Plants Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of plants only.

See also: hub access, assembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 A. eriantha gooseberry (White 2019)
GCA_004150315.1		 n/a 21,507
(2.72 %)		 60,050
(11.57 %)		 n/a 35.92
(99.97 %)		 2,344
(0.03 %)		 1,735
(100.00 %)		 430,950
(2.82 %)		 273,041
(3.10 %)		 4,895,011
(32.98 %)		 29,695
(1.88 %)
2 A.eriantha eudicots (MHT-2021 2021)
GCF_019202715.1		 71,489
(11.95 %)		 23,883
(3.45 %)		 59,407
(13.07 %)		 n/a 35.65
(99.64 %)		 710
(0.36 %)		 88
(100.00 %)		 430,287
(3.04 %)		 350,721
(4.29 %)		 3,875,064
(36.80 %)		 27,794
(1.97 %)
3 adzuki bean (Jingnong 6 2015)
GCF_001190045.1		 40,474
(10.62 %)		 16,697
(3.71 %)		 47,542
(15.07 %)		 n/a 34.07
(96.37 %)		 21,264
(3.63 %)		 58,639
(96.37 %)		 257,290
(4.08 %)		 239,596
(6.43 %)		 2,925,469
(36.04 %)		 24,461
(2.99 %)
4 adzuki bean (LongXiaoDou No.4 2021)
GCF_016808095.1		 50,989
(11.87 %)		 16,661
(3.75 %)		 45,945
(15.40 %)		 n/a 33.63
(100.00 %)		 32
(0.00 %)		 36
(100.00 %)		 263,673
(3.52 %)		 264,113
(5.18 %)		 2,808,981
(37.65 %)		 20,402
(2.60 %)
5 African boxthorn (CSIRO_LF1 2023)
GCF_029784015.1		 54,359
(4.64 %)		 16,693
(1.34 %)		 75,114
(9.09 %)		 n/a 37.42
(99.88 %)		 15,111
(0.12 %)		 14,905
(100.00 %)		 668,488
(2.42 %)		 511,720
(3.29 %)		 8,110,750
(42.79 %)		 50,821
(2.66 %)
6 African oil palm
GCF_000442705.1		 51,575
(5.06 %)		 16,948
(1.48 %)		 76,464
(9.29 %)		 n/a 37.21
(68.90 %)		 166,490
(31.14 %)		 202,468
(68.86 %)		 580,361
(3.63 %)		 445,124
(2.25 %)		 5,831,606
(30.77 %)		 75,576
(3.67 %)
7 African oil palm (ETL-2024a 2024)
GCF_000442705.2		 61,514
(3.59 %)		 17,694
(0.94 %)		 82,131
(6.45 %)		 n/a 38.54
(93.07 %)		 37,524
(6.94 %)		 30
(100.00 %)		 930,885
(3.15 %)		 928,025
(5.06 %)		 6,719,901
(56.47 %)		 104,550
(9.50 %)
8 African rice (2021)
GCF_000147395.1		 43,826
(15.96 %)		 16,224
(4.82 %)		 51,031
(25.64 %)		 n/a 42.87
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 178,763
(2.60 %)		 125,689
(4.18 %)		 1,761,585
(30.96 %)		 60,891
(21.37 %)
9 algarrobo blanco (v1 B1F8T4 2019)
GCF_004799145.1		 62,791
(10.08 %)		 25,423
(3.34 %)		 69,507
(14.55 %)		 n/a 34.31
(100.00 %)		 n/a 6,087
(100.00 %)		 367,402
(2.31 %)		 175,862
(2.27 %)		 4,241,058
(38.29 %)		 18,927
(1.15 %)
10 algarrobo blanco (v2 B1F8T4 2019)
GCF_004799145.2		 62,791
(10.08 %)		 25,443
(3.35 %)		 69,492
(14.56 %)		 n/a 34.31
(100.00 %)		 n/a 6,085
(100.00 %)		 366,178
(2.25 %)		 175,852
(2.27 %)		 4,240,382
(38.29 %)		 18,927
(1.15 %)
11 almond
GCF_902201215.1		 37,363
(19.64 %)		 14,509
(6.35 %)		 33,193
(24.70 %)		 n/a 37.65
(98.29 %)		 6,531
(1.72 %)		 1,700
(99.96 %)		 137,974
(2.59 %)		 100,386
(3.92 %)		 1,251,126
(26.07 %)		 10,893
(2.94 %)
12 annual mercury (v1 primary hap 2022)
GCF_937616625.1		 47,801
(11.07 %)		 13,620
(2.91 %)		 37,334
(14.26 %)		 n/a 33.91
(100.00 %)		 15
(0.00 %)		 63
(100.00 %)		 201,121
(2.22 %)		 661,096
(20.12 %)		 2,185,025
(50.59 %)		 9,024
(2.18 %)
13 annual mercury (v2 primary hap 2022)
GCF_937616625.2		 44,356
(10.99 %)		 13,620
(2.91 %)		 37,334
(14.26 %)		 n/a 33.91
(100.00 %)		 15
(0.00 %)		 63
(100.00 %)		 201,121
(2.22 %)		 661,096
(20.12 %)		 2,185,025
(50.59 %)		 9,024
(2.18 %)
14 annual ryegrass (FL_2022 2022)
GCF_022539505.1		 73,172
(3.41 %)		 26,626
(1.10 %)		 228,260
(15.00 %)		 n/a 44.76
(99.87 %)		 31,919
(0.13 %)		 1,764
(100.00 %)		 639,429
(1.31 %)		 739,566
(3.57 %)		 6,976,583
(59.37 %)		 560,429
(28.70 %)
15 ant C.braunii (S276 2018)
GCA_003427395.1		 n/a 3,649
(0.20 %)		 126,898
(19.85 %)		 n/a 48.33
(81.70 %)		 641,791
(18.38 %)		 653,445
(81.62 %)		 1,577,107
(5.98 %)		 1,434,259
(6.24 %)		 8,533,748
(36.35 %)		 278,266
(17.95 %)
16 ant C.sp. (NIES-68 2022)
GCA_027943385.1		 n/a 3,655
(0.79 %)		 32,911
(30.45 %)		 n/a 55.81
(100.00 %)		 n/a 2,529
(100.00 %)		 255,839
(6.03 %)		 392,694
(15.77 %)		 1,480,495
(52.16 %)		 23,662
(78.57 %)
17 ant L.chinense (Lushan-1 2018)
GCA_003013855.2		 n/a 15,545
(0.82 %)		 85,577
(6.98 %)		 n/a 41.50
(100.00 %)		 473
(0.00 %)		 4,183
(100.00 %)		 860,506
(2.32 %)		 825,722
(4.56 %)		 8,205,488
(53.73 %)		 153,728
(4.12 %)
18 ant M.endlicherianum (SAG 12.97 2019)
GCA_009602735.1		 n/a 2,806
(1.27 %)		 21,989
(34.80 %)		 n/a 51.93
(90.29 %)		 24,291
(9.73 %)		 38,152
(90.27 %)		 147,548
(5.58 %)		 92,866
(3.14 %)		 715,552
(34.44 %)		 34,833
(26.81 %)
19 apple (Golden Delicious X9273 #13 2017 refseq)
GCF_002114115.1		 64,916
(11.38 %)		 22,530
(3.52 %)		 67,146
(16.22 %)		 n/a 38.04
(88.96 %)		 7,264
(11.05 %)		 807
(100.00 %)		 692,611
(50.77 %)		 322,556
(4.41 %)		 3,055,836
(35.69 %)		 25,923
(1.76 %)
20 apple (hap1 2024)
GCF_042453785.1		 78,522
(12.41 %)		 22,548
(3.38 %)		 68,116
(16.07 %)		 n/a 38.09
(100.00 %)		 89
(0.00 %)		 19
(100.00 %)		 315,260
(2.21 %)		 337,450
(5.03 %)		 3,018,840
(41.78 %)		 26,464
(1.96 %)
21 Asian cultivated rice (Carolina Gold Select 2019)
GCA_004007595.1		 n/a 16,583
(4.58 %)		 55,248
(25.46 %)		 n/a 43.36
(99.98 %)		 696
(0.02 %)		 615
(100.00 %)		 495,126
(50.28 %)		 124,567
(3.20 %)		 1,922,072
(32.59 %)		 65,220
(23.87 %)
22 Australian watermeal (WA8730 2020)
GCA_013350365.1		 n/a 8,508
(2.10 %)		 37,551
(17.70 %)		 n/a 40.80
(95.30 %)		 1,778
(4.70 %)		 7,026
(95.30 %)		 167,876
(5.21 %)		 220,174
(6.35 %)		 2,006,559
(31.53 %)		 43,277
(15.01 %)
23 Australian wild rice (MA-2024b 2025)
GCA_047496205.1		 n/a 16,434
(4.16 %)		 55,282
(23.68 %)		 n/a 43.56
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 16
(100.00 %)		 602,996
(48.61 %)		 170,830
(6.54 %)		 1,845,923
(37.36 %)		 69,474
(22.48 %)
24 avocado (Hass MH2022 2023)
GCA_029852735.1		 n/a 15,968
(1.61 %)		 64,612
(11.72 %)		 n/a 39.99
(100.00 %)		 36
(0.00 %)		 482
(100.00 %)		 1,348,599
(20.35 %)		 427,369
(10.49 %)		 4,298,119
(41.03 %)		 54,543
(5.58 %)
25 Bahia grass (Cayasta R1 2024)
GCA_036689595.1		 n/a 17,830
(3.66 %)		 74,926
(26.22 %)		 n/a 45.79
(99.95 %)		 2,801
(0.05 %)		 2,811
(99.95 %)		 643,354
(26.01 %)		 146,179
(4.41 %)		 2,284,294
(38.05 %)		 110,855
(27.67 %)
26 Balbis banana (DH-PKW 2019)
GCA_004837865.1		 n/a 18,974
(3.45 %)		 47,957
(15.55 %)		 n/a 38.02
(99.72 %)		 1,197
(0.27 %)		 2,590
(100.00 %)		 208,141
(3.88 %)		 197,690
(7.95 %)		 2,068,575
(42.39 %)		 52,850
(9.12 %)
27 Barbados nut
GCF_014843425.1		 33,622
(13.80 %)		 12,687
(4.63 %)		 26,511
(14.56 %)		 n/a 33.40
(99.60 %)		 2,151
(0.40 %)		 1,232
(100.00 %)		 281,490
(24.82 %)		 186,260
(5.65 %)		 2,028,357
(33.33 %)		 8,868
(1.38 %)
28 barrel medic (2018)
GCF_003473485.1		 50,906
(14.28 %)		 16,712
(3.68 %)		 41,041
(14.51 %)		 n/a 33.43
(99.87 %)		 22
(0.13 %)		 42
(100.00 %)		 393,909
(27.89 %)		 175,427
(3.92 %)		 2,532,494
(37.64 %)		 3,384
(0.27 %)
29 barrel medic (A17 2014)
GCF_000219495.3		 48,865
(15.69 %)		 16,549
(3.99 %)		 40,316
(15.41 %)		 n/a 33.14
(94.48 %)		 8,785
(5.53 %)		 8,027
(94.47 %)		 366,709
(22.34 %)		 146,748
(2.80 %)		 2,549,499
(32.46 %)		 3,695
(0.65 %)
30 barrel medic (HM340 2017)
GCA_002024945.1		 n/a 16,672
(3.96 %)		 40,032
(15.19 %)		 n/a 33.05
(99.32 %)		 107
(0.68 %)		 909
(100.00 %)		 381,065
(23.82 %)		 162,402
(3.97 %)		 2,490,028
(35.39 %)		 3,335
(0.34 %)
31 bay (USA: Berkeley CA var. californica CCGP_DODD_UMBCAL_S1 alternate hap 2023)
GCA_028538565.1		 n/a 15,063
(1.43 %)		 65,125
(11.47 %)		 n/a 40.34
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 197
(100.00 %)		 735,552
(11.30 %)		 567,295
(6.87 %)		 4,176,675
(45.56 %)		 66,834
(4.90 %)
32 bay (USA: Berkeley CA var. californica CCGP_DODD_UMBCAL_S1 primary hap 2023)
GCA_028534965.1		 n/a 15,223
(1.43 %)		 65,769
(11.33 %)		 n/a 40.37
(100.00 %)		 36
(0.00 %)		 303
(100.00 %)		 744,623
(11.37 %)		 571,691
(7.15 %)		 4,217,655
(45.87 %)		 68,566
(4.96 %)
33 beefsteak plant (Hoko-3 primary hap 2022)
GCA_026008535.1		 n/a 28,039
(2.07 %)		 120,338
(15.60 %)		 n/a 35.28
(100.00 %)		 23
(0.00 %)		 71
(100.00 %)		 2,012,805
(68.74 %)		 678,680
(5.87 %)		 8,191,868
(44.06 %)		 65,395
(2.45 %)
34 beet (v1 EL10 2021 USDA)
GCF_002917755.1		 47,727
(9.45 %)		 11,911
(2.04 %)		 50,202
(16.78 %)		 n/a 35.86
(99.99 %)		 323
(0.01 %)		 42
(100.00 %)		 294,768
(3.41 %)		 341,699
(6.22 %)		 2,932,896
(35.20 %)		 25,364
(1.79 %)
35 beet (v2 EL10 2022 USDA)
GCF_026745355.1		 45,490
(9.22 %)		 11,850
(2.05 %)		 49,071
(15.89 %)		 n/a 35.85
(94.03 %)		 3,200
(5.97 %)		 20
(100.00 %)		 290,870
(3.40 %)		 336,343
(5.76 %)		 2,901,079
(33.21 %)		 25,108
(1.67 %)
36 bell pepper eudicots (UCD-10X-F1 2018)
GCF_002878395.1		 70,848
(2.17 %)		 15,922
(0.50 %)		 69,601
(2.75 %)		 n/a 34.91
(97.27 %)		 52,577
(2.73 %)		 81,202
(100.00 %)		 1,192,132
(1.94 %)		 1,097,384
(4.12 %)		 23,393,622
(47.64 %)		 19,517
(0.21 %)
37 bigberry manzanita (GLNDR_RDG_Rd-6 alternate hap 2021)
GCA_019985075.1		 n/a 13,887
(2.34 %)		 44,507
(14.12 %)		 n/a 37.97
(100.00 %)		 120
(0.00 %)		 2,350
(100.00 %)		 250,361
(2.10 %)		 231,118
(13.56 %)		 2,049,366
(44.58 %)		 22,527
(6.34 %)
38 bigberry manzanita (GLNDR_RDG_Rd-6 primary hap 2022)
GCA_019985065.2		 n/a 15,102
(2.62 %)		 47,553
(15.64 %)		 n/a 38.11
(100.00 %)		 82
(0.00 %)		 272
(100.00 %)		 257,066
(2.22 %)		 226,514
(14.63 %)		 2,470,334
(38.37 %)		 21,415
(5.59 %)
39 birdsfoot trefoil (B-129 2022)
GCF_012489685.1		 57,539
(11.82 %)		 16,919
(2.98 %)		 64,687
(19.59 %)		 n/a 38.05
(99.97 %)		 1,625
(0.04 %)		 65
(100.00 %)		 236,645
(2.13 %)		 205,150
(5.19 %)		 2,202,942
(41.60 %)		 32,283
(3.44 %)
40 bitter melon
GCF_001995035.1		 31,725
(13.80 %)		 12,858
(4.62 %)		 30,539
(16.85 %)		 n/a 34.58
(92.32 %)		 109,310
(7.74 %)		 1,052
(100.00 %)		 162,837
(2.82 %)		 89,571
(2.03 %)		 1,951,167
(30.96 %)		 14,100
(2.00 %)
41 black cottonwood (Ptri.A.LA.226.w1 alternate hap 2023)
GCA_028534865.1		 n/a 20,077
(4.66 %)		 43,061
(17.16 %)		 n/a 34.80
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 338
(100.00 %)		 267,110
(2.88 %)		 173,502
(6.32 %)		 2,366,759
(39.61 %)		 5,093
(4.11 %)
42 black cottonwood (Ptri.A.LA.226.w1 primary hap 2023)
GCA_028534895.1		 n/a 19,804
(4.58 %)		 42,642
(17.03 %)		 n/a 34.85
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 132
(100.00 %)		 265,925
(2.85 %)		 174,688
(6.70 %)		 2,359,101
(40.07 %)		 4,963
(4.10 %)
43 black cottonwood (v4.1 Nisqually-1 2022)
GCF_000002775.5		 59,638
(15.94 %)		 19,969
(4.99 %)		 41,581
(16.22 %)		 n/a 33.75
(99.85 %)		 59
(0.15 %)		 106
(99.85 %)		 257,833
(2.91 %)		 156,371
(4.50 %)		 2,423,627
(36.28 %)		 3,761
(0.66 %)
44 black gram (Urdbean 2024)
GCA_036885675.1		 n/a 16,158
(3.35 %)		 47,346
(15.05 %)		 n/a 33.60
(99.97 %)		 282
(0.03 %)		 13
(100.00 %)		 832,234
(57.53 %)		 240,933
(5.84 %)		 2,976,104
(38.95 %)		 16,895
(2.01 %)
45 black tea
GCF_004153795.1		 101,253
(3.17 %)		 20,982
(0.66 %)		 156,999
(7.69 %)		 n/a 37.85
(92.12 %)		 79,329
(7.89 %)		 14,028
(100.00 %)		 1,926,995
(3.23 %)		 2,024,420
(8.06 %)		 17,959,098
(50.75 %)		 181,027
(2.79 %)
46 blue lilly pilly tree (NSW1041296 2022)
GCF_021117445.2		 46,173
(12.87 %)		 15,187
(3.49 %)		 50,585
(20.61 %)		 n/a 40.95
(100.00 %)		 13
(0.00 %)		 72
(100.00 %)		 494,434
(48.54 %)		 220,571
(4.98 %)		 1,866,530
(29.09 %)		 59,325
(10.76 %)
47 bread wheat (Chinese Spring 2020)
GCA_002220415.3		 n/a 46,431
(0.31 %)		 805,204
(7.93 %)		 n/a 46.09
(99.87 %)		 211,982
(0.14 %)		 70,316
(100.00 %)		 9,191,325
(44.14 %)		 5,086,953
(4.53 %)		 282,298
(99.86 %)		 3,241,124
(28.06 %)
48 bread wheat (Chinese Spring 2021, UC Davis)
GCF_018294505.1		 221,450
(1.62 %)		 n/a 763,380
(8.08 %)		 n/a 46.14
(98.27 %)		 214,799
(1.73 %)		 91,589
(100.00 %)		 8,660,189
(44.94 %)		 4,402,049
(3.94 %)		 306,386
(98.27 %)		 3,040,030
(27.48 %)
49 bread wheat (Chinese Spring IWGSC RefSeq v1.0 2018)
GCA_900519105.1		 n/a n/a 751,576
(8.03 %)		 n/a 46.05
(98.12 %)		 693,028
(1.90 %)		 693,050
(98.10 %)		 8,420,935
(44.23 %)		 4,115,828
(3.69 %)		 693,050
(98.10 %)		 3,076,631
(26.41 %)
50 bread wheat (Fielder 2021)
GCA_907166925.1		 n/a n/a 773,766
(8.20 %)		 n/a 46.05
(100.00 %)		 1,407
(0.00 %)		 3,795
(100.00 %)		 8,703,192
(44.57 %)		 4,569,103
(5.20 %)		 5,202
(100.00 %)		 3,001,896
(28.00 %)
51 bread wheat (Kariega 2021)
GCA_910594105.1		 n/a 47,400
(0.34 %)		 778,134
(8.33 %)		 n/a 46.11
(99.87 %)		 7,376
(0.13 %)		 7,398
(99.87 %)		 14,835,099
(85.31 %)		 4,570,540
(5.40 %)		 7,395
(99.87 %)		 2,994,427
(28.25 %)
52 brown mustard (Varuna 2020)
GCA_015484525.1		 n/a 50,825
(7.02 %)		 128,133
(24.54 %)		 n/a 37.47
(96.71 %)		 3,070
(3.29 %)		 720
(100.00 %)		 905,496
(54.34 %)		 440,139
(7.46 %)		 4,073,637
(39.30 %)		 54,083
(6.71 %)
53 button wrinklewort R.leptorrhynchoides (AG116_Rl617_1_P2 2025)
GCF_046630445.1		 79,194
(1.39 %)		 19,567
(0.31 %)		 119,910
(3.26 %)		 n/a 33.70
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 549
(100.00 %)		 3,727,770
(5.18 %)		 3,762,751
(4.98 %)		 10,213,591
(82.37 %)		 54,254
(0.38 %)
54 cacao
GCF_000208745.1		 34,727
(13.67 %)		 14,294
(4.65 %)		 29,216
(14.38 %)		 n/a 34.09
(94.31 %)		 11,787
(5.70 %)		 431
(100.00 %)		 206,049
(15.64 %)		 99,229
(2.66 %)		 1,933,579
(33.24 %)		 2,964
(0.34 %)
55 California black walnut (Jcal.S.LA.6 alternate hap 2022)
GCA_023349545.1		 n/a 18,729
(3.22 %)		 57,374
