	1,396 (99.99 %)	2,567,492 (23.34 %)	570,250 (2.16 %)	10,485,959 (33.56 %)	46,213 (3.27 %)
251	European pine marten (primary hap 2023) GCA_963455335.1	n/a	18,336 (1.50 %)	20,807 (1.41 %)	n/a	42.38 (99.98 %)	2,250 (0.02 %)	477 (100.00 %)	4,096,160 (31.55 %)	707,337 (3.28 %)	13,715,382 (34.73 %)	61,481 (4.29 %)
252	European shrew (alternate hap 2023) GCA_027595995.1	n/a	17,506 (1.26 %)	25,527 (1.52 %)	n/a	43.20 (100.00 %)	n/a	5,699 (100.00 %)	2,400,784 (15.19 %)	1,062,793 (3.20 %)	13,284,496 (41.93 %)	77,009 (2.86 %)
253	European shrew (GB8-d 2012) GCF_000181275.1	23,525 (1.54 %)	17,290 (1.33 %)	22,005 (1.50 %)	n/a	42.90 (90.49 %)	188,953 (9.54 %)	201,798 (90.46 %)	4,400,127 (33.22 %)	946,629 (2.03 %)	13,377,581 (35.30 %)	77,851 (2.58 %)
254	European shrew (primary hap 2023) GCF_027595985.1	44,643 (2.60 %)	17,479 (1.26 %)	21,293 (1.37 %)	n/a	43.24 (99.46 %)	1,427 (0.54 %)	65 (100.00 %)	2,474,584 (15.18 %)	1,107,884 (3.28 %)	13,638,467 (41.72 %)	79,785 (2.86 %)
255	European snow vole (alternate hap 2023) GCA_950005115.1	n/a	18,364 (1.79 %)	20,379 (1.63 %)	n/a	42.19 (100.00 %)	1 (0.00 %)	4,256 (100.00 %)	3,049,618 (22.22 %)	852,708 (4.50 %)	10,501,392 (33.34 %)	17,629 (0.60 %)
256	European snow vole (primary hap 2023 refseq) GCF_950005125.1	47,025 (2.69 %)	19,592 (1.78 %)	21,173 (1.56 %)	n/a	41.98 (100.00 %)	197 (0.00 %)	160 (100.00 %)	5,048,186 (44.12 %)	998,537 (5.14 %)	12,204,053 (34.97 %)	20,725 (0.63 %)
257	European suslik (primary hap 2024) GCA_964194105.1	n/a	20,075 (1.28 %)	20,274 (1.19 %)	n/a	39.90 (99.99 %)	1,436 (0.01 %)	502 (100.00 %)	4,357,247 (31.78 %)	882,536 (12.27 %)	14,882,486 (41.66 %)	39,275 (0.88 %)
258	European woodmouse (2022 refseq) GCF_947179515.1	54,113 (2.24 %)	19,959 (1.65 %)	19,953 (1.25 %)	n/a	41.23 (99.99 %)	1,129 (0.01 %)	497 (100.00 %)	4,863,650 (37.41 %)	1,795,997 (8.95 %)	13,681,732 (40.58 %)	23,961 (0.53 %)
259	European woodmouse (alternate hap 2022) GCA_947179525.1	n/a	18,692 (1.72 %)	22,021 (1.36 %)	n/a	41.56 (100.00 %)	2 (0.00 %)	10,863 (100.00 %)	4,055,957 (36.08 %)	1,513,576 (9.53 %)	11,306,811 (39.67 %)	20,865 (0.55 %)
260	fallow deer (Ldn47 2023) GCF_033118175.1	57,013 (2.35 %)	20,187 (1.33 %)	23,290 (1.33 %)	n/a	42.38 (100.00 %)	44 (0.00 %)	284 (100.00 %)	3,308,241 (20.72 %)	513,748 (18.20 %)	12,996,819 (48.19 %)	214,480 (2.98 %)
261	fallow deer (maternal hap SK-2024 2025) GCA_048126745.1	n/a	20,072 (1.51 %)	22,668 (1.37 %)	n/a	41.80 (100.00 %)	147 (0.00 %)	1,369 (100.00 %)	4,623,335 (34.75 %)	475,143 (7.51 %)	13,000,703 (41.56 %)	112,581 (2.00 %)
262	fallow deer (paternal hap SK-2024 2025) GCA_048127045.1	n/a	18,238 (1.57 %)	20,307 (1.42 %)	n/a	41.46 (100.00 %)	242 (0.00 %)	388 (100.00 %)	4,244,450 (35.89 %)	405,446 (2.83 %)	12,211,643 (38.55 %)	52,418 (1.36 %)
263	false killer whale (hap1 2024 genbank) GCA_039906515.1	n/a	18,718 (1.50 %)	20,929 (1.32 %)	n/a	42.08 (99.90 %)	123 (0.10 %)	439 (100.00 %)	3,958,932 (35.76 %)	1,002,329 (11.61 %)	12,193,131 (41.85 %)	79,158 (3.74 %)
264	false killer whale (hap1 2024 refseq) GCF_039906515.1	75,958 (3.31 %)	18,718 (1.50 %)	20,982 (1.32 %)	n/a	42.08 (99.90 %)	123 (0.10 %)	438 (100.00 %)	3,958,926 (35.76 %)	1,002,329 (11.61 %)	12,193,061 (41.85 %)	79,158 (3.74 %)
265	false killer whale (hap2 2024) GCA_039906525.1	n/a	17,866 (1.45 %)	21,079 (1.46 %)	n/a	42.37 (99.08 %)	133 (0.92 %)	416 (100.00 %)	3,852,502 (34.98 %)	1,112,185 (16.42 %)	11,435,533 (44.17 %)	75,215 (4.36 %)
266	fat dormouse (US078 2019) GCA_004027185.1	n/a	23,122 (1.24 %)	48,677 (1.27 %)	n/a	42.33 (99.92 %)	10,685 (0.04 %)	444,115 (99.96 %)	6,783,404 (37.03 %)	1,642,515 (3.72 %)	12,706,289 (39.97 %)	65,521 (1.47 %)
267	fat sand rat (mPsaObe1 2021) GCF_907164565.1	43,224 (2.50 %)	18,543 (1.78 %)	20,094 (1.42 %)	n/a	41.95 (99.11 %)	50,482 (0.90 %)	11,389 (100.00 %)	4,686,377 (43.10 %)	920,563 (1.85 %)	12,813,848 (35.08 %)	22,480 (0.71 %)
268	fat sand rat (Psa_ob012049795 2017) GCA_002215935.1	n/a	21,644 (1.71 %)	31,665 (1.41 %)	n/a	41.99 (99.99 %)	n/a	96,427 (100.00 %)	4,646,110 (38.87 %)	946,664 (2.24 %)	13,134,526 (33.94 %)	26,411 (0.73 %)
269	fat-tailed dunnart (SCR6 2025) GCF_048593235.1	60,212 (2.43 %)	15,763 (0.77 %)	16,031 (0.89 %)	n/a	36.12 (99.99 %)	1,908 (0.01 %)	8 (100.00 %)	5,302,378 (24.47 %)	1,450,227 (3.79 %)	20,870,714 (44.26 %)	24,586 (0.65 %)
270	fat-tailed dunnart (SCR6 hap1 2025) GCA_048593235.1	n/a	15,762 (0.77 %)	16,035 (0.89 %)	n/a	36.12 (99.99 %)	1,908 (0.01 %)	1,915 (99.99 %)	5,302,372 (24.47 %)	1,450,220 (3.79 %)	20,870,654 (44.26 %)	24,585 (0.65 %)
271	fat-tailed dunnart (SCR6 hap2 2025) GCA_048593295.1	n/a	16,012 (0.77 %)	16,430 (0.90 %)	n/a	36.18 (99.99 %)	1,730 (0.01 %)	1,737 (99.99 %)	5,361,847 (24.48 %)	1,474,744 (3.79 %)	21,021,671 (44.20 %)	25,669 (0.69 %)
272	fin whale (hap1.1 2025) GCA_965194825.1	n/a	19,491 (1.21 %)	22,538 (1.06 %)	n/a	42.19 (99.99 %)	1,516 (0.01 %)	2,612 (100.00 %)	4,598,236 (35.34 %)	1,716,315 (24.14 %)	12,260,919 (52.40 %)	82,683 (1.47 %)
273	fin whale (hap2.1 2025) GCA_965194765.1	n/a	18,684 (1.40 %)	21,322 (1.20 %)	n/a	41.87 (99.99 %)	1,258 (0.01 %)	3,706 (99.99 %)	4,103,716 (36.69 %)	1,030,821 (16.12 %)	11,633,934 (45.82 %)	74,782 (1.60 %)
274	fishing cat (Anna 2022 U Missouri) GCF_022837055.1	68,085 (2.86 %)	18,432 (1.63 %)	19,912 (1.37 %)	n/a	41.91 (100.00 %)	63 (0.00 %)	192 (100.00 %)	4,777,906 (34.85 %)	937,432 (2.30 %)	13,438,032 (34.55 %)	70,402 (2.61 %)
275	Florida manatee (CSIC 2023) GCA_030013775.1	n/a	19,432 (1.24 %)	24,035 (1.14 %)	n/a	40.66 (100.00 %)	33 (0.00 %)	15,641 (100.00 %)	4,400,331 (33.07 %)	439,615 (1.04 %)	14,884,753 (46.98 %)	32,563 (0.80 %)
276	Florida manatee (Lorelei 2012 refseq) GCF_000243295.1	39,664 (2.08 %)	18,308 (1.37 %)	20,588 (1.23 %)	32,868 (1.38 %)	40.73 (89.24 %)	160,167 (10.78 %)	166,490 (89.22 %)	n/a	389,315 (0.74 %)	14,633,038 (38.46 %)	27,462 (0.64 %)
277	fossa GCA_004023885.1	n/a	21,156 (1.56 %)	29,809 (1.38 %)	n/a	41.51 (99.94 %)	6,335 (0.03 %)	470,371 (99.97 %)	4,962,168 (42.36 %)	814,639 (1.52 %)	13,708,904 (34.14 %)	78,033 (2.52 %)
278	Gambian giant pouched rat GCA_004027575.1	n/a	21,189 (1.59 %)	32,806 (1.43 %)	n/a	42.11 (99.88 %)	7,473 (0.03 %)	1,110,425 (99.97 %)	4,137,605 (24.57 %)	1,071,627 (2.76 %)	12,905,250 (32.78 %)	32,359 (0.80 %)
279	gaur (Gaur_Henry_Doorly_Zoo_5443 2020) GCA_014182915.2	n/a	19,130 (1.53 %)	21,239 (1.30 %)	n/a	41.83 (99.99 %)	2,194 (0.01 %)	635 (100.00 %)	6,520,228 (50.46 %)	466,916 (1.41 %)	13,425,286 (41.25 %)	41,833 (1.15 %)
280	gayal (CVASU_BF_001 2021) GCA_017311355.1	n/a	24,549 (1.09 %)	55,194 (1.15 %)	n/a	42.05 (99.91 %)	n/a	1,262,134 (100.00 %)	3,691,398 (22.78 %)	677,397 (2.00 %)	14,380,670 (42.36 %)	75,114 (1.33 %)
281	gayal (Nagaland 2019) GCA_007844835.1	n/a	22,715 (1.55 %)	23,635 (1.33 %)	n/a	41.67 (96.51 %)	301,761 (3.52 %)	306,776 (96.48 %)	6,243,468 (45.69 %)	518,664 (1.99 %)	15,147,647 (37.64 %)	45,586 (0.89 %)
282	Geoffroy's bat (hap1.1 2025) GCA_965115925.1	n/a	19,320 (1.74 %)	21,940 (1.65 %)	n/a	42.55 (99.99 %)	1,540 (0.01 %)	404 (100.00 %)	3,707,500 (37.60 %)	733,107 (7.78 %)	10,515,474 (39.35 %)	60,200 (2.41 %)
283	Geoffroy's bat (hap2.1 2025) GCA_965115945.1	n/a	18,718 (1.71 %)	20,961 (1.62 %)	n/a	42.29 (99.98 %)	1,597 (0.02 %)	2,101 (99.98 %)	3,662,405 (37.72 %)	717,069 (7.80 %)	10,298,372 (39.22 %)	56,300 (2.26 %)
284	Geoffroy's cat GCF_018350155.1	85,344 (3.53 %)	18,469 (1.66 %)	19,516 (1.36 %)	93,795 (4.83 %)	41.75 (100.00 %)	45 (0.00 %)	82 (100.00 %)	5,021,854 (43.23 %)	930,175 (1.84 %)	13,757,469 (34.29 %)	65,918 (2.36 %)
285	giant anteater GCA_004026745.1	n/a	24,383 (0.91 %)	44,315 (0.93 %)	n/a	39.53 (99.88 %)	8,283 (0.02 %)	1,629,691 (99.98 %)	5,333,757 (35.57 %)	575,140 (0.91 %)	21,181,213 (39.97 %)	57,558 (0.94 %)
286	giant otter GCA_004024605.1	n/a	21,199 (1.46 %)	30,565 (1.34 %)	n/a	41.71 (99.93 %)	7,431 (0.03 %)	652,159 (99.97 %)	5,113,769 (41.55 %)	788,677 (1.46 %)	14,385,279 (35.77 %)	82,376 (2.05 %)
287	giant panda (Jingjing v3 2020) GCF_002007445.2	65,481 (3.27 %)	19,077 (1.67 %)	20,176 (1.39 %)	n/a	41.68 (98.09 %)	189,277 (1.92 %)	73,514 (100.00 %)	4,012,144 (34.40 %)	617,803 (1.99 %)	14,216,587 (30.41 %)	59,449 (1.50 %)
288	goat (v2 San Clemente 2016 USDA) GCF_001704415.2	47,172 (2.31 %)	19,342 (1.38 %)	22,346 (1.24 %)	n/a	43.16 (100.00 %)	790 (0.00 %)	29,886 (100.00 %)	3,502,527 (22.45 %)	760,831 (7.07 %)	13,024,178 (44.85 %)	125,662 (4.00 %)
289	Gobi jerboa GCA_004027895.1	n/a	22,410 (0.91 %)	45,268 (1.02 %)	n/a	41.94 (99.88 %)	10,987 (0.04 %)	1,295,369 (99.96 %)	8,828,417 (40.19 %)	1,979,806 (6.43 %)	14,759,732 (47.73 %)	24,314 (0.52 %)
290	golden hamster (Baylor 2021) GCF_017639785.1	67,831 (3.37 %)	19,354 (1.71 %)	19,863 (1.47 %)	69,903 (4.39 %)	42.04 (96.99 %)	711 (3.01 %)	7,058 (96.99 %)	3,981,818 (27.65 %)	976,456 (3.46 %)	12,580,903 (32.87 %)	21,268 (0.61 %)
291	golden hamster (Broad 2013 refseq) GCF_000349665.1	42,636 (2.91 %)	18,976 (1.82 %)	19,149 (1.51 %)	29,936 (1.96 %)	42.01 (82.92 %)	216,216 (17.12 %)	237,700 (82.88 %)	3,599,795 (26.09 %)	790,256 (1.69 %)	12,003,956 (24.29 %)	18,591 (0.51 %)
292	golden jackal (CA01 2025) GCF_053574225.1	115,457 (4.37 %)	19,332 (1.58 %)	21,009 (1.39 %)	n/a	41.58 (100.00 %)	59 (0.00 %)	306 (100.00 %)	6,089,485 (46.31 %)	1,184,044 (5.44 %)	13,574,928 (35.96 %)	54,314 (2.19 %)
293	golden spiny mouse (2020) GCF_903995435.1	36,997 (1.96 %)	20,006 (1.91 %)	19,132 (1.50 %)	n/a	42.51 (99.65 %)	880 (0.35 %)	623 (100.00 %)	4,785,907 (32.61 %)	1,305,613 (3.34 %)	12,958,061 (32.33 %)	20,760 (0.59 %)
294	golden-mantled ground squirrel (hap1 2025 genbank) GCA_048772815.1	n/a	20,967 (0.89 %)	24,137 (0.94 %)	n/a	39.52 (99.99 %)	1,448 (0.01 %)	8,087 (100.00 %)	5,547,018 (29.30 %)	1,312,047 (10.07 %)	15,174,898 (52.73 %)	40,182 (0.59 %)
295	golden-mantled ground squirrel (hap1 2025 refseq) GCF_048772815.1	49,173 (1.30 %)	19,845 (0.90 %)	24,244 (0.94 %)	n/a	39.52 (99.99 %)	1,448 (0.01 %)	8,088 (100.00 %)	8,197,827 (62.01 %)	1,312,047 (10.07 %)	15,174,958 (52.73 %)	40,182 (0.59 %)
296	golden-mantled ground squirrel (hap2 2025 genbank) GCA_048772825.1	n/a	19,719 (1.16 %)	22,611 (1.21 %)	n/a	39.48 (100.00 %)	643 (0.00 %)	2,820 (100.00 %)	4,725,546 (31.70 %)	997,950 (3.53 %)	14,753,550 (39.53 %)	33,465 (0.69 %)
297	golden-mantled ground squirrel (hap2 2025 refseq) GCF_048772825.1	46,395 (1.71 %)	18,853 (1.19 %)	22,613 (1.21 %)	n/a	39.48 (100.00 %)	643 (0.00 %)	2,821 (100.00 %)	6,984,115 (50.68 %)	997,950 (3.53 %)	14,753,604 (39.53 %)	33,465 (0.69 %)
298	gracile shrew mole GCA_004024945.1	n/a	19,165 (1.25 %)	43,816 (1.48 %)	n/a	41.08 (99.89 %)	8,248 (0.04 %)	732,083 (99.96 %)	2,957,465 (23.76 %)	783,289 (2.60 %)	11,503,344 (31.38 %)	92,729 (3.60 %)
299	gray fox (Vermont ataVT051 2023) GCA_032313775.1	n/a	19,352 (1.42 %)	20,724 (1.33 %)	n/a	42.10 (100.00 %)	26 (0.00 %)	898 (100.00 %)	4,418,039 (36.90 %)	1,050,244 (11.63 %)	13,240,305 (39.50 %)	89,246 (2.69 %)
300	gray seal (241Hg 2020) GCF_012393455.1	79,009 (3.73 %)	19,882 (1.73 %)	22,416 (1.46 %)	n/a	41.44 (100.00 %)	117 (0.00 %)	6,880 (100.00 %)	4,448,588 (43.28 %)	557,710 (1.32 %)	13,340,576 (33.41 %)	55,637 (1.78 %)
301	gray seal (hap1.1 2025) GCA_964656455.1	n/a	19,291 (1.73 %)	20,301 (1.41 %)	n/a	41.56 (99.99 %)	1,130 (0.01 %)	171 (100.00 %)	4,245,582 (34.81 %)	600,624 (2.16 %)	13,240,803 (34.28 %)	56,932 (1.78 %)
302	gray seal (hap2.1 2025) GCA_964656465.1	n/a	19,222 (1.73 %)	20,205 (1.41 %)	n/a	41.54 (99.99 %)	1,110 (0.01 %)	1,233 (99.99 %)	4,236,942 (34.95 %)	601,409 (1.99 %)	13,226,667 (34.03 %)	57,067 (1.82 %)
303	gray seal (mHalGry1.hap1.1 2025) GCF_964656455.1	70,736 (3.27 %)	18,889 (1.71 %)	20,343 (1.40 %)	n/a	41.56 (99.99 %)	1,130 (0.01 %)	1,300 (99.99 %)	5,332,627 (44.68 %)	600,622 (2.16 %)	13,240,769 (34.28 %)	56,931 (1.78 %)
304	gray short-tailed opossum (mMonDom1 alternate hap 2023) GCA_027917375.1	n/a	12,662 (0.70 %)	15,124 (0.89 %)	n/a	37.74 (100.00 %)	24 (0.00 %)	8,086 (100.00 %)	4,098,004 (25.33 %)	806,470 (2.98 %)	16,244,072 (43.39 %)	24,879 (0.67 %)
305	gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 refseq) GCF_027887165.1	73,383 (3.04 %)	16,637 (0.72 %)	16,036 (0.85 %)	n/a	37.92 (99.11 %)	2,255 (0.89 %)	13 (100.00 %)	5,562,359 (25.40 %)	1,096,620 (2.60 %)	22,322,748 (43.37 %)	28,894 (0.57 %)
306	gray short-tailed opossum (MonDom5 2007) GCF_000002295.2	68,388 (2.34 %)	16,663 (0.75 %)	16,162 (0.84 %)	n/a	37.82 (97.26 %)	67,660 (2.75 %)	72,674 (97.25 %)	7,753,175 (55.85 %)	1,051,473 (2.34 %)	22,274,001 (42.23 %)	30,883 (0.53 %)
307	gray squirrel (2020) GCF_902686445.1	59,073 (2.48 %)	20,752 (1.49 %)	21,107 (1.31 %)	32,732 (1.45 %)	40.06 (99.98 %)	1,824 (0.02 %)	752 (100.00 %)	4,605,578 (34.50 %)	728,192 (1.65 %)	15,467,412 (33.91 %)	51,878 (1.11 %)
308	gray squirrel (alternate hap 2019) GCA_902685475.1	n/a	17,156 (1.53 %)	18,190 (1.33 %)	n/a	40.25 (100.00 %)	2 (0.00 %)	9,510 (100.00 %)	3,455,580 (34.94 %)	530,053 (1.56 %)	10,927,458 (32.64 %)	38,976 (1.13 %)
309	gray wolf (2021) GCA_905319855.2	n/a	19,474 (1.55 %)	20,394 (1.40 %)	72,806 (4.12 %)	41.49 (100.00 %)	166 (0.00 %)	82 (100.00 %)	4,550,524 (31.76 %)	1,063,944 (3.96 %)	13,588,117 (34.74 %)	51,996 (2.15 %)
310	gray wolf (alternate hap 2021) GCA_905319845.1	n/a	12,760 (1.57 %)	14,423 (1.42 %)	n/a	41.35 (100.00 %)	1 (0.00 %)	5,537 (100.00 %)	2,725,227 (31.66 %)	616,862 (3.40 %)	8,041,744 (32.68 %)	32,293 (2.35 %)
311	great fruit-eating bat (hap1 2024) GCA_038363145.1	n/a	18,022 (1.56 %)	19,824 (1.51 %)	n/a	42.28 (100.00 %)	81 (0.00 %)	419 (100.00 %)	2,827,417 (26.82 %)	371,479 (4.97 %)	11,603,093 (34.64 %)	71,574 (2.28 %)