(16.70 %)		 n/a 36.81
(100.00 %)		 78
(0.00 %)		 915
(100.00 %)		 421,731
(3.42 %)		 300,957
(5.54 %)		 2,794,242
(34.11 %)		 25,348
(3.39 %)
56 California black walnut (Jcal.S.LA.6 primary hap 2022)
GCA_023349395.1		 n/a 18,579
(3.26 %)		 56,295
(16.71 %)		 n/a 36.92
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 138
(100.00 %)		 414,129
(3.48 %)		 293,951
(5.95 %)		 3,055,420
(34.96 %)		 24,749
(4.05 %)
57 California pipevine (CCGP_79_NKW_82.1479hap1 2023)
GCF_029961685.1		 43,175
(7.78 %)		 16,377
(2.29 %)		 43,559
(11.38 %)		 n/a 36.31
(100.00 %)		 175
(0.00 %)		 706
(100.00 %)		 341,665
(12.46 %)		 223,217
(36.36 %)		 2,388,236
(58.00 %)		 26,535
(3.98 %)
58 California scrub oak (Qber.S.LA.60 alternate hap 2023)
GCA_028535905.1		 n/a 16,153
(1.86 %)		 68,653
(14.03 %)		 n/a 35.79
(100.00 %)		 43
(0.00 %)		 807
(100.00 %)		 783,798
(4.17 %)		 456,025
(10.87 %)		 4,951,918
(40.76 %)		 21,783
(2.16 %)
59 California scrub oak (Qber.S.LA.60 primary hap 2023)
GCA_028535815.1		 n/a 15,836
(1.90 %)		 66,803
(13.99 %)		 n/a 35.77
(100.00 %)		 32
(0.00 %)		 283
(100.00 %)		 762,029
(4.24 %)		 448,099
(10.97 %)		 4,784,968
(41.07 %)		 20,384
(2.28 %)
60 Cannabis sativa ( 2020)
GCA_016165845.1		 n/a 18,838
(1.94 %)		 71,211
(13.84 %)		 n/a 33.78
(99.91 %)		 8,772
(0.10 %)		 147
(100.00 %)		 643,488
(3.49 %)		 361,843
(3.63 %)		 4,074,440
(56.52 %)		 27,745
(1.31 %)
61 Cannabis sativa (Cannatonic 2016)
GCA_001865755.1		 n/a 10,725
(1.71 %)		 41,537
(11.41 %)		 n/a 33.68
(100.00 %)		 n/a 11,110
(100.00 %)		 396,112
(4.11 %)		 221,932
(3.23 %)		 2,389,229
(59.21 %)		 17,045
(1.23 %)
62 Cannabis sativa (Harvard OEB 2019)
GCF_900626175.2		 39,696
(6.07 %)		 13,883
(1.80 %)		 50,556
(11.19 %)		 n/a 33.51
(84.07 %)		 843
(15.93 %)		 1,052
(84.07 %)		 496,648
(3.63 %)		 258,281
(2.28 %)		 3,594,433
(47.71 %)		 22,750
(1.69 %)
63 Cannabis sativa (Jamaican Lion DASH 2019)
GCA_003660325.2		 n/a 24,975
(1.79 %)		 113,252
(15.69 %)		 n/a 34.00
(100.00 %)		 n/a 3,372
(100.00 %)		 936,351
(4.13 %)		 520,230
(3.65 %)		 5,183,602
(58.66 %)		 47,327
(1.58 %)
64 Cannabis sativa (Jamaican Lion Mother 2020)
GCA_012923435.1		 n/a 15,253
(1.67 %)		 62,228
(12.57 %)		 n/a 34.08
(100.00 %)		 n/a 1,599
(100.00 %)		 595,917
(3.95 %)		 335,791
(3.38 %)		 3,478,519
(61.18 %)		 31,738
(1.57 %)
65 Cannabis sativa (JL 2020)
GCA_013030365.1		 n/a 15,334
(1.80 %)		 60,140
(12.83 %)		 n/a 33.79
(99.92 %)		 2,496
(0.09 %)		 483
(100.00 %)		 567,458
(3.73 %)		 320,455
(3.12 %)		 3,403,771
(58.38 %)		 27,791
(1.48 %)
66 capsicum (Zunla-1 2015 refseq)
GCF_000710875.1		 57,769
(2.07 %)		 16,114
(0.55 %)		 62,579
(2.93 %)		 n/a 34.94
(96.78 %)		 107,172
(3.23 %)		 108,799
(96.77 %)		 968,939
(3.15 %)		 948,741
(4.39 %)		 21,535,213
(46.15 %)		 16,685
(0.21 %)
67 carrot
GCF_001625215.1		 51,773
(15.95 %)		 16,649
(3.96 %)		 50,187
(20.50 %)		 n/a 34.79
(91.77 %)		 26,112
(8.24 %)		 4,826
(100.00 %)		 179,630
(2.41 %)		 166,060
(4.97 %)		 1,981,148
(31.51 %)		 8,564
(0.85 %)
68 carrot (DH1 2023)
GCF_001625215.2		 60,116
(15.29 %)		 16,679
(3.49 %)		 51,607
(18.82 %)		 n/a 34.97
(99.99 %)		 554
(0.01 %)		 11
(100.00 %)		 195,035
(2.33 %)		 186,941
(8.11 %)		 2,018,050
(39.61 %)		 10,319
(1.14 %)
69 cassava (60444 2018)
GCA_003957885.1		 n/a 27,737
(2.70 %)		 78,774
(11.79 %)		 n/a 37.13
(76.51 %)		 36,478
(23.50 %)		 4,440
(100.00 %)		 584,617
(3.41 %)		 554,162
(3.52 %)		 4,126,060
(43.14 %)		 77,570
(1.78 %)
70 cassava (v8 AM560-2 2021 DOE)
GCF_001659605.2		 56,386
(9.38 %)		 18,790
(2.86 %)		 49,944
(11.73 %)		 n/a 37.52
(99.61 %)		 672
(0.39 %)		 758
(99.61 %)		 377,964
(3.52 %)		 356,023
(4.79 %)		 2,560,255
(56.85 %)		 52,506
(2.50 %)
71 castor bean (Hale 2011 JCVI)
GCF_000151685.1		 33,377
(11.52 %)		 13,874
(4.00 %)		 33,656
(13.67 %)		 n/a 33.84
(96.11 %)		 23,313
(3.90 %)		 49,406
(96.10 %)		 207,850
(3.52 %)		 166,467
(10.85 %)		 1,676,921
(43.19 %)		 12,838
(2.54 %)
72 castor bean (wild-type WT05 2021)
GCA_019578655.1		 n/a 13,864
(4.31 %)		 29,909
(14.27 %)		 n/a 33.05
(99.95 %)		 331
(0.05 %)		 146
(100.00 %)		 328,084
(38.04 %)		 128,377
(6.36 %)		 1,992,583
(39.20 %)		 7,290
(1.00 %)
73 castor bean (wild-type WT05 2021)
GCF_019578655.1		 39,358
(13.36 %)		 13,841
(4.31 %)		 29,805
(14.24 %)		 n/a 33.03
(99.95 %)		 331
(0.05 %)		 140
(100.00 %)		 205,974
(3.02 %)		 128,354
(6.37 %)		 1,998,066
(39.24 %)		 7,216
(0.99 %)
74 celery A.graveolens (Ventura 2021)
GCF_009905375.1		 89,565
(2.38 %)		 17,560
(0.48 %)		 115,390
(5.30 %)		 n/a 35.68
(99.73 %)		 4,633
(0.27 %)		 4,854
(100.00 %)		 1,247,170
(1.97 %)		 1,423,285
(4.75 %)		 11,041,078
(71.09 %)		 31,562
(0.31 %)
75 Ceratopteris richardii C-fern (Hn-n 2020)
GCA_011386875.1		 n/a 3
(0.11 %)		 117
(7.42 %)		 n/a 39.35
(99.99 %)		 4
(0.01 %)		 35
(100.00 %)		 1,139
(3.04 %)		 1,677
(4.92 %)		 11,074
(10.60 %)		 76
(1.07 %)
76 Ceratopteris richardii C-fern (Hn-n Whitten #5841 2020)
GCA_009866685.1		 n/a 6,487
(0.16 %)		 114,999
(4.12 %)		 n/a 37.82
(62.87 %)		 490,371
(37.15 %)		 1,116,784
(62.85 %)		 692,892
(1.67 %)		 790,165
(1.22 %)		 18,073,193
(31.20 %)		 24,414
(0.46 %)
77 chia eudicots (TCC Black 2014 2022)
GCF_023119035.1		 53,262
(17.46 %)		 17,642
(4.97 %)		 49,474
(23.85 %)		 n/a 36.14
(99.81 %)		 3,756
(0.19 %)		 1,556
(100.00 %)		 156,083
(2.30 %)		 128,904
(3.10 %)		 2,112,137
(31.93 %)		 31,157
(5.92 %)
78 chickpea
GCF_000331145.1		 42,036
(9.83 %)		 15,685
(3.16 %)		 30,411
(8.82 %)		 n/a 31.04
(90.95 %)		 31,897
(9.07 %)		 39,024
(90.93 %)		 339,564
(10.51 %)		 318,439
(11.48 %)		 2,929,750
(43.82 %)		 3,488
(0.28 %)
79 chickpea (CDC Frontier Library 1 2024)
GCF_000331145.2		 42,320
(9.82 %)		 15,593
(3.16 %)		 30,475
(8.82 %)		 n/a 31.03
(91.05 %)		 33,507
(8.98 %)		 6,446
(100.00 %)		 308,190
(3.39 %)		 318,609
(11.50 %)		 2,922,065
(43.86 %)		 3,472
(0.28 %)
80 chicory (Punajuju 2022)
GCA_023525715.1		 n/a 16,855
(1.17 %)		 92,310
(11.34 %)		 n/a 35.50
(99.99 %)		 510
(0.01 %)		 208
(100.00 %)		 1,976,706
(34.89 %)		 781,413
(8.81 %)		 6,080,413
(49.06 %)		 51,571
(2.99 %)
81 China rose (Old Blush v2 2019)
GCF_002994745.2		 66,337
(12.31 %)		 15,432
(2.83 %)		 67,569
(21.71 %)		 n/a 38.83
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 53
(100.00 %)		 275,878
(2.26 %)		 229,333
(3.98 %)		 2,244,200
(35.17 %)		 37,317
(4.17 %)
82 Chinese keys (BR_CEBAR01 2022)
GCA_024364735.1		 n/a 23,898
(0.89 %)		 138,156
(8.52 %)		 n/a 40.10
(96.58 %)		 25,154
(3.42 %)		 35,781
(96.58 %)		 829,613
(1.78 %)		 1,793,985
(6.94 %)		 8,707,237
(62.53 %)		 317,707
(8.50 %)
83 Chinese licorice (Kyoto 2023)
GCA_030159175.1		 n/a 16,920
(3.67 %)		 44,776
(19.51 %)		 n/a 37.70
(100.00 %)		 20
(0.00 %)		 89
(100.00 %)		 593,642
(17.68 %)		 219,391
(21.45 %)		 2,088,553
(50.28 %)		 15,616
(4.58 %)
84 Chinese licorice (manju 2023)
GCA_027886165.1		 n/a 16,877
(4.02 %)		 43,800
(15.68 %)		 n/a 35.67
(99.96 %)		 1,409
(0.03 %)		 6,467
(100.00 %)		 582,162
(19.03 %)		 193,998
(5.82 %)		 2,492,820
(41.31 %)		 18,054
(4.04 %)
85 Chinese medicinal orchid (niu2020 2021)
GCA_019514585.1		 n/a 13,666
(0.97 %)		 71,763
(9.04 %)		 n/a 35.33
(99.97 %)		 1,170
(0.03 %)		 1,621
(100.00 %)		 635,445
(2.92 %)		 599,600
(4.44 %)		 8,101,700
(44.90 %)		 75,475
(3.56 %)
86 Chinese white pear (Dangshansuli 2012)
GCF_000315295.1		 54,029
(12.78 %)		 22,400
(4.38 %)		 57,140
(17.42 %)		 n/a 37.29
(97.86 %)		 24,384
(2.15 %)		 26,566
(97.85 %)		 368,808
(18.26 %)		 218,013
(4.36 %)		 2,456,496
(34.15 %)		 18,367
(1.88 %)
87 Chinese white pear (Hongxiangsu 2021)
GCF_019419815.1		 62,514
(13.83 %)		 22,289
(4.29 %)		 57,502
(17.16 %)		 n/a 37.35
(100.00 %)		 n/a 452
(100.00 %)		 290,077
(2.40 %)		 209,363
(3.56 %)		 2,519,627
(35.77 %)		 19,299
(1.84 %)
88 Christmas fern (IRGN 58ZZQ2NR20 2022)
GCA_025802375.1		 n/a 2,216
(0.22 %)		 115,851
(13.84 %)		 n/a 40.55
(99.77 %)		 6,993
(0.02 %)		 496,888
(99.98 %)		 1,157,849
(61.20 %)		 244,472
(3.76 %)		 2,756,209
(21.19 %)		 9,107
(0.82 %)
89 clementine
GCF_000493195.1		 36,454
(14.29 %)		 14,126
(4.66 %)		 32,820
(18.34 %)		 n/a 34.96
(97.94 %)		 7,564
(2.07 %)		 8,962
(97.93 %)		 178,443
(2.76 %)		 104,853
(5.57 %)		 1,933,079
(33.91 %)		 7,930
(3.80 %)
90 climbing nightshade (primary hap 2022)
GCF_947179165.1		 44,646
(5.40 %)		 15,784
(1.70 %)		 48,875
(7.66 %)		 n/a 35.83
(100.00 %)		 38
(0.00 %)		 105
(100.00 %)		 347,467
(1.98 %)		 290,488
(4.50 %)		 6,293,084
(43.53 %)		 8,929
(0.83 %)
91 club-mosses (2010)
GCF_000143415.4		 49,382
(28.03 %)		 11,312
(4.28 %)		 36,277
(36.82 %)		 n/a 45.22
(98.15 %)		 4,395
(1.86 %)		 5,152
(98.14 %)		 138,958
(36.90 %)		 77,054
(2.71 %)		 802,227
(32.19 %)		 34,479
(27.80 %)
92 club-mosses (Aurea 2015)
GCA_001021135.1		 n/a 6,316
(4.02 %)		 55,013
(41.57 %)		 n/a 44.70
(99.81 %)		 351
(0.00 %)		 106,265
(100.00 %)		 29,218
(1.24 %)		 29,377
(1.67 %)		 480,195
(13.66 %)		 19,392
(13.60 %)
93 coffee (Caturra red CCC135-36 2018)
GCA_003713225.1		 n/a 23,597
(2.02 %)		 86,132
(13.38 %)		 n/a 36.94
(99.79 %)		 690
(0.21 %)		 2,832
(100.00 %)		 502,137
(2.12 %)		 386,196
(3.95 %)		 5,651,566
(41.67 %)		 36,395
(1.62 %)
94 coffee (Red Bourbon ID1545 2023)
GCA_030873655.1		 n/a 25,435
(1.84 %)		 94,196
(12.02 %)		 n/a 37.21
(99.99 %)		 197
(0.01 %)		 1,794
(100.00 %)		 1,591,482
(68.40 %)		 423,470
(5.23 %)		 6,621,994
(45.23 %)		 49,710
(2.01 %)
95 coffee C.arabica (CCC135-36 2018)
GCF_003713225.1		 80,737
(8.03 %)		 23,574
(2.02 %)		 85,662
(13.32 %)		 n/a 36.94
(99.79 %)		 691
(0.21 %)		 2,833
(100.00 %)		 501,414
(2.11 %)		 386,209
(3.95 %)		 5,652,743
(41.66 %)		 36,398
(1.62 %)
96 coffee C.arabica (ET-39 2024)
GCF_036785885.1		 119,626
(9.97 %)		 25,877
(2.06 %)		 97,184
(14.13 %)		 n/a 37.50
(100.00 %)		 107
(0.00 %)		 134
(100.00 %)		 542,076
(2.06 %)		 445,020
(5.76 %)		 5,654,970
(44.41 %)		 38,607
(3.43 %)
97 coffee C.eugenioides (CCC68of 2018)
GCF_003713205.1		 43,829
(7.69 %)		 14,911
(2.02 %)		 57,408
(14.42 %)		 n/a 36.89
(97.92 %)		 3,482
(2.08 %)		 3,530
(100.00 %)		 312,360
(2.09 %)		 234,658
(3.24 %)		 3,464,594
(38.91 %)		 21,553
(1.54 %)
98 Commerson's wild potato (CGN18024_1 2023)
GCA_029007595.1		 n/a 16,068
(2.21 %)		 50,780
(10.49 %)		 n/a 34.48
(99.99 %)		 1
(0.01 %)		 639
(100.00 %)		 1,250,333
(70.08 %)		 249,197
(3.97 %)		 5,014,592
(38.92 %)		 6,970
(0.46 %)
99 common bean
GCF_000499845.1		 32,720
(9.56 %)		 16,474
(3.53 %)		 45,055
(14.46 %)		 n/a 34.96
(90.70 %)		 40,860
(9.33 %)		 41,568
(90.67 %)		 233,709
(2.97 %)		 208,045
(3.61 %)		 2,886,693
(37.28 %)		 38,054
(5.05 %)
100 common cattail (L0001 2021)
GCF_019914945.1		 37,046
(18.67 %)		 14,152
(6.13 %)		 28,640
(19.48 %)		 n/a 37.74
(99.99 %)		 66
(0.01 %)		 76
(100.00 %)		 129,836
(2.97 %)		 80,188
(2.65 %)		 1,248,248
(29.88 %)		 22,935
(5.83 %)
101 common fig (Dottato GU2019 2019)
GCA_009761775.1		 n/a 14,992
(4.28 %)		 36,350
(16.84 %)		 n/a 34.41
(99.99 %)		 394
(0.01 %)		 905
(99.99 %)		 475,247
(5.76 %)		 230,646
(4.36 %)		 2,425,030
(37.74 %)		 18,611
(3.41 %)
102 common jujube (AT0 2021)
GCF_020796205.1		 49,622
(12.72 %)		 14,929
(3.58 %)		 32,981
(12.20 %)		 n/a 33.07
(99.99 %)		 381
(0.01 %)		 538
(100.00 %)		 525,520
(5.43 %)		 225,151
(3.91 %)		 2,463,587
(42.86 %)		 13,018
(1.79 %)
103 common jujube (Dongzao 2015)
GCF_000826755.1		 49,976
(13.24 %)		 16,949
(3.79 %)		 38,488
(13.47 %)		 n/a 33.40
(95.35 %)		 24,158
(4.67 %)		 28,947
(95.33 %)		 525,525
(5.37 %)		 246,475
(5.25 %)		 2,603,240
(38.46 %)		 13,597
(2.11 %)
104 common jujube (Dongzao 2023)
GCF_031755915.1		 51,464
(13.54 %)		 14,443
(3.56 %)		 31,633
(12.06 %)		 n/a 33.20
(100.00 %)		 n/a 14
(100.00 %)		 516,010
(5.54 %)		 234,395
(5.05 %)		 2,319,259
(43.64 %)		 12,926
(2.66 %)
105 common jujube (Junzao 2020)
GCA_001835785.2		 n/a 14,443
(3.88 %)		 30,773
(12.63 %)		 n/a 32.95
(99.91 %)		 222
(0.09 %)		 155
(100.00 %)		 478,087
(5.53 %)		 206,042
(4.15 %)		 2,222,289
(41.43 %)		 11,860
(1.82 %)
106 common reed (primary hap 2023)
GCF_958298935.1		 65,051
(8.85 %)		 26,142
(3.49 %)		 114,639
(23.87 %)		 n/a 44.17
(100.00 %)		 59
(0.00 %)		 37
(100.00 %)		 243,799
(1.41 %)		 237,530
(2.79 %)		 4,477,357
(31.45 %)		 154,087
(19.32 %)
107 common sunflower
GCF_002127325.2		 133,319
(3.74 %)		 19,514
(0.59 %)		 166,187
(9.16 %)		 n/a 38.59
(97.94 %)		 2,384
(2.06 %)		 334
(100.00 %)		 1,263,836
(2.20 %)		 1,549,598
(4.15 %)		 12,728,097
(58.39 %)		 170,287
(2.39 %)
108 common tobacco (Basma Xanthi 2014)
GCA_000715095.1		 n/a 29,103
(0.75 %)		 200,375
(6.85 %)		 n/a 38.98
(95.11 %)		 468,375
(4.88 %)		 1,111,920
(95.12 %)		 1,199,550
(3.27 %)		 1,359,905
(4.81 %)		 24,590,709
(50.95 %)		 205,873
(1.79 %)
109 common tobacco (K326 2023)
GCA_000715075.2		 n/a 31,039
(0.78 %)		 176,804
(6.40 %)		 n/a 39.12
(100.00 %)		 710
(0.00 %)		 699
(100.00 %)		 4,626,207
(84.12 %)		 1,502,920
(6.71 %)		 24,314,611
(56.69 %)		 225,794
(1.93 %)
110 common tobacco (K326 2023)
GCF_000715075.1		 116,106
(3.08 %)		 31,018
(0.77 %)		 176,913
(6.40 %)		 n/a 39.12
(100.00 %)		 712
(0.00 %)		 701
(100.00 %)		 1,205,229
(1.45 %)		 1,502,955
(6.71 %)		 24,316,152
(56.68 %)		 225,863
(1.93 %)
111 common tobacco (TN90 2014)
GCF_000715135.1		 100,875
(3.08 %)		 29,968
(0.80 %)		 184,998
(7.05 %)		 n/a 38.95