312	great fruit-eating bat (mArtLit1hap2 2024) GCA_038363175.2	n/a	16,978 (1.61 %)	18,544 (1.54 %)	n/a	42.42 (100.00 %)	54 (0.00 %)	312 (100.00 %)	2,601,985 (26.67 %)	331,187 (4.87 %)	10,884,729 (33.93 %)	63,610 (2.71 %)
313	great fruit-eating bat (v2 hap1 2024) GCA_038363095.2	n/a	18,051 (1.56 %)	19,955 (1.51 %)	n/a	42.45 (100.00 %)	45 (0.00 %)	487 (100.00 %)	2,841,143 (26.67 %)	379,430 (5.52 %)	11,651,542 (35.11 %)	72,337 (2.76 %)
314	great roundleaf bat (v2 ML-2016 2016) GCF_001890085.2	50,908 (3.26 %)	18,993 (2.01 %)	19,633 (1.65 %)	41,769 (2.41 %)	41.11 (87.42 %)	172,750 (12.60 %)	7,387 (100.00 %)	2,946,981 (30.72 %)	495,272 (1.05 %)	11,587,728 (25.43 %)	32,949 (0.96 %)
315	greater bulldog bat GCA_004026585.1	n/a	20,774 (1.62 %)	28,140 (1.63 %)	n/a	40.92 (99.94 %)	6,171 (0.03 %)	304,393 (99.97 %)	3,288,598 (29.60 %)	478,424 (1.16 %)	11,427,553 (35.29 %)	44,124 (1.99 %)
316	Greater cane rat GCA_004025085.1	n/a	20,383 (0.98 %)	47,456 (1.25 %)	n/a	42.85 (99.83 %)	8,825 (0.03 %)	1,898,466 (99.97 %)	5,569,185 (30.19 %)	946,696 (3.12 %)	13,144,109 (41.83 %)	97,686 (2.61 %)
317	greater horseshoe bat (MPI-CBG alternate hap 2019) GCA_004115295.1	n/a	14,896 (1.85 %)	18,939 (1.59 %)	n/a	40.69 (100.00 %)	2 (0.00 %)	13,426 (100.00 %)	2,426,330 (34.43 %)	418,341 (1.36 %)	8,763,234 (27.86 %)	24,370 (1.08 %)
318	greater horseshoe bat (v2 MPI-CBG 2019) GCF_004115265.2	53,353 (3.13 %)	18,641 (1.97 %)	20,359 (1.68 %)	n/a	40.54 (99.64 %)	158 (0.36 %)	134 (100.00 %)	3,218,744 (34.52 %)	564,789 (1.35 %)	12,217,020 (29.39 %)	32,445 (1.06 %)
319	greater mouse-eared bat (2020 Bat1K) GCF_014108235.1	70,930 (3.43 %)	19,052 (1.84 %)	21,498 (1.73 %)	n/a	43.11 (98.55 %)	538 (1.45 %)	93 (100.00 %)	3,088,083 (26.27 %)	753,124 (2.84 %)	10,383,466 (35.84 %)	61,023 (2.69 %)
320	greater mouse-tailed bat (20210906_DDa primary hap 2024) GCA_043880545.1	n/a	18,582 (1.55 %)	20,954 (1.35 %)	n/a	42.46 (100.00 %)	152 (0.00 %)	106 (100.00 %)	4,158,629 (40.30 %)	696,150 (4.67 %)	12,702,667 (41.11 %)	257,446 (3.38 %)
321	greater sac-winged bat (primary hap 2024 refseq) GCF_036850765.1	55,259 (2.53 %)	18,321 (1.40 %)	21,048 (1.35 %)	n/a	41.71 (98.73 %)	468 (1.27 %)	256 (100.00 %)	4,247,145 (29.53 %)	1,031,385 (2.50 %)	12,465,157 (43.30 %)	101,620 (2.01 %)
322	greater spear-nosed bat (2021 Texas Tech U) GCF_019186645.2	50,563 (2.96 %)	18,224 (1.70 %)	20,689 (1.67 %)	n/a	42.27 (100.00 %)	55 (0.00 %)	534 (100.00 %)	2,961,591 (0.00 %)	387,908 (0.97 %)	12,179,612 (30.91 %)	62,189 (5.35 %)
323	grey whale GCA_004363415.1	n/a	21,827 (1.52 %)	32,191 (1.24 %)	n/a	41.22 (99.88 %)	10,622 (0.04 %)	1,046,770 (99.96 %)	4,841,166 (45.56 %)	780,015 (1.83 %)	13,559,563 (39.86 %)	72,343 (1.59 %)
324	grey whale (mEscRob2 alternate hap 2023) GCA_028021475.1	n/a	19,129 (1.37 %)	24,628 (1.24 %)	n/a	41.83 (100.00 %)	n/a	14,442 (100.00 %)	3,892,130 (35.74 %)	874,864 (15.70 %)	11,484,916 (45.69 %)	73,507 (1.72 %)
325	grey whale (primary hap 2023 genbank) GCA_028021215.1	n/a	19,288 (1.38 %)	21,791 (1.21 %)	n/a	41.74 (100.00 %)	279 (0.00 %)	704 (100.00 %)	4,116,900 (35.85 %)	966,065 (16.74 %)	12,154,173 (46.39 %)	77,011 (1.59 %)
326	grey whale (primary hap 2023 refseq) GCF_028021215.1	49,276 (1.90 %)	19,295 (1.38 %)	21,790 (1.21 %)	n/a	41.74 (100.00 %)	279 (0.00 %)	703 (100.00 %)	4,116,894 (35.85 %)	966,064 (16.74 %)	12,154,101 (46.39 %)	77,011 (1.59 %)
327	hairy big-eared bat (US037 2019 Broad) GCA_004026765.1	n/a	21,360 (1.44 %)	37,376 (1.52 %)	n/a	42.38 (99.94 %)	3,218 (0.01 %)	553,308 (99.99 %)	3,519,246 (30.77 %)	393,318 (0.85 %)	12,525,258 (34.42 %)	84,875 (2.37 %)
328	Hanaki's dwarf bat (2024) GCA_964339955.1	n/a	17,856 (1.76 %)	20,604 (1.75 %)	n/a	42.55 (100.00 %)	306 (0.00 %)	141 (100.00 %)	3,697,250 (33.21 %)	842,827 (8.27 %)	10,094,062 (38.40 %)	61,715 (2.96 %)
329	harbor porpoise (primary hap 2024 genbank) GCA_963924675.1	n/a	18,529 (1.58 %)	20,583 (1.34 %)	n/a	41.72 (99.99 %)	966 (0.01 %)	442 (100.00 %)	3,760,716 (36.18 %)	888,368 (7.18 %)	12,379,240 (39.04 %)	71,530 (2.69 %)
330	harbor porpoise (primary hap 2024 refseq) GCF_963924675.1	33,578 (1.54 %)	18,528 (1.58 %)	20,582 (1.34 %)	n/a	41.72 (99.99 %)	966 (0.01 %)	1,405 (99.99 %)	3,760,713 (36.18 %)	888,368 (7.18 %)	12,379,181 (39.04 %)	71,530 (2.69 %)
331	harbor seal GCF_004348235.1	50,657 (2.98 %)	19,484 (1.76 %)	20,771 (1.44 %)	33,296 (1.58 %)	41.38 (99.09 %)	16,480 (0.91 %)	21,161 (99.09 %)	4,526,182 (43.28 %)	576,921 (1.11 %)	13,421,780 (33.06 %)	54,592 (1.70 %)
332	Hawaiian monk seal (2021 Johns Hopkins U) GCF_002201575.2	37,605 (1.99 %)	19,483 (1.73 %)	19,767 (1.35 %)	n/a	41.41 (98.23 %)	25,763 (1.77 %)	7,487 (100.00 %)	4,575,217 (43.59 %)	583,394 (1.11 %)	13,374,131 (33.69 %)	52,067 (1.50 %)
333	hazel dormouse GCA_004027005.1	n/a	21,556 (1.24 %)	40,971 (1.33 %)	n/a	41.60 (99.91 %)	15,076 (0.06 %)	481,881 (99.94 %)	6,679,641 (33.98 %)	1,653,419 (3.72 %)	12,685,676 (43.98 %)	71,478 (1.57 %)
334	hazel dormouse (alternate hap 2023) GCA_963383665.1	n/a	11,130 (1.23 %)	22,071 (1.36 %)	n/a	42.15 (99.99 %)	n/a	31,856 (100.00 %)	2,958,239 (41.25 %)	788,242 (4.52 %)	6,056,268 (41.88 %)	36,143 (1.96 %)
335	hazel dormouse (primary hap 2023) GCA_963383645.1	n/a	18,620 (1.42 %)	22,403 (1.38 %)	n/a	41.73 (99.99 %)	1,805 (0.01 %)	214 (100.00 %)	6,063,911 (41.66 %)	1,593,657 (4.46 %)	12,229,281 (43.98 %)	71,058 (1.88 %)
336	hippopotamus (BS01 2019 Broad) GCA_004027065.1	n/a	24,267 (1.55 %)	34,820 (1.30 %)	n/a	41.43 (99.91 %)	4,730 (0.02 %)	972,599 (99.98 %)	4,579,311 (41.26 %)	606,731 (1.02 %)	14,514,493 (36.58 %)	54,753 (1.59 %)
337	hippopotamus (HIP001 2018) GCA_002995585.1	n/a	22,343 (1.70 %)	31,687 (1.45 %)	n/a	40.96 (94.63 %)	153,125 (5.38 %)	281,897 (94.62 %)	3,952,905 (38.55 %)	476,243 (1.97 %)	14,216,817 (27.43 %)	48,380 (1.43 %)
338	hippopotamus (mHipAmp2 hap1 2023) GCA_030028035.1	n/a	20,391 (1.63 %)	20,668 (1.37 %)	n/a	41.62 (100.00 %)	83 (0.00 %)	545 (100.00 %)	3,778,764 (35.17 %)	563,345 (3.63 %)	13,524,869 (35.56 %)	48,164 (1.90 %)
339	hippopotamus (v2 hap2 2023 refseq) GCF_030028045.1	64,153 (2.73 %)	20,331 (1.62 %)	20,633 (1.37 %)	n/a	41.60 (100.00 %)	226 (0.00 %)	357 (100.00 %)	3,783,440 (35.17 %)	567,797 (3.38 %)	13,462,531 (35.48 %)	48,365 (1.91 %)
340	hirola (BS46 2019 Broad) GCA_004027495.1	n/a	22,264 (1.40 %)	36,984 (1.26 %)	n/a	42.31 (99.93 %)	9,287 (0.03 %)	545,176 (99.97 %)	5,809,405 (48.62 %)	465,001 (1.08 %)	13,326,245 (42.35 %)	48,312 (1.15 %)
341	Hispaniolan solenodon GCA_004363575.1	n/a	18,805 (1.55 %)	27,454 (1.64 %)	n/a	39.98 (99.96 %)	5,186 (0.02 %)	181,804 (99.98 %)	2,669,787 (26.78 %)	431,610 (1.04 %)	13,429,711 (27.35 %)	53,444 (2.30 %)
342	hispid cotton rat GCA_004025045.1	n/a	25,324 (1.49 %)	31,681 (1.31 %)	39,953 (1.43 %)	39.77 (99.89 %)	13,744 (0.05 %)	897,290 (99.95 %)	4,384,099 (28.17 %)	1,132,313 (3.34 %)	14,729,737 (38.08 %)	17,558 (0.40 %)
343	Hoffmann's two-fingered sloth GCA_000164785.2	n/a	24,546 (1.30 %)	30,273 (1.15 %)	n/a	39.80 (98.09 %)	101,085 (1.91 %)	370,035 (98.09 %)	5,145,551 (52.20 %)	614,819 (1.62 %)	17,932,269 (39.26 %)	55,943 (1.04 %)
344	hog-nosed bat GCA_004027555.1	n/a	20,591 (1.30 %)	39,589 (1.39 %)	n/a	40.99 (99.88 %)	6,224 (0.03 %)	1,230,480 (99.97 %)	4,081,924 (31.12 %)	1,008,077 (2.20 %)	12,068,828 (39.98 %)	55,567 (2.02 %)
345	Honduran yellow-shouldered bat (v2.1 Veracruz 20B 2020) GCF_014824575.3	49,071 (2.78 %)	17,588 (1.64 %)	19,357 (1.60 %)	n/a	42.32 (99.79 %)	38,648 (0.21 %)	25,848 (100.00 %)	2,708,400 (27.89 %)	366,870 (1.48 %)	11,795,308 (31.27 %)	59,066 (1.72 %)
346	horse (maternal 2024) GCA_036418255.1	n/a	16,789 (1.65 %)	18,017 (1.36 %)	n/a	42.07 (100.00 %)	210 (0.00 %)	821 (100.00 %)	3,146,381 (34.68 %)	430,664 (5.91 %)	13,246,059 (32.62 %)	37,293 (2.80 %)
347	horse (paternal hap 2024) GCA_036426135.1	n/a	19,073 (1.67 %)	20,636 (1.38 %)	n/a	42.08 (100.00 %)	114 (0.00 %)	602 (100.00 %)	3,521,953 (35.39 %)	461,571 (5.26 %)	14,833,688 (32.77 %)	43,527 (2.54 %)
348	horse (thoroughbred H_3958 2024) GCF_041296265.1	124,629 (3.91 %)	18,742 (1.47 %)	21,901 (1.39 %)	n/a	42.90 (99.96 %)	5 (0.04 %)	625 (100.00 %)	3,600,073 (33.96 %)	709,759 (8.89 %)	14,396,691 (35.72 %)	48,802 (5.67 %)
349	horse (Twilight 2018) GCF_002863925.1	76,388 (4.03 %)	18,997 (1.73 %)	20,914 (1.42 %)	113,346 (6.08 %)	41.50 (99.62 %)	6,294 (0.38 %)	4,701 (100.00 %)	4,080,319 (44.85 %)	395,037 (1.44 %)	15,169,517 (29.93 %)	44,825 (1.77 %)
350	house mouse (129S1_SvImJv1 2016) GCA_001624185.1	n/a	21,289 (2.22 %)	18,626 (1.42 %)	102,148 (4.16 %)	41.77 (85.00 %)	366,945 (15.05 %)	62,882 (95.15 %)	5,075,137 (40.38 %)	1,400,072 (2.80 %)	13,497,076 (26.20 %)	16,957 (0.40 %)
351	house mouse (129S1_SvImJ_v3 2022) GCA_921998555.2	n/a	21,780 (2.13 %)	19,436 (1.37 %)	110,376 (4.47 %)	41.79 (99.60 %)	1,557 (0.40 %)	188 (100.00 %)	4,653,663 (40.74 %)	1,550,342 (3.54 %)	12,930,784 (35.48 %)	23,211 (0.57 %)
352	house mouse (AKR_J v3 2022) GCA_922000895.2	n/a	21,721 (2.13 %)	19,324 (1.37 %)	110,654 (4.48 %)	41.80 (99.85 %)	2,714 (0.15 %)	201 (100.00 %)	4,645,513 (40.70 %)	1,547,237 (3.56 %)	13,016,932 (35.69 %)	23,309 (0.57 %)
353	house mouse (alternate hap 2023) GCA_949316305.1	n/a	661 (0.88 %)	720 (0.54 %)	n/a	38.59 (100.00 %)	n/a	1,806 (100.00 %)	97,279 (72.21 %)	40,071 (55.89 %)	208,928 (64.94 %)	506 (0.31 %)
354	house mouse (A_J v3 2022) GCA_921998355.2	n/a	21,869 (2.13 %)	19,400 (1.37 %)	110,389 (4.48 %)	41.80 (99.39 %)	608 (0.61 %)	163 (100.00 %)	4,668,553 (40.80 %)	1,556,835 (3.58 %)	12,995,938 (35.53 %)	23,203 (0.56 %)
355	house mouse (BALB_cJ v3 2022) GCA_921997145.2	n/a	21,891 (2.13 %)	19,499 (1.37 %)	110,461 (4.47 %)	41.79 (99.80 %)	274 (0.20 %)	217 (100.00 %)	4,673,990 (40.79 %)	1,560,327 (3.63 %)	13,018,071 (35.70 %)	23,196 (0.56 %)
356	house mouse (C3H_HeJ v3 2022) GCA_921997125.2	n/a	21,793 (2.13 %)	19,516 (1.38 %)	110,049 (4.46 %)	41.79 (99.05 %)	844 (0.95 %)	174 (100.00 %)	4,657,005 (40.76 %)	1,551,107 (3.53 %)	12,949,100 (35.32 %)	23,262 (0.56 %)
357	house mouse (C57BL/6J 2012) GCA_000185105.2	n/a	21,313 (2.28 %)	19,336 (1.53 %)	n/a	41.71 (91.01 %)	189,267 (9.02 %)	191,581 (90.98 %)	4,937,032 (40.05 %)	1,409,489 (2.64 %)	13,090,524 (27.69 %)	16,523 (0.40 %)
358	house mouse (C57BL_6J T2T 2024) GCA_964188535.1	n/a	21,496 (1.92 %)	19,278 (1.25 %)	n/a	41.31 (99.85 %)	108 (0.15 %)	345 (99.85 %)	4,519,975 (46.81 %)	1,564,206 (14.33 %)	12,267,542 (42.16 %)	23,119 (0.55 %)
359	house mouse (CBA_J v3 2022) GCA_921998905.2	n/a	21,829 (2.13 %)	19,841 (1.39 %)	110,858 (4.48 %)	41.79 (99.52 %)	658 (0.48 %)	145 (100.00 %)	4,658,032 (40.77 %)	1,552,298 (3.59 %)	12,948,038 (35.52 %)	23,232 (0.56 %)
360	house mouse (DBA_2J v3 2022) GCA_921998315.2	n/a	22,302 (2.08 %)	19,749 (1.35 %)	113,269 (4.42 %)	41.72 (100.00 %)	153 (0.00 %)	361 (100.00 %)	4,785,676 (41.69 %)	1,597,598 (4.56 %)	13,190,158 (36.58 %)	24,140 (0.59 %)
361	house mouse (FVB_NJ v3 2022) GCA_921998635.2	n/a	21,633 (2.15 %)	19,565 (1.40 %)	110,246 (4.50 %)	41.82 (98.35 %)	6,244 (1.65 %)	384 (100.00 %)	4,621,601 (40.42 %)	1,537,622 (3.48 %)	12,818,729 (34.77 %)	22,696 (0.55 %)
362	house mouse (LP_J v3 2022) GCA_947599735.1	n/a	22,452 (1.91 %)	19,841 (1.23 %)	110,073 (3.98 %)	41.29 (99.99 %)	386 (0.01 %)	515 (100.00 %)	4,839,574 (46.33 %)	1,645,163 (11.88 %)	12,936,515 (41.49 %)	24,374 (0.54 %)
363	house mouse (NOD_ShiLtJ v3 2022) GCA_921998325.2	n/a	21,797 (2.13 %)	19,521 (1.38 %)	109,890 (4.48 %)	41.80 (99.50 %)	1,462 (0.50 %)	170 (100.00 %)	4,650,016 (40.74 %)	1,547,220 (3.54 %)	12,918,125 (35.45 %)	23,253 (0.56 %)
364	house mouse (NZO_HlLtJ v3 2022) GCA_947593165.1	n/a	22,481 (1.93 %)	19,932 (1.26 %)	109,670 (4.03 %)	41.34 (100.00 %)	234 (0.00 %)	441 (100.00 %)	4,822,230 (45.92 %)	1,637,027 (11.19 %)	13,082,730 (41.04 %)	24,187 (0.54 %)
365	house mouse (primary hap 2023) GCA_949316315.1	n/a	22,351 (1.96 %)	19,629 (1.26 %)	n/a	41.38 (100.00 %)	101 (0.00 %)	179 (100.00 %)	4,774,018 (45.31 %)	1,620,102 (10.50 %)	13,181,250 (40.47 %)	23,955 (0.54 %)
366	house mouse C57BL/6J 2020 GRC GCF_000001635.27	136,224 (4.84 %)	22,409 (2.02 %)	19,480 (1.31 %)	140,725 (4.83 %)	41.67 (97.30 %)	334 (2.70 %)	22,273 (97.30 %)	5,361,085 (45.51 %)	1,641,063 (3.41 %)	12,722,791 (36.04 %)	23,794 (0.53 %)
367	house mouse C57BL_6NJ (2016) GCA_001632555.1	n/a	21,177 (2.23 %)	18,495 (1.42 %)	103,002 (4.20 %)	41.76 (82.53 %)	410,660 (17.53 %)	49,821 (96.37 %)	5,081,049 (40.22 %)	1,392,942 (2.58 %)	13,476,268 (25.21 %)	16,877 (0.39 %)
368	house mouse C57BL_6NJ (2022) GCA_921999865.2	n/a	21,817 (2.13 %)	19,349 (1.37 %)	n/a	41.79 (99.76 %)	1,127 (0.24 %)	214 (100.00 %)	4,661,104 (40.76 %)	1,552,079 (3.56 %)	12,953,662 (35.57 %)	23,204 (0.56 %)
369	humpback whale (KW2013002 2024) GCA_041834305.1	n/a	19,463 (1.32 %)	22,424 (1.19 %)	n/a	42.05 (100.00 %)	88 (0.00 %)	1,355 (100.00 %)	4,164,459 (34.02 %)	1,281,751 (18.33 %)	12,412,281 (48.28 %)	82,412 (1.67 %)
370	Iberian mole (v2.1 TD23 2020) GCF_014898055.3	56,986 (3.41 %)	18,431 (1.69 %)	20,317 (1.59 %)	n/a	41.89 (99.89 %)	3,575 (0.11 %)	3,202 (100.00 %)	2,635,974 (23.38 %)	496,514 (1.29 %)	10,969,546 (32.61 %)	47,466 (2.89 %)
371	Indian false vampire GCA_004026885.1	n/a	20,067 (1.37 %)	36,544 (1.53 %)	32,548 (1.37 %)	40.84 (99.83 %)	6,266 (0.02 %)	1,909,067 (99.98 %)	4,096,409 (31.50 %)	699,311 (1.81 %)	12,307,198 (39.96 %)	92,830 (3.12 %)
372	Indian flying fox GCF_902729225.1	64,763 (3.85 %)	18,222 (2.01 %)	23,187 (1.82 %)	45,389 (2.18 %)	39.83 (99.10 %)	17,500 (0.90 %)	16,113 (100.00 %)	2,972,300 (34.11 %)	487,157 (1.49 %)	12,486,528 (27.37 %)	57,869 (3.73 %)