(97.11 %)		 292,325
(2.90 %)		 292,601
(97.11 %)		 1,134,202
(3.09 %)		 1,268,208
(4.45 %)		 24,013,710
(52.08 %)		 204,914
(1.84 %)
112 common vetch (South Australia 2022)
GCA_021764765.1		 n/a 17,420
(0.99 %)		 77,140
(6.43 %)		 n/a 35.62
(99.97 %)		 5,823
(0.04 %)		 18
(100.00 %)		 708,538
(2.24 %)		 719,430
(5.37 %)		 8,370,861
(57.87 %)		 32,513
(0.96 %)
113 cork oak (v2 HL8 2018)
GCF_002906115.2		 53,587
(7.04 %)		 17,804
(1.85 %)		 77,741
(13.65 %)		 n/a 35.35
(97.95 %)		 25,649
(2.05 %)		 22,642
(100.00 %)		 860,049
(3.78 %)		 485,854
(6.14 %)		 5,989,180
(36.35 %)		 20,674
(1.12 %)
114 cork oak (v3 HL8 2024)
GCF_002906115.3		 56,406
(8.63 %)		 16,303
(2.05 %)		 63,990
(13.73 %)		 n/a 34.91
(95.70 %)		 26,066
(4.30 %)		 28,407
(95.70 %)		 743,470
(3.99 %)		 393,077
(5.53 %)		 4,897,193
(34.87 %)		 16,140
(0.90 %)
115 cotton G.hirsutum (BGI 2015)
GCF_000987745.1		 112,410
(5.51 %)		 35,047
(1.61 %)		 101,814
(6.75 %)		 n/a 34.45
(97.16 %)		 48,742
(2.84 %)		 57,884
(97.16 %)		 829,774
(2.69 %)		 808,839
(3.64 %)		 12,556,104
(52.01 %)		 31,946
(0.61 %)
116 cotton G.hirsutum (HudsonAlpha 2021)
GCF_007990345.1		 154,134
(6.02 %)		 37,839
(1.61 %)		 107,764
(6.56 %)		 n/a 34.36
(99.87 %)		 5,708
(0.13 %)		 6,735
(99.87 %)		 996,701
(2.36 %)		 903,817
(3.56 %)		 13,123,355
(54.75 %)		 35,220
(0.59 %)
117 cotton G.raimondii
GCF_000327365.1		 72,590
(8.99 %)		 20,368
(2.64 %)		 86,941
(18.36 %)		 n/a 33.22
(98.25 %)		 19,717
(1.76 %)		 20,751
(98.24 %)		 367,610
(3.53 %)		 300,200
(3.32 %)		 5,199,574
(40.83 %)		 10,926
(0.55 %)
118 cowpea (IT97K-499-35 v2 2019)
GCF_004118075.2		 48,588
(10.55 %)		 16,925
(3.30 %)		 44,689
(13.01 %)		 n/a 32.95
(99.48 %)		 68
(0.52 %)		 676
(100.00 %)		 344,688
(3.92 %)		 283,941
(8.14 %)		 3,091,888
(41.66 %)		 24,507
(2.34 %)
119 crookneck pumpkin
GCF_002738365.1		 49,636
(19.79 %)		 18,863
(6.83 %)		 34,588
(19.24 %)		 n/a 36.43
(97.43 %)		 13,813
(2.58 %)		 3,500
(100.00 %)		 181,838
(3.12 %)		 140,936
(7.42 %)		 1,550,544
(33.30 %)		 13,714
(2.69 %)
120 cucumber
GCF_000004075.3		 37,079
(18.45 %)		 13,349
(5.61 %)		 23,889
(15.73 %)		 n/a 32.84
(99.98 %)		 89
(0.02 %)		 88
(100.00 %)		 158,454
(3.72 %)		 77,247
(3.20 %)		 1,739,467
(33.72 %)		 5,730
(1.35 %)
121 cultivated vanilla (Daphna alternate hap 2020)
GCA_016413885.1		 n/a 14,128
(1.63 %)		 42,460
(7.33 %)		 n/a 30.78
(99.98 %)		 2,018
(0.02 %)		 668
(100.00 %)		 377,357
(3.69 %)		 183,159
(2.82 %)		 5,560,199
(36.58 %)		 30,878
(2.75 %)
122 cultivated vanilla (Daphna primary hap 2020)
GCA_016413895.1		 n/a 13,933
(1.63 %)		 40,035
(6.93 %)		 n/a 30.80
(99.98 %)		 1,977
(0.02 %)		 667
(100.00 %)		 373,612
(3.67 %)		 181,531
(2.84 %)		 5,483,268
(36.45 %)		 30,829
(2.75 %)
123 currant tomato (LA2093 2020)
GCA_014964335.1		 n/a 15,541
(2.01 %)		 39,725
(7.40 %)		 n/a 34.48
(99.94 %)		 373
(0.06 %)		 127
(100.00 %)		 369,651
(3.79 %)		 256,146
(4.80 %)		 5,523,685
(41.09 %)		 32,203
(2.29 %)
124 damask rose (2016)
GCA_001662545.1		 n/a 16,060
(1.87 %)		 117,610
(18.87 %)		 n/a 38.73
(97.06 %)		 101,982
(2.91 %)		 409,854
(97.09 %)		 329,911
(1.95 %)		 258,478
(2.82 %)		 3,747,902
(31.42 %)		 48,987
(3.05 %)
125 date palm (Barhee BC4 2019)
GCF_009389715.1		 61,678
(8.40 %)		 18,582
(2.20 %)		 70,121
(14.29 %)		 n/a 40.29
(100.00 %)		 317
(0.00 %)		 2,391
(100.00 %)		 431,923
(8.92 %)		 371,389
(4.19 %)		 2,721,501
(44.16 %)		 89,481
(12.47 %)
126 date palm (Khalas 2013)
GCF_000413155.1		 48,949
(10.55 %)		 16,697
(2.99 %)		 64,523
(16.24 %)		 n/a 39.33
(91.22 %)		 64,723
(8.79 %)		 143,382
(91.21 %)		 284,003
(7.58 %)		 185,641
(2.23 %)		 2,574,645
(27.52 %)		 62,332
(7.21 %)
127 date-plum (Yz01 2020)
GCF_014633365.1		 48,290
(8.05 %)		 15,110
(2.28 %)		 57,536
(14.48 %)		 n/a 36.57
(99.99 %)		 606
(0.01 %)		 43
(100.00 %)		 445,970
(3.39 %)		 319,468
(5.39 %)		 3,687,072
(36.31 %)		 41,402
(3.02 %)
128 desmid P.margaritaceum (SKD-8 2022)
GCA_023375785.1		 n/a 6,643
(0.13 %)		 342,902
(20.03 %)		 n/a 51.10
(86.42 %)		 704,233
(13.62 %)		 1,037,019
(86.38 %)		 4,516,716
(76.58 %)		 2,687,996
(21.25 %)		 15,150,374
(48.80 %)		 680,776
(31.03 %)
129 dessert banana (baxijiao 2024)
GCF_036884655.1		 193,799
(12.81 %)		 52,060
(3.07 %)		 144,859
(15.37 %)		 n/a 39.78
(99.99 %)		 219
(0.01 %)		 1,085
(100.00 %)		 713,274
(2.40 %)		 840,280
(6.39 %)		 4,419,734
(51.60 %)		 203,906
(13.78 %)
130 domesticated barley (Golden Promise 2019)
GCA_902500625.1		 n/a 17,386
(0.43 %)		 252,520
(9.04 %)		 n/a 44.38
(97.83 %)		 621,008
(2.23 %)		 8
(100.00 %)		 3,098,901
(53.34 %)		 2,055,561
(5.88 %)		 14,404,046
(70.52 %)		 706,795
(16.04 %)
131 domesticated barley (H.vulgare 2021 refseq)
GCF_904849725.1		 63,364
(1.67 %)		 17,849
(0.43 %)		 260,921
(9.04 %)		 n/a 44.46
(99.97 %)		 162
(0.03 %)		 291
(100.00 %)		 2,720,197
(55.13 %)		 1,726,335
(5.40 %)		 14,010,390
(72.58 %)		 732,834
(17.24 %)
132 durian
GCF_002303985.1		 68,467
(10.35 %)		 24,627
(3.34 %)		 48,130
(9.41 %)		 n/a 32.64
(99.58 %)		 3,044
(0.43 %)		 677
(100.00 %)		 490,482
(3.80 %)		 509,842
(12.92 %)		 4,397,155
(48.22 %)		 56,957
(6.23 %)
133 durum wheat (2019)
GCA_900231445.1		 n/a 32,523
(0.34 %)		 530,488
(8.17 %)		 n/a 46.01
(98.73 %)		 330,230
(1.28 %)		 330,244
(98.72 %)		 2,723,974
(3.46 %)		 2,746,444
(3.02 %)		 330,244
(98.72 %)		 2,108,395
(25.96 %)
134 eggplant (2014)
GCA_000787875.1		 n/a 15,481
(1.92 %)		 48,974
(7.98 %)		 n/a 35.72
(95.30 %)		 118,249
(4.75 %)		 143,048
(95.25 %)		 317,711
(2.21 %)		 307,772
(4.55 %)		 6,006,653
(38.61 %)		 7,570
(0.50 %)
135 elephant grass (2022)
GCA_022644695.1		 n/a 34,754
(1.95 %)		 231,748
(22.13 %)		 n/a 46.97
(99.99 %)		 1,574
(0.01 %)		 1,588
(99.99 %)		 587,262
(1.41 %)		 551,392
(2.62 %)		 9,678,348
(46.32 %)		 398,884
(36.81 %)
136 emerald green okra A.esculentus (Green Star 2024)
GCA_035048815.1		 n/a 57,092
(4.66 %)		 139,785
(17.31 %)		 n/a 33.78
(99.95 %)		 104
(0.05 %)		 182
(99.95 %)		 665,897
(3.33 %)		 561,368
(7.98 %)		 6,809,885
(45.67 %)		 31,360
(1.27 %)
137 English oak (primary hap 2022)
GCF_932294415.1		 69,211
(8.60 %)		 15,792
(1.92 %)		 66,872
(14.31 %)		 n/a 35.68
(100.00 %)		 119
(0.00 %)		 96
(100.00 %)		 773,652
(4.18 %)		 429,695
(8.87 %)		 4,823,216
(39.65 %)		 21,654
(2.15 %)
138 English walnut
GCF_001411555.2		 52,962
(10.18 %)		 18,927
(3.19 %)		 60,210
(17.37 %)		 n/a 36.21
(99.89 %)		 1,051
(0.11 %)		 24,757
(100.00 %)		 434,989
(3.86 %)		 303,673
(3.70 %)		 3,318,114
(33.94 %)		 24,028
(1.83 %)
139 eudicot A.cruentus (Arusha 2021)
GCA_019425755.1		 n/a 12,903
(3.20 %)		 33,445
(14.99 %)		 n/a 33.08
(99.96 %)		 983
(0.04 %)		 625
(100.00 %)		 891,822
(54.95 %)		 181,416
(3.89 %)		 2,376,097
(36.79 %)		 4,821
(0.53 %)
140 eudicot A.glutinosa (primary hap 2023)
GCF_958979055.1		 42,218
(10.92 %)		 14,784
(3.18 %)		 46,293
(16.46 %)		 n/a 36.73
(100.00 %)		 96
(0.00 %)		 15
(100.00 %)		 433,802
(3.92 %)		 270,411
(4.15 %)		 2,634,547
(36.26 %)		 29,535
(3.72 %)
141 eudicot A.graveolens (Ventura 2020)
GCA_009905375.1		 n/a 17,520
(0.48 %)		 115,295
(5.30 %)		 n/a 35.68
(99.73 %)		 4,633
(0.27 %)		 4,852
(100.00 %)		 1,247,334
(1.96 %)		 1,423,238
(4.75 %)		 11,040,179
(71.10 %)		 31,499
(0.31 %)
142 eudicot C.lanceoleosa (SQ_2022a 2022)
GCA_025200525.1		 n/a 21,858
(0.67 %)		 153,069
(7.18 %)		 n/a 37.63
(99.99 %)		 2,949
(0.01 %)		 790
(100.00 %)		 4,031,259
(23.47 %)		 2,174,993
(6.70 %)		 18,920,250
(54.60 %)		 200,005
(3.83 %)
143 eudicot C.lavandulifolium (G1 2022)
GCA_022545495.1		 n/a 18,954
(0.61 %)		 117,628
(6.04 %)		 n/a 36.02
(99.96 %)		 10,291
(0.04 %)		 178
(100.00 %)		 2,596,263
(19.70 %)		 1,222,904
(3.44 %)		 12,327,164
(55.80 %)		 67,370
(0.88 %)
144 eudicot C.sativa (Pink pepper KNU-18-1 2023)
GCF_029168945.1		 47,822
(7.37 %)		 14,132
(1.76 %)		 52,606
(11.89 %)		 n/a 34.09
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 18
(100.00 %)		 490,095
(3.26 %)		 291,432
(3.68 %)		 3,197,241
(60.23 %)		 29,385
(2.13 %)
145 eudicot C.seticuspe (Gojo-0 2021)
GCA_019973895.1		 n/a 17,958
(0.52 %)		 141,880
(7.25 %)		 n/a 36.23
(98.03 %)		 37,176
(1.97 %)		 45,671
(98.03 %)		 3,118,877
(21.04 %)		 1,512,311
(3.93 %)		 10,481,296
(59.70 %)		 63,123
(0.67 %)
146 eudicot D.spatulata (IRGN DVMQU6P362 2024)
GCA_035668315.1		 n/a 16,707
(3.49 %)		 62,287
(20.90 %)		 n/a 37.76
(99.96 %)		 1,083
(0.03 %)		 24,058
(99.97 %)		 274,473
(12.37 %)		 110,623
(2.62 %)		 2,103,310
(28.32 %)		 22,076
(2.40 %)
147 eudicot E.lathyris (primary hap 2023)
GCF_963576675.1		 54,052
(4.78 %)		 14,372
(1.33 %)		 80,776
(14.35 %)		 n/a 36.88
(100.00 %)		 24
(0.00 %)		 57
(100.00 %)		 496,928
(2.45 %)		 491,703
(4.75 %)		 4,850,176
(50.53 %)		 57,897
(3.26 %)
148 eudicot E.russellianum (2023)
GCA_036186865.1		 n/a 18,823
(1.28 %)		 96,845
(13.58 %)		 n/a 37.91
(99.98 %)		 26,521
(0.02 %)		 100
(100.00 %)		 1,526,493
(77.75 %)		 539,134
(3.70 %)		 6,307,362
(47.97 %)		 31,022
(0.81 %)
149 eudicot G.bilobum (WA Gb01-03AN 2023)
GCF_033153095.1		 45,049
(8.43 %)		 18,010
(3.03 %)		 54,840
(15.32 %)		 n/a 35.23
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 5,089
(100.00 %)		 397,210
(3.11 %)		 254,173
(4.10 %)		 3,228,435
(42.44 %)		 15,343
(0.97 %)
150 eudicot H.pumila (YLH828 2023)
GCF_033568475.1		 51,602
(5.64 %)		 14,506
(1.52 %)		 55,054
(9.40 %)		 n/a 37.18
(100.00 %)		 411
(0.00 %)		 133
(100.00 %)		 397,610
(2.13 %)		 326,774
(3.20 %)		 4,120,854
(57.35 %)		 63,233
(2.52 %)
151 eudicot M.micrantha (NLD-2019 2019)
GCA_009363875.1		 n/a 19,940
(1.00 %)		 96,066
(8.14 %)		 n/a 36.20
(99.99 %)		 1,599
(0.01 %)		 2,815
(100.00 %)		 908,702
(2.54 %)		 980,385
(4.65 %)		 9,286,677
(54.99 %)		 89,410
(1.77 %)
152 eudicot N.benthamiana (KLAB 2023)
GCA_034376525.1		 n/a 27,772
(0.99 %)		 128,971
(6.28 %)		 n/a 37.84
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 667
(100.00 %)		 4,744,181
(80.09 %)		 1,261,453
(5.53 %)		 18,063,531
(49.81 %)		 86,419
(1.62 %)
153 eudicot N.caerulescens (Cira 2024)
GCA_046127275.1		 n/a 20,205
(8.11 %)		 49,304
(30.44 %)		 n/a 39.42
(99.99 %)		 41
(0.01 %)		 1,181
(100.00 %)		 413,962
(43.41 %)		 125,005
(11.92 %)		 1,047,909
(36.93 %)		 24,840
(5.52 %)
154 eudicot P.eburnea (SZY01 2022)
GCF_022965805.1		 61,645
(7.70 %)		 19,490
(2.24 %)		 62,769
(12.34 %)		 n/a 37.11
(99.83 %)		 1,024
(0.17 %)		 1,225
(100.00 %)		 314,817
(1.84 %)		 291,276
(6.35 %)		 3,964,714
(53.25 %)		 61,424
(2.69 %)
155 eudicot P.frutescens var. frutescens (PF040 2021)
GCA_019511825.2		 n/a 28,418
(2.15 %)		 120,101
(15.79 %)		 n/a 35.13
(99.99 %)		 763
(0.01 %)		 1,465
(100.00 %)		 1,497,762
(21.02 %)		 662,726
(4.46 %)		 8,218,287
(43.32 %)		 65,299
(2.16 %)
156 eudicot P.huaijiensis (GDHJ02 2020)
GCF_012295235.1		 55,830
(12.29 %)		 19,054
(3.86 %)		 48,657
(15.27 %)		 n/a 35.65
(97.46 %)		 31,613
(2.54 %)		 21,121
(100.00 %)		 195,798
(1.99 %)		 128,140
(2.47 %)		 2,568,483
(41.18 %)		 16,399
(1.28 %)
157 eudicot P.nigra (primary hap 2023)
GCF_951802175.1		 55,369
(16.07 %)		 19,591
(4.65 %)		 41,748
(16.14 %)		 n/a 34.95
(99.99 %)		 277
(0.01 %)		 21
(100.00 %)		 256,070
(2.83 %)		 178,940
(8.44 %)		 2,317,187
(40.87 %)		 3,317
(6.62 %)
158 eudicot P.vulgaris (G19833 2024)
GCF_000499845.2		 48,620
(10.29 %)		 16,779
(3.20 %)		 47,438
(13.87 %)		 n/a 35.62
(98.95 %)		 566
(1.05 %)		 1,034
(98.95 %)		 245,672
(2.41 %)		 239,601
(4.78 %)		 2,887,505
(44.41 %)		 44,689
(7.20 %)
159 eudicot R.rugosa (primary hap 2023)
GCF_958449725.1		 62,563
(15.19 %)		 15,236
(3.45 %)		 60,387
(23.53 %)		 n/a 39.30
(99.95 %)		 1,014
(0.05 %)		 77
(100.00 %)		 226,730
(2.23 %)		 196,099
(4.12 %)		 1,632,269
(33.79 %)		 38,448
(5.69 %)
160 eudicot S.americanum (SP2273 SP2273 2023)
GCA_030463325.1		 n/a 15,767
(1.56 %)		 57,615
(9.26 %)		 n/a 36.15
(100.00 %)		 214
(0.00 %)		 90
(100.00 %)		 2,179,570
(59.21 %)		 301,263
(3.51 %)		 5,651,338
(51.90 %)		 28,868
(1.00 %)
161 eudicot S.americanum (SP2275 SP2275 2023)
GCA_030463385.1		 n/a 15,677
(1.56 %)		 57,771
(9.32 %)		 n/a 36.18
(100.00 %)		 n/a 540
(100.00 %)		 2,161,174
(59.26 %)		 298,020
(3.34 %)		 5,624,901
(52.02 %)		 29,520
(1.04 %)
162 eudicot S.miltiorrhiza (Shanhuang shh 2023)
GCA_028751815.1		 n/a 15,144
(2.60 %)		 67,052
(21.48 %)		 n/a 37.46
(99.58 %)		 695
(0.42 %)		 171
(100.00 %)		 614,263
(17.32 %)		 364,006
(5.05 %)		 2,679,398
(42.13 %)		 64,170
(6.16 %)
163 eudicot T.arvense (2022)
GCA_911865555.2		 n/a 23,487
(5.55 %)		 54,244
(16.93 %)		 n/a 38.39
(100.00 %)		 24
(0.00 %)		 964
(100.00 %)		 204,363
(1.86 %)		 150,149
(5.58 %)		 2,245,900
(50.03 %)		 35,971
(3.77 %)
164 eudicot V.riparia x Vitis rupestris (2022)
GCA_946000675.1		 n/a 29,137
(2.81 %)		 89,605
(14.72 %)		 n/a 35.15
(99.99 %)		 102
(0.01 %)		 596
(99.99 %)		 664,293
(2.97 %)		 503,960
(9.26 %)		 5,715,446
(39.21 %)		 22,264
(1.77 %)
165 eudicot V.rotundifolia (Noble 2022)
GCA_022557335.1		 n/a 13,992
(3.39 %)		 38,479
(14.93 %)		 n/a 33.54
(99.82 %)		 17,084
(0.19 %)		 17,104
(99.81 %)		 696,697
(51.55 %)		 178,090
(4.22 %)		 2,480,890
(32.65 %)		 6,497
(0.70 %)
166 Euphrates poplar (v2 2014)
GCF_000495115.2		 56,366
(12.92 %)		 20,853
(4.29 %)		 41,483
(12.40 %)		 n/a 32.05
(95.31 %)		 22,764
(4.70 %)		 32,266
(95.30 %)		 357,310
(3.64 %)		 246,638