373	Indian short-nosed fruit bat (CYSPWHU 2023) GCA_030015415.1	n/a	17,560 (2.04 %)	21,687 (1.83 %)	n/a	39.77 (100.00 %)	26 (0.00 %)	181 (100.00 %)	2,598,385 (30.48 %)	486,921 (1.41 %)	11,828,726 (27.28 %)	37,476 (5.58 %)
374	Indochinese shrew (US011 2019 Broad) GCA_004027635.1	n/a	18,870 (0.51 %)	55,636 (0.81 %)	n/a	39.81 (99.83 %)	5,267 (0.02 %)	2,420,679 (99.98 %)	4,130,068 (16.60 %)	1,663,335 (3.30 %)	18,728,711 (46.19 %)	31,453 (0.55 %)
375	Indus River dolphin GCA_004363435.1	n/a	24,321 (1.30 %)	47,065 (1.14 %)	n/a	41.72 (99.88 %)	11,702 (0.04 %)	1,110,492 (99.96 %)	5,093,308 (45.60 %)	845,860 (1.72 %)	13,162,111 (41.37 %)	68,257 (1.40 %)
376	Inner Mongolia cashmere goat (2024) GCA_041735815.1	n/a	19,123 (1.40 %)	21,508 (1.26 %)	n/a	43.19 (100.00 %)	n/a	31 (100.00 %)	3,982,368 (23.76 %)	650,129 (7.44 %)	12,858,872 (44.33 %)	99,144 (2.87 %)
377	intermediate horseshoe bat (China 20211001_DDa primary hap 2024) GCA_043728065.1	n/a	18,239 (1.76 %)	20,378 (1.53 %)	n/a	41.40 (100.00 %)	37 (0.00 %)	2,195 (100.00 %)	3,438,644 (42.82 %)	584,006 (9.54 %)	12,207,998 (35.49 %)	34,491 (1.02 %)
378	intermediate roundleaf bat (primary hap 2023) GCA_031876335.1	n/a	19,064 (1.67 %)	20,800 (1.49 %)	n/a	41.55 (100.00 %)	119 (0.00 %)	69 (100.00 %)	3,393,548 (30.92 %)	723,545 (6.58 %)	12,073,117 (35.40 %)	43,736 (1.20 %)
379	jaguar (BS21 2019) GCA_004023805.1	n/a	21,431 (1.51 %)	32,835 (1.35 %)	n/a	41.70 (99.89 %)	21,329 (0.09 %)	460,121 (99.91 %)	5,420,861 (43.75 %)	1,049,353 (1.93 %)	13,848,545 (34.90 %)	71,066 (2.37 %)
380	jaguar (hap1 2025) GCA_046562885.1	n/a	17,882 (1.68 %)	19,103 (1.41 %)	n/a	41.66 (100.00 %)	140 (0.00 %)	115 (100.00 %)	4,622,385 (41.25 %)	893,297 (1.89 %)	12,851,116 (33.53 %)	61,319 (2.55 %)
381	jaguar (hap2 2025) GCA_046562875.1	n/a	18,867 (1.64 %)	20,784 (1.40 %)	n/a	41.76 (100.00 %)	200 (0.00 %)	85 (100.00 %)	4,977,843 (41.75 %)	982,064 (2.10 %)	13,365,332 (34.16 %)	66,000 (2.75 %)
382	jaguar (Sample0147 2023) GCF_028533385.1	71,578 (4.12 %)	19,122 (1.67 %)	21,950 (1.36 %)	n/a	41.58 (99.31 %)	56,371 (0.70 %)	36,243 (100.00 %)	4,552,854 (33.37 %)	897,371 (1.63 %)	13,732,912 (32.89 %)	63,777 (2.41 %)
383	jaguarundi GCF_014898765.1	72,564 (3.15 %)	18,602 (1.64 %)	20,510 (1.39 %)	n/a	41.75 (97.85 %)	42,499 (2.16 %)	10,948 (100.00 %)	5,035,745 (43.29 %)	907,329 (1.61 %)	13,590,905 (33.57 %)	69,090 (2.29 %)
384	Jamaican fruit-eating bat (1a 2020 Wuhan U) GCF_014825515.1	48,692 (2.72 %)	19,921 (1.66 %)	23,614 (1.68 %)	39,384 (2.12 %)	41.95 (98.87 %)	110,840 (1.13 %)	56,740 (100.00 %)	2,972,388 (28.79 %)	405,474 (2.15 %)	12,458,880 (30.65 %)	61,973 (1.87 %)
385	Jamaican fruit-eating bat (2021) GCF_021234435.1	55,114 (3.18 %)	17,875 (1.68 %)	19,958 (1.66 %)	n/a	42.00 (100.00 %)	3 (0.00 %)	868 (100.00 %)	2,697,287 (28.17 %)	318,700 (0.84 %)	11,750,329 (31.61 %)	61,951 (1.93 %)
386	Japanese wild mouse (2022) GCA_921999095.2	n/a	23,292 (2.05 %)	20,114 (1.31 %)	n/a	41.71 (100.00 %)	397 (0.00 %)	1,449 (100.00 %)	4,952,306 (42.53 %)	1,635,456 (4.60 %)	12,838,321 (38.56 %)	24,168 (0.56 %)
387	Java mouse-deer (US108 2019 Broad) GCA_004024965.1	n/a	23,081 (1.38 %)	38,181 (1.41 %)	n/a	42.73 (99.91 %)	2,829 (0.01 %)	1,159,819 (99.99 %)	4,791,310 (34.97 %)	448,498 (1.92 %)	13,175,375 (39.89 %)	68,778 (2.92 %)
388	killer whale (2022) GCF_937001465.1	78,479 (3.76 %)	18,710 (1.51 %)	21,101 (1.30 %)	34,448 (1.49 %)	41.91 (100.00 %)	123 (0.00 %)	448 (100.00 %)	3,955,401 (36.81 %)	844,672 (9.94 %)	12,233,568 (41.63 %)	77,307 (3.08 %)
389	killer whale (alternate hap 2022) GCA_937001455.1	n/a	14,982 (1.50 %)	19,185 (1.30 %)	n/a	42.13 (100.00 %)	n/a	12,410 (100.00 %)	2,752,892 (35.61 %)	589,217 (10.15 %)	8,371,032 (41.11 %)	57,347 (3.41 %)
390	killer whale (Morgan 2013) GCF_000331955.2	70,972 (3.55 %)	18,736 (1.86 %)	20,365 (1.48 %)	n/a	41.35 (94.82 %)	78,441 (5.20 %)	80,100 (94.80 %)	3,978,339 (43.98 %)	555,737 (1.13 %)	12,773,973 (31.51 %)	61,145 (1.59 %)
391	koala (Bilbo 61053 2022) GCA_003287225.2	n/a	17,087 (0.81 %)	14,711 (0.86 %)	n/a	39.05 (100.00 %)	669 (0.00 %)	1,246 (100.00 %)	6,280,029 (29.77 %)	1,123,294 (2.02 %)	21,796,316 (39.24 %)	15,957 (0.35 %)
392	koala (Bilbo 61053 2022) GCF_003287225.1	50,393 (2.58 %)	17,125 (0.85 %)	14,711 (0.86 %)	n/a	39.05 (100.00 %)	669 (0.00 %)	1,246 (100.00 %)	10,370,789 (60.23 %)	1,123,294 (2.02 %)	21,796,035 (39.24 %)	15,957 (0.35 %)
393	Kuhl's pipistrelle (2020) GCF_014108245.1	65,654 (3.37 %)	17,918 (1.89 %)	20,819 (1.86 %)	n/a	42.57 (99.31 %)	394 (0.69 %)	202 (100.00 %)	2,897,422 (23.58 %)	797,420 (2.76 %)	10,057,100 (34.56 %)	55,965 (2.99 %)
394	large flying fox GCF_000151845.1	52,243 (3.10 %)	18,454 (1.91 %)	23,631 (1.73 %)	n/a	39.82 (91.80 %)	189,340 (8.24 %)	225,433 (91.76 %)	3,117,045 (36.49 %)	504,277 (3.03 %)	13,025,556 (25.00 %)	78,404 (3.24 %)
395	large Japanese field mouse (IB14-021 2017) GCA_002335545.1	n/a	22,630 (1.74 %)	33,810 (1.26 %)	n/a	42.04 (57.78 %)	4,289,924 (42.35 %)	4,626,044 (57.65 %)	3,638,537 (31.76 %)	1,048,253 (1.87 %)	12,039,926 (16.61 %)	19,817 (0.34 %)
396	large tree shrew (BS70 2022) GCA_026018925.1	n/a	21,678 (1.34 %)	22,317 (1.25 %)	n/a	42.17 (100.00 %)	1,188 (0.00 %)	1,198 (100.00 %)	5,530,547 (22.20 %)	1,357,640 (10.13 %)	14,334,312 (46.09 %)	123,453 (2.17 %)
397	least weasel (hap1.1 2025) GCA_964662115.1	n/a	19,085 (1.11 %)	23,074 (1.09 %)	n/a	43.54 (99.98 %)	2,938 (0.02 %)	3,189 (100.00 %)	4,687,333 (25.05 %)	908,610 (10.98 %)	12,922,050 (49.64 %)	68,749 (2.22 %)
398	least weasel (hap2.1 2025) GCA_964662095.1	n/a	18,255 (1.29 %)	22,201 (1.27 %)	n/a	42.68 (99.98 %)	2,709 (0.02 %)	4,948 (99.98 %)	4,268,233 (27.47 %)	787,850 (6.40 %)	12,592,088 (42.54 %)	62,416 (2.34 %)
399	leopard (Hobbes primary hap 2022) GCF_024362965.1	70,501 (3.29 %)	18,472 (1.56 %)	20,388 (1.41 %)	n/a	41.75 (99.99 %)	335 (0.01 %)	382 (100.00 %)	4,634,038 (33.80 %)	932,991 (2.25 %)	13,686,652 (34.03 %)	65,793 (2.64 %)
400	leopard (Maewha 2016 refseq) GCF_001857705.1	73,279 (3.20 %)	18,881 (1.63 %)	21,010 (1.44 %)	n/a	41.71 (96.17 %)	214,953 (3.85 %)	265,330 (96.15 %)	5,247,029 (42.87 %)	1,059,446 (5.13 %)	14,265,573 (32.20 %)	77,001 (2.45 %)
401	leopard cat GCF_016509475.1	59,965 (3.05 %)	18,472 (1.65 %)	19,934 (1.38 %)	n/a	41.80 (100.00 %)	56 (0.00 %)	123 (100.00 %)	4,978,115 (43.28 %)	901,754 (1.84 %)	13,596,535 (34.23 %)	67,390 (2.50 %)
402	Leschenault's rousette (2020) GCA_015472975.1	n/a	17,815 (2.05 %)	23,917 (1.90 %)	n/a	40.13 (99.14 %)	100,669 (0.88 %)	108,810 (99.12 %)	2,688,705 (31.20 %)	428,968 (1.19 %)	12,245,385 (26.51 %)	58,118 (6.81 %)
403	lesser Egyptian jerboa (2021) GCF_020740685.1	51,730 (1.99 %)	20,129 (1.24 %)	22,089 (1.24 %)	40,414 (1.76 %)	42.00 (99.52 %)	561 (0.48 %)	160 (100.00 %)	7,346,291 (41.25 %)	1,187,587 (2.92 %)	14,222,177 (44.13 %)	34,688 (0.86 %)
404	lesser Egyptian jerboa (alternate hap 2021) GCA_020740715.1	n/a	17,777 (1.27 %)	19,232 (1.28 %)	n/a	42.13 (92.75 %)	2,875 (7.25 %)	508 (100.00 %)	6,476,967 (33.93 %)	999,133 (2.78 %)	11,809,834 (40.52 %)	29,872 (0.82 %)
405	lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 refseq) GCF_000280705.1	25,978 (1.44 %)	19,408 (1.38 %)	20,312 (1.35 %)	n/a	41.87 (87.17 %)	326,464 (12.87 %)	337,360 (87.13 %)	6,125,934 (38.31 %)	832,825 (1.53 %)	13,661,612 (33.98 %)	26,669 (0.59 %)
406	lesser false vampire bat (Vietnam 20211001_DDb primary hap 2024) GCA_043880595.1	n/a	18,484 (1.87 %)	24,356 (1.84 %)	n/a	41.88 (97.91 %)	866 (2.09 %)	617 (99.68 %)	3,419,622 (36.65 %)	663,182 (2.53 %)	11,508,574 (30.58 %)	84,174 (4.85 %)
407	lesser horseshoe bat (hap1 2024) GCA_964194185.1	n/a	19,031 (1.88 %)	21,003 (1.63 %)	n/a	40.81 (99.99 %)	1,627 (0.01 %)	723 (100.00 %)	3,133,745 (33.46 %)	660,064 (3.79 %)	11,720,176 (32.32 %)	35,414 (1.75 %)
408	lesser horseshoe bat (hap2 2024) GCA_964194215.1	n/a	18,875 (1.72 %)	21,166 (1.58 %)	n/a	41.18 (99.99 %)	1,648 (0.01 %)	2,727 (99.99 %)	3,160,659 (34.00 %)	696,130 (6.23 %)	11,662,645 (34.26 %)	36,176 (1.80 %)
409	lesser noctule (v2 hap1 2025) GCA_964264875.2	n/a	18,342 (1.54 %)	22,974 (1.62 %)	n/a	43.04 (100.00 %)	302 (0.00 %)	588 (100.00 %)	4,258,096 (37.31 %)	1,289,911 (11.51 %)	9,694,758 (42.52 %)	65,974 (2.80 %)
410	lesser noctule (v2 hap2 2025) GCA_964264895.2	n/a	17,492 (1.62 %)	22,188 (1.72 %)	n/a	43.10 (100.00 %)	247 (0.00 %)	920 (100.00 %)	3,886,341 (36.52 %)	1,139,308 (10.89 %)	9,356,457 (40.65 %)	62,254 (3.00 %)
411	lesser panda (RP43 2017) GCA_002007465.1	n/a	19,120 (1.69 %)	20,591 (1.50 %)	n/a	41.60 (98.56 %)	137,333 (1.45 %)	148,922 (98.55 %)	4,513,888 (40.87 %)	692,778 (1.62 %)	13,691,859 (31.36 %)	64,369 (2.52 %)
412	lesser sac-winged bat (primary hap 2024 refseq) GCF_036850995.1	53,210 (2.49 %)	18,323 (1.42 %)	21,350 (1.39 %)	n/a	41.84 (99.24 %)	573 (0.76 %)	168 (100.00 %)	4,224,344 (28.69 %)	1,030,576 (2.60 %)	12,591,989 (42.30 %)	98,189 (2.06 %)
413	lion GCF_018350215.1	67,745 (2.86 %)	17,956 (1.69 %)	19,033 (1.40 %)	61,242 (3.04 %)	41.71 (100.00 %)	55 (0.00 %)	99 (100.00 %)	4,666,951 (42.23 %)	889,987 (1.87 %)	13,151,686 (33.40 %)	62,675 (2.56 %)
414	little brown bat GCF_000147115.1	50,660 (2.76 %)	19,314 (1.86 %)	22,683 (1.70 %)	n/a	42.50 (96.66 %)	61,131 (3.35 %)	72,785 (96.65 %)	3,682,263 (37.05 %)	634,854 (2.15 %)	10,841,759 (33.45 %)	57,630 (1.79 %)
415	little pocket mouse (longimembris alternate hap 2022) GCA_024363435.1	n/a	19,150 (1.52 %)	23,435 (1.64 %)	n/a	42.08 (100.00 %)	229 (0.00 %)	718 (100.00 %)	n/a	1,051,300 (12.43 %)	9,858,628 (43.20 %)	48,101 (2.62 %)
416	little pocket mouse (longimembris primary hap 2022) GCA_024363575.1	n/a	19,760 (1.50 %)	24,317 (1.63 %)	n/a	42.09 (100.00 %)	215 (0.00 %)	1,135 (100.00 %)	3,913,744 (28.43 %)	1,095,577 (12.70 %)	10,273,833 (43.74 %)	49,636 (2.61 %)
417	little tube-nosed bat GCA_004026665.1	n/a	22,009 (1.26 %)	45,725 (1.35 %)	n/a	43.80 (99.90 %)	6,795 (0.03 %)	886,972 (99.97 %)	3,372,804 (23.57 %)	1,014,476 (3.00 %)	11,948,592 (41.18 %)	71,530 (2.05 %)
418	long-finned pilot whale (v2 primary hap 2024 refseq) GCF_963455315.2	61,447 (2.80 %)	18,725 (1.51 %)	20,946 (1.39 %)	n/a	42.38 (99.99 %)	1,084 (0.01 %)	2,076 (99.99 %)	4,125,452 (35.62 %)	1,577,896 (12.03 %)	12,347,170 (42.01 %)	71,822 (5.51 %)
419	long-finned pilot whale (X-22926-18 2019) GCF_006547405.1	66,117 (3.28 %)	18,772 (1.80 %)	21,031 (1.46 %)	33,672 (1.78 %)	41.29 (99.58 %)	14,859 (0.42 %)	20,999 (99.58 %)	3,962,125 (45.58 %)	557,247 (1.11 %)	12,616,535 (34.70 %)	62,905 (1.69 %)
420	long-footed potoroo (2021) GCA_904812075.1	n/a	278 (19.06 %)	223 (16.20 %)	n/a	51.14 (99.50 %)	n/a	1,479 (100.00 %)	194 (1.83 %)	54 (0.32 %)	2,088 (5.90 %)	51 (2.47 %)
421	long-tailed chinchilla GCF_000276665.1	54,854 (2.98 %)	18,096 (1.59 %)	19,514 (1.52 %)	n/a	41.06 (95.56 %)	78,817 (4.46 %)	81,656 (95.54 %)	4,018,866 (30.94 %)	607,082 (1.15 %)	13,528,234 (28.15 %)	46,931 (1.25 %)
422	long-tongued fruit bat (US102 2019 Broad) GCA_004027375.1	n/a	19,208 (1.99 %)	31,180 (1.92 %)	n/a	39.56 (99.97 %)	2,056 (0.01 %)	174,041 (99.99 %)	2,893,453 (32.61 %)	597,516 (1.76 %)	12,093,608 (28.14 %)	63,015 (4.70 %)
423	Lowland paca GCA_004365215.1	n/a	21,953 (0.62 %)	56,356 (0.80 %)	n/a	40.83 (99.78 %)	3,060 (0.01 %)	3,771,510 (99.99 %)	5,892,507 (29.20 %)	802,811 (1.38 %)	18,630,883 (38.61 %)	61,715 (0.94 %)
424	Malayan pangolin (MJ-LG 2024) GCF_040802235.1	87,404 (4.24 %)	18,382 (1.54 %)	19,802 (1.30 %)	n/a	41.03 (100.00 %)	90 (0.00 %)	63 (100.00 %)	3,146,889 (38.39 %)	384,539 (2.15 %)	12,642,995 (34.68 %)	48,454 (1.30 %)
425	Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 refseq) GCF_001685135.1	48,591 (2.76 %)	19,458 (1.57 %)	24,783 (1.38 %)	41,272 (1.95 %)	40.78 (92.27 %)	984,658 (7.81 %)	80,670 (100.00 %)	3,064,599 (35.21 %)	866,309 (3.08 %)	13,310,859 (28.76 %)	35,558 (0.84 %)
426	Malayan pangolin YNU ManJav 2.0 GCF_014570535.1	68,043 (3.50 %)	18,167 (1.72 %)	20,453 (1.54 %)	n/a	40.83 (91.78 %)	57,746 (8.23 %)	17,969 (100.00 %)	2,864,567 (34.23 %)	277,996 (1.69 %)	12,659,207 (25.72 %)	33,486 (1.00 %)
427	marsupial mole (Waite Creek area ABTC07570 2025) GCA_048126345.1	n/a	25,281 (0.80 %)	18,740 (0.87 %)	n/a	37.80 (99.99 %)	196 (0.01 %)	889 (99.99 %)	6,538,990 (26.08 %)	1,450,668 (2.40 %)	21,374,371 (47.19 %)	17,923 (0.30 %)
428	Masai giraffe (MA1 2016 Penn St) GCA_001651235.1	n/a	20,950 (1.52 %)	28,854 (1.33 %)	n/a	41.39 (96.50 %)	257,672 (3.48 %)	770,838 (96.52 %)	5,502,479 (43.94 %)	531,418 (2.64 %)	13,936,018 (36.18 %)	40,504 (1.02 %)
429	meadow jumping mouse GCA_004024765.1	n/a	22,236 (1.08 %)	44,719 (1.21 %)	n/a	42.31 (99.88 %)	7,610 (0.03 %)	1,165,710 (99.97 %)	6,135,446 (33.31 %)	1,525,146 (3.34 %)	13,854,475 (39.91 %)	26,633 (0.68 %)
430	meadow vole (hap1 2024 genbank) GCA_037038515.1	n/a	19,134 (1.78 %)	20,672 (1.55 %)	n/a	42.38 (100.00 %)	60 (0.00 %)	181 (100.00 %)	4,818,689 (41.90 %)	962,362 (4.16 %)	12,161,222 (34.42 %)	23,781 (0.74 %)
431	meadow vole (hap1 2024 refseq) GCF_037038515.1	56,969 (2.88 %)	19,974 (1.74 %)	20,672 (1.55 %)	n/a	42.38 (100.00 %)	60 (0.00 %)	180 (100.00 %)	4,116,239 (33.62 %)	962,362 (4.16 %)	12,161,153 (34.42 %)	23,781 (0.74 %)
432	meadow vole (hap2 2024) GCA_037039175.1	n/a	19,001 (1.82 %)	20,271 (1.68 %)	n/a	42.58 (100.00 %)	53 (0.00 %)	143 (100.00 %)	3,141,368 (21.37 %)	898,900 (4.24 %)	11,475,531 (32.14 %)	22,186 (0.75 %)
433	meerkat (VVHF042 2019 DNA Zoo refseq) GCF_006229205.1	58,806 (2.67 %)	19,009 (1.64 %)	19,088 (1.36 %)	n/a	41.68 (99.72 %)	65,245 (0.28 %)	63,791 (100.00 %)	4,564,931 (40.13 %)	634,179 (1.21 %)	13,631,635 (32.17 %)	64,858 (2.22 %)
434	Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 alternate hap 2022) GCA_024711525.1	n/a	18,555 (1.22 %)	24,508 (1.35 %)	n/a	42.04 (100.00 %)	181 (0.00 %)	3,482 (100.00 %)	6,419,007 (53.84 %)	1,384,128 (15.63 %)	11,486,822 (50.51 %)	38,521 (1.60 %)
435	Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022) GCA_024711535.1	n/a	21,281 (1.16 %)	28,592 (1.34 %)	n/a	42.27 (100.00 %)	182 (0.00 %)	4,354 (100.00 %)	4,378,955 (29.66 %)	1,568,842 (17.75 %)	12,889,786 (51.96 %)	46,167 (1.71 %)
436	Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022) GCF_024711535.1	68,331 (2.37 %)	21,280 (1.16 %)	28,582 (1.34 %)	n/a	42.27 (100.00 %)	182 (0.00 %)	4,535 (100.00 %)	4,378,949 (29.66 %)	1,568,842 (17.75 %)	12,889,725 (51.96 %)	46,167 (1.71 %)
437	Merriam's long-tongued bat (hap1 2024) GCA_039655065.1	n/a	18,172 (1.67 %)	20,736 (1.60 %)	n/a	42.19 (100.00 %)	47 (0.00 %)	82 (100.00 %)	2,998,913 (29.48 %)	418,833 (1.07 %)	11,783,716 (32.96 %)	65,956 (4.38 %)
438	Merriam's long-tongued bat (hap2 2024) GCA_039656995.1	n/a	18,105 (1.68 %)	20,751 (1.60 %)	n/a	42.18 (100.00 %)	45 (0.00 %)	71 (100.00 %)	2,994,788 (29.48 %)	415,375 (1.07 %)	11,752,432 (32.88 %)	65,597 (4.38 %)
439	mesic four-striped grass rat (FMNH 192475 2021) GCA_019844195.1	n/a	18,926 (2.00 %)	20,713 (1.46 %)	n/a	41.06 (99.08 %)	121,340 (0.94 %)	152,293 (99.06 %)	6,081,188 (43.08 %)	1,497,646 (3.55 %)	13,086,584 (30.02 %)	15,700 (0.46 %)
440	Mexican gray wolf (hap1 2025 refseq) GCF_048164855.1	112,768 (4.40 %)	19,582 (1.52 %)	20,911 (1.39 %)	n/a	41.56 (100.00 %)	167 (0.00 %)	249 (100.00 %)	4,598,813 (31.70 %)	1,102,136 (4.40 %)	13,591,364 (35.18 %)	53,470 (2.24 %)
441	Mexican gray wolf (hap2 2025) GCA_048164845.1	n/a	18,738 (1.56 %)	19,759 (1.41 %)	n/a	41.58 (100.00 %)	124 (0.00 %)	155 (100.00 %)	4,265,479 (32.40 %)	1,030,876 (4.11 %)	12,818,772 (34.22 %)	50,269 (2.22 %)
442	minke whale (2013 refseq) GCF_000493695.1	42,553 (2.38 %)	19,159 (1.73 %)	18,656 (1.42 %)	n/a	40.94 (94.06 %)	173,296 (5.96 %)	184,072 (94.04 %)	n/a	573,951 (1.48 %)	13,504,347 (30.96 %)	65,448 (1.38 %)
443	minke whale (alternate hap 2023) GCA_950005055.1	n/a	20,412 (1.46 %)	27,421 (1.34 %)	n/a	41.50 (100.00 %)	1 (0.00 %)	21,272 (100.00 %)	3,811,435 (36.24 %)	959,712 (10.27 %)	12,159,896 (41.30 %)	69,852 (1.62 %)
444	minke whale (primary hap 2023 refseq) GCF_949987535.1	61,711 (2.51 %)	19,550 (1.49 %)	21,499 (1.26 %)	n/a	41.55 (99.99 %)	1,177 (0.01 %)	1,374 (100.00 %)	4,006,927 (35.92 %)	1,058,105 (12.08 %)	12,708,103 (42.66 %)	72,756 (1.59 %)
445	Mongolian gerbil (243 2017 Lucigen Corp.) GCF_002204375.1	40,359 (2.29 %)	21,215 (1.83 %)	24,305 (1.47 %)	n/a	42.09 (95.23 %)	91,601 (4.78 %)	68,793 (100.00 %)	4,821,343 (37.74 %)	940,776 (1.82 %)	13,848,274 (31.31 %)	24,154 (0.74 %)
446	Mongolian gerbil (EAM2014 2019 BGI) GCA_008131255.1	n/a	19,952 (1.59 %)	23,462 (1.36 %)	n/a	41.98 (99.01 %)	103,843 (0.97 %)	412,933 (99.03 %)	5,009,454 (0.00 %)	1,042,929 (2.52 %)	14,121,194 (34.63 %)	26,044 (0.71 %)
447	Mongolian gerbil (TT.TT164.6M 2023) GCF_030254825.1	65,502 (2.97 %)	19,045 (1.53 %)	20,203 (1.29 %)	n/a	41.87 (100.00 %)	53 (0.00 %)	193 (100.00 %)	4,477,607 (37.21 %)	1,124,432 (5.22 %)	13,244,320 (39.20 %)	25,300 (0.76 %)
448	monito del monte (mDroGli1 alternate hap 2021) GCA_019395325.1	n/a	16,419 (0.77 %)	17,219 (0.89 %)	n/a	39.03 (100.00 %)	33 (0.00 %)	9,959 (100.00 %)	6,332,360 (29.69 %)	1,065,454 (2.09 %)	17,908,986 (42.25 %)	13,856 (0.35 %)
449	monito del monte (primary hap 2021 refseq) GCF_019393635.1	47,034 (2.02 %)	18,399 (0.80 %)	15,519 (0.85 %)	n/a	39.11 (99.91 %)	260 (0.09 %)	17 (100.00 %)	9,107,968 (41.08 %)	1,249,635 (2.12 %)	21,135,324 (42.80 %)	16,598 (0.36 %)
450	Montane guinea pig GCA_004027695.1	n/a	20,064 (1.06 %)	31,321 (1.18 %)	39,905 (1.42 %)	40.09 (99.88 %)	11,321 (0.04 %)	1,379,500 (99.96 %)	4,730,634 (30.02 %)	1,583,664 (6.57 %)	15,806,339 (40.40 %)	37,371 (0.76 %)
451	moose/elk (2024) GCA_964270355.1	n/a	19,816 (1.60 %)	22,341 (1.44 %)	n/a	41.70 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1,737 (100.00 %)	3,099,775 (24.20 %)	406,796 (2.52 %)	13,117,056 (38.34 %)	50,644 (1.33 %)
452	moose/elk (AALL_1980 2023) GCA_015832495.2	n/a	19,116 (1.66 %)	21,184 (1.45 %)	n/a	41.55 (95.50 %)	71,769 (4.51 %)	77,708 (95.49 %)	3,026,678 (23.77 %)	373,266 (0.91 %)	13,167,376 (34.08 %)	44,302 (1.21 %)
453	moose/elk (MIG12-28694850 2019) GCA_007570765.1	n/a	21,375 (1.65 %)	26,769 (1.42 %)	n/a	41.64 (92.66 %)	83,831 (7.35 %)	131,373 (92.65 %)	5,022,053 (43.27 %)	384,658 (1.22 %)	13,422,381 (34.52 %)	49,216 (1.18 %)
454	Mount Data shrew rat (FMNH 198792 2021) GCA_019843965.1	n/a	18,266 (2.07 %)	18,451 (1.45 %)	n/a	41.51 (99.45 %)	47,796 (0.55 %)	61,989 (99.45 %)	5,656,524 (42.94 %)	1,120,762 (2.44 %)	12,212,163 (29.98 %)	15,204 (0.46 %)
455	mountain beaver GCA_004027875.1	n/a	22,428 (1.10 %)	38,670 (1.12 %)	n/a	40.58 (99.89 %)	7,253 (0.02 %)	1,286,779 (99.98 %)	5,859,004 (32.29 %)	914,052 (2.37 %)	16,249,666 (38.21 %)	39,133 (0.76 %)
456	muskrat GCA_004026605.1	n/a	22,540 (1.52 %)	32,136 (1.35 %)	n/a	41.59 (99.93 %)	6,243 (0.02 %)	571,599 (99.98 %)	4,437,736 (28.49 %)	922,826 (2.38 %)	13,945,732 (35.23 %)	19,876 (0.50 %)
457	naked mole-rat (2022) GCA_944319725.1	n/a	20,755 (1.51 %)	20,024 (1.35 %)	n/a	39.98 (99.96 %)	2,332 (0.04 %)	264 (100.00 %)	3,593,261 (30.76 %)	529,045 (1.14 %)	13,294,831 (36.07 %)	32,235 (0.93 %)
458	naked mole-rat (mHap 2024) GCA_964261345.1	n/a	19,980 (1.56 %)	19,365 (1.33 %)	n/a	39.96 (99.93 %)	2,238 (0.07 %)	263 (100.00 %)	5,099,610 (44.65 %)	523,459 (1.13 %)	13,036,461 (35.91 %)	31,614 (0.92 %)
459	naked mole-rat (pHap 2024) GCA_964261355.1	n/a	19,953 (1.57 %)	19,579 (1.35 %)	n/a	39.98 (99.91 %)	2,381 (0.09 %)	264 (100.00 %)	5,097,978 (44.61 %)	523,861 (1.13 %)	13,168,788 (36.09 %)	31,789 (0.93 %)
460	naked mole-rat (MEF-2018 2020) GCA_014060925.1	n/a	22,011 (1.30 %)	21,392 (1.22 %)	n/a	40.13 (95.11 %)	139,535 (4.91 %)	148,797 (95.09 %)	4,885,102 (35.91 %)	654,418 (1.90 %)	16,401,315 (34.21 %)	40,717 (0.98 %)
461	naked mole-rat (NMR 29 2012 refseq) GCF_000247695.1	74,587 (3.56 %)	21,332 (1.74 %)	20,861 (1.51 %)	n/a	40.21 (88.43 %)	110,424 (11.59 %)	114,653 (88.41 %)	4,179,991 (32.69 %)	484,933 (0.92 %)	13,672,561 (27.63 %)	31,950 (0.88 %)
462	narwhal (Baffin Bay 2019) GCF_005190385.1	51,639 (2.71 %)	18,741 (1.78 %)	20,365 (1.40 %)	33,148 (1.79 %)	41.22 (99.52 %)	18,323 (0.49 %)	6,972 (100.00 %)	4,011,742 (43.97 %)	565,367 (1.22 %)	12,720,018 (34.85 %)	60,492 (1.58 %)
463	narwhal (Baffin Bay Population NGI 2022) GCA_005190385.3	n/a	18,681 (1.79 %)	19,816 (1.40 %)	n/a	41.26 (100.00 %)	313 (0.00 %)	101 (100.00 %)	3,618,235 (37.24 %)	612,229 (1.52 %)	12,641,632 (35.02 %)	60,518 (1.78 %)
464	Natal long-fingered bat GCF_001595765.1	32,050 (3.03 %)	18,015 (2.17 %)	18,293 (1.87 %)	n/a	42.07 (96.24 %)	204,616 (3.79 %)	1,269 (100.00 %)	2,565,457 (28.95 %)	376,532 (1.91 %)	10,427,823 (26.35 %)	63,261 (2.07 %)
465	Nathusius's pipistrelle (hap1.1 2025) GCA_964656225.1	n/a	18,001 (1.75 %)	21,219 (1.77 %)	n/a	42.26 (99.98 %)	1,836 (0.02 %)	1,062 (100.00 %)	3,664,854 (32.90 %)	906,692 (8.55 %)	10,164,440 (37.98 %)	56,705 (2.75 %)
466	Nathusius's pipistrelle (hap2.1 2025) GCA_964656075.1	n/a	17,899 (1.71 %)	20,808 (1.69 %)	n/a	42.15 (99.98 %)	1,832 (0.02 %)	2,485 (99.98 %)	3,637,576 (31.92 %)	930,013 (11.25 %)	9,967,930 (39.61 %)	56,237 (2.62 %)
467	Nathusius's pipistrelle (primary hap 2024) GCA_963693515.1	n/a	17,944 (1.86 %)	20,545 (1.83 %)	n/a	42.45 (100.00 %)	263 (0.00 %)	154 (100.00 %)	3,628,328 (34.57 %)	838,723 (4.04 %)	10,155,601 (35.22 %)	56,332 (2.92 %)
468	Natterer's bat (hap1.2 2025) GCA_964212035.2	n/a	19,475 (1.82 %)	22,424 (1.68 %)	n/a	43.15 (100.00 %)	225 (0.00 %)	212 (100.00 %)	3,841,654 (38.99 %)	801,041 (5.78 %)	10,278,311 (38.66 %)	64,639 (2.57 %)
469	Natterer's bat (hap2.2 2025) GCA_964212025.2	n/a	18,368 (1.91 %)	21,701 (1.80 %)	n/a	43.27 (100.00 %)	136 (0.00 %)	309 (100.00 %)	3,509,151 (38.16 %)	704,537 (5.21 %)	9,806,703 (36.74 %)	61,004 (2.65 %)
470	neotropical fruit bat GCF_014824575.2	49,109 (2.78 %)	17,703 (1.63 %)	19,389 (1.60 %)	n/a	42.32 (99.79 %)	38,675 (0.21 %)	26,068 (100.00 %)	2,862,405 (29.31 %)	366,960 (1.48 %)	11,796,203 (31.27 %)	59,091 (1.70 %)
471	Nilgiri tahr GCA_004026825.1	n/a	22,735 (1.44 %)	34,961 (1.27 %)	n/a	42.37 (99.93 %)	10,387 (0.04 %)	479,550 (99.96 %)	5,793,761 (48.50 %)	535,297 (1.34 %)	13,378,352 (42.46 %)	57,653 (1.29 %)
472	nine-banded armadillo (v2 hap1 2023) GCA_030445055.2	n/a	19,350 (1.07 %)	22,207 (1.07 %)	n/a	40.97 (99.27 %)	823 (0.73 %)	588 (100.00 %)	4,330,716 (32.85 %)	661,966 (1.52 %)	18,302,021 (42.22 %)	130,245 (2.79 %)
473	nine-banded armadillo (v2 hap2 2023) GCF_030445035.2	72,174 (2.47 %)	21,051 (1.11 %)	24,418 (1.07 %)	n/a	41.00 (99.67 %)	793 (0.33 %)	546 (100.00 %)	5,412,063 (53.31 %)	738,320 (2.02 %)	19,755,423 (43.69 %)	142,597 (2.85 %)
474	nine-banded armadillo (v3.2 3-136 2012 Baylor) GCF_000208655.3	46,110 (1.87 %)	20,820 (1.08 %)	25,226 (1.08 %)	n/a	40.77 (90.89 %)	268,437 (9.13 %)	314,788 (90.87 %)	4,552,770 (34.01 %)	651,225 (1.26 %)	19,266,969 (38.27 %)	139,490 (2.47 %)
475	North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 alternate hap 2022) GCA_026167925.1	n/a	19,342 (1.57 %)	20,947 (1.48 %)	n/a	42.40 (100.00 %)	229 (0.00 %)	1,006 (100.00 %)	4,161,568 (23.13 %)	1,278,205 (8.22 %)	13,148,019 (37.60 %)	23,523 (0.71 %)
476	North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 primary hap 2022) GCA_026229955.1	n/a	19,700 (1.54 %)	22,354 (1.46 %)	n/a	42.19 (100.00 %)	244 (0.00 %)	2,082 (100.00 %)	6,089,884 (47.99 %)	1,358,786 (9.39 %)	13,799,349 (39.08 %)	24,733 (0.70 %)
477	North American porcupine (mEreDor1 alternate hap 2023) GCA_028500835.1	n/a	15,210 (1.55 %)	18,316 (1.43 %)	n/a	41.06 (100.00 %)	1 (0.00 %)	5,051 (100.00 %)	3,911,633 (40.55 %)	565,546 (1.54 %)	10,853,726 (32.61 %)	40,925 (1.35 %)
478	North American porcupine (mEreDor1 primary hap 2023) GCA_028451465.1	n/a	18,102 (1.58 %)	20,073 (1.40 %)	n/a	41.03 (100.00 %)	277 (0.00 %)	116 (100.00 %)	4,958,089 (41.64 %)	719,163 (1.59 %)	13,867,662 (33.89 %)	51,299 (1.36 %)
479	North Atlantic right whale (hap1 2023) GCA_028571275.1	n/a	18,699 (1.61 %)	20,354 (1.28 %)	n/a	41.64 (99.84 %)	385 (0.16 %)	947 (100.00 %)	3,815,900 (43.46 %)	718,935 (11.38 %)	11,928,210 (42.25 %)	85,881 (1.90 %)
480	North Atlantic right whale (hap2 + XY 2023 refseq) GCF_028564815.1	49,646 (1.86 %)	19,562 (1.46 %)	21,631 (1.25 %)	n/a	41.69 (99.83 %)	367 (0.17 %)	789 (100.00 %)	1,368,536 (2.24 %)	841,303 (13.08 %)	12,527,582 (43.92 %)	94,259 (1.92 %)
481	North Pacific right whale GCA_004363455.1	n/a	23,145 (1.43 %)	38,161 (1.21 %)	n/a	41.15 (99.88 %)	7,094 (0.03 %)	1,361,057 (99.97 %)	5,039,622 (45.69 %)	694,986 (1.31 %)	14,063,101 (40.51 %)	74,800 (1.52 %)
482	northern American river otter GCF_010015895.1	53,945 (2.18 %)	18,974 (1.68 %)	21,247 (1.45 %)	n/a	41.41 (99.58 %)	7,620 (0.42 %)	13,541 (99.58 %)	4,538,847 (41.18 %)	685,281 (1.20 %)	13,840,953 (32.61 %)	53,559 (1.88 %)
483	northern bat (alternate hap 2023) GCA_951640545.1	n/a	18,343 (1.80 %)	23,253 (1.77 %)	n/a	43.55 (100.00 %)	3 (0.00 %)	4,899 (100.00 %)	1,174,241 (2.96 %)	825,170 (5.11 %)	9,889,579 (36.12 %)	76,164 (3.52 %)
484	northern bat (primary hap 2023) GCA_951640355.1	n/a	18,636 (1.75 %)	21,446 (1.68 %)	n/a	43.32 (99.99 %)	1,423 (0.01 %)	207 (100.00 %)	1,259,729 (2.95 %)	905,676 (6.25 %)	10,554,535 (38.21 %)	77,656 (3.27 %)
485	northern black mastiff bat (mMolNig1 2022) GCA_026936385.1	n/a	18,924 (1.53 %)	22,934 (1.58 %)	n/a	42.38 (100.00 %)	199 (0.00 %)	146 (100.00 %)	3,850,624 (31.21 %)	648,359 (3.76 %)	11,788,702 (39.25 %)	85,908 (2.60 %)
486	northern black mastiff bat (mMolNig1hap1 2024) GCA_039880945.1	n/a	18,933 (1.44 %)	23,629 (1.50 %)	n/a	42.60 (100.00 %)	113 (0.00 %)	366 (100.00 %)	4,027,155 (30.73 %)	712,278 (5.22 %)	12,003,034 (41.58 %)	96,116 (3.02 %)
487	northern black mastiff bat (mMolNig1hap2 2024) GCA_039880925.1	n/a	18,305 (1.49 %)	22,534 (1.56 %)	n/a	42.75 (100.00 %)	80 (0.00 %)	282 (100.00 %)	3,783,543 (30.10 %)	656,592 (4.68 %)	11,353,707 (40.26 %)	92,041 (3.01 %)
488	northern bottlenose whale (alternate hap 2023) GCA_949752845.1	n/a	19,537 (1.44 %)	27,826 (1.30 %)	n/a	41.67 (100.00 %)	n/a	23,401 (100.00 %)	3,634,923 (35.56 %)	672,860 (11.00 %)	11,175,398 (41.72 %)	62,007 (1.94 %)
489	northern bottlenose whale (primary hap 2023) GCA_949752795.1	n/a	19,073 (1.44 %)	20,821 (1.21 %)	n/a	41.81 (99.99 %)	1,098 (0.01 %)	757 (100.00 %)	3,997,911 (34.76 %)	769,275 (14.94 %)	12,133,820 (44.83 %)	67,258 (2.00 %)
490	northern elephant seal (BS05 2019 Broad) GCA_004023865.1	n/a	22,834 (1.54 %)	36,083 (1.32 %)	n/a	41.52 (99.94 %)	9,483 (0.04 %)	330,739 (99.96 %)	4,849,944 (43.83 %)	600,306 (1.16 %)	13,420,049 (34.43 %)	57,236 (1.62 %)
491	northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 genbank) GCA_029215605.1	n/a	19,278 (1.60 %)	19,908 (1.39 %)	n/a	41.84 (100.00 %)	98 (0.00 %)	596 (100.00 %)	4,348,333 (34.40 %)	621,985 (2.21 %)	13,251,768 (35.32 %)	69,898 (2.38 %)
492	Northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 refseq) GCF_029215605.1	74,106 (3.88 %)	19,277 (1.60 %)	20,000 (1.36 %)	n/a	41.84 (100.00 %)	98 (0.00 %)	595 (100.00 %)	4,348,327 (34.40 %)	621,980 (2.21 %)	13,251,706 (35.32 %)	69,897 (2.38 %)
493	northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap2 2023) GCA_029215635.1	n/a	19,340 (1.59 %)	19,732 (1.37 %)	n/a	41.91 (100.00 %)	60 (0.00 %)	482 (100.00 %)	4,365,070 (34.26 %)	627,639 (2.43 %)	13,174,494 (35.47 %)	74,314 (2.49 %)