(4.06 %)		 2,660,781
(43.22 %)		 2,691
(0.38 %)
167 European chestnut (Marrone di Chiusa Pesio 2024)
GCF_040712315.1		 49,645
(7.87 %)		 15,653
(2.10 %)		 61,041
(13.43 %)		 n/a 35.42
(100.00 %)		 65
(0.00 %)		 13
(100.00 %)		 595,120
(3.41 %)		 355,816
(4.98 %)		 4,680,964
(38.07 %)		 20,075
(1.41 %)
168 European crab apple (2022)
GCF_916048215.2		 77,800
(12.38 %)		 22,539
(3.42 %)		 67,761
(16.26 %)		 n/a 38.07
(99.99 %)		 101
(0.01 %)		 34
(100.00 %)		 309,302
(2.18 %)		 331,724
(5.06 %)		 2,996,468
(41.19 %)		 25,597
(2.08 %)
169 European hazelnut (Tombul 2020)
GCF_901000735.1		 39,203
(13.04 %)		 15,600
(4.11 %)		 42,096
(18.23 %)		 n/a 35.90
(99.54 %)		 14,532
(0.48 %)		 12
(100.00 %)		 358,479
(3.69 %)		 179,807
(3.40 %)		 2,234,313
(32.05 %)		 12,963
(1.47 %)
170 European hop (primary hap 2023)
GCF_963169125.1		 72,613
(2.92 %)		 14,868
(0.56 %)		 135,918
(7.87 %)		 n/a 39.00
(100.00 %)		 129
(0.00 %)		 319
(100.00 %)		 1,077,704
(2.26 %)		 853,368
(5.27 %)		 13,477,464
(61.64 %)		 152,063
(4.18 %)
171 European hop (Shinshu Wase 2014)
GCA_000831365.1		 n/a 17,158
(0.86 %)		 191,202
(13.47 %)		 n/a 38.57
(86.69 %)		 530,762
(13.34 %)		 292,698
(86.67 %)		 770,031
(2.12 %)		 637,135
(3.75 %)		 13,484,203
(41.57 %)		 81,500
(2.36 %)
172 European mistletoe (primary hap 2023)
GCA_963277665.1		 n/a 12,110
(0.01 %)		 960,545
(1.07 %)		 n/a 31.25
(100.00 %)		 6,368
(0.00 %)		 5,951
(100.00 %)		 61,111,090
(11.87 %)		 29,667,857
(2.75 %)		 11,464
(100.00 %)		 1,680,995
(2.36 %)
173 false flax
GCF_000633955.1		 123,030
(22.63 %)		 61,894
(13.77 %)		 113,219
(31.09 %)		 n/a 36.55
(92.99 %)		 74,428
(7.02 %)		 37,780
(99.99 %)		 346,267
(2.46 %)		 233,837
(5.56 %)		 3,452,066
(27.34 %)		 32,235
(2.62 %)
174 fava bean (2023)
GCA_948472305.1		 n/a 18,459
(0.14 %)		 221,591
(2.78 %)		 n/a 37.44
(100.00 %)		 5,330
(0.00 %)		 3,992
(100.00 %)		 4,140,168
(2.97 %)		 4,673,353
(13.95 %)		 36,694,276
(79.21 %)		 59,853
(0.73 %)
175 Fendler's bladderpod (2019)
GCA_900406525.1		 n/a 29,791
(9.22 %)		 82,813
(26.56 %)		 n/a 34.83
(99.51 %)		 109,570
(0.49 %)		 209,502
(99.51 %)		 193,365
(2.63 %)		 165,270
(4.54 %)		 2,180,278
(29.35 %)		 8,339
(0.91 %)
176 Fendler's bladderpod (WCL-YS1 PI 610492 2024)
GCA_036630335.1		 n/a 23,679
(9.84 %)		 43,179
(26.89 %)		 n/a 34.92
(96.38 %)		 98,816
(3.75 %)		 9,891
(100.00 %)		 373,519
(23.21 %)		 328,539
(16.37 %)		 1,720,493
(26.70 %)		 5,729
(0.77 %)
177 ferns C-fern (Hn-n Whitten #5841 2021)
GCA_020310875.1		 n/a 9,421
(0.09 %)		 135,222
(2.48 %)		 n/a 38.64
(99.38 %)		 4,604
(0.62 %)		 10,776
(99.38 %)		 2,992,638
(8.23 %)		 4,552,105
(9.86 %)		 24,840,439
(73.42 %)		 166,309
(1.00 %)
178 field dodder (2020)
GCA_900332095.2		 n/a 20,063
(4.21 %)		 57,416
(19.19 %)		 n/a 35.99
(94.55 %)		 29,211
(5.47 %)		 36,112
(94.53 %)		 448,370
(12.07 %)		 208,393
(3.46 %)		 2,648,975
(35.75 %)		 35,117
(3.87 %)
179 field mustard (Chiifu-401-42 2020)
GCF_000309985.2		 73,442
(34.55 %)		 30,193
(10.12 %)		 57,010
(25.57 %)		 n/a 36.83
(99.39 %)		 408
(0.61 %)		 1,100
(100.00 %)		 261,522
(15.13 %)		 196,553
(8.43 %)		 1,533,242
(38.01 %)		 24,895
(5.44 %)
180 field pennycress (KM-2021 2021)
GCA_018983045.1		 n/a 22,245
(5.38 %)		 51,310
(16.10 %)		 n/a 39.02
(99.92 %)		 1,923
(0.08 %)		 2,298
(100.00 %)		 172,036
(1.52 %)		 129,452
(6.55 %)		 2,388,667
(53.91 %)		 37,074
(4.98 %)
181 finger millet (KNE 796-S 2023)
GCA_032690845.1		 n/a 31,097
(3.07 %)		 140,467
(22.19 %)		 n/a 43.87
(99.87 %)		 142
(0.13 %)		 674
(99.87 %)		 1,168,206
(39.18 %)		 229,202
(4.14 %)		 4,910,934
(41.23 %)		 205,561
(17.19 %)
182 finger millet (ML-365 2017)
GCA_002180455.1		 n/a 30,000
(2.41 %)		 346,692
(27.97 %)		 n/a 45.34
(98.74 %)		 507,646
(1.30 %)		 1,033,269
(98.70 %)		 323,234
(1.19 %)		 394,943
(6.28 %)		 6,129,348
(33.00 %)		 325,103
(21.18 %)
183 flowering dogwood (Cherokee Brave 2023)
GCF_030987335.1		 63,465
(6.03 %)		 17,263
(1.31 %)		 78,564
(9.37 %)		 n/a 35.95
(100.00 %)		 96
(0.00 %)		 459
(100.00 %)		 982,341
(3.33 %)		 719,891
(7.87 %)		 6,810,592
(50.46 %)		 27,883
(2.10 %)
184 foxtail millet
GCF_000263155.2		 40,951
(13.47 %)		 17,758
(5.07 %)		 60,598
(30.59 %)		 n/a 46.14
(98.82 %)		 6,442
(1.19 %)		 6,779
(98.81 %)		 115,365
(1.46 %)		 116,980
(2.45 %)		 1,691,260
(29.31 %)		 78,297
(28.27 %)
185 fried-egg orchid (Lindl 2021)
GCA_019925795.1		 n/a 13,889
(0.88 %)		 71,188
(7.43 %)		 n/a 35.53
(99.95 %)		 1,481
(0.05 %)		 822
(100.00 %)		 671,921
(2.91 %)		 624,024
(4.46 %)		 7,792,634
(47.85 %)		 76,668
(3.16 %)
186 garden asparagus (2017)
GCF_001876935.1		 45,159
(4.02 %)		 13,440
(1.02 %)		 85,207
(11.07 %)		 n/a 39.02
(97.02 %)		 47,391
(2.99 %)		 56,182
(97.01 %)		 427,496
(2.02 %)		 885,946
(8.32 %)		 6,075,356
(46.49 %)		 111,109
(6.80 %)
187 garden lettuce (Salinas v11 2022)
GCF_002870075.4		 69,048
(2.69 %)		 16,407
(0.56 %)		 105,654
(5.75 %)		 n/a 37.92
(99.95 %)		 384
(0.05 %)		 93
(100.00 %)		 1,192,578
(2.37 %)		 1,282,344
(4.72 %)		 12,843,881
(61.50 %)		 160,781
(2.86 %)
188 garden pea (Zhongwan6 2022)
GCF_024323335.1		 74,264
(1.88 %)		 17,744
(0.43 %)		 129,692
(4.97 %)		 n/a 37.94
(99.73 %)		 826
(0.27 %)		 1,566
(100.00 %)		 1,517,586
(2.16 %)		 1,541,702
(5.89 %)		 13,206,825
(66.95 %)		 105,766
(0.97 %)
189 garlic-fruit tree (guangnan 2023)
GCF_029873635.1		 43,473
(2.84 %)		 13,544
(0.88 %)		 64,877
(5.24 %)		 n/a 36.06
(100.00 %)		 596
(0.00 %)		 510
(100.00 %)		 1,556,970
(22.50 %)		 788,188
(5.25 %)		 10,081,845
(53.72 %)		 41,032
(1.09 %)
190 ghaf (Desert tree PC_DT_omini 2023)
GCF_029017545.1		 59,652
(8.73 %)		 18,917
(2.55 %)		 47,052
(9.22 %)		 n/a 32.09
(99.98 %)		 1,693
(0.02 %)		 2,266
(100.00 %)		 452,206
(3.00 %)		 195,931
(2.27 %)		 4,921,469
(39.63 %)		 9,731
(0.69 %)
191 ginger
GCF_018446385.1		 127,579
(4.07 %)		 33,995
(0.96 %)		 186,756
(7.79 %)		 n/a 39.16
(100.00 %)		 901
(0.00 %)		 211
(100.00 %)		 1,187,168
(2.18 %)		 2,088,683
(6.47 %)		 12,917,773
(61.42 %)		 398,512
(10.38 %)
192 globe artichoke (v1.1 2C 2018)
GCF_001531365.2		 42,106
(6.72 %)		 15,819
(2.23 %)		 49,753
(11.10 %)		 n/a 35.35
(90.31 %)		 310,402
(9.76 %)		 13,479
(99.93 %)		 394,793
(2.75 %)		 364,336
(3.37 %)		 4,190,750
(39.49 %)		 12,198
(0.64 %)
193 goatgrass A.strangulata
GCF_002575655.1		 87,385
(2.18 %)		 17,963
(0.44 %)		 263,708
(10.29 %)		 n/a 46.32
(97.73 %)		 107,163
(2.27 %)		 109,126
(100.00 %)		 1,490,873
(15.60 %)		 1,415,562
(5.65 %)		 12,540,551
(71.59 %)		 881,849
(29.81 %)
194 goatgrass A.tauschii
GCF_001957025.1		 69,195
(1.77 %)		 18,614
(0.43 %)		 300,274
(11.28 %)		 n/a 46.38
(100.00 %)		 n/a 68,537
(100.00 %)		 1,555,328
(15.65 %)		 1,485,488
(4.71 %)		 13,133,338
(73.17 %)		 928,327
(30.84 %)
195 goatgrass A.tauschii.strangulata (AL8/78 2024)
GCF_002575655.3		 93,689
(2.58 %)		 18,524
(0.46 %)		 261,939
(10.44 %)		 n/a 46.35
(99.97 %)		 347
(0.03 %)		 1,115
(100.00 %)		 1,094,634
(1.42 %)		 1,403,604
(6.42 %)		 12,367,986
(72.90 %)		 849,453
(31.38 %)
196 goji berry (Lr01 2021)
GCF_019175385.1		 69,808
(4.35 %)		 17,353
(1.01 %)		 81,347
(7.68 %)		 n/a 38.10
(99.95 %)		 1,565
(0.05 %)		 166
(100.00 %)		 816,909
(2.29 %)		 708,412
(4.09 %)		 8,106,901
(53.67 %)		 66,433
(1.82 %)
197 golden kiwifruit (Hongyang 2019)
GCA_009663005.1		 n/a 21,161
(2.89 %)		 55,843
(11.78 %)		 n/a 35.63
(99.99 %)		 646
(0.01 %)		 2,366
(99.99 %)		 423,518
(2.92 %)		 293,299
(3.76 %)		 4,466,312
(33.71 %)		 25,250
(1.74 %)
198 golden kiwifruit (Red5 2018)
GCA_003024255.1		 n/a 22,332
(3.88 %)		 51,709
(13.62 %)		 n/a 35.31
(96.44 %)		 25,521
(3.57 %)		 1,234
(100.00 %)		 347,035
(2.87 %)		 241,862
(4.11 %)		 3,578,217
(30.95 %)		 19,259
(1.41 %)
199 grain amaranth (AhG2s 2020)
GCA_000753965.2		 n/a 13,698
(3.27 %)		 34,546
(14.58 %)		 n/a 32.99
(90.06 %)		 7,031
(9.94 %)		 1,567
(100.00 %)		 217,772
(3.32 %)		 181,251
(3.71 %)		 2,391,775
(32.66 %)		 4,425
(0.40 %)
200 great duckweed (2018)
GCA_900492545.1		 n/a 10,264
(6.56 %)		 16,841
(26.52 %)		 n/a 42.27
(99.98 %)		 84
(0.02 %)		 20
(100.00 %)		 96,389
(3.49 %)		 54,278
(2.54 %)		 843,136
(22.61 %)		 18,978
(24.35 %)
201 great duckweed (9509 2017)
GCA_001981405.1		 n/a 10,023
(7.00 %)		 16,353
(26.89 %)		 n/a 42.30
(92.78 %)		 89,257
(7.32 %)		 89,277
(92.68 %)		 80,787
(2.86 %)		 45,432
(1.93 %)		 786,155
(19.70 %)		 19,057
(20.99 %)
202 green algae (1602 2018)
GCA_002245835.2		 n/a 770
(0.70 %)		 5,466
(68.75 %)		 n/a 63.95
(100.00 %)		 n/a 159
(100.00 %)		 62,109
(5.65 %)		 29,993
(4.25 %)		 581,123
(37.15 %)		 127
(97.30 %)
203 green algae (18125 2025)
GCA_048595725.1		 n/a 865
(2.16 %)		 3,109
(76.75 %)		 n/a 67.78
(100.00 %)		 n/a 55
(100.00 %)		 35,578
(6.99 %)		 19,197
(3.61 %)		 216,318
(31.95 %)		 54
(99.88 %)
204 green algae (211/11P 2022)
GCA_023343905.1		 n/a 1,009
(1.60 %)		 4,892
(65.40 %)		 n/a 61.60
(98.43 %)		 12
(1.57 %)		 57
(98.43 %)		 48,271
(5.94 %)		 22,435
(3.81 %)		 358,729
(31.71 %)		 405
(96.46 %)
205 green algae (ATCC 16529 2021)
GCA_016906385.1		 n/a 748
(2.62 %)		 2,222
(71.29 %)		 n/a 64.15
(97.91 %)		 6,559
(2.25 %)		 19
(100.00 %)		 268
(0.10 %)		 2,320
(1.18 %)		 110,762
(22.64 %)		 29
(99.25 %)
206 green algae (CCAP 19/42 2023)
GCA_031753455.1		 n/a 1,362
(0.45 %)		 15,767
(32.44 %)		 n/a 49.19
(100.00 %)		 n/a 300
(100.00 %)		 442,436
(43.24 %)		 171,808
(11.44 %)		 978,912
(31.81 %)		 10,820
(2.10 %)
207 green algae (CCMP1545 2009)
GCF_000151265.4		 10,237
(66.85 %)		 988
(3.27 %)		 4,789
(69.24 %)		 n/a 65.94
(98.86 %)		 583
(1.14 %)		 497
(98.86 %)		 37,284
(8.77 %)		 20,399
(4.09 %)		 206,658
(48.59 %)		 43
(99.34 %)
208 green algae (HMC1 2018)
GCA_003255715.1		 n/a 1,000
(1.89 %)		 7,921
(69.96 %)		 n/a 62.97
(97.56 %)		 2,472
(2.45 %)		 3,774
(100.00 %)		 10,519
(1.96 %)		 4,558
(1.31 %)		 172,635
(22.08 %)		 3,978
(96.84 %)
209 green algae (JCM 15793 2018)
GCA_002897115.2		 n/a 1,087
(3.87 %)		 3,215
(73.44 %)		 n/a 61.27
(98.39 %)		 10,986
(1.68 %)		 46
(100.00 %)		 8,982
(1.85 %)		 3,745
(0.85 %)		 119,487
(14.35 %)		 79
(99.57 %)
210 green algae (JCM 9641 2017)
GCA_002794665.1		 n/a 928
(3.73 %)		 2,196
(76.87 %)		 n/a 73.37
(97.42 %)		 12,055
(2.67 %)		 27
(100.00 %)		 15,929
(5.38 %)		 7,990
(2.29 %)		 164,687
(38.62 %)		 30
(99.90 %)
211 green algae (KO-2023 2023)
GCA_030272585.1		 n/a 1,751
(1.39 %)		 15,265
(40.46 %)		 n/a 46.07
(100.00 %)		 n/a 29
(100.00 %)		 60,131
(4.76 %)		 34,318
(3.34 %)		 393,810
(24.33 %)		 19,071
(23.42 %)
212 green algae (LANL1001 2019)
GCA_006384855.1		 n/a 2,016
(0.62 %)		 31,585
(41.01 %)		 n/a 57.91
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 3,614
(100.00 %)		 183,076
(3.30 %)		 101,860
(5.85 %)		 972,524
(32.54 %)		 4,760
(98.23 %)
213 green algae (RCC4221 2014)
GCA_000214015.2		 n/a 1,108
(6.57 %)		 3,692
(76.52 %)		 n/a 59.39
(99.94 %)		 477
(0.07 %)		 20
(100.00 %)		 8,604
(3.92 %)		 4,944
(2.18 %)		 102,578
(28.06 %)		 20
(99.94 %)
214 green algae (SAG 2063 2018)
GCA_003613005.1		 n/a 869
(2.13 %)		 9,821
(78.63 %)		 n/a 67.62
(98.00 %)		 579
(1.95 %)		 7,535
(98.05 %)		 35,537
(6.91 %)		 19,692
(3.56 %)		 218,412
(30.60 %)		 6,958
(98.59 %)
215 green algae (YS-2018 2019)
GCA_004138255.1		 n/a 1,365
(1.08 %)		 11,070
(58.24 %)		 n/a 55.95
(98.44 %)		 780
(1.56 %)		 597
(100.00 %)		 25,537
(1.66 %)		 27,257
(3.92 %)		 365,387
(19.48 %)		 3,732
(86.39 %)
216 green algae A.protothecoides (0710 2014)
GCF_000733215.1		 7,014
(37.71 %)		 966
(2.72 %)		 2,947
(70.38 %)		 n/a 63.54
(95.35 %)		 1,012
(4.66 %)		 1,386
(95.34 %)		 8,655
(1.88 %)		 3,803
(1.89 %)		 147,537
(20.31 %)		 604
(53.91 %)
217 green algae B.prasinos (RCC1105 2012)
GCF_002220235.1		 7,904
(82.34 %)		 1,231
(6.04 %)		 4,460
(76.24 %)		 n/a 48.02
(99.76 %)		 20
(0.24 %)		 21
(100.00 %)		 17,900
(4.88 %)		 5,674
(1.75 %)		 113,699
(21.91 %)		 7
(0.01 %)
218 green algae C.reinhardtii (CC-5816 2022)
GCA_026108075.1		 n/a 1,057
(0.55 %)		 9,735
(58.02 %)		 n/a 64.03
(100.00 %)		 n/a 17
(100.00 %)		 166,909
(9.00 %)		 120,034
(10.13 %)		 750,946
(37.60 %)		 166
(99.31 %)
219 green algae C.reinhardtii (v2 CC-503 cw92 mt+ 2018 refseq)
GCF_000002595.2		 19,527
(53.99 %)		 990
(0.56 %)		 9,689
(59.71 %)		 n/a 64.08
(96.36 %)		 1,459
(3.65 %)		 1,512
(96.35 %)		 174,119
(17.13 %)		 110,553
(6.12 %)		 748,240
(34.06 %)		 92
(46.06 %)
220 green algae C.subellipsoidea (C-169 2012)
GCF_000258705.1		 9,839
(29.70 %)		 1,307
(1.78 %)		 8,108
(53.71 %)		 n/a 52.94
(100.00 %)		 n/a 29
(100.00 %)		 8,446
(0.85 %)		 5,471
(0.85 %)		 265,761
(14.34 %)		 11,329
(19.64 %)
221 green algae C.variabilis (NC64A 2010 refseq)
GCF_000147415.1		 9,780
(32.79 %)		 744
(1.00 %)		 4,520
(67.55 %)		 n/a 67.14
(91.48 %)		 3,543
(8.55 %)		 3,810
(91.45 %)		 64,770
(8.22 %)		 28,736
(2.86 %)		 416,740
(37.15 %)		 756
(45.48 %)
222 green algae K.nitens (NIES-2285 2014)
GCA_000708835.1		 n/a 2,471
(1.78 %)		 14,771
(54.27 %)		 n/a 52.42
(98.98 %)		 2,081
(1.02 %)		 3,731
(98.98 %)		 10,051
(0.46 %)		 14,278
(1.14 %)		 388,120
(8.55 %)		 8,698
(83.31 %)
223 green algae M.commoda (RCC299 2009)
GCF_000090985.2		 10,137
(72.46 %)		 1,301
(4.51 %)		 5,667
(86.20 %)		 n/a 63.82
(100.00 %)		 n/a 19
(100.00 %)		 14,619
(3.58 %)		 8,937
(2.75 %)		 178,499
(27.69 %)		 10
(25.23 %)