494	northern elephant seal (v3 JK_09032017 2022) GCF_021288785.2	53,819 (3.32 %)	20,099 (1.75 %)	20,957 (1.35 %)	n/a	41.51 (99.35 %)	39,936 (0.65 %)	142,455 (100.00 %)	4,368,400 (33.93 %)	588,877 (1.19 %)	13,745,426 (32.96 %)	52,064 (1.59 %)
495	northern fur seal GCF_003265705.1	54,953 (2.43 %)	23,408 (1.78 %)	23,666 (1.43 %)	52,089 (2.17 %)	41.48 (98.01 %)	38,666 (1.99 %)	52,469 (98.01 %)	5,047,032 (43.38 %)	638,130 (1.06 %)	14,922,442 (33.12 %)	57,281 (1.44 %)
496	northern fur seal (GAN/ISIS: 27379988/994484 2025) GCF_003265705.2	71,169 (3.14 %)	21,276 (1.78 %)	21,276 (1.42 %)	n/a	41.44 (98.05 %)	30,369 (1.95 %)	43,734 (98.05 %)	4,118,994 (34.95 %)	578,801 (1.07 %)	13,530,999 (33.27 %)	51,258 (1.43 %)
497	northern gundi (hap1 2025) GCA_048771875.1	n/a	16,996 (1.51 %)	21,787 (1.66 %)	n/a	42.28 (100.00 %)	117 (0.00 %)	535 (100.00 %)	3,293,772 (27.51 %)	602,403 (3.02 %)	11,827,700 (30.64 %)	44,220 (1.55 %)
498	northern gundi (hap2 2025) GCA_048771865.1	n/a	17,037 (1.43 %)	21,690 (1.55 %)	n/a	42.88 (100.00 %)	115 (0.00 %)	1,031 (100.00 %)	3,527,940 (26.81 %)	646,620 (6.32 %)	11,343,462 (34.09 %)	47,125 (1.51 %)
499	northern gundi (US049 2019) GCA_004027205.1	n/a	18,035 (1.39 %)	27,379 (1.57 %)	n/a	42.68 (99.91 %)	5,037 (0.02 %)	865,110 (99.98 %)	4,149,883 (27.83 %)	654,063 (1.64 %)	12,342,565 (33.72 %)	47,533 (1.43 %)
500	northern mole vole GCA_001685095.1	n/a	23,252 (1.39 %)	44,209 (1.25 %)	n/a	41.68 (99.04 %)	371,627 (0.98 %)	722,087 (99.02 %)	3,923,814 (25.79 %)	898,453 (2.47 %)	13,708,986 (29.04 %)	16,583 (0.36 %)
501	northern three-toed jerboa (halli NM19106 2024) GCA_036346955.1	n/a	19,574 (1.25 %)	21,306 (1.23 %)	n/a	42.16 (99.93 %)	954 (0.07 %)	487 (100.00 %)	6,447,286 (38.11 %)	1,321,523 (3.44 %)	13,986,035 (43.83 %)	30,337 (0.84 %)
502	northern white rhinoceros GCA_004027795.1	n/a	25,328 (1.34 %)	61,003 (1.95 %)	n/a	41.32 (99.90 %)	7,054 (0.03 %)	949,480 (99.97 %)	4,330,882 (38.89 %)	484,754 (1.12 %)	15,544,248 (33.11 %)	43,689 (2.08 %)
503	northern woolly horseshoe bat (20210929_DDc primary hap 2024) GCA_043748575.1	n/a	18,475 (1.82 %)	19,990 (1.56 %)	n/a	40.72 (100.00 %)	63 (0.00 %)	68 (100.00 %)	3,507,612 (39.92 %)	711,081 (2.15 %)	11,788,205 (32.17 %)	35,670 (1.25 %)
504	Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 genbank) GCA_036323735.1	114,725 (42.69 %)	21,917 (1.75 %)	19,476 (1.26 %)	n/a	41.82 (99.86 %)	220 (0.14 %)	77 (100.00 %)	4,700,726 (39.99 %)	1,603,005 (5.45 %)	13,451,813 (38.68 %)	20,118 (0.44 %)
505	Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 refseq) GCF_036323735.1	114,725 (5.38 %)	21,870 (1.74 %)	19,989 (1.27 %)	n/a	41.82 (99.86 %)	220 (0.14 %)	76 (100.00 %)	5,294,185 (42.75 %)	1,603,005 (5.45 %)	13,451,760 (38.68 %)	20,118 (0.44 %)
506	Norway rat (F344/Stm 2024) GCA_041222355.1	n/a	21,764 (1.78 %)	20,141 (1.30 %)	n/a	41.87 (99.96 %)	234 (0.04 %)	120 (100.00 %)	4,636,987 (39.98 %)	1,579,595 (5.22 %)	13,544,768 (38.06 %)	20,127 (0.46 %)
507	Norway rat BN7 haplotype GCA_015244455.1	n/a	3,096 (1.64 %)	2,450 (1.02 %)	n/a	41.23 (100.00 %)	6 (0.00 %)	3,156 (100.00 %)	517,347 (50.76 %)	157,701 (3.90 %)	1,502,752 (34.14 %)	1,806 (0.40 %)
508	Norway rat BN7.2 GCF_015227675.2	97,432 (4.08 %)	21,526 (1.86 %)	19,266 (1.33 %)	54,530 (2.79 %)	41.99 (99.19 %)	581 (0.81 %)	757 (99.19 %)	5,029,005 (45.44 %)	1,514,974 (3.57 %)	13,450,428 (35.83 %)	19,244 (0.46 %)
509	Norway rat celera GCF_000002265.2	39,745 (2.91 %)	21,492 (1.95 %)	19,112 (1.38 %)	n/a	41.98 (95.28 %)	111,391 (4.74 %)	118,423 (95.26 %)	9,721,869 (43.57 %)	1,387,703 (3.05 %)	13,224,921 (32.45 %)	18,944 (0.42 %)
510	Norway rat Rnor6.0 GCF_000001895.5	69,456 (3.34 %)	22,369 (1.83 %)	20,269 (1.32 %)	n/a	41.93 (95.13 %)	145,731 (4.89 %)	76,195 (95.16 %)	5,329,187 (44.14 %)	1,620,304 (3.72 %)	14,520,050 (33.09 %)	22,600 (0.47 %)
511	Norway rat SHR/Utx RGD_8142385 2022 GCA_023515785.1	n/a	21,116 (1.68 %)	20,103 (1.27 %)	57,027 (2.45 %)	41.85 (99.82 %)	1,256 (0.18 %)	2,151 (100.00 %)	4,704,388 (38.22 %)	1,611,144 (5.76 %)	13,524,575 (38.35 %)	20,720 (0.48 %)
512	Norway rat SHRSP/BppUtx 2022 GCA_021556685.1	n/a	22,366 (1.71 %)	20,531 (1.26 %)	57,580 (2.44 %)	41.86 (99.94 %)	1,610 (0.06 %)	2,734 (100.00 %)	5,238,574 (46.36 %)	1,638,412 (5.87 %)	13,769,141 (38.49 %)	21,006 (0.49 %)
513	Norway rat WKY/Bbb 2022 GCA_023515805.1	n/a	21,607 (1.68 %)	21,244 (1.28 %)	58,136 (2.47 %)	41.92 (99.80 %)	1,456 (0.20 %)	3,553 (100.00 %)	4,811,412 (38.21 %)	1,650,950 (5.41 %)	13,740,644 (38.24 %)	21,449 (0.51 %)
514	nutria GCA_004027025.1	n/a	24,707 (1.00 %)	47,533 (1.18 %)	n/a	41.70 (99.84 %)	15,249 (0.05 %)	1,684,916 (99.95 %)	6,961,690 (30.09 %)	1,698,977 (3.31 %)	15,207,563 (42.57 %)	59,854 (1.00 %)
515	okapi GCA_001660835.1	n/a	21,483 (1.43 %)	31,061 (1.26 %)	n/a	41.48 (95.11 %)	376,008 (4.86 %)	1,213,177 (95.14 %)	5,808,036 (42.90 %)	619,044 (4.22 %)	14,940,153 (35.17 %)	47,417 (1.12 %)
516	Okinawa island spiny rat (P-3 2024) GCA_047150545.1	n/a	20,516 (1.33 %)	20,222 (0.99 %)	n/a	40.89 (100.00 %)	19 (0.00 %)	53 (100.00 %)	9,452,355 (48.57 %)	2,252,101 (4.71 %)	12,808,891 (51.48 %)	20,770 (0.36 %)
517	Okinawa island spiny rat (P-3 primary hap 2023) GCA_036184385.1	n/a	18,829 (1.78 %)	19,061 (1.29 %)	n/a	41.18 (100.00 %)	250 (0.00 %)	1,778 (100.00 %)	6,918,941 (46.48 %)	1,550,409 (4.06 %)	12,787,294 (38.04 %)	19,458 (0.47 %)
518	Ord's kangaroo rat GCF_000151885.1	30,625 (2.21 %)	17,959 (1.54 %)	19,318 (1.54 %)	n/a	42.06 (92.36 %)	83,035 (7.65 %)	148,226 (92.35 %)	4,337,455 (33.76 %)	1,140,316 (7.60 %)	10,422,685 (36.59 %)	61,921 (3.56 %)
519	pacarana GCA_004027595.1	n/a	20,748 (1.20 %)	33,195 (1.31 %)	n/a	41.81 (99.90 %)	6,392 (0.02 %)	1,164,830 (99.98 %)	4,374,443 (30.16 %)	660,811 (1.38 %)	14,062,133 (35.99 %)	59,382 (1.23 %)
520	Pacific pocket mouse (BS65 2019 Broad) GCA_004363475.1	n/a	21,575 (1.07 %)	47,478 (1.31 %)	n/a	41.87 (99.76 %)	18,801 (0.07 %)	2,428,619 (99.93 %)	4,881,232 (20.80 %)	1,352,971 (4.11 %)	12,583,960 (48.42 %)	74,961 (2.33 %)
521	Pacific pocket mouse (PPM17 2022 San Diego Zoo) GCF_023159225.1	46,202 (2.48 %)	18,752 (1.50 %)	22,526 (1.60 %)	n/a	41.98 (99.96 %)	1,807 (0.04 %)	6,180 (100.00 %)	3,313,319 (16.79 %)	1,066,382 (10.88 %)	9,981,468 (42.63 %)	49,134 (2.83 %)
522	Pacific walrus GCF_000321225.1	27,163 (1.89 %)	20,293 (1.71 %)	20,982 (1.48 %)	n/a	41.36 (95.85 %)	66,766 (4.16 %)	70,656 (95.84 %)	4,372,578 (41.12 %)	511,500 (1.05 %)	13,507,582 (30.43 %)	45,142 (1.29 %)
523	Pacific white-sided dolphin GCF_003676395.1	65,970 (3.26 %)	18,743 (1.79 %)	20,862 (1.45 %)	31,917 (1.69 %)	41.28 (99.56 %)	16,699 (0.44 %)	21,350 (99.56 %)	3,971,820 (45.64 %)	574,056 (1.14 %)	12,602,965 (34.83 %)	62,275 (1.67 %)
524	pale spear-nosed bat (alternate hap MPI-MPIP 2019) GCA_004115245.1	n/a	18,118 (1.63 %)	23,536 (1.65 %)	n/a	42.48 (100.00 %)	38 (0.00 %)	10,873 (100.00 %)	3,001,130 (29.46 %)	375,042 (0.79 %)	11,813,971 (29.64 %)	67,712 (4.23 %)
525	pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 alternate hap 2020) GCA_004115245.2	n/a	18,116 (1.63 %)	23,608 (1.65 %)	n/a	42.48 (100.00 %)	38 (0.00 %)	10,895 (100.00 %)	3,002,448 (29.46 %)	375,226 (0.79 %)	11,824,034 (29.65 %)	67,718 (4.23 %)
526	pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 primary hap 2020) GCF_004126475.2	54,932 (3.31 %)	18,171 (1.69 %)	20,025 (1.62 %)	42,786 (3.39 %)	42.38 (99.28 %)	884 (0.72 %)	77 (100.00 %)	3,069,141 (30.00 %)	385,664 (0.81 %)	12,050,232 (30.57 %)	63,905 (3.75 %)
527	Pallas's mastiff bat GCF_014108415.1	48,421 (2.20 %)	18,667 (1.61 %)	21,915 (1.59 %)	n/a	42.35 (97.95 %)	349 (2.05 %)	60 (100.00 %)	3,863,217 (32.76 %)	624,933 (1.88 %)	11,572,319 (37.09 %)	79,984 (2.45 %)
528	pallid bat (TK200870 primary hap 2023) GCA_027563665.1	n/a	19,688 (1.69 %)	21,998 (1.64 %)	n/a	43.04 (99.72 %)	234 (0.28 %)	112 (99.99 %)	2,794,986 (22.60 %)	938,016 (3.72 %)	11,241,518 (39.41 %)	70,272 (2.89 %)
529	Parnell's mustached bat (2013) GCA_000465405.1	n/a	21,436 (1.40 %)	57,232 (2.18 %)	n/a	40.82 (99.34 %)	265,720 (0.70 %)	443,121 (99.30 %)	2,780,805 (29.26 %)	290,520 (0.63 %)	12,354,814 (27.13 %)	69,806 (1.89 %)
530	Parnell's mustached bat (Mesoamerican 2021) GCF_021234165.1	37,033 (2.48 %)	18,339 (1.76 %)	21,630 (1.69 %)	n/a	41.32 (100.00 %)	12 (0.00 %)	333 (100.00 %)	2,828,339 (30.56 %)	333,670 (0.75 %)	12,444,271 (30.90 %)	53,180 (4.61 %)
531	particolored bat (primary hap 2024) GCA_963924515.1	n/a	17,913 (1.72 %)	20,720 (1.72 %)	n/a	43.54 (99.99 %)	980 (0.01 %)	185 (100.00 %)	2,932,869 (21.94 %)	874,665 (4.83 %)	10,263,103 (37.46 %)	77,397 (4.55 %)
532	Patagonian cavy GCA_004027295.1	n/a	21,143 (0.94 %)	40,887 (1.10 %)	n/a	39.86 (99.87 %)	6,223 (0.02 %)	1,911,987 (99.98 %)	5,194,890 (30.95 %)	892,551 (2.11 %)	17,052,577 (40.22 %)	45,730 (0.84 %)
533	Pere David's deer GCA_002443075.1	n/a	20,723 (1.65 %)	23,551 (1.43 %)	n/a	41.58 (97.49 %)	144,642 (2.51 %)	339,454 (97.49 %)	5,171,293 (43.30 %)	427,987 (1.20 %)	13,665,133 (35.97 %)	48,374 (1.14 %)
534	Philippine flying lemur (mCynVol1 alternate hap 2022) GCA_027409165.1	n/a	18,794 (1.72 %)	21,421 (1.40 %)	n/a	40.18 (100.00 %)	n/a	1,750 (100.00 %)	4,001,442 (39.37 %)	547,894 (2.75 %)	13,870,563 (34.33 %)	40,162 (1.31 %)
535	Philippine flying lemur (primary hap 2022 genbank) GCA_027409185.1	n/a	20,384 (1.64 %)	22,124 (1.29 %)	n/a	40.24 (100.00 %)	116 (0.00 %)	131 (100.00 %)	4,492,423 (39.31 %)	627,842 (4.79 %)	15,561,515 (36.57 %)	45,336 (1.27 %)
536	Philippine flying lemur (primary hap 2022 refseq) GCF_027409185.1	44,950 (1.91 %)	20,385 (1.64 %)	22,123 (1.29 %)	n/a	40.24 (100.00 %)	116 (0.00 %)	130 (100.00 %)	4,492,417 (39.31 %)	627,841 (4.79 %)	15,561,458 (36.57 %)	45,336 (1.27 %)
537	pig (Bamei 2023) GCA_030704935.1	n/a	18,472 (1.44 %)	19,911 (1.28 %)	n/a	42.63 (99.98 %)	878 (0.02 %)	379 (100.00 %)	3,996,827 (27.97 %)	2,094,728 (7.23 %)	12,677,118 (40.57 %)	81,791 (2.82 %)
538	pig (Duroc 2017) GCF_000003025.6	77,695 (4.05 %)	18,980 (1.64 %)	19,453 (1.32 %)	59,876 (4.84 %)	41.87 (98.81 %)	544 (1.19 %)	1,313 (98.81 %)	5,021,184 (45.67 %)	710,994 (1.32 %)	13,243,289 (36.33 %)	79,132 (1.82 %)
539	pig (Norwegian landrace 2024) GCA_963921485.1	n/a	18,500 (1.46 %)	19,718 (1.29 %)	n/a	42.45 (100.00 %)	n/a	54 (100.00 %)	4,068,783 (28.54 %)	1,511,605 (5.52 %)	12,867,101 (39.59 %)	82,002 (2.44 %)
540	pig (USMARCv1 2017) GCA_002844635.1	n/a	19,458 (1.54 %)	21,487 (1.27 %)	58,655 (2.58 %)	42.49 (95.20 %)	661 (4.80 %)	14,157 (100.00 %)	5,159,244 (47.53 %)	902,079 (3.63 %)	13,145,120 (36.86 %)	82,442 (2.62 %)
541	pig (Wuzhishan WZS1 2025) GCA_048338725.1	n/a	18,525 (1.46 %)	19,792 (1.29 %)	n/a	42.55 (100.00 %)	n/a	20 (100.00 %)	4,084,482 (28.40 %)	1,424,314 (5.35 %)	12,927,595 (39.56 %)	81,967 (2.96 %)
542	plains viscacha rat (AO245 2017) GCA_002564285.1	n/a	23,367 (0.78 %)	50,706 (0.93 %)	n/a	41.26 (99.73 %)	124,165 (0.16 %)	1,682,965 (99.84 %)	5,295,703 (27.32 %)	1,024,529 (1.81 %)	16,181,193 (35.22 %)	46,628 (0.97 %)
543	plains zebra (Etosha38 2022 UCLA) GCF_021613505.1	55,794 (2.87 %)	19,529 (1.76 %)	21,214 (1.39 %)	n/a	41.38 (99.04 %)	14,595 (0.96 %)	11,098 (100.00 %)	3,683,862 (38.74 %)	314,723 (0.68 %)	15,217,328 (29.38 %)	41,391 (1.27 %)
544	platypus (alternate hap Pmale09 2020) GCA_004115175.2	n/a	13,244 (1.26 %)	19,241 (1.68 %)	n/a	46.27 (100.00 %)	25 (0.00 %)	5,868 (100.00 %)	4,420,884 (51.59 %)	513,006 (3.13 %)	7,749,797 (49.18 %)	81,538 (8.24 %)
545	platypus (Pmale09 v4 2020) GCF_004115215.2	51,379 (3.07 %)	14,778 (1.26 %)	18,888 (1.63 %)	n/a	46.14 (99.18 %)	515 (0.82 %)	322 (100.00 %)	5,071,089 (51.34 %)	578,614 (2.89 %)	9,113,848 (48.93 %)	87,796 (6.47 %)
546	polar bear (Baiyulong BGI 2014 refseq) GCF_000687225.1	35,751 (2.39 %)	18,466 (1.69 %)	15,384 (1.38 %)	n/a	41.65 (98.35 %)	110,343 (1.67 %)	134,162 (98.33 %)	4,123,540 (40.16 %)	553,196 (1.29 %)	13,765,581 (29.91 %)	54,907 (1.17 %)
547	polar bear (UCSC 2021) GCF_017311325.1	52,175 (2.92 %)	18,588 (1.75 %)	20,731 (1.54 %)	n/a	41.88 (99.60 %)	45,532 (0.41 %)	3,900 (100.00 %)	4,204,162 (40.75 %)	572,129 (1.75 %)	13,926,894 (30.79 %)	63,315 (1.93 %)
548	prairie deer mouse (Baylor 2013) GCF_000500345.1	50,187 (2.51 %)	20,427 (1.69 %)	20,874 (1.45 %)	n/a	42.34 (94.06 %)	182,263 (5.97 %)	212,962 (94.03 %)	n/a	1,229,123 (2.83 %)	14,447,916 (30.09 %)	23,246 (0.56 %)
549	prairie deer mouse (BWxNUB_F1_BW_parent 2025) GCF_049852395.1	84,704 (3.63 %)	19,312 (1.68 %)	20,354 (1.41 %)	n/a	42.31 (100.00 %)	106 (0.00 %)	25 (100.00 %)	6,577,724 (45.25 %)	1,288,198 (5.24 %)	13,978,540 (35.31 %)	23,724 (0.69 %)
550	prairie deer mouse (Harvard 2020) GCF_003704035.1	69,779 (3.28 %)	19,755 (1.73 %)	19,194 (1.43 %)	n/a	42.28 (95.07 %)	147,442 (4.96 %)	155,966 (95.04 %)	4,751,621 (29.04 %)	1,172,212 (2.66 %)	13,934,672 (29.87 %)	22,444 (0.57 %)
551	prairie vole GCF_000317375.1	40,484 (2.72 %)	19,648 (1.91 %)	19,489 (1.62 %)	n/a	42.25 (92.03 %)	180,677 (8.00 %)	187,012 (92.00 %)	3,779,126 (25.51 %)	879,192 (2.11 %)	12,360,347 (27.34 %)	18,233 (0.52 %)
552	proboscis bat (hap1 2024) GCA_037038545.1	n/a	17,919 (1.46 %)	19,330 (1.31 %)	n/a	40.78 (100.00 %)	68 (0.00 %)	41 (100.00 %)	3,707,234 (28.28 %)	643,817 (2.22 %)	12,106,384 (41.48 %)	54,438 (1.38 %)
553	proboscis bat (hap2 2024) GCA_037038555.1	n/a	17,253 (1.51 %)	18,507 (1.35 %)	n/a	40.91 (100.00 %)	39 (0.00 %)	38 (100.00 %)	3,466,835 (27.96 %)	585,261 (1.91 %)	11,364,898 (40.65 %)	50,527 (1.37 %)
554	pronghorn (PH2016 2021) GCA_021018645.1	n/a	21,848 (1.58 %)	27,614 (1.56 %)	n/a	41.70 (96.83 %)	74,027 (3.17 %)	140,480 (96.83 %)	3,335,744 (24.40 %)	405,435 (4.11 %)	13,855,606 (34.67 %)	48,670 (1.19 %)