224 green algae M.neglectum (SAG 48.87 2015)
GCF_000611645.1		 16,734
(25.96 %)		 666
(0.47 %)		 12,122
(60.02 %)		 n/a 64.75
(96.59 %)		 5,358
(3.43 %)		 12,077
(96.57 %)		 73,343
(6.73 %)		 43,518
(3.04 %)		 568,630
(31.80 %)		 7,776
(96.69 %)
225 green algae M.pusilla (CCMP1545 2009)
GCF_000151265.2		 10,242
(66.86 %)		 990
(3.27 %)		 4,789
(69.24 %)		 n/a 65.94
(98.86 %)		 583
(1.14 %)		 497
(98.86 %)		 36,818
(8.73 %)		 20,399
(4.09 %)		 206,658
(48.59 %)		 32
(47.70 %)
226 green algae O.lucimarinus (CCE9901 2007)
GCF_000092065.1		 7,603
(72.01 %)		 1,064
(6.25 %)		 3,493
(72.08 %)		 n/a 60.44
(100.00 %)		 n/a 21
(100.00 %)		 11,026
(5.45 %)		 11,732
(3.90 %)		 107,661
(34.88 %)		 12
(61.27 %)
227 green algae O.tauri (RCC4221 2014)
GCF_000214015.3		 7,766
(82.33 %)		 1,131
(6.60 %)		 3,714
(76.22 %)		 n/a 59.21
(99.94 %)		 477
(0.07 %)		 22
(100.00 %)		 8,503
(3.84 %)		 4,946
(2.16 %)		 102,428
(27.87 %)		 16
(57.14 %)
228 green algae V.carteri (Eve 2010)
GCF_000143455.1		 14,333
(21.46 %)		 1,411
(0.77 %)		 13,095
(47.93 %)		 n/a 55.97
(91.15 %)		 12,014
(8.87 %)		 11,352
(91.13 %)		 175,729
(14.69 %)		 105,113
(5.10 %)		 667,226
(23.91 %)		 4,325
(42.65 %)
229 green chiretta (2019)
GCF_009805555.1		 46,094
(16.56 %)		 14,632
(4.66 %)		 34,242
(19.36 %)		 n/a 33.53
(100.00 %)		 n/a 271
(100.00 %)		 293,800
(4.64 %)		 151,157
(7.38 %)		 1,732,880
(41.88 %)		 21,835
(6.05 %)
230 green foxtail
GCF_005286985.1		 47,022
(14.66 %)		 17,750
(5.12 %)		 60,106
(30.88 %)		 n/a 46.17
(99.85 %)		 61
(0.15 %)		 76
(99.85 %)		 116,493
(1.51 %)		 120,039
(2.72 %)		 1,676,017
(29.11 %)		 75,497
(29.44 %)
231 green foxtail (2024)
GCF_005286985.2		 43,377
(14.56 %)		 17,909
(5.15 %)		 60,312
(30.80 %)		 n/a 46.17
(99.96 %)		 14
(0.04 %)		 40
(99.96 %)		 117,054
(1.49 %)		 121,212
(2.84 %)		 1,685,787
(29.32 %)		 75,777
(29.49 %)
232 green foxtail (ME034v 2020)
GCA_012934335.1		 n/a 18,040
(5.19 %)		 61,671
(31.38 %)		 n/a 45.99
(100.00 %)		 54
(0.00 %)		 63
(100.00 %)		 105,738
(1.38 %)		 87,424
(2.22 %)		 1,777,815
(26.85 %)		 74,932
(30.30 %)
233 guar (PI 68867901 SD 2022)
GCA_026586085.1		 n/a 16,149
(3.62 %)		 40,368
(13.76 %)		 n/a 32.74
(100.00 %)		 n/a 627
(100.00 %)		 724,179
(25.31 %)		 196,353
(10.67 %)		 2,757,251
(41.21 %)		 9,690
(0.94 %)
234 guar (short-day 2024)
GCA_037177725.1		 n/a 16,198
(3.33 %)		 43,918
(13.95 %)		 n/a 33.41
(100.00 %)		 24
(0.00 %)		 237
(100.00 %)		 813,394
(29.89 %)		 243,439
(13.12 %)		 2,549,208
(42.63 %)		 10,217
(1.78 %)
235 Guinea yam (TDr96_F1 2017)
GCA_002240015.2		 n/a 11,944
(2.63 %)		 37,372
(13.64 %)		 n/a 35.58
(88.95 %)		 1,032,823
(11.31 %)		 21
(100.00 %)		 293,868
(3.21 %)		 174,614
(3.18 %)		 2,690,184
(32.53 %)		 15,323
(1.42 %)
236 habanero-type pepper (PI159236 2017)
GCA_002271895.2		 n/a 16,562
(0.53 %)		 72,911
(2.91 %)		 n/a 34.88
(98.35 %)		 196,261
(1.66 %)		 87,978
(100.00 %)		 1,136,015
(1.95 %)		 1,019,921
(4.33 %)		 22,445,162
(47.06 %)		 20,737
(0.24 %)
237 hairy vetch (HV-30 2023)
GCF_029867415.1		 88,183
(5.03 %)		 22,129
(1.02 %)		 118,243
(9.15 %)		 n/a 35.63
(99.98 %)		 3,486
(0.02 %)		 1,888
(100.00 %)		 1,001,308
(2.63 %)		 1,132,664
(5.72 %)		 8,340,755
(56.16 %)		 43,665
(1.21 %)
238 Hall's panicgrass
GCF_002211085.1		 43,787
(9.63 %)		 17,635
(3.85 %)		 66,270
(23.98 %)		 n/a 46.87
(98.63 %)		 736
(1.37 %)		 1,027
(98.63 %)		 157,811
(1.55 %)		 119,571
(2.57 %)		 2,107,254
(45.30 %)		 102,278
(32.16 %)
239 Hawaiian beggarticks (Kalapana, Puna primary hap 2024)
GCF_021521415.1		 100,198
(3.70 %)		 41,058
(1.06 %)		 207,532
(8.30 %)		 n/a 37.08
(100.00 %)		 n/a 15,833
(100.00 %)		 2,024,684
(2.90 %)		 1,837,742
(5.29 %)		 17,556,257
(56.19 %)		 201,310
(3.34 %)
240 Himalayan balsam (dImpGla2.1 2021)
GCF_907164915.1		 40,392
(7.39 %)		 16,711
(2.29 %)		 50,292
(11.24 %)		 n/a 32.12
(99.95 %)		 858
(0.05 %)		 1,115
(100.00 %)		 439,789
(3.56 %)		 574,639
(8.97 %)		 4,147,814
(47.01 %)		 16,291
(1.13 %)
241 Himalayan yew (Yunnan 2021)
GCA_018340775.1		 n/a 11,782
(0.08 %)		 129,658
(1.42 %)		 n/a 36.91
(99.99 %)		 11,130
(0.01 %)		 150
(100.00 %)		 2,861,102
(1.57 %)		 2,476,232
(2.57 %)		 65,436,741
(53.97 %)		 157,149
(0.72 %)
242 horseweed
GCF_010389155.1		 39,622
(11.54 %)		 14,718
(3.15 %)		 42,194
(16.23 %)		 n/a 34.08
(99.99 %)		 502
(0.01 %)		 357
(100.00 %)		 267,124
(2.84 %)		 155,729
(2.71 %)		 2,475,353
(36.48 %)		 5,205
(0.40 %)
243 Indian licorice
GCF_003935025.1		 44,610
(13.60 %)		 17,108
(4.95 %)		 34,097
(14.33 %)		 n/a 31.84
(100.00 %)		 184
(0.00 %)		 160
(100.00 %)		 217,674
(3.40 %)		 106,243
(4.04 %)		 2,232,509
(38.91 %)		 5,438
(1.06 %)
244 interior live oak (QUWIS_CCGP_1 alternate hap 2022)
GCA_023055485.1		 n/a 16,184
(2.02 %)		 66,215
(14.16 %)		 n/a 35.37
(100.00 %)		 82
(0.00 %)		 689
(100.00 %)		 739,891
(4.58 %)		 435,389
(7.62 %)		 4,843,419
(38.03 %)		 13,298
(2.56 %)
245 interior live oak (QUWIS_CCGP_1 primary hap 2022)
GCA_023055345.1		 n/a 15,832
(2.09 %)		 63,488
(14.36 %)		 n/a 35.19
(100.00 %)		 81
(0.00 %)		 358
(100.00 %)		 703,028
(4.29 %)		 399,798
(6.48 %)		 4,662,881
(36.96 %)		 12,534
(1.92 %)
246 island oak (RSA801373 alternate hap 2023)
GCA_028535165.1		 n/a 15,893
(1.97 %)		 68,998
(15.27 %)		 n/a 35.87
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 156
(100.00 %)		 746,424
(4.43 %)		 451,117
(7.39 %)		 4,820,434
(38.55 %)		 20,367
(2.62 %)
247 island oak (RSA801373 primary hap 2023)
GCA_028535515.1		 n/a 15,880
(1.95 %)		 69,093
(15.25 %)		 n/a 35.97
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 274
(100.00 %)		 751,691
(4.60 %)		 457,914
(7.61 %)		 4,850,082
(38.95 %)		 20,561
(3.01 %)
248 J.microcarpa x regia eudicots (UCDavis 2019)
GCF_004785595.1		 50,504
(10.14 %)		 18,451
(3.41 %)		 55,094
(16.89 %)		 n/a 36.30
(99.18 %)		 54
(0.82 %)		 154
(100.00 %)		 411,290
(3.65 %)		 260,413
(3.49 %)		 3,023,907
(31.93 %)		 23,270
(1.88 %)
249 Japanese apricot
GCF_000346735.1		 32,312
(19.60 %)		 14,463
(6.46 %)		 33,049
(23.94 %)		 n/a 37.45
(92.82 %)		 15,597
(7.20 %)		 23,761
(92.80 %)		 118,757
(2.25 %)		 84,983
(4.53 %)		 1,374,244
(23.24 %)		 7,808
(1.87 %)
250 Japanese cedar (2023)
GCF_030272615.1		 80,727
(1.01 %)		 14,175
(0.13 %)		 225,166
(3.69 %)		 n/a 36.42
(99.98 %)		 3,031
(0.02 %)		 2,699
(100.00 %)		 2,873,672
(2.01 %)		 4,198,037
(4.24 %)		 5,730
(99.98 %)		 71,102
(1.16 %)
251 Japanese morning glory
GCF_001879475.1		 58,979
(8.37 %)		 16,977
(2.14 %)		 77,626
(18.21 %)		 n/a 37.61
(99.97 %)		 449
(0.03 %)		 3,418
(100.00 %)		 641,896
(6.26 %)		 639,051
(8.97 %)		 3,622,236
(46.63 %)		 77,860
(10.47 %)
252 Japanese rice (2023)
GCF_034140825.1		 55,725
(16.73 %)		 16,338
(4.37 %)		 54,077
(25.00 %)		 n/a 43.72
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 15
(100.00 %)		 196,712
(2.76 %)		 141,936
(4.82 %)		 1,727,479
(35.05 %)		 63,894
(25.90 %)
253 Japanese rice (Kitaake 2020)
GCA_009797565.1		 n/a 16,562
(4.59 %)		 53,878
(24.77 %)		 n/a 43.61
(98.95 %)		 474
(1.05 %)		 476
(98.95 %)		 494,831
(50.75 %)		 141,079
(3.52 %)		 1,728,936
(33.69 %)		 64,216
(25.20 %)
254 Japanese rice (Nipponbare 2015)
GCF_001433935.1		 53,454
(17.22 %)		 16,804
(4.69 %)		 53,712
(24.95 %)		 n/a 43.57
(99.97 %)		 925
(0.03 %)		 58
(100.00 %)		 402,182
(39.07 %)		 138,035
(3.47 %)		 1,719,939
(33.46 %)		 63,485
(25.25 %)
255 jewel orchid monocots (Aro_GA 2025)
GCA_051820535.1		 n/a 41,719
(0.73 %)		 293,147
(8.18 %)		 n/a 39.10
(100.00 %)		 283
(0.00 %)		 3,452
(100.00 %)		 3,539,676
(12.83 %)		 1,885,641
(6.09 %)		 19,476,248
(61.01 %)		 583,795
(7.68 %)
256 Joseph's coat eudicots (Red AtriRed21 2022)
GCF_026212465.1		 44,756
(10.39 %)		 13,649
(2.41 %)		 38,664
(12.08 %)		 n/a 31.93
(99.74 %)		 2,496
(0.26 %)		 49
(100.00 %)		 270,085
(9.40 %)		 247,307
(22.95 %)		 2,428,999
(49.81 %)		 5,914
(1.27 %)
257 Korean lawngrass (Nagirizaki 2016)
GCA_001602275.1		 n/a 21,051
(6.88 %)		 57,023
(32.54 %)		 n/a 44.09
(96.75 %)		 14,848
(3.26 %)		 26,634
(96.74 %)		 101,349
(1.46 %)		 71,657
(2.17 %)		 1,693,252
(21.97 %)		 60,198
(24.06 %)
258 lamb's quarters (primary hap 2023)
GCA_948465745.1		 n/a 32,598
(1.94 %)		 125,993
(12.58 %)		 n/a 36.17
(100.00 %)		 67
(0.00 %)		 158
(100.00 %)		 2,407,940
(63.57 %)		 996,815
(6.91 %)		 7,383,118
(51.29 %)		 84,154
(2.40 %)
259 large cranberry (Ben Lear CNJ99-125-1 inbred clone 2014)
GCA_000775335.2		 n/a 14,225
(2.70 %)		 66,262
(14.87 %)		 n/a 37.74
(99.90 %)		 1,390
(0.01 %)		 201,496
(99.99 %)		 201,938
(1.93 %)		 136,145
(2.39 %)		 2,755,676
(26.83 %)		 12,815
(1.29 %)
260 lemon (UCLL1 2023)
GCA_034663555.1		 n/a 27,668
(4.03 %)		 72,915
(18.34 %)		 n/a 36.06
(99.99 %)		 136
(0.01 %)		 624
(99.99 %)		 382,061
(2.62 %)		 254,813
(8.31 %)		 3,593,274
(41.24 %)		 14,758
(7.59 %)
261 lettuce eudicots (Salinas 2011)
GCA_000227445.1		 n/a 15,031
(1.06 %)		 140,751
(10.18 %)		 n/a 36.82
(99.85 %)		 n/a 876,110
(100.00 %)		 505,796
(3.85 %)		 318,171
(2.09 %)		 9,808,138
(33.85 %)		 30,057
(0.85 %)
262 liverwort (2024)
GCA_039105155.1		 n/a 5,119
(1.70 %)		 26,429
(24.22 %)		 n/a 43.50
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 12
(100.00 %)		 178,255
(36.35 %)		 53,790
(2.08 %)		 834,624
(30.68 %)		 25,774
(29.87 %)
263 long-grained rice (Zhenshan 97 2020)
GCA_001623345.3		 n/a 16,254
(4.30 %)		 54,135
(24.00 %)		 n/a 43.62
(100.00 %)		 n/a 13
(100.00 %)		 204,282
(2.82 %)		 143,681
(3.92 %)		 1,729,033
(36.62 %)		 65,538
(25.47 %)
264 lyrate rockcress
GCF_000004255.2		 44,526
(28.52 %)		 25,416
(19.36 %)		 34,938
(31.66 %)		 n/a 36.08
(88.90 %)		 2,950
(11.10 %)		 3,646
(88.90 %)		 141,441
(20.58 %)		 72,583
(3.25 %)		 1,012,438
(24.68 %)		 8,053
(2.48 %)
265 macadamia nut
GCF_013358625.1		 58,226
(8.43 %)		 16,723
(2.11 %)		 62,465
(13.23 %)		 n/a 39.13
(98.51 %)		 22,059
(1.50 %)		 2,644
(100.00 %)		 463,575
(3.09 %)		 304,057
(3.39 %)		 4,183,445
(34.36 %)		 18,956
(1.40 %)
266 Madagascar periwinkle (Sunstorm Apricot 2015)
GCA_000949345.1		 n/a 13,013
(2.26 %)		 38,671
(8.42 %)		 n/a 33.59
(99.19 %)		 123,798
(0.85 %)		 203,100
(99.15 %)		 329,865
(3.57 %)		 244,018
(4.63 %)		 3,737,818
(40.09 %)		 4,827
(0.29 %)
267 Madagascar periwinkle (Sunstorm Apricot FGT_2020_1 2023)
GCA_028651295.1		 n/a 12,929
(2.13 %)		 34,499
(7.89 %)		 n/a 33.83
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 174
(100.00 %)		 560,407
(20.53 %)		 306,275
(8.15 %)		 3,716,838
(44.45 %)		 6,827
(0.40 %)
268 Magnolia sinica (HGM2019 2023)
GCF_029962835.1		 69,307
(3.21 %)		 14,466
(0.72 %)		 84,219
(6.52 %)		 n/a 40.18
(100.00 %)		 73
(0.00 %)		 127
(100.00 %)		 1,415,484
(14.07 %)		 1,154,832
(6.29 %)		 10,231,412
(50.86 %)		 107,342
(2.63 %)
269 maize
GCF_902167145.1		 76,701
(3.66 %)		 23,553
(1.55 %)		 154,773
(10.70 %)		 n/a 46.77
(99.83 %)		 708
(0.17 %)		 697
(100.00 %)		 1,340,549
(78.65 %)		 843,168
(5.20 %)		 5,886,498
(69.23 %)		 372,641
(31.10 %)
270 maize (2020)
GCA_905067065.1		 n/a 23,433
(1.61 %)		 150,853
(10.66 %)		 n/a 46.83
(98.14 %)		 56,163
(1.87 %)		 56,173
(98.13 %)		 581,502
(1.40 %)		 753,129
(3.49 %)		 5,867,216
(67.88 %)		 377,414
(31.33 %)
271 maize (B104 2021)
GCA_910593975.1		 n/a 23,680
(1.58 %)		 153,453
(10.69 %)		 n/a 46.83
(99.71 %)		 1,223
(0.29 %)		 697
(100.00 %)		 593,292
(1.41 %)		 805,647
(4.47 %)		 5,887,178
(69.17 %)		 370,755
(32.34 %)
272 maize (B73 2017)
GCA_000005005.6		 n/a 23,511
(1.62 %)		 151,975
(10.84 %)		 n/a 46.87
(98.56 %)		 2,523
(1.44 %)		 3,128
(98.56 %)		 1,308,956
(78.59 %)		 771,560
(3.39 %)		 5,850,966
(67.94 %)		 367,973
(32.21 %)
273 maize (OH43 2020)
GCA_902167015.1		 n/a 23,864
(1.57 %)		 154,358
(10.67 %)		 n/a 46.77
(99.88 %)		 551
(0.12 %)		 777
(100.00 %)		 1,341,834
(78.70 %)		 834,042
(5.01 %)		 5,916,520
(69.26 %)		 372,114
(32.08 %)
274 malo sina (v2 2021)
GCF_000231095.2		 34,262
(16.98 %)		 15,545
(6.13 %)		 36,746
(24.10 %)		 n/a 41.55
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 74
(100.00 %)		 140,519
(2.59 %)		 67,337
(3.89 %)		 1,493,779
(29.32 %)		 41,044
(18.43 %)
275 Manchurian ash (Dongfeng_Y6 2025)
GCA_050941835.1		 n/a 21,875
(2.60 %)		 65,892
(12.45 %)		 n/a 34.37
(100.00 %)		 n/a 23
(100.00 %)		 1,378,182
(52.01 %)		 240,241
(3.28 %)		 5,127,474
(35.91 %)		 18,208
(1.03 %)
276 mango
GCF_011075055.1		 60,349
(16.06 %)		 20,653
(5.13 %)		 40,887
(15.20 %)		 n/a 32.71
(99.98 %)		 169
(0.02 %)		 250
(100.00 %)		 213,445
(3.09 %)		 125,929
(3.29 %)		 2,447,401
(32.63 %)		 7,059
(0.98 %)
277 Tausch's goatgrass monocots
GCF_002575655.2		 84,334
(2.18 %)		 17,888
(0.44 %)		 263,541
(10.26 %)		 n/a 46.33
(97.97 %)		 69,858
(2.04 %)		 109,197
(100.00 %)		 1,492,485
(15.65 %)		 1,422,870
(5.39 %)		 12,521,384
(71.80 %)		 881,939
(30.07 %)
278 bulbous barley monocots (2017)
GCA_900070015.1		 n/a 13,790
(0.81 %)		 584,401
(17.92 %)		 n/a 44.69
(99.26 %)		 714,678
(0.49 %)		 3,598,227
(99.51 %)		 405,591
(2.31 %)		 383,580
(1.94 %)		 9,713,864
(28.00 %)		 392,202
(11.97 %)
279 pearl millet monocots (2023)
GCA_947561735.1		 n/a 17,702
(1.12 %)		 131,056
(12.62 %)		 n/a 49.54
(99.71 %)		 154
(0.29 %)		 161
(99.71 %)		 2,363,767
(55.11 %)		 562,150
(3.01 %)		 6,046,063
(67.25 %)		 78,069
(17.77 %)
280 least duckweed monocots (lm5633 2022)
GCA_024174645.1		 n/a 10,209
(2.40 %)		 33,920