555	Przewalski's horse (Burgud 2014 refseq) GCF_000696695.1	45,089 (2.76 %)	19,546 (1.69 %)	22,107 (1.36 %)	n/a	41.27 (99.13 %)	80,963 (0.88 %)	134,060 (99.12 %)	3,787,533 (40.54 %)	435,607 (1.73 %)	14,738,418 (28.36 %)	40,752 (0.94 %)
556	Przewalski's horse (Varuska primary hap 2024) GCF_037783145.1	117,131 (4.09 %)	18,569 (1.70 %)	20,018 (1.38 %)	n/a	42.23 (100.00 %)	310 (0.00 %)	2,146 (100.00 %)	3,768,149 (39.86 %)	632,308 (5.35 %)	14,449,518 (32.71 %)	42,166 (4.46 %)
557	puma (L17-30 alternate hap 2023) GCA_028749965.1	n/a	18,380 (1.53 %)	20,701 (1.40 %)	n/a	41.91 (100.00 %)	96 (0.00 %)	304 (100.00 %)	4,881,674 (33.96 %)	978,817 (2.17 %)	13,422,986 (35.08 %)	69,437 (2.62 %)
558	puma (L17-30 primary hap 2023) GCA_028749985.1	n/a	17,553 (1.53 %)	19,299 (1.39 %)	n/a	41.89 (100.00 %)	134 (0.00 %)	390 (100.00 %)	4,629,539 (33.53 %)	919,008 (2.02 %)	12,766,157 (34.70 %)	65,437 (2.53 %)
559	puma (SC36_Marlon 2018 refseq) GCF_003327715.1	25,588 (1.44 %)	17,664 (1.57 %)	16,565 (1.29 %)	n/a	41.36 (95.34 %)	178,992 (4.69 %)	2,175 (100.00 %)	4,885,335 (42.70 %)	833,138 (1.76 %)	13,705,778 (31.28 %)	58,912 (1.65 %)
560	punctate agouti GCA_004363535.1	n/a	22,612 (1.05 %)	45,433 (1.19 %)	n/a	40.79 (99.92 %)	6,459 (0.02 %)	993,123 (99.98 %)	5,671,738 (32.53 %)	945,722 (1.69 %)	17,003,309 (36.58 %)	85,696 (1.65 %)
561	Punta de Vaca leaf-eared mouse (GD2095 2023) GCA_033318265.1	n/a	18,332 (1.50 %)	18,296 (1.29 %)	n/a	40.01 (100.00 %)	133 (0.00 %)	437 (100.00 %)	3,825,722 (28.38 %)	915,865 (11.98 %)	13,456,122 (37.89 %)	18,577 (0.50 %)
562	pygmy sperm whale GCA_004363705.1	n/a	22,661 (1.30 %)	42,546 (1.15 %)	n/a	41.89 (99.89 %)	6,053 (0.02 %)	1,258,125 (99.98 %)	5,185,912 (43.65 %)	836,752 (1.88 %)	14,150,125 (39.88 %)	95,344 (2.15 %)
563	pygmy sperm whale (haplotype 1 2022 refseq) GCF_026419965.1	73,518 (2.67 %)	18,496 (1.55 %)	20,718 (1.32 %)	n/a	42.05 (99.81 %)	143 (0.19 %)	581 (100.00 %)	3,817,659 (34.51 %)	758,297 (7.42 %)	12,196,998 (39.96 %)	101,353 (2.90 %)
564	pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 2 2022) GCA_026419985.1	n/a	18,550 (1.51 %)	20,491 (1.29 %)	n/a	42.18 (99.99 %)	138 (0.01 %)	391 (100.00 %)	3,860,112 (33.83 %)	820,375 (9.58 %)	12,159,196 (41.59 %)	106,168 (2.78 %)
565	Pyrenean desman (IBE-C5619 2021) GCA_019455555.1	n/a	17,527 (1.87 %)	20,474 (1.83 %)	n/a	41.67 (98.52 %)	63,679 (1.49 %)	75,985 (98.51 %)	2,147,379 (23.41 %)	327,740 (0.98 %)	10,539,226 (28.05 %)	44,487 (4.39 %)
566	rabbit (A946 2020) GCA_013371645.1	n/a	19,881 (1.40 %)	22,566 (1.32 %)	n/a	44.09 (99.92 %)	4,254 (0.08 %)	5,157 (99.93 %)	5,202,709 (44.78 %)	1,059,544 (2.39 %)	13,897,372 (40.69 %)	119,691 (2.74 %)
567	rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 refseq) GCF_009806435.1	83,033 (4.16 %)	19,486 (1.31 %)	23,267 (1.31 %)	n/a	43.83 (97.68 %)	18,178 (2.32 %)	3,160 (100.00 %)	4,072,524 (21.41 %)	976,273 (2.33 %)	13,766,413 (39.76 %)	113,371 (2.46 %)
568	rabbit (primary hap 2024 refseq) GCF_964237555.1	95,289 (4.22 %)	19,385 (1.31 %)	22,631 (1.31 %)	n/a	44.02 (99.98 %)	2,276 (0.02 %)	221 (100.00 %)	4,099,586 (21.20 %)	1,062,900 (3.78 %)	13,416,814 (41.72 %)	116,523 (2.66 %)
569	rabbit (Thorbecke 2009 Broad refseq) GCF_000003625.3	43,642 (2.34 %)	18,665 (1.39 %)	20,095 (1.24 %)	n/a	43.75 (95.14 %)	80,789 (4.88 %)	84,024 (95.12 %)	4,890,480 (44.71 %)	883,939 (1.73 %)	13,254,520 (38.27 %)	110,337 (2.33 %)
570	raccoon dog (2021) GCF_905146905.1	52,577 (2.89 %)	19,628 (1.60 %)	20,274 (1.43 %)	n/a	41.28 (99.98 %)	70 (0.02 %)	811 (100.00 %)	4,499,368 (31.98 %)	1,005,212 (2.04 %)	13,884,201 (32.95 %)	52,450 (2.27 %)
571	Rambouillet sheep (Baylor 2017) GCF_002742125.1	50,083 (2.48 %)	19,992 (1.47 %)	22,506 (1.31 %)	41,290 (1.46 %)	41.91 (99.99 %)	4,847 (0.01 %)	7,486 (99.99 %)	5,764,757 (47.38 %)	507,629 (1.55 %)	14,138,601 (41.27 %)	51,748 (1.29 %)
572	Rambouillet sheep (U.Idaho 2021) GCF_016772045.1	70,461 (3.21 %)	19,413 (1.59 %)	21,222 (1.35 %)	n/a	41.99 (100.00 %)	84 (0.00 %)	142 (100.00 %)	5,300,958 (46.83 %)	455,553 (1.24 %)	13,023,443 (40.62 %)	43,959 (1.30 %)
573	ratel GCA_004024625.1	n/a	22,196 (1.21 %)	35,937 (1.18 %)	n/a	42.00 (99.85 %)	6,511 (0.02 %)	2,074,823 (99.98 %)	6,171,383 (41.93 %)	877,669 (1.49 %)	15,269,908 (41.22 %)	95,094 (1.91 %)
574	red bat GCA_004026805.1	n/a	27,510 (1.22 %)	65,467 (1.48 %)	n/a	42.69 (99.94 %)	6,380 (0.02 %)	525,280 (99.98 %)	4,644,227 (28.24 %)	1,170,868 (2.68 %)	15,628,238 (39.97 %)	125,564 (3.55 %)
575	red deer (2021) GCF_910594005.1	68,992 (2.68 %)	20,470 (1.48 %)	22,563 (1.32 %)	n/a	42.98 (100.00 %)	40 (0.00 %)	144 (100.00 %)	5,501,063 (44.60 %)	503,301 (12.23 %)	13,102,622 (44.55 %)	88,756 (1.66 %)
576	red deer (alternate hap 2021) GCA_910593805.1	n/a	18,817 (1.29 %)	21,916 (1.20 %)	n/a	44.23 (100.00 %)	22 (0.00 %)	4,021 (100.00 %)	3,279,005 (20.48 %)	472,706 (21.87 %)	11,466,609 (50.26 %)	128,858 (2.07 %)
577	red fox (BD-2025 2025) GCF_048418805.1	84,632 (3.45 %)	19,565 (1.57 %)	19,909 (1.38 %)	n/a	41.31 (100.00 %)	104 (0.00 %)	289 (100.00 %)	4,480,315 (31.76 %)	1,010,887 (2.70 %)	13,766,344 (33.12 %)	50,763 (2.22 %)
578	red fox (hap1 2024) GCA_964106825.2	n/a	19,622 (1.57 %)	20,371 (1.38 %)	n/a	41.34 (99.98 %)	1,845 (0.02 %)	461 (100.00 %)	4,519,485 (31.91 %)	1,018,114 (2.59 %)	13,810,284 (32.99 %)	52,053 (2.31 %)
579	red fox (hap2 2024) GCA_964106925.2	n/a	19,517 (1.57 %)	20,105 (1.37 %)	n/a	41.31 (99.99 %)	1,819 (0.02 %)	350 (100.00 %)	4,487,839 (31.79 %)	1,010,106 (2.64 %)	13,838,711 (33.07 %)	51,373 (2.26 %)
580	red fox (tameXaggressive cross 2018) GCF_003160815.1	43,508 (2.67 %)	19,826 (1.69 %)	18,893 (1.40 %)	n/a	41.08 (97.06 %)	246,167 (2.96 %)	82,424 (100.00 %)	4,919,102 (40.79 %)	954,461 (2.46 %)	14,190,625 (30.86 %)	53,204 (1.88 %)
581	reed vole (MF-2015 2020) GCF_014885135.2	55,722 (3.60 %)	19,808 (1.93 %)	20,787 (1.69 %)	n/a	42.36 (95.60 %)	67,118 (4.40 %)	10,460 (100.00 %)	3,130,955 (20.09 %)	831,969 (2.09 %)	11,985,657 (28.48 %)	18,764 (0.58 %)
582	Reeves' muntjac (alternate hap 2024) GCA_963930665.1	n/a	18,947 (1.29 %)	24,114 (1.28 %)	n/a	42.75 (100.00 %)	n/a	8,892 (100.00 %)	3,375,476 (23.21 %)	654,539 (6.64 %)	11,132,469 (48.29 %)	79,357 (2.66 %)
583	Reeves' muntjac (primary hap 2024) GCF_963930625.1	52,442 (2.57 %)	19,577 (1.52 %)	22,283 (1.38 %)	n/a	41.89 (99.99 %)	682 (0.01 %)	267 (100.00 %)	3,294,672 (23.89 %)	527,436 (2.98 %)	13,137,581 (39.89 %)	57,436 (1.81 %)
584	reindeer (2023) GCA_963422255.1	n/a	21,329 (1.58 %)	25,201 (1.59 %)	n/a	41.46 (98.35 %)	131,886 (1.65 %)	259,765 (98.35 %)	3,254,173 (23.49 %)	440,431 (2.00 %)	14,258,607 (36.17 %)	48,931 (1.20 %)
585	reindeer (US061 2019) GCA_004026565.1	n/a	24,150 (1.39 %)	39,911 (1.41 %)	n/a	42.08 (99.89 %)	4,769 (0.02 %)	1,365,508 (99.98 %)	6,083,178 (46.10 %)	546,470 (1.23 %)	14,434,855 (43.16 %)	55,319 (1.23 %)
586	Rice's whale (hap1 2023) GCA_028017805.1	n/a	19,396 (1.48 %)	21,693 (1.26 %)	n/a	41.62 (97.80 %)	131 (2.20 %)	1,039 (100.00 %)	3,973,936 (35.55 %)	987,571 (11.66 %)	12,473,459 (42.11 %)	74,971 (1.64 %)
587	Rice's whale (hap2 2023 refseq) GCF_028023285.1	59,888 (2.34 %)	19,291 (1.53 %)	21,195 (1.30 %)	n/a	41.44 (99.90 %)	334 (0.10 %)	774 (100.00 %)	3,917,923 (36.26 %)	828,521 (9.28 %)	12,518,796 (41.08 %)	73,126 (1.69 %)
588	Rickett's big-footed myotis (AB-2021 2024) GCA_036010255.1	n/a	18,982 (1.81 %)	22,002 (1.76 %)	n/a	43.12 (100.00 %)	n/a	105 (100.00 %)	2,909,847 (24.53 %)	757,964 (3.03 %)	10,561,925 (36.25 %)	57,318 (2.32 %)
589	Risso's dolphin (hap1.1 2024) GCA_964374135.1	n/a	18,825 (1.58 %)	20,986 (1.29 %)	n/a	42.25 (99.99 %)	1,138 (0.01 %)	1,150 (100.00 %)	4,405,513 (43.51 %)	1,342,544 (11.28 %)	12,274,096 (41.76 %)	76,936 (4.65 %)
590	Risso's dolphin (hap2.1 2024) GCA_964374185.1	n/a	18,061 (1.68 %)	20,080 (1.36 %)	n/a	41.97 (99.99 %)	1,073 (0.01 %)	2,135 (99.99 %)	3,948,427 (43.52 %)	848,222 (8.00 %)	11,527,950 (38.76 %)	70,117 (3.31 %)
591	root vole (2023) GCA_963919705.1	n/a	19,293 (1.92 %)	20,635 (1.67 %)	n/a	42.30 (100.00 %)	3 (0.00 %)	268 (100.00 %)	4,396,130 (38.90 %)	891,534 (2.66 %)	12,119,692 (31.39 %)	19,542 (0.63 %)
592	Ryukyu mouse (v2 2017) GCF_900094665.2	53,792 (2.85 %)	21,351 (2.29 %)	18,073 (1.39 %)	n/a	41.70 (89.05 %)	306,599 (10.98 %)	30,835 (92.70 %)	4,479,912 (35.83 %)	1,351,677 (2.59 %)	12,964,608 (27.49 %)	15,963 (0.43 %)
593	Saanen dairy goat GCA_015443085.1	n/a	19,257 (1.54 %)	21,221 (1.32 %)	n/a	42.30 (100.00 %)	170 (0.00 %)	1,362 (100.00 %)	5,336,862 (47.58 %)	515,161 (2.87 %)	13,144,895 (41.67 %)	58,623 (2.22 %)
594	saddleback dolphin (alternate hap 2023) GCA_949987525.1	n/a	18,509 (1.54 %)	22,514 (1.36 %)	n/a	41.95 (100.00 %)	1 (0.00 %)	7,427 (100.00 %)	3,675,922 (35.75 %)	950,374 (10.49 %)	11,670,399 (40.31 %)	63,587 (3.15 %)
595	saddleback dolphin (v1 primary hap 2023 refseq) GCF_949987515.1	46,746 (2.39 %)	18,624 (1.49 %)	20,662 (1.31 %)	n/a	42.06 (99.99 %)	968 (0.01 %)	630 (100.00 %)	4,020,676 (35.99 %)	1,259,549 (13.09 %)	12,359,748 (42.64 %)	66,179 (3.91 %)
596	saddleback dolphin (v2 primary hap 2024 refseq) GCF_949987515.2	46,014 (2.36 %)	18,616 (1.49 %)	20,618 (1.32 %)	n/a	42.06 (99.99 %)	968 (0.01 %)	1,598 (99.99 %)	4,020,525 (35.99 %)	1,258,165 (13.09 %)	12,359,758 (42.64 %)	66,188 (3.91 %)
597	saiga antelope GCA_004024985.1	n/a	23,736 (0.84 %)	55,133 (0.88 %)	n/a	42.52 (99.87 %)	2,867 (0.01 %)	1,775,066 (99.99 %)	6,485,113 (49.43 %)	447,097 (0.88 %)	13,972,753 (44.46 %)	46,883 (0.82 %)
598	Schreibers' long-fingered bat (US075 2019) GCA_004026525.1	n/a	20,147 (2.06 %)	31,271 (1.82 %)	n/a	42.27 (99.94 %)	6,918 (0.04 %)	184,538 (99.96 %)	2,772,932 (29.66 %)	366,782 (1.13 %)	10,477,531 (28.60 %)	62,520 (2.73 %)
599	Schreibers' long-fingered bat (v2 hap1 2025) GCA_964146895.2	n/a	18,109 (2.10 %)	21,263 (1.89 %)	n/a	42.51 (100.00 %)	140 (0.00 %)	186 (100.00 %)	2,812,261 (34.39 %)	457,565 (5.58 %)	10,220,083 (31.02 %)	59,522 (2.81 %)
600	Schreibers' long-fingered bat (v2 hap2 2025) GCA_964145185.2	n/a	17,286 (2.19 %)	20,474 (1.95 %)	n/a	42.64 (100.00 %)	86 (0.00 %)	254 (100.00 %)	2,610,773 (33.65 %)	389,844 (4.42 %)	9,728,138 (29.49 %)	56,508 (2.97 %)
601	scimitar-horned oryx GCF_014754425.2	51,527 (2.72 %)	19,713 (1.57 %)	21,928 (1.32 %)	n/a	41.74 (99.30 %)	16,241 (0.70 %)	9,089 (100.00 %)	5,435,109 (46.76 %)	414,279 (0.98 %)	13,490,956 (40.45 %)	42,961 (1.10 %)
602	Screaming hairy armadillo GCA_004027955.1	n/a	24,532 (0.39 %)	56,725 (0.46 %)	n/a	39.68 (99.70 %)	2,747 (0.01 %)	7,680,080 (99.99 %)	8,978,735 (36.02 %)	1,516,551 (1.58 %)	32,918,217 (47.67 %)	234,762 (1.56 %)
603	sea otter (GAN:26980312 2017 refseq) GCF_002288905.1	38,140 (2.17 %)	18,578 (1.64 %)	20,913 (1.44 %)	34,179 (1.77 %)	41.56 (98.79 %)	23,134 (1.21 %)	29,589 (98.79 %)	4,703,044 (41.42 %)	721,750 (1.39 %)	14,065,653 (32.89 %)	55,388 (1.87 %)
604	Seba's short-tailed bat GCA_004027735.1	n/a	21,878 (0.94 %)	55,858 (1.10 %)	n/a	42.70 (99.84 %)	3,864 (0.01 %)	1,929,203 (99.99 %)	3,802,235 (28.35 %)	606,320 (1.03 %)	15,171,250 (31.99 %)	118,227 (2.28 %)
605	sei whale (hap1.1 2025) GCA_965194805.1	n/a	19,292 (1.27 %)	21,865 (1.14 %)	n/a	41.99 (99.99 %)	1,179 (0.01 %)	2,572 (100.00 %)	4,525,289 (42.25 %)	1,097,216 (21.14 %)	12,203,884 (50.47 %)	80,128 (1.58 %)
606	sei whale (hap2.1 2025) GCA_965194725.1	n/a	19,313 (1.37 %)	21,662 (1.17 %)	n/a	41.68 (99.99 %)	1,066 (0.01 %)	2,917 (99.99 %)	4,418,625 (42.98 %)	875,114 (15.81 %)	12,360,254 (46.52 %)	78,537 (1.66 %)
607	sheep (hu hu3095 2024) GCA_040805955.1	n/a	19,388 (1.42 %)	21,612 (1.28 %)	n/a	43.17 (100.00 %)	n/a	28 (100.00 %)	5,311,536 (44.06 %)	653,238 (7.29 %)	12,937,231 (44.10 %)	63,230 (6.03 %)
608	sheep (OAR_USU_Benz2616 2023) GCF_016772045.2	89,680 (5.44 %)	19,308 (1.52 %)	21,506 (1.35 %)	n/a	42.01 (100.00 %)	84 (0.00 %)	143 (100.00 %)	3,275,767 (22.85 %)	464,346 (1.26 %)	12,987,607 (40.61 %)	44,477 (1.28 %)
609	sheep (Texel 2015) GCA_000298735.2	n/a	19,179 (1.56 %)	19,001 (1.26 %)	48,105 (1.85 %)	41.90 (98.94 %)	44,566 (1.07 %)	48,481 (98.93 %)	5,429,824 (46.13 %)	540,267 (1.64 %)	13,509,668 (38.83 %)	43,911 (1.13 %)
610	shrew mouse GCF_900095145.1	46,279 (2.64 %)	20,549 (2.23 %)	18,979 (1.49 %)	94,079 (3.98 %)	41.89 (90.53 %)	269,643 (9.50 %)	17,879 (93.73 %)	4,788,498 (38.32 %)	1,499,714 (3.03 %)	13,021,757 (27.83 %)	16,787 (0.47 %)
611	Siberian hamster (SSSS 2022) GCA_023856395.1	n/a	18,375 (1.83 %)	17,066 (1.44 %)	n/a	41.27 (99.64 %)	88,601 (0.37 %)	7,756 (100.00 %)	3,152,242 (21.63 %)	1,087,009 (2.64 %)	12,055,167 (29.20 %)	15,455 (0.48 %)
612	Siberian musk deer (BS20 2019 Broad) GCA_004024705.1	n/a	23,440 (1.32 %)	37,497 (1.19 %)	n/a	42.32 (99.86 %)	19,764 (0.07 %)	1,195,467 (99.93 %)	6,726,950 (49.79 %)	437,480 (1.57 %)	14,155,240 (46.22 %)	49,177 (1.05 %)
613	sika deer (Changchun, China MLH-2022 2023) GCA_034195675.1	n/a	20,087 (1.59 %)	23,556 (1.46 %)	n/a	41.66 (99.97 %)	1,724 (0.03 %)	1,889 (100.00 %)	3,925,148 (27.17 %)	419,490 (1.24 %)	13,364,988 (37.79 %)	47,630 (1.31 %)
614	small Madagascar hedgehog GCF_000313985.2	37,090 (1.93 %)	18,969 (1.19 %)	19,298 (1.31 %)	n/a	43.01 (88.43 %)	270,406 (11.60 %)	7,490 (100.00 %)	3,789,337 (28.89 %)	429,226 (0.87 %)	16,951,112 (32.23 %)	39,993 (0.70 %)
615	smoky shrew (2023) GCF_029834395.1	37,165 (1.66 %)	17,572 (1.06 %)	24,146 (1.29 %)	n/a	43.43 (100.00 %)	n/a	497 (100.00 %)	2,593,080 (14.11 %)	1,194,567 (7.25 %)	14,051,522 (48.20 %)	107,473 (2.80 %)