(14.90 %)		 n/a 39.23
(99.63 %)		 2,722
(0.38 %)		 2,381
(100.00 %)		 339,295
(20.82 %)		 149,186
(3.14 %)		 1,958,662
(44.97 %)		 37,690
(12.52 %)
281 coastal wild rice monocots (Oco-Bangladesh 2023)
GCA_030770085.1		 n/a 22,601
(4.02 %)		 78,799
(21.93 %)		 n/a 42.06
(100.00 %)		 13
(0.00 %)		 450
(100.00 %)		 708,554
(36.63 %)		 97,691
(2.08 %)		 2,711,269
(26.55 %)		 87,312
(19.47 %)
282 mosses
GCF_000002425.4		 55,044
(11.86 %)		 8,425
(1.46 %)		 30,452
(12.55 %)		 n/a 33.69
(98.74 %)		 2,645
(1.27 %)		 359
(100.00 %)		 454,786
(48.35 %)		 241,826
(2.56 %)		 2,413,326
(52.52 %)		 22,664
(3.06 %)
283 mosses (Gransden 2004 2024)
GCA_000002425.3		 n/a 8,471
(1.47 %)		 30,401
(12.59 %)		 n/a 33.71
(99.04 %)		 1,792
(0.96 %)		 357
(100.00 %)		 296,167
(2.79 %)		 242,589
(2.68 %)		 2,405,125
(52.64 %)		 22,652
(3.11 %)
284 mosses (MN 2022)
GCA_021442195.1		 n/a 8,227
(1.65 %)		 29,076
(15.54 %)		 n/a 36.47
(99.90 %)		 38
(0.10 %)		 74
(99.90 %)		 202,616
(2.17 %)		 147,367
(3.31 %)		 2,577,180
(28.93 %)		 12,940
(1.51 %)
285 mosses (SZ-1 2022)
GCA_026122775.1		 n/a 8,528
(1.45 %)		 30,650
(12.43 %)		 n/a 33.77
(100.00 %)		 29
(0.00 %)		 26
(100.00 %)		 300,802
(2.82 %)		 246,537
(2.86 %)		 2,464,328
(53.57 %)		 23,310
(3.24 %)
286 mulberry M.notabilis
GCF_000414095.1		 29,893
(12.15 %)		 14,092
(4.40 %)		 37,376
(17.73 %)		 n/a 34.86
(94.92 %)		 15,541
(5.08 %)		 46,842
(94.92 %)		 317,532
(5.00 %)		 190,192
(6.25 %)		 2,095,631
(34.49 %)		 20,490
(3.43 %)
287 mung bean (VC1973A 2015 refseq)
GCF_000741045.1		 47,653
(11.89 %)		 16,644
(3.87 %)		 43,967
(14.67 %)		 n/a 33.18
(92.80 %)		 96,870
(7.24 %)		 2,465
(100.00 %)		 264,597
(3.31 %)		 198,963
(3.34 %)		 2,842,720
(34.86 %)		 13,975
(1.49 %)
288 muskmelon (AY 2022)
GCF_025177605.1		 47,062
(10.58 %)		 13,502
(2.95 %)		 32,332
(13.20 %)		 n/a 36.06
(99.99 %)		 239
(0.01 %)		 1,310
(100.00 %)		 282,171
(3.23 %)		 229,959
(11.70 %)		 2,016,709
(43.94 %)		 18,232
(10.96 %)
289 muskmelon (DHL92 2012)
GCF_000313045.1		 35,384
(11.55 %)		 13,191
(3.74 %)		 28,295
(11.09 %)		 n/a 33.23
(89.51 %)		 29,172
(10.51 %)		 60,751
(89.49 %)		 239,295
(7.85 %)		 172,598
(3.17 %)		 2,304,858
(33.21 %)		 12,855
(1.38 %)
290 Nalta jute (JRO-524 2017)
GCA_002141455.1		 n/a 15,450
(3.86 %)		 57,930
(23.73 %)		 n/a 36.82
(99.97 %)		 n/a 52,373
(100.00 %)		 189,007
(2.22 %)		 129,697
(4.38 %)		 1,872,307
(38.03 %)		 11,963
(5.74 %)
291 narrow-leaf cattail (Huaian 2025)
GCF_048772165.1		 35,080
(19.76 %)		 14,109
(6.33 %)		 27,978
(20.09 %)		 n/a 37.69
(100.00 %)		 n/a 15
(100.00 %)		 124,433
(3.10 %)		 69,868
(2.56 %)		 1,208,522
(27.94 %)		 21,007
(5.28 %)
292 narrow-leaved blue lupine
GCF_001865875.1		 57,263
(9.83 %)		 22,097
(3.53 %)		 51,774
(13.22 %)		 n/a 33.46
(99.34 %)		 44,657
(0.68 %)		 55,107
(99.32 %)		 280,867
(4.25 %)		 210,750
(5.67 %)		 3,920,315
(38.10 %)		 6,462
(0.46 %)
293 New South Wales waratah (Mountain lineage 2021)
GCF_018873765.1		 44,477
(5.41 %)		 16,928
(1.94 %)		 77,682
(16.06 %)		 n/a 40.12
(100.00 %)		 2,037
(0.00 %)		 1,289
(100.00 %)		 437,997
(2.33 %)		 266,149
(5.08 %)		 4,764,252
(34.25 %)		 20,667
(1.81 %)
294 opium poppy
GCF_003573695.1		 127,893
(4.57 %)		 25,532
(0.85 %)		 162,032
(9.31 %)		 n/a 37.28
(99.80 %)		 31,183
(0.20 %)		 34,381
(100.00 %)		 819,294
(1.49 %)		 1,050,181
(6.80 %)		 10,625,631
(55.85 %)		 67,521
(1.21 %)
295 orchid D.catenatum
GCF_001605985.2		 39,386
(3.85 %)		 12,208
(0.99 %)		 72,906
(8.22 %)		 n/a 34.70
(96.03 %)		 25,751
(3.92 %)		 311,841
(96.08 %)		 506,361
(2.45 %)		 413,770
(3.23 %)		 8,074,114
(39.07 %)		 56,900
(2.34 %)
296 orchid P.equestris
GCF_001263595.1		 32,146
(3.36 %)		 11,541
(1.01 %)		 54,049
(6.11 %)		 n/a 34.46
(92.46 %)		 98,814
(7.56 %)		 188,398
(92.44 %)		 487,071
(2.96 %)		 511,903
(4.00 %)		 7,060,408
(42.20 %)		 31,179
(1.22 %)
297 Pacific Island silvergrass (M001 2021)
GCF_019320115.1		 120,534
(4.81 %)		 39,902
(1.95 %)		 276,967
(16.36 %)		 n/a 45.32
(99.56 %)		 4,932
(0.44 %)		 2,420
(100.00 %)		 764,083
(1.38 %)		 810,723
(3.95 %)		 11,118,925
(53.40 %)		 520,091
(23.03 %)
298 papaya
GCF_000150535.2		 29,883
(11.99 %)		 12,860
(4.47 %)		 24,403
(11.58 %)		 n/a 35.31
(73.55 %)		 29,719
(26.47 %)		 47,485
(73.53 %)		 260,082
(34.69 %)		 101,644
(3.59 %)		 1,640,647
(28.88 %)		 21,200
(2.95 %)
299 papaya (Sunset 2022)
GCA_022788785.1		 n/a 13,725
(4.02 %)		 25,348
(10.65 %)		 n/a 36.01
(99.88 %)		 337
(0.12 %)		 67
(100.00 %)		 385,123
(61.33 %)		 131,783
(9.99 %)		 2,029,883
(43.40 %)		 25,597
(4.44 %)
300 patchouli (Gaoche1L2016 2018)
GCA_003675935.1		 n/a 43,905
(2.21 %)		 174,920
(14.40 %)		 n/a 35.02
(93.97 %)		 170,266
(6.06 %)		 211,964
(93.94 %)		 1,021,699
(2.86 %)		 1,125,321
(8.02 %)		 9,388,626
(47.60 %)		 102,661
(4.26 %)
301 patchouli (shipai S1-5 2022)
GCA_023678885.1		 n/a 47,432
(2.32 %)		 168,583
(12.17 %)		 n/a 34.43
(99.98 %)		 764
(0.02 %)		 966
(100.00 %)		 2,043,616
(19.48 %)		 1,147,892
(9.18 %)		 9,501,180
(53.37 %)		 110,140
(2.86 %)
302 peach
GCF_000346465.2		 36,201
(20.87 %)		 14,368
(6.26 %)		 32,245
(24.09 %)		 n/a 37.51
(98.79 %)		 2,368
(1.22 %)		 2,531
(98.78 %)		 150,957
(10.06 %)		 96,381
(5.52 %)		 1,221,263
(28.72 %)		 7,885
(2.07 %)
303 peanut
GCF_003086295.2		 155,835
(5.15 %)		 31,810
(1.19 %)		 160,574
(8.81 %)		 n/a 36.33
(99.85 %)		 3,655
(0.15 %)		 385
(100.00 %)		 1,684,814
(3.52 %)		 1,488,297
(4.81 %)		 11,059,688
(62.32 %)		 140,570
(2.45 %)
304 peanut (GDAAS-fuhuasheng2018 2019)
GCA_004170445.1		 n/a 31,065
(1.17 %)		 158,578
(8.79 %)		 n/a 36.33
(98.97 %)		 32,692
(1.04 %)		 29
(100.00 %)		 1,735,218
(3.66 %)		 1,490,806
(4.26 %)		 11,072,983
(61.75 %)		 138,890
(2.46 %)
305 peanut (Tifrunner 2023)
GCF_003086295.3		 173,169
(5.54 %)		 31,897
(1.19 %)		 160,532
(8.81 %)		 n/a 36.33
(99.85 %)		 3,697
(0.15 %)		 443
(100.00 %)		 1,676,149
(3.49 %)		 1,489,126
(4.81 %)		 11,105,477
(62.30 %)		 140,609
(2.45 %)
306 pear (primary hap 2023)
GCF_963583255.1		 48,939
(13.04 %)		 22,082
(4.44 %)		 56,235
(17.69 %)		 n/a 37.45
(99.99 %)		 145
(0.01 %)		 176
(99.99 %)		 289,539
(2.54 %)		 223,443
(3.84 %)		 2,308,351
(35.91 %)		 19,559
(2.15 %)
307 pearl millet (Tift 23D2B1-P1-P5 2018)
GCA_002174835.2		 n/a 17,949
(1.26 %)		 134,829
(14.30 %)		 n/a 47.95
(86.95 %)		 156,852
(13.08 %)		 52,033
(100.00 %)		 380,858
(1.16 %)		 466,997
(2.83 %)		 5,117,134
(56.89 %)		 380,989
(29.47 %)
308 pecan
GCF_018687715.1		 71,340
(9.93 %)		 18,671
(2.67 %)		 60,632
(15.16 %)		 n/a 36.30
(99.97 %)		 22
(0.03 %)		 39
(99.97 %)		 473,853
(3.66 %)		 367,846
(6.75 %)		 3,301,121
(39.03 %)		 27,274
(2.22 %)
309 pepperwort (EHA205 2019)
GCA_009757365.2		 n/a 19,770
(7.79 %)		 48,832
(21.86 %)		 n/a 34.40
(96.79 %)		 105,378
(3.36 %)		 146,054
(96.64 %)		 298,974
(31.14 %)		 68,767
(2.63 %)		 1,422,489
(26.49 %)		 6,844
(1.17 %)
310 perennial ryegrass (Kyuss_39 2021)
GCF_019359855.1		 89,789
(3.75 %)		 17,693
(0.79 %)		 174,787
(12.15 %)		 n/a 44.32
(100.00 %)		 238
(0.00 %)		 1,677
(100.00 %)		 605,852
(1.36 %)		 760,915
(5.68 %)		 5,216,229
(69.24 %)		 542,998
(24.23 %)
311 perennial ryegrass (Kyuss_39 2024)
GCF_019359855.2		 81,335
(3.75 %)		 17,678
(0.79 %)		 172,584
(12.06 %)		 n/a 44.29
(100.00 %)		 61
(0.00 %)		 105
(100.00 %)		 610,404
(1.37 %)		 758,029
(5.51 %)		 5,039,192
(69.30 %)		 542,208
(23.92 %)
312 Peruvian cotton (G.raimondii 2012 DOE)
GCF_000327365.2		 72,518
(8.99 %)		 20,368
(2.64 %)		 52,295
(10.15 %)		 n/a 33.21
(98.25 %)		 19,685
(1.76 %)		 20,680
(98.24 %)		 404,885
(2.81 %)		 300,062
(3.31 %)		 5,198,170
(40.84 %)		 10,912
(0.59 %)
313 Peruvian cotton (GPD5lz 2022)
GCF_025698545.1		 63,582
(8.69 %)		 20,265
(2.62 %)		 51,815
(10.02 %)		 n/a 33.24
(100.00 %)		 79
(0.00 %)		 289
(100.00 %)		 405,385
(2.83 %)		 306,302
(3.81 %)		 5,192,105
(41.79 %)		 10,481
(0.65 %)
314 Phtheirospermum japonicum (okayama 2020)
GCA_014905375.1		 n/a 15,868
(1.22 %)		 104,104
(13.39 %)		 n/a 36.03
(91.65 %)		 318,321
(8.39 %)		 328,880
(91.61 %)		 810,727
(3.49 %)		 710,744
(4.84 %)		 7,339,863
(41.43 %)		 104,967
(3.98 %)
315 pigeon pea (v2 2016 BGI)
GCF_000340665.2		 46,412
(9.42 %)		 17,396
(3.13 %)		 49,710
(12.66 %)		 n/a 32.76
(94.18 %)		 36,323
(5.83 %)		 67,834
(94.17 %)		 395,663
(3.40 %)		 306,602
(4.71 %)		 3,749,364
(39.19 %)		 26,504
(2.90 %)
316 pineapple
GCF_001540865.1		 43,025
(11.65 %)		 13,649
(3.36 %)		 38,917
(14.95 %)		 n/a 38.34
(98.23 %)		 25,542
(1.78 %)		 3,129
(100.00 %)		 352,802
(7.31 %)		 274,578
(4.75 %)		 2,360,455
(38.94 %)		 56,724
(11.73 %)
317 pink shepherd's-purse
GCF_000375325.1		 37,318
(33.25 %)		 22,836
(23.08 %)		 26,822
(33.93 %)		 n/a 35.63
(97.53 %)		 6,294
(2.49 %)		 7,067
(97.51 %)		 74,470
(2.42 %)		 42,509
(3.39 %)		 814,442
(24.99 %)		 5,817
(2.14 %)
318 pistachio
GCF_008641045.1		 47,948
(7.92 %)		 18,462
(2.58 %)		 62,898
(14.05 %)		 n/a 35.95
(99.84 %)		 16,367
(0.16 %)		 1,865
(100.00 %)		 363,793
(2.43 %)		 253,408
(4.08 %)		 4,200,417
(36.34 %)		 22,340
(1.78 %)
319 pocket water lily (Beijing-Zhang1983 2022)
GCF_008831285.2		 41,223
(10.98 %)		 11,576
(2.50 %)		 38,220
(15.70 %)		 n/a 38.61
(99.84 %)		 626
(0.16 %)		 1,409
(99.84 %)		 236,190
(2.95 %)		 153,746
(4.02 %)		 2,151,579
(26.72 %)		 24,561
(4.48 %)
320 pomegranate
GCF_007655135.1		 43,277
(14.87 %)		 14,635
(4.26 %)		 39,381
(19.97 %)		 n/a 40.38
(99.99 %)		 188
(0.01 %)		 474
(100.00 %)		 173,182
(2.28 %)		 174,872
(6.81 %)		 1,640,973
(32.89 %)		 26,506
(9.18 %)
321 potato S.stenotomum (F172 2021)
GCF_019186545.1		 43,754
(6.67 %)		 16,547
(2.25 %)		 54,186
(11.30 %)		 n/a 34.71
(88.41 %)		 37,060
(11.60 %)		 17,084
(100.00 %)		 321,938
(2.14 %)		 250,793
(4.04 %)		 5,136,691
(33.92 %)		 8,536
(0.30 %)
322 potato S.tuberosum (alt pseudohaplotype RH89-039-16 2020)
GCA_014189305.1		 n/a 16,861
(1.98 %)		 58,882
(12.19 %)		 n/a 35.40
(99.95 %)		 4,397
(0.05 %)		 3,012
(100.00 %)		 774,417
(46.83 %)		 392,378
(8.45 %)		 5,068,449
(42.72 %)		 14,548
(1.32 %)
323 potato S.tuberosum (Dihaploid 'C-13' 2020)
GCA_010127505.1		 n/a 17,614
(2.86 %)		 45,684
(10.75 %)		 n/a 34.49
(83.57 %)		 10,041,161
(17.84 %)		 12
(100.00 %)		 606,573
(40.80 %)		 168,871
(2.58 %)		 5,508,800
(26.36 %)		 5,550
(0.22 %)
324 potato S.tuberosum (DM 1-3 516 R44 2011)
GCF_000226075.1		 43,158
(7.63 %)		 16,423
(2.55 %)		 50,333
(11.79 %)		 n/a 34.83
(93.98 %)		 45,215
(6.04 %)		 60,069
(93.96 %)		 662,626
(43.42 %)		 212,315
(4.38 %)		 4,691,843
(34.91 %)		 9,851
(0.45 %)
325 potato S.tuberosum (hap 1 of 4 Otava Stieglitz 2021)
GCA_020169555.1		 n/a 16,415
(2.15 %)		 54,766
(12.48 %)		 n/a 35.21
(99.98 %)		 1,476
(0.02 %)		 25
(100.00 %)		 329,233
(2.28 %)		 285,101
(5.66 %)		 4,832,189
(40.28 %)		 12,944
(0.99 %)
326 potato S.tuberosum (hap 2 of 4 Otava Stieglitz 2021)
GCA_020169535.1		 n/a 16,694
(2.26 %)		 53,990
(12.60 %)		 n/a 35.20
(99.98 %)		 1,499
(0.02 %)		 28
(100.00 %)		 323,447
(2.25 %)		 283,098
(5.39 %)		 4,727,964
(39.87 %)		 12,316
(1.34 %)
327 potato S.tuberosum (hap 3 of 4 Otava Hera 2021)
GCA_020169585.1		 n/a 16,713
(2.23 %)		 54,380
(12.60 %)		 n/a 35.20
(99.98 %)		 1,299
(0.02 %)		 27
(100.00 %)		 329,807
(2.31 %)		 282,372
(6.11 %)		 4,718,807
(40.25 %)		 11,812
(1.00 %)
328 potato S.tuberosum (hap 4 of 4 Otava Hera 2021)
GCA_020169575.1		 n/a 16,640
(2.18 %)		 54,937
(12.38 %)		 n/a 35.18
(99.98 %)		 1,383
(0.02 %)		 26
(100.00 %)		 329,665
(2.30 %)		 285,993
(6.03 %)		 4,858,802
(40.32 %)		 12,792
(1.32 %)
329 potato S.tuberosum (RH89-039-16 2020)
GCA_014189475.1		 n/a 16,312
(2.05 %)		 54,438
(12.18 %)		 n/a 35.23
(99.95 %)		 4,448
(0.05 %)		 12
(100.00 %)		 730,464
(46.17 %)		 338,389
(7.95 %)		 4,903,557
(41.90 %)		 12,226
(0.72 %)
330 potato S.verrucosum (2019)
GCF_900185275.1		 35,846
(6.75 %)		 16,408
(2.54 %)		 48,924
(11.75 %)		 n/a 34.59
(99.55 %)		 1,612
(0.45 %)		 1,332
(100.00 %)		 297,683
(2.31 %)		 234,616
(4.68 %)		 4,308,149
(38.02 %)		 8,192
(0.47 %)
331 Primulina tabacum (GXHZ01 2022)
GCF_025594145.1		 69,821
(7.75 %)		 19,604
(2.27 %)		 61,800
(12.08 %)		 n/a 36.89
(99.89 %)		 1,710
(0.11 %)		 541
(100.00 %)		 310,321
(1.81 %)		 229,404
(3.84 %)		 4,409,199
(51.65 %)		 40,094
(1.87 %)
332 proso millet (2018)
GCA_003046395.2		 n/a 31,203
(4.33 %)		 106,251
(25.92 %)		 n/a 46.82
(98.02 %)		 4,232
(1.98 %)		 1,306
(100.00 %)		 252,710
(1.48 %)		 176,920
(3.16 %)		 3,051,223
(41.53 %)		 159,364
(32.38 %)
333 quinoa
GCF_001683475.1		 74,918
(7.49 %)		 22,914
(1.61 %)		 105,619
(12.97 %)		 n/a 36.87
(99.16 %)		 725
(0.84 %)		 3,487
(100.00 %)		 810,277
(3.58 %)		 762,903
(10.88 %)		 6,551,884
(49.49 %)		 93,630
(2.98 %)
334 radish (v2 WK10039 2023)
GCF_000801105.2		 80,681
(20.53 %)		 36,039
(9.58 %)		 74,081
(26.98 %)		 n/a 36.00
(99.94 %)		 2,853
(0.06 %)		 6,424
(100.00 %)		 224,524
(2.48 %)		 193,525
(5.49 %)		 2,234,480
(35.04 %)		 25,972
(4.13 %)
335 rape (Da-Ae 2021)
GCF_020379485.1		 152,744
(19.27 %)		 57,668
(6.87 %)		 143,092
(23.51 %)		 n/a 37.13
(99.99 %)		 840
(0.01 %)		 3,167
(100.00 %)		 470,302
(2.29 %)		 578,281
(9.24 %)		 4,662,467
(42.41 %)		 64,287
(5.62 %)
336 rape (ZS11 2017)
GCF_000686985.2		 144,991
(17.51 %)		 59,743
(7.71 %)		 146,391
(26.97 %)		 n/a 36.47
(92.96 %)		 32,639
(7.05 %)		 34,110
(92.95 %)		 449,257