616	snow leopard (11264 2022) GCF_023721935.1	53,569 (3.37 %)	18,780 (1.67 %)	21,038 (1.40 %)	n/a	41.60 (99.30 %)	23,786 (0.70 %)	2,636 (100.00 %)	4,714,429 (34.93 %)	919,518 (1.59 %)	13,711,504 (33.24 %)	64,690 (2.41 %)
617	snowshoe hare GCA_004026855.1	n/a	23,263 (0.88 %)	55,811 (1.01 %)	n/a	44.12 (99.87 %)	10,153 (0.03 %)	1,602,982 (99.97 %)	4,767,120 (21.29 %)	1,040,992 (2.22 %)	15,680,144 (43.23 %)	126,152 (2.28 %)
618	social tuco-tuco GCA_004027165.1	n/a	25,166 (1.12 %)	41,316 (1.26 %)	n/a	40.71 (99.89 %)	16,191 (0.06 %)	823,762 (99.94 %)	5,390,906 (28.28 %)	1,027,922 (2.15 %)	15,241,308 (38.39 %)	31,883 (0.72 %)
619	Soft-furred tree mouse (WYS1704033 2022) GCA_023101885.1	n/a	20,505 (1.36 %)	25,606 (1.53 %)	n/a	42.21 (99.64 %)	3,794 (0.36 %)	1,243 (100.00 %)	5,973,279 (45.08 %)	1,551,851 (4.63 %)	13,570,249 (38.60 %)	73,762 (1.53 %)
620	soprano pipistrelle (alternate hap 2023) GCA_949987765.1	n/a	17,590 (1.81 %)	21,597 (1.85 %)	n/a	42.88 (100.00 %)	1 (0.00 %)	2,717 (100.00 %)	2,734,555 (21.46 %)	795,752 (6.56 %)	9,601,735 (36.35 %)	62,524 (3.25 %)
621	soprano pipistrelle (primary hap 2023) GCA_949987585.1	n/a	18,056 (1.78 %)	21,158 (1.79 %)	n/a	42.67 (100.00 %)	161 (0.00 %)	249 (100.00 %)	2,899,535 (21.64 %)	853,717 (7.80 %)	10,162,216 (37.72 %)	63,256 (3.06 %)
622	South African ground squirrel GCA_004024805.1	n/a	22,802 (1.44 %)	33,892 (1.27 %)	n/a	39.97 (99.92 %)	9,745 (0.04 %)	587,115 (99.96 %)	5,256,998 (34.93 %)	594,122 (1.27 %)	14,462,947 (33.96 %)	34,141 (0.80 %)
623	Southeastern Asian house mouse (2016) GCA_001624445.1	n/a	21,103 (2.24 %)	18,682 (1.45 %)	102,099 (4.16 %)	41.83 (86.23 %)	424,005 (13.83 %)	52,352 (97.85 %)	4,990,851 (39.88 %)	1,356,202 (2.67 %)	13,469,640 (26.15 %)	16,724 (0.41 %)
624	Southeastern Asian house mouse (2022) GCA_921999005.2	n/a	21,799 (2.13 %)	19,729 (1.40 %)	110,356 (4.43 %)	41.78 (99.19 %)	278 (0.81 %)	151 (100.00 %)	4,663,228 (40.41 %)	1,549,985 (3.70 %)	13,012,600 (34.99 %)	21,349 (0.52 %)
625	Southeastern Asian house mouse (T2T 2024) GCA_964188545.1	n/a	22,529 (1.85 %)	20,409 (1.22 %)	n/a	41.10 (99.90 %)	78 (0.10 %)	416 (99.90 %)	4,880,101 (47.77 %)	1,689,287 (15.13 %)	12,822,147 (42.92 %)	22,642 (0.54 %)
626	southern elephant seal GCF_011800145.1	53,210 (2.86 %)	19,520 (1.73 %)	20,727 (1.41 %)	39,634 (1.86 %)	41.45 (99.36 %)	22,850 (0.64 %)	1,115 (100.00 %)	4,728,105 (43.75 %)	585,443 (1.13 %)	13,463,979 (33.65 %)	53,182 (1.62 %)
627	southern grasshopper mouse (2020) GCF_903995425.1	47,152 (2.39 %)	19,356 (1.68 %)	18,821 (1.36 %)	n/a	41.81 (98.94 %)	2,143 (1.06 %)	2,949 (100.00 %)	4,850,460 (28.64 %)	1,195,836 (2.72 %)	13,540,762 (32.73 %)	18,046 (0.54 %)
628	southern multimammate mouse GCF_008632895.1	69,058 (3.04 %)	20,313 (2.11 %)	17,745 (1.38 %)	n/a	41.39 (91.90 %)	146,713 (8.12 %)	28 (100.00 %)	4,875,400 (38.43 %)	1,454,350 (2.93 %)	13,104,717 (28.82 %)	16,715 (0.45 %)
629	southern tamandua (mTamTet1 alternate hap 2022) GCA_023853755.1	n/a	20,179 (1.21 %)	24,249 (1.19 %)	n/a	39.54 (100.00 %)	4 (0.00 %)	7,866 (100.00 %)	3,953,031 (35.88 %)	531,111 (1.14 %)	16,354,874 (39.96 %)	59,907 (1.35 %)
630	southern tamandua (mTamTet1 primary hap 2022) GCA_023851605.1	n/a	20,058 (1.26 %)	22,196 (1.13 %)	n/a	39.48 (99.44 %)	961 (0.56 %)	201 (100.00 %)	4,037,291 (46.02 %)	593,019 (1.17 %)	18,033,833 (40.56 %)	65,039 (1.33 %)
631	southern tamandua (mTamTet1 primary hap 2022) GCF_023851605.1	84,279 (3.04 %)	20,960 (1.28 %)	22,188 (1.13 %)	n/a	39.48 (99.44 %)	961 (0.56 %)	200 (100.00 %)	4,793,649 (47.24 %)	593,018 (1.17 %)	18,033,318 (40.56 %)	65,039 (1.33 %)
632	southern three-banded armadillo GCA_004025125.1	n/a	29,138 (0.73 %)	56,522 (0.75 %)	n/a	39.20 (99.82 %)	15,801 (0.04 %)	2,941,308 (99.96 %)	6,990,740 (38.88 %)	839,452 (1.23 %)	24,805,397 (43.95 %)	71,951 (0.98 %)
633	southern two-toed sloth (mChoDid1 alternate hap 2020) GCA_015220265.1	n/a	22,897 (1.23 %)	27,007 (1.18 %)	n/a	39.87 (100.00 %)	70 (0.00 %)	12,050 (100.00 %)	4,502,020 (38.27 %)	576,759 (1.02 %)	17,143,050 (40.65 %)	51,339 (1.15 %)
634	southern two-toed sloth (mChoDid1 primary hap 2020) GCF_015220235.1	63,054 (2.39 %)	21,998 (1.29 %)	23,177 (1.18 %)	45,345 (1.69 %)	39.89 (97.48 %)	1,243 (2.52 %)	146 (100.00 %)	4,559,690 (39.66 %)	577,607 (1.02 %)	16,594,630 (40.50 %)	51,430 (1.14 %)
635	southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 refseq) GCF_000283155.1	37,037 (2.11 %)	18,398 (1.71 %)	19,753 (1.44 %)	n/a	40.90 (96.05 %)	54,737 (3.96 %)	57,824 (96.04 %)	3,685,898 (38.31 %)	421,694 (0.97 %)	14,765,529 (28.93 %)	36,281 (1.02 %)
636	Sowerby's beaked whale (hap1 2024) GCA_964165515.1	n/a	19,471 (1.39 %)	22,951 (1.24 %)	n/a	42.04 (99.99 %)	1,095 (0.01 %)	1,604 (100.00 %)	4,307,839 (34.31 %)	825,475 (10.97 %)	11,375,945 (45.31 %)	76,527 (3.10 %)
637	Sowerby's beaked whale (hap2 2024) GCA_964148845.1	n/a	18,591 (1.46 %)	21,588 (1.27 %)	n/a	42.00 (99.99 %)	974 (0.01 %)	2,126 (99.99 %)	3,961,403 (34.20 %)	742,897 (9.73 %)	10,832,739 (43.68 %)	70,803 (2.85 %)
638	Sowerby's beaked whale (US080 2019) GCA_004027085.1	n/a	22,800 (1.32 %)	38,247 (1.17 %)	n/a	41.68 (99.84 %)	8,597 (0.03 %)	1,810,317 (99.97 %)	5,520,986 (45.05 %)	1,081,962 (2.69 %)	13,480,261 (43.01 %)	69,001 (1.39 %)
639	sperm whale (SW-GA 2023) GCF_002837175.3	62,616 (2.83 %)	19,485 (1.75 %)	22,707 (1.41 %)	n/a	41.33 (95.82 %)	121,387 (4.20 %)	133,555 (95.80 %)	3,906,439 (36.43 %)	691,647 (2.39 %)	13,489,368 (32.95 %)	86,751 (2.23 %)
640	spotted-tailed quoll (Chaos hap1 2025) GCA_048593285.1	n/a	15,188 (0.80 %)	15,406 (0.90 %)	n/a	36.07 (99.97 %)	151 (0.03 %)	157 (99.97 %)	4,933,924 (23.65 %)	1,239,006 (2.76 %)	20,612,787 (41.98 %)	21,700 (0.64 %)
641	spotted-tailed quoll (Chaos hap2 2025) GCA_048593245.1	n/a	15,441 (0.80 %)	15,791 (0.92 %)	n/a	36.12 (99.99 %)	118 (0.01 %)	124 (99.99 %)	4,962,547 (23.62 %)	1,257,253 (2.87 %)	20,652,321 (42.01 %)	22,718 (0.69 %)
642	star-nosed mole GCF_000260355.1	30,444 (2.86 %)	16,116 (1.82 %)	17,403 (1.78 %)	n/a	41.55 (95.10 %)	82,557 (4.92 %)	84,595 (95.08 %)	1,855,039 (18.90 %)	308,473 (0.86 %)	9,571,561 (26.02 %)	48,079 (2.76 %)
643	Steller sea lion GCF_004028035.1	46,044 (2.38 %)	21,171 (1.78 %)	21,626 (1.43 %)	36,701 (1.75 %)	41.38 (99.41 %)	18,994 (0.59 %)	24,485 (99.41 %)	4,556,415 (43.53 %)	577,797 (1.09 %)	13,545,012 (33.71 %)	51,355 (1.45 %)
644	Stephens's kangaroo rat GCA_004024685.1	n/a	20,638 (1.19 %)	43,541 (1.37 %)	n/a	41.90 (99.85 %)	8,882 (0.04 %)	1,278,525 (99.96 %)	4,886,095 (30.36 %)	1,229,832 (5.30 %)	11,334,494 (44.33 %)	38,450 (1.17 %)
645	steppe mouse (ZRU 2018) GCA_003336285.1	n/a	22,032 (2.17 %)	20,891 (1.41 %)	n/a	41.70 (95.78 %)	123,681 (4.24 %)	161,217 (95.76 %)	4,964,415 (42.35 %)	1,414,584 (2.75 %)	12,989,925 (31.80 %)	17,544 (0.44 %)
646	Stoliczka's trident bat (China 2021113_DDA primary hap 2024) GCA_043727835.1	n/a	19,605 (1.80 %)	20,075 (1.48 %)	n/a	41.32 (100.00 %)	87 (0.00 %)	80 (100.00 %)	4,110,913 (40.46 %)	838,212 (2.48 %)	11,938,168 (33.52 %)	40,424 (1.32 %)
647	straw-colored fruit bat GCA_000465285.1	n/a	20,161 (1.66 %)	40,283 (1.50 %)	n/a	39.24 (99.62 %)	154,908 (0.40 %)	288,446 (99.60 %)	2,814,732 (32.92 %)	372,539 (1.01 %)	12,351,823 (25.93 %)	67,245 (2.34 %)
648	stripe-headed round-eared bat GCA_004024845.1	n/a	20,248 (1.62 %)	29,173 (1.61 %)	n/a	42.04 (99.96 %)	2,860 (0.01 %)	252,670 (99.99 %)	3,018,746 (29.48 %)	333,243 (0.74 %)	12,128,116 (30.51 %)	59,513 (1.87 %)
649	striped dolphin (alternate hap 2023) GCA_951394445.1	n/a	18,204 (1.54 %)	21,036 (1.34 %)	n/a	42.07 (100.00 %)	n/a	3,464 (100.00 %)	3,767,720 (35.65 %)	1,102,723 (10.92 %)	11,794,617 (40.96 %)	67,537 (3.57 %)
650	striped dolphin (primary hap 2023) GCA_951394435.1	n/a	18,595 (1.48 %)	20,637 (1.29 %)	n/a	42.18 (99.99 %)	993 (0.01 %)	639 (100.00 %)	4,097,623 (35.88 %)	1,442,973 (13.60 %)	12,327,244 (43.08 %)	68,498 (4.29 %)
651	striped hyena (BS54 2019 Broad) GCA_004023945.1	n/a	22,373 (1.45 %)	39,382 (1.45 %)	n/a	41.66 (99.93 %)	11,849 (0.05 %)	362,072 (99.95 %)	5,048,667 (42.42 %)	712,073 (1.24 %)	13,879,012 (34.58 %)	69,835 (2.20 %)
652	striped hyena (Hyena2069 2018 Potsdam U) GCF_003009895.1	48,870 (2.41 %)	18,793 (1.67 %)	20,950 (1.44 %)	n/a	41.56 (99.29 %)	23,058 (0.71 %)	5,761 (100.00 %)	4,782,500 (41.88 %)	701,157 (1.32 %)	13,436,624 (33.05 %)	58,977 (2.20 %)
653	sugar glider (PSGF00001 2023) GCA_028583685.1	n/a	19,326 (0.81 %)	17,560 (0.95 %)	n/a	38.95 (98.12 %)	85,933 (1.89 %)	1,895 (100.00 %)	6,382,198 (27.07 %)	1,058,207 (1.74 %)	22,508,040 (39.84 %)	16,224 (0.33 %)
654	sugar glider (PSGF00001 2023) GCF_028583685.1	55,990 (2.41 %)	19,328 (0.81 %)	17,559 (0.95 %)	n/a	38.95 (98.12 %)	85,933 (1.89 %)	1,896 (100.00 %)	6,382,203 (27.07 %)	1,058,208 (1.74 %)	22,508,106 (39.84 %)	16,224 (0.33 %)
655	Sumatran rhinoceros (Ipuh 2017) GCA_002844835.1	n/a	20,368 (1.53 %)	24,204 (1.23 %)	n/a	41.05 (95.54 %)	50,876 (4.40 %)	1,112,463 (95.60 %)	4,516,240 (39.90 %)	561,540 (1.56 %)	15,821,451 (34.68 %)	45,201 (1.03 %)
656	Sumatran serow (serow.1 2024) GCF_032405125.1	36,400 (1.65 %)	19,192 (1.42 %)	22,014 (1.41 %)	n/a	43.08 (100.00 %)	6 (0.00 %)	159 (100.00 %)	3,242,768 (21.18 %)	612,565 (8.05 %)	12,812,990 (44.37 %)	75,177 (5.86 %)
657	Sunda flying lemur (2014 WashU) GCF_000696425.1	34,734 (1.83 %)	21,356 (1.55 %)	25,832 (1.21 %)	n/a	40.21 (87.96 %)	412,608 (12.07 %)	511,878 (87.93 %)	4,961,153 (38.35 %)	854,441 (3.33 %)	17,562,576 (28.82 %)	82,988 (1.05 %)
658	Sunda flying lemur (US047 2019 Broad) GCA_004027255.1	n/a	24,882 (1.29 %)	43,546 (1.12 %)	n/a	40.46 (99.88 %)	5,895 (0.02 %)	1,655,642 (99.98 %)	5,807,241 (38.62 %)	953,765 (2.48 %)	18,836,777 (37.68 %)	114,955 (1.43 %)
659	tailed tailless bat GCA_004027475.1	n/a	19,920 (1.58 %)	28,017 (1.58 %)	n/a	41.76 (99.95 %)	4,640 (0.02 %)	341,895 (99.98 %)	3,139,817 (30.43 %)	381,536 (0.81 %)	12,069,229 (32.73 %)	54,528 (2.15 %)
660	tailess tenrec (hap1 2025) GCF_050624435.1	45,770 (1.60 %)	21,323 (0.86 %)	25,223 (1.02 %)	n/a	44.80 (100.00 %)	175 (0.00 %)	2,180 (100.00 %)	5,633,466 (38.91 %)	1,001,072 (14.26 %)	17,866,411 (50.04 %)	53,320 (1.01 %)
661	takin (Tak-1 2022) GCF_023091745.1	31,927 (1.65 %)	19,290 (1.42 %)	21,656 (1.27 %)	n/a	43.32 (100.00 %)	152 (0.00 %)	1,363 (100.00 %)	3,256,033 (21.01 %)	714,375 (8.32 %)	13,010,154 (44.58 %)	49,134 (7.43 %)
662	Talazac's shrew tenrec GCA_004026705.1	n/a	22,605 (0.81 %)	50,725 (1.09 %)	n/a	43.03 (99.93 %)	6,619 (0.02 %)	795,514 (99.98 %)	3,493,378 (14.58 %)	705,274 (1.31 %)	20,975,335 (36.85 %)	70,793 (1.26 %)
663	tammar wallaby (alternate hap 2023) GCA_028389975.1	n/a	11,133 (0.77 %)	13,869 (0.98 %)	n/a	38.63 (100.00 %)	2 (0.00 %)	14,285 (100.00 %)	3,114,522 (26.10 %)	661,874 (3.02 %)	11,667,649 (38.41 %)	12,393 (0.46 %)
664	tammar wallaby (Barry hap1 2025) GCA_048593335.1	n/a	17,491 (0.79 %)	15,701 (0.88 %)	n/a	38.69 (100.00 %)	32 (0.00 %)	40 (100.00 %)	5,762,317 (26.52 %)	1,078,692 (1.83 %)	22,476,051 (38.99 %)	22,756 (0.48 %)
665	tammar wallaby (Barry hap2 2025) GCA_048593345.1	n/a	17,037 (0.79 %)	15,066 (0.87 %)	n/a	38.62 (100.00 %)	16 (0.00 %)	24 (100.00 %)	5,608,153 (26.57 %)	1,050,173 (1.77 %)	21,856,273 (38.96 %)	21,811 (0.47 %)
666	tammar wallaby (v2 primary hap 2023 refseq) GCF_028372415.1	73,219 (3.07 %)	17,615 (0.77 %)	15,415 (0.86 %)	n/a	38.73 (99.81 %)	515 (0.19 %)	272 (100.00 %)	5,866,314 (26.30 %)	1,193,604 (2.72 %)	22,677,480 (39.53 %)	23,590 (0.47 %)
667	Tasmanian devil (McLovin hap1 2025) GCA_048593225.1	n/a	15,725 (0.77 %)	16,721 (0.92 %)	n/a	36.17 (99.49 %)	1,514 (0.51 %)	1,521 (99.49 %)	5,222,976 (23.42 %)	1,357,438 (3.95 %)	21,705,122 (42.26 %)	24,443 (0.70 %)
668	Tasmanian devil (McLovin hap2 2025) GCA_048593325.1	n/a	15,165 (0.76 %)	15,663 (0.91 %)	n/a	36.00 (99.11 %)	2,578 (0.89 %)	2,584 (99.11 %)	5,039,957 (23.64 %)	1,257,168 (2.97 %)	20,893,744 (41.44 %)	22,574 (0.67 %)
669	Tasmanian devil (primary hap 2019) GCF_902635505.1	52,070 (2.36 %)	15,918 (0.85 %)	16,111 (0.91 %)	n/a	36.16 (100.00 %)	354 (0.00 %)	106 (100.00 %)	6,789,158 (44.28 %)	1,246,027 (2.19 %)	21,434,803 (41.20 %)	23,609 (0.65 %)
670	thirteen-lined ground squirrel (2021 HiC) GCF_016881025.1	69,352 (3.50 %)	18,934 (1.68 %)	16,775 (1.37 %)	n/a	39.91 (93.25 %)	146,412 (6.77 %)	7,132 (100.00 %)	4,262,890 (35.64 %)	640,624 (1.64 %)	14,118,452 (27.90 %)	28,317 (0.64 %)
671	thirteen-lined ground squirrel (mIctTri1hap1 2025) GCF_052094955.1	91,025 (3.74 %)	19,425 (1.31 %)	20,977 (1.20 %)	n/a	40.31 (99.99 %)	1,444 (0.01 %)	5,279 (100.00 %)	6,062,154 (43.45 %)	940,716 (10.02 %)	16,322,064 (37.64 %)	34,544 (0.73 %)
672	Tibetan sand fox (lyu1992 2022) GCA_024500485.1	n/a	19,552 (1.59 %)	19,307 (1.35 %)	n/a	41.25 (100.00 %)	145 (0.00 %)	234 (100.00 %)	4,500,832 (32.18 %)	999,068 (2.01 %)	13,646,015 (32.98 %)	49,402 (2.19 %)
673	tiger GCF_018350195.1	71,226 (2.84 %)	18,513 (1.68 %)	19,919 (1.39 %)	n/a	41.64 (100.00 %)	65 (0.00 %)	131 (100.00 %)	4,878,003 (42.77 %)	912,595 (1.82 %)	13,804,650 (33.76 %)	64,312 (2.55 %)
674	Townsend's big-eared bat (haplotype 1 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022) GCA_026230055.1	n/a	19,370 (1.77 %)	21,062 (1.61 %)	n/a	42.81 (100.00 %)	219 (0.00 %)	610 (100.00 %)	2,923,694 (25.49 %)	772,382 (3.25 %)	10,654,074 (37.41 %)	48,226 (2.42 %)
675	Townsend's big-eared bat (haplotype 2 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022) GCA_026230045.1	n/a	18,627 (1.82 %)	20,108 (1.67 %)	n/a	42.95 (100.00 %)	217 (0.00 %)	182 (100.00 %)	2,733,927 (24.79 %)	715,258 (3.17 %)	10,099,456 (36.35 %)	47,139 (2.58 %)
676	Transcaucasian mole vole GCA_001685075.1	n/a	20,173 (1.62 %)	18,627 (1.30 %)	n/a	41.51 (96.09 %)	440,846 (3.96 %)	499,269 (96.04 %)	3,827,136 (25.51 %)	810,597 (2.65 %)	13,634,524 (27.54 %)	9,596 (0.16 %)