(2.67 %)		 441,269
(5.84 %)		 4,867,601
(32.91 %)		 60,082
(3.53 %)
337 red clover eudicots (HEN17-A07 2021)
GCF_020283565.1		 63,238
(17.01 %)		 17,857
(4.13 %)		 43,079
(17.27 %)		 n/a 33.71
(99.97 %)		 231
(0.03 %)		 90
(100.00 %)		 241,481
(2.65 %)		 187,674
(4.85 %)		 2,251,582
(37.03 %)		 6,474
(1.93 %)
338 red sage (Shanhuang shh 2023)
GCF_028751815.1		 62,715
(12.27 %)		 15,176
(2.61 %)		 67,175
(21.50 %)		 n/a 37.47
(99.58 %)		 695
(0.42 %)		 173
(100.00 %)		 377,231
(3.52 %)		 364,027
(5.05 %)		 2,679,528
(42.07 %)		 64,243
(6.17 %)
339 red wild einkorn wheat (G1812 2018)
GCF_003073215.2		 71,160
(1.59 %)		 18,911
(0.39 %)		 321,741
(10.16 %)		 n/a 45.91
(99.38 %)		 33,814
(0.62 %)		 10,205
(100.00 %)		 1,208,165
(1.25 %)		 1,319,817
(2.96 %)		 15,480,313
(71.93 %)		 975,234
(26.52 %)
340 redroot sage (bh2-7 2020)
GCA_016432925.1		 n/a 15,208
(2.55 %)		 68,573
(21.07 %)		 n/a 37.68
(99.37 %)		 2,815
(0.63 %)		 1,118
(100.00 %)		 628,541
(17.44 %)		 380,078
(5.18 %)		 2,710,697
(43.28 %)		 66,987
(6.29 %)
341 Rhododendron vialii eudicots (Sample 1 2023)
GCF_030253575.1		 62,168
(11.90 %)		 15,363
(2.73 %)		 54,203
(18.86 %)		 n/a 39.52
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 18
(100.00 %)		 253,965
(2.10 %)		 235,379
(9.36 %)		 2,668,584
(34.08 %)		 31,789
(3.72 %)
342 rice bean (VRB3 2023)
GCA_029865625.1		 n/a 18,823
(3.07 %)		 63,430
(18.52 %)		 n/a 34.56
(96.54 %)		 4,440
(3.46 %)		 232
(100.00 %)		 1,016,591
(59.80 %)		 384,326
(8.33 %)		 3,318,479
(40.76 %)		 30,562
(3.41 %)
343 rice bean eudicots (VRB-3 Himshakti 2021)
GCF_018835915.1		 38,736
(11.89 %)		 16,669
(4.18 %)		 43,369
(14.64 %)		 n/a 32.90
(93.47 %)		 20,717
(6.53 %)		 15,445
(100.00 %)		 233,635
(3.33 %)		 204,141
(4.85 %)		 2,682,022
(32.58 %)		 16,828
(2.07 %)
344 riverbank grape
GCF_004353265.1		 44,851
(10.22 %)		 15,302
(3.01 %)		 46,011
(14.96 %)		 n/a 34.32
(98.79 %)		 1,095
(1.21 %)		 175
(100.00 %)		 339,984
(3.03 %)		 233,259
(4.71 %)		 2,925,914
(35.27 %)		 11,055
(0.93 %)
345 robusta coffee (DH200=94 2014)
GCA_900059795.1		 n/a 13,770
(2.74 %)		 46,992
(16.51 %)		 n/a 36.65
(82.89 %)		 12,714
(17.11 %)		 25,216
(82.89 %)		 219,723
(2.15 %)		 140,449
(2.62 %)		 2,590,105
(28.19 %)		 12,700
(1.66 %)
346 rose gum (2021)
GCF_016545825.1		 54,676
(10.44 %)		 16,291
(2.42 %)		 69,492
(17.92 %)		 n/a 39.39
(99.97 %)		 1,712
(0.03 %)		 37
(100.00 %)		 358,171
(2.83 %)		 259,031
(3.65 %)		 3,353,128
(29.52 %)		 78,731
(7.66 %)
347 rose gum (BRASUZ1 2014)
GCF_000612305.1		 65,107
(11.08 %)		 16,389
(2.33 %)		 74,557
(18.16 %)		 n/a 39.28
(92.69 %)		 27,773
(7.32 %)		 32,724
(92.68 %)		 357,835
(2.50 %)		 266,806
(3.22 %)		 3,496,176
(27.34 %)		 79,393
(6.54 %)
348 rose of Sharon
GCF_006381635.1		 91,942
(5.18 %)		 44,363
(2.23 %)		 136,768
(10.14 %)		 n/a 34.23
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 1,789
(100.00 %)		 889,945
(2.72 %)		 968,890
(4.91 %)		 9,836,479
(51.73 %)		 42,560
(0.89 %)
349 rubber tree (MT/VB/25A 57/8 2023)
GCF_030052815.1		 71,258
(4.21 %)		 22,208
(1.24 %)		 63,302
(5.13 %)		 n/a 34.70
(91.68 %)		 1,428
(8.32 %)		 755
(100.00 %)		 1,078,590
(2.96 %)		 730,314
(3.70 %)		 6,031,831
(65.59 %)		 24,263
(0.70 %)
350 rubber tree (reyan7-33-97 2016)
GCF_001654055.1		 66,124
(5.23 %)		 22,033
(1.63 %)		 59,727
(6.42 %)		 n/a 34.84
(94.20 %)		 40,863
(5.81 %)		 7,453
(100.00 %)		 827,088
(3.02 %)		 565,394
(5.23 %)		 5,065,470
(61.59 %)		 13,573
(0.45 %)
351 S.splendens huo1 eudicots (BFU 2021)
GCF_004379255.1		 94,414
(12.61 %)		 31,218
(3.57 %)		 108,219
(21.49 %)		 n/a 38.83
(100.00 %)		 471
(0.00 %)		 1,178
(100.00 %)		 360,314
(2.17 %)		 419,051
(4.85 %)		 3,875,932
(41.07 %)		 105,227
(10.14 %)
352 sacred lotus
GCF_000365185.1		 43,140
(7.01 %)		 15,920
(2.13 %)		 61,231
(13.11 %)		 n/a 38.30
(87.98 %)		 175,846
(12.06 %)		 58,428
(87.96 %)		 408,351
(2.83 %)		 275,384
(2.52 %)		 4,643,876
(30.20 %)		 40,599
(2.68 %)
353 saltwater cress
GCF_000478725.1		 38,705
(18.07 %)		 21,851
(11.68 %)		 39,487
(28.65 %)		 n/a 37.71
(98.09 %)		 3,020
(1.92 %)		 3,658
(98.08 %)		 102,162
(1.93 %)		 70,755
(3.25 %)		 1,162,538
(32.09 %)		 15,272
(3.87 %)
354 sandblossoms (Phelan CA IGA184 alternate hap 2022)
GCA_023055565.1		 n/a 14,138
(0.74 %)		 125,370
(12.27 %)		 n/a 40.18
(100.00 %)		 149
(0.00 %)		 581
(100.00 %)		 655,331
(1.73 %)		 500,899
(4.88 %)		 7,172,490
(54.24 %)		 140,800
(5.87 %)
355 sandblossoms (Phelan CA IGA184 primary hap 2022)
GCA_023055425.1		 n/a 15,588
(0.93 %)		 117,831
(12.94 %)		 n/a 40.08
(100.00 %)		 85
(0.00 %)		 123
(100.00 %)		 597,532
(1.81 %)		 430,194
(3.80 %)		 6,075,115
(49.91 %)		 129,512
(5.41 %)
356 scarlet sage (huo1 2021)
GCF_004379255.2		 94,251
(12.60 %)		 31,266
(3.58 %)		 108,141
(21.47 %)		 n/a 38.83
(100.00 %)		 471
(0.00 %)		 1,162
(100.00 %)		 357,482
(2.10 %)		 419,009
(4.86 %)		 3,874,047
(41.08 %)		 105,216
(10.11 %)
357 scented satinash
GCF_900635055.1		 42,531
(12.21 %)		 15,353
(3.67 %)		 53,811
(20.61 %)		 n/a 40.64
(89.65 %)		 11,862
(10.35 %)		 19,039
(100.00 %)		 179,421
(2.10 %)		 174,902
(3.34 %)		 1,785,894
(25.35 %)		 55,685
(7.69 %)
358 sesame
GCF_000512975.1		 38,693
(16.95 %)		 15,555
(5.41 %)		 35,316
(19.66 %)		 n/a 35.00
(98.34 %)		 9,940
(1.66 %)		 26,176
(98.34 %)		 161,123
(2.85 %)		 79,750
(3.97 %)		 1,807,029
(31.02 %)		 9,873
(1.80 %)
359 shrubby jointvetch A. evenia (CIAT22838 2020)
GCA_013621005.1		 n/a 16,242
(4.30 %)		 39,583
(17.06 %)		 n/a 35.22
(98.66 %)		 2,946
(1.35 %)		 1,451
(100.00 %)		 253,228
(3.98 %)		 186,657
(9.89 %)		 1,792,662
(45.14 %)		 19,928
(3.29 %)
360 silver malletwood (14919 2019)
GCF_900635035.1		 46,475
(12.62 %)		 17,469
(4.11 %)		 51,531
(21.75 %)		 n/a 40.30
(93.72 %)		 7,529
(6.28 %)		 15,781
(100.00 %)		 194,855
(2.07 %)		 116,828
(2.25 %)		 1,801,472
(25.38 %)		 44,191
(5.74 %)
361 silver malletwood (NSW1041297 2021)
GCF_020921035.1		 43,419
(12.78 %)		 14,758
(4.01 %)		 41,180
(19.74 %)		 n/a 40.38
(100.00 %)		 36
(0.00 %)		 75
(100.00 %)		 160,749
(1.91 %)		 114,741
(3.07 %)		 1,619,569
(28.25 %)		 43,290
(7.15 %)
362 silver poplar
GCF_005239225.1		 53,066
(14.64 %)		 20,299
(4.74 %)		 44,556
(16.36 %)		 n/a 33.75
(100.00 %)		 n/a 1,287
(100.00 %)		 309,097
(3.34 %)		 175,288
(4.77 %)		 2,457,634
(38.38 %)		 4,613
(0.67 %)
363 silverweed cinquefoil (primary hap 2022)
GCF_933775445.1		 28,734
(15.21 %)		 13,143
(5.29 %)		 32,007
(22.39 %)		 n/a 37.81
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 147
(100.00 %)		 89,958
(1.86 %)		 351,649
(15.29 %)		 884,646
(35.58 %)		 14,711
(4.52 %)
364 sorghum (BTx623 2017)
GCF_000003195.3		 48,290
(8.57 %)		 17,901
(3.45 %)		 73,969
(19.64 %)		 n/a 43.88
(95.30 %)		 3,906
(4.70 %)		 4,775
(95.30 %)		 556,607
(65.39 %)		 177,271
(4.54 %)		 2,371,199
(48.20 %)		 110,115
(18.82 %)
365 sorghum (Tx430 2018)
GCA_003482435.1		 n/a 18,138
(3.63 %)		 75,180
(20.67 %)		 n/a 43.67
(97.96 %)		 2,108
(2.04 %)		 308
(100.00 %)		 559,950
(63.17 %)		 156,952
(3.01 %)		 2,481,716
(46.70 %)		 109,923
(19.06 %)
366 soybean (EMBRAPA BRS 537 2021)
GCA_012273815.2		 n/a 27,746
(3.01 %)		 77,617
(11.66 %)		 n/a 34.80
(97.95 %)		 340
(2.05 %)		 95
(100.00 %)		 1,182,211
(56.35 %)		 444,701
(6.81 %)		 5,365,860
(45.98 %)		 35,684
(1.48 %)
367 soybean (US DOE JGI-PGF v2 2021)
GCF_000004515.6		 88,006
(9.87 %)		 27,705
(3.08 %)		 77,033
(11.88 %)		 n/a 34.74
(97.36 %)		 8,918
(2.65 %)		 9,199
(97.35 %)		 848,398
(38.02 %)		 434,042
(5.29 %)		 5,346,884
(45.07 %)		 35,893
(1.55 %)
368 soybean (Williams 82 2023)
GCA_030864155.1		 n/a 27,960
(2.93 %)		 77,762
(11.36 %)		 n/a 35.02
(100.00 %)		 n/a 20
(100.00 %)		 549,577
(2.73 %)		 453,208
(9.60 %)		 5,325,393
(48.31 %)		 36,641
(1.53 %)
369 spider flower
GCF_000463585.1		 45,524
(22.00 %)		 21,103
(10.40 %)		 38,184
(27.17 %)		 n/a 39.40
(87.71 %)		 24,824
(12.32 %)		 37,073
(87.68 %)		 144,827
(3.22 %)		 103,970
(4.10 %)		 1,118,840
(31.64 %)		 29,313
(6.47 %)
370 spinach (Sp75 2017)
GCF_002007265.1		 41,411
(5.75 %)		 12,540
(1.38 %)		 68,522
(12.26 %)		 n/a 37.82
(95.53 %)		 137,086
(4.48 %)		 78,263
(100.00 %)		 374,336
(2.48 %)		 670,331
(6.78 %)		 3,213,561
(52.82 %)		 89,520
(4.54 %)
371 spinach (Varoflay 2021)
GCF_020520425.1		 58,433
(7.11 %)		 12,431
(1.27 %)		 61,084
(11.35 %)		 n/a 37.89
(100.00 %)		 63
(0.00 %)		 246
(100.00 %)		 378,521
(2.27 %)		 722,814
(6.29 %)		 2,950,586
(58.17 %)		 92,256
(5.21 %)
372 spotted monkey flower
GCF_000504015.1		 34,441
(15.56 %)		 14,508
(4.41 %)		 34,904
(18.83 %)		 n/a 35.50
(93.50 %)		 15,528
(6.52 %)		 17,740
(93.48 %)		 227,143
(4.28 %)		 204,234
(11.85 %)		 1,776,879
(40.60 %)		 21,718
(3.89 %)
373 spreading earthmoss (2024)
GCF_000002425.5		 52,765
(10.63 %)		 8,496
(1.48 %)		 30,423
(12.59 %)		 n/a 33.71
(99.04 %)		 1,794
(0.96 %)		 359
(100.00 %)		 293,130
(2.79 %)		 242,633
(2.68 %)		 2,405,680
(52.61 %)		 22,672
(3.11 %)
374 stiff brome
GCF_000005505.3		 47,531
(20.35 %)		 15,530
(6.01 %)		 45,735
(34.29 %)		 n/a 46.40
(99.84 %)		 27
(0.16 %)		 36
(99.84 %)		 108,976
(17.41 %)		 54,391
(1.94 %)		 1,197,052
(21.34 %)		 48,209
(34.43 %)
375 strawberry (Benihoppe 2023)
GCA_034370585.1		 n/a 45,858
(5.68 %)		 123,100
(24.81 %)		 n/a 39.34
(100.00 %)		 n/a 28
(100.00 %)		 934,221
(35.80 %)		 376,936
(6.46 %)		 3,304,328
(31.01 %)		 69,530
(5.73 %)
376 strawberry (Reikou 2013)
GCA_000511835.1		 n/a 15,045
(1.35 %)		 164,045
(15.16 %)		 n/a 38.82
(94.24 %)		 89,898
(5.63 %)		 714,282
(94.37 %)		 278,640
(1.91 %)		 388,660
(6.94 %)		 3,639,568
(28.92 %)		 64,180
(3.80 %)
377 sugarcane (2018)
GCA_900465005.1		 n/a 18,847
(4.51 %)		 76,529
(27.07 %)		 n/a 45.11
(99.96 %)		 1,423
(0.03 %)		 7,128
(99.97 %)		 258,594
(29.31 %)		 144,716
(2.51 %)		 1,976,510
(35.41 %)		 113,324
(26.96 %)
378 sugarcane (CC_01_1940 2021)
GCA_020102875.1		 n/a 25,299
(3.45 %)		 146,261
(29.51 %)		 n/a 45.01
(99.92 %)		 7,046
(0.08 %)		 35,074
(100.00 %)		 302,307
(1.66 %)		 272,248
(3.71 %)		 4,068,281
(29.60 %)		 204,656
(25.44 %)
379 sugarcane (SP80-3280 WGSA1 2019)
GCA_008692665.1		 n/a 78,903
(2.31 %)		 756,432
(27.56 %)		 n/a 43.71
(99.98 %)		 36
(0.00 %)		 398,389
(100.00 %)		 1,981,854
(25.32 %)		 926,250
(3.55 %)		 15,903,748
(41.06 %)		 829,054
(16.97 %)
380 sweet cherry
GCF_002207925.1		 39,968
(19.06 %)		 15,007
(5.83 %)		 38,107
(23.61 %)		 n/a 37.72
(90.64 %)		 22,628
(9.39 %)		 10,148
(100.00 %)		 136,700
(2.47 %)		 104,376
(7.20 %)		 1,484,591
(25.20 %)		 9,956
(2.27 %)
381 sweet cherry (Tieton 2020)
GCA_014155035.1		 n/a 15,140
(4.31 %)		 39,977
(20.09 %)		 n/a 38.44
(99.98 %)		 2,194
(0.02 %)		 61
(100.00 %)		 189,726
(2.51 %)		 150,018
(21.96 %)		 1,231,274
(44.86 %)		 12,897
(3.14 %)
382 sweet orange
GCF_000317415.1		 46,820
(15.94 %)		 14,390
(4.63 %)		 34,480
(18.04 %)		 n/a 34.07
(91.90 %)		 12,539
(8.11 %)		 17,383
(91.89 %)		 185,212
(2.95 %)		 104,182
(4.92 %)		 2,119,183
(29.53 %)		 6,540
(0.93 %)
383 sweet potato (Taizhong6 2017)
GCA_002525835.2		 n/a 23,319
(2.45 %)		 98,107
(18.19 %)		 n/a 35.14
(88.01 %)		 171,925
(12.06 %)		 28,461
(100.00 %)		 579,745
(3.87 %)		 473,175
(3.79 %)		 4,850,126
(32.44 %)		 52,715
(3.15 %)
384 sweet wormwood (Huhao1# 2018)
GCA_003112345.1		 n/a 22,279
(1.15 %)		 121,694
(10.54 %)		 n/a 35.34
(91.81 %)		 275,710
(8.22 %)		 314,564
(91.78 %)		 856,470
(2.64 %)		 970,252
(5.69 %)		 7,570,175
(42.39 %)		 29,072
(0.54 %)
385 switchgrass
GCF_016808335.1		 114,876
(10.54 %)		 31,534
(3.21 %)		 152,844
(27.54 %)		 n/a 46.79
(99.59 %)		 464
(0.41 %)		 1,091
(99.59 %)		 395,905
(1.77 %)		 323,173
(5.10 %)		 4,922,182
(39.47 %)		 213,249
(32.45 %)
386 Tartarian buckwheat (Pinku1 2017)
GCA_002319775.1		 n/a 15,605
(2.84 %)		 50,437
(14.57 %)		 n/a 38.53
(96.71 %)		 2,456
(3.29 %)		 7,020
(100.00 %)		 257,784
(2.74 %)		 211,756
(3.88 %)		 2,209,417
(41.80 %)		 54,125
(5.80 %)
387 Tasmanian pepperberry (RefF3 2024)
GCF_043159265.1		 65,925
(7.32 %)		 16,247
(1.53 %)		 76,786
(13.23 %)		 n/a 39.37
(100.00 %)		 n/a 1,338
(100.00 %)		 1,968,661
(26.22 %)		 626,214
(13.70 %)		 4,298,324
(45.52 %)		 32,932
(4.92 %)
388 thale cress (Landsberg erecta 2016)
GCA_001651475.1		 n/a 26,053
(33.97 %)		 25,713
(36.19 %)		 n/a 36.01
(98.51 %)		 3,479
(1.50 %)		 30
(100.00 %)		 65,429
(14.19 %)		 24,979
(1.85 %)		 739,651
(21.49 %)		 4,443
(1.81 %)
389 thale cress (tair10.1 Columbia 2018)
GCF_000001735.4		 53,852
(40.10 %)		 26,582
(34.47 %)		 11,416
(18.70 %)		 n/a 36.06
(99.85 %)		 357
(0.16 %)		 7
(100.00 %)		 68,517
(16.50 %)		 27,064
(2.77 %)		 749,005
(22.64 %)		 4,601
(1.63 %)
390 thunder duke vine
GCF_013401445.1		 56,436
(17.59 %)		 20,174
(5.61 %)		 42,326
(19.85 %)		 n/a 37.58
(99.96 %)		 146
(0.04 %)		 321
(100.00 %)		 125,395
(2.23 %)		 102,179
(22.89 %)		 1,226,273
(38.50 %)		 6,893
(1.71 %)
391 tobacco N.attenuata
GCF_001879085.1		 50,668
(2.79 %)		 17,479
(0.82 %)		 117,543
(8.63 %)		 n/a 40.23
(88.38 %)		 119,817
(11.63 %)		 37,194
(100.00 %)		 622,838
(1.51 %)		 788,520
(3.46 %)		 11,822,060
(48.66 %)		 174,838
(3.17 %)
392 tobacco N.tomentosiformis
GCF_000390325.2		 66,966
(3.67 %)		 17,141
(1.02 %)		 81,513
(6.82 %)		 n/a 38.89
(97.29 %)		 213,074
(2.72 %)		 215,609
(97.29 %)		 486,556
(1.53 %)		 669,040
(5.52 %)		 10,446,746