677	trefoil horseshoe bat (Malaysia primary hap 2024) GCA_043728145.1	n/a	18,871 (1.79 %)	20,351 (1.55 %)	n/a	40.66 (99.99 %)	397 (0.01 %)	136 (100.00 %)	3,580,957 (40.75 %)	683,947 (2.19 %)	11,464,418 (33.39 %)	37,175 (1.31 %)
678	True's beaked whale (hap1.1 2024) GCA_964341445.1	n/a	19,530 (1.21 %)	24,576 (1.13 %)	n/a	42.48 (99.99 %)	1,240 (0.01 %)	2,757 (100.00 %)	4,847,855 (34.88 %)	949,927 (20.01 %)	10,981,914 (51.51 %)	91,880 (2.74 %)
679	True's beaked whale (hap2.1 2024) GCA_964341485.1	n/a	19,313 (1.40 %)	22,642 (1.25 %)	n/a	42.03 (99.99 %)	1,073 (0.01 %)	2,457 (99.99 %)	4,540,507 (37.61 %)	826,104 (12.82 %)	11,296,445 (45.25 %)	80,840 (2.24 %)
680	Upper Galilee mountains blind mole rat (2095 2014 refseq) GCF_000622305.1	54,680 (2.07 %)	19,704 (1.26 %)	21,262 (1.20 %)	n/a	41.26 (95.18 %)	201,121 (4.83 %)	356,097 (95.17 %)	6,165,645 (34.95 %)	1,197,750 (2.77 %)	16,282,383 (36.21 %)	22,905 (0.49 %)
681	Vancouver Island marmot (RANI-1049 2019) GCA_005458795.1	n/a	19,867 (1.62 %)	15,893 (1.33 %)	n/a	39.77 (94.43 %)	296,819 (5.60 %)	315,631 (94.40 %)	4,452,628 (33.94 %)	751,210 (1.84 %)	13,917,879 (30.08 %)	26,541 (0.58 %)
682	vaquita (alternate hap mPhoSin1 2019) GCA_008692045.1	n/a	9,367 (1.66 %)	11,297 (1.30 %)	n/a	41.50 (100.00 %)	1 (0.00 %)	9,470 (100.00 %)	1,708,360 (43.81 %)	267,584 (1.67 %)	5,373,410 (33.52 %)	29,783 (1.94 %)
683	vaquita (mPhoSin1 2019) GCF_008692025.1	60,106 (3.00 %)	18,611 (1.76 %)	20,103 (1.39 %)	35,176 (2.22 %)	41.36 (99.66 %)	212 (0.34 %)	64 (100.00 %)	4,067,454 (44.25 %)	602,407 (1.34 %)	12,468,582 (35.55 %)	66,806 (1.79 %)
684	water buffalo (Mediterranean 2018) GCF_003121395.1	69,771 (3.14 %)	19,465 (1.58 %)	21,849 (1.37 %)	46,051 (1.86 %)	41.81 (99.99 %)	410 (0.01 %)	509 (100.00 %)	5,407,697 (47.11 %)	473,976 (1.54 %)	13,015,899 (41.23 %)	43,120 (1.15 %)
685	water buffalo (Murrah 2021) GCF_019923935.1	80,565 (3.26 %)	19,402 (1.59 %)	20,375 (1.31 %)	n/a	41.75 (100.00 %)	659 (0.00 %)	26 (100.00 %)	5,358,548 (47.11 %)	447,338 (1.14 %)	13,034,537 (41.28 %)	40,189 (1.07 %)
686	water vole (JQ59JK4JDI 2023) GCA_019206885.2	n/a	18,401 (2.03 %)	18,085 (1.65 %)	n/a	42.19 (89.99 %)	161,581 (10.04 %)	2,585 (100.00 %)	4,771,963 (38.17 %)	705,400 (1.96 %)	11,410,837 (25.00 %)	16,195 (0.52 %)
687	Weddell seal (WS11-02 2013 refseq) GCF_000349705.1	48,264 (2.73 %)	21,063 (1.73 %)	22,333 (1.43 %)	n/a	41.39 (70.44 %)	152,836 (29.58 %)	169,547 (70.42 %)	4,420,479 (41.72 %)	471,256 (0.66 %)	13,410,237 (22.09 %)	48,738 (1.01 %)
688	western European hedgehog (2012 refseq) GCF_000296755.1	29,923 (1.67 %)	18,067 (1.33 %)	19,777 (1.35 %)	n/a	41.54 (85.94 %)	219,764 (14.09 %)	225,567 (85.91 %)	6,594,783 (45.66 %)	1,271,533 (2.29 %)	12,374,161 (42.02 %)	28,528 (0.71 %)
689	western European hedgehog (alternate hap 2023) GCA_950295305.1	n/a	14,370 (1.06 %)	24,297 (1.27 %)	n/a	42.08 (100.00 %)	1 (0.00 %)	26,601 (100.00 %)	3,360,923 (19.59 %)	1,043,098 (3.92 %)	8,511,380 (53.68 %)	23,321 (0.97 %)
690	western European hedgehog (primary hap 2023 refseq) GCF_950295315.1	61,103 (2.36 %)	18,125 (1.16 %)	20,689 (1.21 %)	n/a	42.00 (99.97 %)	3,760 (0.03 %)	1,174 (100.00 %)	4,891,329 (19.68 %)	1,507,929 (3.81 %)	12,571,105 (54.50 %)	32,667 (0.90 %)
691	western European house mouse (WSB_EiJ v3 2022) GCA_921998345.2	n/a	21,722 (2.14 %)	19,586 (1.39 %)	108,856 (4.46 %)	41.81 (98.87 %)	1,233 (1.13 %)	233 (100.00 %)	4,634,551 (40.61 %)	1,541,826 (3.49 %)	13,030,566 (35.21 %)	22,985 (0.56 %)
692	western roe deer (2023) GCA_951849835.1	n/a	20,291 (1.29 %)	23,555 (1.23 %)	n/a	42.31 (100.00 %)	n/a	212 (100.00 %)	4,204,612 (25.49 %)	848,463 (7.79 %)	12,687,776 (48.28 %)	57,315 (1.25 %)
693	western spotted skunk GCA_004023965.1	n/a	21,665 (1.46 %)	34,370 (1.32 %)	n/a	41.61 (99.92 %)	11,822 (0.05 %)	433,831 (99.95 %)	4,889,781 (40.77 %)	901,906 (2.30 %)	13,931,764 (34.80 %)	54,394 (1.54 %)
694	western wild mouse (SPRET_EiJ v3 2022) GCA_921997135.2	n/a	21,699 (2.10 %)	18,837 (1.32 %)	n/a	41.69 (99.51 %)	1,576 (0.49 %)	143 (100.00 %)	4,507,329 (41.24 %)	1,517,241 (3.77 %)	12,832,499 (36.17 %)	22,568 (0.53 %)
695	whiskered bat (hap1 2024) GCA_964094495.2	n/a	19,504 (1.78 %)	22,272 (1.73 %)	n/a	42.99 (99.99 %)	1,566 (0.02 %)	533 (100.00 %)	3,046,246 (25.06 %)	753,151 (4.86 %)	10,596,418 (37.62 %)	66,785 (2.55 %)
696	whiskered bat (hap2 2024) GCA_964195625.1	n/a	18,681 (1.83 %)	21,523 (1.79 %)	n/a	43.13 (99.99 %)	1,414 (0.01 %)	1,741 (99.99 %)	2,849,223 (24.50 %)	688,594 (4.80 %)	9,968,980 (36.80 %)	64,365 (2.68 %)
697	white-beaked dolphin (alternate hap 2023) GCA_949774935.1	n/a	17,639 (1.50 %)	25,684 (1.35 %)	n/a	42.08 (100.00 %)	n/a	25,619 (100.00 %)	3,039,324 (36.05 %)	637,912 (8.02 %)	9,746,398 (38.98 %)	56,325 (3.33 %)
698	white-beaked dolphin (primary hap 2023 refseq) GCF_949774975.1	59,995 (2.43 %)	18,737 (1.57 %)	20,767 (1.34 %)	n/a	41.91 (99.99 %)	1,070 (0.01 %)	410 (100.00 %)	3,820,566 (36.21 %)	922,103 (8.43 %)	12,304,360 (39.74 %)	68,551 (3.58 %)
699	white-footed mouse (LL stock 2020) GCF_004664715.2	54,479 (2.82 %)	19,971 (1.69 %)	20,132 (1.42 %)	n/a	42.23 (99.95 %)	2,299 (0.05 %)	1,857 (100.00 %)	5,060,487 (30.71 %)	1,258,073 (2.85 %)	14,007,098 (32.99 %)	23,456 (0.67 %)
700	white-tailed deer (Illinois 20LAN1187 2024) GCF_023699985.2	68,660 (3.60 %)	19,951 (1.73 %)	21,804 (1.48 %)	n/a	41.56 (100.00 %)	294 (0.00 %)	718 (100.00 %)	4,512,173 (43.10 %)	402,481 (1.14 %)	12,813,223 (37.56 %)	45,863 (1.30 %)
701	white-tailed deer (Pink-7 2017 refseq) GCF_002102435.1	57,787 (2.93 %)	20,661 (1.75 %)	23,085 (1.50 %)	40,987 (1.94 %)	41.55 (99.10 %)	107,058 (0.91 %)	48,653 (99.10 %)	4,800,704 (41.29 %)	413,129 (2.59 %)	13,296,779 (34.22 %)	44,165 (1.19 %)
702	white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 alternate hap 2022) GCA_024140225.1	n/a	12,198 (1.10 %)	18,494 (1.29 %)	n/a	39.87 (100.00 %)	26 (0.00 %)	14,841 (100.00 %)	1,725,021 (17.81 %)	802,415 (4.26 %)	8,321,474 (45.72 %)	15,669 (0.79 %)
703	white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 primary hap 2022) GCF_024139225.1	40,430 (1.81 %)	17,575 (1.21 %)	21,880 (1.35 %)	47,496 (1.55 %)	39.81 (99.57 %)	1,010 (0.43 %)	147 (100.00 %)	2,846,063 (18.57 %)	1,252,362 (3.89 %)	13,776,063 (46.50 %)	24,589 (0.78 %)
704	wild Bactrian camel (BCGSAC Cfer 1.0 YT-003-E 2020) GCF_009834535.1	70,235 (4.11 %)	18,202 (1.93 %)	20,199 (1.66 %)	42,728 (2.35 %)	41.66 (99.99 %)	2,345 (0.01 %)	2,043 (100.00 %)	3,091,018 (33.31 %)	332,720 (5.33 %)	12,161,286 (28.79 %)	55,524 (1.75 %)
705	wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 refseq) GCF_000311805.1	34,726 (2.40 %)	18,746 (1.96 %)	17,104 (1.61 %)	n/a	41.28 (98.83 %)	60,971 (1.18 %)	68,872 (98.82 %)	2,991,821 (33.93 %)	353,632 (1.23 %)	12,349,615 (25.12 %)	45,437 (1.02 %)
706	wild goat GCA_000978405.1	n/a	19,104 (1.48 %)	16,198 (1.21 %)	n/a	41.91 (91.72 %)	279,195 (8.31 %)	368,693 (91.69 %)	5,563,294 (45.39 %)	452,402 (1.99 %)	13,802,376 (35.47 %)	41,935 (0.63 %)
707	wild yak (GX-2022 2023) GCF_027580195.1	52,505 (2.90 %)	19,278 (1.60 %)	20,813 (1.31 %)	n/a	41.87 (100.00 %)	196 (0.00 %)	2,040 (100.00 %)	5,706,841 (46.71 %)	464,013 (1.82 %)	12,973,198 (41.46 %)	42,508 (1.32 %)
708	wild yak (yakQH1 2013) GCF_000298355.1	29,789 (1.92 %)	19,936 (1.62 %)	19,914 (1.32 %)	n/a	41.71 (95.48 %)	192,006 (4.54 %)	233,198 (95.46 %)	5,348,663 (46.08 %)	449,880 (1.38 %)	13,572,902 (36.62 %)	41,147 (0.82 %)
709	winter white dwarf (Siberian hamster Psun_Stras_1 2023) GCA_030556225.1	n/a	18,177 (1.88 %)	18,942 (1.54 %)	n/a	41.50 (100.00 %)	1 (0.00 %)	742 (100.00 %)	5,398,126 (39.36 %)	1,168,723 (3.56 %)	12,272,233 (30.38 %)	18,332 (0.60 %)
710	woodchuck (v1.1 L192 2022) GCF_021218885.2	68,030 (3.47 %)	19,116 (1.55 %)	21,017 (1.38 %)	n/a	39.92 (100.00 %)	47 (0.00 %)	3,380 (100.00 %)	5,285,788 (43.20 %)	912,552 (2.73 %)	14,538,866 (35.15 %)	36,914 (1.02 %)
711	woodland dormouse GCA_004027655.1	n/a	23,556 (1.09 %)	55,517 (1.33 %)	n/a	41.52 (99.86 %)	15,691 (0.06 %)	1,283,630 (99.94 %)	7,674,195 (34.99 %)	1,698,258 (3.76 %)	13,705,886 (42.23 %)	68,562 (1.41 %)
712	woodland thicket rat GCF_004785775.1	43,129 (2.40 %)	22,710 (2.13 %)	21,042 (1.49 %)	n/a	41.17 (98.57 %)	76,623 (1.44 %)	23,656 (100.00 %)	4,732,544 (38.04 %)	1,424,025 (3.23 %)	13,549,399 (30.42 %)	18,232 (0.48 %)
713	woolly hare (The Qinghai-Tibet Plateau SH-2023 2024) GCA_036325905.1	n/a	19,363 (1.28 %)	22,239 (1.28 %)	n/a	44.08 (100.00 %)	240 (0.00 %)	112 (100.00 %)	4,432,114 (42.23 %)	966,165 (7.11 %)	13,263,822 (43.77 %)	96,755 (2.28 %)
714	Yangtze finless porpoise (v2 wild 2018 refseq) GCF_003031525.2	43,310 (2.49 %)	18,747 (1.81 %)	19,638 (1.46 %)	n/a	41.28 (99.29 %)	52,647 (0.72 %)	66,343 (99.28 %)	3,547,466 (35.83 %)	540,760 (1.65 %)	12,691,756 (32.88 %)	59,050 (1.48 %)
715	Yangtze River dolphin (v1.1 BGI 2013 refseq) GCF_000442215.2	26,128 (1.61 %)	18,978 (1.74 %)	20,661 (1.39 %)	n/a	41.24 (98.69 %)	123,788 (1.33 %)	148,598 (98.67 %)	3,788,303 (37.04 %)	690,288 (1.96 %)	12,841,906 (35.04 %)	62,458 (1.54 %)
716	yellow-bellied marmot (hap1 2025 refseq) GCF_047511675.1	55,299 (2.52 %)	19,502 (1.44 %)	20,297 (1.34 %)	n/a	39.90 (100.00 %)	330 (0.00 %)	813 (100.00 %)	4,038,893 (29.07 %)	978,915 (3.28 %)	14,404,633 (34.97 %)	36,674 (1.05 %)
717	yellow-bellied marmot (hap2 2025) GCA_047512175.1	n/a	18,677 (1.51 %)	19,370 (1.40 %)	n/a	40.03 (100.00 %)	307 (0.00 %)	329 (100.00 %)	3,694,109 (28.05 %)	793,102 (2.43 %)	13,585,913 (33.39 %)	33,990 (1.02 %)
718	yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.1 2019) GCF_003676075.3	42,667 (2.16 %)	19,547 (1.52 %)	21,406 (1.40 %)	n/a	39.89 (97.96 %)	35,509 (2.04 %)	66,442 (97.96 %)	3,814,223 (27.39 %)	800,865 (1.96 %)	14,323,977 (32.63 %)	34,122 (0.91 %)
719	yellow-footed antechinus (v2 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021) GCF_016432865.1	47,618 (2.51 %)	15,703 (0.78 %)	16,155 (0.90 %)	n/a	36.21 (99.99 %)	620 (0.01 %)	486 (100.00 %)	5,191,383 (23.81 %)	1,269,772 (2.59 %)	21,430,585 (42.69 %)	28,118 (0.66 %)
720	yellow-spotted hyrax GCA_004026845.1	n/a	20,424 (0.86 %)	43,984 (1.27 %)	n/a	40.93 (99.94 %)	3,815 (0.01 %)	971,748 (99.99 %)	5,365,974 (31.41 %)	435,699 (1.22 %)	21,229,266 (45.17 %)	38,521 (0.68 %)
721	yellow-spotted hyrax (mHetBru1 2023) GCA_028571685.1	n/a	17,610 (1.00 %)	20,322 (1.04 %)	n/a	40.80 (100.00 %)	276 (0.00 %)	62 (100.00 %)	3,295,935 (23.58 %)	389,907 (6.37 %)	19,525,382 (45.90 %)	31,831 (0.63 %)
722	yellow-spotted hyrax (mHetBru1 alternate hap 2023) GCA_028571665.1	n/a	16,320 (1.03 %)	20,318 (1.13 %)	n/a	40.93 (100.00 %)	1 (0.00 %)	4,169 (100.00 %)	2,911,332 (23.50 %)	347,110 (4.57 %)	17,256,419 (44.04 %)	28,674 (0.68 %)
723	Yong Hoi Sen's woolly horseshoe bat (Malaysia 20210929_DDd primary hap 2024) GCA_043880425.1	n/a	18,352 (1.71 %)	20,233 (1.46 %)	n/a	41.73 (100.00 %)	196 (0.00 %)	1,530 (100.00 %)	3,466,695 (41.95 %)	934,524 (8.81 %)	11,690,112 (36.30 %)	35,257 (5.20 %)
724	Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP alternate hap 2023) GCA_028536395.1	n/a	19,188 (1.79 %)	21,673 (1.72 %)	n/a	43.03 (100.00 %)	215 (0.00 %)	250 (100.00 %)	3,043,589 (24.76 %)	773,853 (4.49 %)	10,648,494 (37.26 %)	61,910 (2.52 %)
725	Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP primary hap 2023 refseq) GCF_028538775.1	48,707 (3.25 %)	18,807 (1.93 %)	21,046 (1.76 %)	n/a	43.22 (100.00 %)	209 (0.00 %)	684 (100.00 %)	3,552,235 (38.46 %)	719,552 (4.26 %)	10,089,365 (36.35 %)	60,974 (2.61 %)
726	zebu cattle (Hainan HN024 2024) GCA_039881165.1	n/a	19,162 (1.53 %)	20,991 (1.34 %)	n/a	41.77 (99.99 %)	350 (0.01 %)	292 (100.00 %)	3,296,209 (23.14 %)	440,574 (1.28 %)	12,824,144 (40.98 %)	39,400 (1.07 %)
727	zebu cattle (Nelore 2014 refseq) GCF_000247795.1	39,830 (2.52 %)	18,603 (1.59 %)	18,779 (1.29 %)	n/a	41.75 (92.62 %)	6,941,272 (7.66 %)	253,770 (92.59 %)	5,119,428 (46.84 %)	358,908 (0.88 %)	13,431,672 (36.60 %)	35,241 (0.84 %)
728	zebu cattle (Sahiwal x Tharparkar maternal NIAB-ARS_2022 2023) GCF_029378745.1	70,745 (4.27 %)	19,546 (1.58 %)	21,187 (1.33 %)	n/a	41.86 (100.00 %)	283 (0.00 %)	67 (100.00 %)	5,530,890 (46.61 %)	459,827 (1.43 %)	13,190,355 (41.36 %)	42,544 (1.21 %)
TOTALS:	total assembly count 728

Additional hubs with collections of assemblies
Collection	Hub index pages:	Assembly statistics:	Track statistics:
Primates	605 assemblies	assembly stats	track stats
Mammals	728 assemblies	assembly stats	track stats
Birds	454 assemblies	assembly stats	track stats
Fishes	527 assemblies	assembly stats	track stats
other vertebrates	350 assemblies	assembly stats	track stats
Invertebrates	1558 assemblies	assembly stats	track stats
Plants	439 assemblies	assembly stats	track stats
Fungi	3998 assemblies	assembly stats	track stats
Viruses	15045 assemblies	assembly stats	track stats
Archaea	2702 assemblies	assembly stats	track stats
Bacteria	22330 assemblies	assembly stats	track stats
legacy/superseded	687 assemblies	assembly stats	track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project	1303 assemblies	assembly stats	track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project	126 assemblies	assembly stats	track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium	464 assemblies	assembly stats	track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center	5058 assemblies	assembly stats	track stats

Mammals Genomes assembly hubs, track statistics

See also: hub access, assembly statistics

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