(53.83 %)		 118,807
(2.33 %)
393 tomato (2024)
GCF_036512215.1		 59,947
(8.20 %)		 15,474
(1.94 %)		 40,638
(7.50 %)		 n/a 35.17
(99.99 %)		 166
(0.01 %)		 14
(100.00 %)		 333,077
(2.31 %)		 259,232
(7.09 %)		 5,402,596
(43.04 %)		 31,740
(4.85 %)
394 tomato (Micro-Tom 2020)
GCA_012431665.1		 n/a 15,607
(2.04 %)		 39,981
(7.57 %)		 n/a 34.32
(97.69 %)		 1,323
(2.31 %)		 391
(100.00 %)		 433,628
(20.28 %)		 248,928
(3.94 %)		 5,440,564
(39.72 %)		 31,891
(1.72 %)
395 tomato (Micro-Tom S9 2023)
GCA_030162295.1		 n/a 15,496
(2.07 %)		 38,799
(7.36 %)		 n/a 34.40
(98.25 %)		 32,234
(1.76 %)		 165
(100.00 %)		 1,028,324
(71.24 %)		 249,749
(4.56 %)		 5,384,286
(39.87 %)		 27,343
(1.53 %)
396 tomato (v3.1 Heinz 1706 2018)
GCF_000188115.5		 45,958
(6.93 %)		 15,425
(2.15 %)		 38,319
(7.54 %)		 n/a 34.12
(90.19 %)		 19,539
(9.82 %)		 3,066
(100.00 %)		 311,852
(2.14 %)		 229,773
(3.18 %)		 5,390,626
(35.26 %)		 25,196
(1.27 %)
397 toyon (HeAr 88 alternate hap 2022)
GCA_024363235.1		 n/a 22,795
(3.47 %)		 67,418
(16.40 %)		 n/a 38.17
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 75
(100.00 %)		 347,375
(3.07 %)		 304,988
(3.96 %)		 3,119,641
(40.22 %)		 30,300
(3.29 %)
398 toyon (HeAr 88 primary hap 2022)
GCA_024362995.1		 n/a 22,897
(3.50 %)		 67,595
(16.43 %)		 n/a 38.12
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 118
(100.00 %)		 344,928
(2.90 %)		 299,566
(3.87 %)		 3,139,734
(39.86 %)		 30,533
(2.95 %)
399 tree cotton (Shixiya-1 2022)
GCF_025698485.1		 69,134
(4.11 %)		 20,169
(1.21 %)		 55,515
(4.75 %)		 n/a 35.17
(100.00 %)		 225
(0.00 %)		 948
(100.00 %)		 618,195
(1.97 %)		 622,748
(3.28 %)		 8,002,633
(61.80 %)		 27,646
(0.67 %)
400 tree cotton (Shixiya1 2015 BGI)
GCF_000612285.1		 53,446
(3.92 %)		 20,707
(1.29 %)		 56,318
(5.01 %)		 n/a 35.03
(92.12 %)		 45,768
(7.88 %)		 121,185
(92.12 %)		 618,119
(2.07 %)		 589,954
(3.54 %)		 8,098,351
(55.57 %)		 28,949
(0.57 %)
401 trifoliate orange (ZK8 2021)
GCA_018350135.1		 n/a 14,955
(4.81 %)		 32,433
(16.97 %)		 n/a 34.13
(99.99 %)		 222
(0.01 %)		 707
(99.99 %)		 181,106
(2.67 %)		 98,804
(3.46 %)		 2,031,768
(34.51 %)		 6,294
(1.72 %)
402 trilobed morning glory
GCF_003576645.1		 49,472
(13.00 %)		 16,803
(3.58 %)		 50,448
(18.68 %)		 n/a 35.68
(94.76 %)		 31,256
(5.25 %)		 17
(100.00 %)		 333,211
(3.67 %)		 335,317
(10.66 %)		 2,341,085
(36.54 %)		 27,290
(3.24 %)
403 turmeric (G26 2024)
GCF_044706935.1		 40,834
(13.17 %)		 18,067
(4.25 %)		 53,196
(20.85 %)		 n/a 37.76
(99.88 %)		 4,668
(0.12 %)		 7,139
(100.00 %)		 169,406
(2.24 %)		 191,181
(4.26 %)		 2,052,731
(28.24 %)		 50,044
(9.42 %)
404 Valencia sweet orange 2022
GCF_022201045.2		 49,199
(16.33 %)		 14,451
(4.70 %)		 33,670
(18.59 %)		 n/a 34.22
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 11
(100.00 %)		 184,421
(2.80 %)		 106,732
(3.28 %)		 1,996,057
(33.86 %)		 6,824
(1.28 %)
405 valley oak (v3.2 2019)
GCF_001633185.2		 63,531
(8.16 %)		 16,883
(1.90 %)		 72,901
(14.48 %)		 n/a 35.38
(99.77 %)		 1,673
(0.23 %)		 2,002
(100.00 %)		 800,288
(3.71 %)		 460,119
(7.41 %)		 5,438,715
(37.84 %)		 19,628
(1.10 %)
406 Van Houtte's columbine (alt pseudohaplotype PFEx6 2022)
GCA_023053535.1		 n/a 13,357
(3.39 %)		 37,446
(17.24 %)		 n/a 37.56
(100.00 %)		 63
(0.00 %)		 249
(100.00 %)		 244,573
(10.74 %)		 180,141
(13.98 %)		 1,184,686
(42.28 %)		 6,470
(2.86 %)
407 Van Houtte's columbine (PFEx6 2022)
GCA_023053565.1		 n/a 13,575
(3.44 %)		 38,113
(17.59 %)		 n/a 37.58
(100.00 %)		 62
(0.00 %)		 463
(100.00 %)		 245,892
(11.25 %)		 158,855
(13.35 %)		 1,221,056
(41.58 %)		 6,436
(2.63 %)
408 vegetable marrow (v2 mu-cu-16 2017)
GCF_002806865.2		 48,839
(21.95 %)		 19,452
(7.44 %)		 35,987
(20.77 %)		 n/a 36.49
(94.38 %)		 49,199
(5.63 %)		 24,194
(100.00 %)		 181,473
(3.18 %)		 143,114
(7.42 %)		 1,614,901
(29.14 %)		 13,094
(2.48 %)
409 water chestnut (Nanhuling F231 2024)
GCA_035582545.1		 n/a 19,879
(3.81 %)		 38,349
(12.06 %)		 n/a 38.10
(100.00 %)		 216
(0.00 %)		 32
(100.00 %)		 116,633
(1.34 %)		 123,546
(2.75 %)		 2,308,826
(51.78 %)		 20,598
(2.37 %)
410 watermelon (97103 2019)
GCA_000238415.2		 n/a 13,387
(3.57 %)		 27,414
(10.73 %)		 n/a 33.57
(98.45 %)		 245
(1.55 %)		 113
(100.00 %)		 292,830
(3.56 %)		 169,773
(2.91 %)		 2,260,362
(43.24 %)		 14,898
(1.47 %)
411 watermelon (Charleston Gray 2019)
GCA_004801215.2		 n/a 13,662
(3.47 %)		 28,811
(10.60 %)		 n/a 33.52
(94.83 %)		 19,579
(5.18 %)		 6,794
(100.00 %)		 314,974
(3.65 %)		 193,157
(4.04 %)		 2,390,687
(41.95 %)		 15,527
(1.38 %)
412 watermelon (Kordofan 2021)
GCA_018142915.1		 n/a 13,494
(3.54 %)		 27,976
(10.71 %)		 n/a 33.60
(100.00 %)		 47
(0.00 %)		 33
(100.00 %)		 780,860
(60.44 %)		 173,577
(3.01 %)		 2,295,095
(44.07 %)		 15,356
(1.51 %)
413 wax gourd
GCF_009727055.1		 40,406
(4.66 %)		 13,481
(1.43 %)		 43,071
(6.68 %)		 n/a 34.85
(98.39 %)		 24,524
(1.62 %)		 1,791
(100.00 %)		 481,638
(2.55 %)		 364,998
(3.11 %)		 6,236,506
(49.68 %)		 21,741
(0.93 %)
414 weeping love grass (Victoria 2019)
GCA_007726485.1		 n/a 22,395
(3.96 %)		 101,555
(33.88 %)		 n/a 45.70
(99.78 %)		 2,245
(0.22 %)		 1,143
(100.00 %)		 206,645
(1.57 %)		 174,457
(2.79 %)		 2,244,665
(26.11 %)		 117,743
(29.88 %)
415 white cockle S.latifolia (original U9 population 2025)
GCF_048544455.1		 89,156
(3.16 %)		 15,292
(0.51 %)		 135,024
(8.39 %)		 n/a 38.77
(98.57 %)		 827
(1.43 %)		 720
(100.00 %)		 1,158,845
(2.32 %)		 1,353,517
(6.28 %)		 10,836,475
(64.19 %)		 161,610
(4.19 %)
416 white fonio (2020)
GCA_902806635.1		 n/a 33,011
(5.39 %)		 109,615
(30.77 %)		 n/a 45.47
(97.23 %)		 29,136
(2.79 %)		 29,155
(97.21 %)		 215,374
(1.42 %)		 159,137
(1.91 %)		 2,776,488
(28.15 %)		 136,308
(27.74 %)
417 white lupine (Amiga GWH2020 2020)
GCA_010261695.1		 n/a 21,959
(3.77 %)		 51,652
(20.18 %)		 n/a 36.92
(99.73 %)		 1,764
(0.27 %)		 3,171
(99.97 %)		 215,169
(3.21 %)		 247,660
(10.71 %)		 2,556,478
(43.72 %)		 14,520
(10.46 %)
418 white poplar (2024)
GCF_005239225.2		 53,525
(15.07 %)		 20,195
(4.72 %)		 44,116
(16.35 %)		 n/a 33.73
(99.86 %)		 1,182
(0.14 %)		 97
(100.00 %)		 307,548
(3.27 %)		 174,946
(4.79 %)		 2,453,000
(38.39 %)		 4,493
(0.61 %)
419 white poplar P.alba x Populus glandulosa (maternal hap 84K 2023)
GCA_033621325.1		 n/a 19,540
(4.79 %)		 41,183
(15.85 %)		 n/a 34.67
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 21
(100.00 %)		 265,758
(2.98 %)		 150,154
(12.12 %)		 2,138,699
(41.34 %)		 3,578
(0.99 %)
420 white poplar P.alba x Populus glandulosa (paternal hap 84K 2023)
GCA_033617975.1		 n/a 19,599
(4.60 %)		 42,133
(16.21 %)		 n/a 35.05
(100.00 %)		 n/a 27
(100.00 %)		 268,999
(2.93 %)		 165,404
(12.23 %)		 2,153,763
(42.62 %)		 5,857
(2.24 %)
421 white yam
GCF_009730915.1		 43,902
(7.41 %)		 13,647
(2.09 %)		 49,877
(12.79 %)		 n/a 36.25
(99.19 %)		 4,760
(0.81 %)		 2,254
(100.00 %)		 391,299
(3.19 %)		 258,918
(3.96 %)		 3,588,023
(40.59 %)		 28,929
(2.37 %)
422 wild cabbage
GCF_000695525.1		 66,716
(15.60 %)		 31,142
(8.08 %)		 103,348
(35.10 %)		 n/a 36.11
(91.23 %)		 52,140
(8.80 %)		 33,760
(99.98 %)		 197,515
(3.12 %)		 214,463
(4.43 %)		 2,535,207
(31.20 %)		 29,995
(2.99 %)
423 wild cabbage (2018)
GCA_900416815.2		 n/a 31,163
(6.66 %)		 79,290
(25.04 %)		 n/a 36.57
(98.21 %)		 135
(1.79 %)		 140
(100.00 %)		 273,972
(2.76 %)		 284,806
(6.41 %)		 2,750,803
(38.77 %)		 33,071
(3.37 %)
424 wild Colombian cocoa
GCF_002168275.1		 29,804
(16.68 %)		 13,252
(5.90 %)		 22,247
(14.89 %)		 n/a 32.94
(94.65 %)		 119,056
(5.55 %)		 6,074
(100.00 %)		 107,979
(2.19 %)		 67,029
(6.76 %)		 1,525,353
(32.45 %)		 2,481
(0.48 %)
425 wild emmer wheat (Zavitan Atlit2015 v2.1 2019)
GCF_002162155.2		 131,285
(1.34 %)		 n/a 567,570
(8.14 %)		 n/a 45.99
(96.70 %)		 344,589
(3.31 %)		 148,296
(100.00 %)		 2,573,102
(1.23 %)		 2,990,888
(3.37 %)		 492,885
(96.69 %)		 2,220,880
(25.34 %)
426 wild Malaysian banana
GCF_000313855.2		 53,171
(14.87 %)		 18,878
(4.31 %)		 45,554
(18.36 %)		 n/a 38.87
(82.70 %)		 22,178
(17.31 %)		 24,423
(82.71 %)		 214,040
(7.81 %)		 136,453
(2.42 %)		 1,656,678
(31.15 %)		 53,687
(8.28 %)
427 wild olive
GCF_002742605.1		 67,081
(6.69 %)		 19,793
(1.69 %)		 68,749
(9.17 %)		 n/a 35.40
(90.41 %)		 47,638
(9.59 %)		 41,226
(100.00 %)		 425,922
(1.79 %)		 378,656
(18.98 %)		 5,982,070
(40.81 %)		 12,534
(0.42 %)
428 wild peanut A.duranensis (v2 V14167 2020)
GCF_000817695.3		 57,163
(6.21 %)		 17,102
(1.68 %)		 76,760
(11.48 %)		 n/a 35.80
(88.03 %)		 135,554
(12.02 %)		 1,589
(100.00 %)		 596,136
(3.37 %)		 499,251
(3.39 %)		 5,279,103
(45.94 %)		 48,556
(1.91 %)
429 wild peanut A.ipaensis (K30076 2017)
GCF_000816755.2		 78,441
(5.58 %)		 16,952
(1.26 %)		 89,380
(9.95 %)		 n/a 36.84
(92.91 %)		 122,617
(7.13 %)		 997
(99.67 %)		 777,978
(3.35 %)		 619,944
(3.82 %)		 5,823,472
(53.61 %)		 79,537
(2.58 %)
430 wild peanut A.stenosperma (V10309 2020)
GCF_014773155.1		 67,384
(5.06 %)		 16,850
(1.28 %)		 83,780
(9.77 %)		 n/a 36.78
(93.48 %)		 14,157
(6.52 %)		 30
(100.00 %)		 767,054
(3.15 %)		 754,355
(3.89 %)		 5,146,558
(56.74 %)		 71,885
(2.45 %)
431 wild soybean
GCF_004193775.1		 81,537
(9.20 %)		 27,977
(2.99 %)		 78,144
(11.64 %)		 n/a 34.88
(97.58 %)		 752
(2.42 %)		 1,120
(100.00 %)		 551,217
(2.79 %)		 450,287
(6.65 %)		 5,379,409
(46.22 %)		 37,183
(1.52 %)
432 wild strawberry (2011 refseq)
GCF_000184155.1		 25,210
(19.38 %)		 13,996
(6.63 %)		 46,505
(35.89 %)		 n/a 38.40
(94.27 %)		 16,253
(5.76 %)		 16,460
(94.25 %)		 71,057
(1.51 %)		 74,581
(2.78 %)		 1,034,180
(21.44 %)		 14,806
(3.21 %)
433 wild sugarcane (AP85-441 2018)
GCA_003544955.1		 n/a 67,698
(2.77 %)		 385,590
(22.40 %)		 n/a 44.92
(99.75 %)		 76,230
(0.26 %)		 15,303
(100.00 %)		 1,015,234
(1.60 %)		 910,932
(3.64 %)		 10,425,387
(46.78 %)		 637,314
(24.52 %)
434 wild tomato S.pennellii
GCF_001406875.1		 46,114
(5.99 %)		 15,458
(1.87 %)		 42,907
(7.63 %)		 n/a 34.50
(92.34 %)		 41,684
(7.67 %)		 41,696
(92.33 %)		 363,460
(2.48 %)		 271,129
(4.15 %)		 6,330,153
(36.93 %)		 19,639
(1.20 %)
435 wine grape (Chardonnay FPS 04 2020)
GCA_011037095.1		 n/a 17,733
(2.85 %)		 55,354
(14.76 %)		 n/a 34.32
(99.33 %)		 780
(0.67 %)		 683
(100.00 %)		 586,981
(35.31 %)		 275,412
(4.57 %)		 3,561,395
(35.28 %)		 14,172
(0.96 %)
436 wine grape (Chkhaveri 2017)
GCA_002922885.1		 n/a 14,109
(3.33 %)		 40,033
(15.32 %)		 n/a 34.56
(97.67 %)		 9,429
(2.34 %)		 21
(100.00 %)		 410,680
(35.69 %)		 189,467
(4.45 %)		 2,405,053
(34.36 %)		 10,620
(1.04 %)
437 wine grape (Pinot Noir 40024 2023)
GCF_030704535.1		 46,430
(10.71 %)		 14,823
(2.93 %)		 44,674
(15.11 %)		 n/a 35.08
(100.00 %)		 n/a 21
(100.00 %)		 310,377
(2.83 %)		 242,451
(9.17 %)		 2,706,407
(38.52 %)		 11,751
(1.05 %)
438 wine grape (PN40024 2009)
GCF_000003745.3		 46,797
(11.01 %)		 14,907
(3.07 %)		 44,949
(15.02 %)		 n/a 34.56
(96.91 %)		 13,440
(3.10 %)		 14,644
(96.90 %)		 462,807
(35.59 %)		 222,647
(4.83 %)		 2,745,513
(34.80 %)		 11,591
(1.00 %)
439 winter cress (G-type 2016)
GCA_001920985.1		 n/a 22,511
(18.61 %)		 30,519
(28.94 %)		 n/a 35.60
(90.69 %)		 22,839
(9.35 %)		 30,649
(90.65 %)		 86,568
(2.39 %)		 44,616
(2.78 %)		 1,035,105
(23.86 %)		 6,701
(1.74 %)
440 winter squash (2017)
GCF_002738345.1		 49,714
(19.34 %)		 18,860
(6.74 %)		 33,884
(18.55 %)		 n/a 36.33
(97.81 %)		 17,224
(2.20 %)		 8,299
(100.00 %)		 169,605
(3.09 %)		 134,380
(10.82 %)		 1,493,623
(35.66 %)		 12,619
(2.64 %)
441 wood tobacco (2013)
GCF_000393655.1		 58,358
(2.93 %)		 17,332
(0.82 %)		 111,663
(7.17 %)		 n/a 39.09
(92.17 %)		 338,901
(7.84 %)		 392,998
(92.16 %)		 598,929
(1.44 %)		 776,240
(4.57 %)		 13,228,149
(49.11 %)		 100,864
(1.49 %)
442 wood tobacco (2023)
GCF_000393655.2		 69,980
(3.08 %)		 17,329
(0.74 %)		 106,002
(6.66 %)		 n/a 39.22
(100.00 %)		 351
(0.00 %)		 153
(100.00 %)		 757,555
(1.52 %)		 896,381
(6.23 %)		 12,682,761
(57.52 %)		 112,643
(1.70 %)
443 wooly tobacco N.tomentosiformis (2023)
GCF_000390325.3		 73,963
(4.14 %)		 17,122
(0.98 %)		 74,889
(6.28 %)		 n/a 39.02
(99.99 %)		 471
(0.01 %)		 570
(100.00 %)		 496,695
(1.39 %)		 640,139
(8.47 %)		 10,077,793
(57.60 %)		 115,283
(2.23 %)
444 zha cai (T84-66 inbred line 2016)
GCA_001687265.1		 n/a 56,069
(8.51 %)		 138,660
(27.88 %)		 n/a 36.22
(79.66 %)		 22,714
(20.35 %)		 9,746
(100.00 %)		 367,321
(2.38 %)		 303,381
(3.03 %)		 4,551,648
(26.34 %)		 50,430
(3.81 %)
TOTALS:total assembly count 444

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Mammals 836 assemblies assembly stats track stats
Birds 543 assemblies assembly stats track stats
Fishes 636 assemblies assembly stats track stats
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Invertebrates 1942 assemblies assembly stats track stats
Plants 444 assemblies assembly stats track stats
Fungi 4128 assemblies assembly stats track stats
Viruses 15060 assemblies assembly stats track stats
Archaea 2702 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 22350 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 689 assemblies assembly stats track stats
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VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 464 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 5519 assemblies assembly stats track stats